data_SMR-812cdbe09078e8a8232566e19cb7c559_5 _entry.id SMR-812cdbe09078e8a8232566e19cb7c559_5 _struct.entry_id SMR-812cdbe09078e8a8232566e19cb7c559_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O35889/ AFAD_RAT, Afadin Estimated model accuracy of this model is 0.015, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O35889' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 240908.039 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP AFAD_RAT O35889 1 ;MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTATTQD VIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNENDAIPAKKA QSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKREKEALRQASDKEERPSQGDDSENSRLAAEVYKDMPETS FTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNIPYKTILLSTTDPADFAVAE SLEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDERGAKEIILDDDECPLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDY IPKKMKKHVEGKPLKGKDRADGSGYGSALPPEKLPYLVELSPGRRNHFAYYSYHTYEDGSDSRDKPKLYR LQLSVTEVGTEKFDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGVVTVTPRSMDAETYVDGQRISETTMLQSGMRLQ FGTSHVFKFVDPIQDHVLSKRSVDGGLMVKGPRHKPGAVQETTFELGGDIHSGTALPASRSTTRLDSDRV SSASSTAERGMVKPMIRLDQEQDYRRRESRTQDAAGPELMLPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHF KLSPTYVLYMACRYVLSSQHRPDISPTERTHKAIAVVNKMVSMMEGVIQEVDQVDQKQKNIAGALAFWMA NASELLNFIKQDRDLSRITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVL HTLTGAMSLLRRCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQ GLELAADCHLSRIVQATTLLTMDKYVPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENVV AVAENTADELARSDGRDVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRLVPHTRS PGTWTIYFEGADYESHLMRENTELTQPLRKEPEVITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLGIYVKSVVKG GAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYHGLATLLNQPSPMMQRI SDRRGSGKPRPKSEGFELYNNSAQNGSPESPQMPWTEYSEPKKLPGDDRLMKNRADHRSSPNVANQPPSP GGKSPYTSGTAAKITSVSTGNLCTEEQTPPPRPEAYPIPTQTYTREYFTFPASKSQDRMAPVQNQWPNYE EKPHMHTESDHASIAIQRVTRSQEELREEKVYQLERHRVESGMDRKCDSDMWINQSSSVESSTSSQEHLN HSSKSVTPASTLTKSGPGRWKTPAAVLPTPVAVSQPIRTDLPPPPPPPPAHYTSDFDGISMDLPLPPPPA NQAAPQSAQVAAAERKKREEHQRWYEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRTQSLNPASFSPLATQAKPE KPSTLQRPQETVIRELQPQQQPRTIERRDLQYITISKEELSSGDSLSPDPWKRDAREKLEKQQQMHIVDM LSKEIHELQNKGDRTAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDDEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRARL QDEERRRQQQLEEMRKREVEDRVRQEEDGRHQEEERVKRDAEEKRRQEEGYYSRLEAERRRQHEEAARRL LEPEEPGLSRPPLPQDYEPPSQSSAPSAPPPPPQRNASYLKTQVLSPDSLFTAKFVAYDDDDEEENYVPA GPNSYSGSAGTTAGTYDAPRDTREKLSRSQDADLPGSSGAPENLTFRERQRLFSQGQDVSDKVKASRKLT ELENELNTK ; Afadin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1829 1 1829 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 1673 HIS 1673 ? ? ? A . A 1 1674 GLU 1674 ? ? ? A . A 1 1675 GLU 1675 ? ? ? A . A 1 1676 ALA 1676 ? ? ? A . A 1 1677 ALA 1677 ? ? ? A . A 1 1678 ARG 1678 ? ? ? A . A 1 1679 ARG 1679 ? ? ? A . A 1 1680 LEU 1680 ? ? ? A . A 1 1681 LEU 1681 ? ? ? A . A 1 1682 GLU 1682 ? ? ? A . A 1 1683 PRO 1683 ? ? ? A . A 1 1684 GLU 1684 ? ? ? A . A 1 1685 GLU 1685 ? ? ? A . A 1 1686 PRO 1686 ? ? ? A . A 1 1687 GLY 1687 ? ? ? A . A 1 1688 LEU 1688 ? ? ? A . A 1 1689 SER 1689 ? ? ? A . A 1 1690 ARG 1690 ? ? ? A . A 1 1691 PRO 1691 ? ? ? A . A 1 1692 PRO 1692 ? ? ? A . A 1 1693 LEU 1693 ? ? ? A . A 1 1694 PRO 1694 ? ? ? A . A 1 1695 GLN 1695 ? ? ? A . A 1 1696 ASP 1696 ? ? ? A . A 1 1697 TYR 1697 ? ? ? A . A 1 1698 GLU 1698 ? ? ? A . A 1 1699 PRO 1699 ? ? ? A . A 1 1700 PRO 1700 ? ? ? A . A 1 1701 SER 1701 ? ? ? A . A 1 1702 GLN 1702 ? ? ? A . A 1 1703 SER 1703 ? ? ? A . A 1 1704 SER 1704 ? ? ? A . A 1 1705 ALA 1705 ? ? ? A . A 1 1706 PRO 1706 ? ? ? A . A 1 1707 SER 1707 ? ? ? A . A 1 1708 ALA 1708 ? ? ? A . A 1 1709 PRO 1709 ? ? ? A . A 1 1710 PRO 1710 ? ? ? A . A 1 1711 PRO 1711 ? ? ? A . A 1 1712 PRO 1712 ? ? ? A . A 1 1713 PRO 1713 ? ? ? A . A 1 1714 GLN 1714 ? ? ? A . A 1 1715 ARG 1715 ? ? ? A . A 1 1716 ASN 1716 ? ? ? A . A 1 1717 ALA 1717 ? ? ? A . A 1 1718 SER 1718 ? ? ? A . A 1 1719 TYR 1719 ? ? ? A . A 1 1720 LEU 1720 ? ? ? A . A 1 1721 LYS 1721 ? ? ? A . A 1 1722 THR 1722 ? ? ? A . A 1 1723 GLN 1723 ? ? ? A . A 1 1724 VAL 1724 ? ? ? A . A 1 1725 LEU 1725 ? ? ? A . A 1 1726 SER 1726 ? ? ? A . A 1 1727 PRO 1727 ? ? ? A . A 1 1728 ASP 1728 ? ? ? A . A 1 1729 SER 1729 ? ? ? A . A 1 1730 LEU 1730 ? ? ? A . A 1 1731 PHE 1731 ? ? ? A . A 1 1732 THR 1732 ? ? ? A . A 1 1733 ALA 1733 ? ? ? A . A 1 1734 LYS 1734 ? ? ? A . A 1 1735 PHE 1735 ? ? ? A . A 1 1736 VAL 1736 ? ? ? A . A 1 1737 ALA 1737 ? ? ? A . A 1 1738 TYR 1738 ? ? ? A . A 1 1739 ASP 1739 ? ? ? A . A 1 1740 ASP 1740 ? ? ? A . A 1 1741 ASP 1741 ? ? ? A . A 1 1742 ASP 1742 ? ? ? A . A 1 1743 GLU 1743 ? ? ? A . A 1 1744 GLU 1744 ? ? ? A . A 1 1745 GLU 1745 ? ? ? A . A 1 1746 ASN 1746 ? ? ? A . A 1 1747 TYR 1747 ? ? ? A . A 1 1748 VAL 1748 ? ? ? A . A 1 1749 PRO 1749 ? ? ? A . A 1 1750 ALA 1750 ? ? ? A . A 1 1751 GLY 1751 ? ? ? A . A 1 1752 PRO 1752 ? ? ? A . A 1 1753 ASN 1753 ? ? ? A . A 1 1754 SER 1754 ? ? ? A . A 1 1755 TYR 1755 ? ? ? A . A 1 1756 SER 1756 ? ? ? A . A 1 1757 GLY 1757 ? ? ? A . A 1 1758 SER 1758 ? ? ? A . A 1 1759 ALA 1759 ? ? ? A . A 1 1760 GLY 1760 ? ? ? A . A 1 1761 THR 1761 ? ? ? A . A 1 1762 THR 1762 ? ? ? A . A 1 1763 ALA 1763 ? ? ? A . A 1 1764 GLY 1764 ? ? ? A . A 1 1765 THR 1765 ? ? ? A . A 1 1766 TYR 1766 ? ? ? A . A 1 1767 ASP 1767 ? ? ? A . A 1 1768 ALA 1768 ? ? ? A . A 1 1769 PRO 1769 ? ? ? A . A 1 1770 ARG 1770 ? ? ? A . A 1 1771 ASP 1771 ? ? ? A . A 1 1772 THR 1772 ? ? ? A . A 1 1773 ARG 1773 ? ? ? A . A 1 1774 GLU 1774 ? ? ? A . A 1 1775 LYS 1775 ? ? ? A . A 1 1776 LEU 1776 ? ? ? A . A 1 1777 SER 1777 ? ? ? A . A 1 1778 ARG 1778 ? ? ? A . A 1 1779 SER 1779 ? ? ? A . A 1 1780 GLN 1780 ? ? ? A . A 1 1781 ASP 1781 ? ? ? A . A 1 1782 ALA 1782 ? ? ? A . A 1 1783 ASP 1783 ? ? ? A . A 1 1784 LEU 1784 ? ? ? A . A 1 1785 PRO 1785 ? ? ? A . A 1 1786 GLY 1786 ? ? ? A . A 1 1787 SER 1787 ? ? ? A . A 1 1788 SER 1788 ? ? ? A . A 1 1789 GLY 1789 ? ? ? A . A 1 1790 ALA 1790 ? ? ? A . A 1 1791 PRO 1791 ? ? ? A . A 1 1792 GLU 1792 ? ? ? A . A 1 1793 ASN 1793 ? ? ? A . A 1 1794 LEU 1794 ? ? ? A . A 1 1795 THR 1795 ? ? ? A . A 1 1796 PHE 1796 ? ? ? A . A 1 1797 ARG 1797 ? ? ? A . A 1 1798 GLU 1798 ? ? ? A . A 1 1799 ARG 1799 ? ? ? A . A 1 1800 GLN 1800 ? ? ? A . A 1 1801 ARG 1801 ? ? ? A . A 1 1802 LEU 1802 ? ? ? A . A 1 1803 PHE 1803 ? ? ? A . A 1 1804 SER 1804 ? ? ? A . A 1 1805 GLN 1805 ? ? ? A . A 1 1806 GLY 1806 ? ? ? A . A 1 1807 GLN 1807 ? ? ? A . A 1 1808 ASP 1808 ? ? ? A . A 1 1809 VAL 1809 ? ? ? A . A 1 1810 SER 1810 ? ? ? A . A 1 1811 ASP 1811 ? ? ? A . A 1 1812 LYS 1812 ? ? ? A . A 1 1813 VAL 1813 ? ? ? A . A 1 1814 LYS 1814 ? ? ? A . A 1 1815 ALA 1815 ? ? ? A . A 1 1816 SER 1816 ? ? ? A . A 1 1817 ARG 1817 ? ? ? A . A 1 1818 LYS 1818 ? ? ? A . A 1 1819 LEU 1819 ? ? ? A . A 1 1820 THR 1820 ? ? ? A . A 1 1821 GLU 1821 ? ? ? A . A 1 1822 LEU 1822 ? ? ? A . A 1 1823 GLU 1823 ? ? ? A . A 1 1824 ASN 1824 ? ? ? A . A 1 1825 GLU 1825 ? ? ? A . A 1 1826 LEU 1826 ? ? ? A . A 1 1827 ASN 1827 ? ? ? A . A 1 1828 THR 1828 ? ? ? A . A 1 1829 LYS 1829 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Afadin {PDB ID=1wln, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1wln.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 1wln, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGPEKLPYLVELSPDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKFDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGV VTVTPRSMDAETYVDGQRISETTMLQSGMRLQFGTSHVFKFVDPSGPSSG ; ;GSSGSSGPEKLPYLVELSPDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKFDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGV VTVTPRSMDAETYVDGQRISETTMLQSGMRLQFGTSHVFKFVDPSGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 114 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1wln 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1829 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1829 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 7.29e-64 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTATTQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNENDAIPAKKAQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKREKEALRQASDKEERPSQGDDSENSRLAAEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNIPYKTILLSTTDPADFAVAESLEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDERGAKEIILDDDECPLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDYIPKKMKKHVEGKPLKGKDRADGSGYGSALPPEKLPYLVELSPGRRNHFAYYSYHTYEDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKFDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGVVTVTPRSMDAETYVDGQRISETTMLQSGMRLQFGTSHVFKFVDPIQDHVLSKRSVDGGLMVKGPRHKPGAVQETTFELGGDIHSGTALPASRSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPMIRLDQEQDYRRRESRTQDAAGPELMLPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYVLSSQHRPDISPTERTHKAIAVVNKMVSMMEGVIQEVDQVDQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRDLSRITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAMSLLRRCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLELAADCHLSRIVQATTLLTMDKYVPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENVVAVAENTADELARSDGRDVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRLVPHTRSPGTWTIYFEGADYESHLMRENTELTQPLRKEPEVITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYHGLATLLNQPSPMMQRISDRRGSGKPRPKSEGFELYNNSAQNGSPESPQMPWTEYSEPKKLPGDDRLMKNRADHRSSPNVANQPPSPGGKSPYTSGTAAKITSVSTGNLCTEEQTPPPRPEAYPIPTQTYTREYFTFPASKSQDRMAPVQNQWPNYEEKPHMHTESDHASIAIQRVTRSQEELREEKVYQLERHRVESGMDRKCDSDMWINQSSSVESSTSSQEHLNHSSKSVTPASTLTKSGPGRWKTPAAVLPTPVAVSQPIRTDLPPPPPPPPAHYTSDFDGISMDLPLPPPPANQAAPQSAQVAAAERKKREEHQRWYEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRTQSLNPASFSPLATQAKPEKPSTLQRPQETVIRELQPQQQPRTIERRDLQYITISKEELSSGDSLSPDPWKRDAREKLEKQQQMHIVDMLSKEIHELQNKGDRTAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDDEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRARLQDEERRRQQQLEEMRKREVEDRVRQEEDGRHQEEERVKRDAEEKRRQEEGYYSRLEAERRRQHEEAARRLLEPEEPGLSRPPLPQDYEPPSQSSAPSAPPPPPQRNASYLKTQVLSPDSLFTAKFVAYDDDDEEENYVPAGPNSYSGSAGTTAGTYDAPRDTREKLSRSQDADLPGSSGAPENLTFRERQRLFSQGQDVSDKVKASRKLTELENELNTK 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PEKLPYLVELSP---------------DGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKFDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGVVTVTPRSMDAETYVDGQRISETTMLQSGMRLQFGTSHVFKFVDP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1wln.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 381 381 ? A -3.941 -13.791 8.813 1 1 A PRO 0.410 1 ATOM 2 C CA . PRO 381 381 ? A -4.324 -12.544 9.537 1 1 A PRO 0.410 1 ATOM 3 C C . PRO 381 381 ? A -3.223 -11.998 10.432 1 1 A PRO 0.410 1 ATOM 4 O O . PRO 381 381 ? A -3.362 -10.835 10.764 1 1 A PRO 0.410 1 ATOM 5 C CB . PRO 381 381 ? A -5.607 -12.930 10.268 1 1 A PRO 0.410 1 ATOM 6 C CG . PRO 381 381 ? A -5.531 -14.439 10.524 1 1 A PRO 0.410 1 ATOM 7 C CD . PRO 381 381 ? A -4.460 -14.974 9.582 1 1 A PRO 0.410 1 ATOM 8 N N . GLU 382 382 ? A -2.126 -12.698 10.822 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 9 C CA . GLU 382 382 ? A -1.106 -12.122 11.692 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 10 C C . GLU 382 382 ? A 0.016 -11.412 10.922 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 11 O O . GLU 382 382 ? A 0.877 -10.737 11.479 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 12 C CB . GLU 382 382 ? A -0.558 -13.300 12.539 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 13 C CG . GLU 382 382 ? A -0.145 -14.547 11.707 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 14 C CD . GLU 382 382 ? A 1.224 -15.113 12.097 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 15 O OE1 . GLU 382 382 ? A 2.236 -14.467 11.734 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 16 O OE2 . GLU 382 382 ? A 1.247 -16.230 12.667 1 1 A GLU 0.430 1 ATOM 17 N N . LYS 383 383 ? A -0.101 -11.472 9.585 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 18 C CA . LYS 383 383 ? A 0.841 -11.063 8.577 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 19 C C . LYS 383 383 ? A -0.005 -10.471 7.446 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 20 O O . LYS 383 383 ? A -0.193 -11.029 6.372 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 21 C CB . LYS 383 383 ? A 1.714 -12.269 8.128 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 22 C CG . LYS 383 383 ? A 0.938 -13.469 7.559 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 23 C CD . LYS 383 383 ? A 1.526 -14.833 7.938 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 24 C CE . LYS 383 383 ? A 2.441 -15.420 6.861 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 25 N NZ . LYS 383 383 ? A 3.840 -14.987 7.075 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 26 N N . LEU 384 384 ? A -0.665 -9.328 7.730 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 27 C CA . LEU 384 384 ? A -1.478 -8.613 6.761 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 28 C C . LEU 384 384 ? A -0.878 -7.272 6.486 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 29 O O . LEU 384 384 ? A -0.463 -6.607 7.440 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 30 C CB . LEU 384 384 ? A -2.882 -8.301 7.292 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 31 C CG . LEU 384 384 ? A -3.679 -9.562 7.589 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 32 C CD1 . LEU 384 384 ? A -4.894 -9.161 8.424 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 33 C CD2 . LEU 384 384 ? A -4.042 -10.316 6.298 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 34 N N . PRO 385 385 ? A -0.819 -6.865 5.218 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 35 C CA . PRO 385 385 ? A -0.103 -5.677 4.816 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 36 C C . PRO 385 385 ? A -0.601 -4.433 5.503 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 37 O O . PRO 385 385 ? A -1.779 -4.334 5.831 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 38 C CB . PRO 385 385 ? A -0.270 -5.596 3.299 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 39 C CG . PRO 385 385 ? A -1.465 -6.477 2.933 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 40 C CD . PRO 385 385 ? A -1.697 -7.362 4.151 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 41 N N . TYR 386 386 ? A 0.267 -3.456 5.751 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 42 C CA . TYR 386 386 ? A -0.136 -2.304 6.503 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 43 C C . TYR 386 386 ? A 0.471 -1.081 5.894 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 44 O O . TYR 386 386 ? A 1.487 -1.142 5.205 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 45 C CB . TYR 386 386 ? A 0.238 -2.416 8.002 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 46 C CG . TYR 386 386 ? A 1.700 -2.678 8.192 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 47 C CD1 . TYR 386 386 ? A 2.184 -3.993 8.201 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 48 C CD2 . TYR 386 386 ? A 2.598 -1.613 8.363 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 49 C CE1 . TYR 386 386 ? A 3.533 -4.244 8.471 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 50 C CE2 . TYR 386 386 ? A 3.936 -1.863 8.688 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 51 C CZ . TYR 386 386 ? A 4.392 -3.184 8.765 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 52 O OH . TYR 386 386 ? A 5.728 -3.461 9.094 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 53 N N . LEU 387 387 ? A -0.148 0.075 6.163 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 54 C CA . LEU 387 387 ? A 0.369 1.341 5.723 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 55 C C . LEU 387 387 ? A 0.842 2.066 6.953 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 56 O O . LEU 387 387 ? A 0.050 2.436 7.818 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 57 C CB . LEU 387 387 ? A -0.716 2.143 4.976 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 58 C CG . LEU 387 387 ? A -1.226 1.417 3.722 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 59 C CD1 . LEU 387 387 ? A -2.568 1.975 3.245 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 60 C CD2 . LEU 387 387 ? A -0.198 1.529 2.597 1 1 A LEU 0.730 1 ATOM 61 N N . VAL 388 388 ? A 2.170 2.253 7.061 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 62 C CA . VAL 388 388 ? A 2.780 3.026 8.123 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 63 C C . VAL 388 388 ? A 2.897 4.461 7.623 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 64 O O . VAL 388 388 ? A 3.565 4.704 6.625 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 65 C CB . VAL 388 388 ? A 4.102 2.393 8.612 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 66 C CG1 . VAL 388 388 ? A 5.277 2.375 7.614 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 67 C CG2 . VAL 388 388 ? A 4.580 3.113 9.872 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 68 N N . GLU 389 389 ? A 2.220 5.462 8.229 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 69 C CA . GLU 389 389 ? A 2.333 6.871 7.835 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 70 C C . GLU 389 389 ? A 3.762 7.368 7.923 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 71 O O . GLU 389 389 ? A 4.461 7.175 8.909 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 72 C CB . GLU 389 389 ? A 1.450 7.788 8.708 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 73 C CG . GLU 389 389 ? A 1.481 9.305 8.382 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 74 C CD . GLU 389 389 ? A 0.820 10.072 9.525 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 75 O OE1 . GLU 389 389 ? A -0.348 9.735 9.860 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 76 O OE2 . GLU 389 389 ? A 1.497 10.957 10.111 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 77 N N . LEU 390 390 ? A 4.261 8.017 6.877 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 78 C CA . LEU 390 390 ? A 5.599 8.523 6.855 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 79 C C . LEU 390 390 ? A 5.477 10.004 6.664 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 80 O O . LEU 390 390 ? A 4.451 10.548 6.269 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 81 C CB . LEU 390 390 ? A 6.472 7.930 5.728 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 82 C CG . LEU 390 390 ? A 6.806 6.429 5.853 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 83 C CD1 . LEU 390 390 ? A 7.953 6.078 4.899 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 84 C CD2 . LEU 390 390 ? A 7.210 5.978 7.264 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 85 N N . SER 391 391 ? A 6.565 10.699 6.976 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 86 C CA . SER 391 391 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #