data_SMR-71cf24c413719dc571893187d9262b50_4
_entry.id SMR-71cf24c413719dc571893187d9262b50_4
_struct.entry_id SMR-71cf24c413719dc571893187d9262b50_4
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q8VIG2/ MARF1_RAT, Meiosis regulator and mRNA stability factor 1

Estimated model accuracy of this model is 0.052, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8VIG2'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_version 1.4.6
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_citation.title
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 5 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 224132.275 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP MARF1_RAT Q8VIG2 1
;MEGNGTENPCSRTLGWLHQNNDAKPWLWKFSGCFSLPEQTLPLSSQTKEYMENKKAAVELKDIPSPLHVG
SKFFPAVPLPDIHSLQQPKVQLSAIPKVSCCAHCPNEPSTSPMPFGGGSGSSGRSGSLIHTGSLLDSPST
GTVTCQVGSDFAFQSVSSLQNASARNNLVGLASDLPSMCVDSNLPSCKHLSCCGKFHFQSCRSNVHKLHQ
FQTLQGCTSAGYFPCSDFPSEAPGHLEEHLSHSELTPHLCTNSLHLNVAPPVCLKGSLYCEDCLNKPARN
SIIDAAKIWPNIPPPSTQPAPRAVPLCNRCGTKGMEKETSLLATSLGKAASKFGSPEVAVTGQVLETLPP
IGVFWDIENCSVPSGRSATTVVQRIREKFFRGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINATAK
NAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANQLIRF
EEFISDLPPRLPLKIPCHTLLYVYNLPANKDGKSISNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAER
AQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKHRECFEAKSSNAVVDKAKSPKKVKNTKLCLIKDTGEQSPSAKAMPGKG
LQANSGSATKNTNFKGLQELCRMEPKSGNRIRDHQQGHGSLATLPNSGPTASVPTLKNTGVRETLHRSSQ
KKENLSSQSIASSPAQKKKREGTVFQISYPSAFSQLIASRQVSPLFSSQSWSPRSMSPNLLNTASPLAFN
IANPSSAADCSDPFANGVDIQVSNVDYRLSRKELQQLLQEAFSKHGQVKSVELSPHTDYQLKAIVQMRNL
HDAICAVNSLHRYKIGSKKILVSLSTGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLN
VSDLYKLTDMIAIREQGNGRLVCLLPSNQARQSPLGSSQSHDGSSTNCSPVLFEELEYHESVCKQHCSNK
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ITCIPGVNIATAQNGVKVVKWIHNKPPPPNTDPWLLRSKSPVRNPQLIQFSREVIDLLKNQPSCILPISN
FIPLYHHHFGKQCRVSDYGYSKLIELLEAVPHVLQILGMGSKRLLTLTHRAQVKRFTQDLLKLLKSQASK
QVIVSDFSQAYHWCFSKDWDVTEYGVCDLIDIISEIPDTTICLSQQDDDMVICIRKRERTQDEIERTKQF
SKDVVDLLRHQPHFRMPFNKFIPSYHHHFGRQCKLAYYGFTKLLELLEAIPEILQVLECGEEKILTLTEV
ERFKALAAQFVKLLRSQKGNCLMMTDLFTEYAKTFGYTFRLQDYDVSSVSALTQKLCHVVKVADMESGKQ
IQLITRKSLRPLTVQLLVVLMSWEGDAYLPVDELKRHYETTHSTPLNPCEYGFMTLTELLKSLPSLVEVF
MNDKAEECVKLTSLYLFAKNVRSLLHTYHYQQIFLHEFAMAYTKYVGETLQPKTYGYSSVEELLGAIPQV
VWIKGHGHKRIVVLKNDMKNRLSSFDLSPVNHEDQPAVSRQILEVPEPHLASELHLRTGPSQMEQELLQL
ANSSPVDLLCAPVPSCLPSPQLRPDPVILQPTDLIQFEEHPQEPLGVLFLNQEEKTEIPIPVKKGNLSCN
SSPSSPASASAPPKPSSEAPGLLISKDAVESPAKKQPKNRVKLAANFSFAPVTKL
;
'Meiosis regulator and mRNA stability factor 1'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1735 1 1735
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . MARF1_RAT Q8VIG2 . 1 1735 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 2012-05-16
9A1999814518EF4C
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no A
;MEGNGTENPCSRTLGWLHQNNDAKPWLWKFSGCFSLPEQTLPLSSQTKEYMENKKAAVELKDIPSPLHVG
SKFFPAVPLPDIHSLQQPKVQLSAIPKVSCCAHCPNEPSTSPMPFGGGSGSSGRSGSLIHTGSLLDSPST
GTVTCQVGSDFAFQSVSSLQNASARNNLVGLASDLPSMCVDSNLPSCKHLSCCGKFHFQSCRSNVHKLHQ
FQTLQGCTSAGYFPCSDFPSEAPGHLEEHLSHSELTPHLCTNSLHLNVAPPVCLKGSLYCEDCLNKPARN
SIIDAAKIWPNIPPPSTQPAPRAVPLCNRCGTKGMEKETSLLATSLGKAASKFGSPEVAVTGQVLETLPP
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NAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANQLIRF
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;

;MEGNGTENPCSRTLGWLHQNNDAKPWLWKFSGCFSLPEQTLPLSSQTKEYMENKKAAVELKDIPSPLHVG
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;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 GLU .
1 3 GLY .
1 4 ASN .
1 5 GLY .
1 6 THR .
1 7 GLU .
1 8 ASN .
1 9 PRO .
1 10 CYS .
1 11 SER .
1 12 ARG .
1 13 THR .
1 14 LEU .
1 15 GLY .
1 16 TRP .
1 17 LEU .
1 18 HIS .
1 19 GLN .
1 20 ASN .
1 21 ASN .
1 22 ASP .
1 23 ALA .
1 24 LYS .
1 25 PRO .
1 26 TRP .
1 27 LEU .
1 28 TRP .
1 29 LYS .
1 30 PHE .
1 31 SER .
1 32 GLY .
1 33 CYS .
1 34 PHE .
1 35 SER .
1 36 LEU .
1 37 PRO .
1 38 GLU .
1 39 GLN .
1 40 THR .
1 41 LEU .
1 42 PRO .
1 43 LEU .
1 44 SER .
1 45 SER .
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1 47 THR .
1 48 LYS .
1 49 GLU .
1 50 TYR .
1 51 MET .
1 52 GLU .
1 53 ASN .
1 54 LYS .
1 55 LYS .
1 56 ALA .
1 57 ALA .
1 58 VAL .
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1 60 LEU .
1 61 LYS .
1 62 ASP .
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1 64 PRO .
1 65 SER .
1 66 PRO .
1 67 LEU .
1 68 HIS .
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1 71 SER .
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1 73 PHE .
1 74 PHE .
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1 76 ALA .
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1 78 PRO .
1 79 LEU .
1 80 PRO .
1 81 ASP .
1 82 ILE .
1 83 HIS .
1 84 SER .
1 85 LEU .
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1 87 GLN .
1 88 PRO .
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1 91 GLN .
1 92 LEU .
1 93 SER .
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1 95 ILE .
1 96 PRO .
1 97 LYS .
1 98 VAL .
1 99 SER .
1 100 CYS .
1 101 CYS .
1 102 ALA .
1 103 HIS .
1 104 CYS .
1 105 PRO .
1 106 ASN .
1 107 GLU .
1 108 PRO .
1 109 SER .
1 110 THR .
1 111 SER .
1 112 PRO .
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1 114 PRO .
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1 117 GLY .
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1 135 LEU .
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1 139 SER .
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1 1657 VAL .
1 1658 LEU .
1 1659 PHE .
1 1660 LEU .
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1 1662 GLN .
1 1663 GLU .
1 1664 GLU .
1 1665 LYS .
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1 1667 GLU .
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1 1669 PRO .
1 1670 ILE .
1 1671 PRO .
1 1672 VAL .
1 1673 LYS .
1 1674 LYS .
1 1675 GLY .
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1 1677 LEU .
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1 1680 ASN .
1 1681 SER .
1 1682 SER .
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1 1697 SER .
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1 1703 LEU .
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1 1711 SER .
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1 1713 ALA .
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1 1715 LYS .
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1 1717 PRO .
1 1718 LYS .
1 1719 ASN .
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1 1721 VAL .
1 1722 LYS .
1 1723 LEU .
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1 1725 ALA .
1 1726 ASN .
1 1727 PHE .
1 1728 SER .
1 1729 PHE .
1 1730 ALA .
1 1731 PRO .
1 1732 VAL .
1 1733 THR .
1 1734 LYS .
1 1735 LEU .
#
#
loop_
_struct_asym.id
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.details
A 1 .
#
#
loop_
_pdbx_poly_seq_scheme.asym_id
_pdbx_poly_seq_scheme.entity_id
_pdbx_poly_seq_scheme.seq_id
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_pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id
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_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code
A 1 1 MET 1 ? ? ? A .
A 1 2 GLU 2 ? ? ? A .
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A 1 5 GLY 5 ? ? ? A .
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A 1 33 CYS 33 ? ? ? A .
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A 1 43 LEU 43 ? ? ? A .
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A 1 55 LYS 55 ? ? ? A .
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A 1 120 GLY 120 ? ? ? A .
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A 1 200 SER 200 ? ? ? A .
A 1 201 CYS 201 ? ? ? A .
A 1 202 ARG 202 ? ? ? A .
A 1 203 SER 203 ? ? ? A .
A 1 204 ASN 204 ? ? ? A .
A 1 205 VAL 205 ? ? ? A .
A 1 206 HIS 206 ? ? ? A .
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A 1 209 HIS 209 ? ? ? A .
A 1 210 GLN 210 ? ? ? A .
A 1 211 PHE 211 ? ? ? A .
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A 1 216 GLY 216 ? ? ? A .
A 1 217 CYS 217 ? ? ? A .
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A 1 220 ALA 220 ? ? ? A .
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A 1 279 ARG 279 ? ? ? A .
A 1 280 ASN 280 ? ? ? A .
A 1 281 SER 281 ? ? ? A .
A 1 282 ILE 282 ? ? ? A .
A 1 283 ILE 283 ? ? ? A .
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A 1 285 ALA 285 ? ? ? A .
A 1 286 ALA 286 ? ? ? A .
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A 1 290 PRO 290 ? ? ? A .
A 1 291 ASN 291 ? ? ? A .
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A 1 294 PRO 294 ? ? ? A .
A 1 295 PRO 295 ? ? ? A .
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A 1 302 ARG 302 ? ? ? A .
A 1 303 ALA 303 ? ? ? A .
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A 1 308 ASN 308 ? ? ? A .
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A 1 310 CYS 310 ? ? ? A .
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A 1 324 THR 324 ? ? ? A .
A 1 325 SER 325 ? ? ? A .
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A 1 340 VAL 340 ? ? ? A .
A 1 341 THR 341 ? ? ? A .
A 1 342 GLY 342 ? ? ? A .
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A 1 350 PRO 350 ? ? ? A .
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A 1 372 VAL 372 ? ? ? A .
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A 1 374 ARG 374 ? ? ? A .
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A 1 1177 THR 1177 ? ? ? A .
A 1 1178 GLN 1178 ? ? ? A .
A 1 1179 ASP 1179 ? ? ? A .
A 1 1180 LEU 1180 ? ? ? A .
A 1 1181 LEU 1181 ? ? ? A .
A 1 1182 LYS 1182 ? ? ? A .
A 1 1183 LEU 1183 ? ? ? A .
A 1 1184 LEU 1184 ? ? ? A .
A 1 1185 LYS 1185 ? ? ? A .
A 1 1186 SER 1186 ? ? ? A .
A 1 1187 GLN 1187 ? ? ? A .
A 1 1188 ALA 1188 ? ? ? A .
A 1 1189 SER 1189 ? ? ? A .
A 1 1190 LYS 1190 ? ? ? A .
A 1 1191 GLN 1191 ? ? ? A .
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A 1 1209 TRP 1209 ? ? ? A .
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A 1 1407 LYS 1407 ? ? ? A .
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A 1 1409 LEU 1409 ? ? ? A .
A 1 1410 ARG 1410 ? ? ? A .
A 1 1411 PRO 1411 ? ? ? A .
A 1 1412 LEU 1412 ? ? ? A .
A 1 1413 THR 1413 ? ? ? A .
A 1 1414 VAL 1414 ? ? ? A .
A 1 1415 GLN 1415 ? ? ? A .
A 1 1416 LEU 1416 ? ? ? A .
A 1 1417 LEU 1417 ? ? ? A .
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A 1 1419 VAL 1419 ? ? ? A .
A 1 1420 LEU 1420 ? ? ? A .
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A 1 1429 LEU 1429 ? ? ? A .
A 1 1430 PRO 1430 ? ? ? A .
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A 1 1433 GLU 1433 ? ? ? A .
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A 1 1435 LYS 1435 ? ? ? A .
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A 1 1437 HIS 1437 ? ? ? A .
A 1 1438 TYR 1438 ? ? ? A .
A 1 1439 GLU 1439 ? ? ? A .
A 1 1440 THR 1440 ? ? ? A .
A 1 1441 THR 1441 ? ? ? A .
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A 1 1443 SER 1443 ? ? ? A .
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A 1 1556 ASN 1556 ? ? ? A .
A 1 1557 ASP 1557 ? ? ? A .
A 1 1558 MET 1558 ? ? ? A .
A 1 1559 LYS 1559 ? ? ? A .
A 1 1560 ASN 1560 ? ? ? A .
A 1 1561 ARG 1561 ? ? ? A .
A 1 1562 LEU 1562 ? ? ? A .
A 1 1563 SER 1563 ? ? ? A .
A 1 1564 SER 1564 ? ? ? A .
A 1 1565 PHE 1565 ? ? ? A .
A 1 1566 ASP 1566 ? ? ? A .
A 1 1567 LEU 1567 ? ? ? A .
A 1 1568 SER 1568 ? ? ? A .
A 1 1569 PRO 1569 ? ? ? A .
A 1 1570 VAL 1570 ? ? ? A .
A 1 1571 ASN 1571 ? ? ? A .
A 1 1572 HIS 1572 ? ? ? A .
A 1 1573 GLU 1573 ? ? ? A .
A 1 1574 ASP 1574 ? ? ? A .
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A 1 1577 ALA 1577 ? ? ? A .
A 1 1578 VAL 1578 ? ? ? A .
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A 1 1580 ARG 1580 ? ? ? A .
A 1 1581 GLN 1581 ? ? ? A .
A 1 1582 ILE 1582 ? ? ? A .
A 1 1583 LEU 1583 ? ? ? A .
A 1 1584 GLU 1584 ? ? ? A .
A 1 1585 VAL 1585 ? ? ? A .
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A 1 1587 GLU 1587 ? ? ? A .
A 1 1588 PRO 1588 ? ? ? A .
A 1 1589 HIS 1589 ? ? ? A .
A 1 1590 LEU 1590 ? ? ? A .
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A 1 1593 GLU 1593 ? ? ? A .
A 1 1594 LEU 1594 ? ? ? A .
A 1 1595 HIS 1595 ? ? ? A .
A 1 1596 LEU 1596 ? ? ? A .
A 1 1597 ARG 1597 ? ? ? A .
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A 1 1599 GLY 1599 ? ? ? A .
A 1 1600 PRO 1600 ? ? ? A .
A 1 1601 SER 1601 ? ? ? A .
A 1 1602 GLN 1602 ? ? ? A .
A 1 1603 MET 1603 ? ? ? A .
A 1 1604 GLU 1604 ? ? ? A .
A 1 1605 GLN 1605 ? ? ? A .
A 1 1606 GLU 1606 ? ? ? A .
A 1 1607 LEU 1607 ? ? ? A .
A 1 1608 LEU 1608 ? ? ? A .
A 1 1609 GLN 1609 ? ? ? A .
A 1 1610 LEU 1610 ? ? ? A .
A 1 1611 ALA 1611 ? ? ? A .
A 1 1612 ASN 1612 ? ? ? A .
A 1 1613 SER 1613 ? ? ? A .
A 1 1614 SER 1614 ? ? ? A .
A 1 1615 PRO 1615 ? ? ? A .
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A 1 1618 LEU 1618 ? ? ? A .
A 1 1619 LEU 1619 ? ? ? A .
A 1 1620 CYS 1620 ? ? ? A .
A 1 1621 ALA 1621 ? ? ? A .
A 1 1622 PRO 1622 ? ? ? A .
A 1 1623 VAL 1623 ? ? ? A .
A 1 1624 PRO 1624 ? ? ? A .
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A 1 1627 LEU 1627 ? ? ? A .
A 1 1628 PRO 1628 ? ? ? A .
A 1 1629 SER 1629 ? ? ? A .
A 1 1630 PRO 1630 ? ? ? A .
A 1 1631 GLN 1631 ? ? ? A .
A 1 1632 LEU 1632 ? ? ? A .
A 1 1633 ARG 1633 ? ? ? A .
A 1 1634 PRO 1634 ? ? ? A .
A 1 1635 ASP 1635 ? ? ? A .
A 1 1636 PRO 1636 ? ? ? A .
A 1 1637 VAL 1637 ? ? ? A .
A 1 1638 ILE 1638 ? ? ? A .
A 1 1639 LEU 1639 ? ? ? A .
A 1 1640 GLN 1640 ? ? ? A .
A 1 1641 PRO 1641 ? ? ? A .
A 1 1642 THR 1642 ? ? ? A .
A 1 1643 ASP 1643 ? ? ? A .
A 1 1644 LEU 1644 ? ? ? A .
A 1 1645 ILE 1645 ? ? ? A .
A 1 1646 GLN 1646 ? ? ? A .
A 1 1647 PHE 1647 ? ? ? A .
A 1 1648 GLU 1648 ? ? ? A .
A 1 1649 GLU 1649 ? ? ? A .
A 1 1650 HIS 1650 ? ? ? A .
A 1 1651 PRO 1651 ? ? ? A .
A 1 1652 GLN 1652 ? ? ? A .
A 1 1653 GLU 1653 ? ? ? A .
A 1 1654 PRO 1654 ? ? ? A .
A 1 1655 LEU 1655 ? ? ? A .
A 1 1656 GLY 1656 ? ? ? A .
A 1 1657 VAL 1657 ? ? ? A .
A 1 1658 LEU 1658 ? ? ? A .
A 1 1659 PHE 1659 ? ? ? A .
A 1 1660 LEU 1660 ? ? ? A .
A 1 1661 ASN 1661 ? ? ? A .
A 1 1662 GLN 1662 ? ? ? A .
A 1 1663 GLU 1663 ? ? ? A .
A 1 1664 GLU 1664 ? ? ? A .
A 1 1665 LYS 1665 ? ? ? A .
A 1 1666 THR 1666 ? ? ? A .
A 1 1667 GLU 1667 ? ? ? A .
A 1 1668 ILE 1668 ? ? ? A .
A 1 1669 PRO 1669 ? ? ? A .
A 1 1670 ILE 1670 ? ? ? A .
A 1 1671 PRO 1671 ? ? ? A .
A 1 1672 VAL 1672 ? ? ? A .
A 1 1673 LYS 1673 ? ? ? A .
A 1 1674 LYS 1674 ? ? ? A .
A 1 1675 GLY 1675 ? ? ? A .
A 1 1676 ASN 1676 ? ? ? A .
A 1 1677 LEU 1677 ? ? ? A .
A 1 1678 SER 1678 ? ? ? A .
A 1 1679 CYS 1679 ? ? ? A .
A 1 1680 ASN 1680 ? ? ? A .
A 1 1681 SER 1681 ? ? ? A .
A 1 1682 SER 1682 ? ? ? A .
A 1 1683 PRO 1683 ? ? ? A .
A 1 1684 SER 1684 ? ? ? A .
A 1 1685 SER 1685 ? ? ? A .
A 1 1686 PRO 1686 ? ? ? A .
A 1 1687 ALA 1687 ? ? ? A .
A 1 1688 SER 1688 ? ? ? A .
A 1 1689 ALA 1689 ? ? ? A .
A 1 1690 SER 1690 ? ? ? A .
A 1 1691 ALA 1691 ? ? ? A .
A 1 1692 PRO 1692 ? ? ? A .
A 1 1693 PRO 1693 ? ? ? A .
A 1 1694 LYS 1694 ? ? ? A .
A 1 1695 PRO 1695 ? ? ? A .
A 1 1696 SER 1696 ? ? ? A .
A 1 1697 SER 1697 ? ? ? A .
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A 1 1699 ALA 1699 ? ? ? A .
A 1 1700 PRO 1700 ? ? ? A .
A 1 1701 GLY 1701 ? ? ? A .
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A 1 1703 LEU 1703 ? ? ? A .
A 1 1704 ILE 1704 ? ? ? A .
A 1 1705 SER 1705 ? ? ? A .
A 1 1706 LYS 1706 ? ? ? A .
A 1 1707 ASP 1707 ? ? ? A .
A 1 1708 ALA 1708 ? ? ? A .
A 1 1709 VAL 1709 ? ? ? A .
A 1 1710 GLU 1710 ? ? ? A .
A 1 1711 SER 1711 ? ? ? A .
A 1 1712 PRO 1712 ? ? ? A .
A 1 1713 ALA 1713 ? ? ? A .
A 1 1714 LYS 1714 ? ? ? A .
A 1 1715 LYS 1715 ? ? ? A .
A 1 1716 GLN 1716 ? ? ? A .
A 1 1717 PRO 1717 ? ? ? A .
A 1 1718 LYS 1718 ? ? ? A .
A 1 1719 ASN 1719 ? ? ? A .
A 1 1720 ARG 1720 ? ? ? A .
A 1 1721 VAL 1721 ? ? ? A .
A 1 1722 LYS 1722 ? ? ? A .
A 1 1723 LEU 1723 ? ? ? A .
A 1 1724 ALA 1724 ? ? ? A .
A 1 1725 ALA 1725 ? ? ? A .
A 1 1726 ASN 1726 ? ? ? A .
A 1 1727 PHE 1727 ? ? ? A .
A 1 1728 SER 1728 ? ? ? A .
A 1 1729 PHE 1729 ? ? ? A .
A 1 1730 ALA 1730 ? ? ? A .
A 1 1731 PRO 1731 ? ? ? A .
A 1 1732 VAL 1732 ? ? ? A .
A 1 1733 THR 1733 ? ? ? A .
A 1 1734 LYS 1734 ? ? ? A .
A 1 1735 LEU 1735 ? ? ? A .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Meiosis regulator and mRNA stability factor 1 {PDB ID=5yad, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5yad.1.A}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by BLAST to 5yad, label_asym_id=A'
'target-template alignment' .
4 'model 4' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;STGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCL
LPSNQ
;

;STGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCL
LPSNQ
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 1 75
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 5yad 2024-10-16
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1735
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1735 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'BLAST e-value' . 2.41e-42 98.667
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MEGNGTENPCSRTLGWLHQNNDAKPWLWKFSGCFSLPEQTLPLSSQTKEYMENKKAAVELKDIPSPLHVGSKFFPAVPLPDIHSLQQPKVQLSAIPKVSCCAHCPNEPSTSPMPFGGGSGSSGRSGSLIHTGSLLDSPSTGTVTCQVGSDFAFQSVSSLQNASARNNLVGLASDLPSMCVDSNLPSCKHLSCCGKFHFQSCRSNVHKLHQFQTLQGCTSAGYFPCSDFPSEAPGHLEEHLSHSELTPHLCTNSLHLNVAPPVCLKGSLYCEDCLNKPARNSIIDAAKIWPNIPPPSTQPAPRAVPLCNRCGTKGMEKETSLLATSLGKAASKFGSPEVAVTGQVLETLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATTVVQRIREKFFRGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINATAKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANQLIRFEEFISDLPPRLPLKIPCHTLLYVYNLPANKDGKSISNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKHRECFEAKSSNAVVDKAKSPKKVKNTKLCLIKDTGEQSPSAKAMPGKGLQANSGSATKNTNFKGLQELCRMEPKSGNRIRDHQQGHGSLATLPNSGPTASVPTLKNTGVRETLHRSSQKKENLSSQSIASSPAQKKKREGTVFQISYPSAFSQLIASRQVSPLFSSQSWSPRSMSPNLLNTASPLAFNIANPSSAADCSDPFANGVDIQVSNVDYRLSRKELQQLLQEAFSKHGQVKSVELSPHTDYQLKAIVQMRNLHDAICAVNSLHRYKIGSKKILVSLSTGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDMIAIREQGNGRLVCLLPSNQARQSPLGSSQSHDGSSTNCSPVLFEELEYHESVCKQHCSNKDFSELVFDPDSYKVPFVVLSLKVFAPQVHSLLQTHEGTVPLLSFPDCYAAEFGDLEITQDRDKGVPLEHFITCIPGVNIATAQNGVKVVKWIHNKPPPPNTDPWLLRSKSPVRNPQLIQFSREVIDLLKNQPSCILPISNFIPLYHHHFGKQCRVSDYGYSKLIELLEAVPHVLQILGMGSKRLLTLTHRAQVKRFTQDLLKLLKSQASKQVIVSDFSQAYHWCFSKDWDVTEYGVCDLIDIISEIPDTTICLSQQDDDMVICIRKRERTQDEIERTKQFSKDVVDLLRHQPHFRMPFNKFIPSYHHHFGRQCKLAYYGFTKLLELLEAIPEILQVLECGEEKILTLTEVERFKALAAQFVKLLRSQKGNCLMMTDLFTEYAKTFGYTFRLQDYDVSSVSALTQKLCHVVKVADMESGKQIQLITRKSLRPLTVQLLVVLMSWEGDAYLPVDELKRHYETTHSTPLNPCEYGFMTLTELLKSLPSLVEVFMNDKAEECVKLTSLYLFAKNVRSLLHTYHYQQIFLHEFAMAYTKYVGETLQPKTYGYSSVEELLGAIPQVVWIKGHGHKRIVVLKNDMKNRLSSFDLSPVNHEDQPAVSRQILEVPEPHLASELHLRTGPSQMEQELLQLANSSPVDLLCAPVPSCLPSPQLRPDPVILQPTDLIQFEEHPQEPLGVLFLNQEEKTEIPIPVKKGNLSCNSSPSSPASASAPPKPSSEAPGLLISKDAVESPAKKQPKNRVKLAANFSFAPVTKL
2 1 2
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------STGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCLLPSNQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.140}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5yad.1, oligomeric state (monomer) as predicted'
4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . GLY 867 867 ? A 43.681 16.472 18.680 1 1 A GLY 0.220 1
ATOM 2 C CA . GLY 867 867 ? A 42.734 16.165 19.813 1 1 A GLY 0.220 1
ATOM 3 C C . GLY 867 867 ? A 42.067 17.381 20.395 1 1 A GLY 0.220 1
ATOM 4 O O . GLY 867 867 ? A 42.607 17.973 21.323 1 1 A GLY 0.220 1
ATOM 5 N N . ALA 868 868 ? A 40.892 17.787 19.868 1 1 A ALA 0.430 1
ATOM 6 C CA . ALA 868 868 ? A 40.058 18.845 20.418 1 1 A ALA 0.430 1
ATOM 7 C C . ALA 868 868 ? A 39.575 18.509 21.830 1 1 A ALA 0.430 1
ATOM 8 O O . ALA 868 868 ? A 39.628 19.332 22.738 1 1 A ALA 0.430 1
ATOM 9 C CB . ALA 868 868 ? A 38.869 19.068 19.459 1 1 A ALA 0.430 1
ATOM 10 N N . ALA 869 869 ? A 39.187 17.234 22.050 1 1 A ALA 0.660 1
ATOM 11 C CA . ALA 869 869 ? A 38.799 16.714 23.346 1 1 A ALA 0.660 1
ATOM 12 C C . ALA 869 869 ? A 39.883 16.839 24.423 1 1 A ALA 0.660 1
ATOM 13 O O . ALA 869 869 ? A 39.630 17.359 25.504 1 1 A ALA 0.660 1
ATOM 14 C CB . ALA 869 869 ? A 38.381 15.239 23.160 1 1 A ALA 0.660 1
ATOM 15 N N . ASN 870 870 ? A 41.144 16.447 24.108 1 1 A ASN 0.650 1
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ATOM 17 C C . ASN 870 870 ? A 42.607 18.073 25.300 1 1 A ASN 0.650 1
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ATOM 72 C CB . SER 877 877 ? A 43.290 19.840 34.056 1 1 A SER 0.890 1
ATOM 73 O OG . SER 877 877 ? A 44.162 20.421 33.098 1 1 A SER 0.890 1
ATOM 74 N N . THR 878 878 ? A 43.079 23.019 34.377 1 1 A THR 0.880 1
ATOM 75 C CA . THR 878 878 ? A 43.555 24.294 34.908 1 1 A THR 0.880 1
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ATOM 79 O OG1 . THR 878 878 ? A 43.381 25.754 32.936 1 1 A THR 0.880 1
ATOM 80 C CG2 . THR 878 878 ? A 45.315 24.391 33.120 1 1 A THR 0.880 1
ATOM 81 N N . GLU 879 879 ? A 41.233 25.049 35.098 1 1 A GLU 0.890 1
ATOM 82 C CA . GLU 879 879 ? A 40.045 25.584 35.733 1 1 A GLU 0.890 1
ATOM 83 C C . GLU 879 879 ? A 39.672 24.898 37.038 1 1 A GLU 0.890 1
ATOM 84 O O . GLU 879 879 ? A 39.360 25.569 38.026 1 1 A GLU 0.890 1
ATOM 85 C CB . GLU 879 879 ? A 38.838 25.485 34.781 1 1 A GLU 0.890 1
ATOM 86 C CG . GLU 879 879 ? A 39.005 26.291 33.471 1 1 A GLU 0.890 1
ATOM 87 C CD . GLU 879 879 ? A 37.861 26.063 32.488 1 1 A GLU 0.890 1
ATOM 88 O OE1 . GLU 879 879 ? A 37.173 25.017 32.608 1 1 A GLU 0.890 1
ATOM 89 O OE2 . GLU 879 879 ? A 37.665 26.931 31.603 1 1 A GLU 0.890 1
ATOM 90 N N . THR 880 880 ? A 39.741 23.554 37.079 1 1 A THR 0.900 1
ATOM 91 C CA . THR 880 880 ? A 39.587 22.702 38.265 1 1 A THR 0.900 1
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ATOM 93 O O . THR 880 880 ? A 40.347 23.095 40.508 1 1 A THR 0.900 1
ATOM 94 C CB . THR 880 880 ? A 39.623 21.217 37.896 1 1 A THR 0.900 1
ATOM 95 O OG1 . THR 880 880 ? A 38.489 20.865 37.119 1 1 A THR 0.900 1
ATOM 96 C CG2 . THR 880 880 ? A 39.578 20.281 39.108 1 1 A THR 0.900 1
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ATOM 98 C CA . MET 881 881 ? A 43.009 23.566 39.794 1 1 A MET 0.840 1
ATOM 99 C C . MET 881 881 ? A 42.744 24.945 40.398 1 1 A MET 0.840 1
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ATOM 101 C CB . MET 881 881 ? A 44.374 23.606 39.053 1 1 A MET 0.840 1
ATOM 102 C CG . MET 881 881 ? A 44.990 22.222 38.739 1 1 A MET 0.840 1
ATOM 103 S SD . MET 881 881 ? A 46.295 22.232 37.465 1 1 A MET 0.840 1
ATOM 104 C CE . MET 881 881 ? A 47.625 22.873 38.521 1 1 A MET 0.840 1
ATOM 105 N N . SER 882 882 ? A 42.266 25.918 39.580 1 1 A SER 0.910 1
ATOM 106 C CA . SER 882 882 ? A 41.957 27.275 40.033 1 1 A SER 0.910 1
ATOM 107 C C . SER 882 882 ? A 40.871 27.347 41.090 1 1 A SER 0.910 1
ATOM 108 O O . SER 882 882 ? A 40.959 28.124 42.029 1 1 A SER 0.910 1
ATOM 109 C CB . SER 882 882 ? A 41.723 28.317 38.878 1 1 A SER 0.910 1
ATOM 110 O OG . SER 882 882 ? A 40.362 28.483 38.450 1 1 A SER 0.910 1
ATOM 111 N N . ILE 883 883 ? A 39.810 26.527 40.970 1 1 A ILE 0.890 1
ATOM 112 C CA . ILE 883 883 ? A 38.772 26.400 41.989 1 1 A ILE 0.890 1
ATOM 113 C C . ILE 883 883 ? A 39.245 25.705 43.261 1 1 A ILE 0.890 1
ATOM 114 O O . ILE 883 883 ? A 38.956 26.133 44.373 1 1 A ILE 0.890 1
ATOM 115 C CB . ILE 883 883 ? A 37.569 25.659 41.405 1 1 A ILE 0.890 1
ATOM 116 C CG1 . ILE 883 883 ? A 36.931 26.527 40.297 1 1 A ILE 0.890 1
ATOM 117 C CG2 . ILE 883 883 ? A 36.535 25.280 42.493 1 1 A ILE 0.890 1
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ATOM 134 O OE1 . GLN 885 885 ? A 46.502 27.022 42.250 1 1 A GLN 0.840 1
ATOM 135 N NE2 . GLN 885 885 ? A 47.323 24.960 41.888 1 1 A GLN 0.840 1
ATOM 136 N N . ASP 886 886 ? A 41.946 27.285 46.047 1 1 A ASP 0.820 1
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ATOM 140 C CB . ASP 886 886 ? A 40.483 29.234 46.264 1 1 A ASP 0.820 1
ATOM 141 C CG . ASP 886 886 ? A 41.292 30.258 45.466 1 1 A ASP 0.820 1
ATOM 142 O OD1 . ASP 886 886 ? A 42.506 30.433 45.733 1 1 A ASP 0.820 1
ATOM 143 O OD2 . ASP 886 886 ? A 40.661 30.913 44.592 1 1 A ASP 0.820 1
ATOM 144 N N . ALA 887 887 ? A 40.192 26.139 47.883 1 1 A ALA 0.890 1
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ATOM 149 N N . PRO 888 888 ? A 39.453 24.804 51.254 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 150 C CA . PRO 888 888 ? A 40.028 24.091 52.406 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 151 C C . PRO 888 888 ? A 40.435 22.651 52.109 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 152 O O . PRO 888 888 ? A 39.621 21.895 51.594 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 153 C CB . PRO 888 888 ? A 38.937 24.157 53.494 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 154 C CG . PRO 888 888 ? A 38.013 25.295 53.051 1 1 A PRO 0.760 1
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ATOM 156 N N . ALA 889 889 ? A 41.708 22.277 52.395 1 1 A ALA 0.800 1
ATOM 157 C CA . ALA 889 889 ? A 42.308 20.978 52.085 1 1 A ALA 0.800 1
ATOM 158 C C . ALA 889 889 ? A 42.330 20.613 50.599 1 1 A ALA 0.800 1
ATOM 159 O O . ALA 889 889 ? A 42.577 19.468 50.215 1 1 A ALA 0.800 1
ATOM 160 C CB . ALA 889 889 ? A 41.723 19.836 52.948 1 1 A ALA 0.800 1
ATOM 161 N N . CYS 890 890 ? A 42.111 21.617 49.730 1 1 A CYS 0.820 1
ATOM 162 C CA . CYS 890 890 ? A 42.057 21.508 48.292 1 1 A CYS 0.820 1
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ATOM 180 C CD2 . LEU 892 892 ? A 34.949 23.548 48.107 1 1 A LEU 0.920 1
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ATOM 185 C CB . PRO 893 893 ? A 30.569 18.948 48.571 1 1 A PRO 0.940 1
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ATOM 188 N N . LEU 894 894 ? A 31.115 17.619 45.529 1 1 A LEU 0.930 1
ATOM 189 C CA . LEU 894 894 ? A 30.847 17.681 44.104 1 1 A LEU 0.930 1
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ATOM 192 C CB . LEU 894 894 ? A 30.505 16.289 43.537 1 1 A LEU 0.930 1
ATOM 193 C CG . LEU 894 894 ? A 30.163 16.273 42.031 1 1 A LEU 0.930 1
ATOM 194 C CD1 . LEU 894 894 ? A 31.326 16.753 41.149 1 1 A LEU 0.930 1
ATOM 195 C CD2 . LEU 894 894 ? A 29.702 14.881 41.607 1 1 A LEU 0.930 1
ATOM 196 N N . PHE 895 895 ? A 28.641 18.753 44.474 1 1 A PHE 0.870 1
ATOM 197 C CA . PHE 895 895 ? A 27.567 19.703 44.191 1 1 A PHE 0.870 1
ATOM 198 C C . PHE 895 895 ? A 28.088 21.145 44.169 1 1 A PHE 0.870 1
ATOM 199 O O . PHE 895 895 ? A 27.825 21.926 43.266 1 1 A PHE 0.870 1
ATOM 200 C CB . PHE 895 895 ? A 26.345 19.497 45.164 1 1 A PHE 0.870 1
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ATOM 212 C CG . LYS 896 896 ? A 30.534 24.287 47.117 1 1 A LYS 0.890 1
ATOM 213 C CD . LYS 896 896 ? A 30.556 24.421 48.641 1 1 A LYS 0.890 1
ATOM 214 C CE . LYS 896 896 ? A 31.336 25.629 49.149 1 1 A LYS 0.890 1
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ATOM 216 N N . PHE 897 897 ? A 31.360 22.164 43.866 1 1 A PHE 0.930 1
ATOM 217 C CA . PHE 897 897 ? A 32.297 22.290 42.766 1 1 A PHE 0.930 1
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ATOM 233 C CG2 . ILE 898 898 ? A 27.474 21.543 38.778 1 1 A ILE 0.910 1
ATOM 234 C CD1 . ILE 898 898 ? A 27.909 18.632 39.915 1 1 A ILE 0.910 1
ATOM 235 N N . ASP 899 899 ? A 28.436 24.012 41.114 1 1 A ASP 0.880 1
ATOM 236 C CA . ASP 899 899 ? A 27.872 25.341 41.274 1 1 A ASP 0.880 1
ATOM 237 C C . ASP 899 899 ? A 28.902 26.472 41.146 1 1 A ASP 0.880 1
ATOM 238 O O . ASP 899 899 ? A 28.677 27.477 40.469 1 1 A ASP 0.880 1
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ATOM 240 C CG . ASP 899 899 ? A 25.834 24.706 42.731 1 1 A ASP 0.880 1
ATOM 241 O OD1 . ASP 899 899 ? A 25.241 24.392 41.672 1 1 A ASP 0.880 1
ATOM 242 O OD2 . ASP 899 899 ? A 25.380 24.497 43.888 1 1 A ASP 0.880 1
ATOM 243 N N . ILE 900 900 ? A 30.093 26.323 41.772 1 1 A ILE 0.910 1
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ATOM 249 C CG2 . ILE 900 900 ? A 33.605 27.804 42.294 1 1 A ILE 0.910 1
ATOM 250 C CD1 . ILE 900 900 ? A 32.832 26.681 45.134 1 1 A ILE 0.910 1
ATOM 251 N N . TYR 901 901 ? A 31.936 26.173 39.543 1 1 A TYR 0.880 1
ATOM 252 C CA . TYR 901 901 ? A 32.392 26.113 38.168 1 1 A TYR 0.880 1
ATOM 253 C C . TYR 901 901 ? A 31.427 26.797 37.217 1 1 A TYR 0.880 1
ATOM 254 O O . TYR 901 901 ? A 31.810 27.692 36.466 1 1 A TYR 0.880 1
ATOM 255 C CB . TYR 901 901 ? A 32.576 24.624 37.744 1 1 A TYR 0.880 1
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ATOM 258 C CD2 . TYR 901 901 ? A 34.519 24.381 36.137 1 1 A TYR 0.880 1
ATOM 259 C CE1 . TYR 901 901 ? A 32.819 24.545 33.929 1 1 A TYR 0.880 1
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ATOM 261 C CZ . TYR 901 901 ? A 34.193 24.455 33.733 1 1 A TYR 0.880 1
ATOM 262 O OH . TYR 901 901 ? A 34.683 24.502 32.417 1 1 A TYR 0.880 1
ATOM 263 N N . GLU 902 902 ? A 30.138 26.416 37.267 1 1 A GLU 0.870 1
ATOM 264 C CA . GLU 902 902 ? A 29.131 26.904 36.347 1 1 A GLU 0.870 1
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ATOM 268 C CG . GLU 902 902 ? A 28.074 24.621 35.932 1 1 A GLU 0.870 1
ATOM 269 C CD . GLU 902 902 ? A 26.833 23.740 35.772 1 1 A GLU 0.870 1
ATOM 270 O OE1 . GLU 902 902 ? A 25.718 24.121 36.190 1 1 A GLU 0.870 1
ATOM 271 O OE2 . GLU 902 902 ? A 27.005 22.649 35.155 1 1 A GLU 0.870 1
ATOM 272 N N . LYS 903 903 ? A 28.884 28.917 37.713 1 1 A LYS 0.830 1
ATOM 273 C CA . LYS 903 903 ? A 28.838 30.342 37.935 1 1 A LYS 0.830 1
ATOM 274 C C . LYS 903 903 ? A 30.075 31.122 37.481 1 1 A LYS 0.830 1
ATOM 275 O O . LYS 903 903 ? A 29.966 32.216 36.933 1 1 A LYS 0.830 1
ATOM 276 C CB . LYS 903 903 ? A 28.578 30.633 39.423 1 1 A LYS 0.830 1
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ATOM 280 N NZ . LYS 903 903 ? A 27.719 34.454 42.563 1 1 A LYS 0.830 1
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ATOM 290 N N . TYR 905 905 ? A 32.491 30.134 35.104 1 1 A TYR 0.810 1
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ATOM 297 C CD2 . TYR 905 905 ? A 34.919 27.812 35.201 1 1 A TYR 0.810 1
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ATOM 332 C CD2 . LEU 909 909 ? A 31.886 20.307 36.854 1 1 A LEU 0.890 1
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ATOM 334 C CA . ASN 910 910 ? A 30.021 17.747 32.075 1 1 A ASN 0.880 1
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ATOM 354 N N . ASP 913 913 ? A 33.631 14.317 32.407 1 1 A ASP 0.860 1
ATOM 355 C CA . ASP 913 913 ? A 34.924 14.897 32.074 1 1 A ASP 0.860 1
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ATOM 370 N N . TYR 915 915 ? A 36.215 12.713 35.630 1 1 A TYR 0.810 1
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ATOM 374 C CB . TYR 915 915 ? A 35.627 10.300 35.584 1 1 A TYR 0.810 1
ATOM 375 C CG . TYR 915 915 ? A 34.825 10.241 36.835 1 1 A TYR 0.810 1
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ATOM 387 C CG . LYS 916 916 ? A 37.572 11.478 30.849 1 1 A LYS 0.810 1
ATOM 388 C CD . LYS 916 916 ? A 37.076 11.929 29.475 1 1 A LYS 0.810 1
ATOM 389 C CE . LYS 916 916 ? A 36.272 10.805 28.828 1 1 A LYS 0.810 1
ATOM 390 N NZ . LYS 916 916 ? A 35.322 11.338 27.834 1 1 A LYS 0.810 1
ATOM 391 N N . LEU 917 917 ? A 40.236 13.374 34.283 1 1 A LEU 0.860 1
ATOM 392 C CA . LEU 917 917 ? A 41.323 14.199 34.767 1 1 A LEU 0.860 1
ATOM 393 C C . LEU 917 917 ? A 42.069 13.513 35.893 1 1 A LEU 0.860 1
ATOM 394 O O . LEU 917 917 ? A 42.254 14.055 36.986 1 1 A LEU 0.860 1
ATOM 395 C CB . LEU 917 917 ? A 40.792 15.564 35.237 1 1 A LEU 0.860 1
ATOM 396 C CG . LEU 917 917 ? A 40.011 16.341 34.167 1 1 A LEU 0.860 1
ATOM 397 C CD1 . LEU 917 917 ? A 39.484 17.647 34.771 1 1 A LEU 0.860 1
ATOM 398 C CD2 . LEU 917 917 ? A 40.834 16.604 32.898 1 1 A LEU 0.860 1
ATOM 399 N N . THR 918 918 ? A 42.548 12.292 35.626 1 1 A THR 0.840 1
ATOM 400 C CA . THR 918 918 ? A 43.110 11.365 36.599 1 1 A THR 0.840 1
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ATOM 403 C CB . THR 918 918 ? A 43.171 9.945 36.035 1 1 A THR 0.840 1
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ATOM 405 C CG2 . THR 918 918 ? A 41.739 9.405 35.910 1 1 A THR 0.840 1
ATOM 406 N N . ASP 919 919 ? A 45.182 12.685 36.422 1 1 A ASP 0.820 1
ATOM 407 C CA . ASP 919 919 ? A 46.432 13.271 36.867 1 1 A ASP 0.820 1
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ATOM 411 C CG . ASP 919 919 ? A 47.784 12.292 34.958 1 1 A ASP 0.820 1
ATOM 412 O OD1 . ASP 919 919 ? A 48.194 11.331 35.654 1 1 A ASP 0.820 1
ATOM 413 O OD2 . ASP 919 919 ? A 47.717 12.288 33.703 1 1 A ASP 0.820 1
ATOM 414 N N . MET 920 920 ? A 44.957 14.997 37.871 1 1 A MET 0.820 1
ATOM 415 C CA . MET 920 920 ? A 44.660 16.262 38.517 1 1 A MET 0.820 1
ATOM 416 C C . MET 920 920 ? A 43.820 16.137 39.754 1 1 A MET 0.820 1
ATOM 417 O O . MET 920 920 ? A 44.062 16.789 40.768 1 1 A MET 0.820 1
ATOM 418 C CB . MET 920 920 ? A 43.826 17.121 37.547 1 1 A MET 0.820 1
ATOM 419 C CG . MET 920 920 ? A 44.613 17.422 36.269 1 1 A MET 0.820 1
ATOM 420 S SD . MET 920 920 ? A 45.901 18.679 36.574 1 1 A MET 0.820 1
ATOM 421 C CE . MET 920 920 ? A 46.723 18.683 34.958 1 1 A MET 0.820 1
ATOM 422 N N . ILE 921 921 ? A 42.785 15.289 39.702 1 1 A ILE 0.850 1
ATOM 423 C CA . ILE 921 921 ? A 41.872 15.158 40.806 1 1 A ILE 0.850 1
ATOM 424 C C . ILE 921 921 ? A 41.580 13.706 41.033 1 1 A ILE 0.850 1
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ATOM 426 C CB . ILE 921 921 ? A 40.546 15.905 40.623 1 1 A ILE 0.850 1
ATOM 427 C CG1 . ILE 921 921 ? A 39.913 15.635 39.241 1 1 A ILE 0.850 1
ATOM 428 C CG2 . ILE 921 921 ? A 40.771 17.408 40.883 1 1 A ILE 0.850 1
ATOM 429 C CD1 . ILE 921 921 ? A 38.476 16.146 39.117 1 1 A ILE 0.850 1
ATOM 430 N N . ALA 922 922 ? A 41.189 13.408 42.275 1 1 A ALA 0.950 1
ATOM 431 C CA . ALA 922 922 ? A 40.575 12.161 42.618 1 1 A ALA 0.950 1
ATOM 432 C C . ALA 922 922 ? A 39.199 12.518 43.115 1 1 A ALA 0.950 1
ATOM 433 O O . ALA 922 922 ? A 39.007 13.512 43.814 1 1 A ALA 0.950 1
ATOM 434 C CB . ALA 922 922 ? A 41.351 11.377 43.698 1 1 A ALA 0.950 1
ATOM 435 N N . ILE 923 923 ? A 38.198 11.714 42.742 1 1 A ILE 0.900 1
ATOM 436 C CA . ILE 923 923 ? A 36.834 11.919 43.174 1 1 A ILE 0.900 1
ATOM 437 C C . ILE 923 923 ? A 36.543 10.769 44.101 1 1 A ILE 0.900 1
ATOM 438 O O . ILE 923 923 ? A 36.675 9.600 43.743 1 1 A ILE 0.900 1
ATOM 439 C CB . ILE 923 923 ? A 35.844 11.996 42.020 1 1 A ILE 0.900 1
ATOM 440 C CG1 . ILE 923 923 ? A 36.254 13.134 41.060 1 1 A ILE 0.900 1
ATOM 441 C CG2 . ILE 923 923 ? A 34.416 12.211 42.570 1 1 A ILE 0.900 1
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ATOM 446 O O . ARG 924 924 ? A 33.874 10.971 46.920 1 1 A ARG 0.820 1
ATOM 447 C CB . ARG 924 924 ? A 36.792 10.466 47.686 1 1 A ARG 0.820 1
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ATOM 482 O OD1 . ASN 928 928 ? A 24.503 11.096 53.804 1 1 A ASN 0.730 1
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ATOM 507 N N . VAL 932 932 ? A 35.481 16.086 45.596 1 1 A VAL 0.940 1
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ATOM 563 C CD . GLN 939 939 ? A 46.799 19.522 47.879 1 1 A GLN 0.690 1
ATOM 564 O OE1 . GLN 939 939 ? A 47.267 19.933 48.936 1 1 A GLN 0.690 1
ATOM 565 N NE2 . GLN 939 939 ? A 46.028 18.403 47.853 1 1 A GLN 0.690 1
ATOM 566 O OXT . GLN 939 939 ? A 48.831 24.197 46.058 1 1 A GLN 0.690 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
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_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.822
2 1 3 0.052
#
#
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_ma_qa_metric_local.label_seq_id
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_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 867 GLY 1 0.220
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3 1 A 869 ALA 1 0.660
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8 1 A 874 SER 1 0.800
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1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
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reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
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ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material,
you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
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;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
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