data_SMR-f46f72a4a73944eed793dd73b09d915f_1 _entry.id SMR-f46f72a4a73944eed793dd73b09d915f_1 _struct.entry_id SMR-f46f72a4a73944eed793dd73b09d915f_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P48634 (isoform 2)/ PRC2A_HUMAN, Protein PRRC2A Estimated model accuracy of this model is 0.008, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P48634 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 190839.688 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PRC2A_HUMAN P48634 1 ;MSDRSGPTAKGKDGKKYSSLNLFDTYKGKSLEIQKPAVAPRHGLQSLGKVAIARRMPPPANLPSLKAENK GNDPNVSLVPKDGTGWASKQEQSDPKSSDASTAQPPESQPLPASQTPASNQPKRPPAAPENTPLVPSGVK SWAQASVTHGAHGDGGRASSLLSRFSREEFPTLQAAGDQDKAAKERESAEQSSGPGPSLRPQNSTTWRDG GGRGPDELEGPDSKLHHGHDPRGGLQPSGPPQFPPYRGMMPPFMYPPYLPFPPPYGPQGPYRYPTPDGPS RFPRVAGPRGSGPPMRLVEPVGRPSILKEDNLKEFDQLDQENDDGWAGAHEEVDYTEKLKFSDEEDGRDS DEEGAEGHRDSQSASGEERPPEADGKKGNSPNSEPPTPKTAWAETSRPPETEPGPPAPKPPLPPPHRGPA GNWGPPGDYPDRGGPPCKPPAPEDEDEAWRQRRKQSSSEISLAVERARRRREEEERRMQEERRAACAEKL KRLDEKFGAPDKRLKAEPAAPPAAPSTPAPPPAVPKELPAPPAPPPASAPTPETEPEEPAQAPPAQSTPT PGVAAAPTLVSGGGSTSSTSSGSFEASPVEPQLPSKEGPEPPEEVPPPTTPPVPKVEPKGDGIGPTRQPP SQGLGYPKYQKSLPPRFQRQQQEQLLKQQQQHQWQQHQQGSAPPTPVPPSPPQPVTLGAVPAPQAPPPPP KALYPGALGRPPPMPPMNFDPRWMMIPPYVDPRLLQGRPPLDFYPPGVHPSGLVPRERSDSGGSSSEPFD RHAPAMLRERGTPPVDPKLAWVGDVFTATPAEPRPLTSPLRQAADEDDKGMRSETPPVPPPPPSSSAVFR LDQVIHSNPAGIQQALAQLSSRQGSVTAPGGHPRHKPGLPQAPQGPSPRPPTRYEPQRVNSGLSSDPHFE EPGPMVRGVGGTPRDSAGVSPFPPKRRERPPRKPELLQEESLPPPHSSGFLGSKPEGPGPQAESRDTGTE ALTPHIWNRLHTATSRKSYRPSSMEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDG GLKGAAEGPPKRPGGSSPLNAVPCEGPPGSEPPRRPPPAPHDGDRKELPREQPLPPGPIGTERSQRTDRG TEPGPIRPSHRPGPPVQFGTSDKDSDLRLVVGDSLKAEKELTASVTEAIPVSRDWELLPSAAASAEPQSK NLDSGHCVPEPSSSGQRLYPEVFYGSAGPSSSQISGGAMDSQLHPNSGGFRPGTPSLHPYRSQPLYLPPG PAPPSALLSGLALKGQFLDFSTMQATELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDTSLLQVRQDLPSPS DFYSTPLQPGGQSGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVVNFGSLPPAPPPAPPPLSLLPVGPALQPPSLAVR PPPAPATRVLPSPARPFPASLGRAELHPVELKPFQDYQKLSSNLGGPGSSRTPPTGRSFSGLNSRLKATP STYSGVFRTQRVDLYQQASPPDALRWIPKPWERTGPPPREGPSRRAEEPGSRGDKEPGLPPPR ; 'Protein PRRC2A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1533 1 1533 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PRC2A_HUMAN P48634 P48634-2 1 1533 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-05-18 0F496D1F2EB629E7 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MSDRSGPTAKGKDGKKYSSLNLFDTYKGKSLEIQKPAVAPRHGLQSLGKVAIARRMPPPANLPSLKAENK GNDPNVSLVPKDGTGWASKQEQSDPKSSDASTAQPPESQPLPASQTPASNQPKRPPAAPENTPLVPSGVK SWAQASVTHGAHGDGGRASSLLSRFSREEFPTLQAAGDQDKAAKERESAEQSSGPGPSLRPQNSTTWRDG GGRGPDELEGPDSKLHHGHDPRGGLQPSGPPQFPPYRGMMPPFMYPPYLPFPPPYGPQGPYRYPTPDGPS RFPRVAGPRGSGPPMRLVEPVGRPSILKEDNLKEFDQLDQENDDGWAGAHEEVDYTEKLKFSDEEDGRDS DEEGAEGHRDSQSASGEERPPEADGKKGNSPNSEPPTPKTAWAETSRPPETEPGPPAPKPPLPPPHRGPA GNWGPPGDYPDRGGPPCKPPAPEDEDEAWRQRRKQSSSEISLAVERARRRREEEERRMQEERRAACAEKL KRLDEKFGAPDKRLKAEPAAPPAAPSTPAPPPAVPKELPAPPAPPPASAPTPETEPEEPAQAPPAQSTPT PGVAAAPTLVSGGGSTSSTSSGSFEASPVEPQLPSKEGPEPPEEVPPPTTPPVPKVEPKGDGIGPTRQPP 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VAL . 1 39 ALA . 1 40 PRO . 1 41 ARG . 1 42 HIS . 1 43 GLY . 1 44 LEU . 1 45 GLN . 1 46 SER . 1 47 LEU . 1 48 GLY . 1 49 LYS . 1 50 VAL . 1 51 ALA . 1 52 ILE . 1 53 ALA . 1 54 ARG . 1 55 ARG . 1 56 MET . 1 57 PRO . 1 58 PRO . 1 59 PRO . 1 60 ALA . 1 61 ASN . 1 62 LEU . 1 63 PRO . 1 64 SER . 1 65 LEU . 1 66 LYS . 1 67 ALA . 1 68 GLU . 1 69 ASN . 1 70 LYS . 1 71 GLY . 1 72 ASN . 1 73 ASP . 1 74 PRO . 1 75 ASN . 1 76 VAL . 1 77 SER . 1 78 LEU . 1 79 VAL . 1 80 PRO . 1 81 LYS . 1 82 ASP . 1 83 GLY . 1 84 THR . 1 85 GLY . 1 86 TRP . 1 87 ALA . 1 88 SER . 1 89 LYS . 1 90 GLN . 1 91 GLU . 1 92 GLN . 1 93 SER . 1 94 ASP . 1 95 PRO . 1 96 LYS . 1 97 SER . 1 98 SER . 1 99 ASP . 1 100 ALA . 1 101 SER . 1 102 THR . 1 103 ALA . 1 104 GLN . 1 105 PRO . 1 106 PRO . 1 107 GLU . 1 108 SER . 1 109 GLN . 1 110 PRO . 1 111 LEU . 1 112 PRO . 1 113 ALA . 1 114 SER . 1 115 GLN . 1 116 THR . 1 117 PRO . 1 118 ALA . 1 119 SER . 1 120 ASN . 1 121 GLN . 1 122 PRO . 1 123 LYS . 1 124 ARG . 1 125 PRO . 1 126 PRO . 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nuclear factor interleukin-3-regulated protein {PDB ID=8k89, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=8k89.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8k89, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GEFMPDEKKDAMYWEKRRKNNEAAKRSREKRRLNDLVLENKLIALGEENATLKAELLSLKLKFGLISSTA YAQEMQKLSNSTAVYFQDYQTSKSNVSS ; ;GEFMPDEKKDAMYWEKRRKNNEAAKRSREKRRLNDLVLENKLIALGEENATLKAELLSLKLKFGLISSTA YAQEMQKLSNSTAVYFQDYQTSKSNVSS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 38 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8k89 2024-11-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1533 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1533 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 120.000 25.806 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSDRSGPTAKGKDGKKYSSLNLFDTYKGKSLEIQKPAVAPRHGLQSLGKVAIARRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVSLVPKDGTGWASKQEQSDPKSSDASTAQPPESQPLPASQTPASNQPKRPPAAPENTPLVPSGVKSWAQASVTHGAHGDGGRASSLLSRFSREEFPTLQAAGDQDKAAKERESAEQSSGPGPSLRPQNSTTWRDGGGRGPDELEGPDSKLHHGHDPRGGLQPSGPPQFPPYRGMMPPFMYPPYLPFPPPYGPQGPYRYPTPDGPSRFPRVAGPRGSGPPMRLVEPVGRPSILKEDNLKEFDQLDQENDDGWAGAHEEVDYTEKLKFSDEEDGRDSDEEGAEGHRDSQSASGEERPPEADGKKGNSPNSEPPTPKTAWAETSRPPETEPGPPAPKPPLPPPHRGPAGNWGPPGDYPDRGGPPCKPPAPEDEDEAWRQRRKQSSSEISLAVERARRRREEEERRMQEERRAACAEKLKRLDEKFGAPDKRLKAEPAAPPAAPSTPAPPPAVPKELPAPPAPPPASAPTPETEPEEPAQAPPAQSTPTPGVAAAPTLVSGGGSTSSTSSGSFEASPVEPQLPSKEGPEPPEEVPPPTTPPVPKVEPKGDGIGPTRQPPSQGLGYPKYQKSLPPRFQRQQQEQLLKQQQQHQWQQHQQGSAPPTPVPPSPPQPVTLGAVPAPQAPPPPPKALYPGALGRPPPMPPMNFDPRWMMIPPYVDPRLLQGRPPLDFYPPGVHPSGLVPRERSDSGGSSSEPFDRHAPAMLRERGTPPVDPKLAWVGDVFTATPAEPRPLTSPLRQAADEDDKGMRSETPPVPPPPPSSSAVFRLDQVIHSNPAGIQQALAQLSSRQGSVTAPGGHPRHKPGLPQAPQGPSPRPPTRYEPQRVNSGLSSDPHFEEPGPMVRGVGGTPRDSAGVSPFPPKRRERPPRKPELLQEESLPPPHSSGFLGSKPEGPGPQAESRDTGTEALTPHIWNRLHTATSRKSYRPSSMEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDGGLKGAAEGPPKRPGGSSPLNAVPCEGPPGSEPPRRPPPAPHDGDRKELPREQPLPPGPIGTERSQRTDRGTEPGPIRPSHRPGPPVQFGTSDKDSDLRLVVGDSLKAEKELTASVTEAIPVSRDWELLPSAAASAEPQSKNLDSGHCVPEPSSSGQRLYPEVFYGSAGPSSSQISGGAMDSQLHPNSGGFRPGTPSLHPYRSQPLYLPPGPAPPSALLSGLALKGQFLDFSTMQATELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDTSLLQVRQDLPSPSDFYSTPLQPGGQSGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVVNFGSLPPAPPPAPPPLSLLPVGPALQPPSLAVRPPPAPATRVLPSPARPFPASLGRAELHPVELKPFQDYQKLSSNLGGPGSSRTPPTGRSFSGLNSRLKATPSTYSGVFRTQRVDLYQQASPPDALRWIPKPWERTGPPPREGPSRRAEEPGSRGDKEPGLPPPR 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KKDAMYWEKRRKNN-----EAAKRSREKRRLNDLVL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.035}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8k89.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 444 444 ? A 23.058 71.629 13.823 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 2 C CA . ASP 444 444 ? A 24.350 70.996 14.273 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 3 C C . ASP 444 444 ? A 25.508 71.933 14.529 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 4 O O . ASP 444 444 ? A 26.632 71.687 14.113 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 5 C CB . ASP 444 444 ? A 24.668 69.913 13.217 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 6 C CG . ASP 444 444 ? A 23.487 68.940 13.168 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 444 444 ? A 22.571 69.111 14.024 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 444 444 ? A 23.419 68.149 12.212 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 9 N N . GLU 445 445 ? A 25.257 73.033 15.262 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 10 C CA . GLU 445 445 ? A 26.256 74.043 15.520 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 11 C C . GLU 445 445 ? A 26.754 73.912 16.944 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 12 O O . GLU 445 445 ? A 26.396 72.976 17.647 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 13 C CB . GLU 445 445 ? A 25.600 75.416 15.344 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 14 C CG . GLU 445 445 ? A 25.026 75.661 13.932 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 15 C CD . GLU 445 445 ? A 24.330 77.020 13.852 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 16 O OE1 . GLU 445 445 ? A 24.189 77.679 14.912 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 17 O OE2 . GLU 445 445 ? A 23.905 77.375 12.726 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 18 N N . ASP 446 446 ? A 27.556 74.868 17.444 1 1 B ASP 0.420 1 ATOM 19 C CA . ASP 446 446 ? A 28.132 74.822 18.778 1 1 B ASP 0.420 1 ATOM 20 C C . ASP 446 446 ? A 27.092 74.734 19.885 1 1 B ASP 0.420 1 ATOM 21 O O . ASP 446 446 ? A 27.225 73.965 20.838 1 1 B ASP 0.420 1 ATOM 22 C CB . ASP 446 446 ? A 29.074 76.031 18.971 1 1 B ASP 0.420 1 ATOM 23 C CG . ASP 446 446 ? A 30.295 75.898 18.066 1 1 B ASP 0.420 1 ATOM 24 O OD1 . ASP 446 446 ? A 30.518 74.791 17.515 1 1 B ASP 0.420 1 ATOM 25 O OD2 . ASP 446 446 ? A 31.014 76.916 17.924 1 1 B ASP 0.420 1 ATOM 26 N N . GLU 447 447 ? A 25.966 75.455 19.734 1 1 B GLU 0.450 1 ATOM 27 C CA . GLU 447 447 ? A 24.849 75.405 20.653 1 1 B GLU 0.450 1 ATOM 28 C C . GLU 447 447 ? A 24.170 74.026 20.710 1 1 B GLU 0.450 1 ATOM 29 O O . GLU 447 447 ? A 23.662 73.614 21.749 1 1 B GLU 0.450 1 ATOM 30 C CB . GLU 447 447 ? A 23.875 76.581 20.393 1 1 B GLU 0.450 1 ATOM 31 C CG . GLU 447 447 ? A 24.499 77.980 20.671 1 1 B GLU 0.450 1 ATOM 32 C CD . GLU 447 447 ? A 24.867 78.191 22.135 1 1 B GLU 0.450 1 ATOM 33 O OE1 . GLU 447 447 ? A 26.074 78.439 22.408 1 1 B GLU 0.450 1 ATOM 34 O OE2 . GLU 447 447 ? A 23.990 78.093 23.029 1 1 B GLU 0.450 1 ATOM 35 N N . ALA 448 448 ? A 24.211 73.233 19.608 1 1 B ALA 0.500 1 ATOM 36 C CA . ALA 448 448 ? A 23.771 71.846 19.584 1 1 B ALA 0.500 1 ATOM 37 C C . ALA 448 448 ? A 24.654 70.958 20.463 1 1 B ALA 0.500 1 ATOM 38 O O . ALA 448 448 ? A 24.177 70.134 21.241 1 1 B ALA 0.500 1 ATOM 39 C CB . ALA 448 448 ? A 23.758 71.287 18.139 1 1 B ALA 0.500 1 ATOM 40 N N . TRP 449 449 ? A 25.988 71.134 20.380 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 41 C CA . TRP 449 449 ? A 26.948 70.416 21.206 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 42 C C . TRP 449 449 ? A 26.959 70.815 22.672 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 43 O O . TRP 449 449 ? A 27.112 69.973 23.557 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 44 C CB . TRP 449 449 ? A 28.370 70.462 20.616 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 45 C CG . TRP 449 449 ? A 28.423 69.809 19.254 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 46 C CD1 . TRP 449 449 ? A 28.573 70.384 18.026 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 47 C CD2 . TRP 449 449 ? A 28.240 68.401 19.015 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 48 N NE1 . TRP 449 449 ? A 28.454 69.440 17.029 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 49 C CE2 . TRP 449 449 ? A 28.264 68.213 17.625 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 50 C CE3 . TRP 449 449 ? A 28.066 67.329 19.890 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 51 C CZ2 . TRP 449 449 ? A 28.122 66.945 17.074 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 52 C CZ3 . TRP 449 449 ? A 27.956 66.049 19.335 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 53 C CH2 . TRP 449 449 ? A 27.984 65.859 17.951 1 1 B TRP 0.370 1 ATOM 54 N N . ARG 450 450 ? A 26.762 72.111 22.982 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 55 C CA . ARG 450 450 ? A 26.491 72.571 24.335 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 56 C C . ARG 450 450 ? A 25.213 71.978 24.911 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 57 O O . ARG 450 450 ? A 25.183 71.576 26.072 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 58 C CB . ARG 450 450 ? A 26.407 74.109 24.420 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 59 C CG . ARG 450 450 ? A 27.739 74.834 24.154 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 60 C CD . ARG 450 450 ? A 27.562 76.352 24.123 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 61 N NE . ARG 450 450 ? A 27.548 76.846 25.540 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 62 C CZ . ARG 450 450 ? A 27.139 78.087 25.834 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 63 N NH1 . ARG 450 450 ? A 26.600 78.895 24.940 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 64 N NH2 . ARG 450 450 ? A 27.321 78.552 27.070 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 65 N N . GLN 451 451 ? A 24.137 71.879 24.105 1 1 B GLN 0.460 1 ATOM 66 C CA . GLN 451 451 ? A 22.912 71.195 24.480 1 1 B GLN 0.460 1 ATOM 67 C C . GLN 451 451 ? A 23.129 69.711 24.764 1 1 B GLN 0.460 1 ATOM 68 O O . GLN 451 451 ? A 22.673 69.179 25.775 1 1 B GLN 0.460 1 ATOM 69 C CB . GLN 451 451 ? A 21.828 71.409 23.397 1 1 B GLN 0.460 1 ATOM 70 C CG . GLN 451 451 ? A 20.374 71.180 23.877 1 1 B GLN 0.460 1 ATOM 71 C CD . GLN 451 451 ? A 19.950 69.709 23.931 1 1 B GLN 0.460 1 ATOM 72 O OE1 . GLN 451 451 ? A 20.442 68.836 23.217 1 1 B GLN 0.460 1 ATOM 73 N NE2 . GLN 451 451 ? A 18.969 69.419 24.822 1 1 B GLN 0.460 1 ATOM 74 N N . ARG 452 452 ? A 23.913 69.024 23.908 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 75 C CA . ARG 452 452 ? A 24.274 67.628 24.079 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 76 C C . ARG 452 452 ? A 25.059 67.297 25.335 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 77 O O . ARG 452 452 ? A 24.790 66.277 25.968 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 78 C CB . ARG 452 452 ? A 24.961 67.051 22.820 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 79 C CG . ARG 452 452 ? A 25.283 65.537 22.857 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 80 C CD . ARG 452 452 ? A 24.767 64.805 21.615 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 81 N NE . ARG 452 452 ? A 25.618 63.582 21.391 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 82 C CZ . ARG 452 452 ? A 25.862 63.073 20.173 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 83 N NH1 . ARG 452 452 ? A 25.304 63.596 19.086 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 84 N NH2 . ARG 452 452 ? A 26.713 62.060 20.018 1 1 B ARG 0.460 1 ATOM 85 N N . ARG 453 453 ? 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A 15.742 47.176 45.720 1 1 B MET 0.630 1 ATOM 310 O OXT . MET 478 478 ? A 19.554 45.204 48.544 1 1 B MET 0.630 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.513 2 1 3 0.008 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 444 ASP 1 0.430 2 1 A 445 GLU 1 0.480 3 1 A 446 ASP 1 0.420 4 1 A 447 GLU 1 0.450 5 1 A 448 ALA 1 0.500 6 1 A 449 TRP 1 0.370 7 1 A 450 ARG 1 0.430 8 1 A 451 GLN 1 0.460 9 1 A 452 ARG 1 0.460 10 1 A 453 ARG 1 0.470 11 1 A 454 LYS 1 0.480 12 1 A 455 GLN 1 0.460 13 1 A 456 SER 1 0.400 14 1 A 457 SER 1 0.390 15 1 A 458 SER 1 0.430 16 1 A 459 GLU 1 0.420 17 1 A 460 ILE 1 0.370 18 1 A 461 SER 1 0.400 19 1 A 462 LEU 1 0.410 20 1 A 463 ALA 1 0.490 21 1 A 464 VAL 1 0.500 22 1 A 465 GLU 1 0.540 23 1 A 466 ARG 1 0.520 24 1 A 467 ALA 1 0.600 25 1 A 468 ARG 1 0.600 26 1 A 469 ARG 1 0.630 27 1 A 470 ARG 1 0.640 28 1 A 471 ARG 1 0.650 29 1 A 472 GLU 1 0.650 30 1 A 473 GLU 1 0.660 31 1 A 474 GLU 1 0.670 32 1 A 475 GLU 1 0.660 33 1 A 476 ARG 1 0.610 34 1 A 477 ARG 1 0.690 35 1 A 478 MET 1 0.630 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #