data_SMR-4e926996084c298fe7485e52ff193262_1 _entry.id SMR-4e926996084c298fe7485e52ff193262_1 _struct.entry_id SMR-4e926996084c298fe7485e52ff193262_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5VZL5/ ZMYM4_HUMAN, Zinc finger MYM-type protein 4 Estimated model accuracy of this model is 0.008, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5VZL5' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 200869.311 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZMYM4_HUMAN Q5VZL5 1 ;MAEREVESGPRKRFEQKSGAVFDEIVENCGGIMDTEMSEDIDHNLTPTLDSMSYGMPNQTGSENSLLDED DYFLNSGDLAGIPVVGSDNEDEQDFSSKDNLVSSIHTDDSLEVERRVTQHESDNENEIQIQNKLKKDFPK QFDQVSVFKSIRKDFSLVRENSKETFSGKEKNRDLTYEREKRLDKPHKDLDSRLKSSFFDKAANQVEETL HTHLPQTPETNFRDSSYPFANKESIGSELGNSFASNIRIKEEPLDDEYDKAMAPQQGLLDKIKDEPDNAQ EYSHGQQQKTQEGELKISAVFSVSGSPLAPQLTTGFQPSLASSGMNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQK GQTAYQRKGSTQLFCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSKDFCSQS CLSTYELKKKPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSKFRSANNLTMNCCENCG GYCYSGSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALCKSLRSSAEMIENTNSLGKTELFCSVN CLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAMSDGSIRNFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMNSSVVPLSQ GQVIVSIPTGSTVSAGGGSTSAVSPTSISSSAAAGLQRLAAQSQHVGFARSVVKLKCQHCNRLFATKPEL LDYKGKMFQFCGKNCSDEYKKINNVMAMCEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRWGN HCKMCSYCLQTSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDACKRQGKLSESLKWRGEMKHFCN LLCILMFCNQQSVCDPPSQNNAANISMVQAASAGPPSLRKDSTPVIANVVSLASAPAAQPTVNSNSVLQG AVPTVTAKIIGDASTQTDALKLPPSQPPRLLKNKALLCKPITQTKATSCKPHTQNKECQTEDTPSQPQII VVPVPVPVFVPIPLHLYTQYAPVPFGIPVPMPVPMLIPSSMDSEDKVTESIEDIKEKLPTHPFEADLLEM AEMIAEDEEKKTLSQGESQTSEHELFLDTKIFEKDQGSTYSGDLESEAVSTPHSWEEELNHYALKSNAVQ EADSELKQFSKGETEQDLEADFPSDSFDPLNKGQGIQARSRTRRRHRDGFPQPRRRGRKKSIVAVEPRSL IQGAFQGCSVSGMTLKYMYGVNAWKNWVQWKNAKEEQGDLKCGGVEQASSSPRSDPLGSTQDHALSQESS EPGCRVRSIKLKEDILSCTFAELSLGLCQFIQEVRRPNGEKYDPDSILYLCLGIQQYLFENGRIDNIFTE PYSRFMIELTKLLKIWEPTILPNGYMFSRIEEEHLWECKQLGAYSPIVLLNTLLFFNTKYFQLKNVTEHL KLSFAHVMRRTRTLKYSTKMTYLRFFPPLQKQESEPDKLTVGKRKRNEDDEVPVGVEMAENTDNPLRCPV RLYEFYLSKCSESVKQRNDVFYLQPERSCVPNSPMWYSTFPIDPGTLDTMLTRILMVREVHEELAKAKSE DSDVELSD ; 'Zinc finger MYM-type protein 4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1548 1 1548 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZMYM4_HUMAN Q5VZL5 . 1 1548 9606 'Homo sapiens (Human)' 2004-12-07 3B5B730EA9B9882B # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAEREVESGPRKRFEQKSGAVFDEIVENCGGIMDTEMSEDIDHNLTPTLDSMSYGMPNQTGSENSLLDED DYFLNSGDLAGIPVVGSDNEDEQDFSSKDNLVSSIHTDDSLEVERRVTQHESDNENEIQIQNKLKKDFPK QFDQVSVFKSIRKDFSLVRENSKETFSGKEKNRDLTYEREKRLDKPHKDLDSRLKSSFFDKAANQVEETL HTHLPQTPETNFRDSSYPFANKESIGSELGNSFASNIRIKEEPLDDEYDKAMAPQQGLLDKIKDEPDNAQ EYSHGQQQKTQEGELKISAVFSVSGSPLAPQLTTGFQPSLASSGMNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQK GQTAYQRKGSTQLFCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSKDFCSQS CLSTYELKKKPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSKFRSANNLTMNCCENCG GYCYSGSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALCKSLRSSAEMIENTNSLGKTELFCSVN CLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAMSDGSIRNFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMNSSVVPLSQ 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;MAEREVESGPRKRFEQKSGAVFDEIVENCGGIMDTEMSEDIDHNLTPTLDSMSYGMPNQTGSENSLLDED DYFLNSGDLAGIPVVGSDNEDEQDFSSKDNLVSSIHTDDSLEVERRVTQHESDNENEIQIQNKLKKDFPK QFDQVSVFKSIRKDFSLVRENSKETFSGKEKNRDLTYEREKRLDKPHKDLDSRLKSSFFDKAANQVEETL HTHLPQTPETNFRDSSYPFANKESIGSELGNSFASNIRIKEEPLDDEYDKAMAPQQGLLDKIKDEPDNAQ EYSHGQQQKTQEGELKISAVFSVSGSPLAPQLTTGFQPSLASSGMNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQK GQTAYQRKGSTQLFCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSKDFCSQS CLSTYELKKKPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSKFRSANNLTMNCCENCG GYCYSGSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALCKSLRSSAEMIENTNSLGKTELFCSVN CLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAMSDGSIRNFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMNSSVVPLSQ GQVIVSIPTGSTVSAGGGSTSAVSPTSISSSAAAGLQRLAAQSQHVGFARSVVKLKCQHCNRLFATKPEL LDYKGKMFQFCGKNCSDEYKKINNVMAMCEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRWGN HCKMCSYCLQTSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDACKRQGKLSESLKWRGEMKHFCN LLCILMFCNQQSVCDPPSQNNAANISMVQAASAGPPSLRKDSTPVIANVVSLASAPAAQPTVNSNSVLQG AVPTVTAKIIGDASTQTDALKLPPSQPPRLLKNKALLCKPITQTKATSCKPHTQNKECQTEDTPSQPQII 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GLY . 1 31 GLY . 1 32 ILE . 1 33 MET . 1 34 ASP . 1 35 THR . 1 36 GLU . 1 37 MET . 1 38 SER . 1 39 GLU . 1 40 ASP . 1 41 ILE . 1 42 ASP . 1 43 HIS . 1 44 ASN . 1 45 LEU . 1 46 THR . 1 47 PRO . 1 48 THR . 1 49 LEU . 1 50 ASP . 1 51 SER . 1 52 MET . 1 53 SER . 1 54 TYR . 1 55 GLY . 1 56 MET . 1 57 PRO . 1 58 ASN . 1 59 GLN . 1 60 THR . 1 61 GLY . 1 62 SER . 1 63 GLU . 1 64 ASN . 1 65 SER . 1 66 LEU . 1 67 LEU . 1 68 ASP . 1 69 GLU . 1 70 ASP . 1 71 ASP . 1 72 TYR . 1 73 PHE . 1 74 LEU . 1 75 ASN . 1 76 SER . 1 77 GLY . 1 78 ASP . 1 79 LEU . 1 80 ALA . 1 81 GLY . 1 82 ILE . 1 83 PRO . 1 84 VAL . 1 85 VAL . 1 86 GLY . 1 87 SER . 1 88 ASP . 1 89 ASN . 1 90 GLU . 1 91 ASP . 1 92 GLU . 1 93 GLN . 1 94 ASP . 1 95 PHE . 1 96 SER . 1 97 SER . 1 98 LYS . 1 99 ASP . 1 100 ASN . 1 101 LEU . 1 102 VAL . 1 103 SER . 1 104 SER . 1 105 ILE . 1 106 HIS . 1 107 THR . 1 108 ASP . 1 109 ASP . 1 110 SER . 1 111 LEU . 1 112 GLU . 1 113 VAL . 1 114 GLU . 1 115 ARG . 1 116 ARG . 1 117 VAL . 1 118 THR . 1 119 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A 1 1514 PRO 1514 ? ? ? A . A 1 1515 GLY 1515 ? ? ? A . A 1 1516 THR 1516 ? ? ? A . A 1 1517 LEU 1517 ? ? ? A . A 1 1518 ASP 1518 ? ? ? A . A 1 1519 THR 1519 ? ? ? A . A 1 1520 MET 1520 ? ? ? A . A 1 1521 LEU 1521 ? ? ? A . A 1 1522 THR 1522 ? ? ? A . A 1 1523 ARG 1523 ? ? ? A . A 1 1524 ILE 1524 ? ? ? A . A 1 1525 LEU 1525 ? ? ? A . A 1 1526 MET 1526 ? ? ? A . A 1 1527 VAL 1527 ? ? ? A . A 1 1528 ARG 1528 ? ? ? A . A 1 1529 GLU 1529 ? ? ? A . A 1 1530 VAL 1530 ? ? ? A . A 1 1531 HIS 1531 ? ? ? A . A 1 1532 GLU 1532 ? ? ? A . A 1 1533 GLU 1533 ? ? ? A . A 1 1534 LEU 1534 ? ? ? A . A 1 1535 ALA 1535 ? ? ? A . A 1 1536 LYS 1536 ? ? ? A . A 1 1537 ALA 1537 ? ? ? A . A 1 1538 LYS 1538 ? ? ? A . A 1 1539 SER 1539 ? ? ? A . A 1 1540 GLU 1540 ? ? ? A . A 1 1541 ASP 1541 ? ? ? A . A 1 1542 SER 1542 ? ? ? A . A 1 1543 ASP 1543 ? ? ? A . A 1 1544 VAL 1544 ? ? ? A . A 1 1545 GLU 1545 ? ? ? A . A 1 1546 LEU 1546 ? ? ? A . A 1 1547 SER 1547 ? ? ? A . A 1 1548 ASP 1548 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Zinc finger MYM-type protein 5 {PDB ID=2das, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2das.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2das, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GSSGSSGQPTAQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCSTTCLSSFSSGPSSG GSSGSSGQPTAQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCSTTCLSSFSSGPSSG # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 12 56 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2das 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1548 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1548 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6e-10 53.333 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAEREVESGPRKRFEQKSGAVFDEIVENCGGIMDTEMSEDIDHNLTPTLDSMSYGMPNQTGSENSLLDEDDYFLNSGDLAGIPVVGSDNEDEQDFSSKDNLVSSIHTDDSLEVERRVTQHESDNENEIQIQNKLKKDFPKQFDQVSVFKSIRKDFSLVRENSKETFSGKEKNRDLTYEREKRLDKPHKDLDSRLKSSFFDKAANQVEETLHTHLPQTPETNFRDSSYPFANKESIGSELGNSFASNIRIKEEPLDDEYDKAMAPQQGLLDKIKDEPDNAQEYSHGQQQKTQEGELKISAVFSVSGSPLAPQLTTGFQPSLASSGMNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTAYQRKGSTQLFCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSKDFCSQSCLSTYELKKKPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSKFRSANNLTMNCCENCGGYCYSGSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALCKSLRSSAEMIENTNSLGKTELFCSVNCLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAMSDGSIRNFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMNSSVVPLSQGQVIVSIPTGSTVSAGGGSTSAVSPTSISSSAAAGLQRLAAQSQHVGFARSVVKLKCQHCNRLFATKPELLDYKGKMFQFCGKNCSDEYKKINNVMAMCEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRWGNHCKMCSYCLQTSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDACKRQGKLSESLKWRGEMKHFCNLLCILMFCNQQSVCDPPSQNNAANISMVQAASAGPPSLRKDSTPVIANVVSLASAPAAQPTVNSNSVLQGAVPTVTAKIIGDASTQTDALKLPPSQPPRLLKNKALLCKPITQTKATSCKPHTQNKECQTEDTPSQPQIIVVPVPVPVFVPIPLHLYTQYAPVPFGIPVPMPVPMLIPSSMDSEDKVTESIEDIKEKLPTHPFEADLLEMAEMIAEDEEKKTLSQGESQTSEHELFLDTKIFEKDQGSTYSGDLESEAVSTPHSWEEELNHYALKSNAVQEADSELKQFSKGETEQDLEADFPSDSFDPLNKGQGIQARSRTRRRHRDGFPQPRRRGRKKSIVAVEPRSLIQGAFQGCSVSGMTLKYMYGVNAWKNWVQWKNAKEEQGDLKCGGVEQASSSPRSDPLGSTQDHALSQESSEPGCRVRSIKLKEDILSCTFAELSLGLCQFIQEVRRPNGEKYDPDSILYLCLGIQQYLFENGRIDNIFTEPYSRFMIELTKLLKIWEPTILPNGYMFSRIEEEHLWECKQLGAYSPIVLLNTLLFFNTKYFQLKNVTEHLKLSFAHVMRRTRTLKYSTKMTYLRFFPPLQKQESEPDKLTVGKRKRNEDDEVPVGVEMAENTDNPLRCPVRLYEFYLSKCSESVKQRNDVFYLQPERSCVPNSPMWYSTFPIDPGTLDTMLTRILMVREVHEELAKAKSEDSDVELSD 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCSTTCLSSFS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2das.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 330 330 ? A -12.962 10.963 8.169 1 1 A PRO 0.160 1 ATOM 2 C CA . PRO 330 330 ? A -11.681 10.176 8.404 1 1 A PRO 0.160 1 ATOM 3 C C . PRO 330 330 ? A -10.442 10.956 7.990 1 1 A PRO 0.160 1 ATOM 4 O O . PRO 330 330 ? A -10.568 11.845 7.150 1 1 A PRO 0.160 1 ATOM 5 C CB . PRO 330 330 ? A -11.887 8.897 7.584 1 1 A PRO 0.160 1 ATOM 6 C CG . PRO 330 330 ? A -13.382 8.796 7.229 1 1 A PRO 0.160 1 ATOM 7 C CD . PRO 330 330 ? A -13.901 10.227 7.226 1 1 A PRO 0.160 1 ATOM 8 N N . SER 331 331 ? A -9.276 10.625 8.591 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 9 C CA . SER 331 331 ? A -7.956 11.184 8.324 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 10 C C . SER 331 331 ? A -7.030 10.017 7.999 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 11 O O . SER 331 331 ? A -7.067 9.012 8.709 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 12 C CB . SER 331 331 ? A -7.396 11.924 9.577 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 13 O OG . SER 331 331 ? A -6.110 12.498 9.339 1 1 A SER 0.200 1 ATOM 14 N N . VAL 332 332 ? A -6.219 10.087 6.919 1 1 A VAL 0.190 1 ATOM 15 C CA . VAL 332 332 ? A -5.348 8.996 6.495 1 1 A VAL 0.190 1 ATOM 16 C C . VAL 332 332 ? A -4.258 9.616 5.609 1 1 A VAL 0.190 1 ATOM 17 O O . VAL 332 332 ? A -4.520 10.712 5.108 1 1 A VAL 0.190 1 ATOM 18 C CB . VAL 332 332 ? A -6.170 7.896 5.781 1 1 A VAL 0.190 1 ATOM 19 C CG1 . VAL 332 332 ? A -6.608 8.261 4.344 1 1 A VAL 0.190 1 ATOM 20 C CG2 . VAL 332 332 ? A -5.449 6.535 5.790 1 1 A VAL 0.190 1 ATOM 21 N N . PRO 333 333 ? A -3.045 9.091 5.358 1 1 A PRO 0.210 1 ATOM 22 C CA . PRO 333 333 ? A -2.191 9.536 4.251 1 1 A PRO 0.210 1 ATOM 23 C C . PRO 333 333 ? A -2.894 9.627 2.893 1 1 A PRO 0.210 1 ATOM 24 O O . PRO 333 333 ? A -3.535 8.660 2.487 1 1 A PRO 0.210 1 ATOM 25 C CB . PRO 333 333 ? A -1.028 8.521 4.212 1 1 A PRO 0.210 1 ATOM 26 C CG . PRO 333 333 ? A -0.992 7.847 5.595 1 1 A PRO 0.210 1 ATOM 27 C CD . PRO 333 333 ? A -2.379 8.103 6.210 1 1 A PRO 0.210 1 ATOM 28 N N . ALA 334 334 ? A -2.745 10.755 2.159 1 1 A ALA 0.250 1 ATOM 29 C CA . ALA 334 334 ? A -3.296 10.990 0.834 1 1 A ALA 0.250 1 ATOM 30 C C . ALA 334 334 ? A -2.863 9.968 -0.208 1 1 A ALA 0.250 1 ATOM 31 O O . ALA 334 334 ? A -3.632 9.545 -1.065 1 1 A ALA 0.250 1 ATOM 32 C CB . ALA 334 334 ? A -2.802 12.377 0.357 1 1 A ALA 0.250 1 ATOM 33 N N . THR 335 335 ? A -1.585 9.565 -0.150 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 34 C CA . THR 335 335 ? A -1.058 8.546 -1.024 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 35 C C . THR 335 335 ? A 0.083 7.859 -0.311 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 36 O O . THR 335 335 ? A 0.746 8.441 0.554 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 37 C CB . THR 335 335 ? A -0.655 9.099 -2.390 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 38 O OG1 . THR 335 335 ? A -0.191 8.082 -3.264 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 39 C CG2 . THR 335 335 ? A 0.426 10.187 -2.268 1 1 A THR 0.280 1 ATOM 40 N N . ALA 336 336 ? A 0.272 6.564 -0.623 1 1 A ALA 0.300 1 ATOM 41 C CA . ALA 336 336 ? A 1.358 5.707 -0.197 1 1 A ALA 0.300 1 ATOM 42 C C . ALA 336 336 ? A 2.717 6.107 -0.783 1 1 A ALA 0.300 1 ATOM 43 O O . ALA 336 336 ? A 2.818 6.613 -1.896 1 1 A ALA 0.300 1 ATOM 44 C CB . ALA 336 336 ? A 1.035 4.238 -0.556 1 1 A ALA 0.300 1 ATOM 45 N N . VAL 337 337 ? A 3.812 5.887 -0.022 1 1 A VAL 0.250 1 ATOM 46 C CA . VAL 337 337 ? A 5.174 6.174 -0.468 1 1 A VAL 0.250 1 ATOM 47 C C . VAL 337 337 ? A 5.804 5.001 -1.215 1 1 A VAL 0.250 1 ATOM 48 O O . VAL 337 337 ? A 6.423 5.152 -2.263 1 1 A VAL 0.250 1 ATOM 49 C CB . VAL 337 337 ? A 6.058 6.551 0.723 1 1 A VAL 0.250 1 ATOM 50 C CG1 . VAL 337 337 ? A 7.512 6.827 0.271 1 1 A VAL 0.250 1 ATOM 51 C CG2 . VAL 337 337 ? A 5.465 7.815 1.380 1 1 A VAL 0.250 1 ATOM 52 N N . ARG 338 338 ? A 5.660 3.776 -0.668 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 53 C CA . ARG 338 338 ? A 6.245 2.567 -1.210 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 54 C C . ARG 338 338 ? A 5.130 1.611 -1.584 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 55 O O . ARG 338 338 ? A 3.959 1.850 -1.300 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 56 C CB . ARG 338 338 ? A 7.166 1.851 -0.181 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 57 C CG . ARG 338 338 ? A 8.393 2.670 0.260 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 58 C CD . 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. 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