data_SMR-2a636c2ddc80123213908f9652ccf589_9 _entry.id SMR-2a636c2ddc80123213908f9652ccf589_9 _struct.entry_id SMR-2a636c2ddc80123213908f9652ccf589_9 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A2J8NBZ0/ A0A2J8NBZ0_PANTR, GAPVD1 isoform 5 - Q14C86/ GAPD1_HUMAN, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.019, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A2J8NBZ0, Q14C86' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 191782.933 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP GAPD1_HUMAN Q14C86 1 ;MVKLDIHTLAHHLKQERLYVNSEKQLIQRLNADVLKTAEKLYRTAWIAKQQRINLDRLIITSAEASPAEC CQHAKILEDTQFVDGYKQLGFQETAYGEFLSRLRENPRLIASSLVAGEKLNQENTQSVIYTVFTSLYGNC IMQEDESYLLQVLRYLIEFELKESDNPRRLLRRGTCAFSILFKLFSEGLFSAKLFLTATLHEPIMQLLVE DEDHLETDPNKLIERFSPSQQEKLFGEKGSDRFRQKVQEMVESNEAKLVALVNKFIGYLKQNTYCFPHSL RWIVSQMYKTLSCVDRLEVGEVRAMCTDLLLACFICPAVVNPEQYGIISDAPINEVARFNLMQVGRLLQQ LAMTGSEEGDPRTKSSLGKFDKSCVAAFLDVVIGGRAVETPPLSSVNLLEGLSRTVVYITYSQLITLVNF MKSVMSGDQLREDRMALDNLLANLPPAKPGKSSSLEMTPYNTPQLSPATTPANKKNRLPIATRSRSRTNM LMDLHMDHEGSSQETIQEVQPEEVLVISLGTGPQLTPGMMSENEVLNMQLSDGGQGDVPVDENKLHGKPD KTLRFSLCSDNLEGISEGPSNRSNSVSSLDLEGESVSELGAGPSGSNGVEALQLLEHEQATTQDNLDDKL RKFEIRDMMGLTDDRDISETVSETWSTDVLGSDFDPNIDEDRLQEIAGAAAENMLGSLLCLPGSGSVLLD PCTGSTISETTSEAWSVEVLPSDSEAPDLKQEERLQELESCSGLGSTSDDTDVREVSSRPSTPGLSVVSG ISATSEDIPNKIEDLRSECSSDFGGKDSVTSPDMDEITHGAHQLTSPPSQSESLLAMFDPLSSHEGASAV VRPKVHYARPSHPPPDPPILEGAVGGNEARLPNFGSHVLTPAEMEAFKQRHSYPERLVRSRSSDIVSSVR RPMSDPSWNRRPGNEERELPPAAAIGATSLVAAPHSSSSSPSKDSSRGETEERKDSDDEKSDRNRPWWRK RFVSAMPKAPIPFRKKEKQEKDKDDLGPDRFSTLTDDPSPRLSAQAQVAEDILDKYRNAIKRTSPSDGAM ANYESTGDNHDRDLSSKLLYHSDKEVMGDGESAHDSPRDEALQNISADDLPDSASQAAHPQDSAFSYRDA KKKLRLALCSADSVAFPVLTHSTRNGLPDHTDPEDNEIVCFLKVQIAEAINLQDKNLMAQLQETMRCVCR FDNRTCRKLLASIAEDYRKRAPYIAYLTRCRQGLQTTQAHLERLLQRVLRDKEVANRYFTTVCVRLLLES KEKKIREFIQDFQKLTAADDKTAQVEDFLQFLYGAMAQDVIWQNASEEQLQDAQLAIERSVMNRIFKLAF YPNQDGDILRDQVLHEHIQRLSKVVTANHRALQIPEVYLREAPWPSAQSEIRTISAYKTPRDKVQCILRM CSTIMNLLSLANEDSVPGADDFVPVLVFVLIKANPPCLLSTVQYISSFYASCLSGEESYWWMQFTAAVEF IKTIDDRK ; 'GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1' 2 1 UNP A0A2J8NBZ0_PANTR A0A2J8NBZ0 1 ;MVKLDIHTLAHHLKQERLYVNSEKQLIQRLNADVLKTAEKLYRTAWIAKQQRINLDRLIITSAEASPAEC CQHAKILEDTQFVDGYKQLGFQETAYGEFLSRLRENPRLIASSLVAGEKLNQENTQSVIYTVFTSLYGNC IMQEDESYLLQVLRYLIEFELKESDNPRRLLRRGTCAFSILFKLFSEGLFSAKLFLTATLHEPIMQLLVE DEDHLETDPNKLIERFSPSQQEKLFGEKGSDRFRQKVQEMVESNEAKLVALVNKFIGYLKQNTYCFPHSL RWIVSQMYKTLSCVDRLEVGEVRAMCTDLLLACFICPAVVNPEQYGIISDAPINEVARFNLMQVGRLLQQ LAMTGSEEGDPRTKSSLGKFDKSCVAAFLDVVIGGRAVETPPLSSVNLLEGLSRTVVYITYSQLITLVNF MKSVMSGDQLREDRMALDNLLANLPPAKPGKSSSLEMTPYNTPQLSPATTPANKKNRLPIATRSRSRTNM LMDLHMDHEGSSQETIQEVQPEEVLVISLGTGPQLTPGMMSENEVLNMQLSDGGQGDVPVDENKLHGKPD KTLRFSLCSDNLEGISEGPSNRSNSVSSLDLEGESVSELGAGPSGSNGVEALQLLEHEQATTQDNLDDKL RKFEIRDMMGLTDDRDISETVSETWSTDVLGSDFDPNIDEDRLQEIAGAAAENMLGSLLCLPGSGSVLLD PCTGSTISETTSEAWSVEVLPSDSEAPDLKQEERLQELESCSGLGSTSDDTDVREVSSRPSTPGLSVVSG ISATSEDIPNKIEDLRSECSSDFGGKDSVTSPDMDEITHGAHQLTSPPSQSESLLAMFDPLSSHEGASAV VRPKVHYARPSHPPPDPPILEGAVGGNEARLPNFGSHVLTPAEMEAFKQRHSYPERLVRSRSSDIVSSVR RPMSDPSWNRRPGNEERELPPAAAIGATSLVAAPHSSSSSPSKDSSRGETEERKDSDDEKSDRNRPWWRK RFVSAMPKAPIPFRKKEKQEKDKDDLGPDRFSTLTDDPSPRLSAQAQVAEDILDKYRNAIKRTSPSDGAM ANYESTGDNHDRDLSSKLLYHSDKEVMGDGESAHDSPRDEALQNISADDLPDSASQAAHPQDSAFSYRDA KKKLRLALCSADSVAFPVLTHSTRNGLPDHTDPEDNEIVCFLKVQIAEAINLQDKNLMAQLQETMRCVCR FDNRTCRKLLASIAEDYRKRAPYIAYLTRCRQGLQTTQAHLERLLQRVLRDKEVANRYFTTVCVRLLLES KEKKIREFIQDFQKLTAADDKTAQVEDFLQFLYGAMAQDVIWQNASEEQLQDAQLAIERSVMNRIFKLAF YPNQDGDILRDQVLHEHIQRLSKVVTANHRALQIPEVYLREAPWPSAQSEIRTISAYKTPRDKVQCILRM CSTIMNLLSLANEDSVPGADDFVPVLVFVLIKANPPCLLSTVQYISSFYASCLSGEESYWWMQFTAAVEF IKTIDDRK ; 'GAPVD1 isoform 5' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1478 1 1478 2 2 1 1478 1 1478 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . GAPD1_HUMAN Q14C86 . 1 1478 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-03-18 DD429B0EB207276C 1 UNP . A0A2J8NBZ0_PANTR A0A2J8NBZ0 . 1 1478 9598 'Pan troglodytes (Chimpanzee)' 2018-03-28 DD429B0EB207276C # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no 3 ;MVKLDIHTLAHHLKQERLYVNSEKQLIQRLNADVLKTAEKLYRTAWIAKQQRINLDRLIITSAEASPAEC CQHAKILEDTQFVDGYKQLGFQETAYGEFLSRLRENPRLIASSLVAGEKLNQENTQSVIYTVFTSLYGNC IMQEDESYLLQVLRYLIEFELKESDNPRRLLRRGTCAFSILFKLFSEGLFSAKLFLTATLHEPIMQLLVE DEDHLETDPNKLIERFSPSQQEKLFGEKGSDRFRQKVQEMVESNEAKLVALVNKFIGYLKQNTYCFPHSL RWIVSQMYKTLSCVDRLEVGEVRAMCTDLLLACFICPAVVNPEQYGIISDAPINEVARFNLMQVGRLLQQ LAMTGSEEGDPRTKSSLGKFDKSCVAAFLDVVIGGRAVETPPLSSVNLLEGLSRTVVYITYSQLITLVNF MKSVMSGDQLREDRMALDNLLANLPPAKPGKSSSLEMTPYNTPQLSPATTPANKKNRLPIATRSRSRTNM LMDLHMDHEGSSQETIQEVQPEEVLVISLGTGPQLTPGMMSENEVLNMQLSDGGQGDVPVDENKLHGKPD KTLRFSLCSDNLEGISEGPSNRSNSVSSLDLEGESVSELGAGPSGSNGVEALQLLEHEQATTQDNLDDKL 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CQHAKILEDTQFVDGYKQLGFQETAYGEFLSRLRENPRLIASSLVAGEKLNQENTQSVIYTVFTSLYGNC IMQEDESYLLQVLRYLIEFELKESDNPRRLLRRGTCAFSILFKLFSEGLFSAKLFLTATLHEPIMQLLVE DEDHLETDPNKLIERFSPSQQEKLFGEKGSDRFRQKVQEMVESNEAKLVALVNKFIGYLKQNTYCFPHSL RWIVSQMYKTLSCVDRLEVGEVRAMCTDLLLACFICPAVVNPEQYGIISDAPINEVARFNLMQVGRLLQQ LAMTGSEEGDPRTKSSLGKFDKSCVAAFLDVVIGGRAVETPPLSSVNLLEGLSRTVVYITYSQLITLVNF MKSVMSGDQLREDRMALDNLLANLPPAKPGKSSSLEMTPYNTPQLSPATTPANKKNRLPIATRSRSRTNM LMDLHMDHEGSSQETIQEVQPEEVLVISLGTGPQLTPGMMSENEVLNMQLSDGGQGDVPVDENKLHGKPD KTLRFSLCSDNLEGISEGPSNRSNSVSSLDLEGESVSELGAGPSGSNGVEALQLLEHEQATTQDNLDDKL RKFEIRDMMGLTDDRDISETVSETWSTDVLGSDFDPNIDEDRLQEIAGAAAENMLGSLLCLPGSGSVLLD PCTGSTISETTSEAWSVEVLPSDSEAPDLKQEERLQELESCSGLGSTSDDTDVREVSSRPSTPGLSVVSG ISATSEDIPNKIEDLRSECSSDFGGKDSVTSPDMDEITHGAHQLTSPPSQSESLLAMFDPLSSHEGASAV VRPKVHYARPSHPPPDPPILEGAVGGNEARLPNFGSHVLTPAEMEAFKQRHSYPERLVRSRSSDIVSSVR RPMSDPSWNRRPGNEERELPPAAAIGATSLVAAPHSSSSSPSKDSSRGETEERKDSDDEKSDRNRPWWRK RFVSAMPKAPIPFRKKEKQEKDKDDLGPDRFSTLTDDPSPRLSAQAQVAEDILDKYRNAIKRTSPSDGAM 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A 1 44 THR 44 ? ? ? 3 . A 1 45 ALA 45 ? ? ? 3 . A 1 46 TRP 46 ? ? ? 3 . A 1 47 ILE 47 ? ? ? 3 . A 1 48 ALA 48 ? ? ? 3 . A 1 49 LYS 49 ? ? ? 3 . A 1 50 GLN 50 ? ? ? 3 . A 1 51 GLN 51 ? ? ? 3 . A 1 52 ARG 52 ? ? ? 3 . A 1 53 ILE 53 ? ? ? 3 . A 1 54 ASN 54 ? ? ? 3 . A 1 55 LEU 55 ? ? ? 3 . A 1 56 ASP 56 ? ? ? 3 . A 1 57 ARG 57 ? ? ? 3 . A 1 58 LEU 58 ? ? ? 3 . A 1 59 ILE 59 ? ? ? 3 . A 1 60 ILE 60 ? ? ? 3 . A 1 61 THR 61 ? ? ? 3 . A 1 62 SER 62 ? ? ? 3 . A 1 63 ALA 63 ? ? ? 3 . A 1 64 GLU 64 ? ? ? 3 . A 1 65 ALA 65 ? ? ? 3 . A 1 66 SER 66 ? ? ? 3 . A 1 67 PRO 67 ? ? ? 3 . A 1 68 ALA 68 ? ? ? 3 . A 1 69 GLU 69 ? ? ? 3 . A 1 70 CYS 70 ? ? ? 3 . A 1 71 CYS 71 ? ? ? 3 . A 1 72 GLN 72 ? ? ? 3 . A 1 73 HIS 73 ? ? ? 3 . A 1 74 ALA 74 ? ? ? 3 . A 1 75 LYS 75 ? ? ? 3 . A 1 76 ILE 76 ? ? ? 3 . A 1 77 LEU 77 ? ? ? 3 . A 1 78 GLU 78 ? ? ? 3 . A 1 79 ASP 79 ? ? ? 3 . A 1 80 THR 80 ? ? ? 3 . A 1 81 GLN 81 ? ? ? 3 . A 1 82 PHE 82 ? ? ? 3 . A 1 83 VAL 83 ? ? ? 3 . A 1 84 ASP 84 ? ? ? 3 . 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A 1 124 ASN 124 ? ? ? 3 . A 1 125 THR 125 ? ? ? 3 . A 1 126 GLN 126 ? ? ? 3 . A 1 127 SER 127 ? ? ? 3 . A 1 128 VAL 128 ? ? ? 3 . A 1 129 ILE 129 ? ? ? 3 . A 1 130 TYR 130 ? ? ? 3 . A 1 131 THR 131 ? ? ? 3 . A 1 132 VAL 132 ? ? ? 3 . A 1 133 PHE 133 ? ? ? 3 . A 1 134 THR 134 ? ? ? 3 . A 1 135 SER 135 ? ? ? 3 . A 1 136 LEU 136 ? ? ? 3 . A 1 137 TYR 137 ? ? ? 3 . A 1 138 GLY 138 ? ? ? 3 . A 1 139 ASN 139 ? ? ? 3 . A 1 140 CYS 140 ? ? ? 3 . A 1 141 ILE 141 ? ? ? 3 . A 1 142 MET 142 ? ? ? 3 . A 1 143 GLN 143 ? ? ? 3 . A 1 144 GLU 144 ? ? ? 3 . A 1 145 ASP 145 ? ? ? 3 . A 1 146 GLU 146 ? ? ? 3 . A 1 147 SER 147 ? ? ? 3 . A 1 148 TYR 148 ? ? ? 3 . A 1 149 LEU 149 ? ? ? 3 . A 1 150 LEU 150 ? ? ? 3 . A 1 151 GLN 151 ? ? ? 3 . A 1 152 VAL 152 ? ? ? 3 . A 1 153 LEU 153 ? ? ? 3 . A 1 154 ARG 154 ? ? ? 3 . A 1 155 TYR 155 ? ? ? 3 . A 1 156 LEU 156 ? ? ? 3 . A 1 157 ILE 157 ? ? ? 3 . A 1 158 GLU 158 ? ? ? 3 . A 1 159 PHE 159 ? ? ? 3 . A 1 160 GLU 160 ? ? ? 3 . A 1 161 LEU 161 ? ? ? 3 . 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A 1 200 LEU 200 ? ? ? 3 . A 1 201 HIS 201 ? ? ? 3 . A 1 202 GLU 202 ? ? ? 3 . A 1 203 PRO 203 ? ? ? 3 . A 1 204 ILE 204 ? ? ? 3 . A 1 205 MET 205 ? ? ? 3 . A 1 206 GLN 206 ? ? ? 3 . A 1 207 LEU 207 ? ? ? 3 . A 1 208 LEU 208 ? ? ? 3 . A 1 209 VAL 209 ? ? ? 3 . A 1 210 GLU 210 ? ? ? 3 . A 1 211 ASP 211 ? ? ? 3 . A 1 212 GLU 212 ? ? ? 3 . A 1 213 ASP 213 ? ? ? 3 . A 1 214 HIS 214 ? ? ? 3 . A 1 215 LEU 215 ? ? ? 3 . A 1 216 GLU 216 ? ? ? 3 . A 1 217 THR 217 ? ? ? 3 . A 1 218 ASP 218 ? ? ? 3 . A 1 219 PRO 219 ? ? ? 3 . A 1 220 ASN 220 ? ? ? 3 . A 1 221 LYS 221 ? ? ? 3 . A 1 222 LEU 222 ? ? ? 3 . A 1 223 ILE 223 ? ? ? 3 . A 1 224 GLU 224 ? ? ? 3 . A 1 225 ARG 225 ? ? ? 3 . A 1 226 PHE 226 ? ? ? 3 . A 1 227 SER 227 ? ? ? 3 . A 1 228 PRO 228 ? ? ? 3 . A 1 229 SER 229 ? ? ? 3 . A 1 230 GLN 230 ? ? ? 3 . A 1 231 GLN 231 ? ? ? 3 . A 1 232 GLU 232 ? ? ? 3 . A 1 233 LYS 233 ? ? ? 3 . A 1 234 LEU 234 ? ? ? 3 . A 1 235 PHE 235 ? ? ? 3 . A 1 236 GLY 236 ? ? ? 3 . A 1 237 GLU 237 ? ? ? 3 . 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A 1 1402 SER 1402 ? ? ? 3 . A 1 1403 THR 1403 ? ? ? 3 . A 1 1404 ILE 1404 ? ? ? 3 . A 1 1405 MET 1405 ? ? ? 3 . A 1 1406 ASN 1406 ? ? ? 3 . A 1 1407 LEU 1407 ? ? ? 3 . A 1 1408 LEU 1408 ? ? ? 3 . A 1 1409 SER 1409 ? ? ? 3 . A 1 1410 LEU 1410 ? ? ? 3 . A 1 1411 ALA 1411 ? ? ? 3 . A 1 1412 ASN 1412 ? ? ? 3 . A 1 1413 GLU 1413 ? ? ? 3 . A 1 1414 ASP 1414 ? ? ? 3 . A 1 1415 SER 1415 ? ? ? 3 . A 1 1416 VAL 1416 ? ? ? 3 . A 1 1417 PRO 1417 ? ? ? 3 . A 1 1418 GLY 1418 ? ? ? 3 . A 1 1419 ALA 1419 ? ? ? 3 . A 1 1420 ASP 1420 ? ? ? 3 . A 1 1421 ASP 1421 ? ? ? 3 . A 1 1422 PHE 1422 ? ? ? 3 . A 1 1423 VAL 1423 ? ? ? 3 . A 1 1424 PRO 1424 ? ? ? 3 . A 1 1425 VAL 1425 ? ? ? 3 . A 1 1426 LEU 1426 ? ? ? 3 . A 1 1427 VAL 1427 ? ? ? 3 . A 1 1428 PHE 1428 ? ? ? 3 . A 1 1429 VAL 1429 ? ? ? 3 . A 1 1430 LEU 1430 ? ? ? 3 . A 1 1431 ILE 1431 ? ? ? 3 . A 1 1432 LYS 1432 ? ? ? 3 . A 1 1433 ALA 1433 ? ? ? 3 . A 1 1434 ASN 1434 ? ? ? 3 . A 1 1435 PRO 1435 ? ? ? 3 . A 1 1436 PRO 1436 ? ? ? 3 . A 1 1437 CYS 1437 ? ? ? 3 . A 1 1438 LEU 1438 ? ? ? 3 . A 1 1439 LEU 1439 ? ? ? 3 . A 1 1440 SER 1440 ? ? ? 3 . A 1 1441 THR 1441 ? ? ? 3 . A 1 1442 VAL 1442 ? ? ? 3 . A 1 1443 GLN 1443 ? ? ? 3 . A 1 1444 TYR 1444 ? ? ? 3 . A 1 1445 ILE 1445 ? ? ? 3 . A 1 1446 SER 1446 ? ? ? 3 . A 1 1447 SER 1447 ? ? ? 3 . A 1 1448 PHE 1448 ? ? ? 3 . A 1 1449 TYR 1449 ? ? ? 3 . A 1 1450 ALA 1450 ? ? ? 3 . A 1 1451 SER 1451 ? ? ? 3 . A 1 1452 CYS 1452 ? ? ? 3 . A 1 1453 LEU 1453 ? ? ? 3 . A 1 1454 SER 1454 ? ? ? 3 . A 1 1455 GLY 1455 ? ? ? 3 . A 1 1456 GLU 1456 ? ? ? 3 . A 1 1457 GLU 1457 ? ? ? 3 . A 1 1458 SER 1458 ? ? ? 3 . A 1 1459 TYR 1459 ? ? ? 3 . A 1 1460 TRP 1460 ? ? ? 3 . A 1 1461 TRP 1461 ? ? ? 3 . A 1 1462 MET 1462 ? ? ? 3 . A 1 1463 GLN 1463 ? ? ? 3 . A 1 1464 PHE 1464 ? ? ? 3 . A 1 1465 THR 1465 ? ? ? 3 . A 1 1466 ALA 1466 ? ? ? 3 . A 1 1467 ALA 1467 ? ? ? 3 . A 1 1468 VAL 1468 ? ? ? 3 . A 1 1469 GLU 1469 ? ? ? 3 . A 1 1470 PHE 1470 ? ? ? 3 . A 1 1471 ILE 1471 ? ? ? 3 . A 1 1472 LYS 1472 ? ? ? 3 . A 1 1473 THR 1473 ? ? ? 3 . A 1 1474 ILE 1474 ? ? ? 3 . A 1 1475 ASP 1475 ? ? ? 3 . A 1 1476 ASP 1476 ? ? ? 3 . A 1 1477 ARG 1477 ? ? ? 3 . A 1 1478 LYS 1478 ? ? ? 3 . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nup214 {PDB ID=7tdz, label_asym_id=DA, auth_asym_id=S, SMTL ID=7tdz.1.3}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7tdz, label_asym_id=DA' 'target-template alignment' . 4 'model 9' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A DA 3 1 S # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MEDDTDLPPERETKDFQFRQLKKVRLFDYPADLPKQRSNLLVISNKYGLLFVGGFMGLKVFHTKDILVTV KPKENANKTVVGPQGIHVPMNSPIHHLALSSDNLTLSVCMTSAEQGSSVSFYDVRTLLNESKQNKMPFAS CKLLRDPSSSVTDLQWNPTLPSMVAVCLSDGSISVLQVTDTVSVFANLPATLGVTSVCWSPKGKQLAVGK QNGTVVQYLPSLQEKKVIPCPSFYDSDNPVKVLDVLWLSTYVFTVVYAAADGSLEASPQLVIVTLPKKED KRAERFLNFTETCYSICSERQHHFFLNYIEDWEILLAASAASVDVGVIARPPDQVGWEQWLLEDSSRAEM PMTENNDDTLPMGVALDYTCQLEVFISESQILPPVPVLLLLSTDGVLCPFHVVNLNQGVKPLTTSPEQLS LDGEREMKVVGGTAVSTPPAPLTSVSAPAPPASAAPRSAAPPPYPFGLSTASSGAPTPVLNPPASLAPAA TPTKTTSQPAAAATSIFQPAGPAAGSLQPPSLPAFSFSSANNAANASAPSSFPFGAAMVSSNTAKVSAPP AMSFQPAMGTRPFSLATPVTVQAATAPGFTPTPSTVKVNLKDKFNASDTPPPATISSAAALSFTPTSKPN ATVPVKSQPTVIPSQASVQPNRPFAVEAPQAPSSVSIASVQKTVRVNPPATKITPQPQRSVALENQAKVT KESDSILNGIREEIAHFQKELDDLKARTSRACFQVGSEEEKRQLRTESDGLHSFFLEIKETTESLRGEFS AMKIKNLEGFASIEDVQQRNKLKQDPKYLQLLYKKPLDPKSETQMQEIRRLNQYVKNAVQDVNDVLDLEW DQYLEEKQKKKGIIIPERETLFNSLANHQEIINQQRPKLEQLVENLQKLRLYNQISQWNVPDSSTKSFDV ELENMQKTLSQTAIDTQTKPQAKLPAKISPVKQSQLRNFLSKRKTPPVRSLAPANLSRSAFLAPSFFEDL DDVSSTSSLSDMADNDNRNPPPKEIERQETPPPESTPVRVPKHAPVARTTSVQPGLGTASLPFQSGLHPA TSTPVAPSQSIRVIPQGADSTMLATKTVKHGAPNITAAQKAAVAAMRRQTASQIPAASLTESTLQTVPQV VNVKELKNNGPGPTIPTVIGPTVPQSAAQVIHQVLATVGSVSARQAAPAAPLKNPPASASSIAPQTWQGS APNKPAAQAIPKSDPSASQAPAPSVSQVNKPVSFSPAAGGFSFSNVTSAPVTSALGSSSAGCAATARDSN QASSYMFGGTGKSLGSEGSFSFASLKPASSSSSSSVVEPTMSKPSVVTAASTTATVTSTTAASSKPGEGL FQGFSGGETLGSFSGLRVGQADEASKVEVAKTPTAAQPVKLPSNPVLFSFAGAPQPAKVGEAPSTTSSTS ASLFGNVQLASAGSTASAFTQSGSKPAFTFGIPQSTSTTAGASSAIPASFQSLLVSAAPATTTPSAPINS GLDVKQPIKPLSEPADSSSSQQQTLTTQSAAEQVPTVTPAATTATALPPPVPTIPSTAEAKIEGAAAPAI PASVISSQTVPFTSTVLASQTPLASTPAGGPTSQVPVLVTTAPPVTTESAQTVSLTGQPVAGSSAFAQST VTAASTPVFGQALASGAAPSPFAQPTSSSVSTSANSSTGFGTSAFGATGGNGGFGQPSFGQAPLWKGPAT SQSTLPFSQPTFGTQPAFGQPAASTATSSAGSLFGCTSSASSFSFGQASNTSGTSTSGVLFGQSSAPVFG QSAAFPQAAPAFGSASVSTTTTASFGFGQPAGFASGTSGSLFNPSQSGSTSVFGQQPASSSGGLFGAGSG GASTVGLFSGLGAKPSQEAANKNPFGSPGSSGFGSAGASNSSNLFGNSGAKAFGFGGTSFGDKPSATFSA GGSVASQGFSFNSPTKTGGFGAAPVFGSPPTFGGSPGFGGSPAFGTAAAFSNTLGSTGGKVFGEGTSAAT TGGFGFGSNSSTAAFGSLATQNTPTFGSISQQSPGFGGQSSGFSGFGAGPGAAAGNTGGFGFGVSNPTSP GFGCWRS ; ;MEDDTDLPPERETKDFQFRQLKKVRLFDYPADLPKQRSNLLVISNKYGLLFVGGFMGLKVFHTKDILVTV KPKENANKTVVGPQGIHVPMNSPIHHLALSSDNLTLSVCMTSAEQGSSVSFYDVRTLLNESKQNKMPFAS CKLLRDPSSSVTDLQWNPTLPSMVAVCLSDGSISVLQVTDTVSVFANLPATLGVTSVCWSPKGKQLAVGK QNGTVVQYLPSLQEKKVIPCPSFYDSDNPVKVLDVLWLSTYVFTVVYAAADGSLEASPQLVIVTLPKKED KRAERFLNFTETCYSICSERQHHFFLNYIEDWEILLAASAASVDVGVIARPPDQVGWEQWLLEDSSRAEM PMTENNDDTLPMGVALDYTCQLEVFISESQILPPVPVLLLLSTDGVLCPFHVVNLNQGVKPLTTSPEQLS LDGEREMKVVGGTAVSTPPAPLTSVSAPAPPASAAPRSAAPPPYPFGLSTASSGAPTPVLNPPASLAPAA TPTKTTSQPAAAATSIFQPAGPAAGSLQPPSLPAFSFSSANNAANASAPSSFPFGAAMVSSNTAKVSAPP AMSFQPAMGTRPFSLATPVTVQAATAPGFTPTPSTVKVNLKDKFNASDTPPPATISSAAALSFTPTSKPN ATVPVKSQPTVIPSQASVQPNRPFAVEAPQAPSSVSIASVQKTVRVNPPATKITPQPQRSVALENQAKVT KESDSILNGIREEIAHFQKELDDLKARTSRACFQVGSEEEKRQLRTESDGLHSFFLEIKETTESLRGEFS AMKIKNLEGFASIEDVQQRNKLKQDPKYLQLLYKKPLDPKSETQMQEIRRLNQYVKNAVQDVNDVLDLEW DQYLEEKQKKKGIIIPERETLFNSLANHQEIINQQRPKLEQLVENLQKLRLYNQISQWNVPDSSTKSFDV ELENMQKTLSQTAIDTQTKPQAKLPAKISPVKQSQLRNFLSKRKTPPVRSLAPANLSRSAFLAPSFFEDL DDVSSTSSLSDMADNDNRNPPPKEIERQETPPPESTPVRVPKHAPVARTTSVQPGLGTASLPFQSGLHPA TSTPVAPSQSIRVIPQGADSTMLATKTVKHGAPNITAAQKAAVAAMRRQTASQIPAASLTESTLQTVPQV VNVKELKNNGPGPTIPTVIGPTVPQSAAQVIHQVLATVGSVSARQAAPAAPLKNPPASASSIAPQTWQGS APNKPAAQAIPKSDPSASQAPAPSVSQVNKPVSFSPAAGGFSFSNVTSAPVTSALGSSSAGCAATARDSN QASSYMFGGTGKSLGSEGSFSFASLKPASSSSSSSVVEPTMSKPSVVTAASTTATVTSTTAASSKPGEGL FQGFSGGETLGSFSGLRVGQADEASKVEVAKTPTAAQPVKLPSNPVLFSFAGAPQPAKVGEAPSTTSSTS ASLFGNVQLASAGSTASAFTQSGSKPAFTFGIPQSTSTTAGASSAIPASFQSLLVSAAPATTTPSAPINS GLDVKQPIKPLSEPADSSSSQQQTLTTQSAAEQVPTVTPAATTATALPPPVPTIPSTAEAKIEGAAAPAI PASVISSQTVPFTSTVLASQTPLASTPAGGPTSQVPVLVTTAPPVTTESAQTVSLTGQPVAGSSAFAQST VTAASTPVFGQALASGAAPSPFAQPTSSSVSTSANSSTGFGTSAFGATGGNGGFGQPSFGQAPLWKGPAT SQSTLPFSQPTFGTQPAFGQPAASTATSSAGSLFGCTSSASSFSFGQASNTSGTSTSGVLFGQSSAPVFG QSAAFPQAAPAFGSASVSTTTTASFGFGQPAGFASGTSGSLFNPSQSGSTSVFGQQPASSSGGLFGAGSG GASTVGLFSGLGAKPSQEAANKNPFGSPGSSGFGSAGASNSSNLFGNSGAKAFGFGGTSFGDKPSATFSA GGSVASQGFSFNSPTKTGGFGAAPVFGSPPTFGGSPGFGGSPAFGTAAAFSNTLGSTGGKVFGEGTSAAT TGGFGFGSNSSTAAFGSLATQNTPTFGSISQQSPGFGGQSSGFSGFGAGPGAAAGNTGGFGFGVSNPTSP GFGCWRS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 734 803 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7tdz 2024-10-09 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1478 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1478 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 36.000 11.429 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MVKLDIHTLAHHLKQERLYVNSEKQLIQRLNADVLKTAEKLYRTAWIAKQQRINLDRLIITSAEASPAECCQHAKILEDTQFVDGYKQLGFQETAYGEFLSRLRENPRLIASSLVAGEKLNQENTQSVIYTVFTSLYGNCIMQEDESYLLQVLRYLIEFELKESDNPRRLLRRGTCAFSILFKLFSEGLFSAKLFLTATLHEPIMQLLVEDEDHLETDPNKLIERFSPSQQEKLFGEKGSDRFRQKVQEMVESNEAKLVALVNKFIGYLKQNTYCFPHSLRWIVSQMYKTLSCVDRLEVGEVRAMCTDLLLACFICPAVVNPEQYGIISDAPINEVARFNLMQVGRLLQQLAMTGSEEGDPRTKSSLGKFDKSCVAAFLDVVIGGRAVETPPLSSVNLLEGLSRTVVYITYSQLITLVNFMKSVMSGDQLREDRMALDNLLANLPPAKPGKSSSLEMTPYNTPQLSPATTPANKKNRLPIATRSRSRTNMLMDLHMDHEGSSQETIQEVQPEEVLVISLGTGPQLTPGMMSENEVLNMQLSDGGQGDVPVDENKLHGKPDKTLRFSLCSDNLEGISEGPSNRSNSVSSLDLEGESVSELGAGPSGSNGVEALQLLEHEQATTQDNLDDKLRKFEIRDMMGLTDDRDISETVSETWSTDVLGSDFDPNIDEDRLQEIAGAAAENMLGSLLCLPGSGSVLLDPCTGSTISETTSEAWSVEVLPSDSEAPDLKQEERLQELESCSGLGSTSDDTDVREVSSRPSTPGLSVVSGISATSEDIPNKIEDLRSECSSDFGGKDSVTSPDMDEITHGAHQLTSPPSQSESLLAMFDPLSSHEGASAVVRPKVHYARPSHPPPDPPILEGAVGGNEARLPNFGSHVLTPAEMEAFKQRHSYPERLVRSRSSDIVSSVRRPMSDPSWNRRPGNEERELPPAAAIGATSLVAAPHSSSSSPSKDSSRGETEERKDSDDEKSDRNRPWWRKRFVSAMPKAPIPFRKKEKQEKDKDDLGPDRFSTLTDDPSPRLSAQAQVAEDILDKYRNAIKRTSPSDGAMANYESTGDNHDRDLSSKLLYHSDKEVMGDGESAHDSPRDEALQNISADDLPDSASQAAHPQDSAFSYRDAKKKLRLALCSADSVAFPVLTHSTRNGLPDHTDPEDNEIVCFLKVQIAEAINLQDKNLMAQLQETMRCVCRFDNRTCRKLLASIAEDYRKRAPYIAYLTRCRQGLQTTQAHLERLLQRVLRDKEVANRYFTTVCVRLLLESKEKKIREFIQDFQKLTAADDKTAQVEDFLQFLYGAMAQDVIWQNASEEQLQDAQLAIERSVMNRIFKLAFYPNQDGDILRDQVLHEHIQRLSKVVTANHRALQIPEVYLREAPWPSAQSEIRTISAYKTPRDKVQCILRMCSTIMNLLSLANEDSVPGADDFVPVLVFVLIKANPPCLLSTVQYISSFYASCLSGEESYWWMQFTAAVEFIKTIDDRK 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QVGSEEEKRQLRT-ESDGLHSFFLEIKETTESLRGEFSAM---KIKNLEGFASIEDVQQRNKLKQDPKYLQLLY----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7tdz.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 9' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . MET 1178 1178 ? A 446.071 349.879 352.728 1 1 3 MET 0.190 1 ATOM 2 C CA . MET 1178 1178 ? A 446.180 351.015 351.753 1 1 3 MET 0.190 1 ATOM 3 C C . MET 1178 1178 ? A 444.804 351.413 351.269 1 1 3 MET 0.190 1 ATOM 4 O O . MET 1178 1178 ? A 444.270 350.820 350.340 1 1 3 MET 0.190 1 ATOM 5 C CB . MET 1178 1178 ? A 447.113 350.592 350.581 1 1 3 MET 0.190 1 ATOM 6 C CG . MET 1178 1178 ? A 447.417 351.699 349.543 1 1 3 MET 0.190 1 ATOM 7 S SD . MET 1178 1178 ? A 448.558 351.172 348.224 1 1 3 MET 0.190 1 ATOM 8 C CE . MET 1178 1178 ? A 450.081 351.094 349.216 1 1 3 MET 0.190 1 ATOM 9 N N . ALA 1179 1179 ? A 444.162 352.401 351.932 1 1 3 ALA 0.210 1 ATOM 10 C CA . ALA 1179 1179 ? A 442.877 352.917 351.521 1 1 3 ALA 0.210 1 ATOM 11 C C . ALA 1179 1179 ? A 443.095 353.915 350.412 1 1 3 ALA 0.210 1 ATOM 12 O O . ALA 1179 1179 ? A 443.129 355.121 350.641 1 1 3 ALA 0.210 1 ATOM 13 C CB . ALA 1179 1179 ? A 442.172 353.603 352.706 1 1 3 ALA 0.210 1 ATOM 14 N N . GLN 1180 1180 ? A 443.282 353.381 349.189 1 1 3 GLN 0.250 1 ATOM 15 C CA . GLN 1180 1180 ? A 443.633 354.131 348.013 1 1 3 GLN 0.250 1 ATOM 16 C C . GLN 1180 1180 ? A 444.990 354.799 348.087 1 1 3 GLN 0.250 1 ATOM 17 O O . GLN 1180 1180 ? A 445.684 354.847 349.104 1 1 3 GLN 0.250 1 ATOM 18 C CB . GLN 1180 1180 ? A 442.520 355.150 347.634 1 1 3 GLN 0.250 1 ATOM 19 C CG . GLN 1180 1180 ? A 441.145 354.496 347.379 1 1 3 GLN 0.250 1 ATOM 20 C CD . GLN 1180 1180 ? A 441.236 353.643 346.119 1 1 3 GLN 0.250 1 ATOM 21 O OE1 . GLN 1180 1180 ? A 441.815 354.059 345.115 1 1 3 GLN 0.250 1 ATOM 22 N NE2 . GLN 1180 1180 ? A 440.683 352.412 346.160 1 1 3 GLN 0.250 1 ATOM 23 N N . LEU 1181 1181 ? A 445.422 355.353 346.951 1 1 3 LEU 0.290 1 ATOM 24 C CA . LEU 1181 1181 ? A 446.384 356.410 346.947 1 1 3 LEU 0.290 1 ATOM 25 C C . LEU 1181 1181 ? A 445.644 357.637 347.496 1 1 3 LEU 0.290 1 ATOM 26 O O . LEU 1181 1181 ? A 444.559 357.952 347.040 1 1 3 LEU 0.290 1 ATOM 27 C CB . LEU 1181 1181 ? A 446.906 356.554 345.473 1 1 3 LEU 0.290 1 ATOM 28 C CG . LEU 1181 1181 ? A 447.486 355.239 344.846 1 1 3 LEU 0.290 1 ATOM 29 C CD1 . LEU 1181 1181 ? A 447.814 355.344 343.339 1 1 3 LEU 0.290 1 ATOM 30 C CD2 . LEU 1181 1181 ? A 448.737 354.723 345.580 1 1 3 LEU 0.290 1 ATOM 31 N N . GLN 1182 1182 ? A 446.208 358.376 348.491 1 1 3 GLN 0.390 1 ATOM 32 C CA . GLN 1182 1182 ? A 445.865 359.779 348.818 1 1 3 GLN 0.390 1 ATOM 33 C C . GLN 1182 1182 ? A 445.692 360.718 347.610 1 1 3 GLN 0.390 1 ATOM 34 O O . GLN 1182 1182 ? A 445.057 361.750 347.677 1 1 3 GLN 0.390 1 ATOM 35 C CB . GLN 1182 1182 ? A 446.955 360.446 349.718 1 1 3 GLN 0.390 1 ATOM 36 C CG . GLN 1182 1182 ? A 446.960 360.017 351.206 1 1 3 GLN 0.390 1 ATOM 37 C CD . GLN 1182 1182 ? A 448.146 360.635 351.959 1 1 3 GLN 0.390 1 ATOM 38 O OE1 . GLN 1182 1182 ? A 449.168 360.995 351.370 1 1 3 GLN 0.390 1 ATOM 39 N NE2 . GLN 1182 1182 ? A 448.034 360.756 353.300 1 1 3 GLN 0.390 1 ATOM 40 N N . GLU 1183 1183 ? A 446.284 360.338 346.459 1 1 3 GLU 0.500 1 ATOM 41 C CA . GLU 1183 1183 ? A 445.993 360.858 345.143 1 1 3 GLU 0.500 1 ATOM 42 C C . GLU 1183 1183 ? A 444.577 360.621 344.635 1 1 3 GLU 0.500 1 ATOM 43 O O . GLU 1183 1183 ? A 443.901 361.555 344.220 1 1 3 GLU 0.500 1 ATOM 44 C CB . GLU 1183 1183 ? A 446.980 360.181 344.167 1 1 3 GLU 0.500 1 ATOM 45 C CG . GLU 1183 1183 ? A 447.008 360.846 342.774 1 1 3 GLU 0.500 1 ATOM 46 C CD . GLU 1183 1183 ? A 447.367 362.326 342.887 1 1 3 GLU 0.500 1 ATOM 47 O OE1 . GLU 1183 1183 ? A 446.898 363.126 342.044 1 1 3 GLU 0.500 1 ATOM 48 O OE2 . GLU 1183 1183 ? A 448.089 362.686 343.860 1 1 3 GLU 0.500 1 ATOM 49 N N . THR 1184 1184 ? A 444.042 359.383 344.741 1 1 3 THR 0.570 1 ATOM 50 C CA . THR 1184 1184 ? A 442.674 359.018 344.364 1 1 3 THR 0.570 1 ATOM 51 C C . THR 1184 1184 ? A 441.681 359.825 345.165 1 1 3 THR 0.570 1 ATOM 52 O O . THR 1184 1184 ? A 440.759 360.409 344.610 1 1 3 THR 0.570 1 ATOM 53 C CB . THR 1184 1184 ? A 442.340 357.544 344.609 1 1 3 THR 0.570 1 ATOM 54 O OG1 . THR 1184 1184 ? A 443.203 356.676 343.889 1 1 3 THR 0.570 1 ATOM 55 C CG2 . THR 1184 1184 ? A 440.906 357.182 344.185 1 1 3 THR 0.570 1 ATOM 56 N N . MET 1185 1185 ? A 441.884 359.965 346.495 1 1 3 MET 0.420 1 ATOM 57 C CA . MET 1185 1185 ? A 441.046 360.807 347.337 1 1 3 MET 0.420 1 ATOM 58 C C . MET 1185 1185 ? A 441.053 362.264 346.916 1 1 3 MET 0.420 1 ATOM 59 O O . MET 1185 1185 ? A 440.016 362.920 346.865 1 1 3 MET 0.420 1 ATOM 60 C CB . MET 1185 1185 ? A 441.486 360.731 348.822 1 1 3 MET 0.420 1 ATOM 61 C CG . MET 1185 1185 ? A 441.197 359.369 349.483 1 1 3 MET 0.420 1 ATOM 62 S SD . MET 1185 1185 ? A 439.435 358.894 349.479 1 1 3 MET 0.420 1 ATOM 63 C CE . MET 1185 1185 ? A 438.820 360.194 350.594 1 1 3 MET 0.420 1 ATOM 64 N N . ARG 1186 1186 ? A 442.232 362.803 346.558 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 65 C CA . ARG 1186 1186 ? A 442.316 364.130 345.995 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 66 C C . ARG 1186 1186 ? A 441.632 364.262 344.653 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 67 O O . ARG 1186 1186 ? A 440.881 365.209 344.462 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 68 C CB . ARG 1186 1186 ? A 443.782 364.589 345.863 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 69 C CG . ARG 1186 1186 ? A 444.359 365.042 347.216 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 70 C CD . ARG 1186 1186 ? A 445.750 365.669 347.120 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 71 N NE . ARG 1186 1186 ? A 446.713 364.574 346.809 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 72 C CZ . ARG 1186 1186 ? A 447.947 364.775 346.336 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 73 N NH1 . ARG 1186 1186 ? A 448.339 365.968 345.898 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 74 N NH2 . ARG 1186 1186 ? A 448.789 363.752 346.221 1 1 3 ARG 0.420 1 ATOM 75 N N . CYS 1187 1187 ? A 441.826 363.320 343.712 1 1 3 CYS 0.600 1 ATOM 76 C CA . CYS 1187 1187 ? A 441.202 363.327 342.398 1 1 3 CYS 0.600 1 ATOM 77 C C . CYS 1187 1187 ? A 439.683 363.297 342.451 1 1 3 CYS 0.600 1 ATOM 78 O O . CYS 1187 1187 ? A 439.038 364.165 341.856 1 1 3 CYS 0.600 1 ATOM 79 C CB . CYS 1187 1187 ? 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A 437.883 365.663 346.977 1 1 3 CYS 0.590 1 ATOM 93 S SG . CYS 1189 1189 ? A 437.151 364.385 348.053 1 1 3 CYS 0.590 1 ATOM 94 N N . ARG 1190 1190 ? A 438.478 366.594 343.589 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 95 C CA . ARG 1190 1190 ? A 439.012 367.687 342.803 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 96 C C . ARG 1190 1190 ? A 438.254 367.814 341.502 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 97 O O . ARG 1190 1190 ? A 437.301 368.582 341.394 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 98 C CB . ARG 1190 1190 ? A 440.518 367.462 342.529 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 99 C CG . ARG 1190 1190 ? A 441.246 368.579 341.768 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 100 C CD . ARG 1190 1190 ? A 442.728 368.246 341.653 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 101 N NE . ARG 1190 1190 ? A 443.357 369.384 340.923 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 102 C CZ . ARG 1190 1190 ? A 444.648 369.399 340.570 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 103 N NH1 . ARG 1190 1190 ? A 445.463 368.406 340.912 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 104 N NH2 . ARG 1190 1190 ? A 445.119 370.402 339.835 1 1 3 ARG 0.350 1 ATOM 105 N N . PHE 1191 1191 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #