data_SMR-a4ec0286ff5a2409647986f73375b583_5 _entry.id SMR-a4ec0286ff5a2409647986f73375b583_5 _struct.entry_id SMR-a4ec0286ff5a2409647986f73375b583_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q3V6T2 (isoform 2)/ GRDN_HUMAN, Girdin Estimated model accuracy of this model is 0.021, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q3V6T2 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' UNK 'L-peptide linking' UNKNOWN . . 'CCD local' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 246025.942 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP GRDN_HUMAN Q3V6T2 1 ;MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKLESQRVNKKVNN DASLRMHNLSILVRQIKFYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEE FIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDIEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSET IIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQE LEQMEIELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELK EDNQVLLETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK QSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLTKTVEELRTTVDSVEGNA SKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQEN EHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETSSKLSKIEFEKRQIKKELEHYKEKGERAEEL ENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEALEQENSELERENRKLKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLD EENLELRRNVESLKCASMKMAQLQLENKELESEKEQLKKGLELLKASFKKTERLEVSYQGLDIENQRLQK TLENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKR LRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLSKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLRED LVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEA RLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSPPISGEDNKWERESQETTRELLKVKDRLIEV ERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSL MNQNAQLLIQQSSLENENESVIKEREDLKSLYDSLIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNL EVEHRDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAAEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKET EVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQI QTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMR KLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSTMNDLVQSM VLAGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAGFRSKQLVNNKDTTSFEDISPQG VSDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNNQSRPQSHSSGEFSLLHDHEAWSSSG SSPIQYLKRQTRSSPVLQHKISETLESRHHKIKTGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQENLLDE VMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGKTPGDFYDRRTTKPEFLRPGPRKTEDTYFISSAGKPTPGTQG KIKLVKESSLSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDSRLPISVDSPPAAADSNTTAA SNVDKVQESRNSKSRSREQQSS ; Girdin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1842 1 1842 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . GRDN_HUMAN Q3V6T2 Q3V6T2-2 1 1842 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-05-15 48C4D509CC7EEE68 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no R ;MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKLESQRVNKKVNN DASLRMHNLSILVRQIKFYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEE FIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDIEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSET IIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQE LEQMEIELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELK EDNQVLLETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK QSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLTKTVEELRTTVDSVEGNA SKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQEN EHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETSSKLSKIEFEKRQIKKELEHYKEKGERAEEL 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VMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGKTPGDFYDRRTTKPEFLRPGPRKTEDTYFISSAGKPTPGTQG KIKLVKESSLSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDSRLPISVDSPPAAADSNTTAA SNVDKVQESRNSKSRSREQQSS ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 ASN . 1 4 GLU . 1 5 ILE . 1 6 PHE . 1 7 THR . 1 8 PRO . 1 9 LEU . 1 10 LEU . 1 11 GLU . 1 12 GLN . 1 13 PHE . 1 14 MET . 1 15 THR . 1 16 SER . 1 17 PRO . 1 18 LEU . 1 19 VAL . 1 20 THR . 1 21 TRP . 1 22 VAL . 1 23 LYS . 1 24 THR . 1 25 PHE . 1 26 GLY . 1 27 PRO . 1 28 LEU . 1 29 ALA . 1 30 ALA . 1 31 GLY . 1 32 ASN . 1 33 GLY . 1 34 THR . 1 35 ASN . 1 36 LEU . 1 37 ASP . 1 38 GLU . 1 39 TYR . 1 40 VAL . 1 41 ALA . 1 42 LEU . 1 43 VAL . 1 44 ASP . 1 45 GLY . 1 46 VAL . 1 47 PHE . 1 48 LEU . 1 49 ASN . 1 50 GLN . 1 51 VAL . 1 52 MET . 1 53 LEU . 1 54 GLN . 1 55 ILE . 1 56 ASN . 1 57 PRO . 1 58 LYS . 1 59 LEU . 1 60 GLU . 1 61 SER . 1 62 GLN . 1 63 ARG . 1 64 VAL . 1 65 ASN . 1 66 LYS . 1 67 LYS . 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A 1 1640 HIS 1640 ? ? ? R . A 1 1641 LYS 1641 ? ? ? R . A 1 1642 ILE 1642 ? ? ? R . A 1 1643 LYS 1643 ? ? ? R . A 1 1644 THR 1644 ? ? ? R . A 1 1645 GLY 1645 ? ? ? R . A 1 1646 SER 1646 ? ? ? R . A 1 1647 PRO 1647 ? ? ? R . A 1 1648 GLY 1648 ? ? ? R . A 1 1649 SER 1649 ? ? ? R . A 1 1650 GLU 1650 ? ? ? R . A 1 1651 VAL 1651 ? ? ? R . A 1 1652 VAL 1652 ? ? ? R . A 1 1653 THR 1653 ? ? ? R . A 1 1654 LEU 1654 ? ? ? R . A 1 1655 GLN 1655 ? ? ? R . A 1 1656 GLN 1656 ? ? ? R . A 1 1657 PHE 1657 ? ? ? R . A 1 1658 LEU 1658 ? ? ? R . A 1 1659 GLU 1659 ? ? ? R . A 1 1660 GLU 1660 ? ? ? R . A 1 1661 SER 1661 ? ? ? R . A 1 1662 ASN 1662 ? ? ? R . A 1 1663 LYS 1663 ? ? ? R . A 1 1664 LEU 1664 ? ? ? R . A 1 1665 THR 1665 ? ? ? R . A 1 1666 SER 1666 ? ? ? R . A 1 1667 VAL 1667 ? ? ? R . A 1 1668 GLN 1668 ? ? ? R . A 1 1669 ILE 1669 ? ? ? R . A 1 1670 LYS 1670 ? ? ? R . A 1 1671 SER 1671 ? ? ? R . A 1 1672 SER 1672 ? ? ? R . A 1 1673 SER 1673 ? ? ? R . A 1 1674 GLN 1674 ? ? ? R . A 1 1675 GLU 1675 ? ? ? R . A 1 1676 ASN 1676 ? ? ? R . A 1 1677 LEU 1677 ? ? ? R . A 1 1678 LEU 1678 ? ? ? R . A 1 1679 ASP 1679 ? ? ? R . A 1 1680 GLU 1680 ? ? ? R . A 1 1681 VAL 1681 ? ? ? R . A 1 1682 MET 1682 ? ? ? R . A 1 1683 LYS 1683 ? ? ? R . A 1 1684 SER 1684 ? ? ? R . A 1 1685 LEU 1685 ? ? ? R . A 1 1686 SER 1686 ? ? ? R . A 1 1687 VAL 1687 ? ? ? R . A 1 1688 SER 1688 ? ? ? R . A 1 1689 SER 1689 ? ? ? R . A 1 1690 ASP 1690 ? ? ? R . A 1 1691 PHE 1691 ? ? ? R . A 1 1692 LEU 1692 ? ? ? R . A 1 1693 GLY 1693 ? ? ? R . A 1 1694 LYS 1694 ? ? ? R . A 1 1695 ASP 1695 ? ? ? R . A 1 1696 LYS 1696 ? ? ? R . A 1 1697 PRO 1697 ? ? ? R . A 1 1698 VAL 1698 ? ? ? R . A 1 1699 SER 1699 ? ? ? R . A 1 1700 CYS 1700 ? ? ? R . A 1 1701 GLY 1701 ? ? ? R . A 1 1702 LEU 1702 ? ? ? R . A 1 1703 ALA 1703 ? ? ? R . A 1 1704 ARG 1704 ? ? ? R . A 1 1705 SER 1705 ? ? ? R . A 1 1706 VAL 1706 ? ? ? R . A 1 1707 SER 1707 ? ? ? R . A 1 1708 GLY 1708 ? ? ? R . A 1 1709 LYS 1709 ? ? ? R . A 1 1710 THR 1710 ? ? ? R . A 1 1711 PRO 1711 ? ? ? R . A 1 1712 GLY 1712 ? ? ? R . A 1 1713 ASP 1713 ? ? ? R . A 1 1714 PHE 1714 ? ? ? R . A 1 1715 TYR 1715 ? ? ? R . A 1 1716 ASP 1716 ? ? ? R . A 1 1717 ARG 1717 ? ? ? R . A 1 1718 ARG 1718 ? ? ? R . A 1 1719 THR 1719 ? ? ? R . A 1 1720 THR 1720 ? ? ? R . A 1 1721 LYS 1721 ? ? ? R . A 1 1722 PRO 1722 ? ? ? R . A 1 1723 GLU 1723 ? ? ? R . A 1 1724 PHE 1724 ? ? ? R . A 1 1725 LEU 1725 ? ? ? R . A 1 1726 ARG 1726 ? ? ? R . A 1 1727 PRO 1727 ? ? ? R . A 1 1728 GLY 1728 ? ? ? R . A 1 1729 PRO 1729 ? ? ? R . A 1 1730 ARG 1730 ? ? ? R . A 1 1731 LYS 1731 ? ? ? R . A 1 1732 THR 1732 ? ? ? R . A 1 1733 GLU 1733 ? ? ? R . A 1 1734 ASP 1734 ? ? ? R . A 1 1735 THR 1735 ? ? ? R . A 1 1736 TYR 1736 ? ? ? R . A 1 1737 PHE 1737 ? ? ? R . A 1 1738 ILE 1738 ? ? ? R . A 1 1739 SER 1739 ? ? ? R . A 1 1740 SER 1740 ? ? ? R . A 1 1741 ALA 1741 ? ? ? R . A 1 1742 GLY 1742 ? ? ? R . A 1 1743 LYS 1743 ? ? ? R . A 1 1744 PRO 1744 ? ? ? R . A 1 1745 THR 1745 ? ? ? R . A 1 1746 PRO 1746 ? ? ? R . A 1 1747 GLY 1747 ? ? ? R . A 1 1748 THR 1748 ? ? ? R . A 1 1749 GLN 1749 ? ? ? R . A 1 1750 GLY 1750 ? ? ? R . A 1 1751 LYS 1751 ? ? ? R . A 1 1752 ILE 1752 ? ? ? R . A 1 1753 LYS 1753 ? ? ? R . A 1 1754 LEU 1754 ? ? ? R . A 1 1755 VAL 1755 ? ? ? R . A 1 1756 LYS 1756 ? ? ? R . A 1 1757 GLU 1757 ? ? ? R . A 1 1758 SER 1758 ? ? ? R . A 1 1759 SER 1759 ? ? ? R . A 1 1760 LEU 1760 ? ? ? R . A 1 1761 SER 1761 ? ? ? R . A 1 1762 ARG 1762 ? ? ? R . A 1 1763 GLN 1763 ? ? ? R . A 1 1764 SER 1764 ? ? ? R . A 1 1765 LYS 1765 ? ? ? R . A 1 1766 ASP 1766 ? ? ? R . A 1 1767 SER 1767 ? ? ? R . A 1 1768 ASN 1768 ? ? ? R . A 1 1769 PRO 1769 ? ? ? R . A 1 1770 TYR 1770 ? ? ? R . A 1 1771 ALA 1771 ? ? ? R . A 1 1772 THR 1772 ? ? ? R . A 1 1773 LEU 1773 ? ? ? R . A 1 1774 PRO 1774 ? ? ? R . A 1 1775 ARG 1775 ? ? ? R . A 1 1776 ALA 1776 ? ? ? R . A 1 1777 SER 1777 ? ? ? R . A 1 1778 SER 1778 ? ? ? R . A 1 1779 VAL 1779 ? ? ? R . A 1 1780 ILE 1780 ? ? ? R . A 1 1781 SER 1781 ? ? ? R . A 1 1782 THR 1782 ? ? ? R . A 1 1783 ALA 1783 ? ? ? R . A 1 1784 GLU 1784 ? ? ? R . A 1 1785 GLY 1785 ? ? ? R . A 1 1786 THR 1786 ? ? ? R . A 1 1787 THR 1787 ? ? ? R . A 1 1788 ARG 1788 ? ? ? R . A 1 1789 ARG 1789 ? ? ? R . A 1 1790 THR 1790 ? ? ? R . A 1 1791 SER 1791 ? ? ? R . A 1 1792 ILE 1792 ? ? ? R . A 1 1793 HIS 1793 ? ? ? R . A 1 1794 ASP 1794 ? ? ? R . A 1 1795 PHE 1795 ? ? ? R . A 1 1796 LEU 1796 ? ? ? R . A 1 1797 THR 1797 ? ? ? R . A 1 1798 LYS 1798 ? ? ? R . A 1 1799 ASP 1799 ? ? ? R . A 1 1800 SER 1800 ? ? ? R . A 1 1801 ARG 1801 ? ? ? R . A 1 1802 LEU 1802 ? ? ? R . A 1 1803 PRO 1803 ? ? ? R . A 1 1804 ILE 1804 ? ? ? R . A 1 1805 SER 1805 ? ? ? R . A 1 1806 VAL 1806 ? ? ? R . A 1 1807 ASP 1807 ? ? ? R . A 1 1808 SER 1808 ? ? ? R . A 1 1809 PRO 1809 ? ? ? R . A 1 1810 PRO 1810 ? ? ? R . A 1 1811 ALA 1811 ? ? ? R . A 1 1812 ALA 1812 ? ? ? R . A 1 1813 ALA 1813 ? ? ? R . A 1 1814 ASP 1814 ? ? ? R . A 1 1815 SER 1815 ? ? ? R . A 1 1816 ASN 1816 ? ? ? R . A 1 1817 THR 1817 ? ? ? R . A 1 1818 THR 1818 ? ? ? R . A 1 1819 ALA 1819 ? ? ? R . A 1 1820 ALA 1820 ? ? ? R . A 1 1821 SER 1821 ? ? ? R . A 1 1822 ASN 1822 ? ? ? R . A 1 1823 VAL 1823 ? ? ? R . A 1 1824 ASP 1824 ? ? ? R . A 1 1825 LYS 1825 ? ? ? R . A 1 1826 VAL 1826 ? ? ? R . A 1 1827 GLN 1827 ? ? ? R . A 1 1828 GLU 1828 ? ? ? R . A 1 1829 SER 1829 ? ? ? R . A 1 1830 ARG 1830 ? ? ? R . A 1 1831 ASN 1831 ? ? ? R . A 1 1832 SER 1832 ? ? ? R . A 1 1833 LYS 1833 ? ? ? R . A 1 1834 SER 1834 ? ? ? R . A 1 1835 ARG 1835 ? ? ? R . A 1 1836 SER 1836 ? ? ? R . A 1 1837 ARG 1837 ? ? ? R . A 1 1838 GLU 1838 ? ? ? R . A 1 1839 GLN 1839 ? ? ? R . A 1 1840 GLN 1840 ? ? ? R . A 1 1841 SER 1841 ? ? ? R . A 1 1842 SER 1842 ? ? ? R . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=7uti, label_asym_id=R, auth_asym_id=f, SMTL ID=7uti.1.R}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7uti, label_asym_id=R' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A R 2 1 f # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;(UNK)MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALK DAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQ KDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLK SLEAQAEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELD HALNDMTSI ; ;XMDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQE KLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEE KMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEA QAEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALN DMTSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 119 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7uti 2022-09-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1842 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1842 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.6e-07 10.714 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKLESQRVNKKVNNDASLRMHNLSILVRQIKFYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDIEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQKQSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLTKTVEELRTTVDSVEGNASKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETSSKLSKIEFEKRQIKKELEHYKEKGERAEELENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEALEQENSELERENRKLKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRNVESLKCASMKMAQLQLENKELESEKEQLKKGLELLKASFKKTERLEVSYQGLDIENQRLQKTLENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLSKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSPPISGEDNKWERESQETTRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENESVIKEREDLKSLYDSLIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHRDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAAEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKETEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSTMNDLVQSMVLAGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAGFRSKQLVNNKDTTSFEDISPQGVSDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNNQSRPQSHSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPVLQHKISETLESRHHKIKTGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQENLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGKTPGDFYDRRTTKPEFLRPGPRKTEDTYFISSAGKPTPGTQGKIKLVKESSLSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDSRLPISVDSPPAAADSNTTAASNVDKVQESRNSKSRSREQQSS 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.117}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7uti.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 1057 1057 ? A 234.178 264.922 -13.410 1 1 R LEU 0.570 1 ATOM 2 C CA . LEU 1057 1057 ? A 235.364 264.746 -12.491 1 1 R LEU 0.570 1 ATOM 3 C C . LEU 1057 1057 ? A 235.720 265.960 -11.627 1 1 R LEU 0.570 1 ATOM 4 O O . LEU 1057 1057 ? A 235.641 265.887 -10.407 1 1 R LEU 0.570 1 ATOM 5 C CB . LEU 1057 1057 ? A 236.613 264.266 -13.291 1 1 R LEU 0.570 1 ATOM 6 C CG . LEU 1057 1057 ? A 237.828 263.850 -12.417 1 1 R LEU 0.570 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 1057 1057 ? A 237.491 262.664 -11.499 1 1 R LEU 0.570 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 1057 1057 ? A 239.045 263.507 -13.293 1 1 R LEU 0.570 1 ATOM 9 N N . GLN 1058 1058 ? A 236.116 267.127 -12.203 1 1 R GLN 0.610 1 ATOM 10 C CA . GLN 1058 1058 ? A 236.438 268.327 -11.424 1 1 R GLN 0.610 1 ATOM 11 C C . GLN 1058 1058 ? A 235.298 268.836 -10.532 1 1 R GLN 0.610 1 ATOM 12 O O . GLN 1058 1058 ? A 235.512 269.111 -9.356 1 1 R GLN 0.610 1 ATOM 13 C CB . GLN 1058 1058 ? A 236.914 269.443 -12.381 1 1 R GLN 0.610 1 ATOM 14 C CG . GLN 1058 1058 ? A 238.277 269.117 -13.043 1 1 R GLN 0.610 1 ATOM 15 C CD . GLN 1058 1058 ? A 238.644 270.203 -14.059 1 1 R GLN 0.610 1 ATOM 16 O OE1 . GLN 1058 1058 ? A 237.765 270.830 -14.648 1 1 R GLN 0.610 1 ATOM 17 N NE2 . GLN 1058 1058 ? A 239.957 270.421 -14.298 1 1 R GLN 0.610 1 ATOM 18 N N . ALA 1059 1059 ? A 234.053 268.877 -11.057 1 1 R ALA 0.840 1 ATOM 19 C CA . ALA 1059 1059 ? A 232.854 269.208 -10.300 1 1 R ALA 0.840 1 ATOM 20 C C . ALA 1059 1059 ? A 232.591 268.281 -9.104 1 1 R ALA 0.840 1 ATOM 21 O O . ALA 1059 1059 ? A 232.306 268.738 -8.001 1 1 R ALA 0.840 1 ATOM 22 C CB . ALA 1059 1059 ? A 231.640 269.182 -11.257 1 1 R ALA 0.840 1 ATOM 23 N N . GLU 1060 1060 ? A 232.743 266.950 -9.283 1 1 R GLU 0.770 1 ATOM 24 C CA . GLU 1060 1060 ? A 232.673 265.958 -8.218 1 1 R GLU 0.770 1 ATOM 25 C C . GLU 1060 1060 ? A 233.749 266.159 -7.158 1 1 R GLU 0.770 1 ATOM 26 O O . GLU 1060 1060 ? A 233.466 266.177 -5.964 1 1 R GLU 0.770 1 ATOM 27 C CB . GLU 1060 1060 ? A 232.799 264.539 -8.816 1 1 R GLU 0.770 1 ATOM 28 C CG . GLU 1060 1060 ? A 231.600 264.139 -9.712 1 1 R GLU 0.770 1 ATOM 29 C CD . GLU 1060 1060 ? A 231.874 262.864 -10.516 1 1 R GLU 0.770 1 ATOM 30 O OE1 . GLU 1060 1060 ? A 233.078 262.516 -10.693 1 1 R GLU 0.770 1 ATOM 31 O OE2 . GLU 1060 1060 ? A 230.893 262.330 -11.079 1 1 R GLU 0.770 1 ATOM 32 N N . LYS 1061 1061 ? A 235.014 266.399 -7.567 1 1 R LYS 0.810 1 ATOM 33 C CA . LYS 1061 1061 ? A 236.091 266.730 -6.646 1 1 R LYS 0.810 1 ATOM 34 C C . LYS 1061 1061 ? A 235.847 267.999 -5.837 1 1 R LYS 0.810 1 ATOM 35 O O . LYS 1061 1061 ? A 236.098 268.033 -4.636 1 1 R LYS 0.810 1 ATOM 36 C CB . LYS 1061 1061 ? A 237.446 266.900 -7.379 1 1 R LYS 0.810 1 ATOM 37 C CG . LYS 1061 1061 ? A 238.025 265.588 -7.924 1 1 R LYS 0.810 1 ATOM 38 C CD . LYS 1061 1061 ? A 239.350 265.809 -8.677 1 1 R LYS 0.810 1 ATOM 39 C CE . LYS 1061 1061 ? A 239.921 264.497 -9.227 1 1 R LYS 0.810 1 ATOM 40 N NZ . LYS 1061 1061 ? A 241.147 264.724 -10.030 1 1 R LYS 0.810 1 ATOM 41 N N . GLN 1062 1062 ? A 235.352 269.080 -6.468 1 1 R GLN 0.850 1 ATOM 42 C CA . GLN 1062 1062 ? A 234.960 270.300 -5.780 1 1 R GLN 0.850 1 ATOM 43 C C . GLN 1062 1062 ? A 233.797 270.100 -4.818 1 1 R GLN 0.850 1 ATOM 44 O O . GLN 1062 1062 ? A 233.834 270.575 -3.683 1 1 R GLN 0.850 1 ATOM 45 C CB . GLN 1062 1062 ? A 234.625 271.418 -6.790 1 1 R GLN 0.850 1 ATOM 46 C CG . GLN 1062 1062 ? A 235.872 271.916 -7.559 1 1 R GLN 0.850 1 ATOM 47 C CD . GLN 1062 1062 ? A 235.479 272.953 -8.613 1 1 R GLN 0.850 1 ATOM 48 O OE1 . GLN 1062 1062 ? A 234.370 272.957 -9.143 1 1 R GLN 0.850 1 ATOM 49 N NE2 . GLN 1062 1062 ? A 236.423 273.864 -8.952 1 1 R GLN 0.850 1 ATOM 50 N N . ALA 1063 1063 ? A 232.759 269.342 -5.229 1 1 R ALA 0.910 1 ATOM 51 C CA . ALA 1063 1063 ? A 231.650 268.975 -4.372 1 1 R ALA 0.910 1 ATOM 52 C C . ALA 1063 1063 ? A 232.096 268.185 -3.140 1 1 R ALA 0.910 1 ATOM 53 O O . ALA 1063 1063 ? A 231.746 268.541 -2.017 1 1 R ALA 0.910 1 ATOM 54 C CB . ALA 1063 1063 ? A 230.609 268.171 -5.183 1 1 R ALA 0.910 1 ATOM 55 N N . LEU 1064 1064 ? A 232.958 267.157 -3.314 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 56 C CA . LEU 1064 1064 ? A 233.552 266.399 -2.218 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 57 C C . LEU 1064 1064 ? A 234.377 267.258 -1.264 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 58 O O . LEU 1064 1064 ? A 234.245 267.142 -0.048 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 59 C CB . LEU 1064 1064 ? A 234.433 265.231 -2.740 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 60 C CG . LEU 1064 1064 ? A 233.654 264.098 -3.447 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 61 C CD1 . LEU 1064 1064 ? A 234.629 263.106 -4.102 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 62 C CD2 . LEU 1064 1064 ? A 232.685 263.366 -2.504 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 63 N N . LYS 1065 1065 ? A 235.217 268.183 -1.775 1 1 R LYS 0.860 1 ATOM 64 C CA . LYS 1065 1065 ? A 235.964 269.124 -0.947 1 1 R LYS 0.860 1 ATOM 65 C C . LYS 1065 1065 ? A 235.085 270.051 -0.113 1 1 R LYS 0.860 1 ATOM 66 O O . LYS 1065 1065 ? A 235.329 270.264 1.076 1 1 R LYS 0.860 1 ATOM 67 C CB . LYS 1065 1065 ? A 236.884 270.009 -1.817 1 1 R LYS 0.860 1 ATOM 68 C CG . LYS 1065 1065 ? A 238.069 269.238 -2.410 1 1 R LYS 0.860 1 ATOM 69 C CD . LYS 1065 1065 ? A 238.919 270.122 -3.332 1 1 R LYS 0.860 1 ATOM 70 C CE . LYS 1065 1065 ? A 240.071 269.350 -3.971 1 1 R LYS 0.860 1 ATOM 71 N NZ . LYS 1065 1065 ? A 240.861 270.262 -4.825 1 1 R LYS 0.860 1 ATOM 72 N N . THR 1066 1066 ? A 234.020 270.614 -0.717 1 1 R THR 0.880 1 ATOM 73 C CA . THR 1066 1066 ? A 233.024 271.426 -0.009 1 1 R THR 0.880 1 ATOM 74 C C . THR 1066 1066 ? A 232.275 270.633 1.038 1 1 R THR 0.880 1 ATOM 75 O O . THR 1066 1066 ? A 232.105 271.089 2.169 1 1 R THR 0.880 1 ATOM 76 C CB . THR 1066 1066 ? A 231.998 272.077 -0.935 1 1 R THR 0.880 1 ATOM 77 O OG1 . THR 1066 1066 ? A 232.646 273.007 -1.792 1 1 R THR 0.880 1 ATOM 78 C CG2 . THR 1066 1066 ? A 230.941 272.899 -0.171 1 1 R THR 0.880 1 ATOM 79 N N . GLN 1067 1067 ? 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A 235.664 266.851 3.095 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 93 C CG . LEU 1068 1068 ? A 235.506 265.445 2.468 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 94 C CD1 . LEU 1068 1068 ? A 236.808 265.008 1.784 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 95 C CD2 . LEU 1068 1068 ? A 235.076 264.372 3.483 1 1 R LEU 0.850 1 ATOM 96 N N . LYS 1069 1069 ? A 234.751 269.860 3.994 1 1 R LYS 0.850 1 ATOM 97 C CA . LYS 1069 1069 ? A 234.868 271.084 4.775 1 1 R LYS 0.850 1 ATOM 98 C C . LYS 1069 1069 ? A 233.667 271.357 5.688 1 1 R LYS 0.850 1 ATOM 99 O O . LYS 1069 1069 ? A 233.802 271.751 6.847 1 1 R LYS 0.850 1 ATOM 100 C CB . LYS 1069 1069 ? A 235.017 272.291 3.817 1 1 R LYS 0.850 1 ATOM 101 C CG . LYS 1069 1069 ? A 235.219 273.627 4.549 1 1 R LYS 0.850 1 ATOM 102 C CD . LYS 1069 1069 ? A 235.276 274.826 3.595 1 1 R LYS 0.850 1 ATOM 103 C CE . LYS 1069 1069 ? A 235.492 276.145 4.339 1 1 R LYS 0.850 1 ATOM 104 N NZ . LYS 1069 1069 ? A 235.512 277.263 3.371 1 1 R LYS 0.850 1 ATOM 105 N N . GLN 1070 1070 ? 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A 188.100 247.863 126.558 1 1 R LYS 0.620 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.804 2 1 3 0.021 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1057 LEU 1 0.570 2 1 A 1058 GLN 1 0.610 3 1 A 1059 ALA 1 0.840 4 1 A 1060 GLU 1 0.770 5 1 A 1061 LYS 1 0.810 6 1 A 1062 GLN 1 0.850 7 1 A 1063 ALA 1 0.910 8 1 A 1064 LEU 1 0.850 9 1 A 1065 LYS 1 0.860 10 1 A 1066 THR 1 0.880 11 1 A 1067 GLN 1 0.860 12 1 A 1068 LEU 1 0.850 13 1 A 1069 LYS 1 0.850 14 1 A 1070 GLN 1 0.860 15 1 A 1071 LEU 1 0.840 16 1 A 1072 GLU 1 0.840 17 1 A 1073 THR 1 0.860 18 1 A 1074 GLN 1 0.840 19 1 A 1075 ASN 1 0.840 20 1 A 1076 ASN 1 0.840 21 1 A 1077 ASN 1 0.830 22 1 A 1078 LEU 1 0.820 23 1 A 1079 GLN 1 0.820 24 1 A 1080 ALA 1 0.870 25 1 A 1081 GLN 1 0.800 26 1 A 1082 ILE 1 0.790 27 1 A 1083 LEU 1 0.790 28 1 A 1084 ALA 1 0.860 29 1 A 1085 LEU 1 0.780 30 1 A 1086 GLN 1 0.790 31 1 A 1087 ARG 1 0.740 32 1 A 1088 GLN 1 0.800 33 1 A 1089 THR 1 0.800 34 1 A 1090 VAL 1 0.820 35 1 A 1091 SER 1 0.820 36 1 A 1092 LEU 1 0.800 37 1 A 1093 GLN 1 0.800 38 1 A 1094 GLU 1 0.800 39 1 A 1095 GLN 1 0.810 40 1 A 1096 ASN 1 0.810 41 1 A 1097 THR 1 0.820 42 1 A 1098 THR 1 0.830 43 1 A 1099 LEU 1 0.810 44 1 A 1100 GLN 1 0.820 45 1 A 1101 THR 1 0.830 46 1 A 1102 GLN 1 0.830 47 1 A 1103 ASN 1 0.830 48 1 A 1104 ALA 1 0.890 49 1 A 1105 LYS 1 0.820 50 1 A 1106 LEU 1 0.810 51 1 A 1107 GLN 1 0.810 52 1 A 1108 VAL 1 0.830 53 1 A 1109 GLU 1 0.790 54 1 A 1110 ASN 1 0.790 55 1 A 1111 SER 1 0.800 56 1 A 1112 THR 1 0.790 57 1 A 1113 LEU 1 0.770 58 1 A 1114 ASN 1 0.770 59 1 A 1115 SER 1 0.800 60 1 A 1116 GLN 1 0.780 61 1 A 1117 SER 1 0.790 62 1 A 1118 THR 1 0.790 63 1 A 1119 SER 1 0.810 64 1 A 1120 LEU 1 0.770 65 1 A 1121 MET 1 0.750 66 1 A 1122 ASN 1 0.800 67 1 A 1123 GLN 1 0.790 68 1 A 1124 ASN 1 0.780 69 1 A 1125 ALA 1 0.840 70 1 A 1126 GLN 1 0.790 71 1 A 1127 LEU 1 0.770 72 1 A 1128 LEU 1 0.760 73 1 A 1129 ILE 1 0.760 74 1 A 1130 GLN 1 0.780 75 1 A 1131 GLN 1 0.780 76 1 A 1132 SER 1 0.800 77 1 A 1133 SER 1 0.810 78 1 A 1134 LEU 1 0.800 79 1 A 1135 GLU 1 0.810 80 1 A 1136 ASN 1 0.820 81 1 A 1137 GLU 1 0.810 82 1 A 1138 ASN 1 0.830 83 1 A 1139 GLU 1 0.840 84 1 A 1140 SER 1 0.860 85 1 A 1141 VAL 1 0.860 86 1 A 1142 ILE 1 0.830 87 1 A 1143 LYS 1 0.840 88 1 A 1144 GLU 1 0.840 89 1 A 1145 ARG 1 0.780 90 1 A 1146 GLU 1 0.840 91 1 A 1147 ASP 1 0.830 92 1 A 1148 LEU 1 0.810 93 1 A 1149 LYS 1 0.810 94 1 A 1150 SER 1 0.830 95 1 A 1151 LEU 1 0.780 96 1 A 1152 TYR 1 0.720 97 1 A 1153 ASP 1 0.750 98 1 A 1154 SER 1 0.740 99 1 A 1155 LEU 1 0.720 100 1 A 1156 ILE 1 0.710 101 1 A 1157 LYS 1 0.620 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #