data_SMR-6bc8dd178c96e785ecd5334eeaf55587_7 _entry.id SMR-6bc8dd178c96e785ecd5334eeaf55587_7 _struct.entry_id SMR-6bc8dd178c96e785ecd5334eeaf55587_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A4D0S4 (isoform 2)/ LAMB4_HUMAN, Laminin subunit beta-4 Estimated model accuracy of this model is 0.046, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A4D0S4 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 220202.497 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP LAMB4_HUMAN A4D0S4 1 ;MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSRAQKYCILSYLEGEQKCF ICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDHVSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAA MLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIE NPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKM RGDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLA SGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSDPALGSVA GQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECT VGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVTGRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATT LQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVTWTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQS AADWTVQIVVNPPGGSEHCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHA HSHVLVDSLGLIPQINSLENFCSKQDLDEYQLHNCVEIASAMGPQVLPGACERLIISMSAKLHDGAVACK CHPQGSVGSSCSRLGGQCQCKPLVVGRCCDRCSTGSYDLGHHGCHPCHCHPQGSKDTVCDQVTGQCPCHG EVSGRRCDRCLAGYFGFPSCHPCPCNRFAELCDPETGSCFNCGGFTTGRNCERCIDGYYGNPSSGQPCRP CLCPDDPSSNQYFAHSCYQNLWSSDVICNCLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAPCQPCACNNNIDVTD PESCSRVTGECLRCLHNTQGANCQLCKPGHYGSALNQTCRRCSCHASGVSPMECPPGGGACLCDPVTGAC PCLPNVTGLACDRCADGYWNLVPGRGCQSCDCDPRTSQSSHCDQLTGQCPCKLGYGGKRCSECQENYYGD PPGRCIPCDCNRAGTQKPICDPDTGMCRCREGVSGQRCDRCARGHSQEFPTCLQCHLCFDQWDHTISSLS KAVQGLMRLAANMEDKRETLPVCEADFKDLRGNVSEIERILKHPVFPSGKFLKVKDYHDSVRRQIMQLNE QLKAVYEFQDLKDTIERAKNEADLLLEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKINETSS TINTSANTRNDLLTILDTLTSKGNLSLERLKQIKIPDIQILNEKVCGDPGNVPCVPLPCGGALCTGRKGH RKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVSKNNALQLREKLGNIRNQ SDSEEENINLFIKKVKNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPIPSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDEN RLNEEADGAQKLLVKAKAAEKAANILLNLDKTLNQLQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQAENQ TREMKSELELAKQRSGLEDGLSLLQTKLQRHQDHAVNAKVQAESAQHQAGSLEKEFVELKKQYAILQRKT STTGLTKETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITGCFQNSAR ; 'Laminin subunit beta-4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1723 1 1723 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . LAMB4_HUMAN A4D0S4 A4D0S4-2 1 1723 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-04-03 EF23F9CBED1266A7 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSRAQKYCILSYLEGEQKCF ICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDHVSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAA MLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIE NPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKM RGDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLA SGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSDPALGSVA GQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECT VGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVTGRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATT LQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVTWTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQS AADWTVQIVVNPPGGSEHCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHA HSHVLVDSLGLIPQINSLENFCSKQDLDEYQLHNCVEIASAMGPQVLPGACERLIISMSAKLHDGAVACK CHPQGSVGSSCSRLGGQCQCKPLVVGRCCDRCSTGSYDLGHHGCHPCHCHPQGSKDTVCDQVTGQCPCHG EVSGRRCDRCLAGYFGFPSCHPCPCNRFAELCDPETGSCFNCGGFTTGRNCERCIDGYYGNPSSGQPCRP CLCPDDPSSNQYFAHSCYQNLWSSDVICNCLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAPCQPCACNNNIDVTD PESCSRVTGECLRCLHNTQGANCQLCKPGHYGSALNQTCRRCSCHASGVSPMECPPGGGACLCDPVTGAC PCLPNVTGLACDRCADGYWNLVPGRGCQSCDCDPRTSQSSHCDQLTGQCPCKLGYGGKRCSECQENYYGD PPGRCIPCDCNRAGTQKPICDPDTGMCRCREGVSGQRCDRCARGHSQEFPTCLQCHLCFDQWDHTISSLS KAVQGLMRLAANMEDKRETLPVCEADFKDLRGNVSEIERILKHPVFPSGKFLKVKDYHDSVRRQIMQLNE QLKAVYEFQDLKDTIERAKNEADLLLEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKINETSS TINTSANTRNDLLTILDTLTSKGNLSLERLKQIKIPDIQILNEKVCGDPGNVPCVPLPCGGALCTGRKGH RKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVSKNNALQLREKLGNIRNQ SDSEEENINLFIKKVKNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPIPSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDEN RLNEEADGAQKLLVKAKAAEKAANILLNLDKTLNQLQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQAENQ 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_entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLN . 1 3 PHE . 1 4 GLN . 1 5 LEU . 1 6 THR . 1 7 LEU . 1 8 PHE . 1 9 LEU . 1 10 HIS . 1 11 LEU . 1 12 GLY . 1 13 TRP . 1 14 LEU . 1 15 SER . 1 16 TYR . 1 17 SER . 1 18 LYS . 1 19 ALA . 1 20 GLN . 1 21 ASP . 1 22 ASP . 1 23 CYS . 1 24 ASN . 1 25 ARG . 1 26 GLY . 1 27 ALA . 1 28 CYS . 1 29 HIS . 1 30 PRO . 1 31 THR . 1 32 THR . 1 33 GLY . 1 34 ASP . 1 35 LEU . 1 36 LEU . 1 37 VAL . 1 38 GLY . 1 39 ARG . 1 40 ASN . 1 41 THR . 1 42 GLN . 1 43 LEU . 1 44 MET . 1 45 ALA . 1 46 SER . 1 47 SER . 1 48 THR . 1 49 CYS . 1 50 GLY . 1 51 LEU . 1 52 SER . 1 53 ARG . 1 54 ALA . 1 55 GLN . 1 56 LYS . 1 57 TYR . 1 58 CYS . 1 59 ILE . 1 60 LEU . 1 61 SER . 1 62 TYR . 1 63 LEU . 1 64 GLU . 1 65 GLY . 1 66 GLU . 1 67 GLN . 1 68 LYS . 1 69 CYS . 1 70 PHE . 1 71 ILE . 1 72 CYS . 1 73 ASP . 1 74 SER . 1 75 ARG . 1 76 PHE . 1 77 PRO . 1 78 TYR . 1 79 ASP . 1 80 PRO . 1 81 TYR . 1 82 ASP . 1 83 GLN . 1 84 PRO . 1 85 ASN . 1 86 SER . 1 87 HIS . 1 88 THR . 1 89 ILE . 1 90 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Unconventional myosin-Va {PDB ID=7yv9, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=7yv9.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7yv9, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAASELYTKFARVWIPDPEEVWKSAELLKDYKPGDKVLLLHLEEGKDLEYRLDPKTGELPHLRNPDILVG ENDLTALSYLHEPAVLHNLRVRFIDSKLIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYGEDIINAYSGQNMGDMDPHIF AVAEEAYKQMARDERNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYFATVSGSASEANVEEKVLASNPIMESIGNAK TTRNDNSSRFGKYIEIGFDKRYRIIGANMRTYLLEKSRVVFQAEEERNYHIFYQLCASAKLPEFKMLRLG NADSFHYTKQGGSPMIEGVDDAKEMAHTRQACTLLGISESYQMGIFRILAGILHLGNVGFASRDSDSCTI PPKHEPLTIFCDLMGVDYEEMCHWLCHRKLATATETYIKPISKLQATNARDALAKHIYAKLFNWIVDHVN QALHSAVKQHSFIGVLDIYGFETFEINSFEQFCINYANEKLQQQFNMHVFKLEQEEYMKEQIPWTLIDFY DNQPCINLIESKLGILDLLDEECKMPKGTDDTWAQKLYNTHLNKCALFEKPRMSNKAFIIKHFADKVEYQ CEGFLEKNKDTVFEEQIKVLKSSKFKMLPELFQDDEKAISPTSATSSGRTPLTRVPVKPTKGRPGQTAKE HKKTVGHQFRNSLHLLMETLNATTPHYVRCIKPNDFKFPFTFDEKRAVQQLRACGVLETIRISAAGFPSR WTYQEFFSRYRVLMKQKDVLGDRKQTCKNVLEKLILDKDKYQFGKTKIFFRAGQVAYLEKLRADKLRAAC IRIQKTIRGWLLRKRYLCMQRAAITVQRYVRGYQARCYAKFLRRTKAATTIQKYWRMYVVRRRYKIRRAA TIVIQSYLRGYLTRNRYRKILREYKAVIIQKRVRGWLARTHYKRTMKAIVYLQCCFRRMMAKRELKKLKI EARSVERYKKLHIGMENKIMQLQRKVDEQNKDYKCLMEKLTNLEGVYNSETEKLRNDVERLQLSEEEAKV ATGRVLSLQEEIAKLRKDLEQTRSEKKSIEERADKYKQETDQLVSNLKEENTLLKQEKETLNHRIVEQAK EMTETMERKLVEETKQLELDLNDERLRYQNLLNEFSRLEERYDDLKEEMTLMLNVPKPGHKRTDSTHSSN ESEYTFSSEFAETEDIAPRTEEPIEKKVPLDMSLFLKLQKRVTELEQEKQLMQDELDRKEEQVFRSKAKE EERPQIRGAELEYESLKRQELESENKKLKNELNELRKALSEKSAPEVTAPGAPAYRVLMEQLTSVSEELD VRKEEVLILRSQLVSQKEAIQPKDDKNTMTDSTILLEDVQKMKDKGEIAQAYIGLKETNRLLESQLQSQK RSHENEAEALRGEIQSLKEENNRQQQLLAQNLQLPPEARIEASLQHEITRLTNENLDLMEQLEKQDKTVR KLKKQLKVFAKKIGELEVGQMENISPGQIIDEPIRPVNIPRKEKDFQGMLEYKREDEQKLVKNLILELKP RGVAVNLIPGLPAYILFMCVRHADYLNDDQKVRSLLTSTINSIKKVLKKRGDDFETVSFWLSNTCRFLHC LKQYSGEEGFMKHNTSRQNEHCLTNFDLAEYRQVLSDLAIQIYQQLVRVLENILQPMIVSGMLEHETIQG VSGVKPTGLRKRTSSIADEGTYTLDSILRQLNSFHSVMCQHGMDPELIKQVVKQMFYIVGAITLNNLLLR KDMCSWSKGMQIRYNVSQLEEWLRDKNLMNSGAKETLEPLIQAAQLLQVKKKTDDDAEAICSMCNALTTA QIVKVLNLYTPVNEFEERVSVSFIRTIQMRLRDRKDSPQLLMDAKHIFPVTFPFNPSSLALETIQIPASL GLGFIARV ; ;MAASELYTKFARVWIPDPEEVWKSAELLKDYKPGDKVLLLHLEEGKDLEYRLDPKTGELPHLRNPDILVG ENDLTALSYLHEPAVLHNLRVRFIDSKLIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYGEDIINAYSGQNMGDMDPHIF AVAEEAYKQMARDERNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYFATVSGSASEANVEEKVLASNPIMESIGNAK TTRNDNSSRFGKYIEIGFDKRYRIIGANMRTYLLEKSRVVFQAEEERNYHIFYQLCASAKLPEFKMLRLG NADSFHYTKQGGSPMIEGVDDAKEMAHTRQACTLLGISESYQMGIFRILAGILHLGNVGFASRDSDSCTI PPKHEPLTIFCDLMGVDYEEMCHWLCHRKLATATETYIKPISKLQATNARDALAKHIYAKLFNWIVDHVN QALHSAVKQHSFIGVLDIYGFETFEINSFEQFCINYANEKLQQQFNMHVFKLEQEEYMKEQIPWTLIDFY DNQPCINLIESKLGILDLLDEECKMPKGTDDTWAQKLYNTHLNKCALFEKPRMSNKAFIIKHFADKVEYQ CEGFLEKNKDTVFEEQIKVLKSSKFKMLPELFQDDEKAISPTSATSSGRTPLTRVPVKPTKGRPGQTAKE HKKTVGHQFRNSLHLLMETLNATTPHYVRCIKPNDFKFPFTFDEKRAVQQLRACGVLETIRISAAGFPSR WTYQEFFSRYRVLMKQKDVLGDRKQTCKNVLEKLILDKDKYQFGKTKIFFRAGQVAYLEKLRADKLRAAC IRIQKTIRGWLLRKRYLCMQRAAITVQRYVRGYQARCYAKFLRRTKAATTIQKYWRMYVVRRRYKIRRAA TIVIQSYLRGYLTRNRYRKILREYKAVIIQKRVRGWLARTHYKRTMKAIVYLQCCFRRMMAKRELKKLKI EARSVERYKKLHIGMENKIMQLQRKVDEQNKDYKCLMEKLTNLEGVYNSETEKLRNDVERLQLSEEEAKV ATGRVLSLQEEIAKLRKDLEQTRSEKKSIEERADKYKQETDQLVSNLKEENTLLKQEKETLNHRIVEQAK EMTETMERKLVEETKQLELDLNDERLRYQNLLNEFSRLEERYDDLKEEMTLMLNVPKPGHKRTDSTHSSN ESEYTFSSEFAETEDIAPRTEEPIEKKVPLDMSLFLKLQKRVTELEQEKQLMQDELDRKEEQVFRSKAKE EERPQIRGAELEYESLKRQELESENKKLKNELNELRKALSEKSAPEVTAPGAPAYRVLMEQLTSVSEELD VRKEEVLILRSQLVSQKEAIQPKDDKNTMTDSTILLEDVQKMKDKGEIAQAYIGLKETNRLLESQLQSQK RSHENEAEALRGEIQSLKEENNRQQQLLAQNLQLPPEARIEASLQHEITRLTNENLDLMEQLEKQDKTVR KLKKQLKVFAKKIGELEVGQMENISPGQIIDEPIRPVNIPRKEKDFQGMLEYKREDEQKLVKNLILELKP RGVAVNLIPGLPAYILFMCVRHADYLNDDQKVRSLLTSTINSIKKVLKKRGDDFETVSFWLSNTCRFLHC LKQYSGEEGFMKHNTSRQNEHCLTNFDLAEYRQVLSDLAIQIYQQLVRVLENILQPMIVSGMLEHETIQG VSGVKPTGLRKRTSSIADEGTYTLDSILRQLNSFHSVMCQHGMDPELIKQVVKQMFYIVGAITLNNLLLR KDMCSWSKGMQIRYNVSQLEEWLRDKNLMNSGAKETLEPLIQAAQLLQVKKKTDDDAEAICSMCNALTTA QIVKVLNLYTPVNEFEERVSVSFIRTIQMRLRDRKDSPQLLMDAKHIFPVTFPFNPSSLALETIQIPASL GLGFIARV ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1051 1395 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7yv9 2024-07-03 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1723 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1732 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6.4e-16 14.286 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSRAQKYCILSYLEGEQKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDHVSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVTGRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVTWTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWTVQIVVNPPGGSEHCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHSHVLVDSLGLIPQINSLENFCSKQDLDEYQLHNCVEIASAMGPQVLPGACERLIISMSAKLHDGAVACKCHPQGSVGSSCSRLGGQCQCKPLVVGRCCDRCSTGSYDLGHHGCHPCHCHPQGSKDTVCDQVTGQCPCHGEVSGRRCDRCLAGYFGFPSCHPCPCNRFAELCDPETGSCFNCGGFTTGRNCERCIDGYYGNPSSGQPCRPCLCPDDPSSNQYFAHSCYQNLWSSDVICNCLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAPCQPCACNNNIDVTDPESCSRVTGECLRCLHNTQGANCQLCKPGHYGSALNQTCRRCSCHASGVSPMECPPGGGACLCDPVTGACPCLPNVTGLACDRCADGYWNLVPGRGCQSCDCDPRTSQSSHCDQLTGQCPCKLGYGGKRCSECQENYYGDPPGRCIPCDCNRAGTQKPICDPDTGMCRCREGVSGQRCDRCARGHSQEFPTCLQCHLCFDQWDHTISSLSKAVQGLMRLAANMEDKRETLPVCEADFKDLRGNVSEIERILKHPVFPSGKFLKVKDYHDSVRRQIMQLNEQLKAVYEFQDLKDTIERAKNEADLLLEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKI-NETSSTINTSANTRNDLLTILDTLTSKGNLSLERLKQI--KIPDIQILNEKVCGDPGN-VPCVPLPCGGALCTGRKGHRKCRGPGCH---GSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVSKNNALQLREKLGNIRNQSDSEEENINLFIKKVKNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPIPSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADGAQKLLVKAKAAEKAANILLNLDKTLNQLQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVL-QAENQTREMKSELELA-KQRSGLEDGLSLLQTKLQRHQDHAVNAKVQAESAQHQAGSLEKEFVELKKQYAILQRKTSTTGLTKETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITGCFQNSAR 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EMTETMERKLVEETKQLELDLNDERLRYQNLLNEFS-RLEERYDDLKEEMTLMLNVPKPGHKRTDSTHSSNES-EYTFSSEFAETEDIAPRTEEPIEKKVPLDMSLFLKLQKRVTELEQEKQLMQDELDRKEEQVFRSKAKEEERPQIRGAELEYESLKRQELESENKKLKNELNELRKALS-EKSAPEVTAPGAPAYRVL-------------------MEQLTSVSEELDVRKEEVLILRSQLVSQKEAIQPKDDKNTMTDSTILLEDVQKMKDKGE--IAQAYIGLKETNRLLESQLQSQKRSHENEAEALRGEIQSLKEENNRQQQLLAQNLQLPPEARIEASLQHEITR-LTNENLDLMEQLEKQ----------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7yv9.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . HIS 1316 1316 ? A 344.386 333.737 293.848 1 1 A HIS 0.460 1 ATOM 2 C CA . HIS 1316 1316 ? A 343.286 333.632 292.821 1 1 A HIS 0.460 1 ATOM 3 C C . HIS 1316 1316 ? A 343.270 334.765 291.802 1 1 A HIS 0.460 1 ATOM 4 O O . HIS 1316 1316 ? A 343.362 334.522 290.615 1 1 A HIS 0.460 1 ATOM 5 C CB . HIS 1316 1316 ? A 341.909 333.487 293.509 1 1 A HIS 0.460 1 ATOM 6 C CG . HIS 1316 1316 ? A 340.806 333.250 292.536 1 1 A HIS 0.460 1 ATOM 7 N ND1 . HIS 1316 1316 ? A 340.800 332.046 291.879 1 1 A HIS 0.460 1 ATOM 8 C CD2 . HIS 1316 1316 ? A 339.752 334.014 292.152 1 1 A HIS 0.460 1 ATOM 9 C CE1 . HIS 1316 1316 ? A 339.730 332.084 291.108 1 1 A HIS 0.460 1 ATOM 10 N NE2 . HIS 1316 1316 ? A 339.061 333.257 291.233 1 1 A HIS 0.460 1 ATOM 11 N N . ILE 1317 1317 ? A 343.197 336.053 292.229 1 1 A ILE 0.500 1 ATOM 12 C CA . ILE 1317 1317 ? A 343.227 337.191 291.306 1 1 A ILE 0.500 1 ATOM 13 C C . ILE 1317 1317 ? A 344.516 337.287 290.507 1 1 A ILE 0.500 1 ATOM 14 O O . ILE 1317 1317 ? A 344.468 337.566 289.318 1 1 A ILE 0.500 1 ATOM 15 C CB . ILE 1317 1317 ? A 342.876 338.506 291.993 1 1 A ILE 0.500 1 ATOM 16 C CG1 . ILE 1317 1317 ? A 341.416 338.417 292.491 1 1 A ILE 0.500 1 ATOM 17 C CG2 . ILE 1317 1317 ? A 343.043 339.701 291.022 1 1 A ILE 0.500 1 ATOM 18 C CD1 . ILE 1317 1317 ? A 341.006 339.588 293.386 1 1 A ILE 0.500 1 ATOM 19 N N . SER 1318 1318 ? A 345.697 336.993 291.105 1 1 A SER 0.400 1 ATOM 20 C CA . SER 1318 1318 ? A 346.937 336.872 290.337 1 1 A SER 0.400 1 ATOM 21 C C . SER 1318 1318 ? A 346.832 335.853 289.211 1 1 A SER 0.400 1 ATOM 22 O O . SER 1318 1318 ? A 347.042 336.184 288.067 1 1 A SER 0.400 1 ATOM 23 C CB . SER 1318 1318 ? A 348.167 336.492 291.197 1 1 A SER 0.400 1 ATOM 24 O OG . SER 1318 1318 ? A 348.299 337.350 292.338 1 1 A SER 0.400 1 ATOM 25 N N . SER 1319 1319 ? A 346.331 334.631 289.501 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 26 C CA . SER 1319 1319 ? A 346.063 333.605 288.499 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 27 C C . SER 1319 1319 ? A 345.084 334.029 287.410 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 28 O O . SER 1319 1319 ? A 345.202 333.656 286.245 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 29 C CB . SER 1319 1319 ? A 345.436 332.337 289.139 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 30 O OG . SER 1319 1319 ? A 346.134 331.856 290.302 1 1 A SER 0.420 1 ATOM 31 N N . SER 1320 1320 ? A 344.059 334.830 287.775 1 1 A SER 0.440 1 ATOM 32 C CA . SER 1320 1320 ? A 343.188 335.534 286.836 1 1 A SER 0.440 1 ATOM 33 C C . SER 1320 1320 ? A 343.918 336.548 285.961 1 1 A SER 0.440 1 ATOM 34 O O . SER 1320 1320 ? A 343.549 336.712 284.806 1 1 A SER 0.440 1 ATOM 35 C CB . SER 1320 1320 ? A 341.979 336.275 287.473 1 1 A SER 0.440 1 ATOM 36 O OG . SER 1320 1320 ? A 341.007 335.368 288.001 1 1 A SER 0.440 1 ATOM 37 N N . ALA 1321 1321 ? A 344.948 337.265 286.477 1 1 A ALA 0.470 1 ATOM 38 C CA . ALA 1321 1321 ? A 345.827 338.117 285.686 1 1 A ALA 0.470 1 ATOM 39 C C . ALA 1321 1321 ? A 346.541 337.352 284.579 1 1 A ALA 0.470 1 ATOM 40 O O . ALA 1321 1321 ? A 346.369 337.693 283.415 1 1 A ALA 0.470 1 ATOM 41 C CB . ALA 1321 1321 ? A 346.898 338.850 286.536 1 1 A ALA 0.470 1 ATOM 42 N N . GLU 1322 1322 ? A 347.279 336.253 284.868 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 43 C CA . GLU 1322 1322 ? A 347.907 335.475 283.804 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 44 C C . GLU 1322 1322 ? A 346.911 334.830 282.851 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 45 O O . GLU 1322 1322 ? A 347.079 334.857 281.633 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 46 C CB . GLU 1322 1322 ? A 348.855 334.354 284.302 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 47 C CG . GLU 1322 1322 ? A 350.160 334.847 284.976 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 48 C CD . GLU 1322 1322 ? A 350.063 335.055 286.488 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 49 O OE1 . GLU 1322 1322 ? A 349.093 334.544 287.100 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 50 O OE2 . GLU 1322 1322 ? A 350.991 335.706 287.038 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 51 N N . LYS 1323 1323 ? A 345.818 334.242 283.383 1 1 A LYS 0.430 1 ATOM 52 C CA . LYS 1323 1323 ? A 344.802 333.622 282.562 1 1 A LYS 0.430 1 ATOM 53 C C . LYS 1323 1323 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #