data_SMR-450defe3ba148d0ce7173748a188f467_4 _entry.id SMR-450defe3ba148d0ce7173748a188f467_4 _struct.entry_id SMR-450defe3ba148d0ce7173748a188f467_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q14999 (isoform 2)/ CUL7_HUMAN, Cullin-7 Estimated model accuracy of this model is 0.033, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q14999 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 232072.237 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CUL7_HUMAN Q14999 1 ;MSRGFWLAEPLAGTGPHPAPVAADSRGCSSVPRRHAPSRLSVSTPSRGPGARMVGELRYREFRVPLGPGL HAYPDELIRQRVGHDGHPEYQIRWLILRRGDEGDGGSGQVDCKAEHILLWMSKDEIYANCHKMLGEDGQV IGPSQESAGEVGALDKSVLEEMETDVKSLIQRALRQLEECVGTIPPAPLLHTVHVLSAYASIEPLTGVFK DPRVLDLLMHMLSSPDYQIRWSAGRMIQALSSHDAGEGQCGEEGKAGEGLGRLRDSQDTVAGASDLIRTR TQILLSLSQQEAIEKHLDFDSRCALLALFAQATLSEHPMSFEGIQLPQVPGRVLFSLVKRYLHVTSLLDQ LNDSAAEPGAQNTSAPEELSGERGQLELEFSMAMGTLISELVQAMRWDQASDRPRSSARSPGSIFQPQLA DVSPGLPAAQAQPSFRRSRRFRPRSEFASGNTYALYVRDTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNG VPPVQVFWESTGRTYWVHWHMLEILGFEEDIEDMVEADEYQGAVASRVLGRALPAWRWRPMTELYAVPYV LPEDEDTEECEHLTLAEWWELLFFIKKLDGPDHQEVLQILQENLDGEILDDEILAELAVPIELAQDLLLT LPQRLNDSALRDLINCHVYKKYGPEALAGNQAYPSLLEAQEDVLLLDAQAQAKDSEDAAKVEAKEPPSQS PNTPLQRLVEGYGPAGKILLDLEQALSSEGTQENKVKPLLLQLQRQPQPFLALMQSLDTPETNRTLHLTV LRILKQLVDFPEALLLPWHEAVDACMACLRSPNTDREVLQELIFFLHRLTSVSRDYAVVLNQLGARDAIS KALEKHLGKLELAQELRDMVFKCEKHAHLYRKLITNILGGCIQMVLGQIEDHRRTHQPINIPFFDVFLRY LCQGSSVEVKEDKCWEKVEVSSNPHRASKLTDHNPKTYWESNGSAGSHYITLHMRRGILIRQLTLLVASE DSSYMPARVVVCGGDSTSSLHTELNSVNVMPSASRVILLENLTRFWPIIQIRIKRCQQGGIDTRIRGLEI LGPKPTFWPVFREQLCRHTRLFYMVRAQAWSQDMAEDRRSLLHLSSRLNGALRQEQNFADRFLPDDEAAQ ALGKTCWEALVSPVVQNITSPDEDGISPLGWLLDQYLECQEAVFNPQSRGPAFFSRVRRLTHLLVHVEPC EAPPPVVATPRPKGRNRSHDWSSLATRGLPSSIMRNLTRCWRAVVEKQVNNFLTSSWRDDDFVPRYCEHF NILQNSSSELFGPRAAFLLALQNGCAGALLKLPFLKAAHVSEQFARHIDQQIQGSRIGGAQEMERLAQLQ QCLQAVLIFSGLEIATTFEHYYQHYMADRLLGVVSSWLEGAVLEQIGPCFPNRLPQQMLQSLSTSKELQR QFHVYQLQQLDQELLKLEDTEKKIQVGLGASGKEHKSEKEEEAGAAAVVDVAEGEEEEEENEDLYYEGAM PEVSVLVLSRHSWPVASICHTLNPRTCLPSYLRGTLNRYSNFYNKSQSHPALERGSQRRLQWTWLGWAEL QFGNQTLHVSTVQMWLLLYLNDLKAVSVESLLAFSGLSADMLNQAIGPLTSSRGPLDLHEQKDIPGGVLK IRDGSKEPRSRWDIVRLIPPQTYLQAEGEDGQNLEKRRNLLNCLIVRILKAHGDEGLHIDQLVCLVLEAW QKGPCPPRGLVSSLGKGSACSSTDVLSCILHLLGKGTLRRHDDRPQVLSYAVPVTVMEPHTESLNPGSSG PNPPLTFHTLQIRSRGVPYASCTATQSFSTFR ; Cullin-7 # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1782 1 1782 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CUL7_HUMAN Q14999 Q14999-2 1 1782 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-10-23 3CFC980A4E8C4EB2 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSRGFWLAEPLAGTGPHPAPVAADSRGCSSVPRRHAPSRLSVSTPSRGPGARMVGELRYREFRVPLGPGL HAYPDELIRQRVGHDGHPEYQIRWLILRRGDEGDGGSGQVDCKAEHILLWMSKDEIYANCHKMLGEDGQV IGPSQESAGEVGALDKSVLEEMETDVKSLIQRALRQLEECVGTIPPAPLLHTVHVLSAYASIEPLTGVFK DPRVLDLLMHMLSSPDYQIRWSAGRMIQALSSHDAGEGQCGEEGKAGEGLGRLRDSQDTVAGASDLIRTR TQILLSLSQQEAIEKHLDFDSRCALLALFAQATLSEHPMSFEGIQLPQVPGRVLFSLVKRYLHVTSLLDQ LNDSAAEPGAQNTSAPEELSGERGQLELEFSMAMGTLISELVQAMRWDQASDRPRSSARSPGSIFQPQLA DVSPGLPAAQAQPSFRRSRRFRPRSEFASGNTYALYVRDTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNG VPPVQVFWESTGRTYWVHWHMLEILGFEEDIEDMVEADEYQGAVASRVLGRALPAWRWRPMTELYAVPYV LPEDEDTEECEHLTLAEWWELLFFIKKLDGPDHQEVLQILQENLDGEILDDEILAELAVPIELAQDLLLT 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A 1 1718 LEU 1718 ? ? ? A . A 1 1719 ARG 1719 ? ? ? A . A 1 1720 ARG 1720 ? ? ? A . A 1 1721 HIS 1721 ? ? ? A . A 1 1722 ASP 1722 ? ? ? A . A 1 1723 ASP 1723 ? ? ? A . A 1 1724 ARG 1724 ? ? ? A . A 1 1725 PRO 1725 ? ? ? A . A 1 1726 GLN 1726 ? ? ? A . A 1 1727 VAL 1727 ? ? ? A . A 1 1728 LEU 1728 ? ? ? A . A 1 1729 SER 1729 ? ? ? A . A 1 1730 TYR 1730 ? ? ? A . A 1 1731 ALA 1731 ? ? ? A . A 1 1732 VAL 1732 ? ? ? A . A 1 1733 PRO 1733 ? ? ? A . A 1 1734 VAL 1734 ? ? ? A . A 1 1735 THR 1735 ? ? ? A . A 1 1736 VAL 1736 ? ? ? A . A 1 1737 MET 1737 ? ? ? A . A 1 1738 GLU 1738 ? ? ? A . A 1 1739 PRO 1739 ? ? ? A . A 1 1740 HIS 1740 ? ? ? A . A 1 1741 THR 1741 ? ? ? A . A 1 1742 GLU 1742 ? ? ? A . A 1 1743 SER 1743 ? ? ? A . A 1 1744 LEU 1744 ? ? ? A . A 1 1745 ASN 1745 ? ? ? A . A 1 1746 PRO 1746 ? ? ? A . A 1 1747 GLY 1747 ? ? ? A . A 1 1748 SER 1748 ? ? ? A . A 1 1749 SER 1749 ? ? ? A . A 1 1750 GLY 1750 ? ? ? A . A 1 1751 PRO 1751 ? ? ? A . A 1 1752 ASN 1752 ? ? ? A . A 1 1753 PRO 1753 ? ? ? A . A 1 1754 PRO 1754 ? ? ? A . A 1 1755 LEU 1755 ? ? ? A . A 1 1756 THR 1756 ? ? ? A . A 1 1757 PHE 1757 ? ? ? A . A 1 1758 HIS 1758 ? ? ? A . A 1 1759 THR 1759 ? ? ? A . A 1 1760 LEU 1760 ? ? ? A . A 1 1761 GLN 1761 ? ? ? A . A 1 1762 ILE 1762 ? ? ? A . A 1 1763 ARG 1763 ? ? ? A . A 1 1764 SER 1764 ? ? ? A . A 1 1765 ARG 1765 ? ? ? A . A 1 1766 GLY 1766 ? ? ? A . A 1 1767 VAL 1767 ? ? ? A . A 1 1768 PRO 1768 ? ? ? A . A 1 1769 TYR 1769 ? ? ? A . A 1 1770 ALA 1770 ? ? ? A . A 1 1771 SER 1771 ? ? ? A . A 1 1772 CYS 1772 ? ? ? A . A 1 1773 THR 1773 ? ? ? A . A 1 1774 ALA 1774 ? ? ? A . A 1 1775 THR 1775 ? ? ? A . A 1 1776 GLN 1776 ? ? ? A . A 1 1777 SER 1777 ? ? ? A . A 1 1778 PHE 1778 ? ? ? A . A 1 1779 SER 1779 ? ? ? A . A 1 1780 THR 1780 ? ? ? A . A 1 1781 PHE 1781 ? ? ? A . A 1 1782 ARG 1782 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Cullin-7 {PDB ID=2jng, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2jng.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2jng, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSHMRSEFASGNTYALYVRDTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNGVPPVQVFWESTGRTYWVHW HMLEILGFEEDIEDMVEADEYQGAVASRVLGRALP ; ;GSHMRSEFASGNTYALYVRDTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNGVPPVQVFWESTGRTYWVHW HMLEILGFEEDIEDMVEADEYQGAVASRVLGRALP ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 105 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2jng 2023-12-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1782 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1782 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.9e-33 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSRGFWLAEPLAGTGPHPAPVAADSRGCSSVPRRHAPSRLSVSTPSRGPGARMVGELRYREFRVPLGPGLHAYPDELIRQRVGHDGHPEYQIRWLILRRGDEGDGGSGQVDCKAEHILLWMSKDEIYANCHKMLGEDGQVIGPSQESAGEVGALDKSVLEEMETDVKSLIQRALRQLEECVGTIPPAPLLHTVHVLSAYASIEPLTGVFKDPRVLDLLMHMLSSPDYQIRWSAGRMIQALSSHDAGEGQCGEEGKAGEGLGRLRDSQDTVAGASDLIRTRTQILLSLSQQEAIEKHLDFDSRCALLALFAQATLSEHPMSFEGIQLPQVPGRVLFSLVKRYLHVTSLLDQLNDSAAEPGAQNTSAPEELSGERGQLELEFSMAMGTLISELVQAMRWDQASDRPRSSARSPGSIFQPQLADVSPGLPAAQAQPSFRRSRRFRPRSEFASGNTYALYVRDTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNGVPPVQVFWESTGRTYWVHWHMLEILGFEEDIEDMVEADEYQGAVASRVLGRALPAWRWRPMTELYAVPYVLPEDEDTEECEHLTLAEWWELLFFIKKLDGPDHQEVLQILQENLDGEILDDEILAELAVPIELAQDLLLTLPQRLNDSALRDLINCHVYKKYGPEALAGNQAYPSLLEAQEDVLLLDAQAQAKDSEDAAKVEAKEPPSQSPNTPLQRLVEGYGPAGKILLDLEQALSSEGTQENKVKPLLLQLQRQPQPFLALMQSLDTPETNRTLHLTVLRILKQLVDFPEALLLPWHEAVDACMACLRSPNTDREVLQELIFFLHRLTSVSRDYAVVLNQLGARDAISKALEKHLGKLELAQELRDMVFKCEKHAHLYRKLITNILGGCIQMVLGQIEDHRRTHQPINIPFFDVFLRYLCQGSSVEVKEDKCWEKVEVSSNPHRASKLTDHNPKTYWESNGSAGSHYITLHMRRGILIRQLTLLVASEDSSYMPARVVVCGGDSTSSLHTELNSVNVMPSASRVILLENLTRFWPIIQIRIKRCQQGGIDTRIRGLEILGPKPTFWPVFREQLCRHTRLFYMVRAQAWSQDMAEDRRSLLHLSSRLNGALRQEQNFADRFLPDDEAAQALGKTCWEALVSPVVQNITSPDEDGISPLGWLLDQYLECQEAVFNPQSRGPAFFSRVRRLTHLLVHVEPCEAPPPVVATPRPKGRNRSHDWSSLATRGLPSSIMRNLTRCWRAVVEKQVNNFLTSSWRDDDFVPRYCEHFNILQNSSSELFGPRAAFLLALQNGCAGALLKLPFLKAAHVSEQFARHIDQQIQGSRIGGAQEMERLAQLQQCLQAVLIFSGLEIATTFEHYYQHYMADRLLGVVSSWLEGAVLEQIGPCFPNRLPQQMLQSLSTSKELQRQFHVYQLQQLDQELLKLEDTEKKIQVGLGASGKEHKSEKEEEAGAAAVVDVAEGEEEEEENEDLYYEGAMPEVSVLVLSRHSWPVASICHTLNPRTCLPSYLRGTLNRYSNFYNKSQSHPALERGSQRRLQWTWLGWAELQFGNQTLHVSTVQMWLLLYLNDLKAVSVESLLAFSGLSADMLNQAIGPLTSSRGPLDLHEQKDIPGGVLKIRDGSKEPRSRWDIVRLIPPQTYLQAEGEDGQNLEKRRNLLNCLIVRILKAHGDEGLHIDQLVCLVLEAWQKGPCPPRGLVSSLGKGSACSSTDVLSCILHLLGKGTLRRHDDRPQVLSYAVPVTVMEPHTESLNPGSSGPNPPLTFHTLQIRSRGVPYASCTATQSFSTFR 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RSEFASGNTYALYVRDTLQPGMRVRMLDDYEEISAGDEGEFRQSNNGVPPVQVFWESTGRTYWVHWHMLEILGFEEDIEDMVEADEYQGAVASRVLGRALP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2jng.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 444 444 ? A 8.296 2.098 -14.148 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 2 C CA . ARG 444 444 ? A 7.022 2.358 -13.375 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 3 C C . ARG 444 444 ? A 6.674 3.811 -13.048 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 4 O O . ARG 444 444 ? A 5.510 4.141 -12.885 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 5 C CB . ARG 444 444 ? A 7.020 1.550 -12.056 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 6 C CG . ARG 444 444 ? A 7.205 0.021 -12.157 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 7 C CD . ARG 444 444 ? A 7.167 -0.635 -10.768 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 8 N NE . ARG 444 444 ? A 7.570 -2.072 -10.939 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 9 C CZ . ARG 444 444 ? A 8.339 -2.704 -10.036 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 444 444 ? A 8.729 -2.092 -8.934 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 444 444 ? A 8.828 -3.925 -10.233 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 12 N N . SER 445 445 ? A 7.652 4.740 -13.009 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 13 C CA . SER 445 445 ? A 7.419 6.188 -12.969 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 14 C C . SER 445 445 ? A 6.968 6.767 -14.331 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 15 O O . SER 445 445 ? A 7.226 7.921 -14.644 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 16 C CB . SER 445 445 ? A 8.735 6.876 -12.493 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 17 O OG . SER 445 445 ? A 8.524 8.112 -11.817 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 18 N N . GLU 446 446 ? A 6.274 5.940 -15.164 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 19 C CA . GLU 446 446 ? A 5.786 6.174 -16.527 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 20 C C . GLU 446 446 ? A 4.649 7.185 -16.584 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 21 O O . GLU 446 446 ? A 4.412 7.853 -17.590 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 22 C CB . GLU 446 446 ? A 5.254 4.829 -17.079 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 23 C CG . GLU 446 446 ? A 4.799 4.822 -18.558 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 24 C CD . GLU 446 446 ? A 4.088 3.505 -18.862 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 25 O OE1 . GLU 446 446 ? A 4.803 2.474 -18.977 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 26 O OE2 . GLU 446 446 ? A 2.833 3.517 -18.914 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 27 N N . PHE 447 447 ? A 3.918 7.321 -15.456 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 28 C CA . PHE 447 447 ? A 2.930 8.359 -15.202 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 29 C C . PHE 447 447 ? A 3.412 9.755 -15.553 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 30 O O . PHE 447 447 ? A 4.592 10.053 -15.422 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 31 C CB . PHE 447 447 ? A 2.547 8.428 -13.708 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 32 C CG . PHE 447 447 ? A 2.091 7.103 -13.209 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 33 C CD1 . PHE 447 447 ? A 0.773 6.675 -13.415 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 34 C CD2 . PHE 447 447 ? A 2.966 6.295 -12.474 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 35 C CE1 . PHE 447 447 ? A 0.331 5.464 -12.871 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 36 C CE2 . PHE 447 447 ? A 2.526 5.087 -11.924 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 37 C CZ . PHE 447 447 ? A 1.205 4.672 -12.119 1 1 A PHE 0.540 1 ATOM 38 N N . ALA 448 448 ? A 2.494 10.668 -15.931 1 1 A ALA 0.610 1 ATOM 39 C CA . ALA 448 448 ? A 2.822 11.922 -16.592 1 1 A ALA 0.610 1 ATOM 40 C C . ALA 448 448 ? A 3.894 12.800 -15.939 1 1 A ALA 0.610 1 ATOM 41 O O . ALA 448 448 ? A 4.744 13.375 -16.615 1 1 A ALA 0.610 1 ATOM 42 C CB . ALA 448 448 ? A 1.517 12.735 -16.703 1 1 A ALA 0.610 1 ATOM 43 N N . SER 449 449 ? 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A 17.527 -3.041 -5.497 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 198 C CD . ARG 468 468 ? A 17.389 -4.370 -6.247 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 199 N NE . ARG 468 468 ? A 18.600 -4.540 -7.105 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 200 C CZ . ARG 468 468 ? A 19.680 -5.259 -6.770 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 201 N NH1 . ARG 468 468 ? A 19.793 -5.972 -5.672 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 202 N NH2 . ARG 468 468 ? A 20.723 -5.268 -7.599 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 203 N N . MET 469 469 ? A 17.699 0.159 -4.319 1 1 A MET 0.720 1 ATOM 204 C CA . MET 469 469 ? A 18.027 1.375 -4.988 1 1 A MET 0.720 1 ATOM 205 C C . MET 469 469 ? A 18.112 1.087 -6.476 1 1 A MET 0.720 1 ATOM 206 O O . MET 469 469 ? A 18.976 0.337 -6.935 1 1 A MET 0.720 1 ATOM 207 C CB . MET 469 469 ? A 19.359 1.928 -4.453 1 1 A MET 0.720 1 ATOM 208 C CG . MET 469 469 ? A 19.575 3.357 -4.947 1 1 A MET 0.720 1 ATOM 209 S SD . MET 469 469 ? A 18.377 4.541 -4.263 1 1 A MET 0.720 1 ATOM 210 C CE . MET 469 469 ? A 19.298 5.994 -4.807 1 1 A MET 0.720 1 ATOM 211 N N . LEU 470 470 ? 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A 6.236 -13.382 6.399 1 1 A GLU 0.560 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.688 2 1 3 0.033 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 444 ARG 1 0.630 2 1 A 445 SER 1 0.690 3 1 A 446 GLU 1 0.630 4 1 A 447 PHE 1 0.540 5 1 A 448 ALA 1 0.610 6 1 A 449 SER 1 0.640 7 1 A 450 GLY 1 0.620 8 1 A 451 ASN 1 0.630 9 1 A 452 THR 1 0.620 10 1 A 453 TYR 1 0.530 11 1 A 454 ALA 1 0.720 12 1 A 455 LEU 1 0.610 13 1 A 456 TYR 1 0.560 14 1 A 457 VAL 1 0.770 15 1 A 458 ARG 1 0.690 16 1 A 459 ASP 1 0.740 17 1 A 460 THR 1 0.770 18 1 A 461 LEU 1 0.780 19 1 A 462 GLN 1 0.770 20 1 A 463 PRO 1 0.770 21 1 A 464 GLY 1 0.770 22 1 A 465 MET 1 0.720 23 1 A 466 ARG 1 0.740 24 1 A 467 VAL 1 0.800 25 1 A 468 ARG 1 0.770 26 1 A 469 MET 1 0.720 27 1 A 470 LEU 1 0.670 28 1 A 471 ASP 1 0.580 29 1 A 472 ASP 1 0.570 30 1 A 473 TYR 1 0.550 31 1 A 474 GLU 1 0.660 32 1 A 475 GLU 1 0.740 33 1 A 476 ILE 1 0.710 34 1 A 477 SER 1 0.680 35 1 A 478 ALA 1 0.690 36 1 A 479 GLY 1 0.690 37 1 A 480 ASP 1 0.680 38 1 A 481 GLU 1 0.760 39 1 A 482 GLY 1 0.800 40 1 A 483 GLU 1 0.800 41 1 A 484 PHE 1 0.760 42 1 A 485 ARG 1 0.750 43 1 A 486 GLN 1 0.770 44 1 A 487 SER 1 0.760 45 1 A 488 ASN 1 0.650 46 1 A 489 ASN 1 0.640 47 1 A 490 GLY 1 0.580 48 1 A 491 VAL 1 0.600 49 1 A 492 PRO 1 0.590 50 1 A 493 PRO 1 0.640 51 1 A 494 VAL 1 0.770 52 1 A 495 GLN 1 0.770 53 1 A 496 VAL 1 0.800 54 1 A 497 PHE 1 0.730 55 1 A 498 TRP 1 0.640 56 1 A 499 GLU 1 0.710 57 1 A 500 SER 1 0.660 58 1 A 501 THR 1 0.690 59 1 A 502 GLY 1 0.720 60 1 A 503 ARG 1 0.620 61 1 A 504 THR 1 0.750 62 1 A 505 TYR 1 0.670 63 1 A 506 TRP 1 0.610 64 1 A 507 VAL 1 0.760 65 1 A 508 HIS 1 0.720 66 1 A 509 TRP 1 0.620 67 1 A 510 HIS 1 0.680 68 1 A 511 MET 1 0.690 69 1 A 512 LEU 1 0.760 70 1 A 513 GLU 1 0.780 71 1 A 514 ILE 1 0.770 72 1 A 515 LEU 1 0.720 73 1 A 516 GLY 1 0.740 74 1 A 517 PHE 1 0.560 75 1 A 518 GLU 1 0.650 76 1 A 519 GLU 1 0.560 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #