data_SMR-4b7ac66d32329890d261bb0ac640152b_2 _entry.id SMR-4b7ac66d32329890d261bb0ac640152b_2 _struct.entry_id SMR-4b7ac66d32329890d261bb0ac640152b_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y4F3 (isoform 3)/ MARF1_HUMAN, Meiosis regulator and mRNA stability factor 1 Estimated model accuracy of this model is 0.031, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y4F3 (isoform 3)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 224435.809 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MARF1_HUMAN Q9Y4F3 1 ;MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHA GSKLFPAVPLPDIRSLQQPKIQLSSVPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGGGGSGGTSSLIHPGALLDSQS TRTITCQVGSGFAFQSASSLQNASARNNLAGIASDFPSMCLESNLSSCKHLPCCGKLHFQSCHGNVHKLH QFPSLQGCTSAGYFPCSDFTSGAPGHLEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLKGSLYCEDCLNKPAR NSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLATSLGKAASKFGSPEVAVAGQVLENL PPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINAT AKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELI RFEEFISDLPPRLPLKMPCHTLLYVYNLPANKDGKSVSNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSA ERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCETKSSNAIADKVKSPKKLKNPKLCLIKDASEQSSSAKATPG KGSQANSGSATKNTNVKSLQELCRMESKTGHRNSEHQQGHLRLVVPTHGNSSAAVSTPKNSGVAEPVYKT SQKKENLSARSVTSSPVEKKDKEETVFQVSYPSAFSKLVASRQVSPLLASQSWSSSRSMSPNLLNRASPL AFNIANSSSEADCPDPFANGADVQVSNIDYRLSRKELQQLLQEAFARHGKVKSVELSPHTDYQLKAVVQM ENLQDAIGAVNSLHRYKIGSKKILVSLATGAASKSLSLLSAETMSVLQDAPACCLPLFKFTDIYEKKFGH KLNVSDLYKLTDTVAIREQGNGRLVCLLPSSQARQSPLGSSQSHDGSSTNCSPIIFEELEYHEPVCRQHC SNKDFSEHEFDPDSYKIPFVILSLKTFAPQVHSLLQTHEGTVPLLSFPDCYIAEFGDLEVVQENQGGVPL EHFITCVPGVNIATAQNGIKVVKWIHNKPPPPNTDPWLLRSKSPVGNPQLIQFSREVIDLLKSQPSCVIP ISHFIPSYHHHFAKQCRVSDYGYSKLIELLEAVPHVLQILGMGSKRLLTLTHRAQVKRFTQDLLKLLKSQ ASKQVIVREFSQAYHWCFSKDWDVTEYGVCELIDIVSEIPDTTICLSQQDNEMVICIPKRERTQDEIERT KQFSKDVVDLLRHQPHFRMPFNKFIPSYHHHFGRQCKLAYYGFTKLLELFEAIPDTLQVLECGEEKILTL TEVERFKALAAQFVKLLRSQKDNCLMMTDLLTEYAKTFGYTFRLQDYDVSSISALTQKLCHVVKVADIES GRQIQLINRKSLRSLTAQLLVLLMSWEGTTHLSVEELKRHYESTHNTPLNPCEYGFMTLTELLKSLPYLV EVFTNDKMEECVKLTSLYLFAKNVRSLLHTYHYQQIFLHEFSMAYTKYVGETLQPKTYGHSSVEELLGAI PQVVWIKGHGHKRIVVLKNDMKSRLSSLSLSPANHENQPSEGERILEVPESHTASELKLGADGSGPSHTE QELLRLTDDSPVDLLCAPVPSCLPSPQLRPDPVILQSADLIQFEERPQEPSEIMILNQEEKMEIPIPGKS KTLTSDSSSSCISAAVPVPPCPSSETSESLLSKDPVESPAKKQPKNRVKLAANFSLAPITKL ; 'Meiosis regulator and mRNA stability factor 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1742 1 1742 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MARF1_HUMAN Q9Y4F3 Q9Y4F3-3 1 1742 9606 'Homo sapiens (Human)' 2012-05-16 68D45929E9D4BB88 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHA GSKLFPAVPLPDIRSLQQPKIQLSSVPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGGGGSGGTSSLIHPGALLDSQS TRTITCQVGSGFAFQSASSLQNASARNNLAGIASDFPSMCLESNLSSCKHLPCCGKLHFQSCHGNVHKLH QFPSLQGCTSAGYFPCSDFTSGAPGHLEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLKGSLYCEDCLNKPAR NSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLATSLGKAASKFGSPEVAVAGQVLENL PPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINAT AKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELI RFEEFISDLPPRLPLKMPCHTLLYVYNLPANKDGKSVSNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSA ERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCETKSSNAIADKVKSPKKLKNPKLCLIKDASEQSSSAKATPG 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_entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 MET . 1 3 GLU . 1 4 GLY . 1 5 ASN . 1 6 GLY . 1 7 THR . 1 8 GLU . 1 9 ASN . 1 10 SER . 1 11 CYS . 1 12 SER . 1 13 ARG . 1 14 THR . 1 15 ARG . 1 16 GLY . 1 17 TRP . 1 18 LEU . 1 19 GLN . 1 20 GLN . 1 21 ASP . 1 22 ASN . 1 23 ASP . 1 24 ALA . 1 25 LYS . 1 26 PRO . 1 27 TRP . 1 28 LEU . 1 29 TRP . 1 30 LYS . 1 31 PHE . 1 32 SER . 1 33 ASN . 1 34 CYS . 1 35 PHE . 1 36 SER . 1 37 ARG . 1 38 PRO . 1 39 GLU . 1 40 GLN . 1 41 THR . 1 42 LEU . 1 43 PRO . 1 44 HIS . 1 45 SER . 1 46 PRO . 1 47 GLN . 1 48 THR . 1 49 LYS . 1 50 GLU . 1 51 TYR . 1 52 MET . 1 53 GLU . 1 54 ASN . 1 55 LYS . 1 56 LYS . 1 57 VAL . 1 58 ALA . 1 59 VAL . 1 60 GLU . 1 61 LEU . 1 62 LYS . 1 63 ASP . 1 64 VAL . 1 65 PRO . 1 66 SER . 1 67 PRO . 1 68 LEU . 1 69 HIS . 1 70 ALA . 1 71 GLY . 1 72 SER . 1 73 LYS . 1 74 LEU . 1 75 PHE . 1 76 PRO . 1 77 ALA . 1 78 VAL . 1 79 PRO . 1 80 LEU . 1 81 PRO . 1 82 ASP . 1 83 ILE . 1 84 ARG . 1 85 SER . 1 86 LEU . 1 87 GLN . 1 88 GLN . 1 89 PRO . 1 90 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'KIAA0430 protein {PDB ID=2dgx, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2dgx.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2dgx, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGNGADVQVSNIDYRLSRKELQQLLQEAFARHGKVKSVELSPHTDYQLKAVVQMENLQDAIGAVN SLHRYKIGSKKILVSLATGASGPSSG ; ;GSSGSSGNGADVQVSNIDYRLSRKELQQLLQEAFARHGKVKSVELSPHTDYQLKAVVQMENLQDAIGAVN SLHRYKIGSKKILVSLATGASGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 90 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2dgx 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1742 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1742 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.00027 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMEGNGTENSCSRTRGWLQQDNDAKPWLWKFSNCFSRPEQTLPHSPQTKEYMENKKVAVELKDVPSPLHAGSKLFPAVPLPDIRSLQQPKIQLSSVPKVSCCAHCPNEPSTSPMRFGGGGGGSGGTSSLIHPGALLDSQSTRTITCQVGSGFAFQSASSLQNASARNNLAGIASDFPSMCLESNLSSCKHLPCCGKLHFQSCHGNVHKLHQFPSLQGCTSAGYFPCSDFTSGAPGHLEEHISQSELTPHLCTNSLHLNVVPPVCLKGSLYCEDCLNKPARNSIIDAAKVWPNIPPPNTQPAPLAVPLCNGCGTKGTGKETTLLLATSLGKAASKFGSPEVAVAGQVLENLPPIGVFWDIENCSVPSGRSATAVVQRIREKFFKGHREAEFICVCDISKENKEVIQELNNCQVTVAHINATAKNAADDKLRQSLRRFANTHTAPATVVLVSTDVNFALELSDLRHRHGFHIILVHKNQASEALLHHANELIRFEEFISDLPPRLPLKMPCHTLLYVYNLPANKDGKSVSNRLRRLSDNCGGKVLSITGCSAILRFINQDSAERAQKRMENEDVFGNRIIVSFTPKNRELCETKSSNAIADKVKSPKKLKNPKLCLIKDASEQSSSAKATPGKGSQANSGSATKNTNVKSLQELCRMESKTGHRNSEHQQGHLRLVVPTHGNSSAAVSTPKNSGVAEPVYKTSQKKENLSARSVTSSPVEKKDKEETVFQVSYPSAFSKLVASRQVSPLLASQSWSSSRSMSPNLLNRASPLAFNIANSSSEADCPDPFANGADVQVSNIDYRLSRKELQQLLQEAFARHGKVKSVELSPHTDYQLKAVVQMENLQDAIGAVNSLHRYKIGSKKILVSLATGAASKSLSLLSAETMSVLQDAPACCLPLFKFTDIYEKKFGHKLNVSDLYKLTDTVAIREQGNGRLVCLLPSSQARQSPLGSSQSHDGSSTNCSPIIFEELEYHEPVCRQHCSNKDFSEHEFDPDSYKIPFVILSLKTFAPQVHSLLQTHEGTVPLLSFPDCYIAEFGDLEVVQENQGGVPLEHFITCVPGVNIATAQNGIKVVKWIHNKPPPPNTDPWLLRSKSPVGNPQLIQFSREVIDLLKSQPSCVIPISHFIPSYHHHFAKQCRVSDYGYSKLIELLEAVPHVLQILGMGSKRLLTLTHRAQVKRFTQDLLKLLKSQASKQVIVREFSQAYHWCFSKDWDVTEYGVCELIDIVSEIPDTTICLSQQDNEMVICIPKRERTQDEIERTKQFSKDVVDLLRHQPHFRMPFNKFIPSYHHHFGRQCKLAYYGFTKLLELFEAIPDTLQVLECGEEKILTLTEVERFKALAAQFVKLLRSQKDNCLMMTDLLTEYAKTFGYTFRLQDYDVSSISALTQKLCHVVKVADIESGRQIQLINRKSLRSLTAQLLVLLMSWEGTTHLSVEELKRHYESTHNTPLNPCEYGFMTLTELLKSLPYLVEVFTNDKMEECVKLTSLYLFAKNVRSLLHTYHYQQIFLHEFSMAYTKYVGETLQPKTYGHSSVEELLGAIPQVVWIKGHGHKRIVVLKNDMKSRLSSLSLSPANHENQPSEGERILEVPESHTASELKLGADGSGPSHTEQELLRLTDDSPVDLLCAPVPSCLPSPQLRPDPVILQSADLIQFEERPQEPSEIMILNQEEKMEIPIPGKSKTLTSDSSSSCISAAVPVPPCPSSETSESLLSKDPVESPAKKQPKNRVKLAANFSLAPITKL 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NGADVQVSNIDYRLSRKELQQLLQEAFARHGKVKSVELSPHTDYQLKAVVQMENLQDAIGAVNSLHRYKIGSKKILVSLATGA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2dgx.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASN 789 789 ? A -11.310 15.396 9.479 1 1 A ASN 0.400 1 ATOM 2 C CA . ASN 789 789 ? A -10.087 15.813 8.685 1 1 A ASN 0.400 1 ATOM 3 C C . ASN 789 789 ? A -9.166 14.608 8.453 1 1 A ASN 0.400 1 ATOM 4 O O . ASN 789 789 ? A -9.347 13.601 9.125 1 1 A ASN 0.400 1 ATOM 5 C CB . ASN 789 789 ? A -9.319 16.993 9.390 1 1 A ASN 0.400 1 ATOM 6 C CG . ASN 789 789 ? A -8.792 16.568 10.765 1 1 A ASN 0.400 1 ATOM 7 O OD1 . ASN 789 789 ? A -9.558 15.942 11.495 1 1 A ASN 0.400 1 ATOM 8 N ND2 . ASN 789 789 ? A -7.522 16.855 11.120 1 1 A ASN 0.400 1 ATOM 9 N N . GLY 790 790 ? A -8.166 14.677 7.539 1 1 A GLY 0.570 1 ATOM 10 C CA . GLY 790 790 ? A -7.246 13.568 7.264 1 1 A GLY 0.570 1 ATOM 11 C C . GLY 790 790 ? A -7.553 13.005 5.909 1 1 A GLY 0.570 1 ATOM 12 O O . GLY 790 790 ? A -8.449 13.494 5.226 1 1 A GLY 0.570 1 ATOM 13 N N . ALA 791 791 ? A -6.775 12.005 5.478 1 1 A ALA 0.780 1 ATOM 14 C CA . ALA 791 791 ? A -6.960 11.346 4.219 1 1 A ALA 0.780 1 ATOM 15 C C . ALA 791 791 ? A -6.679 9.876 4.400 1 1 A ALA 0.780 1 ATOM 16 O O . ALA 791 791 ? A -5.597 9.499 4.846 1 1 A ALA 0.780 1 ATOM 17 C CB . ALA 791 791 ? A -5.924 11.903 3.235 1 1 A ALA 0.780 1 ATOM 18 N N . ASP 792 792 ? A -7.638 9.027 4.024 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 19 C CA . ASP 792 792 ? A -7.577 7.606 4.210 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 20 C C . ASP 792 792 ? A -7.509 6.982 2.815 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 21 O O . ASP 792 792 ? A -8.383 7.175 1.967 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 22 C CB . ASP 792 792 ? A -8.830 7.109 5.001 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 23 C CG . ASP 792 792 ? A -9.317 8.062 6.099 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 24 O OD1 . ASP 792 792 ? A -9.877 9.132 5.739 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 25 O OD2 . ASP 792 792 ? A -9.193 7.712 7.300 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 26 N N . VAL 793 793 ? A -6.432 6.231 2.517 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 27 C CA . VAL 793 793 ? A -6.244 5.576 1.244 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 28 C C . VAL 793 793 ? A -6.460 4.074 1.410 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 29 O O . VAL 793 793 ? A -5.667 3.363 2.018 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 30 C CB . VAL 793 793 ? A -4.842 5.823 0.702 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 31 C CG1 . VAL 793 793 ? A -4.746 5.141 -0.654 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 32 C CG2 . VAL 793 793 ? A -4.545 7.326 0.555 1 1 A VAL 0.820 1 ATOM 33 N N . GLN 794 794 ? A -7.559 3.540 0.848 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 34 C CA . GLN 794 794 ? A -7.861 2.126 0.793 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 35 C C . GLN 794 794 ? A -6.943 1.453 -0.212 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 36 O O . GLN 794 794 ? A -6.810 1.885 -1.355 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 37 C CB . GLN 794 794 ? A -9.353 1.929 0.420 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 38 C CG . GLN 794 794 ? A -10.324 2.205 1.595 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 39 C CD . GLN 794 794 ? A -10.521 0.952 2.450 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 40 O OE1 . GLN 794 794 ? A -9.711 0.030 2.459 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 41 N NE2 . GLN 794 794 ? A -11.654 0.897 3.193 1 1 A GLN 0.790 1 ATOM 42 N N . VAL 795 795 ? A -6.254 0.389 0.221 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 43 C CA . VAL 795 795 ? 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A -3.484 -6.610 -3.541 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 58 O O . ASN 797 797 ? A -2.554 -6.643 -4.348 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 59 C CB . ASN 797 797 ? A -5.153 -6.208 -5.484 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 60 C CG . ASN 797 797 ? A -4.946 -7.349 -6.480 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 61 O OD1 . ASN 797 797 ? A -5.879 -7.776 -7.157 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 62 N ND2 . ASN 797 797 ? A -3.699 -7.844 -6.607 1 1 A ASN 0.810 1 ATOM 63 N N . ILE 798 798 ? A -3.234 -6.649 -2.220 1 1 A ILE 0.830 1 ATOM 64 C CA . ILE 798 798 ? A -1.887 -6.614 -1.702 1 1 A ILE 0.830 1 ATOM 65 C C . ILE 798 798 ? A -1.324 -8.012 -1.769 1 1 A ILE 0.830 1 ATOM 66 O O . ILE 798 798 ? A -2.003 -9.005 -1.513 1 1 A ILE 0.830 1 ATOM 67 C CB . ILE 798 798 ? A -1.824 -6.015 -0.305 1 1 A ILE 0.830 1 ATOM 68 C CG1 . ILE 798 798 ? A -2.456 -4.615 -0.307 1 1 A ILE 0.830 1 ATOM 69 C CG2 . ILE 798 798 ? A -0.372 -5.910 0.201 1 1 A ILE 0.830 1 ATOM 70 C CD1 . ILE 798 798 ? A -2.824 -4.177 1.101 1 1 A ILE 0.830 1 ATOM 71 N N . ASP 799 799 ? 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A 7.806 4.260 1.013 1 1 A GLU 0.890 1 ATOM 198 C C . GLU 813 813 ? A 7.267 4.827 -0.285 1 1 A GLU 0.890 1 ATOM 199 O O . GLU 813 813 ? A 7.628 5.926 -0.693 1 1 A GLU 0.890 1 ATOM 200 C CB . GLU 813 813 ? A 8.856 3.198 0.673 1 1 A GLU 0.890 1 ATOM 201 C CG . GLU 813 813 ? A 9.889 2.964 1.788 1 1 A GLU 0.890 1 ATOM 202 C CD . GLU 813 813 ? A 11.012 2.128 1.192 1 1 A GLU 0.890 1 ATOM 203 O OE1 . GLU 813 813 ? A 10.759 0.931 0.902 1 1 A GLU 0.890 1 ATOM 204 O OE2 . GLU 813 813 ? A 12.105 2.706 0.962 1 1 A GLU 0.890 1 ATOM 205 N N . ALA 814 814 ? A 6.352 4.126 -0.959 1 1 A ALA 0.900 1 ATOM 206 C CA . ALA 814 814 ? A 5.754 4.578 -2.190 1 1 A ALA 0.900 1 ATOM 207 C C . ALA 814 814 ? A 4.830 5.788 -2.089 1 1 A ALA 0.900 1 ATOM 208 O O . ALA 814 814 ? A 4.870 6.671 -2.944 1 1 A ALA 0.900 1 ATOM 209 C CB . ALA 814 814 ? A 5.024 3.395 -2.811 1 1 A ALA 0.900 1 ATOM 210 N N . PHE 815 815 ? A 3.989 5.866 -1.043 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 211 C CA . PHE 815 815 ? A 3.156 7.008 -0.683 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 212 C C . PHE 815 815 ? A 3.975 8.232 -0.250 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 213 O O . PHE 815 815 ? A 3.655 9.372 -0.592 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 214 C CB . PHE 815 815 ? A 2.124 6.598 0.404 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 215 C CG . PHE 815 815 ? A 0.950 5.865 -0.180 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 216 C CD1 . PHE 815 815 ? A -0.109 6.588 -0.744 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 217 C CD2 . PHE 815 815 ? A 0.841 4.468 -0.122 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 218 C CE1 . PHE 815 815 ? A -1.213 5.932 -1.296 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 219 C CE2 . PHE 815 815 ? A -0.251 3.798 -0.675 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 220 C CZ . PHE 815 815 ? A -1.275 4.534 -1.268 1 1 A PHE 0.850 1 ATOM 221 N N . ALA 816 816 ? A 5.081 8.014 0.487 1 1 A ALA 0.830 1 ATOM 222 C CA . ALA 816 816 ? A 6.031 9.026 0.930 1 1 A ALA 0.830 1 ATOM 223 C C . ALA 816 816 ? A 6.807 9.724 -0.185 1 1 A ALA 0.830 1 ATOM 224 O O . ALA 816 816 ? A 7.256 10.857 -0.033 1 1 A ALA 0.830 1 ATOM 225 C CB . ALA 816 816 ? 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A 4.119 12.716 -2.392 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 240 O O . HIS 818 818 ? A 4.160 13.899 -2.726 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 241 C CB . HIS 818 818 ? A 2.950 10.960 -3.666 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 242 C CG . HIS 818 818 ? A 2.992 9.892 -4.705 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 243 N ND1 . HIS 818 818 ? A 3.448 10.200 -5.964 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 244 C CD2 . HIS 818 818 ? A 2.698 8.564 -4.618 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 245 C CE1 . HIS 818 818 ? A 3.444 9.061 -6.627 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 246 N NE2 . HIS 818 818 ? A 2.998 8.048 -5.857 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 247 N N . GLY 819 819 ? A 3.874 12.353 -1.118 1 1 A GLY 0.770 1 ATOM 248 C CA . GLY 819 819 ? A 3.537 13.341 -0.100 1 1 A GLY 0.770 1 ATOM 249 C C . GLY 819 819 ? A 4.035 12.954 1.256 1 1 A GLY 0.770 1 ATOM 250 O O . GLY 819 819 ? A 5.161 12.502 1.439 1 1 A GLY 0.770 1 ATOM 251 N N . LYS 820 820 ? A 3.198 13.108 2.294 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 252 C CA . LYS 820 820 ? A 3.561 12.638 3.614 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 253 C C . LYS 820 820 ? 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A 0.990 9.444 6.884 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 268 C CA . LYS 822 822 ? A 0.594 9.603 8.261 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 269 C C . LYS 822 822 ? A 0.678 8.295 9.023 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 270 O O . LYS 822 822 ? A 1.234 8.229 10.117 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 271 C CB . LYS 822 822 ? A -0.871 10.095 8.300 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 272 C CG . LYS 822 822 ? A -1.464 10.317 9.700 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 273 C CD . LYS 822 822 ? A -1.170 11.731 10.210 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 274 C CE . LYS 822 822 ? A -2.220 12.763 9.804 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 275 N NZ . LYS 822 822 ? A -3.431 12.587 10.617 1 1 A LYS 0.800 1 ATOM 276 N N . SER 823 823 ? A 0.114 7.208 8.470 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 277 C CA . SER 823 823 ? A 0.048 5.949 9.185 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 278 C C . SER 823 823 ? A -0.235 4.843 8.197 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 279 O O . SER 823 823 ? A -0.653 5.099 7.072 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 280 C CB . SER 823 823 ? A -0.925 5.896 10.414 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 281 O OG . SER 823 823 ? 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A -4.871 -7.630 8.224 1 1 A SER 0.750 1 ATOM 310 C CB . SER 827 827 ? A -7.118 -6.184 6.249 1 1 A SER 0.750 1 ATOM 311 O OG . SER 827 827 ? A -7.827 -5.077 5.693 1 1 A SER 0.750 1 ATOM 312 N N . PRO 828 828 ? A -6.968 -7.724 8.970 1 1 A PRO 0.560 1 ATOM 313 C CA . PRO 828 828 ? A -6.754 -8.973 9.701 1 1 A PRO 0.560 1 ATOM 314 C C . PRO 828 828 ? A -6.723 -10.190 8.781 1 1 A PRO 0.560 1 ATOM 315 O O . PRO 828 828 ? A -6.403 -11.278 9.249 1 1 A PRO 0.560 1 ATOM 316 C CB . PRO 828 828 ? A -7.933 -9.026 10.692 1 1 A PRO 0.560 1 ATOM 317 C CG . PRO 828 828 ? A -9.035 -8.226 10.002 1 1 A PRO 0.560 1 ATOM 318 C CD . PRO 828 828 ? A -8.258 -7.109 9.311 1 1 A PRO 0.560 1 ATOM 319 N N . HIS 829 829 ? A -7.082 -10.044 7.489 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 320 C CA . HIS 829 829 ? A -7.026 -11.090 6.477 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 321 C C . HIS 829 829 ? A -5.608 -11.611 6.197 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 322 O O . HIS 829 829 ? A -4.689 -10.829 5.984 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 323 C CB . HIS 829 829 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #