data_SMR-5497ba826fc694c2970823d23386e72b_4 _entry.id SMR-5497ba826fc694c2970823d23386e72b_4 _struct.entry_id SMR-5497ba826fc694c2970823d23386e72b_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8BJ34 (isoform 2)/ MARF1_MOUSE, Meiosis regulator and mRNA stability factor 1 Estimated model accuracy of this model is 0.046, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8BJ34 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 212711.687 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MARF1_MOUSE Q8BJ34 1 ;MENKKAAVELKDIPSPLHVGSKFFPAVPLPDIRSLQQPKVQLSAIPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGSG SSGGSGSLIHTGSLLDSPSTGTVTCQVGSGFAFQSVSSLQNASTRNNLVGLSSDFPSMCVESNLPSCKHL SCCGKLHFQSCHSNVHKLHQFQNLQGCASAGYFPCSDFPSGAPGHLEERLSHSELTPHLCTNSLHLNVAP PVCLKGSLYCEDCLNKVCIFYSLSWGRRGLVLLNGSIWPIPPPSTQPAPPAIPVCNGCGTKGMEKETSLL LATSLGKTASKFGSPEVAVTGQVLETLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATTVVQRIREKFFRGHREAEFICV CDISKENKEVIQELNNSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANQLIRFEEFISDLPPRL PLKIPCHTLLYVYNLPANKDGKSISNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVF GNRIIVSFTPKHREFFEAKSSNAIADKVKSPKKVKNTKLCLIKDTSEQSPSVKAMPGKVLQANSGSATKT TNIKSLQELCRMESKSGNRNSDHQQGHGRLAALPNSGPTASVPIVKNTGVTEPLYRSSQKKENPSSQSTV NSPVEKKKREETVFQVSYPSAFSKLIASRQVSPLLTSQSWSPRASPLAFNIANPSSGADCPDPFANGVDI QVSNVDYRLSRKELQQLLQEAFSKHGQVKSVELSPHTDYQLKAIVQMRNLHEAICAVNSLHRHKIGSKKI LVSLSTGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGR LVCLLPSNQARQSPLGSSQSHDGSSSNCSPVLFEELEYHEPVCKQHCSNKDFSELVFDPDSYKIPFVVLS LKVFAPQVHSLLQTHQGTVPLLSFPDCYAAEFGDLEITQDSHKGVPLEHFITCIPGVNIATAQNGVKVVK WIHNKPPPPNTDPWLLRSKSPVRNPQLIQFSREVIDLLKTQPSCILPVSNFIPSYHHHFGKQCRVSDYGY SKLIELLEAVPHVLQILGMGSKRLMTLTHRAQVKRFTQDLLKLLKSQASKQVIVRDFSQAYHWCFSKDWD VTEYGVCDLIDIISEIPDTTICLSQQDDDMVICIRKRERTQDEIERTKQFSKDVVDLLRHQPHFRMPFNK FIPSYHHHFGRQCKLAYYGFTKLLELLEAIPEILQVLECGEEKILTLTEVERFKALAAQFVKLLRSQKGN CLMMTDLFTEYAKTFGYTFRLQDYDVSSVSALTQKLCHVVKVADMESGKQIQLINRKSLRSLTAQLLVLL MSWEGDAYLPVDELRRHYETTHSTPLNPCEYGFMTLTELLKSLPYLVEVCTNDKAEEYVKLTSLYLFAKN VRSLLHTYHYQQIFLHEFSMAYNKYVGETLQPKTYGYSSVEELLGAIPQVVWIKGHGHKRIVVLKNDMKN RLSSFDLFSVNHEDQPAVSRQILAVPESHLASELQLRTGTGPSQMEQELLHLASSSPVDLLCAPVPSCLP SPQLRPDPVILKPADLIQFEEHPQEPLGVLVLNQEEKSEVPLPVQKGNLSCDSSPSSPAASPAPPGPSSE APRPLFSKDAVESPAKKQPKNRVKLAANFSFAPVTKL ; 'Meiosis regulator and mRNA stability factor 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1647 1 1647 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MARF1_MOUSE Q8BJ34 Q8BJ34-2 1 1647 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2012-05-16 3B517E929A02B38A # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MENKKAAVELKDIPSPLHVGSKFFPAVPLPDIRSLQQPKVQLSAIPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGSG SSGGSGSLIHTGSLLDSPSTGTVTCQVGSGFAFQSVSSLQNASTRNNLVGLSSDFPSMCVESNLPSCKHL SCCGKLHFQSCHSNVHKLHQFQNLQGCASAGYFPCSDFPSGAPGHLEERLSHSELTPHLCTNSLHLNVAP PVCLKGSLYCEDCLNKVCIFYSLSWGRRGLVLLNGSIWPIPPPSTQPAPPAIPVCNGCGTKGMEKETSLL LATSLGKTASKFGSPEVAVTGQVLETLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATTVVQRIREKFFRGHREAEFICV CDISKENKEVIQELNNSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANQLIRFEEFISDLPPRL PLKIPCHTLLYVYNLPANKDGKSISNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVF GNRIIVSFTPKHREFFEAKSSNAIADKVKSPKKVKNTKLCLIKDTSEQSPSVKAMPGKVLQANSGSATKT TNIKSLQELCRMESKSGNRNSDHQQGHGRLAALPNSGPTASVPIVKNTGVTEPLYRSSQKKENPSSQSTV 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APRPLFSKDAVESPAKKQPKNRVKLAANFSFAPVTKL ; ;MENKKAAVELKDIPSPLHVGSKFFPAVPLPDIRSLQQPKVQLSAIPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGSG SSGGSGSLIHTGSLLDSPSTGTVTCQVGSGFAFQSVSSLQNASTRNNLVGLSSDFPSMCVESNLPSCKHL SCCGKLHFQSCHSNVHKLHQFQNLQGCASAGYFPCSDFPSGAPGHLEERLSHSELTPHLCTNSLHLNVAP PVCLKGSLYCEDCLNKVCIFYSLSWGRRGLVLLNGSIWPIPPPSTQPAPPAIPVCNGCGTKGMEKETSLL LATSLGKTASKFGSPEVAVTGQVLETLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATTVVQRIREKFFRGHREAEFICV CDISKENKEVIQELNNSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANQLIRFEEFISDLPPRL PLKIPCHTLLYVYNLPANKDGKSISNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVF GNRIIVSFTPKHREFFEAKSSNAIADKVKSPKKVKNTKLCLIKDTSEQSPSVKAMPGKVLQANSGSATKT TNIKSLQELCRMESKSGNRNSDHQQGHGRLAALPNSGPTASVPIVKNTGVTEPLYRSSQKKENPSSQSTV NSPVEKKKREETVFQVSYPSAFSKLIASRQVSPLLTSQSWSPRASPLAFNIANPSSGADCPDPFANGVDI QVSNVDYRLSRKELQQLLQEAFSKHGQVKSVELSPHTDYQLKAIVQMRNLHEAICAVNSLHRHKIGSKKI LVSLSTGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGR LVCLLPSNQARQSPLGSSQSHDGSSSNCSPVLFEELEYHEPVCKQHCSNKDFSELVFDPDSYKIPFVVLS 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1 15 SER . 1 16 PRO . 1 17 LEU . 1 18 HIS . 1 19 VAL . 1 20 GLY . 1 21 SER . 1 22 LYS . 1 23 PHE . 1 24 PHE . 1 25 PRO . 1 26 ALA . 1 27 VAL . 1 28 PRO . 1 29 LEU . 1 30 PRO . 1 31 ASP . 1 32 ILE . 1 33 ARG . 1 34 SER . 1 35 LEU . 1 36 GLN . 1 37 GLN . 1 38 PRO . 1 39 LYS . 1 40 VAL . 1 41 GLN . 1 42 LEU . 1 43 SER . 1 44 ALA . 1 45 ILE . 1 46 PRO . 1 47 LYS . 1 48 VAL . 1 49 SER . 1 50 CYS . 1 51 CYS . 1 52 ALA . 1 53 HIS . 1 54 CYS . 1 55 PRO . 1 56 ASN . 1 57 GLU . 1 58 PRO . 1 59 SER . 1 60 THR . 1 61 SER . 1 62 PRO . 1 63 MET . 1 64 ARG . 1 65 PHE . 1 66 GLY . 1 67 GLY . 1 68 GLY . 1 69 SER . 1 70 GLY . 1 71 SER . 1 72 SER . 1 73 GLY . 1 74 GLY . 1 75 SER . 1 76 GLY . 1 77 SER . 1 78 LEU . 1 79 ILE . 1 80 HIS . 1 81 THR . 1 82 GLY . 1 83 SER . 1 84 LEU . 1 85 LEU . 1 86 ASP . 1 87 SER . 1 88 PRO . 1 89 SER . 1 90 THR . 1 91 GLY . 1 92 THR . 1 93 VAL . 1 94 THR . 1 95 CYS . 1 96 GLN . 1 97 VAL . 1 98 GLY . 1 99 SER . 1 100 GLY . 1 101 PHE . 1 102 ALA . 1 103 PHE . 1 104 GLN . 1 105 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A 1 1438 SER 1438 ? ? ? A . A 1 1439 SER 1439 ? ? ? A . A 1 1440 VAL 1440 ? ? ? A . A 1 1441 GLU 1441 ? ? ? A . A 1 1442 GLU 1442 ? ? ? A . A 1 1443 LEU 1443 ? ? ? A . A 1 1444 LEU 1444 ? ? ? A . A 1 1445 GLY 1445 ? ? ? A . A 1 1446 ALA 1446 ? ? ? A . A 1 1447 ILE 1447 ? ? ? A . A 1 1448 PRO 1448 ? ? ? A . A 1 1449 GLN 1449 ? ? ? A . A 1 1450 VAL 1450 ? ? ? A . A 1 1451 VAL 1451 ? ? ? A . A 1 1452 TRP 1452 ? ? ? A . A 1 1453 ILE 1453 ? ? ? A . A 1 1454 LYS 1454 ? ? ? A . A 1 1455 GLY 1455 ? ? ? A . A 1 1456 HIS 1456 ? ? ? A . A 1 1457 GLY 1457 ? ? ? A . A 1 1458 HIS 1458 ? ? ? A . A 1 1459 LYS 1459 ? ? ? A . A 1 1460 ARG 1460 ? ? ? A . A 1 1461 ILE 1461 ? ? ? A . A 1 1462 VAL 1462 ? ? ? A . A 1 1463 VAL 1463 ? ? ? A . A 1 1464 LEU 1464 ? ? ? A . A 1 1465 LYS 1465 ? ? ? A . A 1 1466 ASN 1466 ? ? ? A . A 1 1467 ASP 1467 ? ? ? A . A 1 1468 MET 1468 ? ? ? A . A 1 1469 LYS 1469 ? ? ? A . A 1 1470 ASN 1470 ? ? ? A . A 1 1471 ARG 1471 ? ? ? A . A 1 1472 LEU 1472 ? ? ? A . A 1 1473 SER 1473 ? ? ? A . A 1 1474 SER 1474 ? ? ? A . A 1 1475 PHE 1475 ? ? ? A . A 1 1476 ASP 1476 ? ? ? A . A 1 1477 LEU 1477 ? ? ? A . A 1 1478 PHE 1478 ? ? ? A . A 1 1479 SER 1479 ? ? ? A . A 1 1480 VAL 1480 ? ? ? A . A 1 1481 ASN 1481 ? ? ? A . A 1 1482 HIS 1482 ? ? ? A . A 1 1483 GLU 1483 ? ? ? A . A 1 1484 ASP 1484 ? ? ? A . A 1 1485 GLN 1485 ? ? ? A . A 1 1486 PRO 1486 ? ? ? A . A 1 1487 ALA 1487 ? ? ? A . A 1 1488 VAL 1488 ? ? ? A . A 1 1489 SER 1489 ? ? ? A . A 1 1490 ARG 1490 ? ? ? A . A 1 1491 GLN 1491 ? ? ? A . A 1 1492 ILE 1492 ? ? ? A . A 1 1493 LEU 1493 ? ? ? A . A 1 1494 ALA 1494 ? ? ? A . A 1 1495 VAL 1495 ? ? ? A . A 1 1496 PRO 1496 ? ? ? A . A 1 1497 GLU 1497 ? ? ? A . A 1 1498 SER 1498 ? ? ? A . A 1 1499 HIS 1499 ? ? ? A . A 1 1500 LEU 1500 ? ? ? A . A 1 1501 ALA 1501 ? ? ? A . A 1 1502 SER 1502 ? ? ? A . A 1 1503 GLU 1503 ? ? ? A . A 1 1504 LEU 1504 ? ? ? A . A 1 1505 GLN 1505 ? ? ? A . A 1 1506 LEU 1506 ? ? ? A . A 1 1507 ARG 1507 ? ? ? A . A 1 1508 THR 1508 ? ? ? A . A 1 1509 GLY 1509 ? ? ? A . A 1 1510 THR 1510 ? ? ? A . A 1 1511 GLY 1511 ? ? ? A . A 1 1512 PRO 1512 ? ? ? A . A 1 1513 SER 1513 ? ? ? A . A 1 1514 GLN 1514 ? ? ? A . A 1 1515 MET 1515 ? ? ? A . A 1 1516 GLU 1516 ? ? ? A . A 1 1517 GLN 1517 ? ? ? A . A 1 1518 GLU 1518 ? ? ? A . A 1 1519 LEU 1519 ? ? ? A . A 1 1520 LEU 1520 ? ? ? A . A 1 1521 HIS 1521 ? ? ? A . A 1 1522 LEU 1522 ? ? ? A . A 1 1523 ALA 1523 ? ? ? A . A 1 1524 SER 1524 ? ? ? A . A 1 1525 SER 1525 ? ? ? A . A 1 1526 SER 1526 ? ? ? A . A 1 1527 PRO 1527 ? ? ? A . A 1 1528 VAL 1528 ? ? ? A . A 1 1529 ASP 1529 ? ? ? A . A 1 1530 LEU 1530 ? ? ? A . A 1 1531 LEU 1531 ? ? ? A . A 1 1532 CYS 1532 ? ? ? A . A 1 1533 ALA 1533 ? ? ? A . A 1 1534 PRO 1534 ? ? ? A . A 1 1535 VAL 1535 ? ? ? A . A 1 1536 PRO 1536 ? ? ? A . A 1 1537 SER 1537 ? ? ? A . A 1 1538 CYS 1538 ? ? ? A . A 1 1539 LEU 1539 ? ? ? A . A 1 1540 PRO 1540 ? ? ? A . A 1 1541 SER 1541 ? ? ? A . A 1 1542 PRO 1542 ? ? ? A . A 1 1543 GLN 1543 ? ? ? A . A 1 1544 LEU 1544 ? ? ? A . A 1 1545 ARG 1545 ? ? ? A . A 1 1546 PRO 1546 ? ? ? A . A 1 1547 ASP 1547 ? ? ? A . A 1 1548 PRO 1548 ? ? ? A . A 1 1549 VAL 1549 ? ? ? A . A 1 1550 ILE 1550 ? ? ? A . A 1 1551 LEU 1551 ? ? ? A . A 1 1552 LYS 1552 ? ? ? A . A 1 1553 PRO 1553 ? ? ? A . A 1 1554 ALA 1554 ? ? ? A . A 1 1555 ASP 1555 ? ? ? A . A 1 1556 LEU 1556 ? ? ? A . A 1 1557 ILE 1557 ? ? ? A . A 1 1558 GLN 1558 ? ? ? A . A 1 1559 PHE 1559 ? ? ? A . A 1 1560 GLU 1560 ? ? ? A . A 1 1561 GLU 1561 ? ? ? A . A 1 1562 HIS 1562 ? ? ? A . A 1 1563 PRO 1563 ? ? ? A . A 1 1564 GLN 1564 ? ? ? A . A 1 1565 GLU 1565 ? ? ? A . A 1 1566 PRO 1566 ? ? ? A . A 1 1567 LEU 1567 ? ? ? A . A 1 1568 GLY 1568 ? ? ? A . A 1 1569 VAL 1569 ? ? ? A . A 1 1570 LEU 1570 ? ? ? A . A 1 1571 VAL 1571 ? ? ? A . A 1 1572 LEU 1572 ? ? ? A . A 1 1573 ASN 1573 ? ? ? A . A 1 1574 GLN 1574 ? ? ? A . A 1 1575 GLU 1575 ? ? ? A . A 1 1576 GLU 1576 ? ? ? A . A 1 1577 LYS 1577 ? ? ? A . A 1 1578 SER 1578 ? ? ? A . A 1 1579 GLU 1579 ? ? ? A . A 1 1580 VAL 1580 ? ? ? A . A 1 1581 PRO 1581 ? ? ? A . A 1 1582 LEU 1582 ? ? ? A . A 1 1583 PRO 1583 ? ? ? A . A 1 1584 VAL 1584 ? ? ? A . A 1 1585 GLN 1585 ? ? ? A . A 1 1586 LYS 1586 ? ? ? A . A 1 1587 GLY 1587 ? ? ? A . A 1 1588 ASN 1588 ? ? ? A . A 1 1589 LEU 1589 ? ? ? A . A 1 1590 SER 1590 ? ? ? A . A 1 1591 CYS 1591 ? ? ? A . A 1 1592 ASP 1592 ? ? ? A . A 1 1593 SER 1593 ? ? ? A . A 1 1594 SER 1594 ? ? ? A . A 1 1595 PRO 1595 ? ? ? A . A 1 1596 SER 1596 ? ? ? A . A 1 1597 SER 1597 ? ? ? A . A 1 1598 PRO 1598 ? ? ? A . A 1 1599 ALA 1599 ? ? ? A . A 1 1600 ALA 1600 ? ? ? A . A 1 1601 SER 1601 ? ? ? A . A 1 1602 PRO 1602 ? ? ? A . A 1 1603 ALA 1603 ? ? ? A . A 1 1604 PRO 1604 ? ? ? A . A 1 1605 PRO 1605 ? ? ? A . A 1 1606 GLY 1606 ? ? ? A . A 1 1607 PRO 1607 ? ? ? A . A 1 1608 SER 1608 ? ? ? A . A 1 1609 SER 1609 ? ? ? A . A 1 1610 GLU 1610 ? ? ? A . A 1 1611 ALA 1611 ? ? ? A . A 1 1612 PRO 1612 ? ? ? A . A 1 1613 ARG 1613 ? ? ? A . A 1 1614 PRO 1614 ? ? ? A . A 1 1615 LEU 1615 ? ? ? A . A 1 1616 PHE 1616 ? ? ? A . A 1 1617 SER 1617 ? ? ? A . A 1 1618 LYS 1618 ? ? ? A . A 1 1619 ASP 1619 ? ? ? A . A 1 1620 ALA 1620 ? ? ? A . A 1 1621 VAL 1621 ? ? ? A . A 1 1622 GLU 1622 ? ? ? A . A 1 1623 SER 1623 ? ? ? A . A 1 1624 PRO 1624 ? ? ? A . A 1 1625 ALA 1625 ? ? ? A . A 1 1626 LYS 1626 ? ? ? A . A 1 1627 LYS 1627 ? ? ? A . A 1 1628 GLN 1628 ? ? ? A . A 1 1629 PRO 1629 ? ? ? A . A 1 1630 LYS 1630 ? ? ? A . A 1 1631 ASN 1631 ? ? ? A . A 1 1632 ARG 1632 ? ? ? A . A 1 1633 VAL 1633 ? ? ? A . A 1 1634 LYS 1634 ? ? ? A . A 1 1635 LEU 1635 ? ? ? A . A 1 1636 ALA 1636 ? ? ? A . A 1 1637 ALA 1637 ? ? ? A . A 1 1638 ASN 1638 ? ? ? A . A 1 1639 PHE 1639 ? ? ? A . A 1 1640 SER 1640 ? ? ? A . A 1 1641 PHE 1641 ? ? ? A . A 1 1642 ALA 1642 ? ? ? A . A 1 1643 PRO 1643 ? ? ? A . A 1 1644 VAL 1644 ? ? ? A . A 1 1645 THR 1645 ? ? ? A . A 1 1646 LYS 1646 ? ? ? A . A 1 1647 LEU 1647 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Meiosis regulator and mRNA stability factor 1 {PDB ID=5yad, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5yad.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5yad, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;STGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCL LPSNQ ; ;STGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCL LPSNQ ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 75 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5yad 2024-10-16 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1647 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1647 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4.6e-18 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MENKKAAVELKDIPSPLHVGSKFFPAVPLPDIRSLQQPKVQLSAIPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGSGSSGGSGSLIHTGSLLDSPSTGTVTCQVGSGFAFQSVSSLQNASTRNNLVGLSSDFPSMCVESNLPSCKHLSCCGKLHFQSCHSNVHKLHQFQNLQGCASAGYFPCSDFPSGAPGHLEERLSHSELTPHLCTNSLHLNVAPPVCLKGSLYCEDCLNKVCIFYSLSWGRRGLVLLNGSIWPIPPPSTQPAPPAIPVCNGCGTKGMEKETSLLLATSLGKTASKFGSPEVAVTGQVLETLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATTVVQRIREKFFRGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANQLIRFEEFISDLPPRLPLKIPCHTLLYVYNLPANKDGKSISNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKHREFFEAKSSNAIADKVKSPKKVKNTKLCLIKDTSEQSPSVKAMPGKVLQANSGSATKTTNIKSLQELCRMESKSGNRNSDHQQGHGRLAALPNSGPTASVPIVKNTGVTEPLYRSSQKKENPSSQSTVNSPVEKKKREETVFQVSYPSAFSKLIASRQVSPLLTSQSWSPRASPLAFNIANPSSGADCPDPFANGVDIQVSNVDYRLSRKELQQLLQEAFSKHGQVKSVELSPHTDYQLKAIVQMRNLHEAICAVNSLHRHKIGSKKILVSLSTGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCLLPSNQARQSPLGSSQSHDGSSSNCSPVLFEELEYHEPVCKQHCSNKDFSELVFDPDSYKIPFVVLSLKVFAPQVHSLLQTHQGTVPLLSFPDCYAAEFGDLEITQDSHKGVPLEHFITCIPGVNIATAQNGVKVVKWIHNKPPPPNTDPWLLRSKSPVRNPQLIQFSREVIDLLKTQPSCILPVSNFIPSYHHHFGKQCRVSDYGYSKLIELLEAVPHVLQILGMGSKRLMTLTHRAQVKRFTQDLLKLLKSQASKQVIVRDFSQAYHWCFSKDWDVTEYGVCDLIDIISEIPDTTICLSQQDDDMVICIRKRERTQDEIERTKQFSKDVVDLLRHQPHFRMPFNKFIPSYHHHFGRQCKLAYYGFTKLLELLEAIPEILQVLECGEEKILTLTEVERFKALAAQFVKLLRSQKGNCLMMTDLFTEYAKTFGYTFRLQDYDVSSVSALTQKLCHVVKVADMESGKQIQLINRKSLRSLTAQLLVLLMSWEGDAYLPVDELRRHYETTHSTPLNPCEYGFMTLTELLKSLPYLVEVCTNDKAEEYVKLTSLYLFAKNVRSLLHTYHYQQIFLHEFSMAYNKYVGETLQPKTYGYSSVEELLGAIPQVVWIKGHGHKRIVVLKNDMKNRLSSFDLFSVNHEDQPAVSRQILAVPESHLASELQLRTGTGPSQMEQELLHLASSSPVDLLCAPVPSCLPSPQLRPDPVILKPADLIQFEEHPQEPLGVLVLNQEEKSEVPLPVQKGNLSCDSSPSSPAASPAPPGPSSEAPRPLFSKDAVESPAKKQPKNRVKLAANFSFAPVTKL 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCLLPSNQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.140}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5yad.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 779 779 ? A 39.189 17.246 21.903 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 2 C CA . ALA 779 779 ? A 38.841 16.688 23.255 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 3 C C . ALA 779 779 ? A 39.929 16.881 24.302 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 4 O O . ALA 779 779 ? A 39.680 17.574 25.298 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 5 C CB . ALA 779 779 ? A 38.417 15.212 23.100 1 1 A ALA 0.510 1 ATOM 6 N N . ASN 780 780 ? A 41.171 16.389 24.093 1 1 A ASN 0.530 1 ATOM 7 C CA . ASN 780 780 ? A 42.319 16.606 24.978 1 1 A ASN 0.530 1 ATOM 8 C C . ASN 780 780 ? A 42.606 18.069 25.305 1 1 A ASN 0.530 1 ATOM 9 O O . ASN 780 780 ? A 42.894 18.407 26.442 1 1 A ASN 0.530 1 ATOM 10 C CB . ASN 780 780 ? A 43.612 16.000 24.364 1 1 A ASN 0.530 1 ATOM 11 C CG . ASN 780 780 ? A 43.651 14.493 24.567 1 1 A ASN 0.530 1 ATOM 12 O OD1 . ASN 780 780 ? A 43.134 13.993 25.583 1 1 A ASN 0.530 1 ATOM 13 N ND2 . ASN 780 780 ? A 44.253 13.727 23.642 1 1 A ASN 0.530 1 ATOM 14 N N . LYS 781 781 ? A 42.497 18.988 24.320 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 15 C CA . LYS 781 781 ? A 42.645 20.415 24.581 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 16 C C . LYS 781 781 ? A 41.635 20.980 25.580 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 17 O O . LYS 781 781 ? A 41.993 21.667 26.522 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 18 C CB . LYS 781 781 ? A 42.511 21.224 23.268 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 19 C CG . LYS 781 781 ? A 43.695 21.050 22.303 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 20 C CD . LYS 781 781 ? A 43.508 21.887 21.021 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 21 C CE . LYS 781 781 ? A 44.759 22.119 20.157 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 22 N NZ . LYS 781 781 ? A 45.628 20.924 20.144 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 23 N N . SER 782 782 ? A 40.342 20.634 25.398 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 24 C CA . SER 782 782 ? A 39.255 21.018 26.283 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 25 C C . SER 782 782 ? A 39.412 20.445 27.689 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 26 O O . SER 782 782 ? A 39.242 21.144 28.676 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 27 C CB . SER 782 782 ? A 37.873 20.571 25.726 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 28 O OG . SER 782 782 ? A 37.633 21.013 24.382 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 29 N N . LEU 783 783 ? A 39.794 19.151 27.811 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 30 C CA . LEU 783 783 ? A 40.116 18.508 29.078 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 31 C C . LEU 783 783 ? A 41.337 19.097 29.788 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 32 O O . LEU 783 783 ? A 41.350 19.264 30.999 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 33 C CB . LEU 783 783 ? A 40.289 16.983 28.883 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 34 C CG . LEU 783 783 ? A 38.983 16.247 28.518 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 35 C CD1 . LEU 783 783 ? A 39.279 14.846 27.963 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 36 C CD2 . LEU 783 783 ? A 38.040 16.163 29.727 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 37 N N . SER 784 784 ? A 42.394 19.451 29.026 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 38 C CA . SER 784 784 ? A 43.562 20.165 29.546 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 39 C C . SER 784 784 ? A 43.232 21.561 30.070 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 40 O O . SER 784 784 ? A 43.682 21.969 31.139 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 41 C CB . SER 784 784 ? A 44.690 20.259 28.485 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 42 O OG . SER 784 784 ? A 45.933 20.660 29.067 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 43 N N . LEU 785 785 ? A 42.386 22.337 29.366 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 44 C CA . LEU 785 785 ? A 41.847 23.586 29.887 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 45 C C . LEU 785 785 ? A 40.986 23.393 31.121 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 46 O O . LEU 785 785 ? A 41.132 24.083 32.117 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 47 C CB . LEU 785 785 ? A 41.008 24.325 28.829 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 48 C CG . LEU 785 785 ? A 41.837 24.915 27.679 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 49 C CD1 . LEU 785 785 ? A 40.902 25.256 26.513 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 50 C CD2 . LEU 785 785 ? A 42.629 26.154 28.127 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 51 N N . LEU 786 786 ? A 40.104 22.377 31.114 1 1 A LEU 0.830 1 ATOM 52 C CA . LEU 786 786 ? A 39.294 22.056 32.272 1 1 A LEU 0.830 1 ATOM 53 C C . LEU 786 786 ? A 40.124 21.709 33.509 1 1 A LEU 0.830 1 ATOM 54 O O . LEU 786 786 ? A 39.788 22.074 34.640 1 1 A LEU 0.830 1 ATOM 55 C CB . LEU 786 786 ? A 38.341 20.893 31.926 1 1 A LEU 0.830 1 ATOM 56 C CG . LEU 786 786 ? A 37.428 20.431 33.075 1 1 A LEU 0.830 1 ATOM 57 C CD1 . LEU 786 786 ? A 36.537 21.556 33.615 1 1 A LEU 0.830 1 ATOM 58 C CD2 . LEU 786 786 ? A 36.599 19.220 32.639 1 1 A LEU 0.830 1 ATOM 59 N N . SER 787 787 ? A 41.267 21.008 33.348 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 60 C CA . SER 787 787 ? A 42.168 20.700 34.451 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 61 C C . SER 787 787 ? A 42.719 21.929 35.157 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 62 O O . SER 787 787 ? A 42.746 21.970 36.385 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 63 C CB . SER 787 787 ? A 43.313 19.704 34.111 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 64 O OG . SER 787 787 ? A 44.388 20.287 33.388 1 1 A SER 0.880 1 ATOM 65 N N . THR 788 788 ? A 43.102 22.973 34.391 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 66 C CA . THR 788 788 ? A 43.558 24.266 34.913 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 67 C C . THR 788 788 ? A 42.460 25.025 35.631 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 68 O O . THR 788 788 ? A 42.679 25.600 36.718 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 69 C CB . THR 788 788 ? A 44.252 25.175 33.891 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 70 O OG1 . THR 788 788 ? A 43.370 25.733 32.936 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 71 C CG2 . THR 788 788 ? A 45.310 24.381 33.117 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 72 N N . GLU 789 789 ? A 41.233 25.027 35.103 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 73 C CA . GLU 789 789 ? A 40.048 25.577 35.730 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 74 C C . GLU 789 789 ? A 39.674 24.898 37.040 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 75 O O . GLU 789 789 ? A 39.361 25.565 38.026 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 76 C CB . GLU 789 789 ? A 38.840 25.484 34.782 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 77 C CG . GLU 789 789 ? A 39.007 26.290 33.473 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 78 C CD . GLU 789 789 ? A 37.868 26.058 32.486 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 79 O OE1 . GLU 789 789 ? A 37.187 25.005 32.601 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 80 O OE2 . GLU 789 789 ? A 37.668 26.925 31.604 1 1 A GLU 0.880 1 ATOM 81 N N . THR 790 790 ? A 39.745 23.554 37.078 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 82 C CA . THR 790 790 ? A 39.592 22.703 38.265 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 83 C C . THR 790 790 ? A 40.653 22.975 39.319 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 84 O O . THR 790 790 ? A 40.348 23.096 40.508 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 85 C CB . THR 790 790 ? A 39.628 21.220 37.894 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 86 O OG1 . THR 790 790 ? A 38.492 20.873 37.116 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 87 C CG2 . THR 790 790 ? A 39.579 20.283 39.103 1 1 A THR 0.880 1 ATOM 88 N N . MET 791 791 ? A 41.934 23.135 38.917 1 1 A MET 0.830 1 ATOM 89 C CA . MET 791 791 ? A 43.012 23.569 39.795 1 1 A MET 0.830 1 ATOM 90 C C . MET 791 791 ? A 42.747 24.945 40.398 1 1 A MET 0.830 1 ATOM 91 O O . MET 791 791 ? A 42.913 25.139 41.595 1 1 A MET 0.830 1 ATOM 92 C CB . MET 791 791 ? A 44.378 23.608 39.053 1 1 A MET 0.830 1 ATOM 93 C CG . MET 791 791 ? A 44.987 22.219 38.753 1 1 A MET 0.830 1 ATOM 94 S SD . MET 791 791 ? A 46.293 22.191 37.480 1 1 A MET 0.830 1 ATOM 95 C CE . MET 791 791 ? A 47.621 22.863 38.519 1 1 A MET 0.830 1 ATOM 96 N N . SER 792 792 ? A 42.266 25.916 39.582 1 1 A SER 0.890 1 ATOM 97 C CA . SER 792 792 ? A 41.958 27.275 40.033 1 1 A SER 0.890 1 ATOM 98 C C . SER 792 792 ? A 40.871 27.344 41.095 1 1 A SER 0.890 1 ATOM 99 O O . SER 792 792 ? A 40.960 28.120 42.031 1 1 A SER 0.890 1 ATOM 100 C CB . SER 792 792 ? A 41.722 28.310 38.882 1 1 A SER 0.890 1 ATOM 101 O OG . SER 792 792 ? A 40.351 28.476 38.445 1 1 A SER 0.890 1 ATOM 102 N N . ILE 793 793 ? A 39.812 26.523 40.972 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 103 C CA . ILE 793 793 ? A 38.774 26.400 41.989 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 104 C C . ILE 793 793 ? A 39.246 25.708 43.262 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 105 O O . ILE 793 793 ? A 38.962 26.138 44.373 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 106 C CB . ILE 793 793 ? A 37.571 25.659 41.406 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 107 C CG1 . ILE 793 793 ? A 36.934 26.528 40.298 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 108 C CG2 . ILE 793 793 ? A 36.536 25.279 42.493 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 109 C CD1 . ILE 793 793 ? A 35.878 25.793 39.473 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 110 N N . LEU 794 794 ? A 39.974 24.580 43.126 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 111 C CA . LEU 794 794 ? A 40.326 23.781 44.283 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 112 C C . LEU 794 794 ? A 41.554 24.236 45.039 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 113 O O . LEU 794 794 ? A 41.680 23.919 46.214 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 114 C CB . LEU 794 794 ? A 40.511 22.305 43.901 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 115 C CG . LEU 794 794 ? A 39.206 21.613 43.485 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 116 C CD1 . LEU 794 794 ? A 39.537 20.238 42.906 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 117 C CD2 . LEU 794 794 ? A 38.219 21.468 44.651 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 118 N N . GLN 795 795 ? A 42.464 25.026 44.444 1 1 A GLN 0.760 1 ATOM 119 C CA . GLN 795 795 ? A 43.571 25.628 45.182 1 1 A GLN 0.760 1 ATOM 120 C C . GLN 795 795 ? A 43.103 26.623 46.247 1 1 A GLN 0.760 1 ATOM 121 O O . GLN 795 795 ? A 43.740 26.758 47.297 1 1 A GLN 0.760 1 ATOM 122 C CB . GLN 795 795 ? A 44.619 26.251 44.224 1 1 A GLN 0.760 1 ATOM 123 C CG . GLN 795 795 ? A 45.552 25.204 43.562 1 1 A GLN 0.760 1 ATOM 124 C CD . GLN 795 795 ? A 46.492 25.807 42.528 1 1 A GLN 0.760 1 ATOM 125 O OE1 . GLN 795 795 ? A 46.503 27.032 42.253 1 1 A GLN 0.760 1 ATOM 126 N NE2 . GLN 795 795 ? A 47.324 24.968 41.883 1 1 A GLN 0.760 1 ATOM 127 N N . ASP 796 796 ? A 41.946 27.280 46.044 1 1 A ASP 0.710 1 ATOM 128 C CA . ASP 796 796 ? A 41.353 28.184 47.014 1 1 A ASP 0.710 1 ATOM 129 C C . ASP 796 796 ? A 40.481 27.447 48.048 1 1 A ASP 0.710 1 ATOM 130 O O . ASP 796 796 ? A 40.038 28.033 49.049 1 1 A ASP 0.710 1 ATOM 131 C CB . ASP 796 796 ? A 40.483 29.232 46.264 1 1 A ASP 0.710 1 ATOM 132 C CG . ASP 796 796 ? A 41.293 30.256 45.470 1 1 A ASP 0.710 1 ATOM 133 O OD1 . ASP 796 796 ? A 42.506 30.430 45.740 1 1 A ASP 0.710 1 ATOM 134 O OD2 . ASP 796 796 ? A 40.664 30.914 44.596 1 1 A ASP 0.710 1 ATOM 135 N N . ALA 797 797 ? A 40.188 26.140 47.883 1 1 A ALA 0.830 1 ATOM 136 C CA . ALA 797 797 ? A 39.320 25.411 48.793 1 1 A ALA 0.830 1 ATOM 137 C C . ALA 797 797 ? A 40.049 24.893 50.053 1 1 A ALA 0.830 1 ATOM 138 O O . ALA 797 797 ? A 41.221 24.523 49.966 1 1 A ALA 0.830 1 ATOM 139 C CB . ALA 797 797 ? A 38.614 24.238 48.081 1 1 A ALA 0.830 1 ATOM 140 N N . PRO 798 798 ? A 39.452 24.800 51.251 1 1 A PRO 0.680 1 ATOM 141 C CA . PRO 798 798 ? 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A 41.181 19.799 46.808 1 1 A CYS 0.700 1 ATOM 156 C CB . CYS 800 800 ? A 43.464 21.298 47.687 1 1 A CYS 0.700 1 ATOM 157 S SG . CYS 800 800 ? A 44.598 22.679 48.051 1 1 A CYS 0.700 1 ATOM 158 N N . CYS 801 801 ? A 39.831 20.527 48.462 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 159 C CA . CYS 801 801 ? A 38.736 19.650 48.149 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 160 C C . CYS 801 801 ? A 37.413 20.344 48.333 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 161 O O . CYS 801 801 ? A 37.273 21.302 49.107 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 162 C CB . CYS 801 801 ? A 38.785 18.305 48.934 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 163 S SG . CYS 801 801 ? A 38.623 18.433 50.747 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 164 N N . LEU 802 802 ? A 36.390 19.898 47.599 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 165 C CA . LEU 802 802 ? A 35.060 20.442 47.695 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 166 C C . LEU 802 802 ? A 34.080 19.297 47.554 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 167 O O . LEU 802 802 ? A 34.379 18.329 46.841 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 168 C CB . LEU 802 802 ? A 34.770 21.491 46.588 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 169 C CG . LEU 802 802 ? A 35.421 22.868 46.811 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 170 C CD1 . LEU 802 802 ? A 35.144 23.780 45.611 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 171 C CD2 . LEU 802 802 ? A 34.950 23.546 48.107 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 172 N N . PRO 803 803 ? A 32.903 19.308 48.184 1 1 A PRO 0.850 1 ATOM 173 C CA . PRO 803 803 ? A 31.778 18.506 47.722 1 1 A PRO 0.850 1 ATOM 174 C C . PRO 803 803 ? A 31.499 18.688 46.240 1 1 A PRO 0.850 1 ATOM 175 O O . PRO 803 803 ? A 31.601 19.810 45.736 1 1 A PRO 0.850 1 ATOM 176 C CB . PRO 803 803 ? A 30.570 18.948 48.567 1 1 A PRO 0.850 1 ATOM 177 C CG . PRO 803 803 ? A 31.072 20.031 49.532 1 1 A PRO 0.850 1 ATOM 178 C CD . PRO 803 803 ? A 32.448 20.428 49.005 1 1 A PRO 0.850 1 ATOM 179 N N . LEU 804 804 ? A 31.114 17.619 45.530 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 180 C CA . LEU 804 804 ? A 30.847 17.682 44.106 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 181 C C . LEU 804 804 ? A 29.758 18.668 43.716 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 182 O O . LEU 804 804 ? A 29.928 19.412 42.754 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 183 C CB . LEU 804 804 ? 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A 26.781 21.522 48.978 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 198 N N . LYS 806 806 ? A 28.937 21.476 45.157 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 199 C CA . LYS 806 806 ? A 29.503 22.787 45.325 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 200 C C . LYS 806 806 ? A 30.533 23.148 44.273 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 201 O O . LYS 806 806 ? A 30.603 24.281 43.802 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 202 C CB . LYS 806 806 ? A 30.119 22.870 46.723 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 203 C CG . LYS 806 806 ? A 30.534 24.288 47.115 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 204 C CD . LYS 806 806 ? A 30.554 24.423 48.638 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 205 C CE . LYS 806 806 ? A 31.336 25.629 49.146 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 206 N NZ . LYS 806 806 ? A 31.374 25.575 50.624 1 1 A LYS 0.840 1 ATOM 207 N N . PHE 807 807 ? A 31.360 22.163 43.869 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 208 C CA . PHE 807 807 ? A 32.296 22.293 42.768 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 209 C C . PHE 807 807 ? A 31.576 22.613 41.460 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 210 O O . PHE 807 807 ? A 32.003 23.513 40.733 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 211 C CB . PHE 807 807 ? A 33.145 20.996 42.636 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 212 C CG . PHE 807 807 ? A 34.159 21.104 41.525 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 213 C CD1 . PHE 807 807 ? A 35.419 21.680 41.746 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 214 C CD2 . PHE 807 807 ? A 33.814 20.716 40.220 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 215 C CE1 . PHE 807 807 ? A 36.306 21.881 40.680 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 216 C CE2 . PHE 807 807 ? A 34.698 20.917 39.157 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 217 C CZ . PHE 807 807 ? A 35.940 21.506 39.385 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 218 N N . ILE 808 808 ? A 30.456 21.914 41.162 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 219 C CA . ILE 808 808 ? A 29.618 22.167 39.990 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 220 C C . ILE 808 808 ? A 29.074 23.586 40.009 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 221 O O . ILE 808 808 ? A 29.318 24.356 39.066 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 222 C CB . ILE 808 808 ? A 28.466 21.155 39.902 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 223 C CG1 . ILE 808 808 ? A 28.982 19.710 39.685 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 224 C CG2 . ILE 808 808 ? A 27.475 21.542 38.780 1 1 A ILE 0.870 1 ATOM 225 C CD1 . ILE 808 808 ? 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A 28.580 30.633 39.422 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 268 C CG . LYS 813 813 ? A 28.019 32.046 39.616 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 269 C CD . LYS 813 813 ? A 28.016 32.505 41.075 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 270 C CE . LYS 813 813 ? A 27.460 33.924 41.206 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 271 N NZ . LYS 813 813 ? A 27.720 34.453 42.560 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 272 N N . LYS 814 814 ? A 31.290 30.585 37.739 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 273 C CA . LYS 814 814 ? A 32.547 31.195 37.339 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 274 C C . LYS 814 814 ? A 32.810 31.215 35.839 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 275 O O . LYS 814 814 ? A 33.325 32.210 35.320 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 276 C CB . LYS 814 814 ? A 33.729 30.537 38.093 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 277 C CG . LYS 814 814 ? A 35.103 31.145 37.760 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 278 C CD . LYS 814 814 ? A 36.221 30.658 38.696 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 279 C CE . LYS 814 814 ? A 37.606 31.191 38.305 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 280 N NZ . LYS 814 814 ? A 38.668 30.631 39.171 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 281 N N . TYR 815 815 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #