data_SMR-fb01f422b2578ef31c184d7fb61e491a_4
_entry.id SMR-fb01f422b2578ef31c184d7fb61e491a_4
_struct.entry_id SMR-fb01f422b2578ef31c184d7fb61e491a_4
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - P0DJD1/ RGPD2_HUMAN, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2

Estimated model accuracy of this model is 0.016, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries P0DJD1'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.title
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
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_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 229186.473 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP RGPD2_HUMAN P0DJD1 1
;MRRSKAYGERYLASVQGSAPSPGKKLRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYVCTYLSVQERDPRAHRFLGLLYE
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LLKSEIRRLERNQEESAANVEHLKNVLLQFIFLKPGSERESLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGLQET
SIPKKK
;
'RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1756 1 1756
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . RGPD2_HUMAN P0DJD1 . 1 1756 9606 'Homo sapiens (Human)' 2012-01-25
AF734EAD7BBFA429
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no A
;MRRSKAYGERYLASVQGSAPSPGKKLRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYVCTYLSVQERDPRAHRFLGLLYE
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SIPKKK
;

;MRRSKAYGERYLASVQGSAPSPGKKLRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYVCTYLSVQERDPRAHRFLGLLYE
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;

#
#
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_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
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_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 ARG .
1 3 ARG .
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1 5 LYS .
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1 7 TYR .
1 8 GLY .
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1 13 ALA .
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1 15 VAL .
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1 17 GLY .
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1 19 ALA .
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1 21 SER .
1 22 PRO .
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1 25 LYS .
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1 38 ALA .
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1 61 ALA .
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1 73 GLU .
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1 91 PRO .
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1 1655 THR .
1 1656 LYS .
1 1657 SER .
1 1658 ALA .
1 1659 ASP .
1 1660 GLN .
1 1661 LEU .
1 1662 ASN .
1 1663 GLY .
1 1664 LEU .
1 1665 LEU .
1 1666 ARG .
1 1667 GLU .
1 1668 THR .
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1 1670 ALA .
1 1671 THR .
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1 1673 ALA .
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1 1675 LEU .
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1 1721 SER .
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1 1723 LEU .
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1 1725 VAL .
1 1726 ILE .
1 1727 ASN .
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1 1747 LEU .
1 1748 GLN .
1 1749 GLU .
1 1750 THR .
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#
#
loop_
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_struct_asym.entity_id
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A 1 .
#
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loop_
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A 1 105 LYS 105 105 LYS LYS A .
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A 1 180 LEU 180 ? ? ? A .
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A 1 300 MET 300 ? ? ? A .
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A 1 304 GLY 304 ? ? ? A .
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A 1 306 ASN 306 ? ? ? A .
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A 1 329 PRO 329 ? ? ? A .
A 1 330 LYS 330 ? ? ? A .
A 1 331 ILE 331 ? ? ? A .
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A 1 334 ILE 334 ? ? ? A .
A 1 335 LYS 335 ? ? ? A .
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A 1 1160 GLN 1160 ? ? ? A .
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A 1 1538 VAL 1538 ? ? ? A .
A 1 1539 LYS 1539 ? ? ? A .
A 1 1540 ARG 1540 ? ? ? A .
A 1 1541 ILE 1541 ? ? ? A .
A 1 1542 PHE 1542 ? ? ? A .
A 1 1543 SER 1543 ? ? ? A .
A 1 1544 SER 1544 ? ? ? A .
A 1 1545 GLU 1545 ? ? ? A .
A 1 1546 LYS 1546 ? ? ? A .
A 1 1547 SER 1547 ? ? ? A .
A 1 1548 ASN 1548 ? ? ? A .
A 1 1549 PRO 1549 ? ? ? A .
A 1 1550 PHE 1550 ? ? ? A .
A 1 1551 ALA 1551 ? ? ? A .
A 1 1552 PHE 1552 ? ? ? A .
A 1 1553 GLY 1553 ? ? ? A .
A 1 1554 ASN 1554 ? ? ? A .
A 1 1555 SER 1555 ? ? ? A .
A 1 1556 SER 1556 ? ? ? A .
A 1 1557 ALA 1557 ? ? ? A .
A 1 1558 THR 1558 ? ? ? A .
A 1 1559 GLY 1559 ? ? ? A .
A 1 1560 SER 1560 ? ? ? A .
A 1 1561 LEU 1561 ? ? ? A .
A 1 1562 PHE 1562 ? ? ? A .
A 1 1563 GLY 1563 ? ? ? A .
A 1 1564 PHE 1564 ? ? ? A .
A 1 1565 SER 1565 ? ? ? A .
A 1 1566 PHE 1566 ? ? ? A .
A 1 1567 ASN 1567 ? ? ? A .
A 1 1568 ALA 1568 ? ? ? A .
A 1 1569 PRO 1569 ? ? ? A .
A 1 1570 LEU 1570 ? ? ? A .
A 1 1571 LYS 1571 ? ? ? A .
A 1 1572 SER 1572 ? ? ? A .
A 1 1573 ASN 1573 ? ? ? A .
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A 1 1575 SER 1575 ? ? ? A .
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A 1 1579 SER 1579 ? ? ? A .
A 1 1580 VAL 1580 ? ? ? A .
A 1 1581 ALA 1581 ? ? ? A .
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A 1 1584 GLY 1584 ? ? ? A .
A 1 1585 SER 1585 ? ? ? A .
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A 1 1587 SER 1587 ? ? ? A .
A 1 1588 LYS 1588 ? ? ? A .
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A 1 1590 GLU 1590 ? ? ? A .
A 1 1591 PRO 1591 ? ? ? A .
A 1 1592 LYS 1592 ? ? ? A .
A 1 1593 LYS 1593 ? ? ? A .
A 1 1594 CYS 1594 ? ? ? A .
A 1 1595 GLU 1595 ? ? ? A .
A 1 1596 LEU 1596 ? ? ? A .
A 1 1597 SER 1597 ? ? ? A .
A 1 1598 LYS 1598 ? ? ? A .
A 1 1599 ASN 1599 ? ? ? A .
A 1 1600 SER 1600 ? ? ? A .
A 1 1601 ASP 1601 ? ? ? A .
A 1 1602 ILE 1602 ? ? ? A .
A 1 1603 GLU 1603 ? ? ? A .
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A 1 1606 SER 1606 ? ? ? A .
A 1 1607 ASP 1607 ? ? ? A .
A 1 1608 SER 1608 ? ? ? A .
A 1 1609 LYS 1609 ? ? ? A .
A 1 1610 VAL 1610 ? ? ? A .
A 1 1611 LYS 1611 ? ? ? A .
A 1 1612 ASN 1612 ? ? ? A .
A 1 1613 LEU 1613 ? ? ? A .
A 1 1614 SER 1614 ? ? ? A .
A 1 1615 ALA 1615 ? ? ? A .
A 1 1616 SER 1616 ? ? ? A .
A 1 1617 PHE 1617 ? ? ? A .
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A 1 1623 SER 1623 ? ? ? A .
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A 1 1642 PHE 1642 ? ? ? A .
A 1 1643 THR 1643 ? ? ? A .
A 1 1644 LYS 1644 ? ? ? A .
A 1 1645 GLU 1645 ? ? ? A .
A 1 1646 GLU 1646 ? ? ? A .
A 1 1647 LEU 1647 ? ? ? A .
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A 1 1649 GLN 1649 ? ? ? A .
A 1 1650 LYS 1650 ? ? ? A .
A 1 1651 LEU 1651 ? ? ? A .
A 1 1652 SER 1652 ? ? ? A .
A 1 1653 SER 1653 ? ? ? A .
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A 1 1655 THR 1655 ? ? ? A .
A 1 1656 LYS 1656 ? ? ? A .
A 1 1657 SER 1657 ? ? ? A .
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A 1 1659 ASP 1659 ? ? ? A .
A 1 1660 GLN 1660 ? ? ? A .
A 1 1661 LEU 1661 ? ? ? A .
A 1 1662 ASN 1662 ? ? ? A .
A 1 1663 GLY 1663 ? ? ? A .
A 1 1664 LEU 1664 ? ? ? A .
A 1 1665 LEU 1665 ? ? ? A .
A 1 1666 ARG 1666 ? ? ? A .
A 1 1667 GLU 1667 ? ? ? A .
A 1 1668 THR 1668 ? ? ? A .
A 1 1669 GLU 1669 ? ? ? A .
A 1 1670 ALA 1670 ? ? ? A .
A 1 1671 THR 1671 ? ? ? A .
A 1 1672 SER 1672 ? ? ? A .
A 1 1673 ALA 1673 ? ? ? A .
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A 1 1675 LEU 1675 ? ? ? A .
A 1 1676 MET 1676 ? ? ? A .
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A 1 1681 LEU 1681 ? ? ? A .
A 1 1682 LEU 1682 ? ? ? A .
A 1 1683 LYS 1683 ? ? ? A .
A 1 1684 SER 1684 ? ? ? A .
A 1 1685 GLU 1685 ? ? ? A .
A 1 1686 ILE 1686 ? ? ? A .
A 1 1687 ARG 1687 ? ? ? A .
A 1 1688 ARG 1688 ? ? ? A .
A 1 1689 LEU 1689 ? ? ? A .
A 1 1690 GLU 1690 ? ? ? A .
A 1 1691 ARG 1691 ? ? ? A .
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A 1 1694 GLU 1694 ? ? ? A .
A 1 1695 GLU 1695 ? ? ? A .
A 1 1696 SER 1696 ? ? ? A .
A 1 1697 ALA 1697 ? ? ? A .
A 1 1698 ALA 1698 ? ? ? A .
A 1 1699 ASN 1699 ? ? ? A .
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A 1 1702 HIS 1702 ? ? ? A .
A 1 1703 LEU 1703 ? ? ? A .
A 1 1704 LYS 1704 ? ? ? A .
A 1 1705 ASN 1705 ? ? ? A .
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A 1 1707 LEU 1707 ? ? ? A .
A 1 1708 LEU 1708 ? ? ? A .
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A 1 1715 PRO 1715 ? ? ? A .
A 1 1716 GLY 1716 ? ? ? A .
A 1 1717 SER 1717 ? ? ? A .
A 1 1718 GLU 1718 ? ? ? A .
A 1 1719 ARG 1719 ? ? ? A .
A 1 1720 GLU 1720 ? ? ? A .
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A 1 1723 LEU 1723 ? ? ? A .
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A 1 1736 GLU 1736 ? ? ? A .
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A 1 1739 LYS 1739 ? ? ? A .
A 1 1740 LEU 1740 ? ? ? A .
A 1 1741 ALA 1741 ? ? ? A .
A 1 1742 ALA 1742 ? ? ? A .
A 1 1743 VAL 1743 ? ? ? A .
A 1 1744 ALA 1744 ? ? ? A .
A 1 1745 GLN 1745 ? ? ? A .
A 1 1746 GLY 1746 ? ? ? A .
A 1 1747 LEU 1747 ? ? ? A .
A 1 1748 GLN 1748 ? ? ? A .
A 1 1749 GLU 1749 ? ? ? A .
A 1 1750 THR 1750 ? ? ? A .
A 1 1751 SER 1751 ? ? ? A .
A 1 1752 ILE 1752 ? ? ? A .
A 1 1753 PRO 1753 ? ? ? A .
A 1 1754 LYS 1754 ? ? ? A .
A 1 1755 LYS 1755 ? ? ? A .
A 1 1756 LYS 1756 ? ? ? A .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'UPF0169 LIPOPROTEIN YFIO {PDB ID=2yhc, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2yhc.1.A}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 2yhc, label_asym_id=A'
'target-template alignment' .
4 'model 4' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;DNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYYKNADLPLAQAAIDRFIRL
NPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQQARAAFSDFSKLVRGYPNSQYTTDATKRLV
FLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVAKII
AANSSNTLEHHHHHH
;

;DNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYYKNADLPLAQAAIDRFIRL
NPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQQARAAFSDFSKLVRGYPNSQYTTDATKRLV
FLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVAKII
AANSSNTLEHHHHHH
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 78 217
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 2yhc 2024-05-08
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1756
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1794 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 7.7e-05 7.843
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MRRSKAYGERYLASVQGSAPSPGKKLRGFYFAKLYYE------------------AKEYDLAKKYVCTYLSVQERDP-----------------RAHRFLGLLYELEENTEKAVECYRRSLELNPPQK---DLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEHLLDCEGEDGWNKLFDWIQSELYVRPDDVHMNIRLVELYRSNKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTLKEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELSATFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHGNNVQWQALSELAALCYVIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDRLSQSGHMLLNLSRGKQDFLKEVVETFANKSGQSVLYNALFSSQSSKDTSFLGSDDIGNIDVQEPELEDLARYDVGAIQAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLLGVVYTSHLQLKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKRLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAELRLVVQHEINTLRAQEKHGLQPALLVHWAKCLQKMGRGLNSSYDQQEYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKNSIPEPIDPLFKHFHSVDIQASEIVEYEEDAHITFAILDAVHGNIEDAVTAFESIKSVVSYWNLALIFHRKAEDIENDAVFPEEQEECKNYLRKTRDYLIKIIDDSDSNLSVVKKLPVPLESVKEMLKSVMQELEDYSEGGPLYKNGSLRNADSEIKHSTPSPTKYSLSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNSLRKMICQEVKAITKLNSSKSASRHRWPTENYGPDSVPDGYQGSQTFHGAPLTVATTGPSVYYSQSPAYNSQYLLRPAANVTPTKGSSNTEFKSTKEGFSIAVSADGFKFGISEPGNQEKKSEKPLENDTGFQAQDISGQKNGRGVIFGQTSSTFTFADVAKSTSGEGFQFGKKDPNFKGFSGAGEKLFSSQCGKMANKANTSGDFEKDDDACKTEDSDDIHFEPVVQMPEKVELVTGEEGEKVLYSQGVKLFRFDAEISQWKERGLGNLKILKNEVNGKPRMLMRRDQVLKVCANHWITTTMNLKPLSGSDRAWMWLASDFSDGDAKLERLAAQFKTPELAEEFKQKFEECQRLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRAEEMKSGLKDFKTFLTNDQTKVTEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNPENTGPTLEWDNYDLREDALDDNVSSSSVHDSPLASSPVRKNIFRFDESTTGFNFSFKSALSLSKSPAKLNQSGTSVGTDEESDVTQEEERDGQYFEPVVPLPDLVEVSSGEENEQVVFSHMAELYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKLCANHRITPDMSLQNMKGTERVWVWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQEKDSLITPHVSRSSTPRESPCGKIAVAVLEETTRERTDVIQGDDVADAASEVEVSSTSETTTKAVVSPPKFVFGSESVKRIFSSEKSNPFAFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNDSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKVKNLSASFPMEESSINYTFKTPEKEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKSADQLNGLLRETEATSAVLMEQIKLLKSEIRRLERNQEESAANVEHLKNVLLQFIFLKPGSERESLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGLQETSIPKKK
2 1 2
------------------------DYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQQARAAFSDFSKLVRGYPNSQYTTDATKRLVFLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVA-KIIAANSSNT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2yhc.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
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ATOM 147 C C . TYR 41 41 ? A 9.992 6.825 11.820 1 1 A TYR 0.620 1
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ATOM 228 N N . TYR 51 51 ? A 18.280 9.608 21.795 1 1 A TYR 0.610 1
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ATOM 231 O O . TYR 51 51 ? A 18.591 11.405 24.873 1 1 A TYR 0.610 1
ATOM 232 C CB . TYR 51 51 ? A 17.866 12.037 21.687 1 1 A TYR 0.610 1
ATOM 233 C CG . TYR 51 51 ? A 17.773 13.369 22.405 1 1 A TYR 0.610 1
ATOM 234 C CD1 . TYR 51 51 ? A 16.585 13.743 23.044 1 1 A TYR 0.610 1
ATOM 235 C CD2 . TYR 51 51 ? A 18.860 14.250 22.465 1 1 A TYR 0.610 1
ATOM 236 C CE1 . TYR 51 51 ? A 16.471 14.953 23.740 1 1 A TYR 0.610 1
ATOM 237 C CE2 . TYR 51 51 ? A 18.761 15.460 23.173 1 1 A TYR 0.610 1
ATOM 238 C CZ . TYR 51 51 ? A 17.568 15.808 23.817 1 1 A TYR 0.610 1
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ATOM 246 C CD1 . LEU 52 52 ? A 13.034 12.655 25.925 1 1 A LEU 0.600 1
ATOM 247 C CD2 . LEU 52 52 ? A 13.809 11.605 23.803 1 1 A LEU 0.600 1
ATOM 248 N N . SER 53 53 ? A 14.684 8.534 26.696 1 1 A SER 0.530 1
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ATOM 251 O O . SER 53 53 ? A 11.471 6.962 26.810 1 1 A SER 0.530 1
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ATOM 254 N N . VAL 54 54 ? A 12.282 8.174 25.120 1 1 A VAL 0.410 1
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ATOM 267 C CD . GLN 55 55 ? A 9.350 3.475 20.837 1 1 A GLN 0.440 1
ATOM 268 O OE1 . GLN 55 55 ? A 10.406 2.929 21.164 1 1 A GLN 0.440 1
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ATOM 440 C CB . THR 75 75 ? A -3.861 -16.679 13.121 1 1 A THR 0.730 1
ATOM 441 O OG1 . THR 75 75 ? A -3.316 -17.950 12.793 1 1 A THR 0.730 1
ATOM 442 C CG2 . THR 75 75 ? A -5.299 -16.625 12.580 1 1 A THR 0.730 1
ATOM 443 N N . GLU 76 76 ? A -0.699 -16.142 12.933 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 444 C CA . GLU 76 76 ? A 0.616 -15.952 13.532 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 445 C C . GLU 76 76 ? A 1.277 -14.629 13.185 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 446 O O . GLU 76 76 ? A 1.817 -13.946 14.054 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 447 C CB . GLU 76 76 ? A 1.587 -17.089 13.162 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 448 C CG . GLU 76 76 ? A 2.956 -16.990 13.887 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 449 C CD . GLU 76 76 ? A 3.896 -18.137 13.525 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 450 O OE1 . GLU 76 76 ? A 3.508 -18.990 12.687 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 451 O OE2 . GLU 76 76 ? A 5.019 -18.149 14.090 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 452 N N . LYS 77 77 ? A 1.220 -14.186 11.912 1 1 A LYS 0.740 1
ATOM 453 C CA . LYS 77 77 ? A 1.773 -12.903 11.515 1 1 A LYS 0.740 1
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ATOM 479 C CD . GLU 80 80 ? A 6.759 -11.113 13.005 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 480 O OE1 . GLU 80 80 ? A 6.244 -11.509 11.928 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 481 O OE2 . GLU 80 80 ? A 7.980 -10.794 13.116 1 1 A GLU 0.730 1
ATOM 482 N N . CYS 81 81 ? A 2.725 -8.907 14.612 1 1 A CYS 0.740 1
ATOM 483 C CA . CYS 81 81 ? A 2.550 -7.470 14.414 1 1 A CYS 0.740 1
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ATOM 487 S SG . CYS 81 81 ? A 2.406 -7.683 11.614 1 1 A CYS 0.740 1
ATOM 488 N N . TYR 82 82 ? A 0.900 -7.249 16.243 1 1 A TYR 0.710 1
ATOM 489 C CA . TYR 82 82 ? A 0.361 -6.628 17.445 1 1 A TYR 0.710 1
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ATOM 499 O OH . TYR 82 82 ? A -2.759 -5.566 23.083 1 1 A TYR 0.710 1
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ATOM 501 C CA . ARG 83 83 ? A 2.882 -7.860 20.050 1 1 A ARG 0.680 1
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ATOM 503 O O . ARG 83 83 ? A 4.284 -6.180 20.981 1 1 A ARG 0.680 1
ATOM 504 C CB . ARG 83 83 ? A 3.444 -9.276 20.240 1 1 A ARG 0.680 1
ATOM 505 C CG . ARG 83 83 ? A 2.354 -10.280 20.648 1 1 A ARG 0.680 1
ATOM 506 C CD . ARG 83 83 ? A 2.875 -11.715 20.765 1 1 A ARG 0.680 1
ATOM 507 N NE . ARG 83 83 ? A 3.826 -11.762 21.925 1 1 A ARG 0.680 1
ATOM 508 C CZ . ARG 83 83 ? A 3.474 -11.979 23.200 1 1 A ARG 0.680 1
ATOM 509 N NH1 . ARG 83 83 ? A 2.214 -12.156 23.576 1 1 A ARG 0.680 1
ATOM 510 N NH2 . ARG 83 83 ? A 4.421 -12.017 24.135 1 1 A ARG 0.680 1
ATOM 511 N N . ARG 84 84 ? A 4.565 -6.631 18.790 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 512 C CA . ARG 84 84 ? A 5.441 -5.516 18.499 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 513 C C . ARG 84 84 ? A 4.809 -4.143 18.718 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 514 O O . ARG 84 84 ? A 5.451 -3.236 19.242 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 515 C CB . ARG 84 84 ? A 5.895 -5.586 17.025 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 516 C CG . ARG 84 84 ? A 6.727 -6.837 16.691 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 517 C CD . ARG 84 84 ? A 7.046 -6.933 15.192 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 518 N NE . ARG 84 84 ? A 7.820 -8.187 14.917 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 519 C CZ . ARG 84 84 ? A 9.106 -8.408 15.212 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 520 N NH1 . ARG 84 84 ? A 9.853 -7.511 15.843 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 521 N NH2 . ARG 84 84 ? A 9.637 -9.569 14.839 1 1 A ARG 0.670 1
ATOM 522 N N . SER 85 85 ? A 3.527 -3.928 18.338 1 1 A SER 0.700 1
ATOM 523 C CA . SER 85 85 ? A 2.815 -2.711 18.713 1 1 A SER 0.700 1
ATOM 524 C C . SER 85 85 ? A 2.687 -2.548 20.212 1 1 A SER 0.700 1
ATOM 525 O O . SER 85 85 ? A 3.067 -1.509 20.722 1 1 A SER 0.700 1
ATOM 526 C CB . SER 85 85 ? A 1.382 -2.617 18.129 1 1 A SER 0.700 1
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ATOM 528 N N . LEU 86 86 ? A 2.234 -3.574 20.959 1 1 A LEU 0.650 1
ATOM 529 C CA . LEU 86 86 ? A 2.074 -3.537 22.407 1 1 A LEU 0.650 1
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ATOM 532 C CB . LEU 86 86 ? A 1.343 -4.823 22.896 1 1 A LEU 0.650 1
ATOM 533 C CG . LEU 86 86 ? A 0.985 -4.879 24.405 1 1 A LEU 0.650 1
ATOM 534 C CD1 . LEU 86 86 ? A 0.090 -3.703 24.830 1 1 A LEU 0.650 1
ATOM 535 C CD2 . LEU 86 86 ? A 0.296 -6.205 24.775 1 1 A LEU 0.650 1
ATOM 536 N N . GLU 87 87 ? A 4.472 -3.998 22.754 1 1 A GLU 0.620 1
ATOM 537 C CA . GLU 87 87 ? A 5.807 -3.836 23.306 1 1 A GLU 0.620 1
ATOM 538 C C . GLU 87 87 ? A 6.400 -2.450 23.093 1 1 A GLU 0.620 1
ATOM 539 O O . GLU 87 87 ? A 6.949 -1.835 24.006 1 1 A GLU 0.620 1
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ATOM 541 C CG . GLU 87 87 ? A 8.197 -4.930 23.139 1 1 A GLU 0.620 1
ATOM 542 C CD . GLU 87 87 ? A 9.009 -6.026 22.443 1 1 A GLU 0.620 1
ATOM 543 O OE1 . GLU 87 87 ? A 8.456 -6.725 21.551 1 1 A GLU 0.620 1
ATOM 544 O OE2 . GLU 87 87 ? A 10.206 -6.166 22.802 1 1 A GLU 0.620 1
ATOM 545 N N . LEU 88 88 ? A 6.278 -1.900 21.868 1 1 A LEU 0.600 1
ATOM 546 C CA . LEU 88 88 ? A 6.974 -0.679 21.525 1 1 A LEU 0.600 1
ATOM 547 C C . LEU 88 88 ? A 6.113 0.569 21.618 1 1 A LEU 0.600 1
ATOM 548 O O . LEU 88 88 ? A 6.628 1.674 21.752 1 1 A LEU 0.600 1
ATOM 549 C CB . LEU 88 88 ? A 7.507 -0.781 20.069 1 1 A LEU 0.600 1
ATOM 550 C CG . LEU 88 88 ? A 8.601 -1.847 19.846 1 1 A LEU 0.600 1
ATOM 551 C CD1 . LEU 88 88 ? A 8.966 -1.938 18.354 1 1 A LEU 0.600 1
ATOM 552 C CD2 . LEU 88 88 ? A 9.857 -1.569 20.688 1 1 A LEU 0.600 1
ATOM 553 N N . ASN 89 89 ? A 4.780 0.476 21.530 1 1 A ASN 0.620 1
ATOM 554 C CA . ASN 89 89 ? A 3.953 1.650 21.378 1 1 A ASN 0.620 1
ATOM 555 C C . ASN 89 89 ? A 2.644 1.472 22.153 1 1 A ASN 0.620 1
ATOM 556 O O . ASN 89 89 ? A 1.848 0.608 21.791 1 1 A ASN 0.620 1
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ATOM 558 C CG . ASN 89 89 ? A 4.810 1.876 18.958 1 1 A ASN 0.620 1
ATOM 559 O OD1 . ASN 89 89 ? A 5.683 2.753 18.932 1 1 A ASN 0.620 1
ATOM 560 N ND2 . ASN 89 89 ? A 4.877 0.849 18.074 1 1 A ASN 0.620 1
ATOM 561 N N . PRO 90 90 ? A 2.279 2.285 23.142 1 1 A PRO 0.580 1
ATOM 562 C CA . PRO 90 90 ? A 0.939 2.276 23.722 1 1 A PRO 0.580 1
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ATOM 567 C CD . PRO 90 90 ? A 3.116 3.334 23.718 1 1 A PRO 0.580 1
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ATOM 594 C CA . ASP 94 94 ? A -7.964 -0.728 18.017 1 1 A ASP 0.610 1
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ATOM 641 N N . ALA 100 100 ? A -6.668 -10.865 20.158 1 1 A ALA 0.680 1
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ATOM 654 O OE2 . GLU 101 101 ? A -12.817 -9.859 16.487 1 1 A GLU 0.630 1
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ATOM 656 C CA . LEU 102 102 ? A -6.155 -14.528 16.075 1 1 A LEU 0.670 1
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ATOM 676 S SG . CYS 104 104 ? A -11.642 -17.617 20.250 1 1 A CYS 0.670 1
ATOM 677 N N . LYS 105 105 ? A -8.805 -18.104 16.902 1 1 A LYS 0.650 1
ATOM 678 C CA . LYS 105 105 ? A -8.819 -18.820 15.636 1 1 A LYS 0.650 1
ATOM 679 C C . LYS 105 105 ? A -7.787 -19.946 15.579 1 1 A LYS 0.650 1
ATOM 680 O O . LYS 105 105 ? A -7.889 -20.848 14.751 1 1 A LYS 0.650 1
ATOM 681 C CB . LYS 105 105 ? A -8.554 -17.831 14.466 1 1 A LYS 0.650 1
ATOM 682 C CG . LYS 105 105 ? A -9.671 -16.799 14.210 1 1 A LYS 0.650 1
ATOM 683 C CD . LYS 105 105 ? A -9.336 -15.884 13.015 1 1 A LYS 0.650 1
ATOM 684 C CE . LYS 105 105 ? A -10.420 -14.842 12.674 1 1 A LYS 0.650 1
ATOM 685 N NZ . LYS 105 105 ? A -10.089 -14.123 11.433 1 1 A LYS 0.650 1
ATOM 686 N N . ASN 106 106 ? A -6.788 -19.928 16.486 1 1 A ASN 0.690 1
ATOM 687 C CA . ASN 106 106 ? A -5.805 -20.984 16.647 1 1 A ASN 0.690 1
ATOM 688 C C . ASN 106 106 ? A -6.065 -21.830 17.905 1 1 A ASN 0.690 1
ATOM 689 O O . ASN 106 106 ? A -5.199 -22.604 18.310 1 1 A ASN 0.690 1
ATOM 690 C CB . ASN 106 106 ? A -4.390 -20.359 16.793 1 1 A ASN 0.690 1
ATOM 691 C CG . ASN 106 106 ? A -3.927 -19.653 15.528 1 1 A ASN 0.690 1
ATOM 692 O OD1 . ASN 106 106 ? A -4.481 -19.738 14.431 1 1 A ASN 0.690 1
ATOM 693 N ND2 . ASN 106 106 ? A -2.797 -18.918 15.666 1 1 A ASN 0.690 1
ATOM 694 N N . ASP 107 107 ? A -7.229 -21.653 18.574 1 1 A ASP 0.660 1
ATOM 695 C CA . ASP 107 107 ? A -7.644 -22.280 19.827 1 1 A ASP 0.660 1
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ATOM 699 C CG . ASP 107 107 ? A -9.298 -23.949 18.876 1 1 A ASP 0.660 1
ATOM 700 O OD1 . ASP 107 107 ? A -10.270 -23.212 19.197 1 1 A ASP 0.660 1
ATOM 701 O OD2 . ASP 107 107 ? A -9.345 -24.855 18.004 1 1 A ASP 0.660 1
ATOM 702 N N . VAL 108 108 ? A -5.971 -20.929 21.062 1 1 A VAL 0.580 1
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ATOM 706 C CB . VAL 108 108 ? A -3.763 -19.938 21.514 1 1 A VAL 0.580 1
ATOM 707 C CG1 . VAL 108 108 ? A -2.638 -19.787 22.557 1 1 A VAL 0.580 1
ATOM 708 C CG2 . VAL 108 108 ? A -3.218 -20.715 20.299 1 1 A VAL 0.580 1
ATOM 709 N N . THR 109 109 ? A -6.246 -20.629 24.178 1 1 A THR 0.520 1
ATOM 710 C CA . THR 109 109 ? A -7.037 -20.058 25.271 1 1 A THR 0.520 1
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ATOM 712 O O . THR 109 109 ? A -6.692 -18.099 26.571 1 1 A THR 0.520 1
ATOM 713 C CB . THR 109 109 ? A -7.905 -21.126 25.937 1 1 A THR 0.520 1
ATOM 714 O OG1 . THR 109 109 ? A -9.006 -21.446 25.086 1 1 A THR 0.520 1
ATOM 715 C CG2 . THR 109 109 ? A -8.499 -20.668 27.275 1 1 A THR 0.520 1
ATOM 716 N N . ASP 110 110 ? A -5.141 -19.709 26.825 1 1 A ASP 0.600 1
ATOM 717 C CA . ASP 110 110 ? A -4.344 -19.022 27.831 1 1 A ASP 0.600 1
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ATOM 719 O O . ASP 110 110 ? A -3.908 -16.660 28.019 1 1 A ASP 0.600 1
ATOM 720 C CB . ASP 110 110 ? A -3.154 -19.919 28.261 1 1 A ASP 0.600 1
ATOM 721 C CG . ASP 110 110 ? A -3.625 -21.226 28.886 1 1 A ASP 0.600 1
ATOM 722 O OD1 . ASP 110 110 ? A -4.860 -21.425 29.031 1 1 A ASP 0.600 1
ATOM 723 O OD2 . ASP 110 110 ? A -2.732 -22.055 29.183 1 1 A ASP 0.600 1
ATOM 724 N N . GLY 111 111 ? A -3.321 -17.639 26.091 1 1 A GLY 0.630 1
ATOM 725 C CA . GLY 111 111 ? A -2.883 -16.394 25.484 1 1 A GLY 0.630 1
ATOM 726 C C . GLY 111 111 ? A -4.005 -15.440 25.164 1 1 A GLY 0.630 1
ATOM 727 O O . GLY 111 111 ? A -3.844 -14.224 25.239 1 1 A GLY 0.630 1
ATOM 728 N N . ARG 112 112 ? A -5.179 -15.963 24.755 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 729 C CA . ARG 112 112 ? A -6.335 -15.159 24.415 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 730 C C . ARG 112 112 ? A -6.898 -14.453 25.626 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 731 O O . ARG 112 112 ? A -7.189 -13.260 25.582 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 732 C CB . ARG 112 112 ? A -7.422 -16.046 23.764 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 733 C CG . ARG 112 112 ? A -8.709 -15.286 23.387 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 734 C CD . ARG 112 112 ? A -9.835 -16.175 22.862 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 735 N NE . ARG 112 112 ? A -10.333 -17.012 24.000 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 736 C CZ . ARG 112 112 ? A -10.192 -18.339 24.103 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 737 N NH1 . ARG 112 112 ? A -9.591 -19.075 23.180 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 738 N NH2 . ARG 112 112 ? A -10.633 -18.958 25.194 1 1 A ARG 0.520 1
ATOM 739 N N . ALA 113 113 ? A -7.000 -15.185 26.753 1 1 A ALA 0.530 1
ATOM 740 C CA . ALA 113 113 ? A -7.421 -14.680 28.038 1 1 A ALA 0.530 1
ATOM 741 C C . ALA 113 113 ? A -6.488 -13.594 28.567 1 1 A ALA 0.530 1
ATOM 742 O O . ALA 113 113 ? A -6.891 -12.615 29.194 1 1 A ALA 0.530 1
ATOM 743 C CB . ALA 113 113 ? A -7.536 -15.875 28.998 1 1 A ALA 0.530 1
ATOM 744 N N . LYS 114 114 ? A -5.187 -13.744 28.259 1 1 A LYS 0.600 1
ATOM 745 C CA . LYS 114 114 ? A -4.173 -12.749 28.508 1 1 A LYS 0.600 1
ATOM 746 C C . LYS 114 114 ? A -4.406 -11.431 27.762 1 1 A LYS 0.600 1
ATOM 747 O O . LYS 114 114 ? A -4.250 -10.347 28.318 1 1 A LYS 0.600 1
ATOM 748 C CB . LYS 114 114 ? A -2.799 -13.385 28.188 1 1 A LYS 0.600 1
ATOM 749 C CG . LYS 114 114 ? A -1.689 -13.059 29.192 1 1 A LYS 0.600 1
ATOM 750 C CD . LYS 114 114 ? A -0.881 -11.797 28.876 1 1 A LYS 0.600 1
ATOM 751 C CE . LYS 114 114 ? A 0.348 -11.688 29.787 1 1 A LYS 0.600 1
ATOM 752 N NZ . LYS 114 114 ? A -0.070 -11.562 31.185 1 1 A LYS 0.600 1
ATOM 753 N N . TYR 115 115 ? A -4.811 -11.438 26.479 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 754 C CA . TYR 115 115 ? A -5.190 -10.209 25.793 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 755 C C . TYR 115 115 ? A -6.529 -9.649 26.235 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 756 O O . TYR 115 115 ? A -6.664 -8.459 26.509 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 757 C CB . TYR 115 115 ? A -5.197 -10.371 24.257 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 758 C CG . TYR 115 115 ? A -3.822 -10.746 23.760 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 759 C CD1 . TYR 115 115 ? A -2.677 -10.023 24.148 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 760 C CD2 . TYR 115 115 ? A -3.664 -11.770 22.823 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 761 C CE1 . TYR 115 115 ? A -1.406 -10.354 23.652 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 762 C CE2 . TYR 115 115 ? A -2.395 -12.085 22.320 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 763 C CZ . TYR 115 115 ? A -1.273 -11.391 22.732 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 764 O OH . TYR 115 115 ? A -0.062 -11.701 22.095 1 1 A TYR 0.580 1
ATOM 765 N N . TRP 116 116 ? A -7.554 -10.501 26.351 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 766 C CA . TRP 116 116 ? A -8.826 -10.095 26.901 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 767 C C . TRP 116 116 ? A -9.372 -11.231 27.762 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 768 O O . TRP 116 116 ? A -9.566 -12.348 27.294 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 769 C CB . TRP 116 116 ? A -9.826 -9.693 25.790 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 770 C CG . TRP 116 116 ? A -11.146 -9.130 26.305 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 771 C CD1 . TRP 116 116 ? A -11.437 -7.879 26.785 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 772 C CD2 . TRP 116 116 ? A -12.339 -9.906 26.432 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 773 N NE1 . TRP 116 116 ? A -12.747 -7.821 27.186 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 774 C CE2 . TRP 116 116 ? A -13.334 -9.047 26.978 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 775 C CE3 . TRP 116 116 ? A -12.630 -11.234 26.136 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 776 C CZ2 . TRP 116 116 ? A -14.610 -9.511 27.221 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 777 C CZ3 . TRP 116 116 ? A -13.918 -11.707 26.409 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 778 C CH2 . TRP 116 116 ? A -14.902 -10.854 26.943 1 1 A TRP 0.550 1
ATOM 779 N N . VAL 117 117 ? A -9.671 -11.015 29.055 1 1 A VAL 0.460 1
ATOM 780 C CA . VAL 117 117 ? A -9.860 -9.732 29.704 1 1 A VAL 0.460 1
ATOM 781 C C . VAL 117 117 ? A -8.616 -8.966 30.178 1 1 A VAL 0.460 1
ATOM 782 O O . VAL 117 117 ? A -8.703 -7.754 30.350 1 1 A VAL 0.460 1
ATOM 783 C CB . VAL 117 117 ? A -10.875 -9.842 30.835 1 1 A VAL 0.460 1
ATOM 784 C CG1 . VAL 117 117 ? A -12.203 -10.391 30.270 1 1 A VAL 0.460 1
ATOM 785 C CG2 . VAL 117 117 ? A -10.362 -10.736 31.979 1 1 A VAL 0.460 1
ATOM 786 N N . GLU 118 118 ? A -7.426 -9.589 30.378 1 1 A GLU 0.510 1
ATOM 787 C CA . GLU 118 118 ? A -6.308 -8.910 31.041 1 1 A GLU 0.510 1
ATOM 788 C C . GLU 118 118 ? A -5.765 -7.635 30.387 1 1 A GLU 0.510 1
ATOM 789 O O . GLU 118 118 ? A -5.705 -6.602 31.050 1 1 A GLU 0.510 1
ATOM 790 C CB . GLU 118 118 ? A -5.127 -9.886 31.349 1 1 A GLU 0.510 1
ATOM 791 C CG . GLU 118 118 ? A -3.835 -9.204 31.918 1 1 A GLU 0.510 1
ATOM 792 C CD . GLU 118 118 ? A -2.519 -9.935 31.723 1 1 A GLU 0.510 1
ATOM 793 O OE1 . GLU 118 118 ? A -1.550 -9.331 31.159 1 1 A GLU 0.510 1
ATOM 794 O OE2 . GLU 118 118 ? A -2.384 -11.108 32.168 1 1 A GLU 0.510 1
ATOM 795 N N . ARG 119 119 ? A -5.350 -7.624 29.102 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 796 C CA . ARG 119 119 ? A -4.779 -6.409 28.530 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 797 C C . ARG 119 119 ? A -5.809 -5.357 28.161 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 798 O O . ARG 119 119 ? A -5.694 -4.191 28.534 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 799 C CB . ARG 119 119 ? A -3.932 -6.739 27.272 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 800 C CG . ARG 119 119 ? A -2.651 -7.548 27.564 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 801 C CD . ARG 119 119 ? A -1.592 -6.759 28.335 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 802 N NE . ARG 119 119 ? A -0.384 -7.636 28.439 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 803 C CZ . ARG 119 119 ? A 0.685 -7.332 29.186 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 804 N NH1 . ARG 119 119 ? A 0.743 -6.212 29.895 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 805 N NH2 . ARG 119 119 ? A 1.734 -8.153 29.193 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 806 N N . ALA 120 120 ? A -6.859 -5.750 27.425 1 1 A ALA 0.570 1
ATOM 807 C CA . ALA 120 120 ? A -7.850 -4.836 26.908 1 1 A ALA 0.570 1
ATOM 808 C C . ALA 120 120 ? A -8.727 -4.185 27.971 1 1 A ALA 0.570 1
ATOM 809 O O . ALA 120 120 ? A -9.039 -3.002 27.872 1 1 A ALA 0.570 1
ATOM 810 C CB . ALA 120 120 ? A -8.646 -5.525 25.784 1 1 A ALA 0.570 1
ATOM 811 N N . ALA 121 121 ? A -9.125 -4.907 29.041 1 1 A ALA 0.490 1
ATOM 812 C CA . ALA 121 121 ? A -9.958 -4.308 30.065 1 1 A ALA 0.490 1
ATOM 813 C C . ALA 121 121 ? A -9.204 -3.337 30.972 1 1 A ALA 0.490 1
ATOM 814 O O . ALA 121 121 ? A -9.795 -2.439 31.566 1 1 A ALA 0.490 1
ATOM 815 C CB . ALA 121 121 ? A -10.594 -5.423 30.917 1 1 A ALA 0.490 1
ATOM 816 N N . LYS 122 122 ? A -7.867 -3.488 31.090 1 1 A LYS 0.460 1
ATOM 817 C CA . LYS 122 122 ? A -7.089 -2.723 32.044 1 1 A LYS 0.460 1
ATOM 818 C C . LYS 122 122 ? A -6.347 -1.543 31.436 1 1 A LYS 0.460 1
ATOM 819 O O . LYS 122 122 ? A -5.751 -0.749 32.165 1 1 A LYS 0.460 1
ATOM 820 C CB . LYS 122 122 ? A -6.047 -3.638 32.736 1 1 A LYS 0.460 1
ATOM 821 C CG . LYS 122 122 ? A -6.674 -4.721 33.628 1 1 A LYS 0.460 1
ATOM 822 C CD . LYS 122 122 ? A -5.596 -5.595 34.290 1 1 A LYS 0.460 1
ATOM 823 C CE . LYS 122 122 ? A -6.182 -6.690 35.181 1 1 A LYS 0.460 1
ATOM 824 N NZ . LYS 122 122 ? A -5.092 -7.506 35.760 1 1 A LYS 0.460 1
ATOM 825 N N . LEU 123 123 ? A -6.357 -1.348 30.098 1 1 A LEU 0.400 1
ATOM 826 C CA . LEU 123 123 ? A -5.627 -0.228 29.531 1 1 A LEU 0.400 1
ATOM 827 C C . LEU 123 123 ? A -6.446 1.049 29.455 1 1 A LEU 0.400 1
ATOM 828 O O . LEU 123 123 ? A -7.101 1.384 28.463 1 1 A LEU 0.400 1
ATOM 829 C CB . LEU 123 123 ? A -4.984 -0.517 28.162 1 1 A LEU 0.400 1
ATOM 830 C CG . LEU 123 123 ? A -4.044 0.621 27.687 1 1 A LEU 0.400 1
ATOM 831 C CD1 . LEU 123 123 ? A -2.848 0.877 28.618 1 1 A LEU 0.400 1
ATOM 832 C CD2 . LEU 123 123 ? A -3.534 0.324 26.286 1 1 A LEU 0.400 1
ATOM 833 N N . PHE 124 124 ? A -6.375 1.827 30.543 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 834 C CA . PHE 124 124 ? A -6.889 3.171 30.676 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 835 C C . PHE 124 124 ? A -6.583 4.178 29.541 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 836 O O . PHE 124 124 ? A -5.710 3.982 28.688 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 837 C CB . PHE 124 124 ? A -6.443 3.773 32.037 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 838 C CG . PHE 124 124 ? A -7.035 3.017 33.197 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 839 C CD1 . PHE 124 124 ? A -8.391 3.181 33.528 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 840 C CD2 . PHE 124 124 ? A -6.240 2.183 34.002 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 841 C CE1 . PHE 124 124 ? A -8.939 2.538 34.645 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 842 C CE2 . PHE 124 124 ? A -6.785 1.536 35.120 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 843 C CZ . PHE 124 124 ? A -8.135 1.717 35.444 1 1 A PHE 0.220 1
ATOM 844 N N . PRO 125 125 ? A -7.289 5.309 29.473 1 1 A PRO 0.230 1
ATOM 845 C CA . PRO 125 125 ? A -6.881 6.431 28.630 1 1 A PRO 0.230 1
ATOM 846 C C . PRO 125 125 ? A -6.161 7.451 29.467 1 1 A PRO 0.230 1
ATOM 847 O O . PRO 125 125 ? A -5.774 8.487 28.937 1 1 A PRO 0.230 1
ATOM 848 C CB . PRO 125 125 ? A -8.207 6.968 28.072 1 1 A PRO 0.230 1
ATOM 849 C CG . PRO 125 125 ? A -9.245 6.639 29.152 1 1 A PRO 0.230 1
ATOM 850 C CD . PRO 125 125 ? A -8.706 5.381 29.841 1 1 A PRO 0.230 1
ATOM 851 N N . GLY 126 126 ? A -5.930 7.147 30.751 1 1 A GLY 0.270 1
ATOM 852 C CA . GLY 126 126 ? A -4.932 7.823 31.562 1 1 A GLY 0.270 1
ATOM 853 C C . GLY 126 126 ? A -3.548 7.308 31.269 1 1 A GLY 0.270 1
ATOM 854 O O . GLY 126 126 ? A -3.190 6.215 31.706 1 1 A GLY 0.270 1
ATOM 855 N N . SER 127 127 ? A -2.782 8.100 30.506 1 1 A SER 0.230 1
ATOM 856 C CA . SER 127 127 ? A -1.365 7.911 30.241 1 1 A SER 0.230 1
ATOM 857 C C . SER 127 127 ? A -0.485 8.670 31.265 1 1 A SER 0.230 1
ATOM 858 O O . SER 127 127 ? A -1.030 9.434 32.108 1 1 A SER 0.230 1
ATOM 859 C CB . SER 127 127 ? A -0.939 8.487 28.861 1 1 A SER 0.230 1
ATOM 860 O OG . SER 127 127 ? A -1.619 7.865 27.763 1 1 A SER 0.230 1
ATOM 861 O OXT . SER 127 127 ? A 0.765 8.519 31.167 1 1 A SER 0.230 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.599
2 1 3 0.016
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 25 LYS 1 0.260
2 1 A 26 LEU 1 0.130
3 1 A 27 ARG 1 0.450
4 1 A 28 GLY 1 0.590
5 1 A 29 PHE 1 0.610
6 1 A 30 TYR 1 0.610
7 1 A 31 PHE 1 0.660
8 1 A 32 ALA 1 0.690
9 1 A 33 LYS 1 0.660
10 1 A 34 LEU 1 0.680
11 1 A 35 TYR 1 0.670
12 1 A 36 TYR 1 0.650
13 1 A 37 GLU 1 0.670
14 1 A 38 ALA 1 0.710
15 1 A 39 LYS 1 0.620
16 1 A 40 GLU 1 0.620
17 1 A 41 TYR 1 0.620
18 1 A 42 ASP 1 0.630
19 1 A 43 LEU 1 0.660
20 1 A 44 ALA 1 0.680
21 1 A 45 LYS 1 0.620
22 1 A 46 LYS 1 0.620
23 1 A 47 TYR 1 0.660
24 1 A 48 VAL 1 0.650
25 1 A 49 CYS 1 0.630
26 1 A 50 THR 1 0.620
27 1 A 51 TYR 1 0.610
28 1 A 52 LEU 1 0.600
29 1 A 53 SER 1 0.530
30 1 A 54 VAL 1 0.410
31 1 A 55 GLN 1 0.440
32 1 A 56 GLU 1 0.460
33 1 A 57 ARG 1 0.430
34 1 A 58 ASP 1 0.450
35 1 A 59 PRO 1 0.620
36 1 A 60 ARG 1 0.570
37 1 A 61 ALA 1 0.640
38 1 A 62 HIS 1 0.640
39 1 A 63 ARG 1 0.630
40 1 A 64 PHE 1 0.650
41 1 A 65 LEU 1 0.700
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#
#
loop_
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1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
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results that were fully or partially based on the model, please cite
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ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material,
you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
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