data_SMR-162bfb1154ca0fc5729d25086ca2269f_4 _entry.id SMR-162bfb1154ca0fc5729d25086ca2269f_4 _struct.entry_id SMR-162bfb1154ca0fc5729d25086ca2269f_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9BQS8 (isoform 2)/ FYCO1_HUMAN, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.032, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9BQS8 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 196059.239 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP FYCO1_HUMAN Q9BQS8 1 ;MASTNAESQLQRIIRDLQDAVTELSKEFQEAGEPITDDSTSLHKFSYKLEYLLQFDQKEKATLLGNKKDY WDYFCACLAKVKGANDGIRFVKSISELRTSLGKGRAFIRYSLVHQRLADTLQQCFMNTKVTSDWYYARSP FLQPKLSSDIVGQLYELTEVQFDLASRGFDLDAAWPTFARRTLTTGSSAYLWKPPSRSSSMSSLVSSYLQ TQEMVSNFDLNSPLNNEALEGFDEMRLELDQLEVREKQLRERMQQLDRENQELRAAVSQQGEQLQTERER GRTAAEDNVRLTCLVAELQKQWEVTQATQNTVKELQTCLQGLELGAAEKEEDYHTALRRLESMLQPLAQE LEATRDSLDKKNQHLASFPGWLAMAQQKADTASDTKGRQEPIPSDAAQEMQELGEKLQALERERTKVEEV NRQQSAQLEQLVKELQLKEDARASLERLVKEMAPLQEELSGKGQEADQLWRRLQELLAHTSSWEEELAEL RREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFLETQLAQVSQHVSDLEEQKKQLIQDKDHLSQQVGMLERLAGPP GPELPVAGEKNEALVPVNSSLQEAWGKPEEEQRGLQEAQLDDTKVQEGSQEEELRQANRELEKELQNVVG RNQLLEGKLQALQADYQALQQRESAIQGSLASLEAEQASIRHLGDQMEASLLAVRKAKEAMKAQMAEKEA ILQSKEGECQQLREEVEQCQQLAEARHRELRALESQCQQQTQLIEVLTAEKGQQGVGPPTDNEARELAAQ LALSQAQLEVHQGEVQRLQAQVVDLQAKMRAALDDQDKVQSQLSMAEAVLREHKTLVQQLKEQNEALNRA HVQELLQCSEREGALQEERADEAQQREEELRALQEELSQAKCSSEEAQLEHAELQEQLHRANTDTAELGI QVCALTVEKERVEEALACAVQELQDAKEAASREREGLERQVAGLQQEKESLQEKLKAAKAAAGSLPGLQA QLAQAEQRAQSLQEAAHQELNTLKFQLSAEIMDYQSRLKNAGEECKSLRGQLEEQGRQLQAAEEAVEKLK ATQADMGEKLSCTSNHLAECQAAMLRKDKEGAALREDLERTQKELEKATTKIQEYYNKLCQEVTNRERND QKMLADLDDLNRTKKYLEERLIELLRDKDALWQKSDALEFQQKLSAEERWLGDTEANHCLDCKREFSWMV RRHHCRICGRIFCYYCCNNYVLSKHGGKKERCCRACFQKLSEGPGSPDSSGSGTSQGEPSPALSPASPGP QATGGQGANTDYRPPDDAVFDIITDEELCQIQESGSSLPETPTETDSLDPNAAEQASVGASKGLGNLLCE SSACRDTTSTSLTPEDTEDMPVGQDSEICLLKSGELMIKVPLTVDEIASFGEGSRELFVRSSTYSLIPIT VAEAGLTISWVFSSDPKSISFSVVFQEAEDTPLDQCKVLIPTTRCNSHKENIQGQLKVRTPGIYMLIFDN TFSRFVSKKVFYHLTVDRPVIYDGSDFL ; 'FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1498 1 1498 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . FYCO1_HUMAN Q9BQS8 Q9BQS8-2 1 1498 9606 'Homo sapiens (Human)' 2011-02-08 BF5ABFEDF2712834 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MASTNAESQLQRIIRDLQDAVTELSKEFQEAGEPITDDSTSLHKFSYKLEYLLQFDQKEKATLLGNKKDY WDYFCACLAKVKGANDGIRFVKSISELRTSLGKGRAFIRYSLVHQRLADTLQQCFMNTKVTSDWYYARSP FLQPKLSSDIVGQLYELTEVQFDLASRGFDLDAAWPTFARRTLTTGSSAYLWKPPSRSSSMSSLVSSYLQ TQEMVSNFDLNSPLNNEALEGFDEMRLELDQLEVREKQLRERMQQLDRENQELRAAVSQQGEQLQTERER GRTAAEDNVRLTCLVAELQKQWEVTQATQNTVKELQTCLQGLELGAAEKEEDYHTALRRLESMLQPLAQE LEATRDSLDKKNQHLASFPGWLAMAQQKADTASDTKGRQEPIPSDAAQEMQELGEKLQALERERTKVEEV NRQQSAQLEQLVKELQLKEDARASLERLVKEMAPLQEELSGKGQEADQLWRRLQELLAHTSSWEEELAEL RREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFLETQLAQVSQHVSDLEEQKKQLIQDKDHLSQQVGMLERLAGPP GPELPVAGEKNEALVPVNSSLQEAWGKPEEEQRGLQEAQLDDTKVQEGSQEEELRQANRELEKELQNVVG 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# loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GPGSSDSKQHIEVLKESLTAKEQRAAILQTEVDALRLRLEEKETMLNKKTKQIQDMAEEKGTQAGEIHDL KDMLDVKERKVNVLQKKIENLQEQLRDKEKQMSSLKERVKSLQADTTNTDTALTTLEEALADKERTIERL KEQRDR ; ;GPGSSDSKQHIEVLKESLTAKEQRAAILQTEVDALRLRLEEKETMLNKKTKQIQDMAEEKGTQAGEIHDL KDMLDVKERKVNVLQKKIENLQEQLRDKEKQMSSLKERVKSLQADTTNTDTALTTLEEALADKERTIERL KEQRDR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 22 108 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8i3e 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1498 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1498 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.280 19.540 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MASTNAESQLQRIIRDLQDAVTELSKEFQEAGEPITDDSTSLHKFSYKLEYLLQFDQKEKATLLGNKKDYWDYFCACLAKVKGANDGIRFVKSISELRTSLGKGRAFIRYSLVHQRLADTLQQCFMNTKVTSDWYYARSPFLQPKLSSDIVGQLYELTEVQFDLASRGFDLDAAWPTFARRTLTTGSSAYLWKPPSRSSSMSSLVSSYLQTQEMVSNFDLNSPLNNEALEGFDEMRLELDQLEVREKQLRERMQQLDRENQELRAAVSQQGEQLQTERERGRTAAEDNVRLTCLVAELQKQWEVTQATQNTVKELQTCLQGLELGAAEKEEDYHTALRRLESMLQPLAQELEATRDSLDKKNQHLASFPGWLAMAQQKADTASDTKGRQEPIPSDAAQEMQELGEKLQALERERTKVEEVNRQQSAQLEQLVKELQLKEDARASLERLVKEMAPLQEELSGKGQEADQLWRRLQELLAHTSSWEEELAELRREKKQQQEEKELLEQEVRSLTRQLQFLETQLAQVSQHVSDLEEQKKQLIQDKDHLSQQVGMLERLAGPPGPELPVAGEKNEALVPVNSSLQEAWGKPEEEQRGLQEAQLDDTKVQEGSQEEELRQANRELEKELQNVVGRNQLLEGKLQALQADYQALQQRESAIQGSLASLEAEQASIRHLGDQMEASLLAVRKAKEAMKAQMAEKEAILQSKEGECQQLREEVEQCQQLAEARHRELRALESQCQQQTQLIEVLTAEKGQQGVGPPTDNEARELAAQLALSQAQLEVHQGEVQRLQAQVVDLQAKMRAALDDQDKVQSQLSMAEAVLREHKTLVQQLKEQNEALNRAHVQELLQCSEREGALQEERADEAQQREEELRALQEELSQAKCSSEEAQLEHAELQEQLHRANTDTAELGIQVCALTVEKERVEEALACAVQELQDAKEAASREREGLERQVAGLQQEKESLQEKLKAAKAAAGSLPGLQAQLAQAEQRAQSLQEAAHQELNTLKFQLSAEIMDYQSRLKNAGEECKSLRGQLEEQGRQLQAAEEAVEKLKATQADMGEKLSCTSNHLAECQAAMLRKDKEGAALREDLERTQKELEKATTKIQEYYNKLCQEVTNRERNDQKMLADLDDLNRTKKYLEERLIELLRDKDALWQKSDALEFQQKLSAEERWLGDTEANHCLDCKREFSWMVRRHHCRICGRIFCYYCCNNYVLSKHGGKKERCCRACFQKLSEGPGSPDSSGSGTSQGEPSPALSPASPGPQATGGQGANTDYRPPDDAVFDIITDEELCQIQESGSSLPETPTETDSLDPNAAEQASVGASKGLGNLLCESSACRDTTSTSLTPEDTEDMPVGQDSEICLLKSGELMIKVPLTVDEIASFGEGSRELFVRSSTYSLIPITVAEAGLTISWVFSSDPKSISFSVVFQEAEDTPLDQCKVLIPTTRCNSHKENIQGQLKVRTPGIYMLIFDNTFSRFVSKKVFYHLTVDRPVIYDGSDFL 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EQRAAILQTEVDALRLRLEEKETMLNKKTKQIQDMAEEKGTQAGEIHDLKDMLDV---KERKVNVLQKKIENLQEQLRDKEKQMSSLKER------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.157}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8i3e.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 250 250 ? A 25.643 90.461 -17.808 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 2 C CA . ARG 250 250 ? A 25.434 90.372 -16.318 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 3 C C . ARG 250 250 ? A 24.210 89.590 -15.873 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 4 O O . ARG 250 250 ? A 24.383 88.607 -15.164 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 5 C CB . ARG 250 250 ? A 25.505 91.763 -15.648 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 6 C CG . ARG 250 250 ? A 26.919 92.387 -15.670 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 7 C CD . ARG 250 250 ? A 27.083 93.616 -14.760 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 8 N NE . ARG 250 250 ? A 26.181 94.698 -15.276 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 9 C CZ . ARG 250 250 ? A 26.509 95.597 -16.219 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 250 250 ? A 27.694 95.600 -16.818 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 250 250 ? A 25.623 96.526 -16.570 1 1 A ARG 0.330 1 ATOM 12 N N . GLU 251 251 ? A 22.982 89.929 -16.334 1 1 A GLU 0.420 1 ATOM 13 C CA . GLU 251 251 ? A 21.753 89.174 -16.050 1 1 A GLU 0.420 1 ATOM 14 C C . GLU 251 251 ? A 21.890 87.698 -16.406 1 1 A GLU 0.420 1 ATOM 15 O O . GLU 251 251 ? A 21.550 86.792 -15.648 1 1 A GLU 0.420 1 ATOM 16 C CB . GLU 251 251 ? A 20.591 89.790 -16.874 1 1 A GLU 0.420 1 ATOM 17 C CG . GLU 251 251 ? A 19.213 89.113 -16.667 1 1 A GLU 0.420 1 ATOM 18 C CD . GLU 251 251 ? A 18.750 89.167 -15.210 1 1 A GLU 0.420 1 ATOM 19 O OE1 . GLU 251 251 ? A 18.067 88.192 -14.794 1 1 A GLU 0.420 1 ATOM 20 O OE2 . GLU 251 251 ? A 19.085 90.162 -14.529 1 1 A GLU 0.420 1 ATOM 21 N N . ARG 252 252 ? A 22.528 87.419 -17.566 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 22 C CA . ARG 252 252 ? A 22.845 86.061 -17.965 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 23 C C . ARG 252 252 ? A 23.691 85.275 -16.966 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 24 O O . ARG 252 252 ? A 23.366 84.136 -16.658 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 25 C CB . ARG 252 252 ? A 23.571 86.017 -19.335 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 26 C CG . ARG 252 252 ? A 23.766 84.586 -19.897 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 27 C CD . ARG 252 252 ? A 22.433 83.843 -20.030 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 28 N NE . ARG 252 252 ? A 22.642 82.460 -20.558 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 29 C CZ . ARG 252 252 ? A 21.667 81.539 -20.491 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 30 N NH1 . ARG 252 252 ? A 20.479 81.837 -19.972 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 31 N NH2 . ARG 252 252 ? A 21.870 80.291 -20.898 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 32 N N . MET 253 253 ? A 24.769 85.880 -16.430 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 33 C CA . MET 253 253 ? A 25.607 85.311 -15.387 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 34 C C . MET 253 253 ? A 24.859 85.114 -14.068 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 35 O O . MET 253 253 ? A 24.946 84.057 -13.462 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 36 C CB . MET 253 253 ? A 26.905 86.146 -15.201 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 37 C CG . MET 253 253 ? A 27.867 86.099 -16.411 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 38 S SD . MET 253 253 ? A 28.402 84.423 -16.889 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 39 C CE . MET 253 253 ? A 29.352 84.026 -15.391 1 1 A MET 0.620 1 ATOM 40 N N . GLN 254 254 ? A 24.037 86.076 -13.612 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 41 C CA . GLN 254 254 ? A 23.249 85.931 -12.389 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 42 C C . GLN 254 254 ? A 22.234 84.797 -12.413 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 43 O O . GLN 254 254 ? A 22.047 84.060 -11.442 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 44 C CB . GLN 254 254 ? A 22.504 87.238 -12.075 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 45 C CG . GLN 254 254 ? A 23.461 88.370 -11.653 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 46 C CD . GLN 254 254 ? A 22.667 89.648 -11.403 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 47 O OE1 . GLN 254 254 ? A 21.622 89.883 -11.996 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 48 N NE2 . GLN 254 254 ? A 23.172 90.530 -10.510 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 49 N N . GLN 255 255 ? A 21.551 84.607 -13.555 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 50 C CA . GLN 255 255 ? A 20.768 83.409 -13.780 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 51 C C . GLN 255 255 ? A 21.640 82.143 -13.809 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 52 O O . GLN 255 255 ? A 21.328 81.158 -13.138 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 53 C CB . GLN 255 255 ? A 19.898 83.558 -15.047 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 54 C CG . GLN 255 255 ? A 18.836 84.681 -14.918 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 55 C CD . GLN 255 255 ? A 18.028 84.868 -16.207 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 56 O OE1 . GLN 255 255 ? A 17.881 83.950 -17.017 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 57 N NE2 . GLN 255 255 ? A 17.477 86.086 -16.405 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 58 N N . LEU 256 256 ? A 22.805 82.189 -14.500 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 59 C CA . LEU 256 256 ? A 23.808 81.123 -14.512 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 60 C C . LEU 256 256 ? A 24.392 80.708 -13.158 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 61 O O . LEU 256 256 ? A 24.661 79.532 -12.923 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 62 C CB . LEU 256 256 ? A 24.931 81.303 -15.564 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 63 C CG . LEU 256 256 ? A 24.525 81.173 -17.048 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 64 C CD1 . LEU 256 256 ? A 25.739 81.536 -17.914 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 65 C CD2 . LEU 256 256 ? A 24.019 79.773 -17.408 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 66 N N . ASP 257 257 ? A 24.589 81.641 -12.220 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 67 C CA . ASP 257 257 ? A 24.999 81.356 -10.861 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 68 C C . ASP 257 257 ? A 23.920 80.650 -10.051 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 69 O O . ASP 257 257 ? A 24.188 79.676 -9.340 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 70 C CB . ASP 257 257 ? A 25.434 82.673 -10.176 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 71 C CG . ASP 257 257 ? 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A -4.658 -26.746 18.276 1 1 A ARG 0.400 1 ATOM 715 C CD . ARG 338 338 ? A -4.061 -26.892 16.884 1 1 A ARG 0.400 1 ATOM 716 N NE . ARG 338 338 ? A -4.526 -25.711 16.095 1 1 A ARG 0.400 1 ATOM 717 C CZ . ARG 338 338 ? A -5.699 -25.642 15.454 1 1 A ARG 0.400 1 ATOM 718 N NH1 . ARG 338 338 ? A -6.573 -26.644 15.452 1 1 A ARG 0.400 1 ATOM 719 N NH2 . ARG 338 338 ? A -6.032 -24.514 14.827 1 1 A ARG 0.400 1 ATOM 720 N N . ARG 339 339 ? A -3.387 -26.787 22.111 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 721 C CA . ARG 339 339 ? A -3.001 -27.851 23.029 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 722 C C . ARG 339 339 ? A -3.914 -28.008 24.282 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 723 O O . ARG 339 339 ? A -4.803 -27.153 24.520 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 724 C CB . ARG 339 339 ? A -1.572 -27.572 23.572 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 725 C CG . ARG 339 339 ? A -0.469 -28.413 22.920 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 726 C CD . ARG 339 339 ? A 0.914 -28.151 23.516 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 727 N NE . ARG 339 339 ? A 1.326 -26.788 23.038 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 728 C CZ . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.632 2 1 3 0.032 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 250 ARG 1 0.330 2 1 A 251 GLU 1 0.420 3 1 A 252 ARG 1 0.590 4 1 A 253 MET 1 0.620 5 1 A 254 GLN 1 0.690 6 1 A 255 GLN 1 0.720 7 1 A 256 LEU 1 0.710 8 1 A 257 ASP 1 0.720 9 1 A 258 ARG 1 0.690 10 1 A 259 GLU 1 0.730 11 1 A 260 ASN 1 0.730 12 1 A 261 GLN 1 0.730 13 1 A 262 GLU 1 0.720 14 1 A 263 LEU 1 0.710 15 1 A 264 ARG 1 0.640 16 1 A 265 ALA 1 0.760 17 1 A 266 ALA 1 0.760 18 1 A 267 VAL 1 0.700 19 1 A 268 SER 1 0.690 20 1 A 269 GLN 1 0.680 21 1 A 270 GLN 1 0.670 22 1 A 271 GLY 1 0.720 23 1 A 272 GLU 1 0.680 24 1 A 273 GLN 1 0.700 25 1 A 274 LEU 1 0.680 26 1 A 275 GLN 1 0.710 27 1 A 276 THR 1 0.720 28 1 A 277 GLU 1 0.690 29 1 A 278 ARG 1 0.640 30 1 A 279 GLU 1 0.680 31 1 A 280 ARG 1 0.610 32 1 A 281 GLY 1 0.690 33 1 A 282 ARG 1 0.590 34 1 A 283 THR 1 0.650 35 1 A 284 ALA 1 0.700 36 1 A 285 ALA 1 0.700 37 1 A 286 GLU 1 0.650 38 1 A 287 ASP 1 0.640 39 1 A 288 ASN 1 0.650 40 1 A 289 VAL 1 0.680 41 1 A 290 ARG 1 0.610 42 1 A 291 LEU 1 0.650 43 1 A 292 THR 1 0.660 44 1 A 293 CYS 1 0.650 45 1 A 294 LEU 1 0.650 46 1 A 295 VAL 1 0.670 47 1 A 296 ALA 1 0.670 48 1 A 297 GLU 1 0.600 49 1 A 298 LEU 1 0.550 50 1 A 299 GLN 1 0.560 51 1 A 300 LYS 1 0.630 52 1 A 301 GLN 1 0.630 53 1 A 302 TRP 1 0.500 54 1 A 303 GLU 1 0.390 55 1 A 304 VAL 1 0.380 56 1 A 305 THR 1 0.530 57 1 A 306 GLN 1 0.540 58 1 A 307 ALA 1 0.610 59 1 A 308 THR 1 0.680 60 1 A 309 GLN 1 0.680 61 1 A 310 ASN 1 0.630 62 1 A 311 THR 1 0.650 63 1 A 312 VAL 1 0.610 64 1 A 313 LYS 1 0.600 65 1 A 314 GLU 1 0.610 66 1 A 315 LEU 1 0.620 67 1 A 316 GLN 1 0.640 68 1 A 317 THR 1 0.640 69 1 A 318 CYS 1 0.630 70 1 A 319 LEU 1 0.620 71 1 A 320 GLN 1 0.620 72 1 A 321 GLY 1 0.630 73 1 A 322 LEU 1 0.570 74 1 A 323 GLU 1 0.590 75 1 A 324 LEU 1 0.550 76 1 A 325 GLY 1 0.620 77 1 A 326 ALA 1 0.650 78 1 A 327 ALA 1 0.660 79 1 A 328 GLU 1 0.610 80 1 A 329 LYS 1 0.630 81 1 A 330 GLU 1 0.650 82 1 A 331 GLU 1 0.660 83 1 A 332 ASP 1 0.670 84 1 A 333 TYR 1 0.640 85 1 A 334 HIS 1 0.620 86 1 A 335 THR 1 0.650 87 1 A 336 ALA 1 0.680 88 1 A 337 LEU 1 0.590 89 1 A 338 ARG 1 0.400 90 1 A 339 ARG 1 0.340 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #