data_SMR-ed6ea9c55c33fa6e08ca4c519321c82d_10 _entry.id SMR-ed6ea9c55c33fa6e08ca4c519321c82d_10 _struct.entry_id SMR-ed6ea9c55c33fa6e08ca4c519321c82d_10 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q6P5H2/ NEST_MOUSE, Nestin Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6P5H2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' UNK 'L-peptide linking' UNKNOWN . . 'CCD local' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 240893.268 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NEST_MOUSE Q6P5H2 1 ;MEGCVGEESFQMWELNRRLEAYLTRVKTLEEQNQLLSAELGGLRAQSGDASWRARADDELAALRVLVDQR WREKHEAEVQRDNLAEELESVAGRCQQVRLARERTIEEAACSRRALEAEKNARGWLSTQAAELERELEAL RASHEEERAHLNAQAACTPRRPPAPAHASPIRAPEVEELARRLGEVWRGAVRDYQERVAHMESSLGQARE RLGQAVRGARESRLEVQQLQADRDSLQERREALEQRLEGRWQDRLQATEKFQLAVEALEQEKQGLQSQIA QILEGGQQLAHLKMSLSLEVATYRTLLEAENSRLQTPGRSSQASLGFPDPKLKLHFLGIPEDQHLGSVLP VLSPTSFSSPLPNTLETPVTAFLKTQEFLKARTPTLASTPIPPMSEAPYPKNAEVRAQDVPHSLLQGGRQ QAPEPLWAEATVPSSTGVLPELEEPGGEQPDHFPDDPTSLAPPLNPHHSILEAKDRESSESRVSSIFQEE EGQIWELVKKEAATEVKVENSLAQEIQESGLDTEEIQDSQGPLQMETLEALGDEPLMSLKTQNHETPGKE NCNSSIEENSGTVKSPEKEKQTPLKSLEEKNVEAEKTLENGVLELSKPLGEEEPRMEDQELMSPEHTLET VSFLGKENQEVVRSSEEQNLESLITFKEESQYPLGGPEAEDQMLERLVEKEDQRFPRSPEEDQQAFRPLE KENQEPLRFEEAEDQVLERLIEKERQESLKSPEEEDQQAFRLLEKENQEPLRFEDAEDQVLERLIEKERQ ESLKSPEEEDQQAFRLLEKENQEPLRFEEAEDQVLERLVEKESQESLKSPEEEDQRTGKPLEKENQESLR SLDENQETIVLLESKNQRPLRSLEVEEEEQRIVKPLEKVSQVSLESLEKENVQSPRYLEEDDHMIKSLLE DKTHEILGSLEDRNGENFIPPENETQGSLRPPEEEDQRIVNHLEKESQEFLRSPEAEEEEEQVMVRSLEG ENHDPLSSVVKEEQMAESKLENESQDSRKSLEDESQETFGSLEKENLESLRSLAGQDQEEQKLEQETQQP LRAVEDEQMTVNPPEKVDPELPKPLRNDQEVVRSLDKENQESLVSLNEGGMETVKSSETENIESLETVGE CLGRRKSVDTQEPLWSTEVTSETIEPLEDETQEPLGCVDENQEVLTPLERESQELRSLGKWNPETVESPG GVEDSQQCLEVEEGPEREQHQESLRSLGEVEWELPGSGSQQRWEDVVEDGEGQEASLGATGVETEDKAEL HLRGQGGEEKAVEEGELLQDAVGEAWSLGSSEPKEQRVPAEPLDDLEGQPEQTGTLEVPVAQGMPEATEQ DEDRAQAGEQDSVEVTLGLEAARAGLELEQEVVGLEDPRHFAREEAIHPSLGEESVKAKIDQGLEEPGKE PKEAGALDSGIPELPKTSSETLECKGWEESGEGWGEEEASLETSDHEGSHAPQPRPPKTEEDEGLQAALT VPGPKLLEPCSPIPILTDAHELQPQAEGIQEAGWQPEAGTEALGRVEDEPEFGRGEIPEGLQDWEEGRED SEADELGETLPDSTPLGLYLKSPASPKWEQAGEQRLFPQGEARKEGWSPAALAAQGLSDPPEEEQQGHDS DLSSEEFEDLGTEASLLPGVPKEVSDHLGQEPPVLQPACWDQGGESDGFADEEESGEEGEEEDADEEEGA ESGTQWWGPGPSGGGVKVQDVTQRGDLEHESVGDSGLWDDGLSGAAANVLVTALETVSQDSAEPSGSEGS ESASLEGEEGQAIDHLDAPQEVTSVVPGAGDTFDISGQGPNLESEQVNGRMENGLEQAEGQVVLHGDEDQ GIPLQEQGTLKAPLVGSPVHLGPSQPLKFTLSGVDGDSWSSGED ; Nestin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1864 1 1864 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NEST_MOUSE Q6P5H2 . 1 1864 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2004-07-05 B9DF21005D977983 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no h ;MEGCVGEESFQMWELNRRLEAYLTRVKTLEEQNQLLSAELGGLRAQSGDASWRARADDELAALRVLVDQR WREKHEAEVQRDNLAEELESVAGRCQQVRLARERTIEEAACSRRALEAEKNARGWLSTQAAELERELEAL RASHEEERAHLNAQAACTPRRPPAPAHASPIRAPEVEELARRLGEVWRGAVRDYQERVAHMESSLGQARE RLGQAVRGARESRLEVQQLQADRDSLQERREALEQRLEGRWQDRLQATEKFQLAVEALEQEKQGLQSQIA QILEGGQQLAHLKMSLSLEVATYRTLLEAENSRLQTPGRSSQASLGFPDPKLKLHFLGIPEDQHLGSVLP VLSPTSFSSPLPNTLETPVTAFLKTQEFLKARTPTLASTPIPPMSEAPYPKNAEVRAQDVPHSLLQGGRQ QAPEPLWAEATVPSSTGVLPELEEPGGEQPDHFPDDPTSLAPPLNPHHSILEAKDRESSESRVSSIFQEE EGQIWELVKKEAATEVKVENSLAQEIQESGLDTEEIQDSQGPLQMETLEALGDEPLMSLKTQNHETPGKE NCNSSIEENSGTVKSPEKEKQTPLKSLEEKNVEAEKTLENGVLELSKPLGEEEPRMEDQELMSPEHTLET 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A 1 1603 GLU 1603 ? ? ? h . A 1 1604 GLU 1604 ? ? ? h . A 1 1605 GLN 1605 ? ? ? h . A 1 1606 GLN 1606 ? ? ? h . A 1 1607 GLY 1607 ? ? ? h . A 1 1608 HIS 1608 ? ? ? h . A 1 1609 ASP 1609 ? ? ? h . A 1 1610 SER 1610 ? ? ? h . A 1 1611 ASP 1611 ? ? ? h . A 1 1612 LEU 1612 ? ? ? h . A 1 1613 SER 1613 ? ? ? h . A 1 1614 SER 1614 ? ? ? h . A 1 1615 GLU 1615 ? ? ? h . A 1 1616 GLU 1616 ? ? ? h . A 1 1617 PHE 1617 ? ? ? h . A 1 1618 GLU 1618 ? ? ? h . A 1 1619 ASP 1619 ? ? ? h . A 1 1620 LEU 1620 ? ? ? h . A 1 1621 GLY 1621 ? ? ? h . A 1 1622 THR 1622 ? ? ? h . A 1 1623 GLU 1623 ? ? ? h . A 1 1624 ALA 1624 ? ? ? h . A 1 1625 SER 1625 ? ? ? h . A 1 1626 LEU 1626 ? ? ? h . A 1 1627 LEU 1627 ? ? ? h . A 1 1628 PRO 1628 ? ? ? h . A 1 1629 GLY 1629 ? ? ? h . A 1 1630 VAL 1630 ? ? ? h . A 1 1631 PRO 1631 ? ? ? h . A 1 1632 LYS 1632 ? ? ? h . A 1 1633 GLU 1633 ? ? ? h . A 1 1634 VAL 1634 ? ? ? h . A 1 1635 SER 1635 ? ? ? h . A 1 1636 ASP 1636 ? ? ? h . A 1 1637 HIS 1637 ? ? ? h . A 1 1638 LEU 1638 ? ? ? h . A 1 1639 GLY 1639 ? ? ? h . A 1 1640 GLN 1640 ? ? ? h . A 1 1641 GLU 1641 ? ? ? h . A 1 1642 PRO 1642 ? ? ? h . A 1 1643 PRO 1643 ? ? ? h . A 1 1644 VAL 1644 ? ? ? h . A 1 1645 LEU 1645 ? ? ? h . A 1 1646 GLN 1646 ? ? ? h . A 1 1647 PRO 1647 ? ? ? h . A 1 1648 ALA 1648 ? ? ? h . A 1 1649 CYS 1649 ? ? ? h . A 1 1650 TRP 1650 ? ? ? h . A 1 1651 ASP 1651 ? ? ? h . A 1 1652 GLN 1652 ? ? ? h . A 1 1653 GLY 1653 ? ? ? h . A 1 1654 GLY 1654 ? ? ? h . A 1 1655 GLU 1655 ? ? ? h . A 1 1656 SER 1656 ? ? ? h . A 1 1657 ASP 1657 ? ? ? h . A 1 1658 GLY 1658 ? ? ? h . A 1 1659 PHE 1659 ? ? ? h . A 1 1660 ALA 1660 ? ? ? h . A 1 1661 ASP 1661 ? ? ? h . A 1 1662 GLU 1662 ? ? ? h . A 1 1663 GLU 1663 ? ? ? h . A 1 1664 GLU 1664 ? ? ? h . A 1 1665 SER 1665 ? ? ? h . A 1 1666 GLY 1666 ? ? ? h . A 1 1667 GLU 1667 ? ? ? h . A 1 1668 GLU 1668 ? ? ? h . A 1 1669 GLY 1669 ? ? ? h . A 1 1670 GLU 1670 ? ? ? h . A 1 1671 GLU 1671 ? ? ? h . A 1 1672 GLU 1672 ? ? ? h . A 1 1673 ASP 1673 ? ? ? h . A 1 1674 ALA 1674 ? ? ? h . A 1 1675 ASP 1675 ? ? ? h . A 1 1676 GLU 1676 ? ? ? h . A 1 1677 GLU 1677 ? ? ? h . A 1 1678 GLU 1678 ? ? ? h . A 1 1679 GLY 1679 ? ? ? h . A 1 1680 ALA 1680 ? ? ? h . A 1 1681 GLU 1681 ? ? ? h . A 1 1682 SER 1682 ? ? ? h . A 1 1683 GLY 1683 ? ? ? h . A 1 1684 THR 1684 ? ? ? h . A 1 1685 GLN 1685 ? ? ? h . A 1 1686 TRP 1686 ? ? ? h . A 1 1687 TRP 1687 ? ? ? h . A 1 1688 GLY 1688 ? ? ? h . A 1 1689 PRO 1689 ? ? ? h . A 1 1690 GLY 1690 ? ? ? h . A 1 1691 PRO 1691 ? ? ? h . A 1 1692 SER 1692 ? ? ? h . A 1 1693 GLY 1693 ? ? ? h . A 1 1694 GLY 1694 ? ? ? h . A 1 1695 GLY 1695 ? ? ? h . A 1 1696 VAL 1696 ? ? ? h . A 1 1697 LYS 1697 ? ? ? h . A 1 1698 VAL 1698 ? ? ? h . A 1 1699 GLN 1699 ? ? ? h . A 1 1700 ASP 1700 ? ? ? h . A 1 1701 VAL 1701 ? ? ? h . A 1 1702 THR 1702 ? ? ? h . A 1 1703 GLN 1703 ? ? ? h . A 1 1704 ARG 1704 ? ? ? h . A 1 1705 GLY 1705 ? ? ? h . A 1 1706 ASP 1706 ? ? ? h . A 1 1707 LEU 1707 ? ? ? h . A 1 1708 GLU 1708 ? ? ? h . A 1 1709 HIS 1709 ? ? ? h . A 1 1710 GLU 1710 ? ? ? h . A 1 1711 SER 1711 ? ? ? h . A 1 1712 VAL 1712 ? ? ? h . A 1 1713 GLY 1713 ? ? ? h . A 1 1714 ASP 1714 ? ? ? h . A 1 1715 SER 1715 ? ? ? h . A 1 1716 GLY 1716 ? ? ? h . A 1 1717 LEU 1717 ? ? ? h . A 1 1718 TRP 1718 ? ? ? h . A 1 1719 ASP 1719 ? ? ? h . A 1 1720 ASP 1720 ? ? ? h . A 1 1721 GLY 1721 ? ? ? h . A 1 1722 LEU 1722 ? ? ? h . A 1 1723 SER 1723 ? ? ? h . A 1 1724 GLY 1724 ? ? ? h . A 1 1725 ALA 1725 ? ? ? h . A 1 1726 ALA 1726 ? ? ? h . A 1 1727 ALA 1727 ? ? ? h . A 1 1728 ASN 1728 ? ? ? h . A 1 1729 VAL 1729 ? ? ? h . A 1 1730 LEU 1730 ? ? ? h . A 1 1731 VAL 1731 ? ? ? h . A 1 1732 THR 1732 ? ? ? h . A 1 1733 ALA 1733 ? ? ? h . A 1 1734 LEU 1734 ? ? ? h . A 1 1735 GLU 1735 ? ? ? h . A 1 1736 THR 1736 ? ? ? h . A 1 1737 VAL 1737 ? ? ? h . A 1 1738 SER 1738 ? ? ? h . A 1 1739 GLN 1739 ? ? ? h . A 1 1740 ASP 1740 ? ? ? h . A 1 1741 SER 1741 ? ? ? h . A 1 1742 ALA 1742 ? ? ? h . A 1 1743 GLU 1743 ? ? ? h . A 1 1744 PRO 1744 ? ? ? h . A 1 1745 SER 1745 ? ? ? h . A 1 1746 GLY 1746 ? ? ? h . A 1 1747 SER 1747 ? ? ? h . A 1 1748 GLU 1748 ? ? ? h . A 1 1749 GLY 1749 ? ? ? h . A 1 1750 SER 1750 ? ? ? h . A 1 1751 GLU 1751 ? ? ? h . A 1 1752 SER 1752 ? ? ? h . A 1 1753 ALA 1753 ? ? ? h . A 1 1754 SER 1754 ? ? ? h . A 1 1755 LEU 1755 ? ? ? h . A 1 1756 GLU 1756 ? ? ? h . A 1 1757 GLY 1757 ? ? ? h . A 1 1758 GLU 1758 ? ? ? h . A 1 1759 GLU 1759 ? ? ? h . A 1 1760 GLY 1760 ? ? ? h . A 1 1761 GLN 1761 ? ? ? h . A 1 1762 ALA 1762 ? ? ? h . A 1 1763 ILE 1763 ? ? ? h . A 1 1764 ASP 1764 ? ? ? h . A 1 1765 HIS 1765 ? ? ? h . A 1 1766 LEU 1766 ? ? ? h . A 1 1767 ASP 1767 ? ? ? h . A 1 1768 ALA 1768 ? ? ? h . A 1 1769 PRO 1769 ? ? ? h . A 1 1770 GLN 1770 ? ? ? h . A 1 1771 GLU 1771 ? ? ? h . A 1 1772 VAL 1772 ? ? ? h . A 1 1773 THR 1773 ? ? ? h . A 1 1774 SER 1774 ? ? ? h . A 1 1775 VAL 1775 ? ? ? h . A 1 1776 VAL 1776 ? ? ? h . A 1 1777 PRO 1777 ? ? ? h . A 1 1778 GLY 1778 ? ? ? h . A 1 1779 ALA 1779 ? ? ? h . A 1 1780 GLY 1780 ? ? ? h . A 1 1781 ASP 1781 ? ? ? h . A 1 1782 THR 1782 ? ? ? h . A 1 1783 PHE 1783 ? ? ? h . A 1 1784 ASP 1784 ? ? ? h . A 1 1785 ILE 1785 ? ? ? h . A 1 1786 SER 1786 ? ? ? h . A 1 1787 GLY 1787 ? ? ? h . A 1 1788 GLN 1788 ? ? ? h . A 1 1789 GLY 1789 ? ? ? h . A 1 1790 PRO 1790 ? ? ? h . A 1 1791 ASN 1791 ? ? ? h . A 1 1792 LEU 1792 ? ? ? h . A 1 1793 GLU 1793 ? ? ? h . A 1 1794 SER 1794 ? ? ? h . A 1 1795 GLU 1795 ? ? ? h . A 1 1796 GLN 1796 ? ? ? h . A 1 1797 VAL 1797 ? ? ? h . A 1 1798 ASN 1798 ? ? ? h . A 1 1799 GLY 1799 ? ? ? h . A 1 1800 ARG 1800 ? ? ? h . A 1 1801 MET 1801 ? ? ? h . A 1 1802 GLU 1802 ? ? ? h . A 1 1803 ASN 1803 ? ? ? h . A 1 1804 GLY 1804 ? ? ? h . A 1 1805 LEU 1805 ? ? ? h . A 1 1806 GLU 1806 ? ? ? h . A 1 1807 GLN 1807 ? ? ? h . A 1 1808 ALA 1808 ? ? ? h . A 1 1809 GLU 1809 ? ? ? h . A 1 1810 GLY 1810 ? ? ? h . A 1 1811 GLN 1811 ? ? ? h . A 1 1812 VAL 1812 ? ? ? h . A 1 1813 VAL 1813 ? ? ? h . A 1 1814 LEU 1814 ? ? ? h . A 1 1815 HIS 1815 ? ? ? h . A 1 1816 GLY 1816 ? ? ? h . A 1 1817 ASP 1817 ? ? ? h . A 1 1818 GLU 1818 ? ? ? h . A 1 1819 ASP 1819 ? ? ? h . A 1 1820 GLN 1820 ? ? ? h . A 1 1821 GLY 1821 ? ? ? h . A 1 1822 ILE 1822 ? ? ? h . A 1 1823 PRO 1823 ? ? ? h . A 1 1824 LEU 1824 ? ? ? h . A 1 1825 GLN 1825 ? ? ? h . A 1 1826 GLU 1826 ? ? ? h . A 1 1827 GLN 1827 ? ? ? h . A 1 1828 GLY 1828 ? ? ? h . A 1 1829 THR 1829 ? ? ? h . A 1 1830 LEU 1830 ? ? ? h . A 1 1831 LYS 1831 ? ? ? h . A 1 1832 ALA 1832 ? ? ? h . A 1 1833 PRO 1833 ? ? ? h . A 1 1834 LEU 1834 ? ? ? h . A 1 1835 VAL 1835 ? ? ? h . A 1 1836 GLY 1836 ? ? ? h . A 1 1837 SER 1837 ? ? ? h . A 1 1838 PRO 1838 ? ? ? h . A 1 1839 VAL 1839 ? ? ? h . A 1 1840 HIS 1840 ? ? ? h . A 1 1841 LEU 1841 ? ? ? h . A 1 1842 GLY 1842 ? ? ? h . A 1 1843 PRO 1843 ? ? ? h . A 1 1844 SER 1844 ? ? ? h . A 1 1845 GLN 1845 ? ? ? h . A 1 1846 PRO 1846 ? ? ? h . A 1 1847 LEU 1847 ? ? ? h . A 1 1848 LYS 1848 ? ? ? h . A 1 1849 PHE 1849 ? ? ? h . A 1 1850 THR 1850 ? ? ? h . A 1 1851 LEU 1851 ? ? ? h . A 1 1852 SER 1852 ? ? ? h . A 1 1853 GLY 1853 ? ? ? h . A 1 1854 VAL 1854 ? ? ? h . A 1 1855 ASP 1855 ? ? ? h . A 1 1856 GLY 1856 ? ? ? h . A 1 1857 ASP 1857 ? ? ? h . A 1 1858 SER 1858 ? ? ? h . A 1 1859 TRP 1859 ? ? ? h . A 1 1860 SER 1860 ? ? ? h . A 1 1861 SER 1861 ? ? ? h . A 1 1862 GLY 1862 ? ? ? h . A 1 1863 GLU 1863 ? ? ? h . A 1 1864 ASP 1864 ? ? ? h . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'BICD family-like cargo adapter 1,BICD family-like cargo adapter 1,BICD family-like cargo adapter 1 {PDB ID=6f1t, label_asym_id=RA, auth_asym_id=x, SMTL ID=6f1t.1.h}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6f1t, label_asym_id=RA' 'target-template alignment' . 4 'model 10' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A RA 23 1 x # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSAFCLGLAGRASAPAEPDSACCMELPAGAGDAVRSPATAAALVSFPGGPGELELALEEELALLAAGERS SEPGEHPQAEPESPVEGHGPPLPPPPTQDPELLSVIRQKEKDLVLAARLGKALLERNQDMSRQYEQMHKE LTDKLEHLEQEKHELRRRFENREGEWEGRVSELETDVKQLQDELERQQLHLREADREKTRAVQELSEQNQ RLLDQLSRASEVERQLSMQVHALKEDFREKNSSTNQHIIRLESLQAEIKMLSDRKRELEHRLSATLEEND LLQGTVEELQDRVLILERQGHDKDLQLHQSQLELQEVRLSYRQLQ(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;MSAFCLGLAGRASAPAEPDSACCMELPAGAGDAVRSPATAAALVSFPGGPGELELALEEELALLAAGERS SEPGEHPQAEPESPVEGHGPPLPPPPTQDPELLSVIRQKEKDLVLAARLGKALLERNQDMSRQYEQMHKE LTDKLEHLEQEKHELRRRFENREGEWEGRVSELETDVKQLQDELERQQLHLREADREKTRAVQELSEQNQ RLLDQLSRASEVERQLSMQVHALKEDFREKNSSTNQHIIRLESLQAEIKMLSDRKRELEHRLSATLEEND LLQGTVEELQDRVLILERQGHDKDLQLHQSQLELQEVRLSYRQLQXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 126 262 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6f1t 2024-05-15 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1864 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1872 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4.000 11.628 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEGCVGEESFQMWELNRRLEAYL-TRVKTLEEQNQLLSAELGGLRAQSGDASWRARADDELAALRVLVD-------QRWREKHEAEVQRDNLAEELESVAGRCQQVRLARERTIEEAACSRRALEAEKNARGWLSTQAAELERELEALRASHEEERAHLNAQAACTPRRPPAPAHASPIRAPEVEELARRLGEVWRGAVRDYQERVAHMESSLGQARERLGQAVRGARESRLEVQQLQADRDSLQERREALEQRLEGRWQDRLQATEKFQLAVEALEQEKQGLQSQIAQILEGGQQLAHLKMSLSLEVATYRTLLEAENSRLQTPGRSSQASLGFPDPKLKLHFLGIPEDQHLGSVLPVLSPTSFSSPLPNTLETPVTAFLKTQEFLKARTPTLASTPIPPMSEAPYPKNAEVRAQDVPHSLLQGGRQQAPEPLWAEATVPSSTGVLPELEEPGGEQPDHFPDDPTSLAPPLNPHHSILEAKDRESSESRVSSIFQEEEGQIWELVKKEAATEVKVENSLAQEIQESGLDTEEIQDSQGPLQMETLEALGDEPLMSLKTQNHETPGKENCNSSIEENSGTVKSPEKEKQTPLKSLEEKNVEAEKTLENGVLELSKPLGEEEPRMEDQELMSPEHTLETVSFLGKENQEVVRSSEEQNLESLITFKEESQYPLGGPEAEDQMLERLVEKEDQRFPRSPEEDQQAFRPLEKENQEPLRFEEAEDQVLERLIEKERQESLKSPEEEDQQAFRLLEKENQEPLRFEDAEDQVLERLIEKERQESLKSPEEEDQQAFRLLEKENQEPLRFEEAEDQVLERLVEKESQESLKSPEEEDQRTGKPLEKENQESLRSLDENQETIVLLESKNQRPLRSLEVEEEEQRIVKPLEKVSQVSLESLEKENVQSPRYLEEDDHMIKSLLEDKTHEILGSLEDRNGENFIPPENETQGSLRPPEEEDQRIVNHLEKESQEFLRSPEAEEEEEQVMVRSLEGENHDPLSSVVKEEQMAESKLENESQDSRKSLEDESQETFGSLEKENLESLRSLAGQDQEEQKLEQETQQPLRAVEDEQMTVNPPEKVDPELPKPLRNDQEVVRSLDKENQESLVSLNEGGMETVKSSETENIESLETVGECLGRRKSVDTQEPLWSTEVTSETIEPLEDETQEPLGCVDENQEVLTPLERESQELRSLGKWNPETVESPGGVEDSQQCLEVEEGPEREQHQESLRSLGEVEWELPGSGSQQRWEDVVEDGEGQEASLGATGVETEDKAELHLRGQGGEEKAVEEGELLQDAVGEAWSLGSSEPKEQRVPAEPLDDLEGQPEQTGTLEVPVAQGMPEATEQDEDRAQAGEQDSVEVTLGLEAARAGLELEQEVVGLEDPRHFAREEAIHPSLGEESVKAKIDQGLEEPGKEPKEAGALDSGIPELPKTSSETLECKGWEESGEGWGEEEASLETSDHEGSHAPQPRPPKTEEDEGLQAALTVPGPKLLEPCSPIPILTDAHELQPQAEGIQEAGWQPEAGTEALGRVEDEPEFGRGEIPEGLQDWEEGREDSEADELGETLPDSTPLGLYLKSPASPKWEQAGEQRLFPQGEARKEGWSPAALAAQGLSDPPEEEQQGHDSDLSSEEFEDLGTEASLLPGVPKEVSDHLGQEPPVLQPACWDQGGESDGFADEEESGEEGEEEDADEEEGAESGTQWWGPGPSGGGVKVQDVTQRGDLEHESVGDSGLWDDGLSGAAANVLVTALETVSQDSAEPSGSEGSESASLEGEEGQAIDHLDAPQEVTSVVPGAGDTFDISGQGPNLESEQVNGRMENGLEQAEGQVVLHGDEDQGIPLQEQGTLKAPLVGSPVHLGPSQPLKFTLSGVDGDSWSSGED 2 1 2 -------RNQDMSRQYEQMHKELTDKLEHLEQEKHELRRRFENREGEWE--GRVSELETDVKQLQDELERQQLHLREADREKTRA---VQELSEQNQRLLDQLSRASEVERQLSMQVHALKEDFREKNSSTNQHIIRLESLQAEIKMLS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6f1t.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 10' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 8 8 ? A 351.496 368.168 480.821 1 1 h GLU 0.390 1 ATOM 2 C CA . GLU 8 8 ? A 351.207 367.971 479.363 1 1 h GLU 0.390 1 ATOM 3 C C . GLU 8 8 ? A 351.838 368.997 478.450 1 1 h GLU 0.390 1 ATOM 4 O O . GLU 8 8 ? A 352.720 368.657 477.669 1 1 h GLU 0.390 1 ATOM 5 C CB . GLU 8 8 ? A 349.687 367.948 479.214 1 1 h GLU 0.390 1 ATOM 6 C CG . GLU 8 8 ? A 349.215 367.544 477.802 1 1 h GLU 0.390 1 ATOM 7 C CD . GLU 8 8 ? A 347.694 367.445 477.774 1 1 h GLU 0.390 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 8 8 ? A 347.081 367.716 478.838 1 1 h GLU 0.390 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 8 8 ? A 347.165 367.098 476.695 1 1 h GLU 0.390 1 ATOM 10 N N . SER 9 9 ? A 351.491 370.296 478.598 1 1 h SER 0.560 1 ATOM 11 C CA . SER 9 9 ? A 352.105 371.406 477.869 1 1 h SER 0.560 1 ATOM 12 C C . SER 9 9 ? A 353.620 371.469 477.974 1 1 h SER 0.560 1 ATOM 13 O O . SER 9 9 ? A 354.296 371.762 476.999 1 1 h SER 0.560 1 ATOM 14 C CB . SER 9 9 ? A 351.532 372.774 478.312 1 1 h SER 0.560 1 ATOM 15 O OG . SER 9 9 ? A 351.667 372.946 479.727 1 1 h SER 0.560 1 ATOM 16 N N . PHE 10 10 ? A 354.209 371.121 479.135 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 17 C CA . PHE 10 10 ? A 355.647 370.924 479.257 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 18 C C . PHE 10 10 ? A 356.235 369.867 478.305 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 19 O O . PHE 10 10 ? A 357.227 370.128 477.640 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 20 C CB . PHE 10 10 ? A 355.992 370.548 480.726 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 21 C CG . PHE 10 10 ? A 357.482 370.469 480.945 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 22 C CD1 . PHE 10 10 ? A 358.141 369.227 480.923 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 23 C CD2 . PHE 10 10 ? A 358.238 371.639 481.111 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 24 C CE1 . PHE 10 10 ? A 359.533 369.157 481.047 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 25 C CE2 . PHE 10 10 ? A 359.631 371.573 481.244 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 26 C CZ . PHE 10 10 ? A 360.279 370.331 481.205 1 1 h PHE 0.470 1 ATOM 27 N N . GLN 11 11 ? A 355.621 368.670 478.171 1 1 h GLN 0.530 1 ATOM 28 C CA . GLN 11 11 ? A 356.062 367.644 477.232 1 1 h GLN 0.530 1 ATOM 29 C C . GLN 11 11 ? A 355.904 368.093 475.791 1 1 h GLN 0.530 1 ATOM 30 O O . GLN 11 11 ? A 356.758 367.849 474.941 1 1 h GLN 0.530 1 ATOM 31 C CB . GLN 11 11 ? A 355.282 366.320 477.435 1 1 h GLN 0.530 1 ATOM 32 C CG . GLN 11 11 ? A 355.781 365.133 476.569 1 1 h GLN 0.530 1 ATOM 33 C CD . GLN 11 11 ? A 357.157 364.662 477.042 1 1 h GLN 0.530 1 ATOM 34 O OE1 . GLN 11 11 ? A 357.269 364.191 478.176 1 1 h GLN 0.530 1 ATOM 35 N NE2 . GLN 11 11 ? A 358.189 364.787 476.184 1 1 h GLN 0.530 1 ATOM 36 N N . MET 12 12 ? A 354.805 368.818 475.491 1 1 h MET 0.500 1 ATOM 37 C CA . MET 12 12 ? A 354.626 369.475 474.210 1 1 h MET 0.500 1 ATOM 38 C C . MET 12 12 ? A 355.733 370.483 473.936 1 1 h MET 0.500 1 ATOM 39 O O . MET 12 12 ? A 356.348 370.456 472.881 1 1 h MET 0.500 1 ATOM 40 C CB . MET 12 12 ? A 353.268 370.218 474.146 1 1 h MET 0.500 1 ATOM 41 C CG . MET 12 12 ? A 352.030 369.306 474.241 1 1 h MET 0.500 1 ATOM 42 S SD . MET 12 12 ? A 350.472 370.220 474.470 1 1 h MET 0.500 1 ATOM 43 C CE . MET 12 12 ? A 350.419 371.026 472.843 1 1 h MET 0.500 1 ATOM 44 N N . TRP 13 13 ? A 356.076 371.355 474.901 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 45 C CA . TRP 13 13 ? A 357.174 372.299 474.802 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 46 C C . TRP 13 13 ? A 358.548 371.650 474.711 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 47 O O . TRP 13 13 ? A 359.406 372.116 473.962 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 48 C CB . TRP 13 13 ? A 357.114 373.337 475.947 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 49 C CG . TRP 13 13 ? A 355.920 374.283 475.874 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 50 C CD1 . TRP 13 13 ? A 355.042 374.493 474.843 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 51 C CD2 . TRP 13 13 ? A 355.526 375.180 476.926 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 52 N NE1 . TRP 13 13 ? A 354.144 375.482 475.171 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 53 C CE2 . TRP 13 13 ? A 354.418 375.917 476.444 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 54 C CE3 . TRP 13 13 ? A 356.032 375.399 478.205 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 55 C CZ2 . TRP 13 13 ? A 353.810 376.883 477.228 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 56 C CZ3 . TRP 13 13 ? A 355.403 376.368 479.003 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 57 C CH2 . TRP 13 13 ? A 354.308 377.103 478.520 1 1 h TRP 0.440 1 ATOM 58 N N . GLU 14 14 ? A 358.787 370.533 475.430 1 1 h GLU 0.590 1 ATOM 59 C CA . GLU 14 14 ? A 359.978 369.723 475.255 1 1 h GLU 0.590 1 ATOM 60 C C . GLU 14 14 ? A 360.097 369.186 473.837 1 1 h GLU 0.590 1 ATOM 61 O O . GLU 14 14 ? A 361.116 369.366 473.168 1 1 h GLU 0.590 1 ATOM 62 C CB . GLU 14 14 ? A 360.010 368.510 476.219 1 1 h GLU 0.590 1 ATOM 63 C CG . GLU 14 14 ? A 361.331 367.713 476.090 1 1 h GLU 0.590 1 ATOM 64 C CD . GLU 14 14 ? A 361.309 366.350 476.758 1 1 h GLU 0.590 1 ATOM 65 O OE1 . GLU 14 14 ? A 360.400 366.046 477.556 1 1 h GLU 0.590 1 ATOM 66 O OE2 . GLU 14 14 ? A 362.216 365.562 476.374 1 1 h GLU 0.590 1 ATOM 67 N N . LEU 15 15 ? A 359.024 368.571 473.302 1 1 h LEU 0.600 1 ATOM 68 C CA . LEU 15 15 ? A 358.986 368.120 471.927 1 1 h LEU 0.600 1 ATOM 69 C C . LEU 15 15 ? A 359.087 369.262 470.928 1 1 h LEU 0.600 1 ATOM 70 O O . LEU 15 15 ? A 359.783 369.132 469.929 1 1 h LEU 0.600 1 ATOM 71 C CB . LEU 15 15 ? 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A 363.046 371.497 470.542 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 86 O O . ARG 17 17 ? A 364.008 371.801 469.840 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 87 C CB . ARG 17 17 ? A 362.821 372.872 472.630 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 88 C CG . ARG 17 17 ? A 362.286 374.187 473.229 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 89 C CD . ARG 17 17 ? A 362.983 374.517 474.544 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 90 N NE . ARG 17 17 ? A 362.437 375.812 475.049 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 91 C CZ . ARG 17 17 ? A 362.716 376.305 476.262 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 92 N NH1 . ARG 17 17 ? A 363.506 375.649 477.110 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 93 N NH2 . ARG 17 17 ? A 362.197 377.470 476.634 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 94 N N . ARG 18 18 ? A 362.695 370.202 470.669 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 95 C CA . ARG 18 18 ? A 363.286 369.164 469.840 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 96 C C . ARG 18 18 ? A 362.970 369.358 468.356 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 97 O O . ARG 18 18 ? A 363.855 369.262 467.513 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 98 C CB . ARG 18 18 ? A 362.842 367.753 470.303 1 1 h ARG 0.570 1 ATOM 99 C CG . ARG 18 18 ? 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ARG 44 44 ? A 385.704 378.503 436.583 1 1 h ARG 0.500 1 ATOM 303 O O . ARG 44 44 ? A 386.137 379.043 435.565 1 1 h ARG 0.500 1 ATOM 304 C CB . ARG 44 44 ? A 383.366 379.135 437.194 1 1 h ARG 0.500 1 ATOM 305 C CG . ARG 44 44 ? A 381.867 378.905 436.920 1 1 h ARG 0.500 1 ATOM 306 C CD . ARG 44 44 ? A 381.034 379.989 437.600 1 1 h ARG 0.500 1 ATOM 307 N NE . ARG 44 44 ? A 379.589 379.694 437.366 1 1 h ARG 0.500 1 ATOM 308 C CZ . ARG 44 44 ? A 378.602 380.422 437.906 1 1 h ARG 0.500 1 ATOM 309 N NH1 . ARG 44 44 ? A 378.860 381.463 438.692 1 1 h ARG 0.500 1 ATOM 310 N NH2 . ARG 44 44 ? A 377.338 380.100 437.650 1 1 h ARG 0.500 1 ATOM 311 N N . ALA 45 45 ? A 386.518 378.308 437.633 1 1 h ALA 0.530 1 ATOM 312 C CA . ALA 45 45 ? A 387.939 378.551 437.558 1 1 h ALA 0.530 1 ATOM 313 C C . ALA 45 45 ? A 388.620 377.680 436.527 1 1 h ALA 0.530 1 ATOM 314 O O . ALA 45 45 ? A 389.427 378.171 435.765 1 1 h ALA 0.530 1 ATOM 315 C CB . ALA 45 45 ? 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SER 47 47 ? A 384.983 376.801 432.457 1 1 h SER 0.570 1 ATOM 330 O OG . SER 47 47 ? A 384.369 377.842 433.219 1 1 h SER 0.570 1 ATOM 331 N N . GLY 48 48 ? A 387.496 379.064 432.938 1 1 h GLY 0.630 1 ATOM 332 C CA . GLY 48 48 ? A 387.684 380.495 432.718 1 1 h GLY 0.630 1 ATOM 333 C C . GLY 48 48 ? A 389.033 381.002 432.283 1 1 h GLY 0.630 1 ATOM 334 O O . GLY 48 48 ? A 389.842 380.326 431.643 1 1 h GLY 0.630 1 ATOM 335 N N . ASP 49 49 ? A 389.306 382.265 432.661 1 1 h ASP 0.560 1 ATOM 336 C CA . ASP 49 49 ? A 390.326 383.110 432.077 1 1 h ASP 0.560 1 ATOM 337 C C . ASP 49 49 ? A 391.728 382.872 432.657 1 1 h ASP 0.560 1 ATOM 338 O O . ASP 49 49 ? A 392.670 383.609 432.393 1 1 h ASP 0.560 1 ATOM 339 C CB . ASP 49 49 ? A 389.970 384.597 432.314 1 1 h ASP 0.560 1 ATOM 340 C CG . ASP 49 49 ? A 388.613 385.010 431.755 1 1 h ASP 0.560 1 ATOM 341 O OD1 . ASP 49 49 ? A 387.878 384.168 431.172 1 1 h ASP 0.560 1 ATOM 342 O OD2 . ASP 49 49 ? A 388.277 386.202 431.961 1 1 h ASP 0.560 1 ATOM 343 N N . ALA 50 50 ? A 391.920 381.775 433.413 1 1 h ALA 0.600 1 ATOM 344 C CA . ALA 50 50 ? A 393.246 381.275 433.732 1 1 h ALA 0.600 1 ATOM 345 C C . ALA 50 50 ? A 393.324 379.775 433.507 1 1 h ALA 0.600 1 ATOM 346 O O . ALA 50 50 ? A 394.236 379.099 433.975 1 1 h ALA 0.600 1 ATOM 347 C CB . ALA 50 50 ? A 393.646 381.653 435.169 1 1 h ALA 0.600 1 ATOM 348 N N . SER 51 51 ? A 392.359 379.232 432.741 1 1 h SER 0.540 1 ATOM 349 C CA . SER 51 51 ? A 392.244 377.799 432.519 1 1 h SER 0.540 1 ATOM 350 C C . SER 51 51 ? A 391.902 377.480 431.076 1 1 h SER 0.540 1 ATOM 351 O O . SER 51 51 ? A 392.619 377.888 430.167 1 1 h SER 0.540 1 ATOM 352 C CB . SER 51 51 ? A 391.220 377.138 433.431 1 1 h SER 0.540 1 ATOM 353 O OG . SER 51 51 ? A 391.629 377.249 434.785 1 1 h SER 0.540 1 ATOM 354 N N . TRP 52 52 ? A 390.816 376.705 430.793 1 1 h TRP 0.510 1 ATOM 355 C CA . TRP 52 52 ? A 390.530 376.214 429.450 1 1 h TRP 0.510 1 ATOM 356 C C . TRP 52 52 ? 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ALA 54 54 ? A 392.988 381.672 429.791 1 1 h ALA 0.610 1 ATOM 384 N N . ARG 55 55 ? A 393.655 379.380 427.820 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 385 C CA . ARG 55 55 ? A 394.558 378.589 427.006 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 386 C C . ARG 55 55 ? A 394.178 378.648 425.534 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 387 O O . ARG 55 55 ? A 395.010 378.921 424.678 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 388 C CB . ARG 55 55 ? A 394.539 377.112 427.483 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 389 C CG . ARG 55 55 ? A 395.405 376.163 426.626 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 390 C CD . ARG 55 55 ? A 395.257 374.668 426.934 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 391 N NE . ARG 55 55 ? A 393.823 374.280 426.704 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 392 C CZ . ARG 55 55 ? A 393.324 373.956 425.503 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 393 N NH1 . ARG 55 55 ? A 394.076 373.843 424.417 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 394 N NH2 . ARG 55 55 ? A 392.018 373.711 425.387 1 1 h ARG 0.550 1 ATOM 395 N N . ALA 56 56 ? A 392.884 378.469 425.215 1 1 h ALA 0.630 1 ATOM 396 C CA . ALA 56 56 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.526 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 8 GLU 1 0.390 2 1 A 9 SER 1 0.560 3 1 A 10 PHE 1 0.470 4 1 A 11 GLN 1 0.530 5 1 A 12 MET 1 0.500 6 1 A 13 TRP 1 0.440 7 1 A 14 GLU 1 0.590 8 1 A 15 LEU 1 0.600 9 1 A 16 ASN 1 0.610 10 1 A 17 ARG 1 0.570 11 1 A 18 ARG 1 0.570 12 1 A 19 LEU 1 0.570 13 1 A 20 GLU 1 0.550 14 1 A 21 ALA 1 0.570 15 1 A 22 TYR 1 0.490 16 1 A 23 LEU 1 0.500 17 1 A 24 THR 1 0.520 18 1 A 25 ARG 1 0.480 19 1 A 26 VAL 1 0.470 20 1 A 27 LYS 1 0.500 21 1 A 28 THR 1 0.480 22 1 A 29 LEU 1 0.500 23 1 A 30 GLU 1 0.510 24 1 A 31 GLU 1 0.510 25 1 A 32 GLN 1 0.500 26 1 A 33 ASN 1 0.540 27 1 A 34 GLN 1 0.510 28 1 A 35 LEU 1 0.520 29 1 A 36 LEU 1 0.520 30 1 A 37 SER 1 0.530 31 1 A 38 ALA 1 0.570 32 1 A 39 GLU 1 0.530 33 1 A 40 LEU 1 0.530 34 1 A 41 GLY 1 0.530 35 1 A 42 GLY 1 0.540 36 1 A 43 LEU 1 0.510 37 1 A 44 ARG 1 0.500 38 1 A 45 ALA 1 0.530 39 1 A 46 GLN 1 0.550 40 1 A 47 SER 1 0.570 41 1 A 48 GLY 1 0.630 42 1 A 49 ASP 1 0.560 43 1 A 50 ALA 1 0.600 44 1 A 51 SER 1 0.540 45 1 A 52 TRP 1 0.510 46 1 A 53 ARG 1 0.540 47 1 A 54 ALA 1 0.610 48 1 A 55 ARG 1 0.550 49 1 A 56 ALA 1 0.630 50 1 A 57 ASP 1 0.570 51 1 A 58 ASP 1 0.500 52 1 A 59 GLU 1 0.450 53 1 A 60 LEU 1 0.530 54 1 A 61 ALA 1 0.490 55 1 A 62 ALA 1 0.480 56 1 A 63 LEU 1 0.410 57 1 A 64 ARG 1 0.170 58 1 A 65 VAL 1 0.220 59 1 A 66 LEU 1 0.180 60 1 A 67 VAL 1 0.210 61 1 A 68 ASP 1 0.360 62 1 A 69 GLN 1 0.440 63 1 A 70 ARG 1 0.440 64 1 A 71 TRP 1 0.280 65 1 A 72 ARG 1 0.490 66 1 A 73 GLU 1 0.490 67 1 A 74 LYS 1 0.520 68 1 A 75 HIS 1 0.450 69 1 A 76 GLU 1 0.420 70 1 A 77 ALA 1 0.500 71 1 A 78 GLU 1 0.460 72 1 A 79 VAL 1 0.440 73 1 A 80 GLN 1 0.420 74 1 A 81 ARG 1 0.320 75 1 A 82 ASP 1 0.490 76 1 A 83 ASN 1 0.540 77 1 A 84 LEU 1 0.570 78 1 A 85 ALA 1 0.610 79 1 A 86 GLU 1 0.570 80 1 A 87 GLU 1 0.640 81 1 A 88 LEU 1 0.670 82 1 A 89 GLU 1 0.550 83 1 A 90 SER 1 0.560 84 1 A 91 VAL 1 0.620 85 1 A 92 ALA 1 0.610 86 1 A 93 GLY 1 0.640 87 1 A 94 ARG 1 0.530 88 1 A 95 CYS 1 0.620 89 1 A 96 GLN 1 0.580 90 1 A 97 GLN 1 0.620 91 1 A 98 VAL 1 0.670 92 1 A 99 ARG 1 0.570 93 1 A 100 LEU 1 0.620 94 1 A 101 ALA 1 0.690 95 1 A 102 ARG 1 0.580 96 1 A 103 GLU 1 0.640 97 1 A 104 ARG 1 0.570 98 1 A 105 THR 1 0.640 99 1 A 106 ILE 1 0.640 100 1 A 107 GLU 1 0.610 101 1 A 108 GLU 1 0.540 102 1 A 109 ALA 1 0.650 103 1 A 110 ALA 1 0.630 104 1 A 111 CYS 1 0.550 105 1 A 112 SER 1 0.540 106 1 A 113 ARG 1 0.450 107 1 A 114 ARG 1 0.500 108 1 A 115 ALA 1 0.550 109 1 A 116 LEU 1 0.520 110 1 A 117 GLU 1 0.530 111 1 A 118 ALA 1 0.580 112 1 A 119 GLU 1 0.540 113 1 A 120 LYS 1 0.550 114 1 A 121 ASN 1 0.540 115 1 A 122 ALA 1 0.590 116 1 A 123 ARG 1 0.510 117 1 A 124 GLY 1 0.610 118 1 A 125 TRP 1 0.460 119 1 A 126 LEU 1 0.530 120 1 A 127 SER 1 0.570 121 1 A 128 THR 1 0.580 122 1 A 129 GLN 1 0.550 123 1 A 130 ALA 1 0.620 124 1 A 131 ALA 1 0.610 125 1 A 132 GLU 1 0.550 126 1 A 133 LEU 1 0.570 127 1 A 134 GLU 1 0.540 128 1 A 135 ARG 1 0.510 129 1 A 136 GLU 1 0.490 130 1 A 137 LEU 1 0.440 131 1 A 138 GLU 1 0.440 132 1 A 139 ALA 1 0.430 133 1 A 140 LEU 1 0.640 134 1 A 141 ARG 1 0.540 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #