data_SMR-e6a3154cd5f751e82403df90514fadad_2 _entry.id SMR-e6a3154cd5f751e82403df90514fadad_2 _struct.entry_id SMR-e6a3154cd5f751e82403df90514fadad_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P55196 (isoform 2)/ AFAD_HUMAN, Afadin Estimated model accuracy of this model is 0.006, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P55196 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 217669.720 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP AFAD_HUMAN P55196 1 ;MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTATTQD VIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNENDAIPPKKA QSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKREKEALRQASDKDDRPFQGEDVENSRLAAEVYKDMPETS FTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNIPYKTILLSTTDPADFAVAE ALEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDEKGAKEIILDDDECPLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDH IPKKTKKHLEGKTPKGKERADGSGYGSTLPPEKLPYLVELSPGRRNHFAYYNYHTYEDGSDSRDKPKLYR LQLSVTEVGTEKLDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGVVTVTPRSMDAETYVEGQRISETTMLQSGMKVQ FGASHVFKFVDPSQDHALAKRSVDGGLMVKGPRHKPGIVQETTFDLGGDIHSGTALPTSKSTTRLDSDRV SSASSTAERGMVKPMIRVEQQPDYRRQESRTQDASGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHF KLSPTYVLYMACRYVLSNQYRPDISPTERTHKVIAVVNKMVSMMEGVIQKQKNIAGALAFWMANASELLN FIKQDRDLSRITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAM SLLRRCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLELAAD CHLSRIVQATTLLTMDKYAPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENVVTVAENTA DELARSDGREVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRLIPHTRSPGTWTIY FEGADYESHLLRENTELAQPLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLGIYVKSVVKGGAADVDG RLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYHGLATLLNQPSPMMQRISDRRGSG KPRPKSEGFELYNNSTQNGSPESPQLPWAEYSEPKKLPGDDRLMKNRADHRSSPNVANQPPSPGGKSAYA SGTTAKITSVSTGNLCTEEQTPPPRPEAYPIPTQTYTREYFTFPASKSQDRMAPPQNQWPNYEEKPHMHT DSNHSSIAIQRVTRSQEELREDKAYQLERHRIEAAMDRKSDSDMWINQSSSLDSSTSSQEHLNHSSKSVT PASTLTKSGPGRWKTPAAIPATPVAVSQPIRTDLPPPPPPPPVHYAGDFDGMSMDLPLPPPPSANQIGLP SAQVAAAERRKREEHQRWYEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRTQSLNPAPFSPLTAQQMKPEKPSTL QRPQETVIRELQPQQQPRTIERRDLQYITVSKEELSSGDSLSPDPWKRDAKEKLEKQQQMHIVDMLSKEI QELQSKPDRSAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDEEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRARDEERRR QQQLEEMRKREAEDRARQEEERRRQEEERTKRDAEEKVMVL ; Afadin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1651 1 1651 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . AFAD_HUMAN P55196 P55196-2 1 1651 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-02-09 6F55A481FC0DB6B3 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTATTQD VIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNENDAIPPKKA QSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKREKEALRQASDKDDRPFQGEDVENSRLAAEVYKDMPETS FTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNIPYKTILLSTTDPADFAVAE ALEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDEKGAKEIILDDDECPLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDH IPKKTKKHLEGKTPKGKERADGSGYGSTLPPEKLPYLVELSPGRRNHFAYYNYHTYEDGSDSRDKPKLYR LQLSVTEVGTEKLDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGVVTVTPRSMDAETYVEGQRISETTMLQSGMKVQ FGASHVFKFVDPSQDHALAKRSVDGGLMVKGPRHKPGIVQETTFDLGGDIHSGTALPTSKSTTRLDSDRV SSASSTAERGMVKPMIRVEQQPDYRRQESRTQDASGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHF 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ALA . 1 15 ASP . 1 16 ILE . 1 17 ILE . 1 18 HIS . 1 19 HIS . 1 20 TRP . 1 21 ASN . 1 22 ALA . 1 23 ASN . 1 24 ARG . 1 25 LEU . 1 26 ASP . 1 27 LEU . 1 28 PHE . 1 29 GLU . 1 30 ILE . 1 31 SER . 1 32 GLN . 1 33 PRO . 1 34 THR . 1 35 GLU . 1 36 ASP . 1 37 LEU . 1 38 GLU . 1 39 PHE . 1 40 HIS . 1 41 GLY . 1 42 VAL . 1 43 MET . 1 44 ARG . 1 45 PHE . 1 46 TYR . 1 47 PHE . 1 48 GLN . 1 49 ASP . 1 50 LYS . 1 51 ALA . 1 52 ALA . 1 53 GLY . 1 54 ASN . 1 55 PHE . 1 56 ALA . 1 57 THR . 1 58 LYS . 1 59 CYS . 1 60 ILE . 1 61 ARG . 1 62 VAL . 1 63 SER . 1 64 SER . 1 65 THR . 1 66 ALA . 1 67 THR . 1 68 THR . 1 69 GLN . 1 70 ASP . 1 71 VAL . 1 72 ILE . 1 73 GLU . 1 74 THR . 1 75 LEU . 1 76 ALA . 1 77 GLU . 1 78 LYS . 1 79 PHE . 1 80 ARG . 1 81 PRO . 1 82 ASP . 1 83 MET . 1 84 ARG . 1 85 MET . 1 86 LEU . 1 87 SER . 1 88 SER . 1 89 PRO . 1 90 LYS . 1 91 TYR . 1 92 SER . 1 93 LEU . 1 94 TYR . 1 95 GLU . 1 96 VAL . 1 97 HIS . 1 98 VAL . 1 99 SER . 1 100 GLY . 1 101 GLU . 1 102 ARG . 1 103 ARG . 1 104 LEU . 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A 1 1465 GLU 1465 ? ? ? A . A 1 1466 LYS 1466 ? ? ? A . A 1 1467 PRO 1467 ? ? ? A . A 1 1468 SER 1468 ? ? ? A . A 1 1469 THR 1469 ? ? ? A . A 1 1470 LEU 1470 ? ? ? A . A 1 1471 GLN 1471 ? ? ? A . A 1 1472 ARG 1472 ? ? ? A . A 1 1473 PRO 1473 ? ? ? A . A 1 1474 GLN 1474 ? ? ? A . A 1 1475 GLU 1475 ? ? ? A . A 1 1476 THR 1476 ? ? ? A . A 1 1477 VAL 1477 ? ? ? A . A 1 1478 ILE 1478 ? ? ? A . A 1 1479 ARG 1479 ? ? ? A . A 1 1480 GLU 1480 ? ? ? A . A 1 1481 LEU 1481 ? ? ? A . A 1 1482 GLN 1482 ? ? ? A . A 1 1483 PRO 1483 ? ? ? A . A 1 1484 GLN 1484 ? ? ? A . A 1 1485 GLN 1485 ? ? ? A . A 1 1486 GLN 1486 ? ? ? A . A 1 1487 PRO 1487 ? ? ? A . A 1 1488 ARG 1488 ? ? ? A . A 1 1489 THR 1489 ? ? ? A . A 1 1490 ILE 1490 ? ? ? A . A 1 1491 GLU 1491 ? ? ? A . A 1 1492 ARG 1492 ? ? ? A . A 1 1493 ARG 1493 ? ? ? A . A 1 1494 ASP 1494 ? ? ? A . A 1 1495 LEU 1495 ? ? ? A . A 1 1496 GLN 1496 ? ? ? A . A 1 1497 TYR 1497 ? ? ? A . A 1 1498 ILE 1498 ? ? ? A . A 1 1499 THR 1499 ? ? ? A . A 1 1500 VAL 1500 ? ? ? A . A 1 1501 SER 1501 ? ? ? A . A 1 1502 LYS 1502 ? ? ? A . A 1 1503 GLU 1503 ? ? ? A . A 1 1504 GLU 1504 ? ? ? A . A 1 1505 LEU 1505 ? ? ? A . A 1 1506 SER 1506 ? ? ? A . A 1 1507 SER 1507 ? ? ? A . A 1 1508 GLY 1508 ? ? ? A . A 1 1509 ASP 1509 ? ? ? A . A 1 1510 SER 1510 ? ? ? A . A 1 1511 LEU 1511 ? ? ? A . A 1 1512 SER 1512 ? ? ? A . A 1 1513 PRO 1513 ? ? ? A . A 1 1514 ASP 1514 ? ? ? A . A 1 1515 PRO 1515 ? ? ? A . A 1 1516 TRP 1516 ? ? ? A . A 1 1517 LYS 1517 ? ? ? A . A 1 1518 ARG 1518 ? ? ? A . A 1 1519 ASP 1519 ? ? ? A . A 1 1520 ALA 1520 ? ? ? A . A 1 1521 LYS 1521 ? ? ? A . A 1 1522 GLU 1522 ? ? ? A . A 1 1523 LYS 1523 ? ? ? A . A 1 1524 LEU 1524 ? ? ? A . A 1 1525 GLU 1525 ? ? ? A . A 1 1526 LYS 1526 ? ? ? A . A 1 1527 GLN 1527 ? ? ? A . A 1 1528 GLN 1528 ? ? ? A . A 1 1529 GLN 1529 ? ? ? A . A 1 1530 MET 1530 ? ? ? A . A 1 1531 HIS 1531 ? ? ? A . A 1 1532 ILE 1532 ? ? ? A . A 1 1533 VAL 1533 ? ? ? A . A 1 1534 ASP 1534 ? ? ? A . A 1 1535 MET 1535 ? ? ? A . A 1 1536 LEU 1536 ? ? ? A . A 1 1537 SER 1537 ? ? ? A . A 1 1538 LYS 1538 ? ? ? A . A 1 1539 GLU 1539 ? ? ? A . A 1 1540 ILE 1540 ? ? ? A . A 1 1541 GLN 1541 ? ? ? A . A 1 1542 GLU 1542 ? ? ? A . A 1 1543 LEU 1543 ? ? ? A . A 1 1544 GLN 1544 ? ? ? A . A 1 1545 SER 1545 ? ? ? A . A 1 1546 LYS 1546 ? ? ? A . A 1 1547 PRO 1547 ? ? ? A . A 1 1548 ASP 1548 ? ? ? A . A 1 1549 ARG 1549 ? ? ? A . A 1 1550 SER 1550 ? ? ? A . A 1 1551 ALA 1551 ? ? ? A . A 1 1552 GLU 1552 ? ? ? A . A 1 1553 GLU 1553 ? ? ? A . A 1 1554 SER 1554 ? ? ? A . A 1 1555 ASP 1555 ? ? ? A . A 1 1556 ARG 1556 ? ? ? A . A 1 1557 LEU 1557 ? ? ? A . A 1 1558 ARG 1558 ? ? ? A . A 1 1559 LYS 1559 ? ? ? A . A 1 1560 LEU 1560 ? ? ? A . A 1 1561 MET 1561 ? ? ? A . A 1 1562 LEU 1562 ? ? ? A . A 1 1563 GLU 1563 ? ? ? A . A 1 1564 TRP 1564 ? ? ? A . A 1 1565 GLN 1565 ? ? ? A . A 1 1566 PHE 1566 ? ? ? A . A 1 1567 GLN 1567 ? ? ? A . A 1 1568 LYS 1568 ? ? ? A . A 1 1569 ARG 1569 ? ? ? A . A 1 1570 LEU 1570 ? ? ? A . A 1 1571 GLN 1571 ? ? ? A . A 1 1572 GLU 1572 ? ? ? A . A 1 1573 SER 1573 ? ? ? A . A 1 1574 LYS 1574 ? ? ? A . A 1 1575 GLN 1575 ? ? ? A . A 1 1576 LYS 1576 ? ? ? A . A 1 1577 ASP 1577 ? ? ? A . A 1 1578 GLU 1578 ? ? ? A . A 1 1579 ASP 1579 ? ? ? A . A 1 1580 ASP 1580 ? ? ? A . A 1 1581 GLU 1581 ? ? ? A . A 1 1582 GLU 1582 ? ? ? A . A 1 1583 GLU 1583 ? ? ? A . A 1 1584 GLU 1584 ? ? ? A . A 1 1585 ASP 1585 ? ? ? A . A 1 1586 ASP 1586 ? ? ? A . A 1 1587 ASP 1587 ? ? ? A . A 1 1588 VAL 1588 ? ? ? A . A 1 1589 ASP 1589 ? ? ? A . A 1 1590 THR 1590 ? ? ? A . A 1 1591 MET 1591 ? ? ? A . A 1 1592 LEU 1592 ? ? ? A . A 1 1593 ILE 1593 ? ? ? A . A 1 1594 MET 1594 ? ? ? A . A 1 1595 GLN 1595 ? ? ? A . A 1 1596 ARG 1596 ? ? ? A . A 1 1597 LEU 1597 ? ? ? A . A 1 1598 GLU 1598 ? ? ? A . A 1 1599 ALA 1599 ? ? ? A . A 1 1600 GLU 1600 ? ? ? A . A 1 1601 ARG 1601 ? ? ? A . A 1 1602 ARG 1602 ? ? ? A . A 1 1603 ALA 1603 ? ? ? A . A 1 1604 ARG 1604 ? ? ? A . A 1 1605 ASP 1605 ? ? ? A . A 1 1606 GLU 1606 ? ? ? A . A 1 1607 GLU 1607 ? ? ? A . A 1 1608 ARG 1608 ? ? ? A . A 1 1609 ARG 1609 ? ? ? A . A 1 1610 ARG 1610 ? ? ? A . A 1 1611 GLN 1611 ? ? ? A . A 1 1612 GLN 1612 ? ? ? A . A 1 1613 GLN 1613 ? ? ? A . A 1 1614 LEU 1614 ? ? ? A . A 1 1615 GLU 1615 ? ? ? A . A 1 1616 GLU 1616 ? ? ? A . A 1 1617 MET 1617 ? ? ? A . A 1 1618 ARG 1618 ? ? ? A . A 1 1619 LYS 1619 ? ? ? A . A 1 1620 ARG 1620 ? ? ? A . A 1 1621 GLU 1621 ? ? ? A . A 1 1622 ALA 1622 ? ? ? A . A 1 1623 GLU 1623 ? ? ? A . A 1 1624 ASP 1624 ? ? ? A . A 1 1625 ARG 1625 ? ? ? A . A 1 1626 ALA 1626 ? ? ? A . A 1 1627 ARG 1627 ? ? ? A . A 1 1628 GLN 1628 ? ? ? A . A 1 1629 GLU 1629 ? ? ? A . A 1 1630 GLU 1630 ? ? ? A . A 1 1631 GLU 1631 ? ? ? A . A 1 1632 ARG 1632 ? ? ? A . A 1 1633 ARG 1633 ? ? ? A . A 1 1634 ARG 1634 ? ? ? A . A 1 1635 GLN 1635 ? ? ? A . A 1 1636 GLU 1636 ? ? ? A . A 1 1637 GLU 1637 ? ? ? A . A 1 1638 GLU 1638 ? ? ? A . A 1 1639 ARG 1639 ? ? ? A . A 1 1640 THR 1640 ? ? ? A . A 1 1641 LYS 1641 ? ? ? A . A 1 1642 ARG 1642 ? ? ? A . A 1 1643 ASP 1643 ? ? ? A . A 1 1644 ALA 1644 ? ? ? A . A 1 1645 GLU 1645 ? ? ? A . A 1 1646 GLU 1646 ? ? ? A . A 1 1647 LYS 1647 ? ? ? A . A 1 1648 VAL 1648 ? ? ? A . A 1 1649 MET 1649 ? ? ? A . A 1 1650 VAL 1650 ? ? ? A . A 1 1651 LEU 1651 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Afadin {PDB ID=1xz9, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1xz9.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1xz9, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GPLGSLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRS LVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIY ; ;GPLGSLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRS LVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIY ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 9 101 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1xz9 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1651 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1651 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.4e-07 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTATTQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNENDAIPPKKAQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKREKEALRQASDKDDRPFQGEDVENSRLAAEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNIPYKTILLSTTDPADFAVAEALEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDEKGAKEIILDDDECPLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDHIPKKTKKHLEGKTPKGKERADGSGYGSTLPPEKLPYLVELSPGRRNHFAYYNYHTYEDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKLDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGVVTVTPRSMDAETYVEGQRISETTMLQSGMKVQFGASHVFKFVDPSQDHALAKRSVDGGLMVKGPRHKPGIVQETTFDLGGDIHSGTALPTSKSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPMIRVEQQPDYRRQESRTQDASGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYVLSNQYRPDISPTERTHKVIAVVNKMVSMMEGVIQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRDLSRITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAMSLLRRCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLELAADCHLSRIVQATTLLTMDKYAPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENVVTVAENTADELARSDGREVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRLIPHTRSPGTWTIYFEGADYESHLLRENTELAQPLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYHGLATLLNQPSPMMQRISDRRGSGKPRPKSEGFELYNNSTQNGSPESPQLPWAEYSEPKKLPGDDRLMKNRADHRSSPNVANQPPSPGGKSAYASGTTAKITSVSTGNLCTEEQTPPPRPEAYPIPTQTYTREYFTFPASKSQDRMAPPQNQWPNYEEKPHMHTDSNHSSIAIQRVTRSQEELREDKAYQLERHRIEAAMDRKSDSDMWINQSSSLDSSTSSQEHLNHSSKSVTPASTLTKSGPGRWKTPAAIPATPVAVSQPIRTDLPPPPPPPPVHYAGDFDGMSMDLPLPPPPSANQIGLPSAQVAAAERRKREEHQRWYEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRTQSLNPAPFSPLTAQQMKPEKPSTLQRPQETVIRELQPQQQPRTIERRDLQYITVSKEELSSGDSLSPDPWKRDAKEKLEKQQQMHIVDMLSKEIQELQSKPDRSAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDEEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRARDEERRRQQQLEEMRKREAEDRARQEEERRRQEEERTKRDAEEKVMVL 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIY--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1xz9.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 1004 1004 ? A -0.634 -14.425 -0.076 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 2 C CA . GLU 1004 1004 ? A -1.992 -14.254 -0.699 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 3 C C . GLU 1004 1004 ? A -2.282 -13.006 -1.507 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 4 O O . GLU 1004 1004 ? A -2.687 -13.188 -2.647 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 5 C CB . GLU 1004 1004 ? A -3.052 -14.375 0.394 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 6 C CG . GLU 1004 1004 ? A -3.967 -15.601 0.314 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 7 C CD . GLU 1004 1004 ? A -4.764 -15.648 1.627 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 1004 1004 ? A -4.585 -14.679 2.434 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 1004 1004 ? A -5.582 -16.587 1.750 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 10 N N . PRO 1005 1005 ? A -2.147 -11.754 -1.038 1 1 A PRO 0.540 1 ATOM 11 C CA . PRO 1005 1005 ? A -2.418 -10.618 -1.899 1 1 A PRO 0.540 1 ATOM 12 C C . PRO 1005 1005 ? A -1.290 -10.434 -2.894 1 1 A PRO 0.540 1 ATOM 13 O O . PRO 1005 1005 ? A -1.447 -10.845 -4.035 1 1 A PRO 0.540 1 ATOM 14 C CB . PRO 1005 1005 ? A -2.578 -9.425 -0.943 1 1 A PRO 0.540 1 ATOM 15 C CG . PRO 1005 1005 ? A -1.919 -9.823 0.383 1 1 A PRO 0.540 1 ATOM 16 C CD . PRO 1005 1005 ? A -1.756 -11.345 0.313 1 1 A PRO 0.540 1 ATOM 17 N N . GLU 1006 1006 ? A -0.150 -9.869 -2.468 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 18 C CA . GLU 1006 1006 ? A 1.039 -9.672 -3.270 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 19 C C . GLU 1006 1006 ? A 0.851 -8.489 -4.197 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 20 O O . GLU 1006 1006 ? A 1.361 -7.420 -3.930 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 21 C CB . GLU 1006 1006 ? A 1.630 -10.927 -3.949 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 22 C CG . GLU 1006 1006 ? A 3.164 -10.826 -4.141 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 23 C CD . GLU 1006 1006 ? A 3.614 -11.278 -5.528 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 24 O OE1 . GLU 1006 1006 ? A 2.977 -10.859 -6.525 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 25 O OE2 . GLU 1006 1006 ? A 4.599 -12.058 -5.584 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 26 N N . ILE 1007 1007 ? A 0.011 -8.635 -5.232 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 27 C CA . ILE 1007 1007 ? A -0.320 -7.587 -6.173 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 28 C C . ILE 1007 1007 ? A -1.750 -7.125 -5.908 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 29 O O . ILE 1007 1007 ? A -2.715 -7.882 -6.001 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 30 C CB . ILE 1007 1007 ? A -0.057 -8.073 -7.602 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 31 C CG1 . ILE 1007 1007 ? A -0.189 -6.956 -8.660 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 32 C CG2 . ILE 1007 1007 ? A -0.849 -9.344 -7.987 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 33 C CD1 . ILE 1007 1007 ? A 0.764 -7.176 -9.843 1 1 A ILE 0.580 1 ATOM 34 N N . ILE 1008 1008 ? A -1.962 -5.853 -5.511 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 35 C CA . ILE 1008 1008 ? A -3.289 -5.338 -5.190 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 36 C C . ILE 1008 1008 ? A -3.576 -4.181 -6.104 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 37 O O . ILE 1008 1008 ? A -2.877 -3.178 -6.192 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 38 C CB . ILE 1008 1008 ? A -3.507 -4.983 -3.721 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 39 C CG1 . ILE 1008 1008 ? A -3.647 -6.270 -2.872 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 40 C CG2 . ILE 1008 1008 ? A -4.702 -4.032 -3.467 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 41 C CD1 . ILE 1008 1008 ? A -4.841 -7.192 -3.161 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 42 N N . THR 1009 1009 ? A -4.653 -4.303 -6.874 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 43 C CA . THR 1009 1009 ? A -4.971 -3.318 -7.874 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 44 C C . THR 1009 1009 ? A -6.443 -3.159 -7.850 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 45 O O . THR 1009 1009 ? A -7.202 -4.132 -7.886 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 46 C CB . THR 1009 1009 ? A -4.434 -3.653 -9.262 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 47 O OG1 . THR 1009 1009 ? A -4.825 -2.713 -10.255 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 48 C CG2 . THR 1009 1009 ? A -4.917 -5.026 -9.739 1 1 A THR 0.600 1 ATOM 49 N N . VAL 1010 1010 ? A -6.884 -1.908 -7.735 1 1 A VAL 0.520 1 ATOM 50 C CA . VAL 1010 1010 ? A -8.284 -1.601 -7.656 1 1 A VAL 0.520 1 ATOM 51 C C . VAL 1010 1010 ? A -8.477 -0.320 -8.396 1 1 A VAL 0.520 1 ATOM 52 O O . VAL 1010 1010 ? A -7.620 0.569 -8.430 1 1 A VAL 0.520 1 ATOM 53 C CB . VAL 1010 1010 ? A -8.895 -1.518 -6.250 1 1 A VAL 0.520 1 ATOM 54 C CG1 . VAL 1010 1010 ? A -8.882 -2.911 -5.596 1 1 A VAL 0.520 1 ATOM 55 C CG2 . VAL 1010 1010 ? A -8.186 -0.489 -5.347 1 1 A VAL 0.520 1 ATOM 56 N N . THR 1011 1011 ? A -9.630 -0.197 -9.058 1 1 A THR 0.520 1 ATOM 57 C CA . THR 1011 1011 ? A -10.035 1.019 -9.721 1 1 A THR 0.520 1 ATOM 58 C C . THR 1011 1011 ? A -10.455 2.016 -8.671 1 1 A THR 0.520 1 ATOM 59 O O . THR 1011 1011 ? A -11.410 1.822 -7.919 1 1 A THR 0.520 1 ATOM 60 C CB . THR 1011 1011 ? A -11.084 0.813 -10.805 1 1 A THR 0.520 1 ATOM 61 O OG1 . THR 1011 1011 ? A -12.217 0.071 -10.368 1 1 A THR 0.520 1 ATOM 62 C CG2 . THR 1011 1011 ? A -10.433 -0.039 -11.902 1 1 A THR 0.520 1 ATOM 63 N N . LEU 1012 1012 ? A -9.694 3.121 -8.553 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 64 C CA . LEU 1012 1012 ? A -10.072 4.244 -7.738 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 65 C C . LEU 1012 1012 ? A -11.172 5.073 -8.391 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 66 O O . LEU 1012 1012 ? A -12.012 4.579 -9.137 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 67 C CB . LEU 1012 1012 ? A -8.844 5.136 -7.446 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 68 C CG . LEU 1012 1012 ? A -8.780 5.905 -6.113 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 69 C CD1 . LEU 1012 1012 ? A -8.458 7.391 -6.342 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 70 C CD2 . LEU 1012 1012 ? A -10.006 5.690 -5.233 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 71 N N . LYS 1013 1013 ? A -11.215 6.382 -8.078 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 72 C CA . LYS 1013 1013 ? A -12.285 7.299 -8.403 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 73 C C . LYS 1013 1013 ? A -13.633 6.860 -7.832 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 74 O O . LYS 1013 1013 ? A -14.700 7.242 -8.283 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 75 C CB . LYS 1013 1013 ? A -12.270 7.547 -9.926 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 76 C CG . LYS 1013 1013 ? A -13.163 8.664 -10.463 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 77 C CD . LYS 1013 1013 ? A -14.368 8.080 -11.214 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 78 C CE . LYS 1013 1013 ? A -15.474 9.108 -11.399 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 79 N NZ . LYS 1013 1013 ? A -15.593 9.440 -12.829 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 80 N N . LYS 1014 1014 ? A -13.596 6.028 -6.775 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 81 C CA . LYS 1014 1014 ? A -14.776 5.394 -6.238 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 82 C C . LYS 1014 1014 ? A -15.631 6.335 -5.399 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 83 O O . LYS 1014 1014 ? A -16.474 7.050 -5.905 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 84 C CB . LYS 1014 1014 ? A -14.356 4.159 -5.424 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 85 C CG . LYS 1014 1014 ? A -15.564 3.367 -4.918 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 86 C CD . LYS 1014 1014 ? A -15.504 1.872 -5.228 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 87 C CE . LYS 1014 1014 ? A -15.631 1.533 -6.708 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 88 N NZ . LYS 1014 1014 ? A -15.622 0.063 -6.832 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 89 N N . GLN 1015 1015 ? A -15.444 6.357 -4.067 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 90 C CA . GLN 1015 1015 ? A -16.105 7.322 -3.224 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 91 C C . GLN 1015 1015 ? A -15.357 8.642 -3.170 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 92 O O . GLN 1015 1015 ? A -15.882 9.617 -2.653 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 93 C CB . GLN 1015 1015 ? A -16.274 6.754 -1.802 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 94 C CG . GLN 1015 1015 ? A -17.539 5.875 -1.707 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 95 C CD . GLN 1015 1015 ? A -17.871 5.460 -0.274 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 96 O OE1 . GLN 1015 1015 ? A -18.149 4.296 -0.005 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 97 N NE2 . GLN 1015 1015 ? A -17.853 6.428 0.671 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 98 N N . ASN 1016 1016 ? A -14.114 8.640 -3.701 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 99 C CA . ASN 1016 1016 ? A -13.193 9.756 -3.806 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 100 C C . ASN 1016 1016 ? A -11.807 9.184 -3.972 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 101 O O . ASN 1016 1016 ? A -11.241 9.100 -5.055 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 102 C CB . ASN 1016 1016 ? A -13.138 10.678 -2.549 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 103 C CG . ASN 1016 1016 ? A -13.993 11.918 -2.763 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 104 O OD1 . ASN 1016 1016 ? A -14.493 12.205 -3.847 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 105 N ND2 . ASN 1016 1016 ? A -14.109 12.735 -1.688 1 1 A ASN 0.490 1 ATOM 106 N N . GLY 1017 1017 ? A -11.229 8.772 -2.837 1 1 A GLY 0.580 1 ATOM 107 C CA . GLY 1017 1017 ? A -9.822 8.456 -2.730 1 1 A GLY 0.580 1 ATOM 108 C C . GLY 1017 1017 ? A -9.725 7.105 -2.188 1 1 A GLY 0.580 1 ATOM 109 O O . GLY 1017 1017 ? 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LEU 1052 1052 ? A -9.268 -2.317 4.424 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 346 C CB . LEU 1052 1052 ? A -7.593 -1.721 1.895 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 347 C CG . LEU 1052 1052 ? A -6.424 -1.583 0.915 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 348 C CD1 . LEU 1052 1052 ? A -5.179 -1.068 1.643 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 349 C CD2 . LEU 1052 1052 ? A -6.220 -2.837 0.066 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 350 N N . ALA 1053 1053 ? A -7.087 -2.430 4.963 1 1 A ALA 0.530 1 ATOM 351 C CA . ALA 1053 1053 ? A -7.218 -2.229 6.371 1 1 A ALA 0.530 1 ATOM 352 C C . ALA 1053 1053 ? A -5.835 -2.359 6.920 1 1 A ALA 0.530 1 ATOM 353 O O . ALA 1053 1053 ? A -4.874 -2.571 6.188 1 1 A ALA 0.530 1 ATOM 354 C CB . ALA 1053 1053 ? A -8.085 -3.285 7.085 1 1 A ALA 0.530 1 ATOM 355 N N . ALA 1054 1054 ? A -5.711 -2.187 8.242 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 356 C CA . ALA 1054 1054 ? A -4.476 -2.292 8.972 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 357 C C . ALA 1054 1054 ? A -3.732 -3.606 8.791 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 358 O O . ALA 1054 1054 ? A -4.183 -4.659 9.242 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 359 C CB . ALA 1054 1054 ? A -4.739 -2.020 10.459 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 360 N N . GLY 1055 1055 ? A -2.554 -3.555 8.134 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 361 C CA . GLY 1055 1055 ? A -1.816 -4.748 7.741 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 362 C C . GLY 1055 1055 ? A -1.557 -4.949 6.269 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 363 O O . GLY 1055 1055 ? A -1.391 -6.074 5.826 1 1 A GLY 0.650 1 ATOM 364 N N . ASP 1056 1056 ? A -1.480 -3.866 5.481 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 365 C CA . ASP 1056 1056 ? A -1.260 -3.914 4.053 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 366 C C . ASP 1056 1056 ? A 0.153 -3.383 3.808 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 367 O O . ASP 1056 1056 ? A 0.384 -2.200 3.575 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 368 C CB . ASP 1056 1056 ? A -2.359 -3.051 3.383 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 369 C CG . ASP 1056 1056 ? A -3.177 -3.805 2.332 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 370 O OD1 . ASP 1056 1056 ? A -3.797 -4.839 2.682 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 371 O OD2 . ASP 1056 1056 ? A -3.211 -3.303 1.181 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 372 N N . GLN 1057 1057 ? A 1.203 -4.212 3.924 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 373 C CA . GLN 1057 1057 ? A 2.552 -3.730 3.697 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 374 C C . GLN 1057 1057 ? A 2.835 -3.549 2.229 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 375 O O . GLN 1057 1057 ? A 3.023 -4.514 1.503 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 376 C CB . GLN 1057 1057 ? A 3.627 -4.676 4.282 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 377 C CG . GLN 1057 1057 ? A 5.090 -4.201 4.051 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 378 C CD . GLN 1057 1057 ? A 5.968 -5.251 3.378 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 379 O OE1 . GLN 1057 1057 ? A 5.593 -5.924 2.422 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 380 N NE2 . GLN 1057 1057 ? A 7.215 -5.408 3.882 1 1 A GLN 0.680 1 ATOM 381 N N . LEU 1058 1058 ? A 2.894 -2.304 1.737 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 382 C CA . LEU 1058 1058 ? A 3.115 -2.082 0.334 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 383 C C . LEU 1058 1058 ? A 4.601 -2.162 0.032 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 384 O O . LEU 1058 1058 ? A 5.407 -1.417 0.587 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 385 C CB . LEU 1058 1058 ? A 2.467 -0.780 -0.190 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 386 C CG . LEU 1058 1058 ? A 1.034 -0.517 0.332 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 387 C CD1 . LEU 1058 1058 ? A 0.995 0.376 1.575 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 388 C CD2 . LEU 1058 1058 ? A 0.135 0.118 -0.730 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 389 N N . LEU 1059 1059 ? A 5.011 -3.096 -0.841 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 390 C CA . LEU 1059 1059 ? A 6.374 -3.252 -1.290 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 391 C C . LEU 1059 1059 ? A 6.694 -2.294 -2.421 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 392 O O . LEU 1059 1059 ? A 7.834 -1.870 -2.596 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 393 C CB . LEU 1059 1059 ? A 6.642 -4.720 -1.712 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 394 C CG . LEU 1059 1059 ? A 7.589 -5.485 -0.762 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 395 C CD1 . LEU 1059 1059 ? A 7.005 -6.846 -0.366 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 396 C CD2 . LEU 1059 1059 ? A 8.983 -5.667 -1.380 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 397 N N . SER 1060 1060 ? A 5.679 -1.881 -3.193 1 1 A SER 0.680 1 ATOM 398 C CA . SER 1060 1060 ? A 5.834 -0.975 -4.315 1 1 A SER 0.680 1 ATOM 399 C C . SER 1060 1060 ? 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A -3.059 -19.846 5.935 1 1 A TYR 0.090 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.562 2 1 3 0.006 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1004 GLU 1 0.390 2 1 A 1005 PRO 1 0.540 3 1 A 1006 GLU 1 0.580 4 1 A 1007 ILE 1 0.580 5 1 A 1008 ILE 1 0.630 6 1 A 1009 THR 1 0.600 7 1 A 1010 VAL 1 0.520 8 1 A 1011 THR 1 0.520 9 1 A 1012 LEU 1 0.460 10 1 A 1013 LYS 1 0.440 11 1 A 1014 LYS 1 0.450 12 1 A 1015 GLN 1 0.490 13 1 A 1016 ASN 1 0.490 14 1 A 1017 GLY 1 0.580 15 1 A 1018 MET 1 0.600 16 1 A 1019 GLY 1 0.660 17 1 A 1020 LEU 1 0.640 18 1 A 1021 SER 1 0.670 19 1 A 1022 ILE 1 0.680 20 1 A 1023 VAL 1 0.660 21 1 A 1024 ALA 1 0.680 22 1 A 1025 ALA 1 0.530 23 1 A 1026 LYS 1 0.460 24 1 A 1027 GLY 1 0.330 25 1 A 1028 ALA 1 0.280 26 1 A 1029 GLY 1 0.290 27 1 A 1030 GLN 1 0.330 28 1 A 1031 ASP 1 0.370 29 1 A 1032 LYS 1 0.450 30 1 A 1033 LEU 1 0.460 31 1 A 1034 GLY 1 0.570 32 1 A 1035 ILE 1 0.650 33 1 A 1036 TYR 1 0.650 34 1 A 1037 VAL 1 0.690 35 1 A 1038 LYS 1 0.660 36 1 A 1039 SER 1 0.650 37 1 A 1040 VAL 1 0.670 38 1 A 1041 VAL 1 0.660 39 1 A 1042 LYS 1 0.570 40 1 A 1043 GLY 1 0.600 41 1 A 1044 GLY 1 0.610 42 1 A 1045 ALA 1 0.620 43 1 A 1046 ALA 1 0.630 44 1 A 1047 ASP 1 0.580 45 1 A 1048 VAL 1 0.600 46 1 A 1049 ASP 1 0.630 47 1 A 1050 GLY 1 0.590 48 1 A 1051 ARG 1 0.500 49 1 A 1052 LEU 1 0.530 50 1 A 1053 ALA 1 0.530 51 1 A 1054 ALA 1 0.660 52 1 A 1055 GLY 1 0.650 53 1 A 1056 ASP 1 0.630 54 1 A 1057 GLN 1 0.680 55 1 A 1058 LEU 1 0.640 56 1 A 1059 LEU 1 0.670 57 1 A 1060 SER 1 0.680 58 1 A 1061 VAL 1 0.670 59 1 A 1062 ASP 1 0.650 60 1 A 1063 GLY 1 0.680 61 1 A 1064 ARG 1 0.660 62 1 A 1065 SER 1 0.700 63 1 A 1066 LEU 1 0.650 64 1 A 1067 VAL 1 0.600 65 1 A 1068 GLY 1 0.540 66 1 A 1069 LEU 1 0.550 67 1 A 1070 SER 1 0.570 68 1 A 1071 GLN 1 0.610 69 1 A 1072 GLU 1 0.650 70 1 A 1073 ARG 1 0.610 71 1 A 1074 ALA 1 0.660 72 1 A 1075 ALA 1 0.660 73 1 A 1076 GLU 1 0.670 74 1 A 1077 LEU 1 0.670 75 1 A 1078 MET 1 0.670 76 1 A 1079 THR 1 0.630 77 1 A 1080 ARG 1 0.530 78 1 A 1081 THR 1 0.590 79 1 A 1082 SER 1 0.450 80 1 A 1083 SER 1 0.450 81 1 A 1084 VAL 1 0.570 82 1 A 1085 VAL 1 0.650 83 1 A 1086 THR 1 0.660 84 1 A 1087 LEU 1 0.630 85 1 A 1088 GLU 1 0.640 86 1 A 1089 VAL 1 0.660 87 1 A 1090 ALA 1 0.670 88 1 A 1091 LYS 1 0.500 89 1 A 1092 GLN 1 0.300 90 1 A 1093 GLY 1 0.210 91 1 A 1094 ALA 1 0.220 92 1 A 1095 ILE 1 0.180 93 1 A 1096 TYR 1 0.090 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #