data_SMR-11135b0bb46b631fc38ab83caafdcdae_7 _entry.id SMR-11135b0bb46b631fc38ab83caafdcdae_7 _struct.entry_id SMR-11135b0bb46b631fc38ab83caafdcdae_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q7Z3J3/ RGPD4_HUMAN, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4 Estimated model accuracy of this model is 0.015, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q7Z3J3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 229205.572 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RGPD4_HUMAN Q7Z3J3 1 ;MSCSKAYGERYVASVQGSAPSPRKKSTRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYICTYINVREMDPRAHRFLGLLY ELEENTEKAVECYRRSVELNPTQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEQLLD CEGEDGWNKLFDLIQSELYVRPDDVHVNIRLVELYRSTKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQT LKEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELS ATFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHGNNVQWRALSELAALCYLIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACD RLSQSGHMLLNLSRGKQDFLKVVVETFANKSGQSALYDALFSSQSPKDTSFLGSDDIGNIDVQEPELEDL ARYDVGAIRAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLL GVVYTSHLQLKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKQLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAKLRLLVQHEI NTLRAQEKHGLQPALLVHWAKCLQKMGSGLNSFYDQREYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKKNSIPEPIDPL FKHFHSVDIQASEIVEYEEDAHVTFAILDAVNGNIEDAMTAFESIKSVVSYWNLALIFHRKAEDIANDAL SPEEQEECKNYLRKTRGYLIKILDDSDSNLSVVKKLPVPLESVKEMLKSVMQELENYSEGDPLYKNGSLR NADSEIKHSTPSPTKYSLSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNSLLKMIRQEVKAIKEEMQELKLNSSKSASHH RWPTENYGPDSVPDGYQGSQTFHGAPLTVATTGPSVYYSQSPAYNSQYLLRPAANVTPTKGSSNTEFKST KEGFSIPVSADGFKFGISEPGNQEKESEKPLENDTGFQAQDISGQKNGRGVIFGQTSSTFTFADVAKSTS GEGFQFGKKDPNFKGFSGAGEKLFSSQCGKMANKANTSGDFEKDDDAYKTEDSDDIHFEPVVQMPEKVEL VIGEEGEKVLYSQGVKLFRFDAEVRQWKERGLGNLKILKNEVNGKPRMLMRREQVLKVCANHWITTTMNL KPLSGSDRAWMWSASDFSDGDAKLERLAAKFKTPELAEEFKQKFEECQQLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAK LIQRAEEMKSGLKDFKTFLTNDQTKVTEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNPENTGPTLEWDNCDLREDALD DSVSSSSVHASPLASSPVRKNLFHFGESTTGSNFSFKSALSPSKSPAKLNQSGTSVGTDEESDVTQEEER DGQYFEPVVPLPDLVEVSSGEENEKVVFSHRAELYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRD QVLKLCANHTITPDMSLQNMKGTERVWVWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQEK DSLITPHVSRSSTPRESPCGKIAVAVLEETTRERTDVIQGDDVADAASEVEVSSTSETTTKAVVSPPKFV FGSESVKRIFSSEKSKPFAFGNSSATGSLFGFSFNASLKSNNSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDI EQSSDSKVKNLSASFPMEESSINYTFKTPEKEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKSADHLNGLLREAEATS AVLMEQIKLLKSEIRRLERNQEQEESAANVEHLKNVLLQFIFLKPGSERERLLPVINTMLQLSPEEKGKL AAVAQGEE ; 'RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1758 1 1758 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . RGPD4_HUMAN Q7Z3J3 . 1 1758 9606 'Homo sapiens (Human)' 2011-03-08 03C915030A2F1BD3 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no V ;MSCSKAYGERYVASVQGSAPSPRKKSTRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYICTYINVREMDPRAHRFLGLLY ELEENTEKAVECYRRSVELNPTQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEQLLD CEGEDGWNKLFDLIQSELYVRPDDVHVNIRLVELYRSTKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQT LKEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELS ATFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHGNNVQWRALSELAALCYLIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACD RLSQSGHMLLNLSRGKQDFLKVVVETFANKSGQSALYDALFSSQSPKDTSFLGSDDIGNIDVQEPELEDL ARYDVGAIRAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLL GVVYTSHLQLKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKQLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAKLRLLVQHEI NTLRAQEKHGLQPALLVHWAKCLQKMGSGLNSFYDQREYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKKNSIPEPIDPL 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AAVAQGEE ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 SER . 1 3 CYS . 1 4 SER . 1 5 LYS . 1 6 ALA . 1 7 TYR . 1 8 GLY . 1 9 GLU . 1 10 ARG . 1 11 TYR . 1 12 VAL . 1 13 ALA . 1 14 SER . 1 15 VAL . 1 16 GLN . 1 17 GLY . 1 18 SER . 1 19 ALA . 1 20 PRO . 1 21 SER . 1 22 PRO . 1 23 ARG . 1 24 LYS . 1 25 LYS . 1 26 SER . 1 27 THR . 1 28 ARG . 1 29 GLY . 1 30 PHE . 1 31 TYR . 1 32 PHE . 1 33 ALA . 1 34 LYS . 1 35 LEU . 1 36 TYR . 1 37 TYR . 1 38 GLU . 1 39 ALA . 1 40 LYS . 1 41 GLU . 1 42 TYR . 1 43 ASP . 1 44 LEU . 1 45 ALA . 1 46 LYS . 1 47 LYS . 1 48 TYR . 1 49 ILE . 1 50 CYS . 1 51 THR . 1 52 TYR . 1 53 ILE . 1 54 ASN . 1 55 VAL . 1 56 ARG . 1 57 GLU . 1 58 MET . 1 59 ASP . 1 60 PRO . 1 61 ARG . 1 62 ALA . 1 63 HIS . 1 64 ARG . 1 65 PHE . 1 66 LEU . 1 67 GLY . 1 68 LEU . 1 69 LEU . 1 70 TYR . 1 71 GLU . 1 72 LEU . 1 73 GLU . 1 74 GLU . 1 75 ASN . 1 76 THR . 1 77 GLU . 1 78 LYS . 1 79 ALA . 1 80 VAL . 1 81 GLU . 1 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A 1 1717 LEU 1717 1717 LEU LEU V . A 1 1718 LEU 1718 1718 LEU LEU V . A 1 1719 GLN 1719 1719 GLN GLN V . A 1 1720 PHE 1720 1720 PHE PHE V . A 1 1721 ILE 1721 1721 ILE ILE V . A 1 1722 PHE 1722 1722 PHE PHE V . A 1 1723 LEU 1723 1723 LEU LEU V . A 1 1724 LYS 1724 1724 LYS LYS V . A 1 1725 PRO 1725 1725 PRO PRO V . A 1 1726 GLY 1726 1726 GLY GLY V . A 1 1727 SER 1727 1727 SER SER V . A 1 1728 GLU 1728 1728 GLU GLU V . A 1 1729 ARG 1729 1729 ARG ARG V . A 1 1730 GLU 1730 1730 GLU GLU V . A 1 1731 ARG 1731 1731 ARG ARG V . A 1 1732 LEU 1732 1732 LEU LEU V . A 1 1733 LEU 1733 1733 LEU LEU V . A 1 1734 PRO 1734 1734 PRO PRO V . A 1 1735 VAL 1735 1735 VAL VAL V . A 1 1736 ILE 1736 1736 ILE ILE V . A 1 1737 ASN 1737 1737 ASN ASN V . A 1 1738 THR 1738 1738 THR THR V . A 1 1739 MET 1739 1739 MET MET V . A 1 1740 LEU 1740 1740 LEU LEU V . A 1 1741 GLN 1741 1741 GLN GLN V . A 1 1742 LEU 1742 1742 LEU LEU V . A 1 1743 SER 1743 ? ? ? V . A 1 1744 PRO 1744 ? ? ? V . A 1 1745 GLU 1745 ? ? ? V . A 1 1746 GLU 1746 ? ? ? V . A 1 1747 LYS 1747 ? ? ? V . A 1 1748 GLY 1748 ? ? ? V . A 1 1749 LYS 1749 ? ? ? V . A 1 1750 LEU 1750 ? ? ? V . A 1 1751 ALA 1751 ? ? ? V . A 1 1752 ALA 1752 ? ? ? V . A 1 1753 VAL 1753 ? ? ? V . A 1 1754 ALA 1754 ? ? ? V . A 1 1755 GLN 1755 ? ? ? V . A 1 1756 GLY 1756 ? ? ? V . A 1 1757 GLU 1757 ? ? ? V . A 1 1758 GLU 1758 ? ? ? V . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Clusterin-associated protein 1 {PDB ID=8bd7, label_asym_id=V, auth_asym_id=T, SMTL ID=8bd7.1.V}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8bd7, label_asym_id=V' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A V 9 1 T # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSFRELRSFTEVMKALGYPRLISMENFRVPNFELVADCLYWLVHRYYPGVEIADDISTESDRVKFLQSVA QVMLTKARMKLNIKRLYAADGNAVKELLKLASLLYKATSKAGDMDDDAAEAIDVANSLKGFNPKEIKGLA AEIIKAGAGLYDALGQEPELREHRARAVAGHVDTDFVERSIREAIAQVEDNIRSLENQMEDLERNEKTLD NKIEKKKQELERQEKRLSTLQSVRPAYMDEYERLQGELNGLYQSYLDRFRNLEFLENELEAYYQAEQEKM EAQERRLKKMQKRLKEEELRILRGEQEVDEANMNFDDDDMDLSEDGEHEEAEEGEDEDYGAGGQKATMRR DQFGGQGGGGGGGRQQGGGRNVMGNLDGDFDDEASIDEDDNTDGGEVSRQGSQAGGMGGGGGYGGGGGYM NGGGMDDDENNLIQDDDEDDNDF ; ;MSFRELRSFTEVMKALGYPRLISMENFRVPNFELVADCLYWLVHRYYPGVEIADDISTESDRVKFLQSVA QVMLTKARMKLNIKRLYAADGNAVKELLKLASLLYKATSKAGDMDDDAAEAIDVANSLKGFNPKEIKGLA AEIIKAGAGLYDALGQEPELREHRARAVAGHVDTDFVERSIREAIAQVEDNIRSLENQMEDLERNEKTLD NKIEKKKQELERQEKRLSTLQSVRPAYMDEYERLQGELNGLYQSYLDRFRNLEFLENELEAYYQAEQEKM EAQERRLKKMQKRLKEEELRILRGEQEVDEANMNFDDDDMDLSEDGEHEEAEEGEDEDYGAGGQKATMRR DQFGGQGGGGGGGRQQGGGRNVMGNLDGDFDDEASIDEDDNTDGGEVSRQGSQAGGMGGGGGYGGGGGYM NGGGMDDDENNLIQDDDEDDNDF ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 205 296 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8bd7 2024-11-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1758 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1760 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 11.000 17.778 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSCSKAYGERYVASVQGSAPSPRKKSTRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYICTYINVREMDPRAHRFLGLLYELEENTEKAVECYRRSVELNPTQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEQLLDCEGEDGWNKLFDLIQSELYVRPDDVHVNIRLVELYRSTKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTLKEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELSATFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHGNNVQWRALSELAALCYLIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDRLSQSGHMLLNLSRGKQDFLKVVVETFANKSGQSALYDALFSSQSPKDTSFLGSDDIGNIDVQEPELEDLARYDVGAIRAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLLGVVYTSHLQLKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKQLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAKLRLLVQHEINTLRAQEKHGLQPALLVHWAKCLQKMGSGLNSFYDQREYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKKNSIPEPIDPLFKHFHSVDIQASEIVEYEEDAHVTFAILDAVNGNIEDAMTAFESIKSVVSYWNLALIFHRKAEDIANDALSPEEQEECKNYLRKTRGYLIKILDDSDSNLSVVKKLPVPLESVKEMLKSVMQELENYSEGDPLYKNGSLRNADSEIKHSTPSPTKYSLSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNSLLKMIRQEVKAIKEEMQELKLNSSKSASHHRWPTENYGPDSVPDGYQGSQTFHGAPLTVATTGPSVYYSQSPAYNSQYLLRPAANVTPTKGSSNTEFKSTKEGFSIPVSADGFKFGISEPGNQEKESEKPLENDTGFQAQDISGQKNGRGVIFGQTSSTFTFADVAKSTSGEGFQFGKKDPNFKGFSGAGEKLFSSQCGKMANKANTSGDFEKDDDAYKTEDSDDIHFEPVVQMPEKVELVIGEEGEKVLYSQGVKLFRFDAEVRQWKERGLGNLKILKNEVNGKPRMLMRREQVLKVCANHWITTTMNLKPLSGSDRAWMWSASDFSDGDAKLERLAAKFKTPELAEEFKQKFEECQQLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRAEEMKSGLKDFKTFLTNDQTKVTEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNPENTGPTLEWDNCDLREDALDDSVSSSSVHASPLASSPVRKNLFHFGESTTGSNFSFKSALSPSKSPAKLNQSGTSVGTDEESDVTQEEERDGQYFEPVVPLPDLVEVSSGEENEKVVFSHRAELYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKLCANHTITPDMSLQNMKGTERVWVWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQEKDSLITPHVSRSSTPRESPCGKIAVAVLEETTRERTDVIQGDDVADAASEVEVSSTSETTTKAVVSPPKFVFGSESVKRIFSSEKSKPFAFGNSSATGSLFGFSFNASLKSNNSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKVKNLSASFPMEESSINYTFKTPEKEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKSADHLNGLLREAEATSAVLMEQIKLLKSEIRRLERNQEQEESAANVEHLKNVLLQFIFLK--PGSERERLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGEE 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NEKTLDNKIEKKKQELERQEKRLSTLQSVRPAYMDEYERLQGELNGLYQSYLD-R-FRNLEFLENELEAYYQAEQEKMEAQERRLKKMQKRLKE---------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8bd7.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 1651 1651 ? A 480.255 410.363 393.144 1 1 V THR 0.450 1 ATOM 2 C CA . THR 1651 1651 ? A 481.369 410.035 392.159 1 1 V THR 0.450 1 ATOM 3 C C . THR 1651 1651 ? A 482.621 410.872 392.263 1 1 V THR 0.450 1 ATOM 4 O O . THR 1651 1651 ? A 483.719 410.335 392.352 1 1 V THR 0.450 1 ATOM 5 C CB . THR 1651 1651 ? A 480.885 410.080 390.706 1 1 V THR 0.450 1 ATOM 6 O OG1 . THR 1651 1651 ? A 479.716 409.286 390.590 1 1 V THR 0.450 1 ATOM 7 C CG2 . THR 1651 1651 ? A 481.933 409.531 389.716 1 1 V THR 0.450 1 ATOM 8 N N . LYS 1652 1652 ? A 482.522 412.225 392.271 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 9 C CA . LYS 1652 1652 ? A 483.684 413.097 392.399 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 10 C C . LYS 1652 1652 ? A 484.457 412.889 393.686 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 11 O O . LYS 1652 1652 ? A 485.658 412.653 393.655 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 12 C CB . LYS 1652 1652 ? A 483.242 414.575 392.311 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 13 C CG . LYS 1652 1652 ? A 482.753 414.955 390.906 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 14 C CD . LYS 1652 1652 ? A 482.297 416.422 390.825 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 15 C CE . LYS 1652 1652 ? A 481.825 416.818 389.420 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 16 N NZ . LYS 1652 1652 ? A 481.345 418.219 389.408 1 1 V LYS 0.510 1 ATOM 17 N N . GLU 1653 1653 ? A 483.758 412.858 394.836 1 1 V GLU 0.490 1 ATOM 18 C CA . GLU 1653 1653 ? A 484.362 412.577 396.119 1 1 V GLU 0.490 1 ATOM 19 C C . GLU 1653 1653 ? A 484.975 411.186 396.172 1 1 V GLU 0.490 1 ATOM 20 O O . GLU 1653 1653 ? A 486.075 410.990 396.666 1 1 V GLU 0.490 1 ATOM 21 C CB . GLU 1653 1653 ? A 483.352 412.846 397.259 1 1 V GLU 0.490 1 ATOM 22 C CG . GLU 1653 1653 ? A 483.918 412.551 398.665 1 1 V GLU 0.490 1 ATOM 23 C CD . GLU 1653 1653 ? A 485.154 413.363 399.050 1 1 V GLU 0.490 1 ATOM 24 O OE1 . GLU 1653 1653 ? A 485.812 412.913 400.025 1 1 V GLU 0.490 1 ATOM 25 O OE2 . GLU 1653 1653 ? A 485.450 414.389 398.391 1 1 V GLU 0.490 1 ATOM 26 N N . GLU 1654 1654 ? A 484.337 410.166 395.568 1 1 V GLU 0.500 1 ATOM 27 C CA . GLU 1654 1654 ? 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A 488.531 410.810 390.635 1 1 V LEU 0.570 1 ATOM 41 C CD1 . LEU 1655 1655 ? A 489.170 409.490 390.168 1 1 V LEU 0.570 1 ATOM 42 C CD2 . LEU 1655 1655 ? A 488.178 411.708 389.443 1 1 V LEU 0.570 1 ATOM 43 N N . VAL 1656 1656 ? A 488.257 411.627 394.344 1 1 V VAL 0.610 1 ATOM 44 C CA . VAL 1656 1656 ? A 489.147 412.345 395.247 1 1 V VAL 0.610 1 ATOM 45 C C . VAL 1656 1656 ? A 489.634 411.447 396.376 1 1 V VAL 0.610 1 ATOM 46 O O . VAL 1656 1656 ? A 490.825 411.386 396.672 1 1 V VAL 0.610 1 ATOM 47 C CB . VAL 1656 1656 ? A 488.470 413.596 395.798 1 1 V VAL 0.610 1 ATOM 48 C CG1 . VAL 1656 1656 ? A 489.345 414.300 396.856 1 1 V VAL 0.610 1 ATOM 49 C CG2 . VAL 1656 1656 ? A 488.199 414.567 394.631 1 1 V VAL 0.610 1 ATOM 50 N N . GLN 1657 1657 ? A 488.734 410.651 396.984 1 1 V GLN 0.610 1 ATOM 51 C CA . GLN 1657 1657 ? A 489.061 409.624 397.955 1 1 V GLN 0.610 1 ATOM 52 C C . GLN 1657 1657 ? A 489.964 408.538 397.431 1 1 V GLN 0.610 1 ATOM 53 O O . GLN 1657 1657 ? 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A 488.073 406.061 392.046 1 1 V LYS 0.650 1 ATOM 67 N NZ . LYS 1658 1658 ? A 486.724 406.430 392.518 1 1 V LYS 0.650 1 ATOM 68 N N . LEU 1659 1659 ? A 492.254 408.971 394.898 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 69 C CA . LEU 1659 1659 ? A 493.523 409.669 394.791 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 70 C C . LEU 1659 1659 ? A 494.140 409.913 396.152 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 71 O O . LEU 1659 1659 ? A 495.324 409.675 396.356 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 72 C CB . LEU 1659 1659 ? A 493.364 411.027 394.067 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 73 C CG . LEU 1659 1659 ? A 493.014 410.923 392.571 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 74 C CD1 . LEU 1659 1659 ? A 492.676 412.316 392.016 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 75 C CD2 . LEU 1659 1659 ? A 494.159 410.288 391.762 1 1 V LEU 0.620 1 ATOM 76 N N . SER 1660 1660 ? A 493.331 410.345 397.142 1 1 V SER 0.630 1 ATOM 77 C CA . SER 1660 1660 ? A 493.767 410.488 398.521 1 1 V SER 0.630 1 ATOM 78 C C . SER 1660 1660 ? A 494.214 409.185 399.144 1 1 V SER 0.630 1 ATOM 79 O O . SER 1660 1660 ? 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A 516.377 401.819 414.382 1 1 V SER 0.440 1 ATOM 223 C CA . SER 1680 1680 ? A 517.763 401.388 414.403 1 1 V SER 0.440 1 ATOM 224 C C . SER 1680 1680 ? A 518.578 402.168 413.404 1 1 V SER 0.440 1 ATOM 225 O O . SER 1680 1680 ? A 518.754 401.789 412.247 1 1 V SER 0.440 1 ATOM 226 C CB . SER 1680 1680 ? A 517.915 399.876 414.112 1 1 V SER 0.440 1 ATOM 227 O OG . SER 1680 1680 ? A 519.269 399.421 414.243 1 1 V SER 0.440 1 ATOM 228 N N . ALA 1681 1681 ? A 519.179 403.267 413.886 1 1 V ALA 0.480 1 ATOM 229 C CA . ALA 1681 1681 ? A 520.029 404.139 413.112 1 1 V ALA 0.480 1 ATOM 230 C C . ALA 1681 1681 ? A 521.477 403.691 413.213 1 1 V ALA 0.480 1 ATOM 231 O O . ALA 1681 1681 ? A 522.346 404.434 413.658 1 1 V ALA 0.480 1 ATOM 232 C CB . ALA 1681 1681 ? A 519.886 405.595 413.599 1 1 V ALA 0.480 1 ATOM 233 N N . VAL 1682 1682 ? A 521.768 402.441 412.795 1 1 V VAL 0.390 1 ATOM 234 C CA . VAL 1682 1682 ? A 523.134 401.969 412.621 1 1 V VAL 0.390 1 ATOM 235 C C . VAL 1682 1682 ? 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A 528.152 406.116 416.540 1 1 V GLU 0.420 1 ATOM 262 C CD . GLU 1685 1685 ? A 527.545 407.310 415.811 1 1 V GLU 0.420 1 ATOM 263 O OE1 . GLU 1685 1685 ? A 526.795 407.103 414.826 1 1 V GLU 0.420 1 ATOM 264 O OE2 . GLU 1685 1685 ? A 527.841 408.448 416.257 1 1 V GLU 0.420 1 ATOM 265 N N . GLN 1686 1686 ? A 526.662 403.445 418.482 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 266 C CA . GLN 1686 1686 ? A 526.169 403.366 419.850 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 267 C C . GLN 1686 1686 ? A 526.791 402.238 420.665 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 268 O O . GLN 1686 1686 ? A 527.025 402.377 421.857 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 269 C CB . GLN 1686 1686 ? A 524.621 403.367 419.957 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 270 C CG . GLN 1686 1686 ? A 524.118 403.555 421.415 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 271 C CD . GLN 1686 1686 ? A 522.594 403.630 421.508 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 272 O OE1 . GLN 1686 1686 ? A 521.914 404.267 420.704 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 273 N NE2 . GLN 1686 1686 ? A 522.016 402.965 422.536 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 274 N N . ILE 1687 1687 ? A 527.136 401.096 420.048 1 1 V ILE 0.450 1 ATOM 275 C CA . ILE 1687 1687 ? A 527.902 400.022 420.669 1 1 V ILE 0.450 1 ATOM 276 C C . ILE 1687 1687 ? A 529.279 400.496 421.156 1 1 V ILE 0.450 1 ATOM 277 O O . ILE 1687 1687 ? A 529.704 400.172 422.262 1 1 V ILE 0.450 1 ATOM 278 C CB . ILE 1687 1687 ? A 527.990 398.798 419.751 1 1 V ILE 0.450 1 ATOM 279 C CG1 . ILE 1687 1687 ? A 526.589 398.143 419.587 1 1 V ILE 0.450 1 ATOM 280 C CG2 . ILE 1687 1687 ? A 528.998 397.760 420.296 1 1 V ILE 0.450 1 ATOM 281 C CD1 . ILE 1687 1687 ? A 526.482 397.082 418.479 1 1 V ILE 0.450 1 ATOM 282 N N . LYS 1688 1688 ? A 530.011 401.328 420.380 1 1 V LYS 0.410 1 ATOM 283 C CA . LYS 1688 1688 ? A 531.256 401.915 420.866 1 1 V LYS 0.410 1 ATOM 284 C C . LYS 1688 1688 ? A 531.031 403.110 421.776 1 1 V LYS 0.410 1 ATOM 285 O O . LYS 1688 1688 ? A 531.890 403.449 422.594 1 1 V LYS 0.410 1 ATOM 286 C CB . LYS 1688 1688 ? A 532.203 402.323 419.719 1 1 V LYS 0.410 1 ATOM 287 C CG . LYS 1688 1688 ? A 532.731 401.106 418.950 1 1 V LYS 0.410 1 ATOM 288 C CD . LYS 1688 1688 ? A 533.743 401.513 417.872 1 1 V LYS 0.410 1 ATOM 289 C CE . LYS 1688 1688 ? A 534.282 400.312 417.094 1 1 V LYS 0.410 1 ATOM 290 N NZ . LYS 1688 1688 ? A 535.213 400.770 416.039 1 1 V LYS 0.410 1 ATOM 291 N N . LEU 1689 1689 ? A 529.834 403.732 421.708 1 1 V LEU 0.580 1 ATOM 292 C CA . LEU 1689 1689 ? A 529.388 404.713 422.679 1 1 V LEU 0.580 1 ATOM 293 C C . LEU 1689 1689 ? A 529.180 404.096 424.036 1 1 V LEU 0.580 1 ATOM 294 O O . LEU 1689 1689 ? A 529.346 404.800 425.020 1 1 V LEU 0.580 1 ATOM 295 C CB . LEU 1689 1689 ? A 528.085 405.482 422.338 1 1 V LEU 0.580 1 ATOM 296 C CG . LEU 1689 1689 ? A 528.145 406.409 421.112 1 1 V LEU 0.580 1 ATOM 297 C CD1 . LEU 1689 1689 ? A 526.753 406.987 420.806 1 1 V LEU 0.580 1 ATOM 298 C CD2 . LEU 1689 1689 ? A 529.138 407.560 421.323 1 1 V LEU 0.580 1 ATOM 299 N N . LEU 1690 1690 ? A 528.905 402.778 424.152 1 1 V LEU 0.610 1 ATOM 300 C CA . LEU 1690 1690 ? 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A 526.532 417.553 442.366 1 1 V GLU 0.550 1 ATOM 431 O OE1 . GLU 1704 1704 ? A 525.334 417.704 442.019 1 1 V GLU 0.550 1 ATOM 432 O OE2 . GLU 1704 1704 ? A 527.422 418.430 442.228 1 1 V GLU 0.550 1 ATOM 433 N N . GLU 1705 1705 ? A 524.546 411.905 443.140 1 1 V GLU 0.450 1 ATOM 434 C CA . GLU 1705 1705 ? A 523.408 411.072 443.455 1 1 V GLU 0.450 1 ATOM 435 C C . GLU 1705 1705 ? A 523.850 409.816 444.185 1 1 V GLU 0.450 1 ATOM 436 O O . GLU 1705 1705 ? A 523.040 408.940 444.471 1 1 V GLU 0.450 1 ATOM 437 C CB . GLU 1705 1705 ? A 522.366 410.900 442.314 1 1 V GLU 0.450 1 ATOM 438 C CG . GLU 1705 1705 ? A 521.702 412.262 441.950 1 1 V GLU 0.450 1 ATOM 439 C CD . GLU 1705 1705 ? A 520.880 412.850 443.105 1 1 V GLU 0.450 1 ATOM 440 O OE1 . GLU 1705 1705 ? A 520.405 412.066 443.971 1 1 V GLU 0.450 1 ATOM 441 O OE2 . GLU 1705 1705 ? A 520.723 414.095 443.115 1 1 V GLU 0.450 1 ATOM 442 N N . SER 1706 1706 ? A 525.144 409.720 444.592 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 443 C CA . SER 1706 1706 ? A 525.718 408.486 445.126 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 444 C C . SER 1706 1706 ? A 526.803 408.690 446.182 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 445 O O . SER 1706 1706 ? A 526.526 409.142 447.288 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 446 C CB . SER 1706 1706 ? A 526.330 407.678 443.967 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 447 O OG . SER 1706 1706 ? A 525.342 407.080 443.154 1 1 V SER 0.610 1 ATOM 448 N N . ALA 1707 1707 ? A 528.087 408.333 445.900 1 1 V ALA 0.690 1 ATOM 449 C CA . ALA 1707 1707 ? A 529.186 408.419 446.852 1 1 V ALA 0.690 1 ATOM 450 C C . ALA 1707 1707 ? A 529.445 409.836 447.344 1 1 V ALA 0.690 1 ATOM 451 O O . ALA 1707 1707 ? A 529.612 410.047 448.540 1 1 V ALA 0.690 1 ATOM 452 C CB . ALA 1707 1707 ? A 530.476 407.756 446.315 1 1 V ALA 0.690 1 ATOM 453 N N . ALA 1708 1708 ? A 529.370 410.860 446.463 1 1 V ALA 0.600 1 ATOM 454 C CA . ALA 1708 1708 ? A 529.457 412.247 446.867 1 1 V ALA 0.600 1 ATOM 455 C C . ALA 1708 1708 ? A 528.336 412.646 447.819 1 1 V ALA 0.600 1 ATOM 456 O O . ALA 1708 1708 ? A 528.533 413.469 448.708 1 1 V ALA 0.600 1 ATOM 457 C CB . ALA 1708 1708 ? A 529.436 413.207 445.664 1 1 V ALA 0.600 1 ATOM 458 N N . ASN 1709 1709 ? A 527.116 412.086 447.679 1 1 V ASN 0.550 1 ATOM 459 C CA . ASN 1709 1709 ? A 526.048 412.332 448.649 1 1 V ASN 0.550 1 ATOM 460 C C . ASN 1709 1709 ? A 526.347 411.753 449.977 1 1 V ASN 0.550 1 ATOM 461 O O . ASN 1709 1709 ? A 526.149 412.395 451.000 1 1 V ASN 0.550 1 ATOM 462 C CB . ASN 1709 1709 ? A 524.692 411.700 448.305 1 1 V ASN 0.550 1 ATOM 463 C CG . ASN 1709 1709 ? A 524.122 412.536 447.209 1 1 V ASN 0.550 1 ATOM 464 O OD1 . ASN 1709 1709 ? A 524.706 413.585 446.873 1 1 V ASN 0.550 1 ATOM 465 N ND2 . ASN 1709 1709 ? A 522.997 412.082 446.596 1 1 V ASN 0.550 1 ATOM 466 N N . VAL 1710 1710 ? A 526.848 410.515 449.994 1 1 V VAL 0.580 1 ATOM 467 C CA . VAL 1710 1710 ? A 527.288 409.873 451.209 1 1 V VAL 0.580 1 ATOM 468 C C . VAL 1710 1710 ? A 528.415 410.660 451.866 1 1 V VAL 0.580 1 ATOM 469 O O . VAL 1710 1710 ? A 528.429 410.875 453.080 1 1 V VAL 0.580 1 ATOM 470 C CB . VAL 1710 1710 ? A 527.736 408.451 450.934 1 1 V VAL 0.580 1 ATOM 471 C CG1 . VAL 1710 1710 ? A 528.343 407.845 452.215 1 1 V VAL 0.580 1 ATOM 472 C CG2 . VAL 1710 1710 ? A 526.537 407.613 450.443 1 1 V VAL 0.580 1 ATOM 473 N N . GLU 1711 1711 ? A 529.371 411.159 451.060 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 474 C CA . GLU 1711 1711 ? A 530.399 412.069 451.511 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 475 C C . GLU 1711 1711 ? A 529.820 413.359 452.061 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 476 O O . GLU 1711 1711 ? A 530.147 413.769 453.169 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 477 C CB . GLU 1711 1711 ? A 531.383 412.396 450.373 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 478 C CG . GLU 1711 1711 ? A 532.390 411.261 450.086 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 479 C CD . GLU 1711 1711 ? A 533.337 411.671 448.962 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 480 O OE1 . GLU 1711 1711 ? A 533.977 412.746 449.103 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 481 O OE2 . GLU 1711 1711 ? A 533.426 410.915 447.963 1 1 V GLU 0.530 1 ATOM 482 N N . HIS 1712 1712 ? A 528.855 413.971 451.345 1 1 V HIS 0.530 1 ATOM 483 C CA . HIS 1712 1712 ? A 528.095 415.134 451.767 1 1 V HIS 0.530 1 ATOM 484 C C . HIS 1712 1712 ? A 527.372 414.911 453.086 1 1 V HIS 0.530 1 ATOM 485 O O . HIS 1712 1712 ? A 527.338 415.793 453.936 1 1 V HIS 0.530 1 ATOM 486 C CB . HIS 1712 1712 ? A 527.120 415.630 450.675 1 1 V HIS 0.530 1 ATOM 487 C CG . HIS 1712 1712 ? A 526.447 416.911 451.031 1 1 V HIS 0.530 1 ATOM 488 N ND1 . HIS 1712 1712 ? A 527.195 418.066 451.117 1 1 V HIS 0.530 1 ATOM 489 C CD2 . HIS 1712 1712 ? A 525.148 417.158 451.342 1 1 V HIS 0.530 1 ATOM 490 C CE1 . HIS 1712 1712 ? A 526.336 418.999 451.474 1 1 V HIS 0.530 1 ATOM 491 N NE2 . HIS 1712 1712 ? A 525.084 418.503 451.624 1 1 V HIS 0.530 1 ATOM 492 N N . LEU 1713 1713 ? A 526.823 413.706 453.333 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 493 C CA . LEU 1713 1713 ? A 526.263 413.345 454.623 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 494 C C . LEU 1713 1713 ? A 527.274 413.365 455.762 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 495 O O . LEU 1713 1713 ? A 527.024 413.967 456.802 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 496 C CB . LEU 1713 1713 ? A 525.546 411.978 454.589 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 497 C CG . LEU 1713 1713 ? A 524.299 411.934 453.682 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 498 C CD1 . LEU 1713 1713 ? A 523.787 410.489 453.570 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 499 C CD2 . LEU 1713 1713 ? A 523.194 412.894 454.158 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 500 N N . LYS 1714 1714 ? A 528.482 412.784 455.584 1 1 V LYS 0.540 1 ATOM 501 C CA . LYS 1714 1714 ? A 529.563 412.941 456.551 1 1 V LYS 0.540 1 ATOM 502 C C . LYS 1714 1714 ? A 530.008 414.383 456.701 1 1 V LYS 0.540 1 ATOM 503 O O . LYS 1714 1714 ? A 530.263 414.842 457.813 1 1 V LYS 0.540 1 ATOM 504 C CB . LYS 1714 1714 ? A 530.774 412.016 456.305 1 1 V LYS 0.540 1 ATOM 505 C CG . LYS 1714 1714 ? A 530.447 410.546 456.602 1 1 V LYS 0.540 1 ATOM 506 C CD . LYS 1714 1714 ? A 531.693 409.661 456.465 1 1 V LYS 0.540 1 ATOM 507 C CE . LYS 1714 1714 ? A 531.413 408.185 456.749 1 1 V LYS 0.540 1 ATOM 508 N NZ . LYS 1714 1714 ? A 532.640 407.387 456.529 1 1 V LYS 0.540 1 ATOM 509 N N . ASN 1715 1715 ? A 530.054 415.146 455.591 1 1 V ASN 0.540 1 ATOM 510 C CA . ASN 1715 1715 ? A 530.377 416.561 455.603 1 1 V ASN 0.540 1 ATOM 511 C C . ASN 1715 1715 ? A 529.402 417.376 456.446 1 1 V ASN 0.540 1 ATOM 512 O O . ASN 1715 1715 ? A 529.817 418.188 457.266 1 1 V ASN 0.540 1 ATOM 513 C CB . ASN 1715 1715 ? A 530.424 417.183 454.181 1 1 V ASN 0.540 1 ATOM 514 C CG . ASN 1715 1715 ? A 531.519 416.522 453.351 1 1 V ASN 0.540 1 ATOM 515 O OD1 . ASN 1715 1715 ? A 532.537 416.073 453.878 1 1 V ASN 0.540 1 ATOM 516 N ND2 . ASN 1715 1715 ? A 531.332 416.474 452.010 1 1 V ASN 0.540 1 ATOM 517 N N . VAL 1716 1716 ? A 528.077 417.153 456.330 1 1 V VAL 0.560 1 ATOM 518 C CA . VAL 1716 1716 ? A 527.095 417.886 457.123 1 1 V VAL 0.560 1 ATOM 519 C C . VAL 1716 1716 ? A 527.037 417.435 458.584 1 1 V VAL 0.560 1 ATOM 520 O O . VAL 1716 1716 ? A 526.589 418.172 459.462 1 1 V VAL 0.560 1 ATOM 521 C CB . VAL 1716 1716 ? 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A 530.729 418.937 460.612 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 535 O O . LEU 1718 1718 ? A 531.235 419.673 461.453 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 536 C CB . LEU 1718 1718 ? A 532.312 417.429 459.409 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 537 C CG . LEU 1718 1718 ? A 533.084 416.097 459.323 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 538 C CD1 . LEU 1718 1718 ? A 534.061 416.151 458.138 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 539 C CD2 . LEU 1718 1718 ? A 533.851 415.790 460.618 1 1 V LEU 0.540 1 ATOM 540 N N . GLN 1719 1719 ? A 529.741 419.387 459.820 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 541 C CA . GLN 1719 1719 ? A 529.045 420.635 460.065 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 542 C C . GLN 1719 1719 ? A 528.248 420.660 461.368 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 543 O O . GLN 1719 1719 ? A 528.272 421.654 462.079 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 544 C CB . GLN 1719 1719 ? A 528.189 421.094 458.872 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 545 C CG . GLN 1719 1719 ? A 529.049 421.395 457.626 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 546 C CD . GLN 1719 1719 ? A 528.156 421.772 456.451 1 1 V GLN 0.510 1 ATOM 547 O OE1 . GLN 1719 1719 ? 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A 535.032 450.130 483.551 1 1 V LEU 0.530 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.538 2 1 3 0.015 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1651 THR 1 0.450 2 1 A 1652 LYS 1 0.510 3 1 A 1653 GLU 1 0.490 4 1 A 1654 GLU 1 0.500 5 1 A 1655 LEU 1 0.570 6 1 A 1656 VAL 1 0.610 7 1 A 1657 GLN 1 0.610 8 1 A 1658 LYS 1 0.650 9 1 A 1659 LEU 1 0.620 10 1 A 1660 SER 1 0.630 11 1 A 1661 SER 1 0.610 12 1 A 1662 THR 1 0.600 13 1 A 1663 THR 1 0.590 14 1 A 1664 LYS 1 0.560 15 1 A 1665 SER 1 0.580 16 1 A 1666 ALA 1 0.580 17 1 A 1667 ASP 1 0.600 18 1 A 1668 HIS 1 0.610 19 1 A 1669 LEU 1 0.590 20 1 A 1670 ASN 1 0.600 21 1 A 1671 GLY 1 0.610 22 1 A 1672 LEU 1 0.630 23 1 A 1673 LEU 1 0.630 24 1 A 1674 ARG 1 0.560 25 1 A 1675 GLU 1 0.560 26 1 A 1676 ALA 1 0.590 27 1 A 1677 GLU 1 0.490 28 1 A 1678 ALA 1 0.510 29 1 A 1679 THR 1 0.440 30 1 A 1680 SER 1 0.440 31 1 A 1681 ALA 1 0.480 32 1 A 1682 VAL 1 0.390 33 1 A 1683 LEU 1 0.390 34 1 A 1684 MET 1 0.370 35 1 A 1685 GLU 1 0.420 36 1 A 1686 GLN 1 0.510 37 1 A 1687 ILE 1 0.450 38 1 A 1688 LYS 1 0.410 39 1 A 1689 LEU 1 0.580 40 1 A 1690 LEU 1 0.610 41 1 A 1691 LYS 1 0.460 42 1 A 1692 SER 1 0.570 43 1 A 1693 GLU 1 0.550 44 1 A 1694 ILE 1 0.560 45 1 A 1695 ARG 1 0.540 46 1 A 1696 ARG 1 0.550 47 1 A 1697 LEU 1 0.510 48 1 A 1698 GLU 1 0.510 49 1 A 1699 ARG 1 0.550 50 1 A 1700 ASN 1 0.520 51 1 A 1701 GLN 1 0.490 52 1 A 1702 GLU 1 0.530 53 1 A 1703 GLN 1 0.600 54 1 A 1704 GLU 1 0.550 55 1 A 1705 GLU 1 0.450 56 1 A 1706 SER 1 0.610 57 1 A 1707 ALA 1 0.690 58 1 A 1708 ALA 1 0.600 59 1 A 1709 ASN 1 0.550 60 1 A 1710 VAL 1 0.580 61 1 A 1711 GLU 1 0.530 62 1 A 1712 HIS 1 0.530 63 1 A 1713 LEU 1 0.540 64 1 A 1714 LYS 1 0.540 65 1 A 1715 ASN 1 0.540 66 1 A 1716 VAL 1 0.560 67 1 A 1717 LEU 1 0.530 68 1 A 1718 LEU 1 0.540 69 1 A 1719 GLN 1 0.510 70 1 A 1720 PHE 1 0.410 71 1 A 1721 ILE 1 0.440 72 1 A 1722 PHE 1 0.330 73 1 A 1723 LEU 1 0.420 74 1 A 1724 LYS 1 0.450 75 1 A 1725 PRO 1 0.550 76 1 A 1726 GLY 1 0.630 77 1 A 1727 SER 1 0.650 78 1 A 1728 GLU 1 0.650 79 1 A 1729 ARG 1 0.530 80 1 A 1730 GLU 1 0.620 81 1 A 1731 ARG 1 0.550 82 1 A 1732 LEU 1 0.600 83 1 A 1733 LEU 1 0.590 84 1 A 1734 PRO 1 0.610 85 1 A 1735 VAL 1 0.660 86 1 A 1736 ILE 1 0.480 87 1 A 1737 ASN 1 0.530 88 1 A 1738 THR 1 0.540 89 1 A 1739 MET 1 0.430 90 1 A 1740 LEU 1 0.410 91 1 A 1741 GLN 1 0.480 92 1 A 1742 LEU 1 0.530 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #