data_SMR-998f7a48799597608e68c0cd13db0363_1 _entry.id SMR-998f7a48799597608e68c0cd13db0363_1 _struct.entry_id SMR-998f7a48799597608e68c0cd13db0363_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - A0A9Y1QQK3/ A0A9Y1QQK3_HUMAN, Breast cancer type 1 susceptibility protein - P38398 (isoform 2)/ BRCA1_HUMAN, Breast cancer type 1 susceptibility protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A9Y1QQK3, P38398 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 235298.061 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP A0A9Y1QQK3_HUMAN A0A9Y1QQK3 1 ;MLKLLNQKKGPSQCPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVEELLKIICAFQLDTGLEYANSYNFAKKENNSPEH LKDEVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQLSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYIELGSDSS EDTVNKATYCSVGDQELLQITPQGTRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQPSNNDLNTTEKRAAERH PEKYQGSSVSNLHVEPCGTNTHASSLQHENSSLLLTKDRMNVEKAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKET CNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPCSENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDD SHDGESESNAKVADVLDVLNEVDEYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRK KASLPNLSHVTENLIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTN QTEQNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNIHNSKAPK KNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPVRHSRNLQLMEGKEPATG AKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKEFVNPSLPREEKEEKLETVKVSNNAEDP KDLMLSGERVLQTERSVESSSISLVPGTDYGTQESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHG CSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHSRETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSA HSGSLKKQSPKVTFECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQ FRGNETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIPSTVSTIS RNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKLNAMLRLGVLQPEVYKQS LPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSSHASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAE NDIKESSAVFSKSVQKGELSRSPSPFTHTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGKVNNI PSQSTRHSTVATECLSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLT ANTNTQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASGCESETS VSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPSIISDSSALEDLRNPEQ STSEKAVLTSQKSSEYPISQNPEGLSADKFEVSADSSTSKNKEPGVERSSPSKCPSLDDRWYMHSCSGSL QNRNYPSQEELIKVVDVEEQQLEESGPHDLTETSYLPRQDLEGTPYLESGISLFSDDPESDPSEDRAPES ARVGNIPSSTSALKVPQLKVAESAQSPAAAHTTDTAGYNAMEESVSREKPELTASTERVNKRMSMVVSGL TPEEFMLVYKFARKHHITLTNLITEETTHVVMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGGKWVVSYFWVTQSIKERK MLNEHDFEVRGDVVNGRNHQGPKRARESQDRKIFRGLEICCYGPFTNMPTDQLEWMVQLCGASVVKELSS FTLGTGVHPIVVVQPDAWTEDNGFHAIGQMCEAPVVTREWVLDSVALYQCQELDTYLIPQIPHSHY ; 'Breast cancer type 1 susceptibility protein' 2 1 UNP BRCA1_HUMAN P38398 1 ;MLKLLNQKKGPSQCPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVEELLKIICAFQLDTGLEYANSYNFAKKENNSPEH LKDEVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQLSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYIELGSDSS EDTVNKATYCSVGDQELLQITPQGTRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQPSNNDLNTTEKRAAERH PEKYQGSSVSNLHVEPCGTNTHASSLQHENSSLLLTKDRMNVEKAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKET CNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPCSENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDD SHDGESESNAKVADVLDVLNEVDEYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRK KASLPNLSHVTENLIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTN QTEQNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNIHNSKAPK KNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPVRHSRNLQLMEGKEPATG AKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKEFVNPSLPREEKEEKLETVKVSNNAEDP KDLMLSGERVLQTERSVESSSISLVPGTDYGTQESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHG CSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHSRETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSA HSGSLKKQSPKVTFECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQ FRGNETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIPSTVSTIS RNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKLNAMLRLGVLQPEVYKQS LPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSSHASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAE NDIKESSAVFSKSVQKGELSRSPSPFTHTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGKVNNI PSQSTRHSTVATECLSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLT ANTNTQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASGCESETS VSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPSIISDSSALEDLRNPEQ STSEKAVLTSQKSSEYPISQNPEGLSADKFEVSADSSTSKNKEPGVERSSPSKCPSLDDRWYMHSCSGSL QNRNYPSQEELIKVVDVEEQQLEESGPHDLTETSYLPRQDLEGTPYLESGISLFSDDPESDPSEDRAPES ARVGNIPSSTSALKVPQLKVAESAQSPAAAHTTDTAGYNAMEESVSREKPELTASTERVNKRMSMVVSGL TPEEFMLVYKFARKHHITLTNLITEETTHVVMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGGKWVVSYFWVTQSIKERK MLNEHDFEVRGDVVNGRNHQGPKRARESQDRKIFRGLEICCYGPFTNMPTDQLEWMVQLCGASVVKELSS FTLGTGVHPIVVVQPDAWTEDNGFHAIGQMCEAPVVTREWVLDSVALYQCQELDTYLIPQIPHSHY ; 'Breast cancer type 1 susceptibility protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1816 1 1816 2 2 1 1816 1 1816 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . A0A9Y1QQK3_HUMAN A0A9Y1QQK3 . 1 1816 9606 'Homo sapiens (Human)' 2023-11-08 BC96815F32430DEF 1 UNP . 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B 1 1692 ASP 1692 ? ? ? B . B 1 1693 VAL 1693 ? ? ? B . B 1 1694 VAL 1694 ? ? ? B . B 1 1695 ASN 1695 ? ? ? B . B 1 1696 GLY 1696 ? ? ? B . B 1 1697 ARG 1697 ? ? ? B . B 1 1698 ASN 1698 ? ? ? B . B 1 1699 HIS 1699 ? ? ? B . B 1 1700 GLN 1700 ? ? ? B . B 1 1701 GLY 1701 ? ? ? B . B 1 1702 PRO 1702 ? ? ? B . B 1 1703 LYS 1703 ? ? ? B . B 1 1704 ARG 1704 ? ? ? B . B 1 1705 ALA 1705 ? ? ? B . B 1 1706 ARG 1706 ? ? ? B . B 1 1707 GLU 1707 ? ? ? B . B 1 1708 SER 1708 ? ? ? B . B 1 1709 GLN 1709 ? ? ? B . B 1 1710 ASP 1710 ? ? ? B . B 1 1711 ARG 1711 ? ? ? B . B 1 1712 LYS 1712 ? ? ? B . B 1 1713 ILE 1713 ? ? ? B . B 1 1714 PHE 1714 ? ? ? B . B 1 1715 ARG 1715 ? ? ? B . B 1 1716 GLY 1716 ? ? ? B . B 1 1717 LEU 1717 ? ? ? B . B 1 1718 GLU 1718 ? ? ? B . B 1 1719 ILE 1719 ? ? ? B . B 1 1720 CYS 1720 ? ? ? B . B 1 1721 CYS 1721 ? ? ? B . B 1 1722 TYR 1722 ? ? ? B . B 1 1723 GLY 1723 ? ? ? B . B 1 1724 PRO 1724 ? ? ? B . B 1 1725 PHE 1725 ? ? ? B . B 1 1726 THR 1726 ? ? ? B . B 1 1727 ASN 1727 ? ? ? B . B 1 1728 MET 1728 ? ? ? B . B 1 1729 PRO 1729 ? ? ? B . B 1 1730 THR 1730 ? ? ? B . B 1 1731 ASP 1731 ? ? ? B . B 1 1732 GLN 1732 ? ? ? B . B 1 1733 LEU 1733 ? ? ? B . B 1 1734 GLU 1734 ? ? ? B . B 1 1735 TRP 1735 ? ? ? B . B 1 1736 MET 1736 ? ? ? B . B 1 1737 VAL 1737 ? ? ? B . B 1 1738 GLN 1738 ? ? ? B . B 1 1739 LEU 1739 ? ? ? B . B 1 1740 CYS 1740 ? ? ? B . B 1 1741 GLY 1741 ? ? ? B . B 1 1742 ALA 1742 ? ? ? B . B 1 1743 SER 1743 ? ? ? B . B 1 1744 VAL 1744 ? ? ? B . B 1 1745 VAL 1745 ? ? ? B . B 1 1746 LYS 1746 ? ? ? B . B 1 1747 GLU 1747 ? ? ? B . B 1 1748 LEU 1748 ? ? ? B . B 1 1749 SER 1749 ? ? ? B . B 1 1750 SER 1750 ? ? ? B . B 1 1751 PHE 1751 ? ? ? B . B 1 1752 THR 1752 ? ? ? B . B 1 1753 LEU 1753 ? ? ? B . B 1 1754 GLY 1754 ? ? ? B . B 1 1755 THR 1755 ? ? ? B . B 1 1756 GLY 1756 ? ? ? B . B 1 1757 VAL 1757 ? ? ? B . B 1 1758 HIS 1758 ? ? ? B . B 1 1759 PRO 1759 ? ? ? B . B 1 1760 ILE 1760 ? ? ? B . B 1 1761 VAL 1761 ? ? ? B . B 1 1762 VAL 1762 ? ? ? B . B 1 1763 VAL 1763 ? ? ? B . B 1 1764 GLN 1764 ? ? ? B . B 1 1765 PRO 1765 ? ? ? B . B 1 1766 ASP 1766 ? ? ? B . B 1 1767 ALA 1767 ? ? ? B . B 1 1768 TRP 1768 ? ? ? B . B 1 1769 THR 1769 ? ? ? B . B 1 1770 GLU 1770 ? ? ? B . B 1 1771 ASP 1771 ? ? ? B . B 1 1772 ASN 1772 ? ? ? B . B 1 1773 GLY 1773 ? ? ? B . B 1 1774 PHE 1774 ? ? ? B . B 1 1775 HIS 1775 ? ? ? B . B 1 1776 ALA 1776 ? ? ? B . B 1 1777 ILE 1777 ? ? ? B . B 1 1778 GLY 1778 ? ? ? B . B 1 1779 GLN 1779 ? ? ? B . B 1 1780 MET 1780 ? ? ? B . B 1 1781 CYS 1781 ? ? ? B . B 1 1782 GLU 1782 ? ? ? B . B 1 1783 ALA 1783 ? ? ? B . B 1 1784 PRO 1784 ? ? ? B . B 1 1785 VAL 1785 ? ? ? B . B 1 1786 VAL 1786 ? ? ? B . B 1 1787 THR 1787 ? ? ? B . B 1 1788 ARG 1788 ? ? ? B . B 1 1789 GLU 1789 ? ? ? B . B 1 1790 TRP 1790 ? ? ? B . B 1 1791 VAL 1791 ? ? ? B . B 1 1792 LEU 1792 ? ? ? B . B 1 1793 ASP 1793 ? ? ? B . B 1 1794 SER 1794 ? ? ? B . B 1 1795 VAL 1795 ? ? ? B . B 1 1796 ALA 1796 ? ? ? B . B 1 1797 LEU 1797 ? ? ? B . B 1 1798 TYR 1798 ? ? ? B . B 1 1799 GLN 1799 ? ? ? B . B 1 1800 CYS 1800 ? ? ? B . B 1 1801 GLN 1801 ? ? ? B . B 1 1802 GLU 1802 ? ? ? B . B 1 1803 LEU 1803 ? ? ? B . B 1 1804 ASP 1804 ? ? ? B . B 1 1805 THR 1805 ? ? ? B . B 1 1806 TYR 1806 ? ? ? B . B 1 1807 LEU 1807 ? ? ? B . B 1 1808 ILE 1808 ? ? ? B . B 1 1809 PRO 1809 ? ? ? B . B 1 1810 GLN 1810 ? ? ? B . B 1 1811 ILE 1811 ? ? ? B . B 1 1812 PRO 1812 ? ? ? B . B 1 1813 HIS 1813 ? ? ? B . B 1 1814 SER 1814 ? ? ? B . B 1 1815 HIS 1815 ? ? ? B . B 1 1816 TYR 1816 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Voltage-gated hydrogen channel 1 {PDB ID=3vmy, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=3vmy.1.A}' 'template structure' . 2 'Voltage-gated hydrogen channel 1 {PDB ID=3vmy, label_asym_id=C, auth_asym_id=B, SMTL ID=3vmy.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 3vmy, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 3vmy, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B C 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GSERQILRLKQINIQLATKIQHLEFSCSEKEQEIERLNKLLKQNGLLGDVN GSERQILRLKQINIQLATKIQHLEFSCSEKEQEIERLNKLLKQNGLLGDVN 2 GSERQILRLKQINIQLATKIQHLEFSCSEKEQEIERLNKLLKQNGLLGDVN GSERQILRLKQINIQLATKIQHLEFSCSEKEQEIERLNKLLKQNGLLGDVN # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 18 47 2 2 18 47 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3vmy 2023-11-08 2 PDB . 3vmy 2023-11-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1816 2 2 B 1 1816 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1816 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1816 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 29.000 20.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 29.000 20.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MLKLLNQKKGPSQCPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVEELLKIICAFQLDTGLEYANSYNFAKKENNSPEHLKDEVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQLSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYIELGSDSSEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQGTRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQPSNNDLNTTEKRAAERHPEKYQGSSVSNLHVEPCGTNTHASSLQHENSSLLLTKDRMNVEKAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKETCNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPCSENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDDSHDGESESNAKVADVLDVLNEVDEYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRKKASLPNLSHVTENLIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTNQTEQNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNIHNSKAPKKNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPVRHSRNLQLMEGKEPATGAKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKEFVNPSLPREEKEEKLETVKVSNNAEDPKDLMLSGERVLQTERSVESSSISLVPGTDYGTQESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHGCSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHSRETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSAHSGSLKKQSPKVTFECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQFRGNETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIPSTVSTISRNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKLNAMLRLGVLQPEVYKQSLPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSSHASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAENDIKESSAVFSKSVQKGELSRSPSPFTHTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGKVNNIPSQSTRHSTVATECLSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLTANTNTQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASGCESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPSIISDSSALEDLRNPEQSTSEKAVLTSQKSSEYPISQNPEGLSADKFEVSADSSTSKNKEPGVERSSPSKCPSLDDRWYMHSCSGSLQNRNYPSQEELIKVVDVEEQQLEESGPHDLTETSYLPRQDLEGTPYLESGISLFSDDPESDPSEDRAPESARVGNIPSSTSALKVPQLKVAESAQSPAAAHTTDTAGYNAMEESVSREKPELTASTERVNKRMSMVVSGLTPEEFMLVYKFARKHHITLTNLITEETTHVVMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGGKWVVSYFWVTQSIKERKMLNEHDFEVRGDVVNGRNHQGPKRARESQDRKIFRGLEICCYGPFTNMPTDQLEWMVQLCGASVVKELSSFTLGTGVHPIVVVQPDAWTEDNGFHAIGQMCEAPVVTREWVLDSVALYQCQELDTYLIPQIPHSHY 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TKIQHLEFSCSEKEQEIERLNKLLKQNGLL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MLKLLNQKKGPSQCPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVEELLKIICAFQLDTGLEYANSYNFAKKENNSPEHLKDEVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQLSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYIELGSDSSEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQGTRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQPSNNDLNTTEKRAAERHPEKYQGSSVSNLHVEPCGTNTHASSLQHENSSLLLTKDRMNVEKAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKETCNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPCSENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDDSHDGESESNAKVADVLDVLNEVDEYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRKKASLPNLSHVTENLIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTNQTEQNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNIHNSKAPKKNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPVRHSRNLQLMEGKEPATGAKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKEFVNPSLPREEKEEKLETVKVSNNAEDPKDLMLSGERVLQTERSVESSSISLVPGTDYGTQESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHGCSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHSRETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSAHSGSLKKQSPKVTFECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQFRGNETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIPSTVSTISRNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKLNAMLRLGVLQPEVYKQSLPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSSHASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAENDIKESSAVFSKSVQKGELSRSPSPFTHTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGKVNNIPSQSTRHSTVATECLSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLTANTNTQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASGCESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPSIISDSSALEDLRNPEQSTSEKAVLTSQKSSEYPISQNPEGLSADKFEVSADSSTSKNKEPGVERSSPSKCPSLDDRWYMHSCSGSLQNRNYPSQEELIKVVDVEEQQLEESGPHDLTETSYLPRQDLEGTPYLESGISLFSDDPESDPSEDRAPESARVGNIPSSTSALKVPQLKVAESAQSPAAAHTTDTAGYNAMEESVSREKPELTASTERVNKRMSMVVSGLTPEEFMLVYKFARKHHITLTNLITEETTHVVMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGGKWVVSYFWVTQSIKERKMLNEHDFEVRGDVVNGRNHQGPKRARESQDRKIFRGLEICCYGPFTNMPTDQLEWMVQLCGASVVKELSSFTLGTGVHPIVVVQPDAWTEDNGFHAIGQMCEAPVVTREWVLDSVALYQCQELDTYLIPQIPHSHY 4 2 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TKIQHLEFSCSEKEQEIERLNKLLKQNGLL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.120}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3vmy.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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GLN 1349 1349 ? A 39.192 39.964 15.894 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 16 C CD . GLN 1349 1349 ? A 38.468 41.256 16.269 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 17 O OE1 . GLN 1349 1349 ? A 37.852 41.878 15.401 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 18 N NE2 . GLN 1349 1349 ? A 38.513 41.658 17.556 1 1 A GLN 0.490 1 ATOM 19 N N . ARG 1350 1350 ? A 37.213 36.854 13.007 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 20 C CA . ARG 1350 1350 ? A 36.299 35.864 12.448 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 21 C C . ARG 1350 1350 ? A 36.853 34.429 12.433 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 22 O O . ARG 1350 1350 ? A 36.167 33.523 12.894 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 23 C CB . ARG 1350 1350 ? A 35.880 36.256 11.010 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 24 C CG . ARG 1350 1350 ? A 34.868 35.278 10.368 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 25 C CD . ARG 1350 1350 ? A 34.393 35.678 8.972 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 26 N NE . ARG 1350 1350 ? A 35.587 35.573 8.081 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 27 C CZ . ARG 1350 1350 ? A 35.671 36.180 6.891 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 28 N NH1 . ARG 1350 1350 ? A 34.668 36.925 6.427 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 29 N NH2 . ARG 1350 1350 ? A 36.760 36.008 6.145 1 1 A ARG 0.510 1 ATOM 30 N N . ASP 1351 1351 ? A 38.102 34.204 11.963 1 1 A ASP 0.550 1 ATOM 31 C CA . ASP 1351 1351 ? A 38.821 32.934 11.899 1 1 A ASP 0.550 1 ATOM 32 C C . ASP 1351 1351 ? A 38.977 32.318 13.301 1 1 A ASP 0.550 1 ATOM 33 O O . ASP 1351 1351 ? A 38.654 31.154 13.546 1 1 A ASP 0.550 1 ATOM 34 C CB . ASP 1351 1351 ? A 40.213 33.211 11.232 1 1 A ASP 0.550 1 ATOM 35 C CG . ASP 1351 1351 ? A 40.108 33.999 9.910 1 1 A ASP 0.550 1 ATOM 36 O OD1 . ASP 1351 1351 ? A 39.012 34.067 9.296 1 1 A ASP 0.550 1 ATOM 37 O OD2 . ASP 1351 1351 ? A 41.099 34.714 9.600 1 1 A ASP 0.550 1 ATOM 38 N N . THR 1352 1352 ? A 39.381 33.166 14.282 1 1 A THR 0.570 1 ATOM 39 C CA . THR 1352 1352 ? A 39.444 32.871 15.725 1 1 A THR 0.570 1 ATOM 40 C C . THR 1352 1352 ? A 38.099 32.447 16.291 1 1 A THR 0.570 1 ATOM 41 O O . THR 1352 1352 ? A 37.980 31.432 16.976 1 1 A THR 0.570 1 ATOM 42 C CB . THR 1352 1352 ? A 39.936 34.053 16.582 1 1 A THR 0.570 1 ATOM 43 O OG1 . THR 1352 1352 ? A 41.236 34.472 16.195 1 1 A THR 0.570 1 ATOM 44 C CG2 . THR 1352 1352 ? A 40.043 33.695 18.075 1 1 A THR 0.570 1 ATOM 45 N N . MET 1353 1353 ? A 37.028 33.206 15.985 1 1 A MET 0.550 1 ATOM 46 C CA . MET 1353 1353 ? A 35.658 32.899 16.346 1 1 A MET 0.550 1 ATOM 47 C C . MET 1353 1353 ? A 35.128 31.617 15.720 1 1 A MET 0.550 1 ATOM 48 O O . MET 1353 1353 ? A 34.503 30.811 16.403 1 1 A MET 0.550 1 ATOM 49 C CB . MET 1353 1353 ? A 34.719 34.089 16.039 1 1 A MET 0.550 1 ATOM 50 C CG . MET 1353 1353 ? A 34.925 35.313 16.953 1 1 A MET 0.550 1 ATOM 51 S SD . MET 1353 1353 ? A 33.730 36.640 16.638 1 1 A MET 0.550 1 ATOM 52 C CE . MET 1353 1353 ? A 34.351 37.779 17.904 1 1 A MET 0.550 1 ATOM 53 N N . GLN 1354 1354 ? A 35.393 31.354 14.426 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 54 C CA . GLN 1354 1354 ? A 35.074 30.085 13.791 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 55 C C . GLN 1354 1354 ? A 35.784 28.891 14.437 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 56 O O . GLN 1354 1354 ? A 35.148 27.899 14.789 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 57 C CB . GLN 1354 1354 ? A 35.373 30.165 12.274 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 58 C CG . GLN 1354 1354 ? A 34.422 31.134 11.532 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 59 C CD . GLN 1354 1354 ? A 34.804 31.254 10.060 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 60 O OE1 . GLN 1354 1354 ? A 35.921 30.971 9.639 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 61 N NE2 . GLN 1354 1354 ? A 33.835 31.683 9.214 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 62 N N . HIS 1355 1355 ? A 37.103 29.002 14.697 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 63 C CA . HIS 1355 1355 ? A 37.897 27.995 15.395 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 64 C C . HIS 1355 1355 ? A 37.414 27.701 16.811 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 65 O O . HIS 1355 1355 ? A 37.265 26.549 17.223 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 66 C CB . HIS 1355 1355 ? A 39.366 28.466 15.490 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 67 C CG . HIS 1355 1355 ? A 40.266 27.473 16.139 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 68 N ND1 . HIS 1355 1355 ? A 40.578 26.335 15.434 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 69 C CD2 . HIS 1355 1355 ? A 40.818 27.434 17.380 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 70 C CE1 . HIS 1355 1355 ? A 41.318 25.621 16.249 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 71 N NE2 . HIS 1355 1355 ? A 41.499 26.238 17.442 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 72 N N . ASN 1356 1356 ? A 37.120 28.762 17.589 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 73 C CA . ASN 1356 1356 ? A 36.569 28.650 18.930 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 74 C C . ASN 1356 1356 ? A 35.190 28.000 18.986 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 75 O O . ASN 1356 1356 ? A 34.899 27.231 19.899 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 76 C CB . ASN 1356 1356 ? A 36.500 30.025 19.630 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 77 C CG . ASN 1356 1356 ? A 37.900 30.488 20.013 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 78 O OD1 . ASN 1356 1356 ? A 38.845 29.708 20.116 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 79 N ND2 . ASN 1356 1356 ? A 38.050 31.806 20.285 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 80 N N . LEU 1357 1357 ? A 34.308 28.297 18.007 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 81 C CA . LEU 1357 1357 ? A 32.986 27.695 17.874 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 82 C C . LEU 1357 1357 ? A 33.075 26.208 17.631 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 83 O O . LEU 1357 1357 ? A 32.426 25.416 18.315 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 84 C CB . LEU 1357 1357 ? A 32.178 28.385 16.732 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 85 C CG . LEU 1357 1357 ? A 30.680 27.998 16.586 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 86 C CD1 . LEU 1357 1357 ? A 29.847 29.075 15.881 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 87 C CD2 . LEU 1357 1357 ? A 30.366 26.686 15.857 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 88 N N . ILE 1358 1358 ? A 33.942 25.801 16.684 1 1 A ILE 0.540 1 ATOM 89 C CA . ILE 1358 1358 ? A 34.191 24.410 16.318 1 1 A ILE 0.540 1 ATOM 90 C C . ILE 1358 1358 ? A 34.720 23.606 17.495 1 1 A ILE 0.540 1 ATOM 91 O O . ILE 1358 1358 ? A 34.251 22.502 17.783 1 1 A ILE 0.540 1 ATOM 92 C CB . ILE 1358 1358 ? A 35.146 24.340 15.128 1 1 A ILE 0.540 1 ATOM 93 C CG1 . ILE 1358 1358 ? A 34.442 24.900 13.869 1 1 A ILE 0.540 1 ATOM 94 C CG2 . ILE 1358 1358 ? A 35.656 22.898 14.888 1 1 A ILE 0.540 1 ATOM 95 C CD1 . ILE 1358 1358 ? A 35.403 25.177 12.707 1 1 A ILE 0.540 1 ATOM 96 N N . LYS 1359 1359 ? 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LEU 1360 1360 ? A 33.350 26.624 22.746 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 111 C CD1 . LEU 1360 1360 ? A 32.700 28.018 22.787 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 112 C CD2 . LEU 1360 1360 ? A 33.597 26.106 24.166 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 113 N N . GLN 1361 1361 ? A 31.742 23.078 19.950 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 114 C CA . GLN 1361 1361 ? A 30.923 21.983 19.437 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 115 C C . GLN 1361 1361 ? A 31.516 20.613 19.741 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 116 O O . GLN 1361 1361 ? A 30.805 19.702 20.164 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 117 C CB . GLN 1361 1361 ? A 30.660 22.086 17.916 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 118 C CG . GLN 1361 1361 ? A 29.743 23.267 17.541 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 119 C CD . GLN 1361 1361 ? A 29.503 23.287 16.032 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 120 O OE1 . GLN 1361 1361 ? A 30.314 22.823 15.235 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 121 N NE2 . GLN 1361 1361 ? A 28.351 23.859 15.606 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 122 N N . GLN 1362 1362 ? A 32.845 20.450 19.579 1 1 A GLN 0.540 1 ATOM 123 C CA . GLN 1362 1362 ? 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A 35.360 21.602 24.465 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 137 C CD . GLU 1363 1363 ? A 35.747 22.942 25.104 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 138 O OE1 . GLU 1363 1363 ? A 34.896 23.579 25.768 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 139 O OE2 . GLU 1363 1363 ? A 36.927 23.348 24.910 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 140 N N . MET 1364 1364 ? A 31.050 20.128 23.530 1 1 A MET 0.540 1 ATOM 141 C CA . MET 1364 1364 ? A 29.665 19.707 23.693 1 1 A MET 0.540 1 ATOM 142 C C . MET 1364 1364 ? A 29.423 18.226 23.350 1 1 A MET 0.540 1 ATOM 143 O O . MET 1364 1364 ? A 28.881 17.492 24.171 1 1 A MET 0.540 1 ATOM 144 C CB . MET 1364 1364 ? A 28.745 20.622 22.851 1 1 A MET 0.540 1 ATOM 145 C CG . MET 1364 1364 ? A 27.233 20.383 22.990 1 1 A MET 0.540 1 ATOM 146 S SD . MET 1364 1364 ? A 26.242 21.564 22.019 1 1 A MET 0.540 1 ATOM 147 C CE . MET 1364 1364 ? A 26.555 20.795 20.411 1 1 A MET 0.540 1 ATOM 148 N N . ALA 1365 1365 ? A 29.920 17.730 22.189 1 1 A ALA 0.560 1 ATOM 149 C CA . ALA 1365 1365 ? 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GLN 1373 1373 ? A 31.268 7.355 26.075 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 216 N NE2 . GLN 1373 1373 ? A 31.516 6.986 28.280 1 1 A GLN 0.550 1 ATOM 217 N N . HIS 1374 1374 ? A 26.405 7.329 30.917 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 218 C CA . HIS 1374 1374 ? A 25.999 7.232 32.307 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 219 C C . HIS 1374 1374 ? A 24.480 7.260 32.448 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 220 O O . HIS 1374 1374 ? A 23.949 7.415 33.547 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 221 C CB . HIS 1374 1374 ? A 26.690 8.324 33.163 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 222 C CG . HIS 1374 1374 ? A 28.182 8.133 33.278 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 223 N ND1 . HIS 1374 1374 ? A 29.000 8.530 32.244 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 224 C CD2 . HIS 1374 1374 ? A 28.934 7.580 34.267 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 225 C CE1 . HIS 1374 1374 ? A 30.218 8.217 32.607 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 226 N NE2 . HIS 1374 1374 ? A 30.241 7.638 33.827 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 227 N N . GLY 1375 1375 ? A 23.729 7.069 31.337 1 1 A GLY 0.510 1 ATOM 228 C CA . GLY 1375 1375 ? A 22.284 6.848 31.388 1 1 A GLY 0.510 1 ATOM 229 C C . GLY 1375 1375 ? A 21.447 8.072 31.585 1 1 A GLY 0.510 1 ATOM 230 O O . GLY 1375 1375 ? A 20.311 7.968 32.037 1 1 A GLY 0.510 1 ATOM 231 N N . SER 1376 1376 ? A 21.979 9.272 31.292 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 232 C CA . SER 1376 1376 ? A 21.256 10.502 31.559 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 233 C C . SER 1376 1376 ? A 20.681 11.164 30.322 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 234 O O . SER 1376 1376 ? A 20.160 12.275 30.425 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 235 C CB . SER 1376 1376 ? A 22.122 11.530 32.337 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 236 O OG . SER 1376 1376 ? A 23.280 11.924 31.606 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 237 N N . GLN 1377 1377 ? A 20.752 10.508 29.148 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 238 C CA . GLN 1377 1377 ? A 20.197 10.959 27.887 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 239 C C . GLN 1377 1377 ? A 19.398 9.784 27.267 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 240 O O . GLN 1377 1377 ? A 19.468 8.656 27.824 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 241 C CB . GLN 1377 1377 ? A 21.295 11.295 26.843 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 242 C CG . GLN 1377 1377 ? A 22.348 12.323 27.291 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 243 C CD . GLN 1377 1377 ? A 21.740 13.683 27.603 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 244 O OE1 . GLN 1377 1377 ? A 21.142 14.352 26.761 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 245 N NE2 . GLN 1377 1377 ? A 21.920 14.158 28.860 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 246 O OXT . GLN 1377 1377 ? A 18.757 10.001 26.202 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 247 N N . GLN 1348 1348 ? B 29.620 42.954 11.353 1 1 B GLN 0.400 1 ATOM 248 C CA . GLN 1348 1348 ? B 28.360 42.150 11.549 1 1 B GLN 0.400 1 ATOM 249 C C . GLN 1348 1348 ? B 28.549 40.658 11.789 1 1 B GLN 0.400 1 ATOM 250 O O . GLN 1348 1348 ? B 28.086 40.139 12.794 1 1 B GLN 0.400 1 ATOM 251 C CB . GLN 1348 1348 ? B 27.403 42.411 10.370 1 1 B GLN 0.400 1 ATOM 252 C CG . GLN 1348 1348 ? B 26.974 43.891 10.213 1 1 B GLN 0.400 1 ATOM 253 C CD . GLN 1348 1348 ? B 26.115 44.043 8.952 1 1 B GLN 0.400 1 ATOM 254 O OE1 . GLN 1348 1348 ? B 26.276 43.278 8.005 1 1 B GLN 0.400 1 ATOM 255 N NE2 . GLN 1348 1348 ? 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ARG 1350 1350 ? B 32.767 40.046 14.576 1 1 B ARG 0.480 1 ATOM 270 C CG . ARG 1350 1350 ? B 34.051 39.929 13.732 1 1 B ARG 0.480 1 ATOM 271 C CD . ARG 1350 1350 ? B 35.168 40.852 14.229 1 1 B ARG 0.480 1 ATOM 272 N NE . ARG 1350 1350 ? B 34.742 42.276 14.065 1 1 B ARG 0.480 1 ATOM 273 C CZ . ARG 1350 1350 ? B 34.971 43.025 12.977 1 1 B ARG 0.480 1 ATOM 274 N NH1 . ARG 1350 1350 ? B 35.551 42.524 11.888 1 1 B ARG 0.480 1 ATOM 275 N NH2 . ARG 1350 1350 ? B 34.654 44.319 12.993 1 1 B ARG 0.480 1 ATOM 276 N N . ASP 1351 1351 ? B 29.689 39.819 15.460 1 1 B ASP 0.520 1 ATOM 277 C CA . ASP 1351 1351 ? B 28.621 39.892 16.446 1 1 B ASP 0.520 1 ATOM 278 C C . ASP 1351 1351 ? B 27.776 38.614 16.452 1 1 B ASP 0.520 1 ATOM 279 O O . ASP 1351 1351 ? B 27.507 38.019 17.499 1 1 B ASP 0.520 1 ATOM 280 C CB . ASP 1351 1351 ? B 27.753 41.150 16.155 1 1 B ASP 0.520 1 ATOM 281 C CG . ASP 1351 1351 ? B 28.568 42.447 16.205 1 1 B ASP 0.520 1 ATOM 282 O OD1 . ASP 1351 1351 ? 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B 25.184 30.842 27.723 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 374 C CD . GLN 1362 1362 ? B 26.092 31.407 28.807 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 375 O OE1 . GLN 1362 1362 ? B 27.147 31.963 28.510 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 376 N NE2 . GLN 1362 1362 ? B 25.685 31.284 30.090 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 377 N N . GLU 1363 1363 ? B 25.689 26.281 27.022 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 378 C CA . GLU 1363 1363 ? B 25.415 24.852 26.932 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 379 C C . GLU 1363 1363 ? B 26.494 24.015 27.589 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 380 O O . GLU 1363 1363 ? B 26.212 23.121 28.383 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 381 C CB . GLU 1363 1363 ? B 25.250 24.448 25.449 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 382 C CG . GLU 1363 1363 ? B 24.929 22.957 25.192 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 383 C CD . GLU 1363 1363 ? B 23.541 22.566 25.706 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 384 O OE1 . GLU 1363 1363 ? B 22.706 23.480 25.884 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 385 O OE2 . GLU 1363 1363 ? B 23.326 21.340 25.858 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 386 N N . MET 1364 1364 ? 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GLU 1366 1366 ? B 24.754 23.539 31.636 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 401 C C . GLU 1366 1366 ? B 25.129 22.066 31.747 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 402 O O . GLU 1366 1366 ? B 24.937 21.426 32.781 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 403 C CB . GLU 1366 1366 ? B 23.606 23.719 30.599 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 404 C CG . GLU 1366 1366 ? B 22.325 22.922 30.965 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 405 C CD . GLU 1366 1366 ? B 21.044 23.238 30.160 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 406 O OE1 . GLU 1366 1366 ? B 20.888 24.358 29.648 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 407 O OE2 . GLU 1366 1366 ? B 20.149 22.346 30.237 1 1 B GLU 0.510 1 ATOM 408 N N . LEU 1367 1367 ? B 25.789 21.520 30.711 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 409 C CA . LEU 1367 1367 ? B 26.245 20.148 30.669 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 410 C C . LEU 1367 1367 ? B 27.262 19.794 31.742 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 411 O O . LEU 1367 1367 ? B 27.186 18.715 32.327 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 412 C CB . LEU 1367 1367 ? B 26.857 19.798 29.298 1 1 B LEU 0.520 1 ATOM 413 C CG . LEU 1367 1367 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.528 2 1 3 0 3 1 4 0.120 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1348 GLN 1 0.430 2 1 A 1349 GLN 1 0.490 3 1 A 1350 ARG 1 0.510 4 1 A 1351 ASP 1 0.550 5 1 A 1352 THR 1 0.570 6 1 A 1353 MET 1 0.550 7 1 A 1354 GLN 1 0.550 8 1 A 1355 HIS 1 0.540 9 1 A 1356 ASN 1 0.570 10 1 A 1357 LEU 1 0.570 11 1 A 1358 ILE 1 0.540 12 1 A 1359 LYS 1 0.520 13 1 A 1360 LEU 1 0.570 14 1 A 1361 GLN 1 0.560 15 1 A 1362 GLN 1 0.540 16 1 A 1363 GLU 1 0.520 17 1 A 1364 MET 1 0.540 18 1 A 1365 ALA 1 0.560 19 1 A 1366 GLU 1 0.520 20 1 A 1367 LEU 1 0.520 21 1 A 1368 GLU 1 0.520 22 1 A 1369 ALA 1 0.560 23 1 A 1370 VAL 1 0.530 24 1 A 1371 LEU 1 0.520 25 1 A 1372 GLU 1 0.510 26 1 A 1373 GLN 1 0.550 27 1 A 1374 HIS 1 0.490 28 1 A 1375 GLY 1 0.510 29 1 A 1376 SER 1 0.530 30 1 A 1377 GLN 1 0.480 31 1 B 1348 GLN 1 0.400 32 1 B 1349 GLN 1 0.460 33 1 B 1350 ARG 1 0.480 34 1 B 1351 ASP 1 0.520 35 1 B 1352 THR 1 0.540 36 1 B 1353 MET 1 0.540 37 1 B 1354 GLN 1 0.560 38 1 B 1355 HIS 1 0.540 39 1 B 1356 ASN 1 0.560 40 1 B 1357 LEU 1 0.570 41 1 B 1358 ILE 1 0.540 42 1 B 1359 LYS 1 0.510 43 1 B 1360 LEU 1 0.580 44 1 B 1361 GLN 1 0.560 45 1 B 1362 GLN 1 0.530 46 1 B 1363 GLU 1 0.510 47 1 B 1364 MET 1 0.540 48 1 B 1365 ALA 1 0.560 49 1 B 1366 GLU 1 0.510 50 1 B 1367 LEU 1 0.520 51 1 B 1368 GLU 1 0.520 52 1 B 1369 ALA 1 0.570 53 1 B 1370 VAL 1 0.530 54 1 B 1371 LEU 1 0.530 55 1 B 1372 GLU 1 0.510 56 1 B 1373 GLN 1 0.570 57 1 B 1374 HIS 1 0.500 58 1 B 1375 GLY 1 0.510 59 1 B 1376 SER 1 0.540 60 1 B 1377 GLN 1 0.480 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #