data_SMR-ca9ad6519a34aec20952cf8c28e921fd_4 _entry.id SMR-ca9ad6519a34aec20952cf8c28e921fd_4 _struct.entry_id SMR-ca9ad6519a34aec20952cf8c28e921fd_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y4F3 (isoform 3)/ MARF1_HUMAN, Meiosis regulator and mRNA stability factor 1 Estimated model accuracy of this model is 0.05, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y4F3 (isoform 3)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 216996.620 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MARF1_HUMAN Q9Y4F3 1 ;MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHA GSKLFPAVPLPDIRSLQQPKIQLSSVPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGGGGSGGTSSLIHPGALLDSQS TRTITCQVGSGFAFQSASSLQNASARNNLAGIASDFPSMCLESNLSSCKHLPCCGKLHFQSCHGNVHKLH QFPSLQGCTSAGYFPCSDFTSGAPGHLEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLKGSLYCEDCLNKPAR NSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLATSLGKAASKFGSPEVAVAGQVLENL PPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINAT AKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELI RFEEFISDLPPRLPLKMPQCHTLLYVYNLPANKDGKSVSNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDS AERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCETKSSNAIADKVKSPKKLKNPKLCLIKDASEQSSSAKATP GKGSQANSGSATKNTNVKSLQELCRMESKTGHRNSEHQQGHLRLVVPTHGNSSAAVSTPKNSGVAEPVYK TSQKKENLSARSVTSSPVEKKDKEETVFQVSYPSAFSKLVASRQVSPLLASQSWSSRSMSPNLLNRASPL AFNIANSSSEADCPDPFANGADVQVSNIDYRLSRKELQQLLQEAFARHGKVKSVELSPHTDYQLKAVVQM ENLQDAIGAVNSLHRYKIGSKKILVSLATGAASKSLSLLSAETMSVLQDAPACCLPLFKFTDIYEKKFGH KLNVSDLYKLTDTVAIREQGNGRLVCLLPSSQARQSPLGSSQSHDGSSTNCSPIIFEELEYHEPVCRQHC SNKDFSEHEFDPDSYKIPFVILSLKTFAPQVHSLLQTHEGTVPLLDPWLLRSKSPVGNPQLIQFSREVID LLKSQPSCVIPISHFIPSYHHHFAKQCRVSDYGYSKLIELLEAVPHVLQILGMGSKRLLTLTHRAQVKRF TQDLLKLLKSQASKQVIVREFSQAYHWCFSKDWDVTEYGVCELIDIVSEIPDTTICLSQQDNEMVICIPK RERTQDEIERTKQFSKDVVDLLRHQPHFRMPFNKFIPSYHHHFGRQCKLAYYGFTKLLELFEAIPDTLQV LECGEEKILTLTEVERFKALAAQFVKLLRSQKDNCLMMTDLLTEYAKTFGYTFRLQDYDVSSISALTQKL CHVVKVADIESGRQIQLINRKSLRSLTAQLLVLLMSWEGTTHLSVEELKRHYESTHNTPLNPCEYGFMTL TELLKSLPYLVEVFTNDKMEECVKLTSLYLFAKNVRSLLHTYHYQQIFLHEFSMAYTKYVGETLQPKTYG HSSVEELLGAIPQVVWIKGHGHKRIVVLKNDMKSRLSSLSLSPANHENQPSEGERILEVPESHTASELKL GADGSGPSHTEQELLRLTDDSPVDLLCAPVPSCLPSPQLRPDPVILQSADLIQFEERPQEPSEIMILNQE EKMEIPIPGKSKTLTSDSSSSCISAAVPVPPCPSSETSESLLSKDPVESPAKKQPKNRVKLAANFSLAPI TKL ; 'Meiosis regulator and mRNA stability factor 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1683 1 1683 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MARF1_HUMAN Q9Y4F3 Q9Y4F3-3 1 1683 9606 'Homo sapiens (Human)' 2012-05-16 FBB6FE3DF3E14D75 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHA GSKLFPAVPLPDIRSLQQPKIQLSSVPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGGGGSGGTSSLIHPGALLDSQS TRTITCQVGSGFAFQSASSLQNASARNNLAGIASDFPSMCLESNLSSCKHLPCCGKLHFQSCHGNVHKLH QFPSLQGCTSAGYFPCSDFTSGAPGHLEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLKGSLYCEDCLNKPAR NSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLATSLGKAASKFGSPEVAVAGQVLENL PPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINAT AKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELI RFEEFISDLPPRLPLKMPQCHTLLYVYNLPANKDGKSVSNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDS AERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCETKSSNAIADKVKSPKKLKNPKLCLIKDASEQSSSAKATP 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EKMEIPIPGKSKTLTSDSSSSCISAAVPVPPCPSSETSESLLSKDPVESPAKKQPKNRVKLAANFSLAPI TKL ; ;MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHA GSKLFPAVPLPDIRSLQQPKIQLSSVPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGGGGSGGTSSLIHPGALLDSQS TRTITCQVGSGFAFQSASSLQNASARNNLAGIASDFPSMCLESNLSSCKHLPCCGKLHFQSCHGNVHKLH QFPSLQGCTSAGYFPCSDFTSGAPGHLEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLKGSLYCEDCLNKPAR NSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLATSLGKAASKFGSPEVAVAGQVLENL PPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINAT AKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELI RFEEFISDLPPRLPLKMPQCHTLLYVYNLPANKDGKSVSNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDS AERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCETKSSNAIADKVKSPKKLKNPKLCLIKDASEQSSSAKATP GKGSQANSGSATKNTNVKSLQELCRMESKTGHRNSEHQQGHLRLVVPTHGNSSAAVSTPKNSGVAEPVYK TSQKKENLSARSVTSSPVEKKDKEETVFQVSYPSAFSKLVASRQVSPLLASQSWSSRSMSPNLLNRASPL AFNIANSSSEADCPDPFANGADVQVSNIDYRLSRKELQQLLQEAFARHGKVKSVELSPHTDYQLKAVVQM ENLQDAIGAVNSLHRYKIGSKKILVSLATGAASKSLSLLSAETMSVLQDAPACCLPLFKFTDIYEKKFGH 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CYS . 1 12 SER . 1 13 ARG . 1 14 THR . 1 15 ARG . 1 16 GLY . 1 17 TRP . 1 18 LEU . 1 19 GLN . 1 20 GLN . 1 21 ASP . 1 22 ASN . 1 23 ASP . 1 24 ALA . 1 25 LYS . 1 26 PRO . 1 27 TRP . 1 28 LEU . 1 29 TRP . 1 30 LYS . 1 31 PHE . 1 32 SER . 1 33 ASN . 1 34 CYS . 1 35 PHE . 1 36 SER . 1 37 ARG . 1 38 PRO . 1 39 GLU . 1 40 GLN . 1 41 THR . 1 42 LEU . 1 43 PRO . 1 44 HIS . 1 45 SER . 1 46 PRO . 1 47 GLN . 1 48 THR . 1 49 LYS . 1 50 GLU . 1 51 TYR . 1 52 MET . 1 53 GLU . 1 54 ASN . 1 55 LYS . 1 56 LYS . 1 57 VAL . 1 58 ALA . 1 59 VAL . 1 60 GLU . 1 61 LEU . 1 62 LYS . 1 63 ASP . 1 64 VAL . 1 65 PRO . 1 66 SER . 1 67 PRO . 1 68 LEU . 1 69 HIS . 1 70 ALA . 1 71 GLY . 1 72 SER . 1 73 LYS . 1 74 LEU . 1 75 PHE . 1 76 PRO . 1 77 ALA . 1 78 VAL . 1 79 PRO . 1 80 LEU . 1 81 PRO . 1 82 ASP . 1 83 ILE . 1 84 ARG . 1 85 SER . 1 86 LEU . 1 87 GLN . 1 88 GLN . 1 89 PRO . 1 90 LYS . 1 91 ILE . 1 92 GLN . 1 93 LEU . 1 94 SER . 1 95 SER . 1 96 VAL . 1 97 PRO . 1 98 LYS . 1 99 VAL . 1 100 SER . 1 101 CYS . 1 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A 1 1441 THR 1441 ? ? ? A . A 1 1442 TYR 1442 ? ? ? A . A 1 1443 HIS 1443 ? ? ? A . A 1 1444 TYR 1444 ? ? ? A . A 1 1445 GLN 1445 ? ? ? A . A 1 1446 GLN 1446 ? ? ? A . A 1 1447 ILE 1447 ? ? ? A . A 1 1448 PHE 1448 ? ? ? A . A 1 1449 LEU 1449 ? ? ? A . A 1 1450 HIS 1450 ? ? ? A . A 1 1451 GLU 1451 ? ? ? A . A 1 1452 PHE 1452 ? ? ? A . A 1 1453 SER 1453 ? ? ? A . A 1 1454 MET 1454 ? ? ? A . A 1 1455 ALA 1455 ? ? ? A . A 1 1456 TYR 1456 ? ? ? A . A 1 1457 THR 1457 ? ? ? A . A 1 1458 LYS 1458 ? ? ? A . A 1 1459 TYR 1459 ? ? ? A . A 1 1460 VAL 1460 ? ? ? A . A 1 1461 GLY 1461 ? ? ? A . A 1 1462 GLU 1462 ? ? ? A . A 1 1463 THR 1463 ? ? ? A . A 1 1464 LEU 1464 ? ? ? A . A 1 1465 GLN 1465 ? ? ? A . A 1 1466 PRO 1466 ? ? ? A . A 1 1467 LYS 1467 ? ? ? A . A 1 1468 THR 1468 ? ? ? A . A 1 1469 TYR 1469 ? ? ? A . A 1 1470 GLY 1470 ? ? ? A . A 1 1471 HIS 1471 ? ? ? A . A 1 1472 SER 1472 ? ? ? A . A 1 1473 SER 1473 ? ? ? A . A 1 1474 VAL 1474 ? ? ? A . A 1 1475 GLU 1475 ? ? ? A . A 1 1476 GLU 1476 ? ? ? A . A 1 1477 LEU 1477 ? ? ? A . A 1 1478 LEU 1478 ? ? ? A . A 1 1479 GLY 1479 ? ? ? A . A 1 1480 ALA 1480 ? ? ? A . A 1 1481 ILE 1481 ? ? ? A . A 1 1482 PRO 1482 ? ? ? A . A 1 1483 GLN 1483 ? ? ? A . A 1 1484 VAL 1484 ? ? ? A . A 1 1485 VAL 1485 ? ? ? A . A 1 1486 TRP 1486 ? ? ? A . A 1 1487 ILE 1487 ? ? ? A . A 1 1488 LYS 1488 ? ? ? A . A 1 1489 GLY 1489 ? ? ? A . A 1 1490 HIS 1490 ? ? ? A . A 1 1491 GLY 1491 ? ? ? A . A 1 1492 HIS 1492 ? ? ? A . A 1 1493 LYS 1493 ? ? ? A . A 1 1494 ARG 1494 ? ? ? A . A 1 1495 ILE 1495 ? ? ? A . A 1 1496 VAL 1496 ? ? ? A . A 1 1497 VAL 1497 ? ? ? A . A 1 1498 LEU 1498 ? ? ? A . A 1 1499 LYS 1499 ? ? ? A . A 1 1500 ASN 1500 ? ? ? A . A 1 1501 ASP 1501 ? ? ? A . A 1 1502 MET 1502 ? ? ? A . A 1 1503 LYS 1503 ? ? ? A . A 1 1504 SER 1504 ? ? ? A . A 1 1505 ARG 1505 ? ? ? A . A 1 1506 LEU 1506 ? ? ? A . A 1 1507 SER 1507 ? ? ? A . A 1 1508 SER 1508 ? ? ? A . A 1 1509 LEU 1509 ? ? ? A . A 1 1510 SER 1510 ? ? ? A . A 1 1511 LEU 1511 ? ? ? A . A 1 1512 SER 1512 ? ? ? A . A 1 1513 PRO 1513 ? ? ? A . A 1 1514 ALA 1514 ? ? ? A . A 1 1515 ASN 1515 ? ? ? A . A 1 1516 HIS 1516 ? ? ? A . A 1 1517 GLU 1517 ? ? ? A . A 1 1518 ASN 1518 ? ? ? A . A 1 1519 GLN 1519 ? ? ? A . A 1 1520 PRO 1520 ? ? ? A . A 1 1521 SER 1521 ? ? ? A . A 1 1522 GLU 1522 ? ? ? A . A 1 1523 GLY 1523 ? ? ? A . A 1 1524 GLU 1524 ? ? ? A . A 1 1525 ARG 1525 ? ? ? A . A 1 1526 ILE 1526 ? ? ? A . A 1 1527 LEU 1527 ? ? ? A . A 1 1528 GLU 1528 ? ? ? A . A 1 1529 VAL 1529 ? ? ? A . A 1 1530 PRO 1530 ? ? ? A . A 1 1531 GLU 1531 ? ? ? A . A 1 1532 SER 1532 ? ? ? A . A 1 1533 HIS 1533 ? ? ? A . A 1 1534 THR 1534 ? ? ? A . A 1 1535 ALA 1535 ? ? ? A . A 1 1536 SER 1536 ? ? ? A . A 1 1537 GLU 1537 ? ? ? A . A 1 1538 LEU 1538 ? ? ? A . A 1 1539 LYS 1539 ? ? ? A . A 1 1540 LEU 1540 ? ? ? A . A 1 1541 GLY 1541 ? ? ? A . A 1 1542 ALA 1542 ? ? ? A . A 1 1543 ASP 1543 ? ? ? A . A 1 1544 GLY 1544 ? ? ? A . A 1 1545 SER 1545 ? ? ? A . A 1 1546 GLY 1546 ? ? ? A . A 1 1547 PRO 1547 ? ? ? A . A 1 1548 SER 1548 ? ? ? A . A 1 1549 HIS 1549 ? ? ? A . A 1 1550 THR 1550 ? ? ? A . A 1 1551 GLU 1551 ? ? ? A . A 1 1552 GLN 1552 ? ? ? A . A 1 1553 GLU 1553 ? ? ? A . A 1 1554 LEU 1554 ? ? ? A . A 1 1555 LEU 1555 ? ? ? A . A 1 1556 ARG 1556 ? ? ? A . A 1 1557 LEU 1557 ? ? ? A . A 1 1558 THR 1558 ? ? ? A . A 1 1559 ASP 1559 ? ? ? A . A 1 1560 ASP 1560 ? ? ? A . A 1 1561 SER 1561 ? ? ? A . A 1 1562 PRO 1562 ? ? ? A . A 1 1563 VAL 1563 ? ? ? A . A 1 1564 ASP 1564 ? ? ? A . A 1 1565 LEU 1565 ? ? ? A . A 1 1566 LEU 1566 ? ? ? A . A 1 1567 CYS 1567 ? ? ? A . A 1 1568 ALA 1568 ? ? ? A . A 1 1569 PRO 1569 ? ? ? A . A 1 1570 VAL 1570 ? ? ? A . A 1 1571 PRO 1571 ? ? ? A . A 1 1572 SER 1572 ? ? ? A . A 1 1573 CYS 1573 ? ? ? A . A 1 1574 LEU 1574 ? ? ? A . A 1 1575 PRO 1575 ? ? ? A . A 1 1576 SER 1576 ? ? ? A . A 1 1577 PRO 1577 ? ? ? A . A 1 1578 GLN 1578 ? ? ? A . A 1 1579 LEU 1579 ? ? ? A . A 1 1580 ARG 1580 ? ? ? A . A 1 1581 PRO 1581 ? ? ? A . A 1 1582 ASP 1582 ? ? ? A . A 1 1583 PRO 1583 ? ? ? A . A 1 1584 VAL 1584 ? ? ? A . A 1 1585 ILE 1585 ? ? ? A . A 1 1586 LEU 1586 ? ? ? A . A 1 1587 GLN 1587 ? ? ? A . A 1 1588 SER 1588 ? ? ? A . A 1 1589 ALA 1589 ? ? ? A . A 1 1590 ASP 1590 ? ? ? A . A 1 1591 LEU 1591 ? ? ? A . A 1 1592 ILE 1592 ? ? ? A . A 1 1593 GLN 1593 ? ? ? A . A 1 1594 PHE 1594 ? ? ? A . A 1 1595 GLU 1595 ? ? ? A . A 1 1596 GLU 1596 ? ? ? A . A 1 1597 ARG 1597 ? ? ? A . A 1 1598 PRO 1598 ? ? ? A . A 1 1599 GLN 1599 ? ? ? A . A 1 1600 GLU 1600 ? ? ? A . A 1 1601 PRO 1601 ? ? ? A . A 1 1602 SER 1602 ? ? ? A . A 1 1603 GLU 1603 ? ? ? A . A 1 1604 ILE 1604 ? ? ? A . A 1 1605 MET 1605 ? ? ? A . A 1 1606 ILE 1606 ? ? ? A . A 1 1607 LEU 1607 ? ? ? A . A 1 1608 ASN 1608 ? ? ? A . A 1 1609 GLN 1609 ? ? ? A . A 1 1610 GLU 1610 ? ? ? A . A 1 1611 GLU 1611 ? ? ? A . A 1 1612 LYS 1612 ? ? ? A . A 1 1613 MET 1613 ? ? ? A . A 1 1614 GLU 1614 ? ? ? A . A 1 1615 ILE 1615 ? ? ? A . A 1 1616 PRO 1616 ? ? ? A . A 1 1617 ILE 1617 ? ? ? A . A 1 1618 PRO 1618 ? ? ? A . A 1 1619 GLY 1619 ? ? ? A . A 1 1620 LYS 1620 ? ? ? A . A 1 1621 SER 1621 ? ? ? A . A 1 1622 LYS 1622 ? ? ? A . A 1 1623 THR 1623 ? ? ? A . A 1 1624 LEU 1624 ? ? ? A . A 1 1625 THR 1625 ? ? ? A . A 1 1626 SER 1626 ? ? ? A . A 1 1627 ASP 1627 ? ? ? A . A 1 1628 SER 1628 ? ? ? A . A 1 1629 SER 1629 ? ? ? A . A 1 1630 SER 1630 ? ? ? A . A 1 1631 SER 1631 ? ? ? A . A 1 1632 CYS 1632 ? ? ? A . A 1 1633 ILE 1633 ? ? ? A . A 1 1634 SER 1634 ? ? ? A . A 1 1635 ALA 1635 ? ? ? A . A 1 1636 ALA 1636 ? ? ? A . A 1 1637 VAL 1637 ? ? ? A . A 1 1638 PRO 1638 ? ? ? A . A 1 1639 VAL 1639 ? ? ? A . A 1 1640 PRO 1640 ? ? ? A . A 1 1641 PRO 1641 ? ? ? A . A 1 1642 CYS 1642 ? ? ? A . A 1 1643 PRO 1643 ? ? ? A . A 1 1644 SER 1644 ? ? ? A . A 1 1645 SER 1645 ? ? ? A . A 1 1646 GLU 1646 ? ? ? A . A 1 1647 THR 1647 ? ? ? A . A 1 1648 SER 1648 ? ? ? A . A 1 1649 GLU 1649 ? ? ? A . A 1 1650 SER 1650 ? ? ? A . A 1 1651 LEU 1651 ? ? ? A . A 1 1652 LEU 1652 ? ? ? A . A 1 1653 SER 1653 ? ? ? A . A 1 1654 LYS 1654 ? ? ? A . A 1 1655 ASP 1655 ? ? ? A . A 1 1656 PRO 1656 ? ? ? A . A 1 1657 VAL 1657 ? ? ? A . A 1 1658 GLU 1658 ? ? ? A . A 1 1659 SER 1659 ? ? ? A . A 1 1660 PRO 1660 ? ? ? A . A 1 1661 ALA 1661 ? ? ? A . A 1 1662 LYS 1662 ? ? ? A . A 1 1663 LYS 1663 ? ? ? A . A 1 1664 GLN 1664 ? ? ? A . A 1 1665 PRO 1665 ? ? ? A . A 1 1666 LYS 1666 ? ? ? A . A 1 1667 ASN 1667 ? ? ? A . A 1 1668 ARG 1668 ? ? ? A . A 1 1669 VAL 1669 ? ? ? A . A 1 1670 LYS 1670 ? ? ? A . A 1 1671 LEU 1671 ? ? ? A . A 1 1672 ALA 1672 ? ? ? A . A 1 1673 ALA 1673 ? ? ? A . A 1 1674 ASN 1674 ? ? ? A . A 1 1675 PHE 1675 ? ? ? A . A 1 1676 SER 1676 ? ? ? A . A 1 1677 LEU 1677 ? ? ? A . A 1 1678 ALA 1678 ? ? ? A . A 1 1679 PRO 1679 ? ? ? A . A 1 1680 ILE 1680 ? ? ? A . A 1 1681 THR 1681 ? ? ? A . A 1 1682 LYS 1682 ? ? ? A . A 1 1683 LEU 1683 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Meiosis regulator and mRNA stability factor 1 {PDB ID=5yad, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5yad.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 5yad, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;STGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCL LPSNQ ; ;STGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCL LPSNQ ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 15 75 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5yad 2024-10-16 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1683 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1683 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 8.66e-33 91.803 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHAGSKLFPAVPLPDIRSLQQPKIQLSSVPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGGGGSGGTSSLIHPGALLDSQSTRTITCQVGSGFAFQSASSLQNASARNNLAGIASDFPSMCLESNLSSCKHLPCCGKLHFQSCHGNVHKLHQFPSLQGCTSAGYFPCSDFTSGAPGHLEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLKGSLYCEDCLNKPARNSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLATSLGKAASKFGSPEVAVAGQVLENLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINATAKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELIRFEEFISDLPPRLPLKMPQCHTLLYVYNLPANKDGKSVSNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCETKSSNAIADKVKSPKKLKNPKLCLIKDASEQSSSAKATPGKGSQANSGSATKNTNVKSLQELCRMESKTGHRNSEHQQGHLRLVVPTHGNSSAAVSTPKNSGVAEPVYKTSQKKENLSARSVTSSPVEKKDKEETVFQVSYPSAFSKLVASRQVSPLLASQSWSSRSMSPNLLNRASPLAFNIANSSSEADCPDPFANGADVQVSNIDYRLSRKELQQLLQEAFARHGKVKSVELSPHTDYQLKAVVQMENLQDAIGAVNSLHRYKIGSKKILVSLATGAASKSLSLLSAETMSVLQDAPACCLPLFKFTDIYEKKFGHKLNVSDLYKLTDTVAIREQGNGRLVCLLPSSQARQSPLGSSQSHDGSSTNCSPIIFEELEYHEPVCRQHCSNKDFSEHEFDPDSYKIPFVILSLKTFAPQVHSLLQTHEGTVPLLDPWLLRSKSPVGNPQLIQFSREVIDLLKSQPSCVIPISHFIPSYHHHFAKQCRVSDYGYSKLIELLEAVPHVLQILGMGSKRLLTLTHRAQVKRFTQDLLKLLKSQASKQVIVREFSQAYHWCFSKDWDVTEYGVCELIDIVSEIPDTTICLSQQDNEMVICIPKRERTQDEIERTKQFSKDVVDLLRHQPHFRMPFNKFIPSYHHHFGRQCKLAYYGFTKLLELFEAIPDTLQVLECGEEKILTLTEVERFKALAAQFVKLLRSQKDNCLMMTDLLTEYAKTFGYTFRLQDYDVSSISALTQKLCHVVKVADIESGRQIQLINRKSLRSLTAQLLVLLMSWEGTTHLSVEELKRHYESTHNTPLNPCEYGFMTLTELLKSLPYLVEVFTNDKMEECVKLTSLYLFAKNVRSLLHTYHYQQIFLHEFSMAYTKYVGETLQPKTYGHSSVEELLGAIPQVVWIKGHGHKRIVVLKNDMKSRLSSLSLSPANHENQPSEGERILEVPESHTASELKLGADGSGPSHTEQELLRLTDDSPVDLLCAPVPSCLPSPQLRPDPVILQSADLIQFEERPQEPSEIMILNQEEKMEIPIPGKSKTLTSDSSSSCISAAVPVPPCPSSETSESLLSKDPVESPAKKQPKNRVKLAANFSLAPITKL 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCLLPSNQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.196}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5yad.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 882 882 ? A 41.275 25.018 34.979 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 2 C CA . GLU 882 882 ? A 40.077 25.536 35.728 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 3 C C . GLU 882 882 ? A 39.773 24.847 37.040 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 4 O O . GLU 882 882 ? A 39.662 25.496 38.072 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 5 C CB . GLU 882 882 ? A 38.901 25.432 34.759 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 6 C CG . GLU 882 882 ? A 39.108 26.221 33.445 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 7 C CD . GLU 882 882 ? A 37.937 25.982 32.495 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 882 882 ? A 37.275 24.926 32.647 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 882 882 ? A 37.737 26.836 31.608 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 10 N N . THR 883 883 ? A 39.727 23.504 37.059 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 11 C CA . THR 883 883 ? A 39.617 22.691 38.270 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 12 C C . THR 883 883 ? A 40.664 22.968 39.338 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 13 O O . THR 883 883 ? A 40.340 23.140 40.507 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 14 C CB . THR 883 883 ? A 39.727 21.240 37.862 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 15 O OG1 . THR 883 883 ? A 38.725 20.969 36.897 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 16 C CG2 . THR 883 883 ? A 39.519 20.288 39.038 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 17 N N . MET 884 884 ? A 41.954 23.105 38.946 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 18 C CA . MET 884 884 ? A 43.019 23.560 39.828 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 19 C C . MET 884 884 ? A 42.759 24.945 40.427 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 20 O O . MET 884 884 ? A 42.959 25.149 41.611 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 21 C CB . MET 884 884 ? A 44.370 23.612 39.065 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 22 C CG . MET 884 884 ? A 44.977 22.227 38.746 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 23 S SD . MET 884 884 ? A 46.278 22.195 37.477 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 24 C CE . MET 884 884 ? A 47.606 22.861 38.517 1 1 A MET 0.810 1 ATOM 25 N N . SER 885 885 ? A 42.262 25.917 39.616 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 26 C CA . SER 885 885 ? A 41.968 27.283 40.058 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 27 C C . SER 885 885 ? A 40.864 27.357 41.097 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 28 O O . SER 885 885 ? A 40.933 28.151 42.019 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 29 C CB . SER 885 885 ? A 41.718 28.318 38.895 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 30 O OG . SER 885 885 ? A 40.379 28.368 38.356 1 1 A SER 0.870 1 ATOM 31 N N . VAL 886 886 ? A 39.802 26.534 40.966 1 1 A VAL 0.900 1 ATOM 32 C CA . VAL 886 886 ? A 38.760 26.412 41.978 1 1 A VAL 0.900 1 ATOM 33 C C . VAL 886 886 ? A 39.227 25.719 43.254 1 1 A VAL 0.900 1 ATOM 34 O O . VAL 886 886 ? A 38.940 26.154 44.363 1 1 A VAL 0.900 1 ATOM 35 C CB . VAL 886 886 ? A 37.561 25.656 41.409 1 1 A VAL 0.900 1 ATOM 36 C CG1 . VAL 886 886 ? A 36.467 25.417 42.475 1 1 A VAL 0.900 1 ATOM 37 C CG2 . VAL 886 886 ? A 36.981 26.469 40.234 1 1 A VAL 0.900 1 ATOM 38 N N . LEU 887 887 ? A 39.954 24.587 43.124 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 39 C CA . LEU 887 887 ? A 40.315 23.788 44.280 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 40 C C . LEU 887 887 ? A 41.543 24.239 45.039 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 41 O O . LEU 887 887 ? A 41.663 23.912 46.212 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 42 C CB . LEU 887 887 ? A 40.509 22.311 43.901 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 43 C CG . LEU 887 887 ? A 39.207 21.614 43.483 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 44 C CD1 . LEU 887 887 ? A 39.536 20.237 42.902 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 45 C CD2 . LEU 887 887 ? A 38.215 21.466 44.650 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 46 N N . GLN 888 888 ? A 42.461 25.028 44.451 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 47 C CA . GLN 888 888 ? A 43.569 25.630 45.187 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 48 C C . GLN 888 888 ? A 43.106 26.624 46.255 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 49 O O . GLN 888 888 ? A 43.743 26.755 47.299 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 50 C CB . GLN 888 888 ? A 44.622 26.252 44.226 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 51 C CG . GLN 888 888 ? A 45.552 25.202 43.563 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 52 C CD . GLN 888 888 ? A 46.483 25.814 42.516 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 53 O OE1 . GLN 888 888 ? A 46.490 27.012 42.228 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 54 N NE2 . GLN 888 888 ? A 47.319 24.950 41.884 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 55 N N . ASP 889 889 ? A 41.948 27.285 46.051 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 56 C CA . ASP 889 889 ? A 41.357 28.188 47.017 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 57 C C . ASP 889 889 ? A 40.483 27.449 48.056 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 58 O O . ASP 889 889 ? A 40.043 28.026 49.053 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 59 C CB . ASP 889 889 ? A 40.484 29.232 46.259 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 60 C CG . ASP 889 889 ? A 41.292 30.256 45.463 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 61 O OD1 . ASP 889 889 ? A 42.502 30.433 45.741 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 62 O OD2 . ASP 889 889 ? A 40.665 30.911 44.585 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 63 N N . ALA 890 890 ? A 40.191 26.137 47.881 1 1 A ALA 0.850 1 ATOM 64 C CA . ALA 890 890 ? A 39.314 25.412 48.790 1 1 A ALA 0.850 1 ATOM 65 C C . ALA 890 890 ? A 40.043 24.899 50.056 1 1 A ALA 0.850 1 ATOM 66 O O . ALA 890 890 ? A 41.214 24.528 49.970 1 1 A ALA 0.850 1 ATOM 67 C CB . ALA 890 890 ? A 38.610 24.237 48.078 1 1 A ALA 0.850 1 ATOM 68 N N . PRO 891 891 ? A 39.452 24.811 51.258 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 69 C CA . PRO 891 891 ? A 40.027 24.093 52.406 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 70 C C . PRO 891 891 ? A 40.432 22.651 52.104 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 71 O O . PRO 891 891 ? A 39.617 21.897 51.589 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 72 C CB . PRO 891 891 ? A 38.939 24.156 53.499 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 73 C CG . PRO 891 891 ? A 38.010 25.294 53.053 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 74 C CD . PRO 891 891 ? A 38.091 25.244 51.528 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 75 N N . ALA 892 892 ? A 41.704 22.273 52.397 1 1 A ALA 0.760 1 ATOM 76 C CA . ALA 892 892 ? A 42.311 20.976 52.086 1 1 A ALA 0.760 1 ATOM 77 C C . ALA 892 892 ? A 42.330 20.612 50.599 1 1 A ALA 0.760 1 ATOM 78 O O . ALA 892 892 ? A 42.574 19.468 50.216 1 1 A ALA 0.760 1 ATOM 79 C CB . ALA 892 892 ? A 41.726 19.834 52.949 1 1 A ALA 0.760 1 ATOM 80 N N . CYS 893 893 ? A 42.107 21.617 49.729 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 81 C CA . CYS 893 893 ? A 42.052 21.506 48.292 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 82 C C . CYS 893 893 ? A 40.998 20.523 47.786 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 83 O O . CYS 893 893 ? A 41.173 19.801 46.802 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 84 C CB . CYS 893 893 ? A 43.469 21.308 47.694 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 85 S SG . CYS 893 893 ? A 44.612 22.681 48.057 1 1 A CYS 0.770 1 ATOM 86 N N . CYS 894 894 ? A 39.826 20.528 48.457 1 1 A CYS 0.840 1 ATOM 87 C CA . CYS 894 894 ? A 38.731 19.649 48.144 1 1 A CYS 0.840 1 ATOM 88 C C . CYS 894 894 ? A 37.412 20.351 48.334 1 1 A CYS 0.840 1 ATOM 89 O O . CYS 894 894 ? A 37.277 21.303 49.101 1 1 A CYS 0.840 1 ATOM 90 C CB . CYS 894 894 ? A 38.782 18.305 48.938 1 1 A CYS 0.840 1 ATOM 91 S SG . CYS 894 894 ? A 38.625 18.425 50.752 1 1 A CYS 0.840 1 ATOM 92 N N . LEU 895 895 ? A 36.388 19.900 47.594 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 93 C CA . LEU 895 895 ? A 35.058 20.443 47.695 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 94 C C . LEU 895 895 ? A 34.082 19.294 47.557 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 95 O O . LEU 895 895 ? A 34.386 18.329 46.851 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 96 C CB . LEU 895 895 ? A 34.769 21.492 46.584 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 97 C CG . LEU 895 895 ? A 35.422 22.869 46.810 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 98 C CD1 . LEU 895 895 ? A 35.147 23.781 45.610 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 99 C CD2 . LEU 895 895 ? 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A 31.723 30.538 31.589 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 212 C CB . PHE 908 908 ? A 33.466 28.703 33.331 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 213 C CG . PHE 908 908 ? A 34.799 28.654 34.022 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 214 C CD1 . PHE 908 908 ? A 35.869 29.422 33.542 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 215 C CD2 . PHE 908 908 ? A 34.996 27.858 35.157 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 216 C CE1 . PHE 908 908 ? A 37.113 29.394 34.181 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 217 C CE2 . PHE 908 908 ? A 36.235 27.833 35.808 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 218 C CZ . PHE 908 908 ? A 37.295 28.606 35.321 1 1 A PHE 0.760 1 ATOM 219 N N . GLY 909 909 ? A 30.343 30.280 33.326 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 220 C CA . GLY 909 909 ? A 29.148 30.645 32.564 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 221 C C . GLY 909 909 ? A 28.565 29.577 31.684 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 222 O O . GLY 909 909 ? A 27.663 29.842 30.891 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 223 N N . HIS 910 910 ? A 29.043 28.332 31.794 1 1 A HIS 0.740 1 ATOM 224 C CA . HIS 910 910 ? A 28.537 27.240 31.000 1 1 A HIS 0.740 1 ATOM 225 C C . HIS 910 910 ? A 28.500 25.988 31.832 1 1 A HIS 0.740 1 ATOM 226 O O . HIS 910 910 ? A 29.109 25.897 32.892 1 1 A HIS 0.740 1 ATOM 227 C CB . HIS 910 910 ? A 29.353 26.982 29.702 1 1 A HIS 0.740 1 ATOM 228 C CG . HIS 910 910 ? A 30.736 26.429 29.897 1 1 A HIS 0.740 1 ATOM 229 N ND1 . HIS 910 910 ? A 31.754 27.286 30.246 1 1 A HIS 0.740 1 ATOM 230 C CD2 . HIS 910 910 ? A 31.197 25.152 29.834 1 1 A HIS 0.740 1 ATOM 231 C CE1 . HIS 910 910 ? A 32.816 26.522 30.395 1 1 A HIS 0.740 1 ATOM 232 N NE2 . HIS 910 910 ? A 32.536 25.217 30.159 1 1 A HIS 0.740 1 ATOM 233 N N . LYS 911 911 ? A 27.721 25.000 31.357 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 234 C CA . LYS 911 911 ? A 27.504 23.735 32.021 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 235 C C . LYS 911 911 ? A 28.733 22.846 32.170 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 236 O O . LYS 911 911 ? A 29.484 22.632 31.223 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 237 C CB . LYS 911 911 ? A 26.434 22.936 31.242 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 238 C CG . LYS 911 911 ? A 25.938 21.697 31.996 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 239 C CD . LYS 911 911 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #