data_SMR-25ba0c172b32602ada489ea7f8c2557a_4 _entry.id SMR-25ba0c172b32602ada489ea7f8c2557a_4 _struct.entry_id SMR-25ba0c172b32602ada489ea7f8c2557a_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q80UV9 (isoform 2)/ TAF1_MOUSE, Transcription initiation factor TFIID subunit 1 Estimated model accuracy of this model is 0.061, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q80UV9 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 246496.845 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP TAF1_MOUSE Q80UV9 1 ;MSDTDSDEESAGGGPFSLTGFLFGNINGAGQLEGESVLDDECKKHLAGLGALGLGSLITELTANEELSGS DGALVNDEGWIRSREDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHTDYDEDDYDADCEDIDCKLMPPPP PPPGPLKKEKDQDDITGVSEDGEGIILPSIIAPSSLASEKVDFSSSSDSESEMGPQDAAQSESKDGQLTL PLAGIMQHDATKLLPSVTELFPEFRPGKVLRFLRLFGPGKNVPSVWRSARRKRKKKHRELIQEGQVQEEE CSVELEVNQKSLWNYDYAPPPLPDQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDTDKVMDTKPRVAEWRYGPARLW YDMLGVPEDGSGFDYGFKMKKTEHESTIKCNIMKKLRKLEENSGVDLLADENFLMVTQLHWEDDIIWDGE DVKHKGTKPQRASLAGWLPSSMTRNAMAYNVQQGFTATLDDDKPWYSIFPIDNEDLVYGRWEDNIIWDAQ NMPRILEPPVLTLDPNDENLILEIPDEKEEATSNSPSKENKKESSLKKSRILLGKTGVIKEEPQQNMSQP EVKDPWNLSNDEYYYPKQQGLRGTFGGNIIQHSIPAVELRQPFFPTHMGPIKLRQFHRPPLKKYSFGALS QPGPHSVQPLLKHIKKKAKMREQERQASGGGEMFFMRTPQDLTGKDGDLILAEYSEENGPLMMQVGMATK IKNYYKRKPGKDPGAPDCKYGETVYCHTSPFLGSLHPGQLLQAFENNLFRAPIYLHKMPESDFLIIRTRQ GYFIRELVDIFVVGQQCPLFEVPGPNSKRANTHIRDFLQVFIYRLFWKSKDRPRRIRMEDIKKAFPSHSE SSIRKRLKLCADFKRTGMDSNWWVLKSDFRLPTEEEIRAMVSPEQCCAYYSMIAAEQRLKDAGYGEKSFF APEEENEEDFQMKIDDEVRTAPWNTTRAFIAAMKGKCLLEVTGVADPTGCGEGFSYVKIPNKPTQQKDDK EPQPVKKTVTGTDADLRRLSLKNAKQLLRKFGVPEEEIKKLSRWEVIDVVRTMSTEQARSGEGPMSKFAR GSRFSVAEHQERYKEECQRIFDLQNKVLSSTEVLSTDTDSSSAEDSDFEEMGKNIENMLQNKKTSSQLSR EREEQERKELQRMLLAAGSAAAGNNHRDDDTASVTSLNSSATGRCLKIYRTFRDEEGKEYVRCETVRKAT VIDAYVRIRTTKDEEFIRKFALFDEQHREEMRKERRRIQEQLRRLKRNQEKEKLKGPPEKKPKKMKERPD LKLKCGACGAIGHMRTNKFCPLYYQTNAPPSNPVAMTEEQEEELEKTVIHNDNEELIKVEGTKIVLGKQL IESADEVRRKSLVLKFPKQQLPPKKKRRVGTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDL PNTYPFHTPVNAKVVKDYYKIITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQI SQSMLDLCDEKLKEKEDKLARLEKAINPLLDDDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPD YYKVIVSPMDLETIRKNISKHKYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCHQTLTEYDE HLTQLEKDICTAKEAALEEAELESLDPMTPGPYTPQPPDLYDNNTSLSVSRDASVYQDESNLSVLDIPSA TSEKQLTQEGGDGDGDLADEEEGTVQQPQASVLYEDLLMSEGEDDEEDAGSDEEGDNPFFAIQLSESGSD SDVESGSLRPKQPRVLQENTRMGMENEESMMSYEGDGGDASRGLEDSNISYGSYEEPDPKSNTQDTSFSS IGGYEVSEEEEDEEEQRSGPSVLSQVHLSEDEEDSEDFHSIAGDTDLDSDE ; 'Transcription initiation factor TFIID subunit 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1871 1 1871 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . TAF1_MOUSE Q80UV9 Q80UV9-2 1 1871 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-03-06 396E32131D3A6782 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSDTDSDEESAGGGPFSLTGFLFGNINGAGQLEGESVLDDECKKHLAGLGALGLGSLITELTANEELSGS DGALVNDEGWIRSREDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHTDYDEDDYDADCEDIDCKLMPPPP PPPGPLKKEKDQDDITGVSEDGEGIILPSIIAPSSLASEKVDFSSSSDSESEMGPQDAAQSESKDGQLTL PLAGIMQHDATKLLPSVTELFPEFRPGKVLRFLRLFGPGKNVPSVWRSARRKRKKKHRELIQEGQVQEEE CSVELEVNQKSLWNYDYAPPPLPDQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDTDKVMDTKPRVAEWRYGPARLW YDMLGVPEDGSGFDYGFKMKKTEHESTIKCNIMKKLRKLEENSGVDLLADENFLMVTQLHWEDDIIWDGE DVKHKGTKPQRASLAGWLPSSMTRNAMAYNVQQGFTATLDDDKPWYSIFPIDNEDLVYGRWEDNIIWDAQ NMPRILEPPVLTLDPNDENLILEIPDEKEEATSNSPSKENKKESSLKKSRILLGKTGVIKEEPQQNMSQP EVKDPWNLSNDEYYYPKQQGLRGTFGGNIIQHSIPAVELRQPFFPTHMGPIKLRQFHRPPLKKYSFGALS 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A 1 1638 MET 1638 ? ? ? A . A 1 1639 THR 1639 ? ? ? A . A 1 1640 PRO 1640 ? ? ? A . A 1 1641 GLY 1641 ? ? ? A . A 1 1642 PRO 1642 ? ? ? A . A 1 1643 TYR 1643 ? ? ? A . A 1 1644 THR 1644 ? ? ? A . A 1 1645 PRO 1645 ? ? ? A . A 1 1646 GLN 1646 ? ? ? A . A 1 1647 PRO 1647 ? ? ? A . A 1 1648 PRO 1648 ? ? ? A . A 1 1649 ASP 1649 ? ? ? A . A 1 1650 LEU 1650 ? ? ? A . A 1 1651 TYR 1651 ? ? ? A . A 1 1652 ASP 1652 ? ? ? A . A 1 1653 ASN 1653 ? ? ? A . A 1 1654 ASN 1654 ? ? ? A . A 1 1655 THR 1655 ? ? ? A . A 1 1656 SER 1656 ? ? ? A . A 1 1657 LEU 1657 ? ? ? A . A 1 1658 SER 1658 ? ? ? A . A 1 1659 VAL 1659 ? ? ? A . A 1 1660 SER 1660 ? ? ? A . A 1 1661 ARG 1661 ? ? ? A . A 1 1662 ASP 1662 ? ? ? A . A 1 1663 ALA 1663 ? ? ? A . A 1 1664 SER 1664 ? ? ? A . A 1 1665 VAL 1665 ? ? ? A . A 1 1666 TYR 1666 ? ? ? A . A 1 1667 GLN 1667 ? ? ? A . A 1 1668 ASP 1668 ? ? ? A . A 1 1669 GLU 1669 ? ? ? A . A 1 1670 SER 1670 ? ? ? A . A 1 1671 ASN 1671 ? ? ? A . A 1 1672 LEU 1672 ? ? ? A . A 1 1673 SER 1673 ? ? ? A . A 1 1674 VAL 1674 ? ? ? A . A 1 1675 LEU 1675 ? ? ? A . A 1 1676 ASP 1676 ? ? ? A . A 1 1677 ILE 1677 ? ? ? A . A 1 1678 PRO 1678 ? ? ? A . A 1 1679 SER 1679 ? ? ? A . A 1 1680 ALA 1680 ? ? ? A . A 1 1681 THR 1681 ? ? ? A . A 1 1682 SER 1682 ? ? ? A . A 1 1683 GLU 1683 ? ? ? A . A 1 1684 LYS 1684 ? ? ? A . A 1 1685 GLN 1685 ? ? ? A . A 1 1686 LEU 1686 ? ? ? A . A 1 1687 THR 1687 ? ? ? A . A 1 1688 GLN 1688 ? ? ? A . A 1 1689 GLU 1689 ? ? ? A . A 1 1690 GLY 1690 ? ? ? A . A 1 1691 GLY 1691 ? ? ? A . A 1 1692 ASP 1692 ? ? ? A . A 1 1693 GLY 1693 ? ? ? A . A 1 1694 ASP 1694 ? ? ? A . A 1 1695 GLY 1695 ? ? ? A . A 1 1696 ASP 1696 ? ? ? A . A 1 1697 LEU 1697 ? ? ? A . A 1 1698 ALA 1698 ? ? ? A . A 1 1699 ASP 1699 ? ? ? A . A 1 1700 GLU 1700 ? ? ? A . A 1 1701 GLU 1701 ? ? ? A . A 1 1702 GLU 1702 ? ? ? A . A 1 1703 GLY 1703 ? ? ? A . A 1 1704 THR 1704 ? ? ? A . A 1 1705 VAL 1705 ? ? ? A . A 1 1706 GLN 1706 ? ? ? A . A 1 1707 GLN 1707 ? ? ? A . A 1 1708 PRO 1708 ? ? ? A . A 1 1709 GLN 1709 ? ? ? A . A 1 1710 ALA 1710 ? ? ? A . A 1 1711 SER 1711 ? ? ? A . A 1 1712 VAL 1712 ? ? ? A . A 1 1713 LEU 1713 ? ? ? A . A 1 1714 TYR 1714 ? ? ? A . A 1 1715 GLU 1715 ? ? ? A . A 1 1716 ASP 1716 ? ? ? A . A 1 1717 LEU 1717 ? ? ? A . A 1 1718 LEU 1718 ? ? ? A . A 1 1719 MET 1719 ? ? ? A . A 1 1720 SER 1720 ? ? ? A . A 1 1721 GLU 1721 ? ? ? A . A 1 1722 GLY 1722 ? ? ? A . A 1 1723 GLU 1723 ? ? ? A . A 1 1724 ASP 1724 ? ? ? A . A 1 1725 ASP 1725 ? ? ? A . A 1 1726 GLU 1726 ? ? ? A . A 1 1727 GLU 1727 ? ? ? A . A 1 1728 ASP 1728 ? ? ? A . A 1 1729 ALA 1729 ? ? ? A . A 1 1730 GLY 1730 ? ? ? A . A 1 1731 SER 1731 ? ? ? A . A 1 1732 ASP 1732 ? ? ? A . A 1 1733 GLU 1733 ? ? ? A . A 1 1734 GLU 1734 ? ? ? A . A 1 1735 GLY 1735 ? ? ? A . A 1 1736 ASP 1736 ? ? ? A . A 1 1737 ASN 1737 ? ? ? A . A 1 1738 PRO 1738 ? ? ? A . A 1 1739 PHE 1739 ? ? ? A . A 1 1740 PHE 1740 ? ? ? A . A 1 1741 ALA 1741 ? ? ? A . A 1 1742 ILE 1742 ? ? ? A . A 1 1743 GLN 1743 ? ? ? A . A 1 1744 LEU 1744 ? ? ? A . A 1 1745 SER 1745 ? ? ? A . A 1 1746 GLU 1746 ? ? ? A . A 1 1747 SER 1747 ? ? ? A . A 1 1748 GLY 1748 ? ? ? A . A 1 1749 SER 1749 ? ? ? A . A 1 1750 ASP 1750 ? ? ? A . A 1 1751 SER 1751 ? ? ? A . A 1 1752 ASP 1752 ? ? ? A . A 1 1753 VAL 1753 ? ? ? A . A 1 1754 GLU 1754 ? ? ? A . A 1 1755 SER 1755 ? ? ? A . A 1 1756 GLY 1756 ? ? ? A . A 1 1757 SER 1757 ? ? ? A . A 1 1758 LEU 1758 ? ? ? A . A 1 1759 ARG 1759 ? ? ? A . A 1 1760 PRO 1760 ? ? ? A . A 1 1761 LYS 1761 ? ? ? A . A 1 1762 GLN 1762 ? ? ? A . A 1 1763 PRO 1763 ? ? ? A . A 1 1764 ARG 1764 ? ? ? A . A 1 1765 VAL 1765 ? ? ? A . A 1 1766 LEU 1766 ? ? ? A . A 1 1767 GLN 1767 ? ? ? A . A 1 1768 GLU 1768 ? ? ? A . A 1 1769 ASN 1769 ? ? ? A . A 1 1770 THR 1770 ? ? ? A . A 1 1771 ARG 1771 ? ? ? A . A 1 1772 MET 1772 ? ? ? A . A 1 1773 GLY 1773 ? ? ? A . A 1 1774 MET 1774 ? ? ? A . A 1 1775 GLU 1775 ? ? ? A . A 1 1776 ASN 1776 ? ? ? A . A 1 1777 GLU 1777 ? ? ? A . A 1 1778 GLU 1778 ? ? ? A . A 1 1779 SER 1779 ? ? ? A . A 1 1780 MET 1780 ? ? ? A . A 1 1781 MET 1781 ? ? ? A . A 1 1782 SER 1782 ? ? ? A . A 1 1783 TYR 1783 ? ? ? A . A 1 1784 GLU 1784 ? ? ? A . A 1 1785 GLY 1785 ? ? ? A . A 1 1786 ASP 1786 ? ? ? A . A 1 1787 GLY 1787 ? ? ? A . A 1 1788 GLY 1788 ? ? ? A . A 1 1789 ASP 1789 ? ? ? A . A 1 1790 ALA 1790 ? ? ? A . A 1 1791 SER 1791 ? ? ? A . A 1 1792 ARG 1792 ? ? ? A . A 1 1793 GLY 1793 ? ? ? A . A 1 1794 LEU 1794 ? ? ? A . A 1 1795 GLU 1795 ? ? ? A . A 1 1796 ASP 1796 ? ? ? A . A 1 1797 SER 1797 ? ? ? A . A 1 1798 ASN 1798 ? ? ? A . A 1 1799 ILE 1799 ? ? ? A . A 1 1800 SER 1800 ? ? ? A . A 1 1801 TYR 1801 ? ? ? A . A 1 1802 GLY 1802 ? ? ? A . A 1 1803 SER 1803 ? ? ? A . A 1 1804 TYR 1804 ? ? ? A . A 1 1805 GLU 1805 ? ? ? A . A 1 1806 GLU 1806 ? ? ? A . A 1 1807 PRO 1807 ? ? ? A . A 1 1808 ASP 1808 ? ? ? A . A 1 1809 PRO 1809 ? ? ? A . A 1 1810 LYS 1810 ? ? ? A . A 1 1811 SER 1811 ? ? ? A . A 1 1812 ASN 1812 ? ? ? A . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Bromodomain-containing protein 4 {PDB ID=6dne, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6dne.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6dne, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-11-27 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-22 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;NPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKR LENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGR KETGTAKPGVSTVPNTTQASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPV PPQPQPPPAPAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQRRE SSRPVKPPKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKPVDVEALGLHDYCDI IKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEE PVVAVSSPAVPPPT ; ;NPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKR LENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGR KETGTAKPGVSTVPNTTQASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPV PPQPQPPPAPAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQRRE SSRPVKPPKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKPVDVEALGLHDYCDI IKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEE PVVAVSSPAVPPPT ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 16 417 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6dne 2023-10-11 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1871 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2045 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.4e-29 25.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSDTDSDEESAGGGPFSLTGFLFGNINGAGQLEGESVLDDECKKHLAGLGALGLGSLITELTANEELSGSDGALVNDEGWIRSREDAVDYSDINEVAEDESRRYQQTMGSLQPLCHTDYDEDDYDADCEDIDCKLMPPPPPPPGPLKKEKDQDDITGVSEDGEGIILPSIIAPSSLASEKVDFSSSSDSESEMGPQDAAQSESKDGQLTLPLAGIMQHDATKLLPSVTELFPEFRPGKVLRFLRLFGPGKNVPSVWRSARRKRKKKHRELIQEGQVQEEECSVELEVNQKSLWNYDYAPPPLPDQCLSDDEITMMAPVESKFSQSTGDTDKVMDTKPRVAEWRYGPARLWYDMLGVPEDGSGFDYGFKMKKTEHESTIKCNIMKKLRKLEENSGVDLLADENFLMVTQLHWEDDIIWDGEDVKHKGTKPQRASLAGWLPSSMTRNAMAYNVQQGFTATLDDDKPWYSIFPIDNEDLVYGRWEDNIIWDAQNMPRILEPPVLTLDPNDENLILEIPDEKEEATSNSPSKENKKESSLKKSRILLGKTGVIKEEPQQNMSQPEVKDPWNLSNDEYYYPKQQGLRGTFGGNIIQHSIPAVELRQPFFPTHMGPIKLRQFHRPPLKKYSFGALSQPGPHSVQPLLKHIKKKAKMREQERQASGGGEMFFMRTPQDLTGKDGDLILAEYSEENGPLMMQVGMATKIKNYYKRKPGKDPGAPDCKYGETVYCHTSPFLGSLHPGQLLQAFENNLFRAPIYLHKMPESDFLIIRTRQGYFIRELVDIFVVGQQCPLFEVPGPNSKRANTHIRDFLQVFIYRLFWKSKDRPRRIRMEDIKKAFPSHSESSIRKRLKLCADFKRTGMDSNWWVLKSDFRLPTEEEIRAMVSPEQCCAYYSMIAAEQRLKDAGYGEKSFFAPEEENEEDFQMKIDDEVRTAPWNTTRAFIAAMKGKCLLEVTGVADPTGCGEGFSYVKIPNKPTQQKDDKEPQPVKKTVTGTDADLRRLSLKNAKQLLRKFGVPEEEIKKLSRWEVIDVVRTMSTEQARSGEGPMSKFARGSRFSVAEHQERYKEECQRIFDLQNKVLSSTEVLSTDTDSSSAEDSDFEEMGKNIENMLQNKKTSSQLSREREEQERKELQRMLLAAGSAAAGNNHRDDDTASVTSLNSSATGRCLKIYRTFRDEEGKEYVRCETVRKATVIDAYVRIRTTKDEEFIRKFALFDEQHREEMRKERRRIQEQLRRLKRNQEKEKLKGPPEKKPKKMKERPDLKLKCGACGAIGHMRTNKFCPLYYQTNAPPSNPVAMTEEQEEELEKTVIHNDNEELIKVEGTKIVLGKQLIESADEVRRKSLVLKFPKQQLPPKKKRRVGTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLPNTYPFHTPVN--AKVVKDYYKIITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLARL-----------EKA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------INP----------------------------LLDD-----------------DDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFV--PDYYKVIVSPMDLETIRKNISKHKYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCHQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAELESLDPMTPGPYTPQPPDLYDNNTSLSVSRDASVYQDESNLSVLDIPSATSEKQLTQEGGDGDGDLADEEEGTVQQPQASVLYEDLLMSEGEDDEEDAGSDEEGDNPFFAIQLSESGSDSDVESGSLRPKQPRVLQENTRMGMENEESMMSYEGDGGDASRGLEDSNISYGSYEEPDPKSNTQDTSFSSIGGYEVSEEEEDEEEQRSGPSVLSQVHLSEDEEDSEDFHSIAGDTDLDSDE 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGRKETGTAKPGVSTVPNTTQASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPVPPQPQPPPAPAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQRRESSRPVKPPKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFA--KKHAAYAWPFYKPVDVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6dne.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 1382 1382 ? A 11.661 17.566 4.755 1 1 A PRO 0.450 1 ATOM 2 C CA . PRO 1382 1382 ? A 11.799 16.780 3.488 1 1 A PRO 0.450 1 ATOM 3 C C . PRO 1382 1382 ? A 12.637 15.567 3.753 1 1 A PRO 0.450 1 ATOM 4 O O . PRO 1382 1382 ? A 13.350 15.519 4.747 1 1 A PRO 0.450 1 ATOM 5 C CB . PRO 1382 1382 ? A 12.415 17.796 2.530 1 1 A PRO 0.450 1 ATOM 6 C CG . PRO 1382 1382 ? A 13.193 18.817 3.383 1 1 A PRO 0.450 1 ATOM 7 C CD . PRO 1382 1382 ? A 12.661 18.694 4.798 1 1 A PRO 0.450 1 ATOM 8 N N . MET 1383 1383 ? A 12.529 14.568 2.859 1 1 A MET 0.440 1 ATOM 9 C CA . MET 1383 1383 ? A 13.108 13.269 3.030 1 1 A MET 0.440 1 ATOM 10 C C . MET 1383 1383 ? A 13.315 12.763 1.623 1 1 A MET 0.440 1 ATOM 11 O O . MET 1383 1383 ? A 12.601 13.214 0.740 1 1 A MET 0.440 1 ATOM 12 C CB . MET 1383 1383 ? A 12.070 12.384 3.755 1 1 A MET 0.440 1 ATOM 13 C CG . MET 1383 1383 ? A 12.472 10.942 4.060 1 1 A MET 0.440 1 ATOM 14 S SD . MET 1383 1383 ? A 11.203 10.039 4.994 1 1 A MET 0.440 1 ATOM 15 C CE . MET 1383 1383 ? A 11.585 10.768 6.603 1 1 A MET 0.440 1 ATOM 16 N N . VAL 1384 1384 ? A 14.265 11.824 1.384 1 1 A VAL 0.470 1 ATOM 17 C CA . VAL 1384 1384 ? A 14.552 11.251 0.072 1 1 A VAL 0.470 1 ATOM 18 C C . VAL 1384 1384 ? A 13.321 10.627 -0.533 1 1 A VAL 0.470 1 ATOM 19 O O . VAL 1384 1384 ? A 12.890 10.962 -1.630 1 1 A VAL 0.470 1 ATOM 20 C CB . VAL 1384 1384 ? A 15.629 10.179 0.235 1 1 A VAL 0.470 1 ATOM 21 C CG1 . VAL 1384 1384 ? A 15.822 9.364 -1.055 1 1 A VAL 0.470 1 ATOM 22 C CG2 . VAL 1384 1384 ? A 16.958 10.858 0.614 1 1 A VAL 0.470 1 ATOM 23 N N . THR 1385 1385 ? A 12.648 9.784 0.250 1 1 A THR 0.450 1 ATOM 24 C CA . THR 1385 1385 ? A 11.424 9.142 -0.131 1 1 A THR 0.450 1 ATOM 25 C C . THR 1385 1385 ? A 10.271 10.113 -0.330 1 1 A THR 0.450 1 ATOM 26 O O . THR 1385 1385 ? A 9.507 9.945 -1.265 1 1 A THR 0.450 1 ATOM 27 C CB . THR 1385 1385 ? A 11.038 8.140 0.919 1 1 A THR 0.450 1 ATOM 28 O OG1 . THR 1385 1385 ? A 11.031 8.772 2.188 1 1 A THR 0.450 1 ATOM 29 C CG2 . THR 1385 1385 ? A 12.079 7.015 1.022 1 1 A THR 0.450 1 ATOM 30 N N . LEU 1386 1386 ? A 10.103 11.166 0.510 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 31 C CA . LEU 1386 1386 ? A 9.118 12.233 0.303 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 32 C C . LEU 1386 1386 ? A 9.320 12.982 -0.998 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 33 O O . LEU 1386 1386 ? A 8.357 13.296 -1.698 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 34 C CB . LEU 1386 1386 ? A 9.097 13.276 1.451 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 35 C CG . LEU 1386 1386 ? A 8.325 12.820 2.701 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 36 C CD1 . LEU 1386 1386 ? A 8.550 13.796 3.869 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 37 C CD2 . LEU 1386 1386 ? A 6.820 12.704 2.395 1 1 A LEU 0.630 1 ATOM 38 N N . SER 1387 1387 ? A 10.583 13.260 -1.364 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 39 C CA . SER 1387 1387 ? A 10.936 13.786 -2.672 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 40 C C . SER 1387 1387 ? A 10.571 12.822 -3.788 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 41 O O . SER 1387 1387 ? A 9.849 13.203 -4.700 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 42 C CB . SER 1387 1387 ? A 12.439 14.128 -2.792 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 43 O OG . SER 1387 1387 ? A 12.815 15.135 -1.845 1 1 A SER 0.610 1 ATOM 44 N N . SER 1388 1388 ? A 10.939 11.518 -3.686 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 45 C CA . SER 1388 1388 ? A 10.608 10.461 -4.651 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 46 C C . SER 1388 1388 ? A 9.153 10.268 -4.842 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 47 O O . SER 1388 1388 ? A 8.648 9.957 -5.915 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 48 C CB . SER 1388 1388 ? A 11.090 9.063 -4.223 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 49 O OG . SER 1388 1388 ? A 12.505 9.110 -4.235 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 50 N N . ILE 1389 1389 ? A 8.425 10.433 -3.751 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 51 C CA . ILE 1389 1389 ? A 7.005 10.496 -3.759 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 52 C C . ILE 1389 1389 ? A 6.446 11.635 -4.576 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 53 O O . ILE 1389 1389 ? A 5.653 11.400 -5.476 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 54 C CB . ILE 1389 1389 ? A 6.556 10.486 -2.323 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 55 C CG1 . ILE 1389 1389 ? A 6.697 9.090 -1.680 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 56 C CG2 . ILE 1389 1389 ? A 5.093 10.857 -2.272 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 57 C CD1 . ILE 1389 1389 ? A 6.561 9.057 -0.157 1 1 A ILE 0.610 1 ATOM 58 N N . LEU 1390 1390 ? A 6.876 12.885 -4.345 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 59 C CA . LEU 1390 1390 ? A 6.428 13.972 -5.178 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 60 C C . LEU 1390 1390 ? A 6.872 13.852 -6.617 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 61 O O . LEU 1390 1390 ? A 6.078 13.988 -7.546 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 62 C CB . LEU 1390 1390 ? A 6.843 15.296 -4.518 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 63 C CG . LEU 1390 1390 ? A 6.533 16.570 -5.323 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 64 C CD1 . LEU 1390 1390 ? A 5.092 16.658 -5.870 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 65 C CD2 . LEU 1390 1390 ? A 6.913 17.793 -4.479 1 1 A LEU 0.610 1 ATOM 66 N N . GLU 1391 1391 ? A 8.143 13.528 -6.838 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 67 C CA . GLU 1391 1391 ? A 8.688 13.448 -8.162 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 68 C C . GLU 1391 1391 ? A 8.225 12.283 -9.016 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 69 O O . GLU 1391 1391 ? A 7.888 12.450 -10.184 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 70 C CB . GLU 1391 1391 ? A 10.208 13.362 -8.032 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 71 C CG . GLU 1391 1391 ? A 10.845 14.648 -7.461 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 72 C CD . GLU 1391 1391 ? A 12.354 14.501 -7.301 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 73 O OE1 . GLU 1391 1391 ? A 12.896 13.424 -7.654 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 74 O OE2 . GLU 1391 1391 ? A 12.971 15.485 -6.817 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 75 N N . SER 1392 1392 ? A 8.205 11.057 -8.461 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 76 C CA . SER 1392 1392 ? A 7.878 9.867 -9.226 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 77 C C . SER 1392 1392 ? A 6.422 9.496 -9.047 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 78 O O . SER 1392 1392 ? A 5.656 9.416 -10.005 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 79 C CB . SER 1392 1392 ? A 8.829 8.688 -8.845 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 80 O OG . SER 1392 1392 ? A 8.607 7.500 -9.612 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 81 N N . ILE 1393 1393 ? A 5.974 9.269 -7.804 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 82 C CA . ILE 1393 1393 ? A 4.701 8.601 -7.557 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 83 C C . ILE 1393 1393 ? A 3.471 9.433 -7.789 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 84 O O . ILE 1393 1393 ? A 2.521 9.008 -8.443 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 85 C CB . ILE 1393 1393 ? A 4.683 8.132 -6.129 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 86 C CG1 . ILE 1393 1393 ? A 5.805 7.085 -6.027 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 87 C CG2 . ILE 1393 1393 ? A 3.312 7.566 -5.664 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 88 C CD1 . ILE 1393 1393 ? A 6.293 6.935 -4.605 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 89 N N . ILE 1394 1394 ? A 3.469 10.669 -7.246 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 90 C CA . ILE 1394 1394 ? A 2.378 11.611 -7.433 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 91 C C . ILE 1394 1394 ? A 2.231 11.979 -8.877 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 92 O O . ILE 1394 1394 ? A 1.117 12.015 -9.393 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 93 C CB . ILE 1394 1394 ? A 2.550 12.897 -6.630 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 94 C CG1 . ILE 1394 1394 ? A 2.376 12.562 -5.144 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 95 C CG2 . ILE 1394 1394 ? A 1.496 13.968 -7.025 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 96 C CD1 . ILE 1394 1394 ? A 2.689 13.722 -4.206 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 97 N N . ASN 1395 1395 ? A 3.361 12.239 -9.566 1 1 A ASN 0.730 1 ATOM 98 C CA . ASN 1395 1395 ? A 3.352 12.626 -10.961 1 1 A ASN 0.730 1 ATOM 99 C C . ASN 1395 1395 ? 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A -6.997 16.419 -9.701 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 205 C CG . HIS 1407 1407 ? A -8.019 17.353 -10.299 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 206 N ND1 . HIS 1407 1407 ? A -9.233 16.802 -10.560 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 207 C CD2 . HIS 1407 1407 ? A -8.089 18.714 -10.417 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 208 C CE1 . HIS 1407 1407 ? A -10.040 17.804 -10.829 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 209 N NE2 . HIS 1407 1407 ? A -9.395 18.989 -10.757 1 1 A HIS 0.730 1 ATOM 210 N N . THR 1408 1408 ? A -8.824 16.952 -6.584 1 1 A THR 0.770 1 ATOM 211 C CA . THR 1408 1408 ? A -9.336 18.028 -5.748 1 1 A THR 0.770 1 ATOM 212 C C . THR 1408 1408 ? A -10.205 17.359 -4.690 1 1 A THR 0.770 1 ATOM 213 O O . THR 1408 1408 ? A -10.562 16.206 -4.939 1 1 A THR 0.770 1 ATOM 214 C CB . THR 1408 1408 ? A -10.053 19.094 -6.587 1 1 A THR 0.770 1 ATOM 215 O OG1 . THR 1408 1408 ? A -10.394 20.267 -5.875 1 1 A THR 0.770 1 ATOM 216 C CG2 . THR 1408 1408 ? A -11.321 18.545 -7.243 1 1 A THR 0.770 1 ATOM 217 N N . PRO 1409 1409 ? 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A -26.245 14.542 -2.943 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 257 C CB . VAL 1414 1414 ? A -25.505 15.699 -5.789 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 258 C CG1 . VAL 1414 1414 ? A -25.872 16.806 -6.803 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 259 C CG2 . VAL 1414 1414 ? A -24.166 15.029 -6.168 1 1 A VAL 0.340 1 ATOM 260 N N . VAL 1415 1415 ? A -24.050 15.023 -2.793 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 261 C CA . VAL 1415 1415 ? A -23.677 13.930 -1.893 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 262 C C . VAL 1415 1415 ? A -23.728 14.419 -0.453 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 263 O O . VAL 1415 1415 ? A -22.737 14.668 0.225 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 264 C CB . VAL 1415 1415 ? A -22.332 13.242 -2.214 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 265 C CG1 . VAL 1415 1415 ? A -22.414 12.570 -3.594 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 266 C CG2 . VAL 1415 1415 ? A -21.124 14.188 -2.265 1 1 A VAL 0.570 1 ATOM 267 N N . LYS 1416 1416 ? A -24.963 14.576 0.059 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 268 C CA . LYS 1416 1416 ? A -25.249 15.150 1.361 1 1 A LYS 0.490 1 ATOM 269 C C . LYS 1416 1416 ? 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ARG 1438 1438 ? A 13.121 22.862 2.850 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 471 N NH2 . ARG 1438 1438 ? A 13.294 22.604 0.582 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 472 N N . LEU 1439 1439 ? A 4.866 19.645 4.425 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 473 C CA . LEU 1439 1439 ? A 3.975 19.430 5.548 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 474 C C . LEU 1439 1439 ? A 4.144 18.090 6.190 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 475 O O . LEU 1439 1439 ? A 4.047 17.978 7.406 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 476 C CB . LEU 1439 1439 ? A 2.487 19.617 5.182 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 477 C CG . LEU 1439 1439 ? A 2.135 21.075 4.843 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 478 C CD1 . LEU 1439 1439 ? A 0.646 21.204 4.506 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 479 C CD2 . LEU 1439 1439 ? A 2.509 22.094 5.936 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 480 N N . TYR 1440 1440 ? A 4.389 17.052 5.368 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 481 C CA . TYR 1440 1440 ? A 4.608 15.698 5.821 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 482 C C . TYR 1440 1440 ? A 5.878 15.503 6.671 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 483 O O . TYR 1440 1440 ? A 6.950 15.690 6.115 1 1 A TYR 0.680 1 ATOM 484 C CB . 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PRO 1441 1441 ? A 4.829 15.325 8.972 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 499 N N . SER 1442 1442 ? A 7.173 12.474 7.330 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 500 C CA . SER 1442 1442 ? A 7.871 11.360 6.700 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 501 C C . SER 1442 1442 ? A 7.042 10.800 5.580 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 502 O O . SER 1442 1442 ? A 5.882 11.151 5.384 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 503 C CB . SER 1442 1442 ? A 8.282 10.186 7.658 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 504 O OG . SER 1442 1442 ? A 7.192 9.362 8.086 1 1 A SER 0.690 1 ATOM 505 N N . ARG 1443 1443 ? A 7.638 9.883 4.791 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 506 C CA . ARG 1443 1443 ? A 6.969 9.246 3.681 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 507 C C . ARG 1443 1443 ? A 5.770 8.420 4.020 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 508 O O . ARG 1443 1443 ? A 4.883 8.221 3.192 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 509 C CB . ARG 1443 1443 ? A 7.907 8.280 2.937 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 510 C CG . ARG 1443 1443 ? A 8.484 7.058 3.688 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 511 C CD . ARG 1443 1443 ? A 8.901 5.953 2.721 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 512 N NE . ARG 1443 1443 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.677 2 1 3 0.061 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1382 PRO 1 0.450 2 1 A 1383 MET 1 0.440 3 1 A 1384 VAL 1 0.470 4 1 A 1385 THR 1 0.450 5 1 A 1386 LEU 1 0.630 6 1 A 1387 SER 1 0.610 7 1 A 1388 SER 1 0.550 8 1 A 1389 ILE 1 0.610 9 1 A 1390 LEU 1 0.610 10 1 A 1391 GLU 1 0.580 11 1 A 1392 SER 1 0.710 12 1 A 1393 ILE 1 0.740 13 1 A 1394 ILE 1 0.740 14 1 A 1395 ASN 1 0.730 15 1 A 1396 ASP 1 0.780 16 1 A 1397 MET 1 0.730 17 1 A 1398 ARG 1 0.650 18 1 A 1399 ASP 1 0.720 19 1 A 1400 LEU 1 0.740 20 1 A 1401 PRO 1 0.760 21 1 A 1402 ASN 1 0.580 22 1 A 1403 THR 1 0.620 23 1 A 1404 TYR 1 0.720 24 1 A 1405 PRO 1 0.750 25 1 A 1406 PHE 1 0.730 26 1 A 1407 HIS 1 0.730 27 1 A 1408 THR 1 0.770 28 1 A 1409 PRO 1 0.780 29 1 A 1410 VAL 1 0.720 30 1 A 1411 ASN 1 0.640 31 1 A 1412 ALA 1 0.650 32 1 A 1413 LYS 1 0.530 33 1 A 1414 VAL 1 0.340 34 1 A 1415 VAL 1 0.570 35 1 A 1416 LYS 1 0.490 36 1 A 1417 ASP 1 0.660 37 1 A 1418 TYR 1 0.740 38 1 A 1419 TYR 1 0.750 39 1 A 1420 LYS 1 0.690 40 1 A 1421 ILE 1 0.730 41 1 A 1422 ILE 1 0.790 42 1 A 1423 THR 1 0.770 43 1 A 1424 ARG 1 0.750 44 1 A 1425 PRO 1 0.860 45 1 A 1426 MET 1 0.790 46 1 A 1427 ASP 1 0.790 47 1 A 1428 LEU 1 0.770 48 1 A 1429 GLN 1 0.750 49 1 A 1430 THR 1 0.830 50 1 A 1431 LEU 1 0.790 51 1 A 1432 ARG 1 0.720 52 1 A 1433 GLU 1 0.730 53 1 A 1434 ASN 1 0.730 54 1 A 1435 VAL 1 0.750 55 1 A 1436 ARG 1 0.630 56 1 A 1437 LYS 1 0.660 57 1 A 1438 ARG 1 0.590 58 1 A 1439 LEU 1 0.660 59 1 A 1440 TYR 1 0.680 60 1 A 1441 PRO 1 0.690 61 1 A 1442 SER 1 0.690 62 1 A 1443 ARG 1 0.590 63 1 A 1444 GLU 1 0.670 64 1 A 1445 GLU 1 0.710 65 1 A 1446 PHE 1 0.700 66 1 A 1447 ARG 1 0.700 67 1 A 1448 GLU 1 0.740 68 1 A 1449 HIS 1 0.820 69 1 A 1450 LEU 1 0.790 70 1 A 1451 GLU 1 0.750 71 1 A 1452 LEU 1 0.820 72 1 A 1453 ILE 1 0.750 73 1 A 1454 VAL 1 0.740 74 1 A 1455 LYS 1 0.740 75 1 A 1456 ASN 1 0.790 76 1 A 1457 SER 1 0.780 77 1 A 1458 ALA 1 0.740 78 1 A 1459 THR 1 0.750 79 1 A 1460 TYR 1 0.740 80 1 A 1461 ASN 1 0.760 81 1 A 1462 GLY 1 0.580 82 1 A 1463 PRO 1 0.520 83 1 A 1464 LYS 1 0.490 84 1 A 1465 HIS 1 0.600 85 1 A 1466 SER 1 0.680 86 1 A 1467 LEU 1 0.740 87 1 A 1468 THR 1 0.660 88 1 A 1469 GLN 1 0.670 89 1 A 1470 ILE 1 0.700 90 1 A 1471 SER 1 0.690 91 1 A 1472 GLN 1 0.700 92 1 A 1473 SER 1 0.740 93 1 A 1474 MET 1 0.690 94 1 A 1475 LEU 1 0.740 95 1 A 1476 ASP 1 0.770 96 1 A 1477 LEU 1 0.810 97 1 A 1478 CYS 1 0.780 98 1 A 1479 ASP 1 0.750 99 1 A 1480 GLU 1 0.740 100 1 A 1481 LYS 1 0.670 101 1 A 1482 LEU 1 0.640 102 1 A 1483 LYS 1 0.620 103 1 A 1484 GLU 1 0.550 104 1 A 1485 LYS 1 0.510 105 1 A 1486 GLU 1 0.400 106 1 A 1487 ASP 1 0.360 107 1 A 1488 LYS 1 0.270 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #