data_SMR-4fc6577c14e8cf8a9eddf007875b6d25_3 _entry.id SMR-4fc6577c14e8cf8a9eddf007875b6d25_3 _struct.entry_id SMR-4fc6577c14e8cf8a9eddf007875b6d25_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A7E2V4/ ZSWM8_HUMAN, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8 Estimated model accuracy of this model is 0.005, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A7E2V4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 230607.224 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZSWM8_HUMAN A7E2V4 1 ;MELMFAEWEDGERFSFEDSDRFEEDSLCSFISEAESLCQNWRGWRKQSAGPNSPTGGGGGGGSGGTRMRD GLVIPLVELSAKQVAFHIPFEVVEKVYPPVPEQLQLRIAFWSFPENEEDIRLYSCLANGSADEFQRGDQL FRMRAVKDPLQIGFHLSATVVPPQMVPPKGAYNVAVMFDRCRVTSCSCTCGAGAKWCTHVVALCLFRIHN ASAVCLRAPVSESLSRLQRDQLQKFAQYLISELPQQILPTAQRLLDELLSSQSTAINTVCGAPDPTAGPS ASDQSTWYLDESTLTDNIKKTLHKFCGPSPVVFSDVNSMYLSSTEPPAAAEWACLLRPLRGREPEGVWNL LSIVREMFKRRDSNAAPLLEILTDQCLTYEQITGWWYSVRTSASHSSASGHTGRSNGQSEVAAHACASMC DEMVTLWRLAVLDPALSPQRRRELCTQLRQWQLKVIENVKRGQHKKTLERLFPGFRPAVEACYFNWEEAY PLPGVTYSGTDRKLALCWARALPSRPGASRSGGLEESRDRPRPLPTEPAVRPKEPGTKRKGLGEGVPSSQ RGPRRLSAEGGDKALHKMGPGGGKAKALGGAGSGSKGSAGGGSKRRLSSEDSSLEPDLAEMSLDDSSLAL GAEASTFGGFPESPPPCPLHGGSRGPSTFLPEPPDTYEEDGGVYFSEGPEPPTASVGPPGLLPGDVCTQD DLPSTDESGNGLPKTKEAAPAVGEEDDDYQAYYLNAQDGAGGEEEKAEGGAGEEHDLFAGLKPLEQESRM EVLFACAEALHAHGYSSEASRLTVELAQDLLANPPDLKVEPPPAKGKKNKVSTSRQTWVATNTLSKAAFL LTVLSERPEHHNLAFRVGMFALELQRPPASTKALEVKLAYQESEVAALLKKIPLGPSEMSTMRCRAEELR EGTLCDYRPVLPLMLASFIFDVLCAPGSRPPSRNWNSETPGDEELGFEAAVAALGMKTTVSEAEHPLLCE GTRREKGDLALALMITYKDDQAKLKKILDKLLDRESQTHKPQTLSSFYSSSRPTTASQRSPSKHGGPSAP GALQPLTSGSAGPAQPGSVAGAGPGPTEGFTEKNVPESSPHSPCEGLPSEAALTPRPEGKVPSRLALGSR GGYNGRGWGSPGRPKKKHTGMASIDSSAPETTSDSSPTLSRRPLRGGWAPTSWGRGQDSDSISSSSSDSL GSSSSSGSRRASASGGARAKTVEVGRYKGRRPESHAPHVPNQPSEAAAHFYFELAKTVLIKAGGNSSTSI FTHPSSSGGHQGPHRNLHLCAFEIGLYALGLHNFVSPNWLSRTYSSHVSWITGQAMEIGSAALTILVECW DGHLTPPEVASLADRASRARDSNMVRAAAELALSCLPHAHALNPNEIQRALVQCKEQDNLMLEKACMAVE EAAKGGGVYPEVLFEVAHQWFWLYEQTAGGSSTAREGATSCSASGIRAGGEAGRGMPEGRGGPGTEPVTV AAAAVTAAATVVPVISVGSSLYPGPGLGHGHSPGLHPYTALQPHLPCSPQYLTHPAHPAHPMPHMPRPAV FPVPSSAYPQGVHPAFLGAQYPYSVTPPSLAATAVSFPVPSMAPITVHPYHTEPGLPLPTSVACELWGQG TVSSVHPASTFPAIQGASLPALTTQPSPLVSGGFPPPEEETHSQPVNPHSLHHLHAAYRVGMLALEMLGR RAHNDHPNNFSRSPPYTDDVKWLLGLAAKLGVNYVHQFCVGAAKGVLSPFVLQEIVMETLQRLSPAHAHN HLRAPAFHQLVQRCQQAYMQYIHHRLIHLTPADYDDFVNAIRSARSAFCLTPMGMMQFNDILQNLKRSKQ TKELWQRVSLEMATFSP ; 'Zinc finger SWIM domain-containing protein 8' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1837 1 1837 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZSWM8_HUMAN A7E2V4 . 1 1837 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-09-11 391CF6AE25E4F8C6 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MELMFAEWEDGERFSFEDSDRFEEDSLCSFISEAESLCQNWRGWRKQSAGPNSPTGGGGGGGSGGTRMRD GLVIPLVELSAKQVAFHIPFEVVEKVYPPVPEQLQLRIAFWSFPENEEDIRLYSCLANGSADEFQRGDQL FRMRAVKDPLQIGFHLSATVVPPQMVPPKGAYNVAVMFDRCRVTSCSCTCGAGAKWCTHVVALCLFRIHN ASAVCLRAPVSESLSRLQRDQLQKFAQYLISELPQQILPTAQRLLDELLSSQSTAINTVCGAPDPTAGPS ASDQSTWYLDESTLTDNIKKTLHKFCGPSPVVFSDVNSMYLSSTEPPAAAEWACLLRPLRGREPEGVWNL LSIVREMFKRRDSNAAPLLEILTDQCLTYEQITGWWYSVRTSASHSSASGHTGRSNGQSEVAAHACASMC DEMVTLWRLAVLDPALSPQRRRELCTQLRQWQLKVIENVKRGQHKKTLERLFPGFRPAVEACYFNWEEAY PLPGVTYSGTDRKLALCWARALPSRPGASRSGGLEESRDRPRPLPTEPAVRPKEPGTKRKGLGEGVPSSQ RGPRRLSAEGGDKALHKMGPGGGKAKALGGAGSGSKGSAGGGSKRRLSSEDSSLEPDLAEMSLDDSSLAL 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A 1 1734 GLU 1734 ? ? ? A . A 1 1735 ILE 1735 ? ? ? A . A 1 1736 VAL 1736 ? ? ? A . A 1 1737 MET 1737 ? ? ? A . A 1 1738 GLU 1738 ? ? ? A . A 1 1739 THR 1739 ? ? ? A . A 1 1740 LEU 1740 ? ? ? A . A 1 1741 GLN 1741 ? ? ? A . A 1 1742 ARG 1742 ? ? ? A . A 1 1743 LEU 1743 ? ? ? A . A 1 1744 SER 1744 ? ? ? A . A 1 1745 PRO 1745 ? ? ? A . A 1 1746 ALA 1746 ? ? ? A . A 1 1747 HIS 1747 ? ? ? A . A 1 1748 ALA 1748 ? ? ? A . A 1 1749 HIS 1749 ? ? ? A . A 1 1750 ASN 1750 ? ? ? A . A 1 1751 HIS 1751 ? ? ? A . A 1 1752 LEU 1752 ? ? ? A . A 1 1753 ARG 1753 ? ? ? A . A 1 1754 ALA 1754 ? ? ? A . A 1 1755 PRO 1755 ? ? ? A . A 1 1756 ALA 1756 ? ? ? A . A 1 1757 PHE 1757 ? ? ? A . A 1 1758 HIS 1758 ? ? ? A . A 1 1759 GLN 1759 ? ? ? A . A 1 1760 LEU 1760 ? ? ? A . A 1 1761 VAL 1761 ? ? ? A . A 1 1762 GLN 1762 ? ? ? A . A 1 1763 ARG 1763 ? ? ? A . A 1 1764 CYS 1764 ? ? ? A . A 1 1765 GLN 1765 ? ? ? A . A 1 1766 GLN 1766 ? ? ? A . A 1 1767 ALA 1767 ? ? ? A . A 1 1768 TYR 1768 1768 TYR TYR A . A 1 1769 MET 1769 1769 MET MET A . A 1 1770 GLN 1770 1770 GLN GLN A . A 1 1771 TYR 1771 1771 TYR TYR A . A 1 1772 ILE 1772 1772 ILE ILE A . A 1 1773 HIS 1773 1773 HIS HIS A . A 1 1774 HIS 1774 1774 HIS HIS A . A 1 1775 ARG 1775 1775 ARG ARG A . A 1 1776 LEU 1776 1776 LEU LEU A . A 1 1777 ILE 1777 1777 ILE ILE A . A 1 1778 HIS 1778 1778 HIS HIS A . A 1 1779 LEU 1779 1779 LEU LEU A . A 1 1780 THR 1780 1780 THR THR A . A 1 1781 PRO 1781 1781 PRO PRO A . A 1 1782 ALA 1782 1782 ALA ALA A . A 1 1783 ASP 1783 1783 ASP ASP A . A 1 1784 TYR 1784 1784 TYR TYR A . A 1 1785 ASP 1785 1785 ASP ASP A . A 1 1786 ASP 1786 1786 ASP ASP A . A 1 1787 PHE 1787 1787 PHE PHE A . A 1 1788 VAL 1788 1788 VAL VAL A . A 1 1789 ASN 1789 1789 ASN ASN A . A 1 1790 ALA 1790 1790 ALA ALA A . A 1 1791 ILE 1791 1791 ILE ILE A . A 1 1792 ARG 1792 1792 ARG ARG A . A 1 1793 SER 1793 1793 SER SER A . A 1 1794 ALA 1794 ? ? ? A . A 1 1795 ARG 1795 ? ? ? A . A 1 1796 SER 1796 ? ? ? A . A 1 1797 ALA 1797 ? ? ? A . A 1 1798 PHE 1798 ? ? ? A . A 1 1799 CYS 1799 ? ? ? A . A 1 1800 LEU 1800 ? ? ? A . A 1 1801 THR 1801 ? ? ? A . A 1 1802 PRO 1802 ? ? ? A . A 1 1803 MET 1803 ? ? ? A . A 1 1804 GLY 1804 ? ? ? A . A 1 1805 MET 1805 ? ? ? A . A 1 1806 MET 1806 ? ? ? A . A 1 1807 GLN 1807 ? ? ? A . A 1 1808 PHE 1808 ? ? ? A . A 1 1809 ASN 1809 ? ? ? A . A 1 1810 ASP 1810 ? ? ? A . A 1 1811 ILE 1811 ? ? ? A . A 1 1812 LEU 1812 ? ? ? A . A 1 1813 GLN 1813 ? ? ? A . A 1 1814 ASN 1814 ? ? ? A . A 1 1815 LEU 1815 ? ? ? A . A 1 1816 LYS 1816 ? ? ? A . A 1 1817 ARG 1817 ? ? ? A . A 1 1818 SER 1818 ? ? ? A . A 1 1819 LYS 1819 ? ? ? A . A 1 1820 GLN 1820 ? ? ? A . A 1 1821 THR 1821 ? ? ? A . A 1 1822 LYS 1822 ? ? ? A . A 1 1823 GLU 1823 ? ? ? A . A 1 1824 LEU 1824 ? ? ? A . A 1 1825 TRP 1825 ? ? ? A . A 1 1826 GLN 1826 ? ? ? A . A 1 1827 ARG 1827 ? ? ? A . A 1 1828 VAL 1828 ? ? ? A . A 1 1829 SER 1829 ? ? ? A . A 1 1830 LEU 1830 ? ? ? A . A 1 1831 GLU 1831 ? ? ? A . A 1 1832 MET 1832 ? ? ? A . A 1 1833 ALA 1833 ? ? ? A . A 1 1834 THR 1834 ? ? ? A . A 1 1835 PHE 1835 ? ? ? A . A 1 1836 SER 1836 ? ? ? A . A 1 1837 PRO 1837 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Paired amphipathic helix protein Sin3b {PDB ID=5y95, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5y95.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5y95, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPATYNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFN AFLPSGPSSG ; ;GSSGSSGVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPATYNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFN AFLPSGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 16 40 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5y95 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1837 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1837 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 16.000 24.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MELMFAEWEDGERFSFEDSDRFEEDSLCSFISEAESLCQNWRGWRKQSAGPNSPTGGGGGGGSGGTRMRDGLVIPLVELSAKQVAFHIPFEVVEKVYPPVPEQLQLRIAFWSFPENEEDIRLYSCLANGSADEFQRGDQLFRMRAVKDPLQIGFHLSATVVPPQMVPPKGAYNVAVMFDRCRVTSCSCTCGAGAKWCTHVVALCLFRIHNASAVCLRAPVSESLSRLQRDQLQKFAQYLISELPQQILPTAQRLLDELLSSQSTAINTVCGAPDPTAGPSASDQSTWYLDESTLTDNIKKTLHKFCGPSPVVFSDVNSMYLSSTEPPAAAEWACLLRPLRGREPEGVWNLLSIVREMFKRRDSNAAPLLEILTDQCLTYEQITGWWYSVRTSASHSSASGHTGRSNGQSEVAAHACASMCDEMVTLWRLAVLDPALSPQRRRELCTQLRQWQLKVIENVKRGQHKKTLERLFPGFRPAVEACYFNWEEAYPLPGVTYSGTDRKLALCWARALPSRPGASRSGGLEESRDRPRPLPTEPAVRPKEPGTKRKGLGEGVPSSQRGPRRLSAEGGDKALHKMGPGGGKAKALGGAGSGSKGSAGGGSKRRLSSEDSSLEPDLAEMSLDDSSLALGAEASTFGGFPESPPPCPLHGGSRGPSTFLPEPPDTYEEDGGVYFSEGPEPPTASVGPPGLLPGDVCTQDDLPSTDESGNGLPKTKEAAPAVGEEDDDYQAYYLNAQDGAGGEEEKAEGGAGEEHDLFAGLKPLEQESRMEVLFACAEALHAHGYSSEASRLTVELAQDLLANPPDLKVEPPPAKGKKNKVSTSRQTWVATNTLSKAAFLLTVLSERPEHHNLAFRVGMFALELQRPPASTKALEVKLAYQESEVAALLKKIPLGPSEMSTMRCRAEELREGTLCDYRPVLPLMLASFIFDVLCAPGSRPPSRNWNSETPGDEELGFEAAVAALGMKTTVSEAEHPLLCEGTRREKGDLALALMITYKDDQAKLKKILDKLLDRESQTHKPQTLSSFYSSSRPTTASQRSPSKHGGPSAPGALQPLTSGSAGPAQPGSVAGAGPGPTEGFTEKNVPESSPHSPCEGLPSEAALTPRPEGKVPSRLALGSRGGYNGRGWGSPGRPKKKHTGMASIDSSAPETTSDSSPTLSRRPLRGGWAPTSWGRGQDSDSISSSSSDSLGSSSSSGSRRASASGGARAKTVEVGRYKGRRPESHAPHVPNQPSEAAAHFYFELAKTVLIKAGGNSSTSIFTHPSSSGGHQGPHRNLHLCAFEIGLYALGLHNFVSPNWLSRTYSSHVSWITGQAMEIGSAALTILVECWDGHLTPPEVASLADRASRARDSNMVRAAAELALSCLPHAHALNPNEIQRALVQCKEQDNLMLEKACMAVEEAAKGGGVYPEVLFEVAHQWFWLYEQTAGGSSTAREGATSCSASGIRAGGEAGRGMPEGRGGPGTEPVTVAAAAVTAAATVVPVISVGSSLYPGPGLGHGHSPGLHPYTALQPHLPCSPQYLTHPAHPAHPMPHMPRPAVFPVPSSAYPQGVHPAFLGAQYPYSVTPPSLAATAVSFPVPSMAPITVHPYHTEPGLPLPTSVACELWGQGTVSSVHPASTFPAIQGASLPALTTQPSPLVSGGFPPPEEETHSQPVNPHSLHHLHAAYRVGMLALEMLGRRAHNDHPNNFSRSPPYTDDVKWLLGLAAKLGVNYVHQFCVGAAKGVLSPFVLQEIVMETLQRLSPAHAHNHLRAPAFHQLVQRCQQAYMQYIHHRLIHLTPADYDDFVNAIRSARSAFCLTPMGMMQFNDILQNLKRSKQTKELWQRVSLEMATFSP 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YLDQVKIRFGS-DPATYNGFLEIMKE-------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5y95.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . TYR 1768 1768 ? A 4.810 3.905 4.320 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 2 C CA . TYR 1768 1768 ? A 3.592 3.890 3.435 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 3 C C . TYR 1768 1768 ? A 2.285 3.656 4.187 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 4 O O . TYR 1768 1768 ? A 1.307 4.329 3.909 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 5 C CB . TYR 1768 1768 ? A 3.821 2.889 2.269 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 6 C CG . TYR 1768 1768 ? A 2.628 2.750 1.353 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 7 C CD1 . TYR 1768 1768 ? A 1.662 1.767 1.612 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 8 C CD2 . TYR 1768 1768 ? A 2.456 3.578 0.233 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 9 C CE1 . TYR 1768 1768 ? A 0.562 1.603 0.765 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 10 C CE2 . TYR 1768 1768 ? A 1.359 3.401 -0.625 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 11 C CZ . TYR 1768 1768 ? A 0.421 2.398 -0.367 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 12 O OH . TYR 1768 1768 ? A -0.679 2.183 -1.218 1 1 A TYR 0.170 1 ATOM 13 N N . MET 1769 1769 ? A 2.237 2.758 5.200 1 1 A MET 0.210 1 ATOM 14 C CA . MET 1769 1769 ? A 1.014 2.446 5.927 1 1 A MET 0.210 1 ATOM 15 C C . MET 1769 1769 ? 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A -4.121 9.600 9.349 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 58 C CE1 . HIS 1773 1773 ? A -4.935 8.508 11.053 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 59 N NE2 . HIS 1773 1773 ? A -4.819 9.754 10.529 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 60 N N . HIS 1774 1774 ? A -2.390 9.821 6.094 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 61 C CA . HIS 1774 1774 ? A -2.248 11.242 5.873 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 62 C C . HIS 1774 1774 ? A -2.826 11.801 4.585 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 63 O O . HIS 1774 1774 ? A -3.307 12.924 4.552 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 64 C CB . HIS 1774 1774 ? A -0.793 11.655 6.030 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 65 C CG . HIS 1774 1774 ? A -0.368 11.382 7.424 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 66 N ND1 . HIS 1774 1774 ? A -0.832 12.170 8.461 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 67 C CD2 . HIS 1774 1774 ? A 0.498 10.456 7.882 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 68 C CE1 . HIS 1774 1774 ? A -0.216 11.711 9.527 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 69 N NE2 . HIS 1774 1774 ? A 0.604 10.673 9.236 1 1 A HIS 0.540 1 ATOM 70 N N . ARG 1775 1775 ? A -2.796 10.999 3.508 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 71 C CA . ARG 1775 1775 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.505 2 1 3 0.005 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1768 TYR 1 0.170 2 1 A 1769 MET 1 0.210 3 1 A 1770 GLN 1 0.520 4 1 A 1771 TYR 1 0.470 5 1 A 1772 ILE 1 0.590 6 1 A 1773 HIS 1 0.560 7 1 A 1774 HIS 1 0.540 8 1 A 1775 ARG 1 0.530 9 1 A 1776 LEU 1 0.660 10 1 A 1777 ILE 1 0.470 11 1 A 1778 HIS 1 0.450 12 1 A 1779 LEU 1 0.340 13 1 A 1780 THR 1 0.700 14 1 A 1781 PRO 1 0.730 15 1 A 1782 ALA 1 0.760 16 1 A 1783 ASP 1 0.730 17 1 A 1784 TYR 1 0.630 18 1 A 1785 ASP 1 0.700 19 1 A 1786 ASP 1 0.670 20 1 A 1787 PHE 1 0.560 21 1 A 1788 VAL 1 0.570 22 1 A 1789 ASN 1 0.470 23 1 A 1790 ALA 1 0.370 24 1 A 1791 ILE 1 0.320 25 1 A 1792 ARG 1 0.220 26 1 A 1793 SER 1 0.190 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #