data_SMR-dde62e012cf4e707eb0b7b5ff7799e75_6 _entry.id SMR-dde62e012cf4e707eb0b7b5ff7799e75_6 _struct.entry_id SMR-dde62e012cf4e707eb0b7b5ff7799e75_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q96SN8 (isoform 2)/ CK5P2_HUMAN, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q96SN8 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 239283.741 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CK5P2_HUMAN Q96SN8 1 ;MMDLVLEEDVTVPGTLSGCSGLVPSVPDDLDGINPNAGLGNGLLPNVSEETVSPTRARNMKDFENQITEL KKENFNLKLRIYFLEERMQQEFHGPTEHIYKTNIELKVEVESLKRELQEREQLLIKASKAVESLAEAGGS EIQRVKEDARKKVQQVEDLLTKRILLLEKDVTAAQAELEKAFAGTETEKALRLRLESKLSEMKKMHEGDL AMALVLDEKDRLIEELKLSLKSKEALIQCLKEEKSQMACPDENVSSGELRGLCAAPREEKERETEAAQME HQKERNSFEERIQALEEDLREKEREIATEKKNSLKRDKAIQGLTMALKSKEKKVEELNSEIEKLSAAFAK AREALQKAQTQEFQGSEDYETALSGKEALSAALRSQNLTKSTENHRLRRSIKKITQELSDLQQERERLEK DLEEAHREKSKGDCTIRDLRNEVEKLRNEVNEREKAMENRYKSLLSESNKKLHNQEQVIKHLTESTNQKD VLLQKFNEKDLEVIQQNCYLMAAEDLELRSEGLITEKCSSQQPPGSKTIFSKEKKQSSDYEELIQVLKKE QDIYTHLVKSLQESDSINNLQAELNKIFALRKQLEQDVLSYQNLRKTLEEQISEIRRREEESFSLYSDQT SYLSICLEENNRFQVEHFSQEELKKKVSDLIQLVKELYTDNQHLKKTIFDLSCMGFQGNGFPDRLASTEQ TELLASKEDEDTIKIGEDDEINFLSDQHLQQSNEIMKDLSKGGCKNGYLRHTESKISDCDGAHAPGCLEE GAFINLLAPLFNEKATLLLESRPDLLKVVRELLLGQLFLTEQEVSGEHLDGKTEKTPKQKGELVHFVQTN SFSKPHDELKLSCEAQLVKAGEVPKVGLKDASVQTVATEGDLLRFKHEATREAWEEKPINTALSAEHRPE NLHGVPGWQAALLSLPGITNREAKKSRLPILIKPSRSLGNMYRLPATQEVVTQLQSQILELQGELKEFKT CNKQLHQKLILAEAVMEGRPTPDKTLLNAQPPVGAAYQDSPGEQKGIKTTSSVWRDKEMDSDQQRSYEID SEICPPDDLASLPSCKENPEDVLSPTSVATYLSSKSQPSAKVSVMGTDQSESINTSNETEYLKQKIHDLE TELEGYQNFIFQLQKHSQCSEAIITVLCGTEGAQDGLSKPKNGSDGEEMTFSSLHQVRYVKHVKILGPLA PEMIDSRVLENLKQQLEEQEYKLQKEQNLNMQLFSEIHNLQNKFRDLSPPRYDSLVQSQARELSLQRQQI KDGHGICVISRQHMNTMIKAFEELLQASDVDYCVAEGFQEQLNQCAELLEKLEKLFLNGKSVGVEMNTQN ELMERIEEDNLTYQHLLPESPEPSASHALSDYETSEKSFFSRDQKQDNETEKTSVMVNSFSQDLLMEHIQ EIRTLRKRLEESIKTNEKLRKQLERQGSEFVQGSTSIFASGSELHSSLTSEIHFLRKQNQALNAMLIKGS RDKQKENDKLRESLSRKTVSLEHLQREYASVKEENERLQKEGSEKERHNQQLIQEVRCSGQELSRVQEEV KLRQQLLSQNDKLLQSLRVELKAYEKLDEEHRRLRDGDKYPMESDNSFDLFDSSQAVTPKSVSETPPLSG NDTDSLSCDSGSSATSTPCVSRLVTGHHLWASKNGRHVLGLIEDYEALLKQISQGQRLLAEMDIQTQEAP SSTSQELGTKGPHPAPLSKFVSSVSTAKLTLEEAYRRLKLLWRVSLPEDGQCPLHCEQIGEMKAEVTKLH KKLFEQEKKLQNTMKLLQLSKRQEKVIFDQLVVTHKILRKARGNLELRPGGAHPGTCSPSRPGS ; 'CDK5 regulatory subunit-associated protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1814 1 1814 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CK5P2_HUMAN Q96SN8 Q96SN8-2 1 1814 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-05-18 C28575B525292309 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no J ;MMDLVLEEDVTVPGTLSGCSGLVPSVPDDLDGINPNAGLGNGLLPNVSEETVSPTRARNMKDFENQITEL KKENFNLKLRIYFLEERMQQEFHGPTEHIYKTNIELKVEVESLKRELQEREQLLIKASKAVESLAEAGGS EIQRVKEDARKKVQQVEDLLTKRILLLEKDVTAAQAELEKAFAGTETEKALRLRLESKLSEMKKMHEGDL AMALVLDEKDRLIEELKLSLKSKEALIQCLKEEKSQMACPDENVSSGELRGLCAAPREEKERETEAAQME HQKERNSFEERIQALEEDLREKEREIATEKKNSLKRDKAIQGLTMALKSKEKKVEELNSEIEKLSAAFAK AREALQKAQTQEFQGSEDYETALSGKEALSAALRSQNLTKSTENHRLRRSIKKITQELSDLQQERERLEK DLEEAHREKSKGDCTIRDLRNEVEKLRNEVNEREKAMENRYKSLLSESNKKLHNQEQVIKHLTESTNQKD VLLQKFNEKDLEVIQQNCYLMAAEDLELRSEGLITEKCSSQQPPGSKTIFSKEKKQSSDYEELIQVLKKE QDIYTHLVKSLQESDSINNLQAELNKIFALRKQLEQDVLSYQNLRKTLEEQISEIRRREEESFSLYSDQT 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A 1 1684 SER 1684 ? ? ? J . A 1 1685 GLN 1685 ? ? ? J . A 1 1686 GLU 1686 ? ? ? J . A 1 1687 LEU 1687 ? ? ? J . A 1 1688 GLY 1688 ? ? ? J . A 1 1689 THR 1689 ? ? ? J . A 1 1690 LYS 1690 ? ? ? J . A 1 1691 GLY 1691 ? ? ? J . A 1 1692 PRO 1692 ? ? ? J . A 1 1693 HIS 1693 ? ? ? J . A 1 1694 PRO 1694 ? ? ? J . A 1 1695 ALA 1695 ? ? ? J . A 1 1696 PRO 1696 ? ? ? J . A 1 1697 LEU 1697 ? ? ? J . A 1 1698 SER 1698 ? ? ? J . A 1 1699 LYS 1699 ? ? ? J . A 1 1700 PHE 1700 ? ? ? J . A 1 1701 VAL 1701 ? ? ? J . A 1 1702 SER 1702 ? ? ? J . A 1 1703 SER 1703 ? ? ? J . A 1 1704 VAL 1704 ? ? ? J . A 1 1705 SER 1705 ? ? ? J . A 1 1706 THR 1706 ? ? ? J . A 1 1707 ALA 1707 ? ? ? J . A 1 1708 LYS 1708 ? ? ? J . A 1 1709 LEU 1709 ? ? ? J . A 1 1710 THR 1710 ? ? ? J . A 1 1711 LEU 1711 ? ? ? J . A 1 1712 GLU 1712 ? ? ? J . A 1 1713 GLU 1713 ? ? ? J . A 1 1714 ALA 1714 ? ? ? J . A 1 1715 TYR 1715 ? ? ? J . A 1 1716 ARG 1716 ? ? ? J . A 1 1717 ARG 1717 ? ? ? J . A 1 1718 LEU 1718 ? ? ? J . A 1 1719 LYS 1719 ? ? ? J . A 1 1720 LEU 1720 ? ? ? J . A 1 1721 LEU 1721 ? ? ? J . A 1 1722 TRP 1722 ? ? ? J . A 1 1723 ARG 1723 ? ? ? J . A 1 1724 VAL 1724 ? ? ? J . A 1 1725 SER 1725 ? ? ? J . A 1 1726 LEU 1726 ? ? ? J . A 1 1727 PRO 1727 ? ? ? J . A 1 1728 GLU 1728 ? ? ? J . A 1 1729 ASP 1729 ? ? ? J . A 1 1730 GLY 1730 ? ? ? J . A 1 1731 GLN 1731 ? ? ? J . A 1 1732 CYS 1732 ? ? ? J . A 1 1733 PRO 1733 ? ? ? J . A 1 1734 LEU 1734 ? ? ? J . A 1 1735 HIS 1735 ? ? ? J . A 1 1736 CYS 1736 ? ? ? J . A 1 1737 GLU 1737 ? ? ? J . A 1 1738 GLN 1738 ? ? ? J . A 1 1739 ILE 1739 ? ? ? J . A 1 1740 GLY 1740 ? ? ? J . A 1 1741 GLU 1741 ? ? ? J . A 1 1742 MET 1742 ? ? ? J . A 1 1743 LYS 1743 ? ? ? J . A 1 1744 ALA 1744 ? ? ? J . A 1 1745 GLU 1745 ? ? ? J . A 1 1746 VAL 1746 ? ? ? J . A 1 1747 THR 1747 ? ? ? J . A 1 1748 LYS 1748 ? ? ? J . A 1 1749 LEU 1749 ? ? ? J . A 1 1750 HIS 1750 ? ? ? J . A 1 1751 LYS 1751 ? ? ? J . A 1 1752 LYS 1752 ? ? ? J . A 1 1753 LEU 1753 ? ? ? J . A 1 1754 PHE 1754 ? ? ? J . A 1 1755 GLU 1755 ? ? ? J . A 1 1756 GLN 1756 ? ? ? J . A 1 1757 GLU 1757 ? ? ? J . A 1 1758 LYS 1758 ? ? ? J . A 1 1759 LYS 1759 ? ? ? J . A 1 1760 LEU 1760 ? ? ? J . A 1 1761 GLN 1761 ? ? ? J . A 1 1762 ASN 1762 ? ? ? J . A 1 1763 THR 1763 ? ? ? J . A 1 1764 MET 1764 ? ? ? J . A 1 1765 LYS 1765 ? ? ? J . A 1 1766 LEU 1766 ? ? ? J . A 1 1767 LEU 1767 ? ? ? J . A 1 1768 GLN 1768 ? ? ? J . A 1 1769 LEU 1769 ? ? ? J . A 1 1770 SER 1770 ? ? ? J . A 1 1771 LYS 1771 ? ? ? J . A 1 1772 ARG 1772 ? ? ? J . A 1 1773 GLN 1773 ? ? ? J . A 1 1774 GLU 1774 ? ? ? J . A 1 1775 LYS 1775 ? ? ? J . A 1 1776 VAL 1776 ? ? ? J . A 1 1777 ILE 1777 ? ? ? J . A 1 1778 PHE 1778 ? ? ? J . A 1 1779 ASP 1779 ? ? ? J . A 1 1780 GLN 1780 ? ? ? J . A 1 1781 LEU 1781 ? ? ? J . A 1 1782 VAL 1782 ? ? ? J . A 1 1783 VAL 1783 ? ? ? J . A 1 1784 THR 1784 ? ? ? J . A 1 1785 HIS 1785 ? ? ? J . A 1 1786 LYS 1786 ? ? ? J . A 1 1787 ILE 1787 ? ? ? J . A 1 1788 LEU 1788 ? ? ? J . A 1 1789 ARG 1789 ? ? ? J . A 1 1790 LYS 1790 ? ? ? J . A 1 1791 ALA 1791 ? ? ? J . A 1 1792 ARG 1792 ? ? ? J . A 1 1793 GLY 1793 ? ? ? J . A 1 1794 ASN 1794 ? ? ? J . A 1 1795 LEU 1795 ? ? ? J . A 1 1796 GLU 1796 ? ? ? J . A 1 1797 LEU 1797 ? ? ? J . A 1 1798 ARG 1798 ? ? ? J . A 1 1799 PRO 1799 ? ? ? J . A 1 1800 GLY 1800 ? ? ? J . A 1 1801 GLY 1801 ? ? ? J . A 1 1802 ALA 1802 ? ? ? J . A 1 1803 HIS 1803 ? ? ? J . A 1 1804 PRO 1804 ? ? ? J . A 1 1805 GLY 1805 ? ? ? J . A 1 1806 THR 1806 ? ? ? J . A 1 1807 CYS 1807 ? ? ? J . A 1 1808 SER 1808 ? ? ? J . A 1 1809 PRO 1809 ? ? ? J . A 1 1810 SER 1810 ? ? ? J . A 1 1811 ARG 1811 ? ? ? J . A 1 1812 PRO 1812 ? ? ? J . A 1 1813 GLY 1813 ? ? ? J . A 1 1814 SER 1814 ? ? ? J . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=8dd0, label_asym_id=J, auth_asym_id=J, SMTL ID=8dd0.1.J}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8dd0, label_asym_id=J' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A J 2 1 J # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKRLEDELVSLQKKLKATEDELDKYSEAPKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKRLEDELVSLQKKLKATEDELDKYSEAPKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 108 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8dd0 2024-06-12 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1814 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1814 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.300 25.234 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMDLVLEEDVTVPGTLSGCSGLVPSVPDDLDGINPNAGLGNGLLPNVSEETVSPTRARNMKDFENQITELKKENFNLKLRIYFLEERMQQEFHGPTEHIYKTNIELKVEVESLKRELQEREQLLIKASKAVESLAEAGGSEIQRVKEDARKKVQQVEDLLTKRILLLEKDVTAAQAELEKAFAGTETEKALRLRLESKLSEMKKMHEGDLAMALVLDEKDRLIEELKLSLKSKEALIQCLKEEKSQMACPDENVSSGELRGLCAAPREEKERETEAAQMEHQKERNSFEERIQALEEDLREKEREIATEKKNSLKRDKAIQGLTMALKSKEKKVEELNSEIEKLSAAFAKAREALQKAQTQEFQGSEDYETALSGKEALSAALRSQNLTKSTENHRLRRSIKKITQELSDLQQERERLEKDLEEAHREKSKGDCTIRDLRNEVEKLRNEVNEREKAMENRYKSLLSESNKKLHNQEQVIKHLTESTNQKDVLLQKFNEKDLEVIQQNCYLMAAEDLELRSEGLITEKCSSQQPPGSKTIFSKEKKQSSDYEELIQVLKKEQDIYTHLVKSLQESDSINNLQAELNKIFALRKQLEQDVLSYQNLRKTLEEQISEIRRREEESFSLYSDQTSYLSICLEENNRFQVEHFSQEELKKKVSDLIQLVKELYTDNQHLKKTIFDLSCMGFQGNGFPDRLASTEQTELLASKEDEDTIKIGEDDEINFLSDQHLQQSNEIMKDLSKGGCKNGYLRHTESKISDCDGAHAPGCLEEGAFINLLAPLFNEKATLLLESRPDLLKVVRELLLGQLFLTEQEVSGEHLDGKTEKTPKQKGELVHFVQTNSFSKPHDELKLSCEAQLVKAGEVPKVGLKDASVQTVATEGDLLRFKHEATREAWEEKPINTALSAEHRPENLHGVPGWQAALLSLPGITNREAKKSRLPILIKPSRSLGNMYRLPATQEVVTQLQSQILELQGELKEFKTCNKQLHQKLILAEAVMEGRPTPDKTLLNAQPPVGAAYQDSPGEQKGIKTTSSVWRDKEMDSDQQRSYEIDSEICPPDDLASLPSCKENPEDVLSPTSVATYLSSKSQPSAKVSVMGTDQSESINTSNETEYLKQKIHDLETELEGYQNFIFQLQKHSQCSEAIITVLCGTEGAQDGLSKPKNGSDGEEMTFSSLHQVRYVKHVKILGPLAPEMIDSRVLENLKQQLEEQEYKLQKEQNLNMQLFSEIHNLQNKFRDLSPPRYDSLVQSQARELSLQRQQIKDGHGICVISRQHMNTMIKAFEELLQASDVDYCVAEGFQEQLNQCAELLEKLEKLFLNGKSVGVEMNTQNELMERIEEDNLTYQHLLPESPEPSASHALSDYETSEKSFFSRDQKQDNETEKTSVMVNSFSQDLLMEHIQEIRTLRKRLEESIKTNEKLRKQLERQGSEFVQGSTSIFASGSELHSSLTSEIHFLRKQNQALNAMLIKGSRDKQKENDKLRESLSRKTVSLEHLQREYASVKEENERLQKEGSEKERHNQQLIQEVRCSGQELSRVQEEVKLRQQLLSQNDKLLQSLRVELKAYEKLDEEHRRLRDGDKYPMESDNSFDLFDSSQAVTPKSVSETPPLSGNDTDSLSCDSGSSATSTPCVSRLVTGHHLWASKNGRHVLGLIEDYEALLKQISQGQRLLAEMDIQTQEAPSSTSQELGTKGPHPAPLSKFVSSVSTAKLTLEEAYRRLKLLWRVSLPEDGQCPLHCEQIGEMKAEVTKLHKKLFEQEKKLQNTMKLLQLSKRQEKVIFDQLVVTHKILRKARGNLELRPGGAHPGTCSPSRPGS 2 1 2 -------------------------------------------------------------------DAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQA-EADKKAAEDRSKRLEDELVSLQKKLKATEDELDKYSEAPKDAQE----KLELAEKKATD-AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLAT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8dd0.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 17.218 32.734 52.243 1 1 J GLU 0.610 1 ATOM 366 C CG . GLU 109 109 ? A 18.263 33.591 53.006 1 1 J GLU 0.610 1 ATOM 367 C CD . GLU 109 109 ? A 18.991 34.609 52.124 1 1 J GLU 0.610 1 ATOM 368 O OE1 . GLU 109 109 ? A 18.735 34.662 50.894 1 1 J GLU 0.610 1 ATOM 369 O OE2 . GLU 109 109 ? A 19.820 35.360 52.697 1 1 J GLU 0.610 1 ATOM 370 N N . VAL 110 110 ? A 14.336 31.694 51.379 1 1 J VAL 0.630 1 ATOM 371 C CA . VAL 110 110 ? A 13.419 30.927 50.550 1 1 J VAL 0.630 1 ATOM 372 C C . VAL 110 110 ? A 12.335 31.803 49.926 1 1 J VAL 0.630 1 ATOM 373 O O . VAL 110 110 ? A 12.027 31.676 48.740 1 1 J VAL 0.630 1 ATOM 374 C CB . VAL 110 110 ? A 12.798 29.762 51.317 1 1 J VAL 0.630 1 ATOM 375 C CG1 . VAL 110 110 ? A 11.752 29.025 50.451 1 1 J VAL 0.630 1 ATOM 376 C CG2 . VAL 110 110 ? A 13.928 28.776 51.671 1 1 J VAL 0.630 1 ATOM 377 N N . GLU 111 111 ? A 11.732 32.740 50.695 1 1 J GLU 0.640 1 ATOM 378 C CA . GLU 111 111 ? A 10.747 33.685 50.188 1 1 J GLU 0.640 1 ATOM 379 C C . GLU 111 111 ? 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A 14.234 33.037 46.059 1 1 J LEU 0.620 1 ATOM 394 C C . LEU 113 113 ? A 12.983 32.722 45.241 1 1 J LEU 0.620 1 ATOM 395 O O . LEU 113 113 ? A 13.005 32.739 44.011 1 1 J LEU 0.620 1 ATOM 396 C CB . LEU 113 113 ? A 14.913 31.725 46.526 1 1 J LEU 0.620 1 ATOM 397 C CG . LEU 113 113 ? A 15.404 30.800 45.381 1 1 J LEU 0.620 1 ATOM 398 C CD1 . LEU 113 113 ? A 16.138 31.544 44.240 1 1 J LEU 0.620 1 ATOM 399 C CD2 . LEU 113 113 ? A 16.329 29.724 45.971 1 1 J LEU 0.620 1 ATOM 400 N N . LYS 114 114 ? A 11.830 32.477 45.903 1 1 J LYS 0.670 1 ATOM 401 C CA . LYS 114 114 ? A 10.537 32.342 45.247 1 1 J LYS 0.670 1 ATOM 402 C C . LYS 114 114 ? A 10.122 33.590 44.490 1 1 J LYS 0.670 1 ATOM 403 O O . LYS 114 114 ? A 9.657 33.492 43.361 1 1 J LYS 0.670 1 ATOM 404 C CB . LYS 114 114 ? A 9.414 32.015 46.258 1 1 J LYS 0.670 1 ATOM 405 C CG . LYS 114 114 ? A 9.528 30.594 46.818 1 1 J LYS 0.670 1 ATOM 406 C CD . LYS 114 114 ? A 8.423 30.309 47.841 1 1 J LYS 0.670 1 ATOM 407 C CE . LYS 114 114 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #