data_SMR-fb01f422b2578ef31c184d7fb61e491a_7 _entry.id SMR-fb01f422b2578ef31c184d7fb61e491a_7 _struct.entry_id SMR-fb01f422b2578ef31c184d7fb61e491a_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P0DJD1/ RGPD2_HUMAN, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.016, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P0DJD1' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 229186.473 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RGPD2_HUMAN P0DJD1 1 ;MRRSKAYGERYLASVQGSAPSPGKKLRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYVCTYLSVQERDPRAHRFLGLLYE LEENTEKAVECYRRSLELNPPQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEHLLDC EGEDGWNKLFDWIQSELYVRPDDVHMNIRLVELYRSNKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTL KEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELSA TFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHGNNVQWQALSELAALCYVIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDR LSQSGHMLLNLSRGKQDFLKEVVETFANKSGQSVLYNALFSSQSSKDTSFLGSDDIGNIDVQEPELEDLA RYDVGAIQAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLLG VVYTSHLQLKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKRLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAELRLVVQHEIN TLRAQEKHGLQPALLVHWAKCLQKMGRGLNSSYDQQEYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKNSIPEPIDPLFK HFHSVDIQASEIVEYEEDAHITFAILDAVHGNIEDAVTAFESIKSVVSYWNLALIFHRKAEDIENDAVFP EEQEECKNYLRKTRDYLIKIIDDSDSNLSVVKKLPVPLESVKEMLKSVMQELEDYSEGGPLYKNGSLRNA DSEIKHSTPSPTKYSLSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNSLRKMICQEVKAITKLNSSKSASRHRWPTENYG PDSVPDGYQGSQTFHGAPLTVATTGPSVYYSQSPAYNSQYLLRPAANVTPTKGSSNTEFKSTKEGFSIAV SADGFKFGISEPGNQEKKSEKPLENDTGFQAQDISGQKNGRGVIFGQTSSTFTFADVAKSTSGEGFQFGK KDPNFKGFSGAGEKLFSSQCGKMANKANTSGDFEKDDDACKTEDSDDIHFEPVVQMPEKVELVTGEEGEK VLYSQGVKLFRFDAEISQWKERGLGNLKILKNEVNGKPRMLMRRDQVLKVCANHWITTTMNLKPLSGSDR AWMWLASDFSDGDAKLERLAAQFKTPELAEEFKQKFEECQRLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRAEEM KSGLKDFKTFLTNDQTKVTEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNPENTGPTLEWDNYDLREDALDDNVSSSSV HDSPLASSPVRKNIFRFDESTTGFNFSFKSALSLSKSPAKLNQSGTSVGTDEESDVTQEEERDGQYFEPV VPLPDLVEVSSGEENEQVVFSHMAELYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKLCAN HRITPDMSLQNMKGTERVWVWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQEKDSLITPHV SRSSTPRESPCGKIAVAVLEETTRERTDVIQGDDVADAASEVEVSSTSETTTKAVVSPPKFVFGSESVKR IFSSEKSNPFAFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNDSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKV KNLSASFPMEESSINYTFKTPEKEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKSADQLNGLLRETEATSAVLMEQIK LLKSEIRRLERNQEESAANVEHLKNVLLQFIFLKPGSERESLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGLQET SIPKKK ; 'RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1756 1 1756 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . RGPD2_HUMAN P0DJD1 . 1 1756 9606 'Homo sapiens (Human)' 2012-01-25 AF734EAD7BBFA429 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no V ;MRRSKAYGERYLASVQGSAPSPGKKLRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYVCTYLSVQERDPRAHRFLGLLYE LEENTEKAVECYRRSLELNPPQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEHLLDC EGEDGWNKLFDWIQSELYVRPDDVHMNIRLVELYRSNKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTL KEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELSA TFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHGNNVQWQALSELAALCYVIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDR LSQSGHMLLNLSRGKQDFLKEVVETFANKSGQSVLYNALFSSQSSKDTSFLGSDDIGNIDVQEPELEDLA RYDVGAIQAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLLG VVYTSHLQLKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKRLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAELRLVVQHEIN TLRAQEKHGLQPALLVHWAKCLQKMGRGLNSSYDQQEYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKNSIPEPIDPLFK 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; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ARG . 1 3 ARG . 1 4 SER . 1 5 LYS . 1 6 ALA . 1 7 TYR . 1 8 GLY . 1 9 GLU . 1 10 ARG . 1 11 TYR . 1 12 LEU . 1 13 ALA . 1 14 SER . 1 15 VAL . 1 16 GLN . 1 17 GLY . 1 18 SER . 1 19 ALA . 1 20 PRO . 1 21 SER . 1 22 PRO . 1 23 GLY . 1 24 LYS . 1 25 LYS . 1 26 LEU . 1 27 ARG . 1 28 GLY . 1 29 PHE . 1 30 TYR . 1 31 PHE . 1 32 ALA . 1 33 LYS . 1 34 LEU . 1 35 TYR . 1 36 TYR . 1 37 GLU . 1 38 ALA . 1 39 LYS . 1 40 GLU . 1 41 TYR . 1 42 ASP . 1 43 LEU . 1 44 ALA . 1 45 LYS . 1 46 LYS . 1 47 TYR . 1 48 VAL . 1 49 CYS . 1 50 THR . 1 51 TYR . 1 52 LEU . 1 53 SER . 1 54 VAL . 1 55 GLN . 1 56 GLU . 1 57 ARG . 1 58 ASP . 1 59 PRO . 1 60 ARG . 1 61 ALA . 1 62 HIS . 1 63 ARG . 1 64 PHE . 1 65 LEU . 1 66 GLY . 1 67 LEU . 1 68 LEU . 1 69 TYR . 1 70 GLU . 1 71 LEU . 1 72 GLU . 1 73 GLU . 1 74 ASN . 1 75 THR . 1 76 GLU . 1 77 LYS . 1 78 ALA . 1 79 VAL . 1 80 GLU . 1 81 CYS . 1 82 TYR . 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A 1 1688 ARG 1688 1688 ARG ARG V . A 1 1689 LEU 1689 1689 LEU LEU V . A 1 1690 GLU 1690 1690 GLU GLU V . A 1 1691 ARG 1691 1691 ARG ARG V . A 1 1692 ASN 1692 1692 ASN ASN V . A 1 1693 GLN 1693 1693 GLN GLN V . A 1 1694 GLU 1694 1694 GLU GLU V . A 1 1695 GLU 1695 1695 GLU GLU V . A 1 1696 SER 1696 1696 SER SER V . A 1 1697 ALA 1697 1697 ALA ALA V . A 1 1698 ALA 1698 1698 ALA ALA V . A 1 1699 ASN 1699 1699 ASN ASN V . A 1 1700 VAL 1700 1700 VAL VAL V . A 1 1701 GLU 1701 1701 GLU GLU V . A 1 1702 HIS 1702 1702 HIS HIS V . A 1 1703 LEU 1703 1703 LEU LEU V . A 1 1704 LYS 1704 1704 LYS LYS V . A 1 1705 ASN 1705 1705 ASN ASN V . A 1 1706 VAL 1706 1706 VAL VAL V . A 1 1707 LEU 1707 1707 LEU LEU V . A 1 1708 LEU 1708 1708 LEU LEU V . A 1 1709 GLN 1709 1709 GLN GLN V . A 1 1710 PHE 1710 1710 PHE PHE V . A 1 1711 ILE 1711 1711 ILE ILE V . A 1 1712 PHE 1712 1712 PHE PHE V . A 1 1713 LEU 1713 1713 LEU LEU V . A 1 1714 LYS 1714 1714 LYS LYS V . A 1 1715 PRO 1715 1715 PRO PRO V . A 1 1716 GLY 1716 1716 GLY GLY V . A 1 1717 SER 1717 1717 SER SER V . A 1 1718 GLU 1718 1718 GLU GLU V . A 1 1719 ARG 1719 1719 ARG ARG V . A 1 1720 GLU 1720 1720 GLU GLU V . A 1 1721 SER 1721 1721 SER SER V . A 1 1722 LEU 1722 1722 LEU LEU V . A 1 1723 LEU 1723 1723 LEU LEU V . A 1 1724 PRO 1724 1724 PRO PRO V . A 1 1725 VAL 1725 1725 VAL VAL V . A 1 1726 ILE 1726 1726 ILE ILE V . A 1 1727 ASN 1727 1727 ASN ASN V . A 1 1728 THR 1728 1728 THR THR V . A 1 1729 MET 1729 1729 MET MET V . A 1 1730 LEU 1730 1730 LEU LEU V . A 1 1731 GLN 1731 1731 GLN GLN V . A 1 1732 LEU 1732 1732 LEU LEU V . A 1 1733 SER 1733 ? ? ? V . A 1 1734 PRO 1734 ? ? ? V . A 1 1735 GLU 1735 ? ? ? V . A 1 1736 GLU 1736 ? ? ? V . A 1 1737 LYS 1737 ? ? ? V . A 1 1738 GLY 1738 ? ? ? V . A 1 1739 LYS 1739 ? ? ? V . A 1 1740 LEU 1740 ? ? ? V . A 1 1741 ALA 1741 ? ? ? V . A 1 1742 ALA 1742 ? ? ? V . A 1 1743 VAL 1743 ? ? ? V . A 1 1744 ALA 1744 ? ? ? V . A 1 1745 GLN 1745 ? ? ? V . A 1 1746 GLY 1746 ? ? ? V . A 1 1747 LEU 1747 ? ? ? V . A 1 1748 GLN 1748 ? ? ? V . A 1 1749 GLU 1749 ? ? ? V . A 1 1750 THR 1750 ? ? ? V . A 1 1751 SER 1751 ? ? ? V . A 1 1752 ILE 1752 ? ? ? V . A 1 1753 PRO 1753 ? ? ? V . A 1 1754 LYS 1754 ? ? ? V . A 1 1755 LYS 1755 ? ? ? V . A 1 1756 LYS 1756 ? ? ? V . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Clusterin-associated protein 1 {PDB ID=8bd7, label_asym_id=V, auth_asym_id=T, SMTL ID=8bd7.1.V}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8bd7, label_asym_id=V' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A V 9 1 T # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSFRELRSFTEVMKALGYPRLISMENFRVPNFELVADCLYWLVHRYYPGVEIADDISTESDRVKFLQSVA QVMLTKARMKLNIKRLYAADGNAVKELLKLASLLYKATSKAGDMDDDAAEAIDVANSLKGFNPKEIKGLA AEIIKAGAGLYDALGQEPELREHRARAVAGHVDTDFVERSIREAIAQVEDNIRSLENQMEDLERNEKTLD NKIEKKKQELERQEKRLSTLQSVRPAYMDEYERLQGELNGLYQSYLDRFRNLEFLENELEAYYQAEQEKM EAQERRLKKMQKRLKEEELRILRGEQEVDEANMNFDDDDMDLSEDGEHEEAEEGEDEDYGAGGQKATMRR DQFGGQGGGGGGGRQQGGGRNVMGNLDGDFDDEASIDEDDNTDGGEVSRQGSQAGGMGGGGGYGGGGGYM NGGGMDDDENNLIQDDDEDDNDF ; ;MSFRELRSFTEVMKALGYPRLISMENFRVPNFELVADCLYWLVHRYYPGVEIADDISTESDRVKFLQSVA QVMLTKARMKLNIKRLYAADGNAVKELLKLASLLYKATSKAGDMDDDAAEAIDVANSLKGFNPKEIKGLA AEIIKAGAGLYDALGQEPELREHRARAVAGHVDTDFVERSIREAIAQVEDNIRSLENQMEDLERNEKTLD NKIEKKKQELERQEKRLSTLQSVRPAYMDEYERLQGELNGLYQSYLDRFRNLEFLENELEAYYQAEQEKM EAQERRLKKMQKRLKEEELRILRGEQEVDEANMNFDDDDMDLSEDGEHEEAEEGEDEDYGAGGQKATMRR DQFGGQGGGGGGGRQQGGGRNVMGNLDGDFDDEASIDEDDNTDGGEVSRQGSQAGGMGGGGGYGGGGGYM NGGGMDDDENNLIQDDDEDDNDF ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 205 296 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8bd7 2024-11-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1756 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1758 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6.500 16.667 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRRSKAYGERYLASVQGSAPSPGKKLRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYVCTYLSVQERDPRAHRFLGLLYELEENTEKAVECYRRSLELNPPQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEHLLDCEGEDGWNKLFDWIQSELYVRPDDVHMNIRLVELYRSNKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTLKEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELSATFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHGNNVQWQALSELAALCYVIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDRLSQSGHMLLNLSRGKQDFLKEVVETFANKSGQSVLYNALFSSQSSKDTSFLGSDDIGNIDVQEPELEDLARYDVGAIQAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLLGVVYTSHLQLKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKRLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAELRLVVQHEINTLRAQEKHGLQPALLVHWAKCLQKMGRGLNSSYDQQEYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKNSIPEPIDPLFKHFHSVDIQASEIVEYEEDAHITFAILDAVHGNIEDAVTAFESIKSVVSYWNLALIFHRKAEDIENDAVFPEEQEECKNYLRKTRDYLIKIIDDSDSNLSVVKKLPVPLESVKEMLKSVMQELEDYSEGGPLYKNGSLRNADSEIKHSTPSPTKYSLSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNSLRKMICQEVKAITKLNSSKSASRHRWPTENYGPDSVPDGYQGSQTFHGAPLTVATTGPSVYYSQSPAYNSQYLLRPAANVTPTKGSSNTEFKSTKEGFSIAVSADGFKFGISEPGNQEKKSEKPLENDTGFQAQDISGQKNGRGVIFGQTSSTFTFADVAKSTSGEGFQFGKKDPNFKGFSGAGEKLFSSQCGKMANKANTSGDFEKDDDACKTEDSDDIHFEPVVQMPEKVELVTGEEGEKVLYSQGVKLFRFDAEISQWKERGLGNLKILKNEVNGKPRMLMRRDQVLKVCANHWITTTMNLKPLSGSDRAWMWLASDFSDGDAKLERLAAQFKTPELAEEFKQKFEECQRLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRAEEMKSGLKDFKTFLTNDQTKVTEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNPENTGPTLEWDNYDLREDALDDNVSSSSVHDSPLASSPVRKNIFRFDESTTGFNFSFKSALSLSKSPAKLNQSGTSVGTDEESDVTQEEERDGQYFEPVVPLPDLVEVSSGEENEQVVFSHMAELYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKLCANHRITPDMSLQNMKGTERVWVWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQEKDSLITPHVSRSSTPRESPCGKIAVAVLEETTRERTDVIQGDDVADAASEVEVSSTSETTTKAVVSPPKFVFGSESVKRIFSSEKSNPFAFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNDSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKVKNLSASFPMEESSINYTFKTPEKEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKSADQLNGLLRETEATSAVLMEQIKLLKSEIRRLERNQEESAANVEHLKNVLLQFIFLK--PGSERESLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGLQETSIPKKK 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NEKTLDNKIEKKKQELERQEKRLSTLQSVRPAYMDEYERLQGELNGLYQSYLDRFRNLEFLENELEAYYQAEQEKMEAQERRLKKMQKRLKE------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8bd7.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 1643 1643 ? A 480.256 410.369 393.148 1 1 V THR 0.510 1 ATOM 2 C CA . THR 1643 1643 ? A 481.370 410.027 392.160 1 1 V THR 0.510 1 ATOM 3 C C . THR 1643 1643 ? A 482.622 410.867 392.260 1 1 V THR 0.510 1 ATOM 4 O O . THR 1643 1643 ? A 483.719 410.330 392.349 1 1 V THR 0.510 1 ATOM 5 C CB . THR 1643 1643 ? A 480.888 410.084 390.704 1 1 V THR 0.510 1 ATOM 6 O OG1 . THR 1643 1643 ? A 479.721 409.290 390.596 1 1 V THR 0.510 1 ATOM 7 C CG2 . THR 1643 1643 ? A 481.936 409.532 389.710 1 1 V THR 0.510 1 ATOM 8 N N . LYS 1644 1644 ? A 482.526 412.224 392.265 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 9 C CA . LYS 1644 1644 ? A 483.685 413.099 392.394 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 10 C C . LYS 1644 1644 ? A 484.456 412.889 393.682 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 11 O O . LYS 1644 1644 ? A 485.653 412.647 393.646 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 12 C CB . LYS 1644 1644 ? A 483.239 414.578 392.314 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 13 C CG . LYS 1644 1644 ? A 482.753 414.955 390.907 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 14 C CD . LYS 1644 1644 ? A 482.298 416.422 390.826 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 15 C CE . LYS 1644 1644 ? A 481.826 416.816 389.419 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 16 N NZ . LYS 1644 1644 ? A 481.345 418.216 389.407 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 17 N N . GLU 1645 1645 ? A 483.760 412.856 394.838 1 1 V GLU 0.500 1 ATOM 18 C CA . GLU 1645 1645 ? A 484.366 412.581 396.122 1 1 V GLU 0.500 1 ATOM 19 C C . GLU 1645 1645 ? A 484.974 411.184 396.175 1 1 V GLU 0.500 1 ATOM 20 O O . GLU 1645 1645 ? A 486.076 410.986 396.656 1 1 V GLU 0.500 1 ATOM 21 C CB . GLU 1645 1645 ? A 483.345 412.849 397.259 1 1 V GLU 0.500 1 ATOM 22 C CG . GLU 1645 1645 ? A 483.915 412.553 398.666 1 1 V GLU 0.500 1 ATOM 23 C CD . GLU 1645 1645 ? A 485.152 413.365 399.047 1 1 V GLU 0.500 1 ATOM 24 O OE1 . GLU 1645 1645 ? A 485.810 412.911 400.021 1 1 V GLU 0.500 1 ATOM 25 O OE2 . GLU 1645 1645 ? A 485.452 414.391 398.391 1 1 V GLU 0.500 1 ATOM 26 N N . GLU 1646 1646 ? A 484.336 410.163 395.571 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 27 C CA . GLU 1646 1646 ? A 484.925 408.843 395.442 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 28 C C . GLU 1646 1646 ? A 486.197 408.828 394.619 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 29 O O . GLU 1646 1646 ? A 487.117 408.063 394.876 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 30 C CB . GLU 1646 1646 ? A 483.960 407.877 394.754 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 31 C CG . GLU 1646 1646 ? A 482.718 407.565 395.605 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 32 C CD . GLU 1646 1646 ? A 481.734 406.770 394.763 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 33 O OE1 . GLU 1646 1646 ? A 481.974 406.666 393.530 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 34 O OE2 . GLU 1646 1646 ? A 480.694 406.364 395.324 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 35 N N . LEU 1647 1647 ? A 486.290 409.624 393.538 1 1 V LEU 0.550 1 ATOM 36 C CA . LEU 1647 1647 ? A 487.533 409.835 392.819 1 1 V LEU 0.550 1 ATOM 37 C C . LEU 1647 1647 ? A 488.611 410.538 393.628 1 1 V LEU 0.550 1 ATOM 38 O O . LEU 1647 1647 ? A 489.748 410.071 393.669 1 1 V LEU 0.550 1 ATOM 39 C CB . LEU 1647 1647 ? A 487.273 410.602 391.508 1 1 V LEU 0.550 1 ATOM 40 C CG . LEU 1647 1647 ? 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A 495.199 409.135 399.861 1 1 V SER 0.620 1 ATOM 80 C CB . SER 1652 1652 ? A 492.783 411.251 399.477 1 1 V SER 0.620 1 ATOM 81 O OG . SER 1652 1652 ? A 491.733 410.475 400.045 1 1 V SER 0.620 1 ATOM 82 N N . SER 1653 1653 ? A 493.514 408.073 398.874 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 83 C CA . SER 1653 1653 ? A 493.895 406.762 399.378 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 84 C C . SER 1653 1653 ? A 495.204 406.250 398.812 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 85 O O . SER 1653 1653 ? A 496.039 405.744 399.551 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 86 C CB . SER 1653 1653 ? A 492.817 405.671 399.159 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 87 O OG . SER 1653 1653 ? A 491.726 405.875 400.051 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 88 N N . THR 1654 1654 ? A 495.453 406.383 397.490 1 1 V THR 0.580 1 ATOM 89 C CA . THR 1654 1654 ? A 496.717 405.983 396.864 1 1 V THR 0.580 1 ATOM 90 C C . THR 1654 1654 ? A 497.894 406.820 397.305 1 1 V THR 0.580 1 ATOM 91 O O . THR 1654 1654 ? A 498.978 406.281 397.539 1 1 V THR 0.580 1 ATOM 92 C CB . THR 1654 1654 ? 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A 533.362 426.121 461.770 1 1 V PHE 0.390 1 ATOM 561 C CZ . PHE 1712 1712 ? A 532.403 427.084 461.422 1 1 V PHE 0.390 1 ATOM 562 N N . LEU 1713 1713 ? A 528.812 423.359 464.229 1 1 V LEU 0.430 1 ATOM 563 C CA . LEU 1713 1713 ? A 527.733 424.123 464.847 1 1 V LEU 0.430 1 ATOM 564 C C . LEU 1713 1713 ? A 527.660 424.013 466.362 1 1 V LEU 0.430 1 ATOM 565 O O . LEU 1713 1713 ? A 526.766 424.581 466.988 1 1 V LEU 0.430 1 ATOM 566 C CB . LEU 1713 1713 ? A 526.338 423.657 464.336 1 1 V LEU 0.430 1 ATOM 567 C CG . LEU 1713 1713 ? A 526.055 423.932 462.847 1 1 V LEU 0.430 1 ATOM 568 C CD1 . LEU 1713 1713 ? A 524.715 423.277 462.462 1 1 V LEU 0.430 1 ATOM 569 C CD2 . LEU 1713 1713 ? A 526.082 425.435 462.506 1 1 V LEU 0.430 1 ATOM 570 N N . LYS 1714 1714 ? A 528.583 423.273 467.005 1 1 V LYS 0.500 1 ATOM 571 C CA . LYS 1714 1714 ? A 528.653 423.143 468.438 1 1 V LYS 0.500 1 ATOM 572 C C . LYS 1714 1714 ? A 528.780 424.509 469.144 1 1 V LYS 0.500 1 ATOM 573 O O . LYS 1714 1714 ? A 529.695 425.268 468.818 1 1 V LYS 0.500 1 ATOM 574 C CB . LYS 1714 1714 ? A 529.878 422.273 468.814 1 1 V LYS 0.500 1 ATOM 575 C CG . LYS 1714 1714 ? A 529.990 421.979 470.314 1 1 V LYS 0.500 1 ATOM 576 C CD . LYS 1714 1714 ? A 531.150 421.032 470.644 1 1 V LYS 0.500 1 ATOM 577 C CE . LYS 1714 1714 ? A 531.229 420.764 472.149 1 1 V LYS 0.500 1 ATOM 578 N NZ . LYS 1714 1714 ? A 532.349 419.848 472.440 1 1 V LYS 0.500 1 ATOM 579 N N . PRO 1715 1715 ? A 527.977 424.887 470.139 1 1 V PRO 0.470 1 ATOM 580 C CA . PRO 1715 1715 ? A 528.029 426.214 470.751 1 1 V PRO 0.470 1 ATOM 581 C C . PRO 1715 1715 ? A 529.097 426.206 471.834 1 1 V PRO 0.470 1 ATOM 582 O O . PRO 1715 1715 ? A 528.840 426.527 472.995 1 1 V PRO 0.470 1 ATOM 583 C CB . PRO 1715 1715 ? A 526.598 426.386 471.302 1 1 V PRO 0.470 1 ATOM 584 C CG . PRO 1715 1715 ? A 526.121 424.959 471.629 1 1 V PRO 0.470 1 ATOM 585 C CD . PRO 1715 1715 ? A 526.902 424.059 470.667 1 1 V PRO 0.470 1 ATOM 586 N N . GLY 1716 1716 ? A 530.337 425.839 471.449 1 1 V GLY 0.570 1 ATOM 587 C CA . GLY 1716 1716 ? A 531.494 425.757 472.324 1 1 V GLY 0.570 1 ATOM 588 C C . GLY 1716 1716 ? A 532.306 427.012 472.308 1 1 V GLY 0.570 1 ATOM 589 O O . GLY 1716 1716 ? A 533.218 427.155 473.110 1 1 V GLY 0.570 1 ATOM 590 N N . SER 1717 1717 ? A 531.978 427.946 471.392 1 1 V SER 0.590 1 ATOM 591 C CA . SER 1717 1717 ? A 532.792 429.128 471.145 1 1 V SER 0.590 1 ATOM 592 C C . SER 1717 1717 ? A 532.019 430.412 471.328 1 1 V SER 0.590 1 ATOM 593 O O . SER 1717 1717 ? A 532.575 431.392 471.774 1 1 V SER 0.590 1 ATOM 594 C CB . SER 1717 1717 ? A 533.353 429.188 469.703 1 1 V SER 0.590 1 ATOM 595 O OG . SER 1717 1717 ? A 534.183 428.054 469.464 1 1 V SER 0.590 1 ATOM 596 N N . GLU 1718 1718 ? A 530.705 430.480 471.012 1 1 V GLU 0.610 1 ATOM 597 C CA . GLU 1718 1718 ? A 529.904 431.674 471.266 1 1 V GLU 0.610 1 ATOM 598 C C . GLU 1718 1718 ? A 529.686 431.988 472.730 1 1 V GLU 0.610 1 ATOM 599 O O . GLU 1718 1718 ? A 529.860 433.110 473.184 1 1 V GLU 0.610 1 ATOM 600 C CB . GLU 1718 1718 ? A 528.521 431.532 470.618 1 1 V GLU 0.610 1 ATOM 601 C CG . GLU 1718 1718 ? A 528.592 431.575 469.078 1 1 V GLU 0.610 1 ATOM 602 C CD . GLU 1718 1718 ? A 527.217 431.336 468.467 1 1 V GLU 0.610 1 ATOM 603 O OE1 . GLU 1718 1718 ? A 526.280 430.979 469.228 1 1 V GLU 0.610 1 ATOM 604 O OE2 . GLU 1718 1718 ? A 527.114 431.499 467.227 1 1 V GLU 0.610 1 ATOM 605 N N . ARG 1719 1719 ? A 529.359 430.980 473.562 1 1 V ARG 0.560 1 ATOM 606 C CA . ARG 1719 1719 ? A 529.324 431.173 475.000 1 1 V ARG 0.560 1 ATOM 607 C C . ARG 1719 1719 ? A 530.711 431.459 475.528 1 1 V ARG 0.560 1 ATOM 608 O O . ARG 1719 1719 ? A 530.870 432.243 476.459 1 1 V ARG 0.560 1 ATOM 609 C CB . ARG 1719 1719 ? A 528.802 429.932 475.733 1 1 V ARG 0.560 1 ATOM 610 C CG . ARG 1719 1719 ? A 527.311 429.706 475.471 1 1 V ARG 0.560 1 ATOM 611 C CD . ARG 1719 1719 ? A 526.843 428.451 476.191 1 1 V ARG 0.560 1 ATOM 612 N NE . ARG 1719 1719 ? 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A 532.989 433.218 473.768 1 1 V SER 0.640 1 ATOM 626 C CA . SER 1721 1721 ? A 533.239 434.644 473.588 1 1 V SER 0.640 1 ATOM 627 C C . SER 1721 1721 ? A 532.396 435.561 474.474 1 1 V SER 0.640 1 ATOM 628 O O . SER 1721 1721 ? A 532.854 436.620 474.903 1 1 V SER 0.640 1 ATOM 629 C CB . SER 1721 1721 ? A 533.067 435.169 472.138 1 1 V SER 0.640 1 ATOM 630 O OG . SER 1721 1721 ? A 531.737 434.969 471.643 1 1 V SER 0.640 1 ATOM 631 N N . LEU 1722 1722 ? A 531.141 435.190 474.802 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 632 C CA . LEU 1722 1722 ? A 530.276 435.962 475.686 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 633 C C . LEU 1722 1722 ? A 530.824 436.082 477.111 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 634 O O . LEU 1722 1722 ? A 530.868 437.177 477.661 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 635 C CB . LEU 1722 1722 ? A 528.812 435.442 475.636 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 636 C CG . LEU 1722 1722 ? A 528.157 435.630 474.241 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 637 C CD1 . LEU 1722 1722 ? A 526.799 434.911 474.196 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 638 C CD2 . LEU 1722 1722 ? 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A 537.248 449.074 479.747 1 1 V LEU 0.560 1 ATOM 717 O OXT . LEU 1732 1732 ? A 535.037 450.121 483.544 1 1 V LEU 0.560 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.566 2 1 3 0.016 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1643 THR 1 0.510 2 1 A 1644 LYS 1 0.510 3 1 A 1645 GLU 1 0.500 4 1 A 1646 GLU 1 0.530 5 1 A 1647 LEU 1 0.550 6 1 A 1648 VAL 1 0.570 7 1 A 1649 GLN 1 0.580 8 1 A 1650 LYS 1 0.630 9 1 A 1651 LEU 1 0.600 10 1 A 1652 SER 1 0.620 11 1 A 1653 SER 1 0.610 12 1 A 1654 THR 1 0.580 13 1 A 1655 THR 1 0.580 14 1 A 1656 LYS 1 0.540 15 1 A 1657 SER 1 0.550 16 1 A 1658 ALA 1 0.560 17 1 A 1659 ASP 1 0.570 18 1 A 1660 GLN 1 0.570 19 1 A 1661 LEU 1 0.570 20 1 A 1662 ASN 1 0.590 21 1 A 1663 GLY 1 0.600 22 1 A 1664 LEU 1 0.610 23 1 A 1665 LEU 1 0.630 24 1 A 1666 ARG 1 0.580 25 1 A 1667 GLU 1 0.560 26 1 A 1668 THR 1 0.580 27 1 A 1669 GLU 1 0.530 28 1 A 1670 ALA 1 0.560 29 1 A 1671 THR 1 0.470 30 1 A 1672 SER 1 0.470 31 1 A 1673 ALA 1 0.500 32 1 A 1674 VAL 1 0.430 33 1 A 1675 LEU 1 0.470 34 1 A 1676 MET 1 0.480 35 1 A 1677 GLU 1 0.530 36 1 A 1678 GLN 1 0.590 37 1 A 1679 ILE 1 0.560 38 1 A 1680 LYS 1 0.550 39 1 A 1681 LEU 1 0.670 40 1 A 1682 LEU 1 0.680 41 1 A 1683 LYS 1 0.560 42 1 A 1684 SER 1 0.630 43 1 A 1685 GLU 1 0.600 44 1 A 1686 ILE 1 0.590 45 1 A 1687 ARG 1 0.530 46 1 A 1688 ARG 1 0.520 47 1 A 1689 LEU 1 0.530 48 1 A 1690 GLU 1 0.550 49 1 A 1691 ARG 1 0.490 50 1 A 1692 ASN 1 0.540 51 1 A 1693 GLN 1 0.670 52 1 A 1694 GLU 1 0.610 53 1 A 1695 GLU 1 0.580 54 1 A 1696 SER 1 0.620 55 1 A 1697 ALA 1 0.640 56 1 A 1698 ALA 1 0.620 57 1 A 1699 ASN 1 0.570 58 1 A 1700 VAL 1 0.600 59 1 A 1701 GLU 1 0.560 60 1 A 1702 HIS 1 0.560 61 1 A 1703 LEU 1 0.590 62 1 A 1704 LYS 1 0.600 63 1 A 1705 ASN 1 0.580 64 1 A 1706 VAL 1 0.590 65 1 A 1707 LEU 1 0.570 66 1 A 1708 LEU 1 0.540 67 1 A 1709 GLN 1 0.540 68 1 A 1710 PHE 1 0.440 69 1 A 1711 ILE 1 0.460 70 1 A 1712 PHE 1 0.390 71 1 A 1713 LEU 1 0.430 72 1 A 1714 LYS 1 0.500 73 1 A 1715 PRO 1 0.470 74 1 A 1716 GLY 1 0.570 75 1 A 1717 SER 1 0.590 76 1 A 1718 GLU 1 0.610 77 1 A 1719 ARG 1 0.560 78 1 A 1720 GLU 1 0.660 79 1 A 1721 SER 1 0.640 80 1 A 1722 LEU 1 0.620 81 1 A 1723 LEU 1 0.610 82 1 A 1724 PRO 1 0.610 83 1 A 1725 VAL 1 0.690 84 1 A 1726 ILE 1 0.640 85 1 A 1727 ASN 1 0.670 86 1 A 1728 THR 1 0.680 87 1 A 1729 MET 1 0.480 88 1 A 1730 LEU 1 0.530 89 1 A 1731 GLN 1 0.590 90 1 A 1732 LEU 1 0.560 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #