data_SMR-ed6ea9c55c33fa6e08ca4c519321c82d_9 _entry.id SMR-ed6ea9c55c33fa6e08ca4c519321c82d_9 _struct.entry_id SMR-ed6ea9c55c33fa6e08ca4c519321c82d_9 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q6P5H2/ NEST_MOUSE, Nestin Estimated model accuracy of this model is 0.018, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6P5H2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 240893.268 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NEST_MOUSE Q6P5H2 1 ;MEGCVGEESFQMWELNRRLEAYLTRVKTLEEQNQLLSAELGGLRAQSGDASWRARADDELAALRVLVDQR WREKHEAEVQRDNLAEELESVAGRCQQVRLARERTIEEAACSRRALEAEKNARGWLSTQAAELERELEAL RASHEEERAHLNAQAACTPRRPPAPAHASPIRAPEVEELARRLGEVWRGAVRDYQERVAHMESSLGQARE RLGQAVRGARESRLEVQQLQADRDSLQERREALEQRLEGRWQDRLQATEKFQLAVEALEQEKQGLQSQIA QILEGGQQLAHLKMSLSLEVATYRTLLEAENSRLQTPGRSSQASLGFPDPKLKLHFLGIPEDQHLGSVLP VLSPTSFSSPLPNTLETPVTAFLKTQEFLKARTPTLASTPIPPMSEAPYPKNAEVRAQDVPHSLLQGGRQ QAPEPLWAEATVPSSTGVLPELEEPGGEQPDHFPDDPTSLAPPLNPHHSILEAKDRESSESRVSSIFQEE EGQIWELVKKEAATEVKVENSLAQEIQESGLDTEEIQDSQGPLQMETLEALGDEPLMSLKTQNHETPGKE NCNSSIEENSGTVKSPEKEKQTPLKSLEEKNVEAEKTLENGVLELSKPLGEEEPRMEDQELMSPEHTLET VSFLGKENQEVVRSSEEQNLESLITFKEESQYPLGGPEAEDQMLERLVEKEDQRFPRSPEEDQQAFRPLE KENQEPLRFEEAEDQVLERLIEKERQESLKSPEEEDQQAFRLLEKENQEPLRFEDAEDQVLERLIEKERQ ESLKSPEEEDQQAFRLLEKENQEPLRFEEAEDQVLERLVEKESQESLKSPEEEDQRTGKPLEKENQESLR SLDENQETIVLLESKNQRPLRSLEVEEEEQRIVKPLEKVSQVSLESLEKENVQSPRYLEEDDHMIKSLLE DKTHEILGSLEDRNGENFIPPENETQGSLRPPEEEDQRIVNHLEKESQEFLRSPEAEEEEEQVMVRSLEG ENHDPLSSVVKEEQMAESKLENESQDSRKSLEDESQETFGSLEKENLESLRSLAGQDQEEQKLEQETQQP LRAVEDEQMTVNPPEKVDPELPKPLRNDQEVVRSLDKENQESLVSLNEGGMETVKSSETENIESLETVGE CLGRRKSVDTQEPLWSTEVTSETIEPLEDETQEPLGCVDENQEVLTPLERESQELRSLGKWNPETVESPG GVEDSQQCLEVEEGPEREQHQESLRSLGEVEWELPGSGSQQRWEDVVEDGEGQEASLGATGVETEDKAEL HLRGQGGEEKAVEEGELLQDAVGEAWSLGSSEPKEQRVPAEPLDDLEGQPEQTGTLEVPVAQGMPEATEQ DEDRAQAGEQDSVEVTLGLEAARAGLELEQEVVGLEDPRHFAREEAIHPSLGEESVKAKIDQGLEEPGKE PKEAGALDSGIPELPKTSSETLECKGWEESGEGWGEEEASLETSDHEGSHAPQPRPPKTEEDEGLQAALT VPGPKLLEPCSPIPILTDAHELQPQAEGIQEAGWQPEAGTEALGRVEDEPEFGRGEIPEGLQDWEEGRED SEADELGETLPDSTPLGLYLKSPASPKWEQAGEQRLFPQGEARKEGWSPAALAAQGLSDPPEEEQQGHDS DLSSEEFEDLGTEASLLPGVPKEVSDHLGQEPPVLQPACWDQGGESDGFADEEESGEEGEEEDADEEEGA ESGTQWWGPGPSGGGVKVQDVTQRGDLEHESVGDSGLWDDGLSGAAANVLVTALETVSQDSAEPSGSEGS ESASLEGEEGQAIDHLDAPQEVTSVVPGAGDTFDISGQGPNLESEQVNGRMENGLEQAEGQVVLHGDEDQ GIPLQEQGTLKAPLVGSPVHLGPSQPLKFTLSGVDGDSWSSGED ; Nestin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1864 1 1864 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NEST_MOUSE Q6P5H2 . 1 1864 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2004-07-05 B9DF21005D977983 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MEGCVGEESFQMWELNRRLEAYLTRVKTLEEQNQLLSAELGGLRAQSGDASWRARADDELAALRVLVDQR WREKHEAEVQRDNLAEELESVAGRCQQVRLARERTIEEAACSRRALEAEKNARGWLSTQAAELERELEAL RASHEEERAHLNAQAACTPRRPPAPAHASPIRAPEVEELARRLGEVWRGAVRDYQERVAHMESSLGQARE RLGQAVRGARESRLEVQQLQADRDSLQERREALEQRLEGRWQDRLQATEKFQLAVEALEQEKQGLQSQIA QILEGGQQLAHLKMSLSLEVATYRTLLEAENSRLQTPGRSSQASLGFPDPKLKLHFLGIPEDQHLGSVLP VLSPTSFSSPLPNTLETPVTAFLKTQEFLKARTPTLASTPIPPMSEAPYPKNAEVRAQDVPHSLLQGGRQ QAPEPLWAEATVPSSTGVLPELEEPGGEQPDHFPDDPTSLAPPLNPHHSILEAKDRESSESRVSSIFQEE EGQIWELVKKEAATEVKVENSLAQEIQESGLDTEEIQDSQGPLQMETLEALGDEPLMSLKTQNHETPGKE NCNSSIEENSGTVKSPEKEKQTPLKSLEEKNVEAEKTLENGVLELSKPLGEEEPRMEDQELMSPEHTLET 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A 1 1638 LEU 1638 ? ? ? A . A 1 1639 GLY 1639 ? ? ? A . A 1 1640 GLN 1640 ? ? ? A . A 1 1641 GLU 1641 ? ? ? A . A 1 1642 PRO 1642 ? ? ? A . A 1 1643 PRO 1643 ? ? ? A . A 1 1644 VAL 1644 ? ? ? A . A 1 1645 LEU 1645 ? ? ? A . A 1 1646 GLN 1646 ? ? ? A . A 1 1647 PRO 1647 ? ? ? A . A 1 1648 ALA 1648 ? ? ? A . A 1 1649 CYS 1649 ? ? ? A . A 1 1650 TRP 1650 ? ? ? A . A 1 1651 ASP 1651 ? ? ? A . A 1 1652 GLN 1652 ? ? ? A . A 1 1653 GLY 1653 ? ? ? A . A 1 1654 GLY 1654 ? ? ? A . A 1 1655 GLU 1655 ? ? ? A . A 1 1656 SER 1656 ? ? ? A . A 1 1657 ASP 1657 ? ? ? A . A 1 1658 GLY 1658 ? ? ? A . A 1 1659 PHE 1659 ? ? ? A . A 1 1660 ALA 1660 ? ? ? A . A 1 1661 ASP 1661 ? ? ? A . A 1 1662 GLU 1662 ? ? ? A . A 1 1663 GLU 1663 ? ? ? A . A 1 1664 GLU 1664 ? ? ? A . A 1 1665 SER 1665 ? ? ? A . A 1 1666 GLY 1666 ? ? ? A . A 1 1667 GLU 1667 ? ? ? A . A 1 1668 GLU 1668 ? ? ? A . A 1 1669 GLY 1669 ? ? ? A . A 1 1670 GLU 1670 ? ? ? A . A 1 1671 GLU 1671 ? ? ? A . A 1 1672 GLU 1672 ? ? ? A . A 1 1673 ASP 1673 ? ? ? A . A 1 1674 ALA 1674 ? ? ? A . A 1 1675 ASP 1675 ? ? ? A . A 1 1676 GLU 1676 ? ? ? A . A 1 1677 GLU 1677 ? ? ? A . A 1 1678 GLU 1678 ? ? ? A . A 1 1679 GLY 1679 ? ? ? A . A 1 1680 ALA 1680 ? ? ? A . A 1 1681 GLU 1681 ? ? ? A . A 1 1682 SER 1682 ? ? ? A . A 1 1683 GLY 1683 ? ? ? A . A 1 1684 THR 1684 ? ? ? A . A 1 1685 GLN 1685 ? ? ? A . A 1 1686 TRP 1686 ? ? ? A . A 1 1687 TRP 1687 ? ? ? A . A 1 1688 GLY 1688 ? ? ? A . A 1 1689 PRO 1689 ? ? ? A . A 1 1690 GLY 1690 ? ? ? A . A 1 1691 PRO 1691 ? ? ? A . A 1 1692 SER 1692 ? ? ? A . A 1 1693 GLY 1693 ? ? ? A . A 1 1694 GLY 1694 ? ? ? A . A 1 1695 GLY 1695 ? ? ? A . A 1 1696 VAL 1696 ? ? ? A . A 1 1697 LYS 1697 ? ? ? A . A 1 1698 VAL 1698 ? ? ? A . A 1 1699 GLN 1699 ? ? ? A . A 1 1700 ASP 1700 ? ? ? A . A 1 1701 VAL 1701 ? ? ? A . A 1 1702 THR 1702 ? ? ? A . A 1 1703 GLN 1703 ? ? ? A . A 1 1704 ARG 1704 ? ? ? A . A 1 1705 GLY 1705 ? ? ? A . A 1 1706 ASP 1706 ? ? ? A . A 1 1707 LEU 1707 ? ? ? A . 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A 1 1743 GLU 1743 ? ? ? A . A 1 1744 PRO 1744 ? ? ? A . A 1 1745 SER 1745 ? ? ? A . A 1 1746 GLY 1746 ? ? ? A . A 1 1747 SER 1747 ? ? ? A . A 1 1748 GLU 1748 ? ? ? A . A 1 1749 GLY 1749 ? ? ? A . A 1 1750 SER 1750 ? ? ? A . A 1 1751 GLU 1751 ? ? ? A . A 1 1752 SER 1752 ? ? ? A . A 1 1753 ALA 1753 ? ? ? A . A 1 1754 SER 1754 ? ? ? A . A 1 1755 LEU 1755 ? ? ? A . A 1 1756 GLU 1756 ? ? ? A . A 1 1757 GLY 1757 ? ? ? A . A 1 1758 GLU 1758 ? ? ? A . A 1 1759 GLU 1759 ? ? ? A . A 1 1760 GLY 1760 ? ? ? A . A 1 1761 GLN 1761 ? ? ? A . A 1 1762 ALA 1762 ? ? ? A . A 1 1763 ILE 1763 ? ? ? A . A 1 1764 ASP 1764 ? ? ? A . A 1 1765 HIS 1765 ? ? ? A . A 1 1766 LEU 1766 ? ? ? A . A 1 1767 ASP 1767 ? ? ? A . A 1 1768 ALA 1768 ? ? ? A . A 1 1769 PRO 1769 ? ? ? A . A 1 1770 GLN 1770 ? ? ? A . A 1 1771 GLU 1771 ? ? ? A . A 1 1772 VAL 1772 ? ? ? A . A 1 1773 THR 1773 ? ? ? A . A 1 1774 SER 1774 ? ? ? A . A 1 1775 VAL 1775 ? ? ? A . A 1 1776 VAL 1776 ? ? ? A . A 1 1777 PRO 1777 ? ? ? A . 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A 1 1813 VAL 1813 ? ? ? A . A 1 1814 LEU 1814 ? ? ? A . A 1 1815 HIS 1815 ? ? ? A . A 1 1816 GLY 1816 ? ? ? A . A 1 1817 ASP 1817 ? ? ? A . A 1 1818 GLU 1818 ? ? ? A . A 1 1819 ASP 1819 ? ? ? A . A 1 1820 GLN 1820 ? ? ? A . A 1 1821 GLY 1821 ? ? ? A . A 1 1822 ILE 1822 ? ? ? A . A 1 1823 PRO 1823 ? ? ? A . A 1 1824 LEU 1824 ? ? ? A . A 1 1825 GLN 1825 ? ? ? A . A 1 1826 GLU 1826 ? ? ? A . A 1 1827 GLN 1827 ? ? ? A . A 1 1828 GLY 1828 ? ? ? A . A 1 1829 THR 1829 ? ? ? A . A 1 1830 LEU 1830 ? ? ? A . A 1 1831 LYS 1831 ? ? ? A . A 1 1832 ALA 1832 ? ? ? A . A 1 1833 PRO 1833 ? ? ? A . A 1 1834 LEU 1834 ? ? ? A . A 1 1835 VAL 1835 ? ? ? A . A 1 1836 GLY 1836 ? ? ? A . A 1 1837 SER 1837 ? ? ? A . A 1 1838 PRO 1838 ? ? ? A . A 1 1839 VAL 1839 ? ? ? A . A 1 1840 HIS 1840 ? ? ? A . A 1 1841 LEU 1841 ? ? ? A . A 1 1842 GLY 1842 ? ? ? A . A 1 1843 PRO 1843 ? ? ? A . A 1 1844 SER 1844 ? ? ? A . A 1 1845 GLN 1845 ? ? ? A . A 1 1846 PRO 1846 ? ? ? A . A 1 1847 LEU 1847 ? ? ? A . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tektin-3 {PDB ID=8otz, label_asym_id=EE, auth_asym_id=C8, SMTL ID=8otz.135.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8otz, label_asym_id=EE' 'target-template alignment' . 4 'model 9' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A EE 28 1 C8 # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MELLGSTLTATYAHPRPTPTNFLPAISTMASTYRDRFPHYNLTHSLSLPWRPSTYYKAASNWPTLDPYCT RSQRVSESTMLPFVSNRTTLFTRYTPDDWYRSNLTNFQESNTSRHNSERLRVDTSRLIQDKYQQTRKTQA DSTQNLGERVNDIGFWKSEIIHELDAMIGETNELTDIKKRLERALMETEAPLQVARECLFHREKRMGIDL VHDEVEKELLTEVDTILCCQERMKLYLDKAIAQLAANRAAQHELEKDLSDKQSAYRIDDKCHHLRNTSDG VSYFHGVERVDATVSVPESWAKFTDDNILRSQSERAASAKLRDDIQNVLVVTANEMWNQFNKVNLAFTNR IAETADAKNKIQTHLAKTLQEIFQTEMTIESIKKAIVEKSAFLKVAQTRLDERTRRPNIELCRDMAQLRL VNEVYEVDDTIQTLQQRLRDAEDTLQSLAHTKATLEHDLAVKANSLYIDQDKCMSMRRSFPSTLRLVGFC ; ;MELLGSTLTATYAHPRPTPTNFLPAISTMASTYRDRFPHYNLTHSLSLPWRPSTYYKAASNWPTLDPYCT RSQRVSESTMLPFVSNRTTLFTRYTPDDWYRSNLTNFQESNTSRHNSERLRVDTSRLIQDKYQQTRKTQA DSTQNLGERVNDIGFWKSEIIHELDAMIGETNELTDIKKRLERALMETEAPLQVARECLFHREKRMGIDL VHDEVEKELLTEVDTILCCQERMKLYLDKAIAQLAANRAAQHELEKDLSDKQSAYRIDDKCHHLRNTSDG VSYFHGVERVDATVSVPESWAKFTDDNILRSQSERAASAKLRDDIQNVLVVTANEMWNQFNKVNLAFTNR IAETADAKNKIQTHLAKTLQEIFQTEMTIESIKKAIVEKSAFLKVAQTRLDERTRRPNIELCRDMAQLRL VNEVYEVDDTIQTLQQRLRDAEDTLQSLAHTKATLEHDLAVKANSLYIDQDKCMSMRRSFPSTLRLVGFC ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 345 466 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8otz 2023-11-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1864 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1870 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.170 17.241 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEGCVGEESFQMWELNRRLEAYLTRVKTLEEQNQLLSAELGGLRAQSGDASWRARADDELAALRVLVDQRWREKHEAEVQRDNLAEELESVAGRCQQVRLARERTIEEAACSRRALEAEKNARGWLSTQAAELERELEALRASHEEERAHLNAQAACTPRRPPAPAHASPIRAPEVEELARRLGEVWRGAVRDYQERVAHMESSLGQARERLGQAVRGARESRLEVQQLQADRDSLQERREALEQRLEGRWQD------RLQATEKFQLAVEALEQEKQGLQSQIAQILEGGQQLAHLKMSLSLEVATYRTLLEAENSRLQTPGRSSQASLGFPDPKLKLHFLGIPEDQHLGSVLPVLSPTSFSSPLPNTLETPVTAFLKTQEFLKARTPTLASTPIPPMSEAPYPKNAEVRAQDVPHSLLQGGRQQAPEPLWAEATVPSSTGVLPELEEPGGEQPDHFPDDPTSLAPPLNPHHSILEAKDRESSESRVSSIFQEEEGQIWELVKKEAATEVKVENSLAQEIQESGLDTEEIQDSQGPLQMETLEALGDEPLMSLKTQNHETPGKENCNSSIEENSGTVKSPEKEKQTPLKSLEEKNVEAEKTLENGVLELSKPLGEEEPRMEDQELMSPEHTLETVSFLGKENQEVVRSSEEQNLESLITFKEESQYPLGGPEAEDQMLERLVEKEDQRFPRSPEEDQQAFRPLEKENQEPLRFEEAEDQVLERLIEKERQESLKSPEEEDQQAFRLLEKENQEPLRFEDAEDQVLERLIEKERQESLKSPEEEDQQAFRLLEKENQEPLRFEEAEDQVLERLVEKESQESLKSPEEEDQRTGKPLEKENQESLRSLDENQETIVLLESKNQRPLRSLEVEEEEQRIVKPLEKVSQVSLESLEKENVQSPRYLEEDDHMIKSLLEDKTHEILGSLEDRNGENFIPPENETQGSLRPPEEEDQRIVNHLEKESQEFLRSPEAEEEEEQVMVRSLEGENHDPLSSVVKEEQMAESKLENESQDSRKSLEDESQETFGSLEKENLESLRSLAGQDQEEQKLEQETQQPLRAVEDEQMTVNPPEKVDPELPKPLRNDQEVVRSLDKENQESLVSLNEGGMETVKSSETENIESLETVGECLGRRKSVDTQEPLWSTEVTSETIEPLEDETQEPLGCVDENQEVLTPLERESQELRSLGKWNPETVESPGGVEDSQQCLEVEEGPEREQHQESLRSLGEVEWELPGSGSQQRWEDVVEDGEGQEASLGATGVETEDKAELHLRGQGGEEKAVEEGELLQDAVGEAWSLGSSEPKEQRVPAEPLDDLEGQPEQTGTLEVPVAQGMPEATEQDEDRAQAGEQDSVEVTLGLEAARAGLELEQEVVGLEDPRHFAREEAIHPSLGEESVKAKIDQGLEEPGKEPKEAGALDSGIPELPKTSSETLECKGWEESGEGWGEEEASLETSDHEGSHAPQPRPPKTEEDEGLQAALTVPGPKLLEPCSPIPILTDAHELQPQAEGIQEAGWQPEAGTEALGRVEDEPEFGRGEIPEGLQDWEEGREDSEADELGETLPDSTPLGLYLKSPASPKWEQAGEQRLFPQGEARKEGWSPAALAAQGLSDPPEEEQQGHDSDLSSEEFEDLGTEASLLPGVPKEVSDHLGQEPPVLQPACWDQGGESDGFADEEESGEEGEEEDADEEEGAESGTQWWGPGPSGGGVKVQDVTQRGDLEHESVGDSGLWDDGLSGAAANVLVTALETVSQDSAEPSGSEGSESASLEGEEGQAIDHLDAPQEVTSVVPGAGDTFDISGQGPNLESEQVNGRMENGLEQAEGQVVLHGDEDQGIPLQEQGTLKAPLVGSPVHLGPSQPLKFTLSGVDGDSWSSGED 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LAFTNRIAETADAKNKIQTHLAKTLQEIFQTEMTIESIKKAIVEKSAFLKVAQTRLDERTRRPNIELCRDMAQLRLVNEVYEVDDTIQTLQQRLRDAEDTLQSLAHTKATLEHDLAVKANSL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8otz.135' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 9' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 192 192 ? A 289.311 374.699 156.021 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 2 C CA . ARG 192 192 ? A 289.545 375.784 155.005 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 3 C C . ARG 192 192 ? A 290.419 375.314 153.848 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 4 O O . ARG 192 192 ? A 289.938 375.261 152.731 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 5 C CB . ARG 192 192 ? A 290.103 377.043 155.709 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 6 C CG . ARG 192 192 ? A 290.257 378.278 154.787 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 7 C CD . ARG 192 192 ? A 291.257 379.325 155.292 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 8 N NE . ARG 192 192 ? A 292.596 378.665 155.303 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 9 C CZ . ARG 192 192 ? A 293.673 379.096 155.970 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 192 192 ? A 293.593 380.147 156.770 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 192 192 ? A 294.826 378.472 155.764 1 1 A ARG 0.420 1 ATOM 12 N N . ASP 193 193 ? A 291.676 374.869 154.085 1 1 A ASP 0.470 1 ATOM 13 C CA . ASP 193 193 ? A 292.628 374.423 153.076 1 1 A ASP 0.470 1 ATOM 14 C C . ASP 193 193 ? A 292.092 373.299 152.181 1 1 A ASP 0.470 1 ATOM 15 O O . ASP 193 193 ? A 292.279 373.295 150.959 1 1 A ASP 0.470 1 ATOM 16 C CB . ASP 193 193 ? A 293.907 373.967 153.834 1 1 A ASP 0.470 1 ATOM 17 C CG . ASP 193 193 ? A 294.534 375.059 154.693 1 1 A ASP 0.470 1 ATOM 18 O OD1 . ASP 193 193 ? A 293.965 376.175 154.769 1 1 A ASP 0.470 1 ATOM 19 O OD2 . ASP 193 193 ? A 295.552 374.762 155.365 1 1 A ASP 0.470 1 ATOM 20 N N . TYR 194 194 ? A 291.322 372.344 152.759 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 21 C CA . TYR 194 194 ? A 290.558 371.355 152.008 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 22 C C . TYR 194 194 ? A 289.602 372.004 150.998 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 23 O O . TYR 194 194 ? A 289.657 371.690 149.809 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 24 C CB . TYR 194 194 ? A 289.802 370.391 152.982 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 25 C CG . TYR 194 194 ? A 289.072 369.287 152.255 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 26 C CD1 . TYR 194 194 ? A 287.687 369.361 152.040 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 27 C CD2 . TYR 194 194 ? A 289.770 368.179 151.750 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 28 C CE1 . TYR 194 194 ? A 287.015 368.340 151.357 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 29 C CE2 . TYR 194 194 ? A 289.098 367.161 151.054 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 30 C CZ . TYR 194 194 ? A 287.714 367.235 150.872 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 31 O OH . TYR 194 194 ? A 286.992 366.227 150.202 1 1 A TYR 0.410 1 ATOM 32 N N . GLN 195 195 ? A 288.768 372.982 151.404 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 33 C CA . GLN 195 195 ? A 287.818 373.674 150.545 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 34 C C . GLN 195 195 ? A 288.475 374.413 149.386 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 35 O O . GLN 195 195 ? A 288.017 374.317 148.243 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 36 C CB . GLN 195 195 ? A 286.961 374.668 151.370 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 37 C CG . GLN 195 195 ? A 285.998 373.969 152.357 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 38 C CD . GLN 195 195 ? A 285.292 374.972 153.268 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 39 O OE1 . GLN 195 195 ? A 285.897 375.956 153.712 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 40 N NE2 . GLN 195 195 ? A 284.022 374.688 153.632 1 1 A GLN 0.480 1 ATOM 41 N N . GLU 196 196 ? A 289.592 375.121 149.645 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 42 C CA . GLU 196 196 ? A 290.391 375.793 148.636 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 43 C C . GLU 196 196 ? A 290.977 374.843 147.602 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 44 O O . GLU 196 196 ? A 290.889 375.063 146.390 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 45 C CB . GLU 196 196 ? A 291.562 376.532 149.322 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 46 C CG . GLU 196 196 ? A 291.113 377.743 150.177 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 47 C CD . GLU 196 196 ? A 292.255 378.405 150.953 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 48 O OE1 . GLU 196 196 ? A 293.423 377.971 150.804 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 49 O OE2 . GLU 196 196 ? A 291.938 379.331 151.749 1 1 A GLU 0.520 1 ATOM 50 N N . ARG 197 197 ? A 291.563 373.717 148.059 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 51 C CA . ARG 197 197 ? A 292.101 372.705 147.174 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 52 C C . ARG 197 197 ? A 291.063 371.998 146.319 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 53 O O . ARG 197 197 ? A 291.291 371.809 145.122 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 54 C CB . ARG 197 197 ? A 292.949 371.659 147.936 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 55 C CG . ARG 197 197 ? A 293.742 370.695 147.022 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 56 C CD . ARG 197 197 ? A 294.731 371.427 146.109 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 57 N NE . ARG 197 197 ? A 295.608 370.395 145.466 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 58 C CZ . ARG 197 197 ? A 296.522 370.672 144.526 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 59 N NH1 . ARG 197 197 ? A 296.681 371.908 144.065 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 60 N NH2 . ARG 197 197 ? A 297.305 369.703 144.055 1 1 A ARG 0.490 1 ATOM 61 N N . VAL 198 198 ? A 289.901 371.623 146.902 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 62 C CA . VAL 198 198 ? A 288.790 370.985 146.198 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 63 C C . VAL 198 198 ? A 288.272 371.865 145.071 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 64 O O . VAL 198 198 ? A 288.180 371.415 143.925 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 65 C CB . VAL 198 198 ? A 287.662 370.612 147.165 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 66 C CG1 . VAL 198 198 ? A 286.396 370.114 146.438 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 67 C CG2 . VAL 198 198 ? A 288.147 369.467 148.071 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 68 N N . ALA 199 199 ? A 288.033 373.170 145.337 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 69 C CA . ALA 199 199 ? A 287.597 374.127 144.334 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 70 C C . ALA 199 199 ? A 288.600 374.306 143.195 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 71 O O . ALA 199 199 ? A 288.246 374.290 142.013 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 72 C CB . ALA 199 199 ? A 287.338 375.495 145.008 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 73 N N . HIS 200 200 ? A 289.903 374.431 143.519 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 74 C CA . HIS 200 200 ? A 290.963 374.541 142.527 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 75 C C . HIS 200 200 ? A 291.094 373.319 141.612 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 76 O O . HIS 200 200 ? A 291.202 373.441 140.388 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 77 C CB . HIS 200 200 ? A 292.314 374.817 143.232 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 78 C CG . HIS 200 200 ? A 293.463 375.033 142.301 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 79 N ND1 . HIS 200 200 ? A 293.469 376.166 141.532 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 80 C CD2 . HIS 200 200 ? A 294.553 374.258 142.021 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 81 C CE1 . HIS 200 200 ? A 294.556 376.077 140.788 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 82 N NE2 . HIS 200 200 ? A 295.242 374.944 141.050 1 1 A HIS 0.560 1 ATOM 83 N N . MET 201 201 ? A 291.054 372.092 142.170 1 1 A MET 0.590 1 ATOM 84 C CA . MET 201 201 ? A 291.102 370.857 141.400 1 1 A MET 0.590 1 ATOM 85 C C . MET 201 201 ? A 289.863 370.605 140.550 1 1 A MET 0.590 1 ATOM 86 O O . MET 201 201 ? A 289.979 370.121 139.421 1 1 A MET 0.590 1 ATOM 87 C CB . MET 201 201 ? A 291.459 369.633 142.278 1 1 A MET 0.590 1 ATOM 88 C CG . MET 201 201 ? A 292.898 369.683 142.843 1 1 A MET 0.590 1 ATOM 89 S SD . MET 201 201 ? A 294.226 369.893 141.609 1 1 A MET 0.590 1 ATOM 90 C CE . MET 201 201 ? A 293.989 368.320 140.734 1 1 A MET 0.590 1 ATOM 91 N N . GLU 202 202 ? A 288.657 370.968 141.037 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 92 C CA . GLU 202 202 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #