data_SMR-37722b8cdfdd23fbb5fbb29318b21531_4 _entry.id SMR-37722b8cdfdd23fbb5fbb29318b21531_4 _struct.entry_id SMR-37722b8cdfdd23fbb5fbb29318b21531_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P21675 (isoform 1)/ TAF1_HUMAN, Transcription initiation factor TFIID subunit 1 Estimated model accuracy of this model is 0.062, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P21675 (isoform 1)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 244363.335 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP TAF1_HUMAN P21675 1 ;MSDTDSDEDSAGGGPFSLAGFLFGNINGAGQLEGESVLDDECKKHLAGLGALGLGSLITELTANEELTGT DGALVNDEGWVRSTEDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHSDYDEDDYDADCEDIDCKLMPPPP PPPGPMKKDKDQDSITGEKVDFSSSSDSESEMGPQEATQAESEDGKLTLPLAGIMQHDATKLLPSVTELF PEFRPGKVLRFLRLFGPGKNVPSVWRSARRKRKKKHRELIQEEQIQEVECSVESEVSQKSLWNYDYAPPP PPEQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDIDKVTDTKPRVAEWRYGPARLWYDMLGVPEDGSGFDYGFKLRK TEHEPVIKSRMIEEFRKLEENNGTDLLADENFLMVTQLHWEDDIIWDGEDVKHKGTKPQRASLAGWLPSS MTRNAMAYNVQQGFAATLDDDKPWYSIFPIDNEDLVYGRWEDNIIWDAQAMPRLLEPPVLTLDPNDENLI LEIPDEKEEATSNSPSKESKKESSLKKSRILLGKTGVIKEEPQQNMSQPEVKDPWNLSNDEYYYPKQQGL RGTFGGNIIQHSIPAVELRQPFFPTHMGPIKLRQFHRPPLKKYSFGALSQPGPHSVQPLLKHIKKKAKMR EQERQASGGGEMFFMRTPQDLTGKDGDLILAEYSEENGPLMMQVGMATKIKNYYKRKPGKDPGAPDCKYG ETVYCHTSPFLGSLHPGQLLQAFENNLFRAPIYLHKMPETDFLIIRTRQGYYIRELVDIFVVGQQCPLFE VPGPNSKRANTHIRDFLQVFIYRLFWKSKDRPRRIRMEDIKKAFPSHSESSIRKRLKLCADFKRTGMDSN WWVLKSDFRLPTEEEIRAMVSPEQCCAYYSMIAAEQRLKDAGYGEKSFFAPEEENEEDFQMKIDDEVRTA PWNTTRAFIAAMKGKCLLEVTGVADPTGCGEGFSYVKIPNKPTQQKDDKEPQPVKKTVTGTDADLRRLSL KNAKQLLRKFGVPEEEIKKLSRWEVIDVVRTMSTEQARSGEGPMSKFARGSRFSVAEHQERYKEECQRIF DLQNKVLSSTEVLSTDTDSSSAEDSDFEEMGKNIENMLQNKKTSSQLSREREEQERKELQRMLLAAGSAA SGNNHRDDDTASVTSLNSSATGRCLKIYRTFRDEEGKEYVRCETVRKPAVIDAYVRIRTTKDEEFIRKFA LFDEQHREEMRKERRRIQEQLRRLKRNQEKEKLKGPPEKKPKKMKERPDLKLKCGACGAIGHMRTNKFCP LYYQTNAPPSNPVAMTEEQEEELEKTVIHNDNEELIKVEGTKIVLGKQLIESADEVRRKSLVLKFPKQQL PPKKKRRVGTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLPNTYPFHTPVNAKVVKDYYKI ITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLAR LEKAINPLLDDDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDLETIRKNISKH KYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAE LESLDPMTPGPYTPQPPDLYDTNTSLSMSRDASVFQDESNMSVLDIPSATPEKQVTQEGEDGDGDLADEE EGTVQQPQASVLYEDLLMSEGEDDEEDAGSDEEGDNPFSAIQLSESGSDSDVGSGGIRPKQPRMLQENTR MDMENEESMMSYEGDGGEASHGLEDSNISYGSYEEPDPKSNTQDTSFSSIGGYEVSEEEEDEEEEEQRSG PSVLSQVHLSEDEEDSEDFHSIAGDSDLDSDE ; 'Transcription initiation factor TFIID subunit 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1852 1 1852 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . TAF1_HUMAN P21675 P21675-1 1 1852 9606 'Homo sapiens (Human)' 2023-11-08 342BD9520864C6AD # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSDTDSDEDSAGGGPFSLAGFLFGNINGAGQLEGESVLDDECKKHLAGLGALGLGSLITELTANEELTGT DGALVNDEGWVRSTEDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHSDYDEDDYDADCEDIDCKLMPPPP PPPGPMKKDKDQDSITGEKVDFSSSSDSESEMGPQEATQAESEDGKLTLPLAGIMQHDATKLLPSVTELF PEFRPGKVLRFLRLFGPGKNVPSVWRSARRKRKKKHRELIQEEQIQEVECSVESEVSQKSLWNYDYAPPP PPEQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDIDKVTDTKPRVAEWRYGPARLWYDMLGVPEDGSGFDYGFKLRK TEHEPVIKSRMIEEFRKLEENNGTDLLADENFLMVTQLHWEDDIIWDGEDVKHKGTKPQRASLAGWLPSS MTRNAMAYNVQQGFAATLDDDKPWYSIFPIDNEDLVYGRWEDNIIWDAQAMPRLLEPPVLTLDPNDENLI LEIPDEKEEATSNSPSKESKKESSLKKSRILLGKTGVIKEEPQQNMSQPEVKDPWNLSNDEYYYPKQQGL RGTFGGNIIQHSIPAVELRQPFFPTHMGPIKLRQFHRPPLKKYSFGALSQPGPHSVQPLLKHIKKKAKMR EQERQASGGGEMFFMRTPQDLTGKDGDLILAEYSEENGPLMMQVGMATKIKNYYKRKPGKDPGAPDCKYG ETVYCHTSPFLGSLHPGQLLQAFENNLFRAPIYLHKMPETDFLIIRTRQGYYIRELVDIFVVGQQCPLFE VPGPNSKRANTHIRDFLQVFIYRLFWKSKDRPRRIRMEDIKKAFPSHSESSIRKRLKLCADFKRTGMDSN WWVLKSDFRLPTEEEIRAMVSPEQCCAYYSMIAAEQRLKDAGYGEKSFFAPEEENEEDFQMKIDDEVRTA PWNTTRAFIAAMKGKCLLEVTGVADPTGCGEGFSYVKIPNKPTQQKDDKEPQPVKKTVTGTDADLRRLSL KNAKQLLRKFGVPEEEIKKLSRWEVIDVVRTMSTEQARSGEGPMSKFARGSRFSVAEHQERYKEECQRIF DLQNKVLSSTEVLSTDTDSSSAEDSDFEEMGKNIENMLQNKKTSSQLSREREEQERKELQRMLLAAGSAA SGNNHRDDDTASVTSLNSSATGRCLKIYRTFRDEEGKEYVRCETVRKPAVIDAYVRIRTTKDEEFIRKFA LFDEQHREEMRKERRRIQEQLRRLKRNQEKEKLKGPPEKKPKKMKERPDLKLKCGACGAIGHMRTNKFCP LYYQTNAPPSNPVAMTEEQEEELEKTVIHNDNEELIKVEGTKIVLGKQLIESADEVRRKSLVLKFPKQQL PPKKKRRVGTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLPNTYPFHTPVNAKVVKDYYKI ITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLAR LEKAINPLLDDDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDLETIRKNISKH KYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAE 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ETVYCHTSPFLGSLHPGQLLQAFENNLFRAPIYLHKMPETDFLIIRTRQGYYIRELVDIFVVGQQCPLFE VPGPNSKRANTHIRDFLQVFIYRLFWKSKDRPRRIRMEDIKKAFPSHSESSIRKRLKLCADFKRTGMDSN WWVLKSDFRLPTEEEIRAMVSPEQCCAYYSMIAAEQRLKDAGYGEKSFFAPEEENEEDFQMKIDDEVRTA PWNTTRAFIAAMKGKCLLEVTGVADPTGCGEGFSYVKIPNKPTQQKDDKEPQPVKKTVTGTDADLRRLSL KNAKQLLRKFGVPEEEIKKLSRWEVIDVVRTMSTEQARSGEGPMSKFARGSRFSVAEHQERYKEECQRIF DLQNKVLSSTEVLSTDTDSSSAEDSDFEEMGKNIENMLQNKKTSSQLSREREEQERKELQRMLLAAGSAA SGNNHRDDDTASVTSLNSSATGRCLKIYRTFRDEEGKEYVRCETVRKPAVIDAYVRIRTTKDEEFIRKFA LFDEQHREEMRKERRRIQEQLRRLKRNQEKEKLKGPPEKKPKKMKERPDLKLKCGACGAIGHMRTNKFCP LYYQTNAPPSNPVAMTEEQEEELEKTVIHNDNEELIKVEGTKIVLGKQLIESADEVRRKSLVLKFPKQQL PPKKKRRVGTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLPNTYPFHTPVNAKVVKDYYKI ITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLAR LEKAINPLLDDDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDLETIRKNISKH KYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAE LESLDPMTPGPYTPQPPDLYDTNTSLSMSRDASVFQDESNMSVLDIPSATPEKQVTQEGEDGDGDLADEE 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A 1 1707 ASP 1707 ? ? ? A . A 1 1708 ALA 1708 ? ? ? A . A 1 1709 GLY 1709 ? ? ? A . A 1 1710 SER 1710 ? ? ? A . A 1 1711 ASP 1711 ? ? ? A . A 1 1712 GLU 1712 ? ? ? A . A 1 1713 GLU 1713 ? ? ? A . A 1 1714 GLY 1714 ? ? ? A . A 1 1715 ASP 1715 ? ? ? A . A 1 1716 ASN 1716 ? ? ? A . A 1 1717 PRO 1717 ? ? ? A . A 1 1718 PHE 1718 ? ? ? A . A 1 1719 SER 1719 ? ? ? A . A 1 1720 ALA 1720 ? ? ? A . A 1 1721 ILE 1721 ? ? ? A . A 1 1722 GLN 1722 ? ? ? A . A 1 1723 LEU 1723 ? ? ? A . A 1 1724 SER 1724 ? ? ? A . A 1 1725 GLU 1725 ? ? ? A . A 1 1726 SER 1726 ? ? ? A . A 1 1727 GLY 1727 ? ? ? A . A 1 1728 SER 1728 ? ? ? A . A 1 1729 ASP 1729 ? ? ? A . A 1 1730 SER 1730 ? ? ? A . A 1 1731 ASP 1731 ? ? ? A . A 1 1732 VAL 1732 ? ? ? A . A 1 1733 GLY 1733 ? ? ? A . A 1 1734 SER 1734 ? ? ? A . A 1 1735 GLY 1735 ? ? ? A . A 1 1736 GLY 1736 ? ? ? A . A 1 1737 ILE 1737 ? ? ? A . A 1 1738 ARG 1738 ? ? ? A . A 1 1739 PRO 1739 ? ? ? A . A 1 1740 LYS 1740 ? ? ? A . A 1 1741 GLN 1741 ? ? ? A . A 1 1742 PRO 1742 ? ? ? A . A 1 1743 ARG 1743 ? ? ? A . A 1 1744 MET 1744 ? ? ? A . A 1 1745 LEU 1745 ? ? ? A . A 1 1746 GLN 1746 ? ? ? A . A 1 1747 GLU 1747 ? ? ? A . A 1 1748 ASN 1748 ? ? ? A . A 1 1749 THR 1749 ? ? ? A . A 1 1750 ARG 1750 ? ? ? A . A 1 1751 MET 1751 ? ? ? A . A 1 1752 ASP 1752 ? ? ? A . A 1 1753 MET 1753 ? ? ? A . A 1 1754 GLU 1754 ? ? ? A . A 1 1755 ASN 1755 ? ? ? A . A 1 1756 GLU 1756 ? ? ? A . A 1 1757 GLU 1757 ? ? ? A . A 1 1758 SER 1758 ? ? ? A . A 1 1759 MET 1759 ? ? ? A . A 1 1760 MET 1760 ? ? ? A . A 1 1761 SER 1761 ? ? ? A . A 1 1762 TYR 1762 ? ? ? A . A 1 1763 GLU 1763 ? ? ? A . A 1 1764 GLY 1764 ? ? ? A . A 1 1765 ASP 1765 ? ? ? A . A 1 1766 GLY 1766 ? ? ? A . A 1 1767 GLY 1767 ? ? ? A . A 1 1768 GLU 1768 ? ? ? A . A 1 1769 ALA 1769 ? ? ? A . A 1 1770 SER 1770 ? ? ? A . A 1 1771 HIS 1771 ? ? ? A . A 1 1772 GLY 1772 ? ? ? A . A 1 1773 LEU 1773 ? ? ? A . A 1 1774 GLU 1774 ? ? ? A . A 1 1775 ASP 1775 ? ? ? A . A 1 1776 SER 1776 ? ? ? A . A 1 1777 ASN 1777 ? ? ? A . A 1 1778 ILE 1778 ? ? ? A . A 1 1779 SER 1779 ? ? ? A . A 1 1780 TYR 1780 ? ? ? A . A 1 1781 GLY 1781 ? ? ? A . A 1 1782 SER 1782 ? ? ? A . A 1 1783 TYR 1783 ? ? ? A . A 1 1784 GLU 1784 ? ? ? A . A 1 1785 GLU 1785 ? ? ? A . A 1 1786 PRO 1786 ? ? ? A . A 1 1787 ASP 1787 ? ? ? A . A 1 1788 PRO 1788 ? ? ? A . A 1 1789 LYS 1789 ? ? ? A . A 1 1790 SER 1790 ? ? ? A . A 1 1791 ASN 1791 ? ? ? A . A 1 1792 THR 1792 ? ? ? A . A 1 1793 GLN 1793 ? ? ? A . A 1 1794 ASP 1794 ? ? ? A . A 1 1795 THR 1795 ? ? ? A . A 1 1796 SER 1796 ? ? ? A . A 1 1797 PHE 1797 ? ? ? A . A 1 1798 SER 1798 ? ? ? A . A 1 1799 SER 1799 ? ? ? A . A 1 1800 ILE 1800 ? ? ? A . A 1 1801 GLY 1801 ? ? ? A . A 1 1802 GLY 1802 ? ? ? A . A 1 1803 TYR 1803 ? ? ? A . A 1 1804 GLU 1804 ? ? ? A . A 1 1805 VAL 1805 ? ? ? A . A 1 1806 SER 1806 ? ? ? A . A 1 1807 GLU 1807 ? ? ? A . A 1 1808 GLU 1808 ? ? ? A . A 1 1809 GLU 1809 ? ? ? A . A 1 1810 GLU 1810 ? ? ? A . A 1 1811 ASP 1811 ? ? ? A . A 1 1812 GLU 1812 ? ? ? A . A 1 1813 GLU 1813 ? ? ? A . A 1 1814 GLU 1814 ? ? ? A . A 1 1815 GLU 1815 ? ? ? A . A 1 1816 GLU 1816 ? ? ? A . A 1 1817 GLN 1817 ? ? ? A . A 1 1818 ARG 1818 ? ? ? A . A 1 1819 SER 1819 ? ? ? A . A 1 1820 GLY 1820 ? ? ? A . A 1 1821 PRO 1821 ? ? ? A . A 1 1822 SER 1822 ? ? ? A . A 1 1823 VAL 1823 ? ? ? A . A 1 1824 LEU 1824 ? ? ? A . A 1 1825 SER 1825 ? ? ? A . A 1 1826 GLN 1826 ? ? ? A . A 1 1827 VAL 1827 ? ? ? A . A 1 1828 HIS 1828 ? ? ? A . A 1 1829 LEU 1829 ? ? ? A . A 1 1830 SER 1830 ? ? ? A . A 1 1831 GLU 1831 ? ? ? A . A 1 1832 ASP 1832 ? ? ? A . A 1 1833 GLU 1833 ? ? ? A . A 1 1834 GLU 1834 ? ? ? A . A 1 1835 ASP 1835 ? ? ? A . A 1 1836 SER 1836 ? ? ? A . A 1 1837 GLU 1837 ? ? ? A . A 1 1838 ASP 1838 ? ? ? A . A 1 1839 PHE 1839 ? ? ? A . A 1 1840 HIS 1840 ? ? ? A . A 1 1841 SER 1841 ? ? ? A . A 1 1842 ILE 1842 ? ? ? A . A 1 1843 ALA 1843 ? ? ? A . A 1 1844 GLY 1844 ? ? ? A . A 1 1845 ASP 1845 ? ? ? A . A 1 1846 SER 1846 ? ? ? A . A 1 1847 ASP 1847 ? ? ? A . A 1 1848 LEU 1848 ? ? ? A . A 1 1849 ASP 1849 ? ? ? A . A 1 1850 SER 1850 ? ? ? A . A 1 1851 ASP 1851 ? ? ? A . A 1 1852 GLU 1852 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Bromodomain-containing protein 4 {PDB ID=6dne, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6dne.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6dne, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;NPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKR LENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGR KETGTAKPGVSTVPNTTQASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPV PPQPQPPPAPAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQRRE SSRPVKPPKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKPVDVEALGLHDYCDI IKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEE PVVAVSSPAVPPPT ; ;NPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKR LENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGR KETGTAKPGVSTVPNTTQASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPV PPQPQPPPAPAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQRRE SSRPVKPPKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKPVDVEALGLHDYCDI IKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEE PVVAVSSPAVPPPT ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 16 416 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6dne 2023-10-11 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1852 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2026 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.9e-29 25.110 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSDTDSDEDSAGGGPFSLAGFLFGNINGAGQLEGESVLDDECKKHLAGLGALGLGSLITELTANEELTGTDGALVNDEGWVRSTEDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHSDYDEDDYDADCEDIDCKLMPPPPPPPGPMKKDKDQDSITGEKVDFSSSSDSESEMGPQEATQAESEDGKLTLPLAGIMQHDATKLLPSVTELFPEFRPGKVLRFLRLFGPGKNVPSVWRSARRKRKKKHRELIQEEQIQEVECSVESEVSQKSLWNYDYAPPPPPEQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDIDKVTDTKPRVAEWRYGPARLWYDMLGVPEDGSGFDYGFKLRKTEHEPVIKSRMIEEFRKLEENNGTDLLADENFLMVTQLHWEDDIIWDGEDVKHKGTKPQRASLAGWLPSSMTRNAMAYNVQQGFAATLDDDKPWYSIFPIDNEDLVYGRWEDNIIWDAQAMPRLLEPPVLTLDPNDENLILEIPDEKEEATSNSPSKESKKESSLKKSRILLGKTGVIKEEPQQNMSQPEVKDPWNLSNDEYYYPKQQGLRGTFGGNIIQHSIPAVELRQPFFPTHMGPIKLRQFHRPPLKKYSFGALSQPGPHSVQPLLKHIKKKAKMREQERQASGGGEMFFMRTPQDLTGKDGDLILAEYSEENGPLMMQVGMATKIKNYYKRKPGKDPGAPDCKYGETVYCHTSPFLGSLHPGQLLQAFENNLFRAPIYLHKMPETDFLIIRTRQGYYIRELVDIFVVGQQCPLFEVPGPNSKRANTHIRDFLQVFIYRLFWKSKDRPRRIRMEDIKKAFPSHSESSIRKRLKLCADFKRTGMDSNWWVLKSDFRLPTEEEIRAMVSPEQCCAYYSMIAAEQRLKDAGYGEKSFFAPEEENEEDFQMKIDDEVRTAPWNTTRAFIAAMKGKCLLEVTGVADPTGCGEGFSYVKIPNKPTQQKDDKEPQPVKKTVTGTDADLRRLSLKNAKQLLRKFGVPEEEIKKLSRWEVIDVVRTMSTEQARSGEGPMSKFARGSRFSVAEHQERYKEECQRIFDLQNKVLSSTEVLSTDTDSSSAEDSDFEEMGKNIENMLQNKKTSSQLSREREEQERKELQRMLLAAGSAASGNNHRDDDTASVTSLNSSATGRCLKIYRTFRDEEGKEYVRCETVRKPAVIDAYVRIRTTKDEEFIRKFALFDEQHREEMRKERRRIQEQLRRLKRNQEKEKLKGPPEKKPKKMKERPDLKLKCGACGAIGHMRTNKFCPLYYQTNAPPSNPVAMTEEQEEELEKTVIHNDNEELIKVEGTKIVLGKQLIESADEVRRKSLVLKFPKQQLPPKKKRRVGTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLPNTYPFHTPVN--AKVVKDYYKIITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLARL-----------EKA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------INP----------------------------LLDD-----------------DDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFV--PDYYKVIVNPMDLETIRKNISKHKYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAELESLDPMTPGPYTPQPPDLYDTNTSLSMSRDASVFQDESNMSVLDIPSATPEKQVTQEGEDGDGDLADEEEGTVQQPQASVLYEDLLMSEGEDDEEDAGSDEEGDNPFSAIQLSESGSDSDVGSGGIRPKQPRMLQENTRMDMENEESMMSYEGDGGEASHGLEDSNISYGSYEEPDPKSNTQDTSFSSIGGYEVSEEEEDEEEEEQRSGPSVLSQVHLSEDEEDSEDFHSIAGDSDLDSDE 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGRKETGTAKPGVSTVPNTTQASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPVPPQPQPPPAPAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQRRESSRPVKPPKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFA--KKHAAYAWPFYKPVDVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6dne.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 1361 1361 ? A 11.661 17.566 4.755 1 1 A PRO 0.440 1 ATOM 2 C CA . PRO 1361 1361 ? A 11.799 16.780 3.488 1 1 A PRO 0.440 1 ATOM 3 C C . PRO 1361 1361 ? A 12.637 15.567 3.753 1 1 A PRO 0.440 1 ATOM 4 O O . PRO 1361 1361 ? A 13.350 15.519 4.747 1 1 A PRO 0.440 1 ATOM 5 C CB . PRO 1361 1361 ? A 12.415 17.796 2.530 1 1 A PRO 0.440 1 ATOM 6 C CG . PRO 1361 1361 ? A 13.193 18.817 3.383 1 1 A PRO 0.440 1 ATOM 7 C CD . PRO 1361 1361 ? A 12.661 18.694 4.798 1 1 A PRO 0.440 1 ATOM 8 N N . MET 1362 1362 ? A 12.529 14.568 2.859 1 1 A MET 0.430 1 ATOM 9 C CA . MET 1362 1362 ? A 13.108 13.269 3.030 1 1 A MET 0.430 1 ATOM 10 C C . MET 1362 1362 ? A 13.315 12.763 1.623 1 1 A MET 0.430 1 ATOM 11 O O . MET 1362 1362 ? A 12.601 13.214 0.740 1 1 A MET 0.430 1 ATOM 12 C CB . MET 1362 1362 ? A 12.070 12.384 3.755 1 1 A MET 0.430 1 ATOM 13 C CG . MET 1362 1362 ? A 12.472 10.942 4.060 1 1 A MET 0.430 1 ATOM 14 S SD . MET 1362 1362 ? A 11.203 10.039 4.994 1 1 A MET 0.430 1 ATOM 15 C CE . MET 1362 1362 ? A 11.585 10.768 6.603 1 1 A MET 0.430 1 ATOM 16 N N . VAL 1363 1363 ? A 14.265 11.824 1.384 1 1 A VAL 0.450 1 ATOM 17 C CA . VAL 1363 1363 ? A 14.552 11.251 0.072 1 1 A VAL 0.450 1 ATOM 18 C C . VAL 1363 1363 ? A 13.321 10.627 -0.533 1 1 A VAL 0.450 1 ATOM 19 O O . VAL 1363 1363 ? A 12.890 10.962 -1.630 1 1 A VAL 0.450 1 ATOM 20 C CB . VAL 1363 1363 ? A 15.629 10.179 0.235 1 1 A VAL 0.450 1 ATOM 21 C CG1 . VAL 1363 1363 ? A 15.822 9.364 -1.055 1 1 A VAL 0.450 1 ATOM 22 C CG2 . VAL 1363 1363 ? A 16.958 10.858 0.614 1 1 A VAL 0.450 1 ATOM 23 N N . THR 1364 1364 ? A 12.648 9.784 0.250 1 1 A THR 0.460 1 ATOM 24 C CA . THR 1364 1364 ? A 11.424 9.142 -0.131 1 1 A THR 0.460 1 ATOM 25 C C . THR 1364 1364 ? A 10.271 10.113 -0.330 1 1 A THR 0.460 1 ATOM 26 O O . THR 1364 1364 ? A 9.507 9.945 -1.265 1 1 A THR 0.460 1 ATOM 27 C CB . THR 1364 1364 ? A 11.038 8.140 0.919 1 1 A THR 0.460 1 ATOM 28 O OG1 . THR 1364 1364 ? A 11.031 8.772 2.188 1 1 A THR 0.460 1 ATOM 29 C CG2 . THR 1364 1364 ? A 12.079 7.015 1.022 1 1 A THR 0.460 1 ATOM 30 N N . LEU 1365 1365 ? A 10.103 11.166 0.510 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 31 C CA . LEU 1365 1365 ? A 9.118 12.233 0.303 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 32 C C . LEU 1365 1365 ? A 9.320 12.982 -0.998 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 33 O O . LEU 1365 1365 ? A 8.357 13.296 -1.698 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 34 C CB . LEU 1365 1365 ? A 9.097 13.276 1.451 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 35 C CG . LEU 1365 1365 ? A 8.325 12.820 2.701 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 36 C CD1 . LEU 1365 1365 ? A 8.550 13.796 3.869 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 37 C CD2 . LEU 1365 1365 ? A 6.820 12.704 2.395 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 38 N N . SER 1366 1366 ? A 10.583 13.260 -1.364 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 39 C CA . SER 1366 1366 ? A 10.936 13.786 -2.672 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 40 C C . SER 1366 1366 ? A 10.571 12.822 -3.788 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 41 O O . SER 1366 1366 ? A 9.849 13.203 -4.700 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 42 C CB . SER 1366 1366 ? A 12.439 14.128 -2.792 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 43 O OG . SER 1366 1366 ? A 12.815 15.135 -1.845 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 44 N N . SER 1367 1367 ? A 10.939 11.518 -3.686 1 1 A SER 0.570 1 ATOM 45 C CA . SER 1367 1367 ? A 10.608 10.461 -4.651 1 1 A SER 0.570 1 ATOM 46 C C . SER 1367 1367 ? A 9.153 10.268 -4.842 1 1 A SER 0.570 1 ATOM 47 O O . SER 1367 1367 ? A 8.648 9.957 -5.915 1 1 A SER 0.570 1 ATOM 48 C CB . SER 1367 1367 ? A 11.090 9.063 -4.223 1 1 A SER 0.570 1 ATOM 49 O OG . SER 1367 1367 ? A 12.505 9.110 -4.235 1 1 A SER 0.570 1 ATOM 50 N N . ILE 1368 1368 ? A 8.425 10.433 -3.751 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 51 C CA . ILE 1368 1368 ? A 7.005 10.496 -3.759 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 52 C C . ILE 1368 1368 ? A 6.446 11.635 -4.576 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 53 O O . ILE 1368 1368 ? A 5.653 11.400 -5.476 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 54 C CB . ILE 1368 1368 ? A 6.556 10.486 -2.323 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 55 C CG1 . ILE 1368 1368 ? A 6.697 9.090 -1.680 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 56 C CG2 . ILE 1368 1368 ? A 5.093 10.857 -2.272 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 57 C CD1 . ILE 1368 1368 ? A 6.561 9.057 -0.157 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 58 N N . LEU 1369 1369 ? A 6.876 12.885 -4.345 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 59 C CA . LEU 1369 1369 ? A 6.428 13.972 -5.178 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 60 C C . LEU 1369 1369 ? A 6.872 13.852 -6.617 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 61 O O . LEU 1369 1369 ? A 6.078 13.988 -7.546 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 62 C CB . LEU 1369 1369 ? A 6.843 15.296 -4.518 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 63 C CG . LEU 1369 1369 ? A 6.533 16.570 -5.323 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 64 C CD1 . LEU 1369 1369 ? A 5.092 16.658 -5.870 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 65 C CD2 . LEU 1369 1369 ? A 6.913 17.793 -4.479 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 66 N N . GLU 1370 1370 ? A 8.143 13.528 -6.838 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 67 C CA . GLU 1370 1370 ? A 8.688 13.448 -8.162 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 68 C C . GLU 1370 1370 ? A 8.225 12.283 -9.016 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 69 O O . GLU 1370 1370 ? A 7.888 12.450 -10.184 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 70 C CB . GLU 1370 1370 ? A 10.208 13.362 -8.032 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 71 C CG . GLU 1370 1370 ? A 10.845 14.648 -7.461 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 72 C CD . GLU 1370 1370 ? A 12.354 14.501 -7.301 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 73 O OE1 . GLU 1370 1370 ? A 12.896 13.424 -7.654 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 74 O OE2 . GLU 1370 1370 ? A 12.971 15.485 -6.817 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 75 N N . SER 1371 1371 ? A 8.205 11.057 -8.461 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 76 C CA . SER 1371 1371 ? A 7.878 9.867 -9.226 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 77 C C . SER 1371 1371 ? A 6.422 9.496 -9.047 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 78 O O . SER 1371 1371 ? A 5.656 9.416 -10.005 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 79 C CB . SER 1371 1371 ? A 8.829 8.688 -8.845 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 80 O OG . SER 1371 1371 ? A 8.607 7.500 -9.612 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 81 N N . ILE 1372 1372 ? A 5.974 9.269 -7.804 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 82 C CA . ILE 1372 1372 ? A 4.701 8.601 -7.557 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 83 C C . ILE 1372 1372 ? A 3.471 9.433 -7.789 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 84 O O . ILE 1372 1372 ? A 2.521 9.008 -8.443 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 85 C CB . ILE 1372 1372 ? 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A 2.730 11.561 -11.858 1 1 A ASN 0.730 1 ATOM 100 O O . ASN 1374 1374 ? A 1.847 11.889 -12.642 1 1 A ASN 0.730 1 ATOM 101 C CB . ASN 1374 1374 ? A 4.759 13.034 -11.464 1 1 A ASN 0.730 1 ATOM 102 C CG . ASN 1374 1374 ? A 5.180 14.382 -10.884 1 1 A ASN 0.730 1 ATOM 103 O OD1 . ASN 1374 1374 ? A 4.450 15.097 -10.193 1 1 A ASN 0.730 1 ATOM 104 N ND2 . ASN 1374 1374 ? A 6.436 14.768 -11.204 1 1 A ASN 0.730 1 ATOM 105 N N . ASP 1375 1375 ? A 3.077 10.261 -11.694 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 106 C CA . ASP 1375 1375 ? A 2.521 9.179 -12.491 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 107 C C . ASP 1375 1375 ? A 0.997 9.074 -12.370 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 108 O O . ASP 1375 1375 ? A 0.240 9.104 -13.341 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 109 C CB . ASP 1375 1375 ? A 3.187 7.870 -11.980 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 110 C CG . ASP 1375 1375 ? A 2.844 6.647 -12.814 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 111 O OD1 . ASP 1375 1375 ? A 2.664 6.791 -14.045 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 112 O OD2 . ASP 1375 1375 ? A 2.817 5.544 -12.214 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 113 N N . 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A -6.766 8.182 -18.456 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 153 C CG . PRO 1380 1380 ? A -5.424 7.665 -18.986 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 154 C CD . PRO 1380 1380 ? A -4.439 7.891 -17.835 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 155 N N . ASN 1381 1381 ? A -7.265 8.449 -15.247 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 156 C CA . ASN 1381 1381 ? A -8.173 8.209 -14.171 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 157 C C . ASN 1381 1381 ? A -7.995 9.154 -13.000 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 158 O O . ASN 1381 1381 ? A -8.745 9.072 -12.037 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 159 C CB . ASN 1381 1381 ? A -7.840 6.785 -13.706 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 160 C CG . ASN 1381 1381 ? A -8.514 5.826 -14.669 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 161 O OD1 . ASN 1381 1381 ? A -9.433 6.179 -15.391 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 162 N ND2 . ASN 1381 1381 ? A -8.060 4.553 -14.701 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 163 N N . THR 1382 1382 ? A -7.030 10.094 -13.044 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 164 C CA . THR 1382 1382 ? A -6.722 10.993 -11.932 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 165 C C . THR 1382 1382 ? 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PRO 1420 1420 ? A 4.829 15.325 8.972 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 499 N N . SER 1421 1421 ? A 7.173 12.474 7.330 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 500 C CA . SER 1421 1421 ? A 7.871 11.360 6.700 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 501 C C . SER 1421 1421 ? A 7.042 10.800 5.580 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 502 O O . SER 1421 1421 ? A 5.882 11.151 5.384 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 503 C CB . SER 1421 1421 ? A 8.282 10.186 7.658 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 504 O OG . SER 1421 1421 ? A 7.192 9.362 8.086 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 505 N N . ARG 1422 1422 ? A 7.638 9.883 4.791 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 506 C CA . ARG 1422 1422 ? A 6.969 9.246 3.681 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 507 C C . ARG 1422 1422 ? A 5.770 8.420 4.020 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 508 O O . ARG 1422 1422 ? A 4.883 8.221 3.192 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 509 C CB . ARG 1422 1422 ? A 7.907 8.280 2.937 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 510 C CG . ARG 1422 1422 ? A 8.484 7.058 3.688 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 511 C CD . ARG 1422 1422 ? A 8.901 5.953 2.721 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 512 N NE . ARG 1422 1422 ? A 9.444 4.838 3.540 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 513 C CZ . ARG 1422 1422 ? A 8.761 3.768 3.948 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 514 N NH1 . ARG 1422 1422 ? A 7.443 3.698 3.737 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 515 N NH2 . ARG 1422 1422 ? A 9.372 2.820 4.640 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 516 N N . GLU 1423 1423 ? A 5.769 7.870 5.243 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 517 C CA . GLU 1423 1423 ? A 4.729 7.026 5.738 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 518 C C . GLU 1423 1423 ? A 3.438 7.779 5.843 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 519 O O . GLU 1423 1423 ? A 2.412 7.337 5.344 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 520 C CB . GLU 1423 1423 ? A 5.167 6.373 7.070 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 521 C CG . GLU 1423 1423 ? A 4.117 5.416 7.652 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 522 C CD . GLU 1423 1423 ? A 3.905 4.213 6.752 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 523 O OE1 . GLU 1423 1423 ? A 4.458 4.104 5.611 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 524 O OE2 . GLU 1423 1423 ? A 3.174 3.307 7.204 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 525 N N . GLU 1424 1424 ? A 3.498 9.015 6.366 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 526 C CA . GLU 1424 1424 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #