data_SMR-db1a21e1278b43d8ffcf595589db7f56_2 _entry.id SMR-db1a21e1278b43d8ffcf595589db7f56_2 _struct.entry_id SMR-db1a21e1278b43d8ffcf595589db7f56_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P41229 (isoform 2)/ KDM5C_HUMAN, Lysine-specific demethylase 5C Estimated model accuracy of this model is 0.053, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P41229 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 198071.166 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KDM5C_HUMAN P41229 1 ;MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQ RLNELEIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVQCNTRPF DNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLM AKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQF IESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATRE YTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRH LTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEP KTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAY HSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMF IMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCS SSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSEL LQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVE AYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMR GLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQA LKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLK KNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGI LQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSP LLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDV TALLGRLAELRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSDL ELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAE RHGSRARGRALERRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTT GSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL ; 'Lysine-specific demethylase 5C' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1516 1 1516 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . KDM5C_HUMAN P41229 P41229-2 1 1516 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-11-14 F82BDA8A82C57C01 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQ RLNELEIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVQCNTRPF DNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLM AKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQF IESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATRE YTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRH LTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEP KTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAY HSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMF IMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCS SSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSEL LQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVE AYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMR GLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQA LKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLK KNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGI LQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSP LLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDV TALLGRLAELRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSDL ELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAE RHGSRARGRALERRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTT GSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL ; ;MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQ 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KNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGI LQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSP LLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDV TALLGRLAELRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSDL ELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAE RHGSRARGRALERRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTT GSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 PRO . 1 4 GLY . 1 5 SER . 1 6 ASP . 1 7 ASP . 1 8 PHE . 1 9 LEU . 1 10 PRO . 1 11 PRO . 1 12 PRO . 1 13 GLU . 1 14 CYS . 1 15 PRO . 1 16 VAL . 1 17 PHE . 1 18 GLU . 1 19 PRO . 1 20 SER . 1 21 TRP . 1 22 ALA . 1 23 GLU . 1 24 PHE . 1 25 ARG . 1 26 ASP . 1 27 PRO . 1 28 LEU . 1 29 GLY . 1 30 TYR . 1 31 ILE . 1 32 ALA . 1 33 LYS . 1 34 ILE . 1 35 ARG . 1 36 PRO . 1 37 ILE . 1 38 ALA . 1 39 GLU . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Histone demethylase JARID1C {PDB ID=2jrz, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2jrz.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2jrz, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SMNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQR LNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVCNTRPFDNEEKDK ; ;SMNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQR LNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVCNTRPFDNEEKDK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 11 102 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2jrz 2024-05-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1516 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1517 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.2e-06 73.626 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNEL-EIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVQCNTRPFDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSDLELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAERHGSRARGRALERRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL 2 1 2 -------------------------VKLNYLDQIAKFWEIQGSSL-KIPN-------VE-------RRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGAN----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2jrz.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 26 26 ? A 15.250 2.879 -10.176 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 2 C CA . ASP 26 26 ? A 14.443 1.986 -9.257 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 3 C C . ASP 26 26 ? A 13.135 2.618 -8.833 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 4 O O . ASP 26 26 ? A 12.094 2.024 -9.108 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 5 C CB . ASP 26 26 ? A 15.330 1.513 -8.072 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 6 C CG . ASP 26 26 ? A 16.527 0.779 -8.639 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 26 26 ? A 16.553 0.661 -9.893 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 26 26 ? A 17.451 0.500 -7.856 1 1 A ASP 0.460 1 ATOM 9 N N . PRO 27 27 ? A 13.079 3.828 -8.258 1 1 A PRO 0.470 1 ATOM 10 C CA . PRO 27 27 ? A 11.800 4.482 -8.026 1 1 A PRO 0.470 1 ATOM 11 C C . PRO 27 27 ? A 11.018 4.777 -9.291 1 1 A PRO 0.470 1 ATOM 12 O O . PRO 27 27 ? A 9.891 4.319 -9.385 1 1 A PRO 0.470 1 ATOM 13 C CB . PRO 27 27 ? A 12.132 5.781 -7.272 1 1 A PRO 0.470 1 ATOM 14 C CG . PRO 27 27 ? A 13.539 5.598 -6.692 1 1 A PRO 0.470 1 ATOM 15 C CD . PRO 27 27 ? A 14.168 4.472 -7.506 1 1 A PRO 0.470 1 ATOM 16 N N . LEU 28 28 ? A 11.590 5.492 -10.287 1 1 A LEU 0.370 1 ATOM 17 C CA . LEU 28 28 ? A 10.882 6.023 -11.443 1 1 A LEU 0.370 1 ATOM 18 C C . LEU 28 28 ? A 10.176 4.982 -12.267 1 1 A LEU 0.370 1 ATOM 19 O O . LEU 28 28 ? A 9.054 5.202 -12.697 1 1 A LEU 0.370 1 ATOM 20 C CB . LEU 28 28 ? A 11.814 6.824 -12.394 1 1 A LEU 0.370 1 ATOM 21 C CG . LEU 28 28 ? A 12.319 8.189 -11.864 1 1 A LEU 0.370 1 ATOM 22 C CD1 . LEU 28 28 ? A 11.163 9.155 -11.541 1 1 A LEU 0.370 1 ATOM 23 C CD2 . LEU 28 28 ? A 13.313 8.097 -10.689 1 1 A LEU 0.370 1 ATOM 24 N N . GLY 29 29 ? A 10.800 3.810 -12.458 1 1 A GLY 0.430 1 ATOM 25 C CA . GLY 29 29 ? A 10.196 2.672 -13.137 1 1 A GLY 0.430 1 ATOM 26 C C . GLY 29 29 ? A 9.030 2.061 -12.404 1 1 A GLY 0.430 1 ATOM 27 O O . GLY 29 29 ? A 7.989 1.810 -13.001 1 1 A GLY 0.430 1 ATOM 28 N N . TYR 30 30 ? A 9.154 1.838 -11.075 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 29 C CA . TYR 30 30 ? A 8.072 1.397 -10.214 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 30 C C . TYR 30 30 ? A 6.953 2.423 -10.159 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 31 O O . TYR 30 30 ? A 5.787 2.080 -10.322 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 32 C CB . TYR 30 30 ? A 8.636 1.160 -8.779 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 33 C CG . TYR 30 30 ? A 7.627 0.657 -7.769 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 34 C CD1 . TYR 30 30 ? A 6.665 1.510 -7.194 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 35 C CD2 . TYR 30 30 ? A 7.664 -0.679 -7.349 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 36 C CE1 . TYR 30 30 ? A 5.744 1.027 -6.259 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 37 C CE2 . TYR 30 30 ? A 6.768 -1.154 -6.381 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 38 C CZ . TYR 30 30 ? A 5.809 -0.298 -5.840 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 39 O OH . TYR 30 30 ? A 4.923 -0.742 -4.848 1 1 A TYR 0.390 1 ATOM 40 N N . ILE 31 31 ? A 7.289 3.721 -9.971 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 41 C CA . ILE 31 31 ? A 6.344 4.827 -9.948 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 42 C C . ILE 31 31 ? A 5.633 4.927 -11.286 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 43 O O . ILE 31 31 ? A 4.423 5.052 -11.369 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 44 C CB . ILE 31 31 ? A 6.991 6.166 -9.626 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 45 C CG1 . ILE 31 31 ? A 7.539 6.157 -8.186 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 46 C CG2 . ILE 31 31 ? A 5.994 7.343 -9.808 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 47 C CD1 . ILE 31 31 ? A 8.513 7.314 -7.946 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 48 N N . ALA 32 32 ? A 6.380 4.821 -12.406 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 49 C CA . ALA 32 32 ? A 5.828 4.912 -13.714 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 50 C C . ALA 32 32 ? A 5.106 3.664 -14.210 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 51 O O . ALA 32 32 ? A 4.678 3.600 -15.289 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 52 C CB . ALA 32 32 ? A 6.879 5.247 -14.790 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 53 N N . LYS 33 33 ? A 5.194 2.545 -13.412 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 54 C CA . LYS 33 33 ? A 4.294 1.423 -13.565 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 55 C C . LYS 33 33 ? A 3.063 1.461 -12.664 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 56 O O . LYS 33 33 ? A 1.960 1.152 -13.117 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 57 C CB . LYS 33 33 ? A 5.112 0.175 -13.195 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 58 C CG . LYS 33 33 ? A 4.330 -1.136 -13.267 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 59 C CD . LYS 33 33 ? A 5.228 -2.317 -12.907 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 60 C CE . LYS 33 33 ? A 4.481 -3.647 -12.945 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 61 N NZ . LYS 33 33 ? A 5.398 -4.757 -12.611 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 62 N N . ILE 34 34 ? A 3.220 1.873 -11.381 1 1 A ILE 0.700 1 ATOM 63 C CA . ILE 34 34 ? A 2.175 1.940 -10.360 1 1 A ILE 0.700 1 ATOM 64 C C . ILE 34 34 ? A 1.203 3.091 -10.597 1 1 A ILE 0.700 1 ATOM 65 O O . ILE 34 34 ? A 0.091 3.154 -10.065 1 1 A ILE 0.700 1 ATOM 66 C CB . ILE 34 34 ? A 2.801 2.064 -8.964 1 1 A ILE 0.700 1 ATOM 67 C CG1 . ILE 34 34 ? A 1.928 1.507 -7.840 1 1 A ILE 0.700 1 ATOM 68 C CG2 . ILE 34 34 ? A 3.193 3.512 -8.605 1 1 A ILE 0.700 1 ATOM 69 C CD1 . ILE 34 34 ? A 2.046 -0.009 -7.664 1 1 A ILE 0.700 1 ATOM 70 N N . ARG 35 35 ? A 1.619 4.054 -11.433 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 71 C CA . ARG 35 35 ? A 0.753 5.054 -11.991 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 72 C C . ARG 35 35 ? A -0.059 4.440 -13.156 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 73 O O . ARG 35 35 ? A -1.230 4.213 -12.899 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 74 C CB . ARG 35 35 ? A 1.593 6.304 -12.336 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 75 C CG . ARG 35 35 ? A 2.112 7.177 -11.179 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 76 C CD . ARG 35 35 ? A 3.094 8.224 -11.712 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 77 N NE . ARG 35 35 ? A 2.294 9.183 -12.533 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 78 C CZ . ARG 35 35 ? A 2.811 10.166 -13.277 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 79 N NH1 . ARG 35 35 ? A 4.127 10.320 -13.398 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 80 N NH2 . ARG 35 35 ? A 1.989 10.979 -13.934 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 81 N N . PRO 36 36 ? A 0.384 4.054 -14.367 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 82 C CA . PRO 36 36 ? A -0.455 3.628 -15.499 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 83 C C . PRO 36 36 ? A -1.392 2.506 -15.235 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 84 O O . PRO 36 36 ? A -2.488 2.547 -15.771 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 85 C CB . PRO 36 36 ? A 0.516 3.105 -16.557 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 86 C CG . PRO 36 36 ? A 1.820 3.801 -16.276 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 87 C CD . PRO 36 36 ? A 1.743 4.254 -14.811 1 1 A PRO 0.590 1 ATOM 88 N N . ILE 37 37 ? A -0.995 1.463 -14.475 1 1 A ILE 0.710 1 ATOM 89 C CA . ILE 37 37 ? 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A -7.529 7.049 -11.795 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 132 O O . ILE 43 43 ? A -6.687 7.135 -10.906 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 133 C CB . ILE 43 43 ? A -8.691 5.243 -10.481 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 134 C CG1 . ILE 43 43 ? A -7.557 4.212 -10.618 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 135 C CG2 . ILE 43 43 ? A -10.059 4.582 -10.194 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 136 C CD1 . ILE 43 43 ? A -7.204 3.476 -9.318 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 137 N N . CYS 44 44 ? A -7.338 7.704 -12.961 1 1 A CYS 0.250 1 ATOM 138 C CA . CYS 44 44 ? A -6.145 8.476 -13.289 1 1 A CYS 0.250 1 ATOM 139 C C . CYS 44 44 ? A -5.844 9.591 -12.343 1 1 A CYS 0.250 1 ATOM 140 O O . CYS 44 44 ? A -4.720 9.966 -12.044 1 1 A CYS 0.250 1 ATOM 141 C CB . CYS 44 44 ? A -6.191 8.983 -14.754 1 1 A CYS 0.250 1 ATOM 142 S SG . CYS 44 44 ? A -7.606 10.052 -15.194 1 1 A CYS 0.250 1 ATOM 143 N N . LYS 45 45 ? A -6.918 10.093 -11.768 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 144 C CA . LYS 45 45 ? A -6.846 11.107 -10.806 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 145 C C . LYS 45 45 ? A -7.156 10.531 -9.494 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 146 O O . LYS 45 45 ? A -7.903 11.096 -8.760 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 147 C CB . LYS 45 45 ? A -7.894 12.164 -11.070 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 148 C CG . LYS 45 45 ? A -7.653 12.817 -12.413 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 149 C CD . LYS 45 45 ? A -8.717 13.885 -12.558 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 150 C CE . LYS 45 45 ? A -8.727 14.501 -13.940 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 151 N NZ . LYS 45 45 ? A -9.843 15.457 -14.021 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 152 N N . ILE 46 46 ? A -6.521 9.385 -9.181 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 153 C CA . ILE 46 46 ? A -6.402 8.907 -7.873 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 154 C C . ILE 46 46 ? A -4.977 8.919 -7.406 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 155 O O . ILE 46 46 ? A -4.706 9.719 -6.526 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 156 C CB . ILE 46 46 ? A -7.079 7.598 -7.757 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 157 C CG1 . ILE 46 46 ? A -8.589 7.692 -8.051 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 158 C CG2 . ILE 46 46 ? A -6.980 7.244 -6.317 1 1 A ILE 0.340 1 ATOM 159 C CD1 . ILE 46 46 ? 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A -5.285 -6.589 2.306 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 474 C CE1 . TYR 84 84 ? A -4.641 -4.151 3.492 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 475 C CE2 . TYR 84 84 ? A -6.256 -5.585 2.420 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 476 C CZ . TYR 84 84 ? A -5.940 -4.371 3.027 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 477 O OH . TYR 84 84 ? A -6.943 -3.392 3.179 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 478 N N . GLU 85 85 ? A -4.556 -9.282 4.740 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 479 C CA . GLU 85 85 ? A -5.735 -9.665 5.493 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 480 C C . GLU 85 85 ? A -5.449 -10.025 6.948 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 481 O O . GLU 85 85 ? A -6.182 -9.653 7.867 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 482 C CB . GLU 85 85 ? A -6.386 -10.905 4.837 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 483 C CG . GLU 85 85 ? A -7.783 -11.251 5.407 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 484 C CD . GLU 85 85 ? A -8.807 -10.216 4.976 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 485 O OE1 . GLU 85 85 ? A -9.121 -10.141 3.768 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 486 O OE2 . GLU 85 85 ? A -9.295 -9.459 5.856 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 487 N N . ALA 86 86 ? 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A -5.595 -8.860 12.619 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 516 C CA . ASP 90 90 ? A -4.751 -8.913 13.790 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 517 C C . ASP 90 90 ? A -4.385 -7.500 14.255 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 518 O O . ASP 90 90 ? A -3.795 -7.282 15.318 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 519 C CB . ASP 90 90 ? A -3.489 -9.739 13.417 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 520 C CG . ASP 90 90 ? A -2.732 -10.197 14.647 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 521 O OD1 . ASP 90 90 ? A -3.351 -10.277 15.737 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 522 O OD2 . ASP 90 90 ? A -1.491 -10.372 14.533 1 1 A ASP 0.570 1 ATOM 523 N N . ARG 91 91 ? A -4.775 -6.473 13.462 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 524 C CA . ARG 91 91 ? A -4.644 -5.063 13.763 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 525 C C . ARG 91 91 ? A -3.184 -4.639 13.928 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 526 O O . ARG 91 91 ? A -2.800 -3.776 14.717 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 527 C CB . ARG 91 91 ? A -5.574 -4.754 14.961 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 528 C CG . ARG 91 91 ? A -5.677 -3.292 15.434 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 529 C CD . ARG 91 91 ? A -6.695 -3.048 16.549 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 530 N NE . ARG 91 91 ? A -6.435 -4.078 17.609 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 531 C CZ . ARG 91 91 ? A -7.230 -4.273 18.667 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 532 N NH1 . ARG 91 91 ? A -8.235 -3.438 18.902 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 533 N NH2 . ARG 91 91 ? A -7.047 -5.310 19.480 1 1 A ARG 0.650 1 ATOM 534 N N . ARG 92 92 ? A -2.289 -5.209 13.100 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 535 C CA . ARG 92 92 ? A -0.859 -5.025 13.270 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 536 C C . ARG 92 92 ? A -0.361 -3.831 12.518 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 537 O O . ARG 92 92 ? A 0.812 -3.477 12.597 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 538 C CB . ARG 92 92 ? A -0.061 -6.313 12.939 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 539 C CG . ARG 92 92 ? A 0.433 -7.027 14.211 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 540 C CD . ARG 92 92 ? A -0.678 -7.305 15.216 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 541 N NE . ARG 92 92 ? A -0.048 -7.739 16.491 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 542 C CZ . ARG 92 92 ? A -0.785 -7.875 17.596 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 543 N NH1 . ARG 92 92 ? A -2.094 -7.655 17.576 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 544 N NH2 . ARG 92 92 ? A -0.222 -8.302 18.720 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 545 N N . TRP 93 93 ? A -1.288 -3.080 11.899 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 546 C CA . TRP 93 93 ? A -1.012 -1.833 11.229 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 547 C C . TRP 93 93 ? A -0.403 -0.787 12.137 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 548 O O . TRP 93 93 ? A 0.279 0.120 11.671 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 549 C CB . TRP 93 93 ? A -2.274 -1.227 10.579 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 550 C CG . TRP 93 93 ? A -2.892 -2.086 9.510 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 551 C CD1 . TRP 93 93 ? A -4.127 -2.668 9.487 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 552 C CD2 . TRP 93 93 ? A -2.226 -2.486 8.300 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 553 N NE1 . TRP 93 93 ? A -4.275 -3.404 8.335 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 554 C CE2 . TRP 93 93 ? A -3.119 -3.314 7.604 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 555 C CE3 . TRP 93 93 ? A -0.953 -2.219 7.793 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 556 C CZ2 . TRP 93 93 ? A -2.749 -3.907 6.413 1 1 A TRP 0.690 1 ATOM 557 C CZ3 . TRP 93 93 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.560 2 1 3 0.053 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 26 ASP 1 0.460 2 1 A 27 PRO 1 0.470 3 1 A 28 LEU 1 0.370 4 1 A 29 GLY 1 0.430 5 1 A 30 TYR 1 0.390 6 1 A 31 ILE 1 0.550 7 1 A 32 ALA 1 0.660 8 1 A 33 LYS 1 0.670 9 1 A 34 ILE 1 0.700 10 1 A 35 ARG 1 0.600 11 1 A 36 PRO 1 0.590 12 1 A 37 ILE 1 0.710 13 1 A 38 ALA 1 0.750 14 1 A 39 GLU 1 0.490 15 1 A 40 LYS 1 0.490 16 1 A 41 SER 1 0.660 17 1 A 42 GLY 1 0.550 18 1 A 43 ILE 1 0.340 19 1 A 44 CYS 1 0.250 20 1 A 45 LYS 1 0.220 21 1 A 46 ILE 1 0.340 22 1 A 47 ARG 1 0.360 23 1 A 48 PRO 1 0.260 24 1 A 49 PRO 1 0.250 25 1 A 50 ALA 1 0.300 26 1 A 51 ASP 1 0.290 27 1 A 52 TRP 1 0.260 28 1 A 53 GLN 1 0.250 29 1 A 54 PRO 1 0.270 30 1 A 55 PRO 1 0.350 31 1 A 56 PHE 1 0.300 32 1 A 57 ALA 1 0.430 33 1 A 58 VAL 1 0.650 34 1 A 59 GLU 1 0.630 35 1 A 60 VAL 1 0.390 36 1 A 61 ASP 1 0.240 37 1 A 62 ASN 1 0.200 38 1 A 63 PHE 1 0.170 39 1 A 64 ARG 1 0.250 40 1 A 65 PHE 1 0.240 41 1 A 66 THR 1 0.260 42 1 A 67 PRO 1 0.530 43 1 A 68 ARG 1 0.430 44 1 A 69 ILE 1 0.560 45 1 A 70 GLN 1 0.620 46 1 A 71 ARG 1 0.600 47 1 A 72 LEU 1 0.690 48 1 A 73 ASN 1 0.680 49 1 A 74 GLU 1 0.680 50 1 A 75 LEU 1 0.670 51 1 A 76 GLU 1 0.590 52 1 A 77 ILE 1 0.620 53 1 A 78 VAL 1 0.650 54 1 A 79 VAL 1 0.560 55 1 A 80 GLU 1 0.440 56 1 A 81 GLU 1 0.540 57 1 A 82 GLY 1 0.510 58 1 A 83 GLY 1 0.620 59 1 A 84 TYR 1 0.650 60 1 A 85 GLU 1 0.700 61 1 A 86 ALA 1 0.720 62 1 A 87 ILE 1 0.670 63 1 A 88 CYS 1 0.730 64 1 A 89 LYS 1 0.620 65 1 A 90 ASP 1 0.570 66 1 A 91 ARG 1 0.650 67 1 A 92 ARG 1 0.660 68 1 A 93 TRP 1 0.690 69 1 A 94 ALA 1 0.770 70 1 A 95 ARG 1 0.680 71 1 A 96 VAL 1 0.780 72 1 A 97 ALA 1 0.800 73 1 A 98 GLN 1 0.750 74 1 A 99 ARG 1 0.710 75 1 A 100 LEU 1 0.700 76 1 A 101 ASN 1 0.720 77 1 A 102 TYR 1 0.640 78 1 A 103 PRO 1 0.660 79 1 A 104 PRO 1 0.600 80 1 A 105 GLY 1 0.720 81 1 A 106 LYS 1 0.590 82 1 A 107 ASN 1 0.740 83 1 A 108 ILE 1 0.720 84 1 A 109 GLY 1 0.770 85 1 A 110 SER 1 0.720 86 1 A 111 LEU 1 0.720 87 1 A 112 LEU 1 0.750 88 1 A 113 ARG 1 0.670 89 1 A 114 SER 1 0.690 90 1 A 115 HIS 1 0.640 91 1 A 116 TYR 1 0.670 92 1 A 117 GLU 1 0.680 93 1 A 118 ARG 1 0.650 94 1 A 119 ILE 1 0.660 95 1 A 120 VAL 1 0.730 96 1 A 121 TYR 1 0.670 97 1 A 122 PRO 1 0.740 98 1 A 123 TYR 1 0.690 99 1 A 124 GLU 1 0.690 100 1 A 125 MET 1 0.510 101 1 A 126 TYR 1 0.630 102 1 A 127 GLN 1 0.650 103 1 A 128 SER 1 0.660 104 1 A 129 GLY 1 0.530 105 1 A 130 ALA 1 0.540 106 1 A 131 ASN 1 0.480 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #