data_SMR-369ef6d232bebeb0e04fd51108b6802d_4
_entry.id SMR-369ef6d232bebeb0e04fd51108b6802d_4
_struct.entry_id SMR-369ef6d232bebeb0e04fd51108b6802d_4
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q9Y4F3 (isoform 3)/ MARF1_HUMAN, Meiosis regulator and mRNA stability factor 1

Estimated model accuracy of this model is 0.048, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y4F3 (isoform 3)'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.title
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_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 5 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 224181.570 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP MARF1_HUMAN Q9Y4F3 1
;MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHA
GSKLFPAVPLPDIRSLQQPKIQLSSVPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGGGGSGGTSSLIHPGALLDSQS
TRTITCQVGSGFAFQSASSLQNASARNNLAGIASDFPSMCLESNLSSCKHLPCCGKLHFQSCHGNVHKLH
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NSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLATSLGKAASKFEVAVAGQVLENLPPI
GVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINATAKN
AADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELIRFE
EFISDLPPRLPLKMPQCHTLLYVYNLPANKDGKSVSNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAER
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SQANSGSATKNTNVKSLQELCRMESKTGHRNSEHQQGHLRLVVPTHGNSSAAVSTPKNSGVAEPVYKTSQ
KKENLSARSVTSSPVEKKDKEETVFQVSYPSAFSKLVASRQVSPLLASQSWSSRSMSPNLLNRASPLAFN
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QDAIGAVNSLHRYKIGSKKILVSLATGAASKSLSLLSAETMSVLQDAPACCLPLFKFTDIYEKKFGHKLN
VSDLYKLTDTVAIREQGNGRLVCLLPSSQARQSPLGSSQSHDGSSTNCSPIIFEELEYHEPVCRQHCSNK
DFSEHEFDPDSYKIPFVILSLKTFAPQVHSLLQTHEGTVPLLSFPDCYIAEFGDLEVVQENQGGVPLEHF
ITCVPGVNIATAQNGIKVVKWIHNKPPPPNTDPWLLRSKSPVGNPQLIQFSREVIDLLKSQPSCVIPISH
FIPSYHHHFAKQCRVSDYGYSKLIELLEAVPHVLQILGMGSKRLLTLTHRAQVKRFTQDLLKLLKSQASK
QVIVREFSQAYHWCFSKDWDVTEYGVCELIDIVSEIPDTTICLSQQDNEMVICIPKRERTQDEIERTKQF
SKDVVDLLRHQPHFRMPFNKFIPSYHHHFGRQCKLAYYGFTKLLELFEAIPDTLQVLECGEEKILTLTEV
ERFKALAAQFVKLLRSQKDNCLMMTDLLTEYAKTFGYTFRLQDYDVSSISALTQKLCHVVKVADIESGRQ
IQLINRKSLRSLTAQLLVLLMSWEGTTHLSVEELKRHYESTHNTPLNPCEYGFMTLTELLKSLPYLVEVF
TNDKMEECVKLTSLYLFAKNVRSLLHTYHYQQIFLHEFSMAYTKYVGETLQPKTYGHSSVEELLGAIPQV
VWIKGHGHKRIVVLKNDMKSRLSSLSLSPANHENQPSEGERILEVPESHTASELKLGADGSGPSHTEQEL
LRLTDDSPVDLLCAPVPSCLPSPQLRPDPVILQSADLIQFEERPQEPSEIMILNQEEKMEIPIPGKSKTL
TSDSSSSCISAAVPVPPCPSSETSESLLSKDPVESPAKKQPKNRVKLAANFSLAPITKL
;
'Meiosis regulator and mRNA stability factor 1'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1739 1 1739
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . MARF1_HUMAN Q9Y4F3 Q9Y4F3-3 1 1739 9606 'Homo sapiens (Human)'
2012-05-16 AE0825D8F42C7200
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no A
;MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHA
GSKLFPAVPLPDIRSLQQPKIQLSSVPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGGGGSGGTSSLIHPGALLDSQS
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QFPSLQGCTSAGYFPCSDFTSGAPGHLEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLKGSLYCEDCLNKPAR
NSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLATSLGKAASKFEVAVAGQVLENLPPI
GVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINATAKN
AADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELIRFE
EFISDLPPRLPLKMPQCHTLLYVYNLPANKDGKSVSNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAER
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;

;MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHA
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;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 MET .
1 3 GLU .
1 4 GLY .
1 5 ASN .
1 6 GLY .
1 7 THR .
1 8 GLU .
1 9 ASN .
1 10 SER .
1 11 CYS .
1 12 SER .
1 13 ARG .
1 14 THR .
1 15 ARG .
1 16 GLY .
1 17 TRP .
1 18 LEU .
1 19 GLN .
1 20 GLN .
1 21 ASP .
1 22 ASN .
1 23 ASP .
1 24 ALA .
1 25 LYS .
1 26 PRO .
1 27 TRP .
1 28 LEU .
1 29 TRP .
1 30 LYS .
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1 32 SER .
1 33 ASN .
1 34 CYS .
1 35 PHE .
1 36 SER .
1 37 ARG .
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1 40 GLN .
1 41 THR .
1 42 LEU .
1 43 PRO .
1 44 HIS .
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1 46 PRO .
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1 48 THR .
1 49 LYS .
1 50 GLU .
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1 52 MET .
1 53 GLU .
1 54 ASN .
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1 56 LYS .
1 57 VAL .
1 58 ALA .
1 59 VAL .
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1 61 LEU .
1 62 LYS .
1 63 ASP .
1 64 VAL .
1 65 PRO .
1 66 SER .
1 67 PRO .
1 68 LEU .
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1 77 ALA .
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1 79 PRO .
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1 81 PRO .
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1 84 ARG .
1 85 SER .
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1 87 GLN .
1 88 GLN .
1 89 PRO .
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1 91 ILE .
1 92 GLN .
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1 95 SER .
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1 97 PRO .
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1 99 VAL .
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1 102 CYS .
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1 118 GLY .
1 119 GLY .
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1 1739 LEU .
#
#
loop_
_struct_asym.id
_struct_asym.entity_id
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A 1 .
#
#
loop_
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A 1 1178 GLN 1178 ? ? ? A .
A 1 1179 ASP 1179 ? ? ? A .
A 1 1180 LEU 1180 ? ? ? A .
A 1 1181 LEU 1181 ? ? ? A .
A 1 1182 LYS 1182 ? ? ? A .
A 1 1183 LEU 1183 ? ? ? A .
A 1 1184 LEU 1184 ? ? ? A .
A 1 1185 LYS 1185 ? ? ? A .
A 1 1186 SER 1186 ? ? ? A .
A 1 1187 GLN 1187 ? ? ? A .
A 1 1188 ALA 1188 ? ? ? A .
A 1 1189 SER 1189 ? ? ? A .
A 1 1190 LYS 1190 ? ? ? A .
A 1 1191 GLN 1191 ? ? ? A .
A 1 1192 VAL 1192 ? ? ? A .
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A 1 1209 TRP 1209 ? ? ? A .
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A 1 1407 LYS 1407 ? ? ? A .
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A 1 1412 LEU 1412 ? ? ? A .
A 1 1413 THR 1413 ? ? ? A .
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A 1 1555 LYS 1555 ? ? ? A .
A 1 1556 ASN 1556 ? ? ? A .
A 1 1557 ASP 1557 ? ? ? A .
A 1 1558 MET 1558 ? ? ? A .
A 1 1559 LYS 1559 ? ? ? A .
A 1 1560 SER 1560 ? ? ? A .
A 1 1561 ARG 1561 ? ? ? A .
A 1 1562 LEU 1562 ? ? ? A .
A 1 1563 SER 1563 ? ? ? A .
A 1 1564 SER 1564 ? ? ? A .
A 1 1565 LEU 1565 ? ? ? A .
A 1 1566 SER 1566 ? ? ? A .
A 1 1567 LEU 1567 ? ? ? A .
A 1 1568 SER 1568 ? ? ? A .
A 1 1569 PRO 1569 ? ? ? A .
A 1 1570 ALA 1570 ? ? ? A .
A 1 1571 ASN 1571 ? ? ? A .
A 1 1572 HIS 1572 ? ? ? A .
A 1 1573 GLU 1573 ? ? ? A .
A 1 1574 ASN 1574 ? ? ? A .
A 1 1575 GLN 1575 ? ? ? A .
A 1 1576 PRO 1576 ? ? ? A .
A 1 1577 SER 1577 ? ? ? A .
A 1 1578 GLU 1578 ? ? ? A .
A 1 1579 GLY 1579 ? ? ? A .
A 1 1580 GLU 1580 ? ? ? A .
A 1 1581 ARG 1581 ? ? ? A .
A 1 1582 ILE 1582 ? ? ? A .
A 1 1583 LEU 1583 ? ? ? A .
A 1 1584 GLU 1584 ? ? ? A .
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A 1 1587 GLU 1587 ? ? ? A .
A 1 1588 SER 1588 ? ? ? A .
A 1 1589 HIS 1589 ? ? ? A .
A 1 1590 THR 1590 ? ? ? A .
A 1 1591 ALA 1591 ? ? ? A .
A 1 1592 SER 1592 ? ? ? A .
A 1 1593 GLU 1593 ? ? ? A .
A 1 1594 LEU 1594 ? ? ? A .
A 1 1595 LYS 1595 ? ? ? A .
A 1 1596 LEU 1596 ? ? ? A .
A 1 1597 GLY 1597 ? ? ? A .
A 1 1598 ALA 1598 ? ? ? A .
A 1 1599 ASP 1599 ? ? ? A .
A 1 1600 GLY 1600 ? ? ? A .
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A 1 1602 GLY 1602 ? ? ? A .
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A 1 1604 SER 1604 ? ? ? A .
A 1 1605 HIS 1605 ? ? ? A .
A 1 1606 THR 1606 ? ? ? A .
A 1 1607 GLU 1607 ? ? ? A .
A 1 1608 GLN 1608 ? ? ? A .
A 1 1609 GLU 1609 ? ? ? A .
A 1 1610 LEU 1610 ? ? ? A .
A 1 1611 LEU 1611 ? ? ? A .
A 1 1612 ARG 1612 ? ? ? A .
A 1 1613 LEU 1613 ? ? ? A .
A 1 1614 THR 1614 ? ? ? A .
A 1 1615 ASP 1615 ? ? ? A .
A 1 1616 ASP 1616 ? ? ? A .
A 1 1617 SER 1617 ? ? ? A .
A 1 1618 PRO 1618 ? ? ? A .
A 1 1619 VAL 1619 ? ? ? A .
A 1 1620 ASP 1620 ? ? ? A .
A 1 1621 LEU 1621 ? ? ? A .
A 1 1622 LEU 1622 ? ? ? A .
A 1 1623 CYS 1623 ? ? ? A .
A 1 1624 ALA 1624 ? ? ? A .
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A 1 1626 VAL 1626 ? ? ? A .
A 1 1627 PRO 1627 ? ? ? A .
A 1 1628 SER 1628 ? ? ? A .
A 1 1629 CYS 1629 ? ? ? A .
A 1 1630 LEU 1630 ? ? ? A .
A 1 1631 PRO 1631 ? ? ? A .
A 1 1632 SER 1632 ? ? ? A .
A 1 1633 PRO 1633 ? ? ? A .
A 1 1634 GLN 1634 ? ? ? A .
A 1 1635 LEU 1635 ? ? ? A .
A 1 1636 ARG 1636 ? ? ? A .
A 1 1637 PRO 1637 ? ? ? A .
A 1 1638 ASP 1638 ? ? ? A .
A 1 1639 PRO 1639 ? ? ? A .
A 1 1640 VAL 1640 ? ? ? A .
A 1 1641 ILE 1641 ? ? ? A .
A 1 1642 LEU 1642 ? ? ? A .
A 1 1643 GLN 1643 ? ? ? A .
A 1 1644 SER 1644 ? ? ? A .
A 1 1645 ALA 1645 ? ? ? A .
A 1 1646 ASP 1646 ? ? ? A .
A 1 1647 LEU 1647 ? ? ? A .
A 1 1648 ILE 1648 ? ? ? A .
A 1 1649 GLN 1649 ? ? ? A .
A 1 1650 PHE 1650 ? ? ? A .
A 1 1651 GLU 1651 ? ? ? A .
A 1 1652 GLU 1652 ? ? ? A .
A 1 1653 ARG 1653 ? ? ? A .
A 1 1654 PRO 1654 ? ? ? A .
A 1 1655 GLN 1655 ? ? ? A .
A 1 1656 GLU 1656 ? ? ? A .
A 1 1657 PRO 1657 ? ? ? A .
A 1 1658 SER 1658 ? ? ? A .
A 1 1659 GLU 1659 ? ? ? A .
A 1 1660 ILE 1660 ? ? ? A .
A 1 1661 MET 1661 ? ? ? A .
A 1 1662 ILE 1662 ? ? ? A .
A 1 1663 LEU 1663 ? ? ? A .
A 1 1664 ASN 1664 ? ? ? A .
A 1 1665 GLN 1665 ? ? ? A .
A 1 1666 GLU 1666 ? ? ? A .
A 1 1667 GLU 1667 ? ? ? A .
A 1 1668 LYS 1668 ? ? ? A .
A 1 1669 MET 1669 ? ? ? A .
A 1 1670 GLU 1670 ? ? ? A .
A 1 1671 ILE 1671 ? ? ? A .
A 1 1672 PRO 1672 ? ? ? A .
A 1 1673 ILE 1673 ? ? ? A .
A 1 1674 PRO 1674 ? ? ? A .
A 1 1675 GLY 1675 ? ? ? A .
A 1 1676 LYS 1676 ? ? ? A .
A 1 1677 SER 1677 ? ? ? A .
A 1 1678 LYS 1678 ? ? ? A .
A 1 1679 THR 1679 ? ? ? A .
A 1 1680 LEU 1680 ? ? ? A .
A 1 1681 THR 1681 ? ? ? A .
A 1 1682 SER 1682 ? ? ? A .
A 1 1683 ASP 1683 ? ? ? A .
A 1 1684 SER 1684 ? ? ? A .
A 1 1685 SER 1685 ? ? ? A .
A 1 1686 SER 1686 ? ? ? A .
A 1 1687 SER 1687 ? ? ? A .
A 1 1688 CYS 1688 ? ? ? A .
A 1 1689 ILE 1689 ? ? ? A .
A 1 1690 SER 1690 ? ? ? A .
A 1 1691 ALA 1691 ? ? ? A .
A 1 1692 ALA 1692 ? ? ? A .
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A 1 1695 VAL 1695 ? ? ? A .
A 1 1696 PRO 1696 ? ? ? A .
A 1 1697 PRO 1697 ? ? ? A .
A 1 1698 CYS 1698 ? ? ? A .
A 1 1699 PRO 1699 ? ? ? A .
A 1 1700 SER 1700 ? ? ? A .
A 1 1701 SER 1701 ? ? ? A .
A 1 1702 GLU 1702 ? ? ? A .
A 1 1703 THR 1703 ? ? ? A .
A 1 1704 SER 1704 ? ? ? A .
A 1 1705 GLU 1705 ? ? ? A .
A 1 1706 SER 1706 ? ? ? A .
A 1 1707 LEU 1707 ? ? ? A .
A 1 1708 LEU 1708 ? ? ? A .
A 1 1709 SER 1709 ? ? ? A .
A 1 1710 LYS 1710 ? ? ? A .
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A 1 1713 VAL 1713 ? ? ? A .
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A 1 1715 SER 1715 ? ? ? A .
A 1 1716 PRO 1716 ? ? ? A .
A 1 1717 ALA 1717 ? ? ? A .
A 1 1718 LYS 1718 ? ? ? A .
A 1 1719 LYS 1719 ? ? ? A .
A 1 1720 GLN 1720 ? ? ? A .
A 1 1721 PRO 1721 ? ? ? A .
A 1 1722 LYS 1722 ? ? ? A .
A 1 1723 ASN 1723 ? ? ? A .
A 1 1724 ARG 1724 ? ? ? A .
A 1 1725 VAL 1725 ? ? ? A .
A 1 1726 LYS 1726 ? ? ? A .
A 1 1727 LEU 1727 ? ? ? A .
A 1 1728 ALA 1728 ? ? ? A .
A 1 1729 ALA 1729 ? ? ? A .
A 1 1730 ASN 1730 ? ? ? A .
A 1 1731 PHE 1731 ? ? ? A .
A 1 1732 SER 1732 ? ? ? A .
A 1 1733 LEU 1733 ? ? ? A .
A 1 1734 ALA 1734 ? ? ? A .
A 1 1735 PRO 1735 ? ? ? A .
A 1 1736 ILE 1736 ? ? ? A .
A 1 1737 THR 1737 ? ? ? A .
A 1 1738 LYS 1738 ? ? ? A .
A 1 1739 LEU 1739 ? ? ? A .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Meiosis regulator and mRNA stability factor 1 {PDB ID=5yad, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5yad.1.A}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by BLAST to 5yad, label_asym_id=A'
'target-template alignment' .
4 'model 4' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;STGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCL
LPSNQ
;

;STGAANKSLSLLSTETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCL
LPSNQ
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 15 75
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 5yad 2024-10-16
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1739
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1739 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'BLAST e-value' . 8.92e-33 91.803
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHAGSKLFPAVPLPDIRSLQQPKIQLSSVPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGGGGSGGTSSLIHPGALLDSQSTRTITCQVGSGFAFQSASSLQNASARNNLAGIASDFPSMCLESNLSSCKHLPCCGKLHFQSCHGNVHKLHQFPSLQGCTSAGYFPCSDFTSGAPGHLEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLKGSLYCEDCLNKPARNSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLATSLGKAASKFEVAVAGQVLENLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINATAKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELIRFEEFISDLPPRLPLKMPQCHTLLYVYNLPANKDGKSVSNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCETKSSNAIADKVKSPKKLKNPKLCLIKDASEQSSSAKATPGKGSQANSGSATKNTNVKSLQELCRMESKTGHRNSEHQQGHLRLVVPTHGNSSAAVSTPKNSGVAEPVYKTSQKKENLSARSVTSSPVEKKDKEETVFQVSYPSAFSKLVASRQVSPLLASQSWSSRSMSPNLLNRASPLAFNIANSSSEADCPDPFANGADVQVSNIDYRLSRKELQQLLQEAFARHGKVKSVELSPHTDYQLKAVVQMENLQDAIGAVNSLHRYKIGSKKILVSLATGAASKSLSLLSAETMSVLQDAPACCLPLFKFTDIYEKKFGHKLNVSDLYKLTDTVAIREQGNGRLVCLLPSSQARQSPLGSSQSHDGSSTNCSPIIFEELEYHEPVCRQHCSNKDFSEHEFDPDSYKIPFVILSLKTFAPQVHSLLQTHEGTVPLLSFPDCYIAEFGDLEVVQENQGGVPLEHFITCVPGVNIATAQNGIKVVKWIHNKPPPPNTDPWLLRSKSPVGNPQLIQFSREVIDLLKSQPSCVIPISHFIPSYHHHFAKQCRVSDYGYSKLIELLEAVPHVLQILGMGSKRLLTLTHRAQVKRFTQDLLKLLKSQASKQVIVREFSQAYHWCFSKDWDVTEYGVCELIDIVSEIPDTTICLSQQDNEMVICIPKRERTQDEIERTKQFSKDVVDLLRHQPHFRMPFNKFIPSYHHHFGRQCKLAYYGFTKLLELFEAIPDTLQVLECGEEKILTLTEVERFKALAAQFVKLLRSQKDNCLMMTDLLTEYAKTFGYTFRLQDYDVSSISALTQKLCHVVKVADIESGRQIQLINRKSLRSLTAQLLVLLMSWEGTTHLSVEELKRHYESTHNTPLNPCEYGFMTLTELLKSLPYLVEVFTNDKMEECVKLTSLYLFAKNVRSLLHTYHYQQIFLHEFSMAYTKYVGETLQPKTYGHSSVEELLGAIPQVVWIKGHGHKRIVVLKNDMKSRLSSLSLSPANHENQPSEGERILEVPESHTASELKLGADGSGPSHTEQELLRLTDDSPVDLLCAPVPSCLPSPQLRPDPVILQSADLIQFEERPQEPSEIMILNQEEKMEIPIPGKSKTLTSDSSSSCISAAVPVPPCPSSETSESLLSKDPVESPAKKQPKNRVKLAANFSLAPITKL
2 1 2
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ETMSILQDAPACCLPLFKFIDIYEKKYGHKLNVSDLYKLTDTIAIREQGNGRLVCLLPSNQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.136}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5yad.1, oligomeric state (monomer) as predicted'
4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . GLU 879 879 ? A 41.275 25.018 34.979 1 1 A GLU 0.680 1
ATOM 2 C CA . GLU 879 879 ? A 40.077 25.536 35.728 1 1 A GLU 0.680 1
ATOM 3 C C . GLU 879 879 ? A 39.773 24.847 37.040 1 1 A GLU 0.680 1
ATOM 4 O O . GLU 879 879 ? A 39.662 25.496 38.072 1 1 A GLU 0.680 1
ATOM 5 C CB . GLU 879 879 ? A 38.901 25.432 34.759 1 1 A GLU 0.680 1
ATOM 6 C CG . GLU 879 879 ? A 39.108 26.221 33.445 1 1 A GLU 0.680 1
ATOM 7 C CD . GLU 879 879 ? A 37.937 25.982 32.495 1 1 A GLU 0.680 1
ATOM 8 O OE1 . GLU 879 879 ? A 37.275 24.926 32.647 1 1 A GLU 0.680 1
ATOM 9 O OE2 . GLU 879 879 ? A 37.737 26.836 31.608 1 1 A GLU 0.680 1
ATOM 10 N N . THR 880 880 ? A 39.727 23.504 37.059 1 1 A THR 0.770 1
ATOM 11 C CA . THR 880 880 ? A 39.617 22.691 38.270 1 1 A THR 0.770 1
ATOM 12 C C . THR 880 880 ? A 40.664 22.968 39.338 1 1 A THR 0.770 1
ATOM 13 O O . THR 880 880 ? A 40.340 23.140 40.507 1 1 A THR 0.770 1
ATOM 14 C CB . THR 880 880 ? A 39.727 21.240 37.862 1 1 A THR 0.770 1
ATOM 15 O OG1 . THR 880 880 ? A 38.725 20.969 36.897 1 1 A THR 0.770 1
ATOM 16 C CG2 . THR 880 880 ? A 39.519 20.288 39.038 1 1 A THR 0.770 1
ATOM 17 N N . MET 881 881 ? A 41.954 23.105 38.946 1 1 A MET 0.800 1
ATOM 18 C CA . MET 881 881 ? A 43.019 23.560 39.828 1 1 A MET 0.800 1
ATOM 19 C C . MET 881 881 ? A 42.759 24.945 40.427 1 1 A MET 0.800 1
ATOM 20 O O . MET 881 881 ? A 42.959 25.149 41.611 1 1 A MET 0.800 1
ATOM 21 C CB . MET 881 881 ? A 44.370 23.612 39.065 1 1 A MET 0.800 1
ATOM 22 C CG . MET 881 881 ? A 44.977 22.227 38.746 1 1 A MET 0.800 1
ATOM 23 S SD . MET 881 881 ? A 46.278 22.195 37.477 1 1 A MET 0.800 1
ATOM 24 C CE . MET 881 881 ? A 47.606 22.861 38.517 1 1 A MET 0.800 1
ATOM 25 N N . SER 882 882 ? A 42.262 25.917 39.616 1 1 A SER 0.850 1
ATOM 26 C CA . SER 882 882 ? A 41.968 27.283 40.058 1 1 A SER 0.850 1
ATOM 27 C C . SER 882 882 ? A 40.864 27.357 41.097 1 1 A SER 0.850 1
ATOM 28 O O . SER 882 882 ? A 40.933 28.151 42.019 1 1 A SER 0.850 1
ATOM 29 C CB . SER 882 882 ? A 41.718 28.318 38.895 1 1 A SER 0.850 1
ATOM 30 O OG . SER 882 882 ? A 40.379 28.368 38.356 1 1 A SER 0.850 1
ATOM 31 N N . VAL 883 883 ? A 39.802 26.534 40.966 1 1 A VAL 0.880 1
ATOM 32 C CA . VAL 883 883 ? A 38.760 26.412 41.978 1 1 A VAL 0.880 1
ATOM 33 C C . VAL 883 883 ? A 39.227 25.719 43.254 1 1 A VAL 0.880 1
ATOM 34 O O . VAL 883 883 ? A 38.940 26.154 44.363 1 1 A VAL 0.880 1
ATOM 35 C CB . VAL 883 883 ? A 37.561 25.656 41.409 1 1 A VAL 0.880 1
ATOM 36 C CG1 . VAL 883 883 ? A 36.467 25.417 42.475 1 1 A VAL 0.880 1
ATOM 37 C CG2 . VAL 883 883 ? A 36.981 26.469 40.234 1 1 A VAL 0.880 1
ATOM 38 N N . LEU 884 884 ? A 39.954 24.587 43.124 1 1 A LEU 0.850 1
ATOM 39 C CA . LEU 884 884 ? A 40.315 23.788 44.280 1 1 A LEU 0.850 1
ATOM 40 C C . LEU 884 884 ? A 41.543 24.239 45.039 1 1 A LEU 0.850 1
ATOM 41 O O . LEU 884 884 ? A 41.663 23.912 46.212 1 1 A LEU 0.850 1
ATOM 42 C CB . LEU 884 884 ? A 40.509 22.311 43.901 1 1 A LEU 0.850 1
ATOM 43 C CG . LEU 884 884 ? A 39.207 21.614 43.483 1 1 A LEU 0.850 1
ATOM 44 C CD1 . LEU 884 884 ? A 39.536 20.237 42.902 1 1 A LEU 0.850 1
ATOM 45 C CD2 . LEU 884 884 ? A 38.215 21.466 44.650 1 1 A LEU 0.850 1
ATOM 46 N N . GLN 885 885 ? A 42.461 25.028 44.451 1 1 A GLN 0.780 1
ATOM 47 C CA . GLN 885 885 ? A 43.569 25.630 45.187 1 1 A GLN 0.780 1
ATOM 48 C C . GLN 885 885 ? A 43.106 26.624 46.255 1 1 A GLN 0.780 1
ATOM 49 O O . GLN 885 885 ? A 43.743 26.755 47.299 1 1 A GLN 0.780 1
ATOM 50 C CB . GLN 885 885 ? A 44.622 26.252 44.226 1 1 A GLN 0.780 1
ATOM 51 C CG . GLN 885 885 ? A 45.552 25.202 43.563 1 1 A GLN 0.780 1
ATOM 52 C CD . GLN 885 885 ? A 46.483 25.814 42.516 1 1 A GLN 0.780 1
ATOM 53 O OE1 . GLN 885 885 ? A 46.490 27.012 42.228 1 1 A GLN 0.780 1
ATOM 54 N NE2 . GLN 885 885 ? A 47.319 24.950 41.884 1 1 A GLN 0.780 1
ATOM 55 N N . ASP 886 886 ? A 41.948 27.285 46.051 1 1 A ASP 0.750 1
ATOM 56 C CA . ASP 886 886 ? A 41.357 28.188 47.017 1 1 A ASP 0.750 1
ATOM 57 C C . ASP 886 886 ? A 40.483 27.449 48.056 1 1 A ASP 0.750 1
ATOM 58 O O . ASP 886 886 ? A 40.043 28.026 49.053 1 1 A ASP 0.750 1
ATOM 59 C CB . ASP 886 886 ? A 40.484 29.232 46.259 1 1 A ASP 0.750 1
ATOM 60 C CG . ASP 886 886 ? A 41.292 30.256 45.463 1 1 A ASP 0.750 1
ATOM 61 O OD1 . ASP 886 886 ? A 42.502 30.433 45.741 1 1 A ASP 0.750 1
ATOM 62 O OD2 . ASP 886 886 ? A 40.665 30.911 44.585 1 1 A ASP 0.750 1
ATOM 63 N N . ALA 887 887 ? A 40.191 26.137 47.881 1 1 A ALA 0.840 1
ATOM 64 C CA . ALA 887 887 ? A 39.314 25.412 48.790 1 1 A ALA 0.840 1
ATOM 65 C C . ALA 887 887 ? A 40.043 24.899 50.056 1 1 A ALA 0.840 1
ATOM 66 O O . ALA 887 887 ? A 41.214 24.528 49.970 1 1 A ALA 0.840 1
ATOM 67 C CB . ALA 887 887 ? A 38.610 24.237 48.078 1 1 A ALA 0.840 1
ATOM 68 N N . PRO 888 888 ? A 39.452 24.811 51.258 1 1 A PRO 0.720 1
ATOM 69 C CA . PRO 888 888 ? A 40.027 24.093 52.406 1 1 A PRO 0.720 1
ATOM 70 C C . PRO 888 888 ? A 40.432 22.651 52.104 1 1 A PRO 0.720 1
ATOM 71 O O . PRO 888 888 ? A 39.617 21.897 51.589 1 1 A PRO 0.720 1
ATOM 72 C CB . PRO 888 888 ? A 38.939 24.156 53.499 1 1 A PRO 0.720 1
ATOM 73 C CG . PRO 888 888 ? A 38.010 25.294 53.053 1 1 A PRO 0.720 1
ATOM 74 C CD . PRO 888 888 ? A 38.091 25.244 51.528 1 1 A PRO 0.720 1
ATOM 75 N N . ALA 889 889 ? A 41.704 22.273 52.397 1 1 A ALA 0.760 1
ATOM 76 C CA . ALA 889 889 ? A 42.311 20.976 52.086 1 1 A ALA 0.760 1
ATOM 77 C C . ALA 889 889 ? A 42.330 20.612 50.599 1 1 A ALA 0.760 1
ATOM 78 O O . ALA 889 889 ? A 42.574 19.468 50.216 1 1 A ALA 0.760 1
ATOM 79 C CB . ALA 889 889 ? A 41.726 19.834 52.949 1 1 A ALA 0.760 1
ATOM 80 N N . CYS 890 890 ? A 42.107 21.617 49.729 1 1 A CYS 0.750 1
ATOM 81 C CA . CYS 890 890 ? A 42.052 21.506 48.292 1 1 A CYS 0.750 1
ATOM 82 C C . CYS 890 890 ? A 40.998 20.523 47.786 1 1 A CYS 0.750 1
ATOM 83 O O . CYS 890 890 ? A 41.173 19.801 46.802 1 1 A CYS 0.750 1
ATOM 84 C CB . CYS 890 890 ? A 43.469 21.308 47.694 1 1 A CYS 0.750 1
ATOM 85 S SG . CYS 890 890 ? A 44.612 22.681 48.057 1 1 A CYS 0.750 1
ATOM 86 N N . CYS 891 891 ? A 39.826 20.528 48.457 1 1 A CYS 0.840 1
ATOM 87 C CA . CYS 891 891 ? A 38.731 19.649 48.144 1 1 A CYS 0.840 1
ATOM 88 C C . CYS 891 891 ? A 37.412 20.351 48.334 1 1 A CYS 0.840 1
ATOM 89 O O . CYS 891 891 ? A 37.277 21.303 49.101 1 1 A CYS 0.840 1
ATOM 90 C CB . CYS 891 891 ? A 38.782 18.305 48.938 1 1 A CYS 0.840 1
ATOM 91 S SG . CYS 891 891 ? A 38.625 18.425 50.752 1 1 A CYS 0.840 1
ATOM 92 N N . LEU 892 892 ? A 36.388 19.900 47.594 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 93 C CA . LEU 892 892 ? A 35.058 20.443 47.695 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 94 C C . LEU 892 892 ? A 34.082 19.294 47.557 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 95 O O . LEU 892 892 ? A 34.386 18.329 46.851 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 96 C CB . LEU 892 892 ? A 34.769 21.492 46.584 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 97 C CG . LEU 892 892 ? A 35.422 22.869 46.810 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 98 C CD1 . LEU 892 892 ? A 35.147 23.781 45.610 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 99 C CD2 . LEU 892 892 ? A 34.952 23.547 48.108 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 100 N N . PRO 893 893 ? A 32.902 19.305 48.188 1 1 A PRO 0.900 1
ATOM 101 C CA . PRO 893 893 ? A 31.776 18.508 47.722 1 1 A PRO 0.900 1
ATOM 102 C C . PRO 893 893 ? A 31.500 18.695 46.238 1 1 A PRO 0.900 1
ATOM 103 O O . PRO 893 893 ? A 31.600 19.817 45.740 1 1 A PRO 0.900 1
ATOM 104 C CB . PRO 893 893 ? A 30.566 18.948 48.571 1 1 A PRO 0.900 1
ATOM 105 C CG . PRO 893 893 ? A 31.069 20.032 49.534 1 1 A PRO 0.900 1
ATOM 106 C CD . PRO 893 893 ? A 32.447 20.425 49.005 1 1 A PRO 0.900 1
ATOM 107 N N . LEU 894 894 ? A 31.118 17.626 45.522 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 108 C CA . LEU 894 894 ? A 30.848 17.687 44.096 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 109 C C . LEU 894 894 ? A 29.750 18.664 43.694 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 110 O O . LEU 894 894 ? A 29.892 19.378 42.708 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 111 C CB . LEU 894 894 ? A 30.502 16.294 43.534 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 112 C CG . LEU 894 894 ? A 30.158 16.276 42.026 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 113 C CD1 . LEU 894 894 ? A 31.323 16.758 41.146 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 114 C CD2 . LEU 894 894 ? A 29.697 14.882 41.607 1 1 A LEU 0.880 1
ATOM 115 N N . PHE 895 895 ? A 28.640 18.754 44.468 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 116 C CA . PHE 895 895 ? A 27.562 19.699 44.191 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 117 C C . PHE 895 895 ? A 28.081 21.142 44.168 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 118 O O . PHE 895 895 ? A 27.817 21.918 43.262 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 119 C CB . PHE 895 895 ? A 26.343 19.492 45.167 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 120 C CG . PHE 895 895 ? A 26.463 20.158 46.526 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 121 C CD1 . PHE 895 895 ? A 27.050 19.521 47.633 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 122 C CD2 . PHE 895 895 ? A 26.002 21.476 46.685 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 123 C CE1 . PHE 895 895 ? A 27.210 20.199 48.852 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 124 C CE2 . PHE 895 895 ? A 26.174 22.159 47.893 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 125 C CZ . PHE 895 895 ? A 26.781 21.523 48.979 1 1 A PHE 0.810 1
ATOM 126 N N . LYS 896 896 ? A 28.935 21.477 45.156 1 1 A LYS 0.850 1
ATOM 127 C CA . LYS 896 896 ? A 29.497 22.790 45.324 1 1 A LYS 0.850 1
ATOM 128 C C . LYS 896 896 ? A 30.533 23.157 44.279 1 1 A LYS 0.850 1
ATOM 129 O O . LYS 896 896 ? A 30.600 24.293 43.819 1 1 A LYS 0.850 1
ATOM 130 C CB . LYS 896 896 ? A 30.116 22.868 46.723 1 1 A LYS 0.850 1
ATOM 131 C CG . LYS 896 896 ? A 30.535 24.286 47.115 1 1 A LYS 0.850 1
ATOM 132 C CD . LYS 896 896 ? A 30.553 24.423 48.638 1 1 A LYS 0.850 1
ATOM 133 C CE . LYS 896 896 ? A 31.336 25.629 49.148 1 1 A LYS 0.850 1
ATOM 134 N NZ . LYS 896 896 ? A 31.376 25.577 50.626 1 1 A LYS 0.850 1
ATOM 135 N N . PHE 897 897 ? A 31.370 22.174 43.874 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 136 C CA . PHE 897 897 ? A 32.316 22.301 42.781 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 137 C C . PHE 897 897 ? A 31.593 22.630 41.477 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 138 O O . PHE 897 897 ? A 31.991 23.551 40.768 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 139 C CB . PHE 897 897 ? A 33.153 20.993 42.644 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 140 C CG . PHE 897 897 ? A 34.165 21.099 41.527 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 141 C CD1 . PHE 897 897 ? A 35.424 21.678 41.742 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 142 C CD2 . PHE 897 897 ? A 33.816 20.718 40.220 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 143 C CE1 . PHE 897 897 ? A 36.310 21.877 40.675 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 144 C CE2 . PHE 897 897 ? A 34.702 20.912 39.156 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 145 C CZ . PHE 897 897 ? A 35.948 21.497 39.380 1 1 A PHE 0.890 1
ATOM 146 N N . THR 898 898 ? A 30.486 21.912 41.172 1 1 A THR 0.890 1
ATOM 147 C CA . THR 898 898 ? A 29.649 22.164 39.998 1 1 A THR 0.890 1
ATOM 148 C C . THR 898 898 ? A 29.066 23.563 40.003 1 1 A THR 0.890 1
ATOM 149 O O . THR 898 898 ? A 29.269 24.315 39.050 1 1 A THR 0.890 1
ATOM 150 C CB . THR 898 898 ? A 28.507 21.161 39.877 1 1 A THR 0.890 1
ATOM 151 O OG1 . THR 898 898 ? A 29.015 19.846 39.693 1 1 A THR 0.890 1
ATOM 152 C CG2 . THR 898 898 ? A 27.598 21.414 38.666 1 1 A THR 0.890 1
ATOM 153 N N . ASP 899 899 ? A 28.429 23.990 41.116 1 1 A ASP 0.850 1
ATOM 154 C CA . ASP 899 899 ? A 27.870 25.322 41.268 1 1 A ASP 0.850 1
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ATOM 339 C CA . VAL 921 921 ? A 41.931 15.170 40.772 1 1 A VAL 0.870 1
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ATOM 347 C C . ALA 922 922 ? A 39.205 12.527 43.111 1 1 A ALA 0.900 1
ATOM 348 O O . ALA 922 922 ? A 39.011 13.521 43.809 1 1 A ALA 0.900 1
ATOM 349 C CB . ALA 922 922 ? A 41.351 11.381 43.696 1 1 A ALA 0.900 1
ATOM 350 N N . ILE 923 923 ? A 38.203 11.716 42.743 1 1 A ILE 0.870 1
ATOM 351 C CA . ILE 923 923 ? A 36.837 11.918 43.175 1 1 A ILE 0.870 1
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ATOM 353 O O . ILE 923 923 ? A 36.670 9.600 43.743 1 1 A ILE 0.870 1
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ATOM 398 N ND2 . ASN 928 928 ? A 26.090 12.063 55.068 1 1 A ASN 0.670 1
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ATOM 410 N NE . ARG 930 930 ? A 29.426 11.516 42.553 1 1 A ARG 0.790 1
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ATOM 414 N N . LEU 931 931 ? A 33.281 13.758 46.899 1 1 A LEU 0.880 1
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ATOM 423 C CA . VAL 932 932 ? A 36.424 16.320 44.511 1 1 A VAL 0.910 1
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ATOM 426 C CB . VAL 932 932 ? A 35.919 17.360 43.511 1 1 A VAL 0.910 1
ATOM 427 C CG1 . VAL 932 932 ? A 36.901 17.508 42.328 1 1 A VAL 0.910 1
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ATOM 429 N N . CYS 933 933 ? A 38.818 16.087 44.978 1 1 A CYS 0.880 1
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ATOM 432 O O . CYS 933 933 ? A 41.502 15.729 43.964 1 1 A CYS 0.880 1
ATOM 433 C CB . CYS 933 933 ? A 40.403 15.174 46.621 1 1 A CYS 0.880 1
ATOM 434 S SG . CYS 933 933 ? A 39.062 14.718 47.749 1 1 A CYS 0.880 1
ATOM 435 N N . LEU 934 934 ? A 41.831 17.749 44.884 1 1 A LEU 0.840 1
ATOM 436 C CA . LEU 934 934 ? A 43.006 18.060 44.110 1 1 A LEU 0.840 1
ATOM 437 C C . LEU 934 934 ? A 44.186 17.203 44.546 1 1 A LEU 0.840 1
ATOM 438 O O . LEU 934 934 ? A 44.465 17.088 45.742 1 1 A LEU 0.840 1
ATOM 439 C CB . LEU 934 934 ? A 43.308 19.557 44.316 1 1 A LEU 0.840 1
ATOM 440 C CG . LEU 934 934 ? A 44.237 20.223 43.294 1 1 A LEU 0.840 1
ATOM 441 C CD1 . LEU 934 934 ? A 43.715 20.102 41.856 1 1 A LEU 0.840 1
ATOM 442 C CD2 . LEU 934 934 ? A 44.488 21.696 43.646 1 1 A LEU 0.840 1
ATOM 443 N N . LEU 935 935 ? A 44.891 16.530 43.615 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 444 C CA . LEU 935 935 ? A 46.014 15.675 43.971 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 445 C C . LEU 935 935 ? A 47.174 16.444 44.621 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 446 O O . LEU 935 935 ? A 47.335 17.621 44.327 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 447 C CB . LEU 935 935 ? A 46.508 14.828 42.777 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 448 C CG . LEU 935 935 ? A 45.458 13.834 42.235 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 449 C CD1 . LEU 935 935 ? A 46.023 13.089 41.020 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 450 C CD2 . LEU 935 935 ? A 44.950 12.818 43.276 1 1 A LEU 0.800 1
ATOM 451 N N . PRO 936 936 ? A 48.003 15.886 45.514 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 452 C CA . PRO 936 936 ? A 48.989 16.663 46.275 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 453 C C . PRO 936 936 ? A 49.999 17.465 45.463 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 454 O O . PRO 936 936 ? A 50.467 18.493 45.931 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 455 C CB . PRO 936 936 ? A 49.724 15.595 47.093 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 456 C CG . PRO 936 936 ? A 48.658 14.533 47.370 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 457 C CD . PRO 936 936 ? A 47.794 14.559 46.107 1 1 A PRO 0.760 1
ATOM 458 N N . SER 937 937 ? A 50.365 16.976 44.260 1 1 A SER 0.730 1
ATOM 459 C CA . SER 937 937 ? A 51.327 17.564 43.341 1 1 A SER 0.730 1
ATOM 460 C C . SER 937 937 ? A 50.801 18.788 42.597 1 1 A SER 0.730 1
ATOM 461 O O . SER 937 937 ? A 51.582 19.515 41.993 1 1 A SER 0.730 1
ATOM 462 C CB . SER 937 937 ? A 51.779 16.517 42.279 1 1 A SER 0.730 1
ATOM 463 O OG . SER 937 937 ? A 50.659 15.909 41.626 1 1 A SER 0.730 1
ATOM 464 N N . SER 938 938 ? A 49.470 19.032 42.607 1 1 A SER 0.620 1
ATOM 465 C CA . SER 938 938 ? A 48.827 20.118 41.885 1 1 A SER 0.620 1
ATOM 466 C C . SER 938 938 ? A 48.234 21.175 42.812 1 1 A SER 0.620 1
ATOM 467 O O . SER 938 938 ? A 47.539 22.079 42.346 1 1 A SER 0.620 1
ATOM 468 C CB . SER 938 938 ? A 47.720 19.568 40.933 1 1 A SER 0.620 1
ATOM 469 O OG . SER 938 938 ? A 46.790 18.731 41.615 1 1 A SER 0.620 1
ATOM 470 N N . GLN 939 939 ? A 48.521 21.091 44.131 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 471 C CA . GLN 939 939 ? A 48.134 22.064 45.143 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 472 C C . GLN 939 939 ? A 49.111 23.267 45.242 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 473 O O . GLN 939 939 ? A 50.131 23.299 44.504 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 474 C CB . GLN 939 939 ? A 48.030 21.377 46.536 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 475 C CG . GLN 939 939 ? A 47.001 20.222 46.529 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 476 C CD . GLN 939 939 ? A 46.801 19.525 47.876 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 477 O OE1 . GLN 939 939 ? A 47.263 19.934 48.936 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 478 N NE2 . GLN 939 939 ? A 46.033 18.405 47.845 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 479 O OXT . GLN 939 939 ? A 48.818 24.181 46.060 1 1 A GLN 0.560 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.795
2 1 3 0.048
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 879 GLU 1 0.680
2 1 A 880 THR 1 0.770
3 1 A 881 MET 1 0.800
4 1 A 882 SER 1 0.850
5 1 A 883 VAL 1 0.880
6 1 A 884 LEU 1 0.850
7 1 A 885 GLN 1 0.780
8 1 A 886 ASP 1 0.750
9 1 A 887 ALA 1 0.840
10 1 A 888 PRO 1 0.720
11 1 A 889 ALA 1 0.760
12 1 A 890 CYS 1 0.750
13 1 A 891 CYS 1 0.840
14 1 A 892 LEU 1 0.880
15 1 A 893 PRO 1 0.900
16 1 A 894 LEU 1 0.880
17 1 A 895 PHE 1 0.810
18 1 A 896 LYS 1 0.850
19 1 A 897 PHE 1 0.890
20 1 A 898 THR 1 0.890
21 1 A 899 ASP 1 0.850
22 1 A 900 ILE 1 0.850
23 1 A 901 TYR 1 0.850
24 1 A 902 GLU 1 0.820
25 1 A 903 LYS 1 0.790
26 1 A 904 LYS 1 0.800
27 1 A 905 PHE 1 0.740
28 1 A 906 GLY 1 0.770
29 1 A 907 HIS 1 0.730
30 1 A 908 LYS 1 0.760
31 1 A 909 LEU 1 0.800
32 1 A 910 ASN 1 0.810
33 1 A 911 VAL 1 0.850
34 1 A 912 SER 1 0.790
35 1 A 913 ASP 1 0.780
36 1 A 914 LEU 1 0.830
37 1 A 915 TYR 1 0.750
38 1 A 916 LYS 1 0.710
39 1 A 917 LEU 1 0.760
40 1 A 918 THR 1 0.750
41 1 A 919 ASP 1 0.740
42 1 A 920 THR 1 0.820
43 1 A 921 VAL 1 0.870
44 1 A 922 ALA 1 0.900
45 1 A 923 ILE 1 0.870
46 1 A 924 ARG 1 0.820
47 1 A 925 GLU 1 0.780
48 1 A 926 GLN 1 0.710
49 1 A 927 GLY 1 0.620
50 1 A 928 ASN 1 0.670
51 1 A 929 GLY 1 0.760
52 1 A 930 ARG 1 0.790
53 1 A 931 LEU 1 0.880
54 1 A 932 VAL 1 0.910
55 1 A 933 CYS 1 0.880
56 1 A 934 LEU 1 0.840
57 1 A 935 LEU 1 0.800
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59 1 A 937 SER 1 0.730
60 1 A 938 SER 1 0.620
61 1 A 939 GLN 1 0.560
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
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the corresponding papers mentioned under JRNL.
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you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
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