data_SMR-c9b6a8cf7cf9955d2665e0ec1c1d6d86_3 _entry.id SMR-c9b6a8cf7cf9955d2665e0ec1c1d6d86_3 _struct.entry_id SMR-c9b6a8cf7cf9955d2665e0ec1c1d6d86_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - B2RY04/ DOCK5_MOUSE, Dedicator of cytokinesis protein 5 Estimated model accuracy of this model is 0.013, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries B2RY04' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 248349.151 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DOCK5_MOUSE B2RY04 1 ;MARWIPTKRQKYGVAIYNYNASQDVELSLQIGDTVHILEMYEGWYRGYALQNRSKKGIFPETYIHLKEAT VEDGGQHETVIPGELPLVQELTNTLREWAVIWRKLYVNNKVTLFRQLQQMTYSLIEWRSQILSGTLPKDE LAELKKKVTAKIDHGNRMLGLDLVVRDDNGNILDPDETSTVALFRAHEVASKRIEEKIQEEKSILQNLDL RGQAIFSTVHTYGLYVNFKNFVCNIGEDAELFIALYDPDQSTFISENYLIRWGSNGMPKEIEKLNNLQAV FTDLSSTDLIRPRISLVCQIVRVGRMELKEGKKHTCGLRRPFGVAVMDISDIVHGKVDDEEKQHFIPFQQ IAMETYIRQRQLIMSPLITSHVIGENEPLTSVLNKVIAAKEVNHKGQGLWVSLKLLPGDLTQVQKNFSHL VDRSTAIARKMGFPEIILPGDVRNDIYVTLIHGEFDKGKKKTPKNVEVTMSVFDEEGNLLEKAIHPGAGY EGVSEYKSVVYYQVKQPCWYETVKVFIAIEEVTRCHIRFTFRHRSSQESRDKSERAFGVAFVKLMNADGT TLQDGRHDLVVYKGDNKKMEDAKYYLTLPGTKAELEEKELQASKNPSVFTPSKDSTKDSFQIATLICSTK LTQNVDLLGLLNWRSNSQNIKHNLKKLMEVDGGEIVKFLQDTLDALFNIMMEMSDNETYDFLVFDALVFI ISLIGDIKFQHFNPVLETYIYKHFSATLAHVKLSKVLNFYVANAEDPSKTELLFAALKALKYLFRFIIQS RVLYLRFYGQSEDGDEFNDSIRQLFLAFNTLMDRPLEEAVKIKGAALKYLPSIINDVKLVFDPMELSVLF CKFIQSIPDNQLVRQKLNCMTKIVESSLFQQAECREVLLPLLTDQLSGQLDDHSTKPDHEASSQLLSNIL EVLDRTDVGPTSAHVQLIMERLLRRINRTVIGMSRQSPHIGSFVACMIAVLRQMEDSHYSHYISTFKTRQ DIIDFLMETFIMFKDLIGKNVYAKDWMVMNMTQNRVFLRAINQFAEVLTKSFMDQASFELQLWNNYFHLA VAFLTHESLQLETFSEAKRNKIVKKYGDMRKEIGFRIRDMWYNLGPHKIKFIPSMVGPILEVTLTPEVEL RKATIPIFFDMMQCEFNLSGNGNFHMFENELITKLDQEVEGGRGDEQYKVLLEKLLLEHCRKHKYLANSG EAFAFLVSSLLENLLDYRTIIIHDESKENRMSCTVNVLNFYKDKKREDIYIRYLYKLRDLHRDCENYTEA AYTLLLHAELLQWSDKPCVPHLLQRDSYYVYTQQELKEKLYQEIISYFDKGKMWEKAIKLSKELAETYES KVFDYEGLGSLLKKRALFYENIIKAMRPQPEYFAVGYYGQGFPSFLRNKIFIYRGKEYERREDFSLRLLT QFPNAEKMTSTTPPGEDIKSSPKQYLQCFTVKPVMSLPPSYKDKPVPEQILNYYRANEVQQFSYSRPFRK GEKDPENEFATMWIERTTYRTAYTFPGILKWFEAKEISVEEISPLENAIETMELTNERVSNCVQQHAWDH SLSVHPLSMLLSGIVDPAVMGGFSNYEKAFFTEKYLQEHPEDQEKVELLKRLIALQIPLLTEGIRIHGEK LTEQLKPLHARLSSCFRELKEKVEKLYGVITLPPSMTERKPSRAGSMVLPYILSSTLRRLSVTSVASSVI STSSNSSDNASSRPGSDGSILEPLFERRASSGARVEDLPPKEDSENRISKFKRKDWNLSKSQVIAEKAPE PDVMSPGKKTQRPKSLQLVDSRLTPFHSPSPLQSTALSPPPLTPKATRTLSSPSLQTDGLTASVPPPPPP KSKPYESSQRNSAEIAPPLPVRRDSKAPPPPPPKARKSGILSSEPGSQ ; 'Dedicator of cytokinesis protein 5' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1868 1 1868 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DOCK5_MOUSE B2RY04 . 1 1868 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 D4AB0D8CD588F73D # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MARWIPTKRQKYGVAIYNYNASQDVELSLQIGDTVHILEMYEGWYRGYALQNRSKKGIFPETYIHLKEAT VEDGGQHETVIPGELPLVQELTNTLREWAVIWRKLYVNNKVTLFRQLQQMTYSLIEWRSQILSGTLPKDE LAELKKKVTAKIDHGNRMLGLDLVVRDDNGNILDPDETSTVALFRAHEVASKRIEEKIQEEKSILQNLDL RGQAIFSTVHTYGLYVNFKNFVCNIGEDAELFIALYDPDQSTFISENYLIRWGSNGMPKEIEKLNNLQAV FTDLSSTDLIRPRISLVCQIVRVGRMELKEGKKHTCGLRRPFGVAVMDISDIVHGKVDDEEKQHFIPFQQ IAMETYIRQRQLIMSPLITSHVIGENEPLTSVLNKVIAAKEVNHKGQGLWVSLKLLPGDLTQVQKNFSHL VDRSTAIARKMGFPEIILPGDVRNDIYVTLIHGEFDKGKKKTPKNVEVTMSVFDEEGNLLEKAIHPGAGY EGVSEYKSVVYYQVKQPCWYETVKVFIAIEEVTRCHIRFTFRHRSSQESRDKSERAFGVAFVKLMNADGT TLQDGRHDLVVYKGDNKKMEDAKYYLTLPGTKAELEEKELQASKNPSVFTPSKDSTKDSFQIATLICSTK 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ISLIGDIKFQHFNPVLETYIYKHFSATLAHVKLSKVLNFYVANAEDPSKTELLFAALKALKYLFRFIIQS RVLYLRFYGQSEDGDEFNDSIRQLFLAFNTLMDRPLEEAVKIKGAALKYLPSIINDVKLVFDPMELSVLF CKFIQSIPDNQLVRQKLNCMTKIVESSLFQQAECREVLLPLLTDQLSGQLDDHSTKPDHEASSQLLSNIL EVLDRTDVGPTSAHVQLIMERLLRRINRTVIGMSRQSPHIGSFVACMIAVLRQMEDSHYSHYISTFKTRQ DIIDFLMETFIMFKDLIGKNVYAKDWMVMNMTQNRVFLRAINQFAEVLTKSFMDQASFELQLWNNYFHLA VAFLTHESLQLETFSEAKRNKIVKKYGDMRKEIGFRIRDMWYNLGPHKIKFIPSMVGPILEVTLTPEVEL RKATIPIFFDMMQCEFNLSGNGNFHMFENELITKLDQEVEGGRGDEQYKVLLEKLLLEHCRKHKYLANSG EAFAFLVSSLLENLLDYRTIIIHDESKENRMSCTVNVLNFYKDKKREDIYIRYLYKLRDLHRDCENYTEA AYTLLLHAELLQWSDKPCVPHLLQRDSYYVYTQQELKEKLYQEIISYFDKGKMWEKAIKLSKELAETYES KVFDYEGLGSLLKKRALFYENIIKAMRPQPEYFAVGYYGQGFPSFLRNKIFIYRGKEYERREDFSLRLLT QFPNAEKMTSTTPPGEDIKSSPKQYLQCFTVKPVMSLPPSYKDKPVPEQILNYYRANEVQQFSYSRPFRK GEKDPENEFATMWIERTTYRTAYTFPGILKWFEAKEISVEEISPLENAIETMELTNERVSNCVQQHAWDH SLSVHPLSMLLSGIVDPAVMGGFSNYEKAFFTEKYLQEHPEDQEKVELLKRLIALQIPLLTEGIRIHGEK LTEQLKPLHARLSSCFRELKEKVEKLYGVITLPPSMTERKPSRAGSMVLPYILSSTLRRLSVTSVASSVI 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A 1 1637 TYR 1637 ? ? ? D . A 1 1638 GLY 1638 ? ? ? D . A 1 1639 VAL 1639 ? ? ? D . A 1 1640 ILE 1640 ? ? ? D . A 1 1641 THR 1641 ? ? ? D . A 1 1642 LEU 1642 ? ? ? D . A 1 1643 PRO 1643 ? ? ? D . A 1 1644 PRO 1644 ? ? ? D . A 1 1645 SER 1645 ? ? ? D . A 1 1646 MET 1646 ? ? ? D . A 1 1647 THR 1647 ? ? ? D . A 1 1648 GLU 1648 ? ? ? D . A 1 1649 ARG 1649 ? ? ? D . A 1 1650 LYS 1650 ? ? ? D . A 1 1651 PRO 1651 ? ? ? D . A 1 1652 SER 1652 ? ? ? D . A 1 1653 ARG 1653 ? ? ? D . A 1 1654 ALA 1654 ? ? ? D . A 1 1655 GLY 1655 ? ? ? D . A 1 1656 SER 1656 ? ? ? D . A 1 1657 MET 1657 ? ? ? D . A 1 1658 VAL 1658 ? ? ? D . A 1 1659 LEU 1659 ? ? ? D . A 1 1660 PRO 1660 ? ? ? D . A 1 1661 TYR 1661 ? ? ? D . A 1 1662 ILE 1662 ? ? ? D . A 1 1663 LEU 1663 ? ? ? D . A 1 1664 SER 1664 ? ? ? D . A 1 1665 SER 1665 ? ? ? D . A 1 1666 THR 1666 ? ? ? D . A 1 1667 LEU 1667 ? ? ? D . A 1 1668 ARG 1668 ? ? ? D . A 1 1669 ARG 1669 ? ? ? D . A 1 1670 LEU 1670 ? ? ? D . A 1 1671 SER 1671 ? ? ? D . A 1 1672 VAL 1672 ? ? ? D . A 1 1673 THR 1673 ? ? ? D . A 1 1674 SER 1674 ? ? ? D . A 1 1675 VAL 1675 ? ? ? D . A 1 1676 ALA 1676 ? ? ? D . A 1 1677 SER 1677 ? ? ? D . A 1 1678 SER 1678 ? ? ? D . A 1 1679 VAL 1679 ? ? ? D . A 1 1680 ILE 1680 ? ? ? D . A 1 1681 SER 1681 ? ? ? D . A 1 1682 THR 1682 ? ? ? D . A 1 1683 SER 1683 ? ? ? D . A 1 1684 SER 1684 ? ? ? D . A 1 1685 ASN 1685 ? ? ? D . A 1 1686 SER 1686 ? ? ? D . A 1 1687 SER 1687 ? ? ? D . A 1 1688 ASP 1688 ? ? ? D . A 1 1689 ASN 1689 ? ? ? D . A 1 1690 ALA 1690 ? ? ? D . A 1 1691 SER 1691 ? ? ? D . A 1 1692 SER 1692 ? ? ? D . A 1 1693 ARG 1693 ? ? ? D . A 1 1694 PRO 1694 ? ? ? D . A 1 1695 GLY 1695 ? ? ? D . A 1 1696 SER 1696 ? ? ? D . A 1 1697 ASP 1697 ? ? ? D . A 1 1698 GLY 1698 ? ? ? D . A 1 1699 SER 1699 ? ? ? D . A 1 1700 ILE 1700 ? ? ? D . A 1 1701 LEU 1701 ? ? ? D . A 1 1702 GLU 1702 ? ? ? D . A 1 1703 PRO 1703 ? ? ? D . A 1 1704 LEU 1704 ? ? ? D . A 1 1705 PHE 1705 ? ? ? D . A 1 1706 GLU 1706 ? ? ? D . A 1 1707 ARG 1707 ? ? ? D . A 1 1708 ARG 1708 ? ? ? D . A 1 1709 ALA 1709 ? ? ? D . A 1 1710 SER 1710 ? ? ? D . A 1 1711 SER 1711 ? ? ? D . A 1 1712 GLY 1712 ? ? ? D . A 1 1713 ALA 1713 ? ? ? D . A 1 1714 ARG 1714 ? ? ? D . A 1 1715 VAL 1715 ? ? ? D . A 1 1716 GLU 1716 ? ? ? D . A 1 1717 ASP 1717 ? ? ? D . A 1 1718 LEU 1718 ? ? ? D . A 1 1719 PRO 1719 ? ? ? D . A 1 1720 PRO 1720 ? ? ? D . A 1 1721 LYS 1721 ? ? ? D . A 1 1722 GLU 1722 ? ? ? D . A 1 1723 ASP 1723 ? ? ? D . A 1 1724 SER 1724 ? ? ? D . A 1 1725 GLU 1725 ? ? ? D . A 1 1726 ASN 1726 ? ? ? D . A 1 1727 ARG 1727 ? ? ? D . A 1 1728 ILE 1728 ? ? ? D . A 1 1729 SER 1729 ? ? ? D . A 1 1730 LYS 1730 ? ? ? D . A 1 1731 PHE 1731 ? ? ? D . A 1 1732 LYS 1732 ? ? ? D . A 1 1733 ARG 1733 ? ? ? D . A 1 1734 LYS 1734 ? ? ? D . A 1 1735 ASP 1735 ? ? ? D . A 1 1736 TRP 1736 ? ? ? D . A 1 1737 ASN 1737 ? ? ? D . A 1 1738 LEU 1738 ? ? ? D . A 1 1739 SER 1739 ? ? ? D . A 1 1740 LYS 1740 ? ? ? D . A 1 1741 SER 1741 ? ? ? D . A 1 1742 GLN 1742 ? ? ? D . A 1 1743 VAL 1743 ? ? ? D . A 1 1744 ILE 1744 ? ? ? D . A 1 1745 ALA 1745 ? ? ? D . A 1 1746 GLU 1746 ? ? ? D . A 1 1747 LYS 1747 ? ? ? D . A 1 1748 ALA 1748 ? ? ? D . A 1 1749 PRO 1749 ? ? ? D . A 1 1750 GLU 1750 ? ? ? D . A 1 1751 PRO 1751 ? ? ? D . A 1 1752 ASP 1752 ? ? ? D . A 1 1753 VAL 1753 ? ? ? D . A 1 1754 MET 1754 ? ? ? D . A 1 1755 SER 1755 ? ? ? D . A 1 1756 PRO 1756 ? ? ? D . A 1 1757 GLY 1757 ? ? ? D . A 1 1758 LYS 1758 ? ? ? D . A 1 1759 LYS 1759 ? ? ? D . A 1 1760 THR 1760 ? ? ? D . A 1 1761 GLN 1761 ? ? ? D . A 1 1762 ARG 1762 ? ? ? D . A 1 1763 PRO 1763 ? ? ? D . A 1 1764 LYS 1764 ? ? ? D . A 1 1765 SER 1765 ? ? ? D . A 1 1766 LEU 1766 ? ? ? D . A 1 1767 GLN 1767 ? ? ? D . A 1 1768 LEU 1768 ? ? ? D . A 1 1769 VAL 1769 ? ? ? D . A 1 1770 ASP 1770 ? ? ? D . A 1 1771 SER 1771 ? ? ? D . A 1 1772 ARG 1772 ? ? ? D . A 1 1773 LEU 1773 ? ? ? D . A 1 1774 THR 1774 ? ? ? D . A 1 1775 PRO 1775 ? ? ? D . A 1 1776 PHE 1776 ? ? ? D . A 1 1777 HIS 1777 ? ? ? D . A 1 1778 SER 1778 ? ? ? D . A 1 1779 PRO 1779 ? ? ? D . A 1 1780 SER 1780 ? ? ? D . A 1 1781 PRO 1781 ? ? ? D . A 1 1782 LEU 1782 ? ? ? D . A 1 1783 GLN 1783 ? ? ? D . A 1 1784 SER 1784 ? ? ? D . A 1 1785 THR 1785 ? ? ? D . A 1 1786 ALA 1786 ? ? ? D . A 1 1787 LEU 1787 ? ? ? D . A 1 1788 SER 1788 ? ? ? D . A 1 1789 PRO 1789 ? ? ? D . A 1 1790 PRO 1790 ? ? ? D . A 1 1791 PRO 1791 ? ? ? D . A 1 1792 LEU 1792 ? ? ? D . A 1 1793 THR 1793 ? ? ? D . A 1 1794 PRO 1794 ? ? ? D . A 1 1795 LYS 1795 ? ? ? D . A 1 1796 ALA 1796 ? ? ? D . A 1 1797 THR 1797 ? ? ? D . A 1 1798 ARG 1798 ? ? ? D . A 1 1799 THR 1799 ? ? ? D . A 1 1800 LEU 1800 ? ? ? D . A 1 1801 SER 1801 ? ? ? D . A 1 1802 SER 1802 ? ? ? D . A 1 1803 PRO 1803 ? ? ? D . A 1 1804 SER 1804 ? ? ? D . A 1 1805 LEU 1805 ? ? ? D . A 1 1806 GLN 1806 ? ? ? D . A 1 1807 THR 1807 ? ? ? D . A 1 1808 ASP 1808 ? ? ? D . A 1 1809 GLY 1809 ? ? ? D . A 1 1810 LEU 1810 ? ? ? D . A 1 1811 THR 1811 ? ? ? D . A 1 1812 ALA 1812 ? ? ? D . A 1 1813 SER 1813 ? ? ? D . A 1 1814 VAL 1814 ? ? ? D . A 1 1815 PRO 1815 ? ? ? D . A 1 1816 PRO 1816 ? ? ? D . A 1 1817 PRO 1817 ? ? ? D . A 1 1818 PRO 1818 ? ? ? D . A 1 1819 PRO 1819 ? ? ? D . A 1 1820 PRO 1820 ? ? ? D . A 1 1821 LYS 1821 ? ? ? D . A 1 1822 SER 1822 ? ? ? D . A 1 1823 LYS 1823 ? ? ? D . A 1 1824 PRO 1824 ? ? ? D . A 1 1825 TYR 1825 ? ? ? D . A 1 1826 GLU 1826 ? ? ? D . A 1 1827 SER 1827 ? ? ? D . A 1 1828 SER 1828 ? ? ? D . A 1 1829 GLN 1829 ? ? ? D . A 1 1830 ARG 1830 ? ? ? D . A 1 1831 ASN 1831 ? ? ? D . A 1 1832 SER 1832 ? ? ? D . A 1 1833 ALA 1833 ? ? ? D . A 1 1834 GLU 1834 ? ? ? D . A 1 1835 ILE 1835 ? ? ? D . A 1 1836 ALA 1836 ? ? ? D . A 1 1837 PRO 1837 ? ? ? D . A 1 1838 PRO 1838 ? ? ? D . A 1 1839 LEU 1839 ? ? ? D . A 1 1840 PRO 1840 ? ? ? D . A 1 1841 VAL 1841 ? ? ? D . A 1 1842 ARG 1842 ? ? ? D . A 1 1843 ARG 1843 ? ? ? D . A 1 1844 ASP 1844 ? ? ? D . A 1 1845 SER 1845 ? ? ? D . A 1 1846 LYS 1846 ? ? ? D . A 1 1847 ALA 1847 ? ? ? D . A 1 1848 PRO 1848 ? ? ? D . A 1 1849 PRO 1849 ? ? ? D . A 1 1850 PRO 1850 ? ? ? D . A 1 1851 PRO 1851 ? ? ? D . A 1 1852 PRO 1852 ? ? ? D . A 1 1853 PRO 1853 ? ? ? D . A 1 1854 LYS 1854 ? ? ? D . A 1 1855 ALA 1855 ? ? ? D . A 1 1856 ARG 1856 ? ? ? D . A 1 1857 LYS 1857 ? ? ? D . A 1 1858 SER 1858 ? ? ? D . A 1 1859 GLY 1859 ? ? ? D . A 1 1860 ILE 1860 ? ? ? D . A 1 1861 LEU 1861 ? ? ? D . A 1 1862 SER 1862 ? ? ? D . A 1 1863 SER 1863 ? ? ? D . A 1 1864 GLU 1864 ? ? ? D . A 1 1865 PRO 1865 ? ? ? D . A 1 1866 GLY 1866 ? ? ? D . A 1 1867 SER 1867 ? ? ? D . A 1 1868 GLN 1868 ? ? ? D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Outer membrane protein assembly factor BamD {PDB ID=6so8, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=6so8.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6so8, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 4 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;EVPDNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYYKNADLPLAQAAIDRF IRLNPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYTTDATK RLVFLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVA KIIAANSS ; ;EVPDNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYYKNADLPLAQAAIDRF IRLNPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYTTDATK RLVFLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVA KIIAANSS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 103 200 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6so8 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1868 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1868 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 230.000 12.245 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MARWIPTKRQKYGVAIYNYNASQDVELSLQIGDTVHILEMYEGWYRGYALQNRSKKGIFPETYIHLKEATVEDGGQHETVIPGELPLVQELTNTLREWAVIWRKLYVNNKVTLFRQLQQMTYSLIEWRSQILSGTLPKDELAELKKKVTAKIDHGNRMLGLDLVVRDDNGNILDPDETSTVALFRAHEVASKRIEEKIQEEKSILQNLDLRGQAIFSTVHTYGLYVNFKNFVCNIGEDAELFIALYDPDQSTFISENYLIRWGSNGMPKEIEKLNNLQAVFTDLSSTDLIRPRISLVCQIVRVGRMELKEGKKHTCGLRRPFGVAVMDISDIVHGKVDDEEKQHFIPFQQIAMETYIRQRQLIMSPLITSHVIGENEPLTSVLNKVIAAKEVNHKGQGLWVSLKLLPGDLTQVQKNFSHLVDRSTAIARKMGFPEIILPGDVRNDIYVTLIHGEFDKGKKKTPKNVEVTMSVFDEEGNLLEKAIHPGAGYEGVSEYKSVVYYQVKQPCWYETVKVFIAIEEVTRCHIRFTFRHRSSQESRDKSERAFGVAFVKLMNADGTTLQDGRHDLVVYKGDNKKMEDAKYYLTLPGTKAELEEKELQASKNPSVFTPSKDSTKDSFQIATLICSTKLTQNVDLLGLLNWRSNSQNIKHNLKKLMEVDGGEIVKFLQDTLDALFNIMMEMSDNETYDFLVFDALVFIISLIGDIKFQHFNPVLETYIYKHFSATLAHVKLSKVLNFYVANAEDPSKTELLFAALKALKYLFRFIIQSRVLYLRFYGQSEDGDEFNDSIRQLFLAFNTLMDRPLEEAVKIKGAALKYLPSIINDVKLVFDPMELSVLFCKFIQSIPDNQLVRQKLNCMTKIVESSLFQQAECREVLLPLLTDQLSGQLDDHSTKPDHEASSQLLSNILEVLDRTDVGPTSAHVQLIMERLLRRINRTVIGMSRQSPHIGSFVACMIAVLRQMEDSHYSHYISTFKTRQDIIDFLMETFIMFKDLIGKNVYAKDWMVMNMTQNRVFLRAINQFAEVLTKSFMDQASFELQLWNNYFHLAVAFLTHESLQLETFSEAKRNKIVKKYGDMRKEIGFRIRDMWYNLGPHKIKFIPSMVGPILEVTLTPEVELRKATIPIFFDMMQCEFNLSGNGNFHMFENELITKLDQEVEGGRGDEQYKVLLEKLLLEHCRKHKYLANSGEAFAFLVSSLLENLLDYRTIIIHDESKENRMSCTVNVLNFYKDKKREDIYIRYLYKLRDLHRDCENYTEAAYTLLLHAELLQWSDKPCVPHLLQRDSYYVYTQQELKEKLYQEIISYFDKGKMWEKAIKLSKELAETYESKVFDYEGLGSLLKKRALFYENIIKAMRPQPEYFAVGYYGQGFPSFLRNKIFIYRGKEYERREDFSLRLLTQFPNAEKMTSTTPPGEDIKSSPKQYLQCFTVKPVMSLPPSYKDKPVPEQILNYYRANEVQQFSYSRPFRKGEKDPENEFATMWIERTTYRTAYTFPGILKWFEAKEISVEEISPLENAIETMELTNERVSNCVQQHAWDHSLSVHPLSMLLSGIVDPAVMGGFSNYEKAFFTEKYLQEHPEDQEKVELLKRLIALQIPLLTEGIRIHGEKLTEQLKPLHARLSSCFRELKEKVEKLYGVITLPPSMTERKPSRAGSMVLPYILSSTLRRLSVTSVASSVISTSSNSSDNASSRPGSDGSILEPLFERRASSGARVEDLPPKEDSENRISKFKRKDWNLSKSQVIAEKAPEPDVMSPGKKTQRPKSLQLVDSRLTPFHSPSPLQSTALSPPPLTPKATRTLSSPSLQTDGLTASVPPPPPPKSKPYESSQRNSAEIAPPLPVRRDSKAPPPPPPKARKSGILSSEPGSQ 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYT--TDAT--K-RLVFLKDRLAKYEY-SVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQ----ATRDALPLMENAYRQM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6so8.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . TYR 1245 1245 ? A 185.703 170.575 166.007 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 2 C CA . TYR 1245 1245 ? A 185.944 169.478 167.016 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 3 C C . TYR 1245 1245 ? A 186.707 168.223 166.569 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 4 O O . TYR 1245 1245 ? A 186.708 167.251 167.308 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 5 C CB . TYR 1245 1245 ? A 184.574 169.054 167.634 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 6 C CG . TYR 1245 1245 ? A 183.911 170.187 168.376 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 7 C CD1 . TYR 1245 1245 ? A 184.449 170.645 169.592 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 8 C CD2 . TYR 1245 1245 ? A 182.744 170.793 167.877 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 9 C CE1 . TYR 1245 1245 ? A 183.833 171.691 170.293 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 10 C CE2 . TYR 1245 1245 ? A 182.127 171.839 168.580 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 11 C CZ . TYR 1245 1245 ? A 182.673 172.285 169.789 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 12 O OH . TYR 1245 1245 ? A 182.060 173.322 170.516 1 1 D TYR 0.020 1 ATOM 13 N N . LYS 1246 1246 ? A 187.394 168.208 165.391 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 14 C CA . LYS 1246 1246 ? A 188.351 167.153 165.035 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 15 C C . LYS 1246 1246 ? A 187.733 165.867 164.470 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 16 O O . LYS 1246 1246 ? A 188.239 164.762 164.643 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 17 C CB . LYS 1246 1246 ? A 189.417 166.894 166.141 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 18 C CG . LYS 1246 1246 ? A 190.716 166.211 165.676 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 19 C CD . LYS 1246 1246 ? A 191.601 165.836 166.876 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 20 C CE . LYS 1246 1246 ? A 192.690 164.818 166.530 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 21 N NZ . LYS 1246 1246 ? A 193.454 164.467 167.748 1 1 D LYS 0.080 1 ATOM 22 N N . LEU 1247 1247 ? A 186.633 165.988 163.708 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 23 C CA . LEU 1247 1247 ? A 186.073 164.886 162.954 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 24 C C . LEU 1247 1247 ? A 186.100 165.317 161.498 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 25 O O . LEU 1247 1247 ? A 186.073 166.510 161.197 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 26 C CB . LEU 1247 1247 ? A 184.648 164.503 163.440 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 27 C CG . LEU 1247 1247 ? A 184.598 164.022 164.913 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 28 C CD1 . LEU 1247 1247 ? A 183.152 163.831 165.397 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 29 C CD2 . LEU 1247 1247 ? A 185.395 162.727 165.148 1 1 D LEU 0.070 1 ATOM 30 N N . ARG 1248 1248 ? A 186.232 164.355 160.566 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 31 C CA . ARG 1248 1248 ? A 186.378 164.613 159.146 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 32 C C . ARG 1248 1248 ? A 185.542 163.576 158.432 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 33 O O . ARG 1248 1248 ? A 185.485 162.436 158.887 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 34 C CB . ARG 1248 1248 ? A 187.828 164.383 158.619 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 35 C CG . ARG 1248 1248 ? A 188.947 165.193 159.306 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 36 C CD . ARG 1248 1248 ? A 190.325 165.034 158.633 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 37 N NE . ARG 1248 1248 ? A 190.675 163.578 158.660 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 38 C CZ . ARG 1248 1248 ? A 191.533 162.946 157.852 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 39 N NH1 . ARG 1248 1248 ? A 192.272 163.545 156.930 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 40 N NH2 . ARG 1248 1248 ? A 191.593 161.624 157.915 1 1 D ARG 0.220 1 ATOM 41 N N . ASP 1249 1249 ? A 184.924 163.928 157.287 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 42 C CA . ASP 1249 1249 ? A 184.037 163.039 156.561 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 43 C C . ASP 1249 1249 ? A 184.549 162.722 155.157 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 44 O O . ASP 1249 1249 ? A 183.796 162.595 154.197 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 45 C CB . ASP 1249 1249 ? A 182.597 163.598 156.540 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 46 C CG . ASP 1249 1249 ? A 181.974 163.439 157.920 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 47 O OD1 . ASP 1249 1249 ? A 181.960 162.290 158.447 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 48 O OD2 . ASP 1249 1249 ? A 181.492 164.459 158.461 1 1 D ASP 0.290 1 ATOM 49 N N . LEU 1250 1250 ? A 185.867 162.443 155.028 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 50 C CA . LEU 1250 1250 ? A 186.478 161.941 153.798 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 51 C C . LEU 1250 1250 ? A 186.291 160.427 153.685 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 52 O O . LEU 1250 1250 ? A 186.935 159.727 152.916 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 53 C CB . LEU 1250 1250 ? A 188.003 162.220 153.781 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 54 C CG . LEU 1250 1250 ? A 188.427 163.670 154.087 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 55 C CD1 . LEU 1250 1250 ? A 189.941 163.820 153.867 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 56 C CD2 . LEU 1250 1250 ? A 187.646 164.686 153.247 1 1 D LEU 0.370 1 ATOM 57 N N . HIS 1251 1251 ? A 185.353 159.889 154.479 1 1 D HIS 0.290 1 ATOM 58 C CA . HIS 1251 1251 ? A 185.026 158.490 154.600 1 1 D HIS 0.290 1 ATOM 59 C C . HIS 1251 1251 ? A 183.533 158.376 154.817 1 1 D HIS 0.290 1 ATOM 60 O O . HIS 1251 1251 ? A 183.059 157.728 155.748 1 1 D HIS 0.290 1 ATOM 61 C CB . HIS 1251 1251 ? A 185.835 157.766 155.717 1 1 D HIS 0.290 1 ATOM 62 C CG . HIS 1251 1251 ? A 185.848 158.417 157.078 1 1 D HIS 0.290 1 ATOM 63 N ND1 . HIS 1251 1251 ? A 185.705 157.651 158.228 1 1 D HIS 0.290 1 ATOM 64 C CD2 . HIS 1251 1251 ? A 186.176 159.688 157.418 1 1 D HIS 0.290 1 ATOM 65 C CE1 . HIS 1251 1251 ? A 185.962 158.468 159.228 1 1 D HIS 0.290 1 ATOM 66 N NE2 . HIS 1251 1251 ? 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A 185.639 171.937 136.077 1 1 D HIS 0.460 1 ATOM 197 C CD2 . HIS 1267 1267 ? A 184.708 170.968 134.278 1 1 D HIS 0.460 1 ATOM 198 C CE1 . HIS 1267 1267 ? A 184.342 171.824 136.270 1 1 D HIS 0.460 1 ATOM 199 N NE2 . HIS 1267 1267 ? A 183.725 171.251 135.207 1 1 D HIS 0.460 1 ATOM 200 N N . ALA 1268 1268 ? A 189.951 170.016 133.252 1 1 D ALA 0.500 1 ATOM 201 C CA . ALA 1268 1268 ? A 191.342 170.070 132.820 1 1 D ALA 0.500 1 ATOM 202 C C . ALA 1268 1268 ? A 191.629 169.428 131.463 1 1 D ALA 0.500 1 ATOM 203 O O . ALA 1268 1268 ? A 192.414 169.957 130.679 1 1 D ALA 0.500 1 ATOM 204 C CB . ALA 1268 1268 ? A 192.282 169.479 133.890 1 1 D ALA 0.500 1 ATOM 205 N N . GLU 1269 1269 ? A 191.020 168.269 131.138 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 206 C CA . GLU 1269 1269 ? A 191.179 167.641 129.833 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 207 C C . GLU 1269 1269 ? A 190.609 168.455 128.675 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 208 O O . GLU 1269 1269 ? A 191.270 168.664 127.660 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 209 C CB . GLU 1269 1269 ? A 190.509 166.246 129.818 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 210 C CG . GLU 1269 1269 ? A 191.232 165.200 130.702 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 211 C CD . GLU 1269 1269 ? A 190.541 163.836 130.700 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 212 O OE1 . GLU 1269 1269 ? A 189.427 163.717 130.129 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 213 O OE2 . GLU 1269 1269 ? A 191.143 162.899 131.287 1 1 D GLU 0.560 1 ATOM 214 N N . LEU 1270 1270 ? A 189.365 168.959 128.807 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 215 C CA . LEU 1270 1270 ? A 188.709 169.756 127.786 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 216 C C . LEU 1270 1270 ? A 189.221 171.188 127.716 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 217 O O . LEU 1270 1270 ? A 189.371 171.759 126.637 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 218 C CB . LEU 1270 1270 ? A 187.171 169.779 128.004 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 219 C CG . LEU 1270 1270 ? A 186.490 168.390 127.967 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 220 C CD1 . LEU 1270 1270 ? A 185.035 168.488 128.457 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 221 C CD2 . LEU 1270 1270 ? A 186.549 167.743 126.575 1 1 D LEU 0.510 1 ATOM 222 N N . LEU 1271 1271 ? A 189.482 171.827 128.874 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 223 C CA . LEU 1271 1271 ? A 189.857 173.224 128.930 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 224 C C . LEU 1271 1271 ? A 191.138 173.396 129.727 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 225 O O . LEU 1271 1271 ? A 191.146 173.433 130.950 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 226 C CB . LEU 1271 1271 ? A 188.736 174.061 129.609 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 227 C CG . LEU 1271 1271 ? A 187.384 174.059 128.863 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 228 C CD1 . LEU 1271 1271 ? A 186.262 174.610 129.757 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 229 C CD2 . LEU 1271 1271 ? A 187.459 174.850 127.550 1 1 D LEU 0.440 1 ATOM 230 N N . GLN 1272 1272 ? A 192.278 173.598 129.043 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 231 C CA . GLN 1272 1272 ? A 193.560 173.814 129.700 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 232 C C . GLN 1272 1272 ? A 193.865 175.303 129.817 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 233 O O . GLN 1272 1272 ? A 194.962 175.721 130.177 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 234 C CB . GLN 1272 1272 ? A 194.670 173.098 128.893 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 235 C CG . GLN 1272 1272 ? A 194.480 171.563 128.892 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 236 C CD . GLN 1272 1272 ? A 195.528 170.839 128.051 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 237 O OE1 . GLN 1272 1272 ? A 196.326 171.422 127.319 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 238 N NE2 . GLN 1272 1272 ? A 195.522 169.489 128.152 1 1 D GLN 0.400 1 ATOM 239 N N . TRP 1273 1273 ? A 192.862 176.141 129.506 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 240 C CA . TRP 1273 1273 ? A 192.982 177.575 129.360 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 241 C C . TRP 1273 1273 ? A 192.450 178.339 130.565 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 242 O O . TRP 1273 1273 ? A 191.705 177.825 131.396 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 243 C CB . TRP 1273 1273 ? A 192.238 178.044 128.081 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 244 C CG . TRP 1273 1273 ? A 192.745 177.370 126.812 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 245 C CD1 . TRP 1273 1273 ? A 192.172 176.368 126.075 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 246 C CD2 . TRP 1273 1273 ? A 193.993 177.689 126.178 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 247 N NE1 . TRP 1273 1273 ? A 192.992 176.034 125.020 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 248 C CE2 . TRP 1273 1273 ? A 194.112 176.828 125.053 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 249 C CE3 . TRP 1273 1273 ? A 194.987 178.616 126.476 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 250 C CZ2 . TRP 1273 1273 ? A 195.220 176.900 124.224 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 251 C CZ3 . TRP 1273 1273 ? A 196.105 178.682 125.635 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 252 C CH2 . TRP 1273 1273 ? A 196.221 177.836 124.520 1 1 D TRP 0.280 1 ATOM 253 N N . SER 1274 1274 ? A 192.816 179.634 130.662 1 1 D SER 0.390 1 ATOM 254 C CA . SER 1274 1274 ? A 192.475 180.553 131.745 1 1 D SER 0.390 1 ATOM 255 C C . SER 1274 1274 ? A 190.997 180.852 131.868 1 1 D SER 0.390 1 ATOM 256 O O . SER 1274 1274 ? A 190.509 181.233 132.930 1 1 D SER 0.390 1 ATOM 257 C CB . SER 1274 1274 ? A 193.188 181.913 131.536 1 1 D SER 0.390 1 ATOM 258 O OG . SER 1274 1274 ? A 193.109 182.335 130.168 1 1 D SER 0.390 1 ATOM 259 N N . ASP 1275 1275 ? A 190.254 180.637 130.771 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 260 C CA . ASP 1275 1275 ? A 188.838 180.871 130.591 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 261 C C . ASP 1275 1275 ? A 188.011 179.913 131.437 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 262 O O . ASP 1275 1275 ? A 186.818 180.095 131.676 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 263 C CB . ASP 1275 1275 ? A 188.495 180.680 129.090 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 264 C CG . ASP 1275 1275 ? A 189.345 181.555 128.172 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 265 O OD1 . ASP 1275 1275 ? A 190.192 182.348 128.663 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 266 O OD2 . ASP 1275 1275 ? A 189.181 181.376 126.942 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 267 N N . LYS 1276 1276 ? A 188.667 178.864 131.963 1 1 D LYS 0.370 1 ATOM 268 C CA . LYS 1276 1276 ? A 188.134 178.050 133.016 1 1 D LYS 0.370 1 ATOM 269 C C . LYS 1276 1276 ? A 188.900 178.350 134.319 1 1 D LYS 0.370 1 ATOM 270 O O . LYS 1276 1276 ? A 189.999 177.823 134.500 1 1 D LYS 0.370 1 ATOM 271 C CB . LYS 1276 1276 ? A 188.314 176.584 132.577 1 1 D LYS 0.370 1 ATOM 272 C CG . LYS 1276 1276 ? A 187.617 175.542 133.458 1 1 D LYS 0.370 1 ATOM 273 C CD . LYS 1276 1276 ? A 186.086 175.652 133.398 1 1 D LYS 0.370 1 ATOM 274 C CE . LYS 1276 1276 ? 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A 194.890 129.622 153.954 1 1 D ILE 0.520 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.503 2 1 3 0.013 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1245 TYR 1 0.020 2 1 A 1246 LYS 1 0.080 3 1 A 1247 LEU 1 0.070 4 1 A 1248 ARG 1 0.220 5 1 A 1249 ASP 1 0.290 6 1 A 1250 LEU 1 0.370 7 1 A 1251 HIS 1 0.290 8 1 A 1252 ARG 1 0.270 9 1 A 1253 ASP 1 0.390 10 1 A 1254 CYS 1 0.500 11 1 A 1255 GLU 1 0.440 12 1 A 1256 ASN 1 0.520 13 1 A 1257 TYR 1 0.440 14 1 A 1258 THR 1 0.530 15 1 A 1259 GLU 1 0.540 16 1 A 1260 ALA 1 0.580 17 1 A 1261 ALA 1 0.580 18 1 A 1262 TYR 1 0.530 19 1 A 1263 THR 1 0.590 20 1 A 1264 LEU 1 0.500 21 1 A 1265 LEU 1 0.520 22 1 A 1266 LEU 1 0.550 23 1 A 1267 HIS 1 0.460 24 1 A 1268 ALA 1 0.500 25 1 A 1269 GLU 1 0.560 26 1 A 1270 LEU 1 0.510 27 1 A 1271 LEU 1 0.440 28 1 A 1272 GLN 1 0.400 29 1 A 1273 TRP 1 0.280 30 1 A 1274 SER 1 0.390 31 1 A 1275 ASP 1 0.390 32 1 A 1276 LYS 1 0.370 33 1 A 1277 PRO 1 0.370 34 1 A 1278 CYS 1 0.370 35 1 A 1279 VAL 1 0.360 36 1 A 1280 PRO 1 0.410 37 1 A 1281 HIS 1 0.350 38 1 A 1282 LEU 1 0.400 39 1 A 1283 LEU 1 0.410 40 1 A 1284 GLN 1 0.360 41 1 A 1285 ARG 1 0.360 42 1 A 1286 ASP 1 0.340 43 1 A 1287 SER 1 0.390 44 1 A 1288 TYR 1 0.360 45 1 A 1289 TYR 1 0.370 46 1 A 1290 VAL 1 0.370 47 1 A 1291 TYR 1 0.370 48 1 A 1292 THR 1 0.450 49 1 A 1293 GLN 1 0.440 50 1 A 1294 GLN 1 0.510 51 1 A 1295 GLU 1 0.510 52 1 A 1296 LEU 1 0.470 53 1 A 1297 LYS 1 0.510 54 1 A 1298 GLU 1 0.480 55 1 A 1299 LYS 1 0.550 56 1 A 1300 LEU 1 0.440 57 1 A 1301 TYR 1 0.570 58 1 A 1302 GLN 1 0.500 59 1 A 1303 GLU 1 0.580 60 1 A 1304 ILE 1 0.650 61 1 A 1305 ILE 1 0.630 62 1 A 1306 SER 1 0.580 63 1 A 1307 TYR 1 0.570 64 1 A 1308 PHE 1 0.610 65 1 A 1309 ASP 1 0.630 66 1 A 1310 LYS 1 0.650 67 1 A 1311 GLY 1 0.730 68 1 A 1312 LYS 1 0.640 69 1 A 1313 MET 1 0.640 70 1 A 1314 TRP 1 0.640 71 1 A 1315 GLU 1 0.780 72 1 A 1316 LYS 1 0.680 73 1 A 1317 ALA 1 0.750 74 1 A 1318 ILE 1 0.770 75 1 A 1319 LYS 1 0.720 76 1 A 1320 LEU 1 0.650 77 1 A 1321 SER 1 0.720 78 1 A 1322 LYS 1 0.710 79 1 A 1323 GLU 1 0.610 80 1 A 1324 LEU 1 0.650 81 1 A 1325 ALA 1 0.640 82 1 A 1326 GLU 1 0.500 83 1 A 1327 THR 1 0.470 84 1 A 1328 TYR 1 0.440 85 1 A 1329 GLU 1 0.450 86 1 A 1330 SER 1 0.370 87 1 A 1331 LYS 1 0.410 88 1 A 1332 VAL 1 0.400 89 1 A 1333 PHE 1 0.350 90 1 A 1334 ASP 1 0.370 91 1 A 1335 TYR 1 0.290 92 1 A 1336 GLU 1 0.420 93 1 A 1337 GLY 1 0.490 94 1 A 1338 LEU 1 0.450 95 1 A 1339 GLY 1 0.550 96 1 A 1340 SER 1 0.620 97 1 A 1341 LEU 1 0.580 98 1 A 1342 LEU 1 0.630 99 1 A 1343 LYS 1 0.670 100 1 A 1344 LYS 1 0.640 101 1 A 1345 ARG 1 0.680 102 1 A 1346 ALA 1 0.800 103 1 A 1347 LEU 1 0.780 104 1 A 1348 PHE 1 0.770 105 1 A 1349 TYR 1 0.790 106 1 A 1350 GLU 1 0.790 107 1 A 1351 ASN 1 0.670 108 1 A 1352 ILE 1 0.520 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #