data_SMR-ab84fc09cd16ec6b1e1561611fc2f45a_4 _entry.id SMR-ab84fc09cd16ec6b1e1561611fc2f45a_4 _struct.entry_id SMR-ab84fc09cd16ec6b1e1561611fc2f45a_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8IVV2/ LOXH1_HUMAN, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.024, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8IVV2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 273198.396 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP LOXH1_HUMAN Q8IVV2 1 ;MMPQKKRRRKKDIDFLALYEAELLNYASEDDEGELEHEYYKARVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGE NGLSPKLQLTSKSKSAFEKGNVDVFRVRTNNVGLIYKVRIEHDNTGLNASWYLDHVIVTDMKRPHLRYYF NCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFNPMDMPRGNKYEVKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLEN EKDNFEKGAEDRFILDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSQIVIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDG KIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDVRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHIE LAVLLSPLSRVSVGHGNVGVNRGWFCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKK RLKKFPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGQKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRIELPDLGRFYKIR VWHDKRSSGSGWHLERMTLMNTLNKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYHVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRNVRRVRIRHDGKGSG SGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSSATLKNFRYHISLKTGDVSGAST DSRVYIKLYGDKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGNINRLVIGHDSTGMHASWFLGSV QIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEVEIWTGDVGGAGTSARVYMQIYG EKGKTEVLFLSSRSKVFERASKDTFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRAGWFLDRIDITDMNNEI TYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPQSEEGRGGGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGVK KNAGTDANVFITLFGTQDDTGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRLGHDNTGKAPGWF VDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIIRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDANI FIIIYGCDAVCTQQKYLCTNKREQKQFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHNNTGMNPGWHCSHVDI RRLLPDKDGAETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQI FTGNIPGAGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFERGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNSKW CADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKMA DVDISTVTGPMADYVQEGPIIPYYVSVTTGKHKDAATDSRAFIFLIGEDDERSKRIWLDYPRGKRGFSRG SVEEFYVAGLDVGIIKKIELGHDGASPESCWLVEELCLAVPTQGTKYMLNCNCWLAKDRGDGITSRVFDL LDAMVVNIGVKVLYEMTVWTGDVVGGGTDSNIFMTLYGINGSTEEMQLDKKKARFEREQNDTFIMEILDI APFTKMRIRIDGLGSRPEWFLERILLKNMNTGDLTMFYYGDWLSQRKGKKTLVCEMCAVIDEEEMMEWTS YTVAVKTSDILGAGTDANVFIIIFGENGDSGTLALKQSANWNKFERNNTDTFNFPDMLSLGHLCKLRVWH DNKGIFPGWHLSYVDVKDNSRDETFHFQCDCWLSKSEGDGQTVRDFACANNKICDELEETTYEIVIETGN GGETRENVWLILEGRKNRSKEFLMENSSRQRAFRKGTTDTFEFDSIYLGDIASLCVGHLAREDRFIPKRE LAWHVKTITITEMEYGNVYFFNCDCLIPLKRKRKYFKVFEVTKTTESFASKVQSLVPVKYEVIVTTGYEP GAGTDANVFVTIFGANGDTGKRELKQKMRNLFERGSTDRFFLETLELGELRKVRLEHDSSGYCSGWLVEK VEVTNTSTGVATIFNCGRWLDKKRGDGLTWRDLFPSV ; 'Lipoxygenase homology domain-containing protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2067 1 2067 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . LOXH1_HUMAN Q8IVV2 . 1 2067 9606 'Homo sapiens (Human)' 2018-09-12 DE990B7BB824A094 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MMPQKKRRRKKDIDFLALYEAELLNYASEDDEGELEHEYYKARVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGE NGLSPKLQLTSKSKSAFEKGNVDVFRVRTNNVGLIYKVRIEHDNTGLNASWYLDHVIVTDMKRPHLRYYF NCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFNPMDMPRGNKYEVKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLEN EKDNFEKGAEDRFILDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSQIVIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDG KIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDVRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHIE LAVLLSPLSRVSVGHGNVGVNRGWFCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKK RLKKFPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGQKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRIELPDLGRFYKIR VWHDKRSSGSGWHLERMTLMNTLNKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYHVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRNVRRVRIRHDGKGSG 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VWHDKRSSGSGWHLERMTLMNTLNKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYHVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRNVRRVRIRHDGKGSG SGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSSATLKNFRYHISLKTGDVSGAST DSRVYIKLYGDKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGNINRLVIGHDSTGMHASWFLGSV QIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEVEIWTGDVGGAGTSARVYMQIYG EKGKTEVLFLSSRSKVFERASKDTFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRAGWFLDRIDITDMNNEI TYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPQSEEGRGGGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGVK KNAGTDANVFITLFGTQDDTGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRLGHDNTGKAPGWF VDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIIRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDANI FIIIYGCDAVCTQQKYLCTNKREQKQFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHNNTGMNPGWHCSHVDI RRLLPDKDGAETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQI FTGNIPGAGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFERGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNSKW CADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKMA DVDISTVTGPMADYVQEGPIIPYYVSVTTGKHKDAATDSRAFIFLIGEDDERSKRIWLDYPRGKRGFSRG 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A 1 1843 LEU 1843 ? ? ? B . A 1 1844 MET 1844 ? ? ? B . A 1 1845 GLU 1845 ? ? ? B . A 1 1846 ASN 1846 ? ? ? B . A 1 1847 SER 1847 ? ? ? B . A 1 1848 SER 1848 ? ? ? B . A 1 1849 ARG 1849 ? ? ? B . A 1 1850 GLN 1850 ? ? ? B . A 1 1851 ARG 1851 ? ? ? B . A 1 1852 ALA 1852 ? ? ? B . A 1 1853 PHE 1853 ? ? ? B . A 1 1854 ARG 1854 ? ? ? B . A 1 1855 LYS 1855 ? ? ? B . A 1 1856 GLY 1856 ? ? ? B . A 1 1857 THR 1857 ? ? ? B . A 1 1858 THR 1858 ? ? ? B . A 1 1859 ASP 1859 ? ? ? B . A 1 1860 THR 1860 ? ? ? B . A 1 1861 PHE 1861 ? ? ? B . A 1 1862 GLU 1862 ? ? ? B . A 1 1863 PHE 1863 ? ? ? B . A 1 1864 ASP 1864 ? ? ? B . A 1 1865 SER 1865 ? ? ? B . A 1 1866 ILE 1866 ? ? ? B . A 1 1867 TYR 1867 ? ? ? B . A 1 1868 LEU 1868 ? ? ? B . A 1 1869 GLY 1869 ? ? ? B . A 1 1870 ASP 1870 ? ? ? B . A 1 1871 ILE 1871 ? ? ? B . A 1 1872 ALA 1872 ? ? ? B . A 1 1873 SER 1873 ? ? ? B . A 1 1874 LEU 1874 ? ? ? B . A 1 1875 CYS 1875 ? ? ? B . A 1 1876 VAL 1876 ? ? ? B . A 1 1877 GLY 1877 ? ? ? B . A 1 1878 HIS 1878 ? ? ? B . A 1 1879 LEU 1879 ? ? ? B . A 1 1880 ALA 1880 ? ? ? B . A 1 1881 ARG 1881 ? ? ? B . A 1 1882 GLU 1882 ? ? ? B . A 1 1883 ASP 1883 ? ? ? B . A 1 1884 ARG 1884 ? ? ? B . A 1 1885 PHE 1885 ? ? ? B . A 1 1886 ILE 1886 ? ? ? B . A 1 1887 PRO 1887 ? ? ? B . A 1 1888 LYS 1888 ? ? ? B . A 1 1889 ARG 1889 ? ? ? B . A 1 1890 GLU 1890 ? ? ? B . A 1 1891 LEU 1891 ? ? ? B . A 1 1892 ALA 1892 ? ? ? B . A 1 1893 TRP 1893 ? ? ? B . A 1 1894 HIS 1894 ? ? ? B . A 1 1895 VAL 1895 ? ? ? B . A 1 1896 LYS 1896 ? ? ? B . A 1 1897 THR 1897 ? ? ? B . A 1 1898 ILE 1898 ? ? ? B . A 1 1899 THR 1899 ? ? ? B . A 1 1900 ILE 1900 ? ? ? B . A 1 1901 THR 1901 ? ? ? B . A 1 1902 GLU 1902 ? ? ? B . A 1 1903 MET 1903 ? ? ? B . A 1 1904 GLU 1904 ? ? ? B . A 1 1905 TYR 1905 ? ? ? B . A 1 1906 GLY 1906 ? ? ? B . A 1 1907 ASN 1907 ? ? ? B . A 1 1908 VAL 1908 ? ? ? B . A 1 1909 TYR 1909 ? ? ? B . A 1 1910 PHE 1910 ? ? ? B . A 1 1911 PHE 1911 ? ? ? B . A 1 1912 ASN 1912 ? ? ? B . A 1 1913 CYS 1913 ? ? ? B . A 1 1914 ASP 1914 ? ? ? B . A 1 1915 CYS 1915 ? ? ? B . A 1 1916 LEU 1916 ? ? ? B . A 1 1917 ILE 1917 ? ? ? B . A 1 1918 PRO 1918 ? ? ? B . A 1 1919 LEU 1919 ? ? ? B . A 1 1920 LYS 1920 ? ? ? B . A 1 1921 ARG 1921 ? ? ? B . A 1 1922 LYS 1922 ? ? ? B . A 1 1923 ARG 1923 ? ? ? B . A 1 1924 LYS 1924 ? ? ? B . A 1 1925 TYR 1925 ? ? ? B . A 1 1926 PHE 1926 ? ? ? B . A 1 1927 LYS 1927 ? ? ? B . A 1 1928 VAL 1928 ? ? ? B . A 1 1929 PHE 1929 ? ? ? B . A 1 1930 GLU 1930 ? ? ? B . A 1 1931 VAL 1931 ? ? ? B . A 1 1932 THR 1932 ? ? ? B . A 1 1933 LYS 1933 ? ? ? B . A 1 1934 THR 1934 ? ? ? B . A 1 1935 THR 1935 ? ? ? B . A 1 1936 GLU 1936 ? ? ? B . A 1 1937 SER 1937 ? ? ? B . A 1 1938 PHE 1938 ? ? ? B . A 1 1939 ALA 1939 ? ? ? B . A 1 1940 SER 1940 ? ? ? B . A 1 1941 LYS 1941 ? ? ? B . A 1 1942 VAL 1942 ? ? ? B . A 1 1943 GLN 1943 ? ? ? B . A 1 1944 SER 1944 ? ? ? B . A 1 1945 LEU 1945 ? ? ? B . A 1 1946 VAL 1946 ? ? ? B . A 1 1947 PRO 1947 ? ? ? B . A 1 1948 VAL 1948 ? ? ? B . A 1 1949 LYS 1949 ? ? ? B . A 1 1950 TYR 1950 ? ? ? B . A 1 1951 GLU 1951 ? ? ? B . A 1 1952 VAL 1952 ? ? ? B . A 1 1953 ILE 1953 ? ? ? B . A 1 1954 VAL 1954 ? ? ? B . A 1 1955 THR 1955 ? ? ? B . A 1 1956 THR 1956 ? ? ? B . A 1 1957 GLY 1957 ? ? ? B . A 1 1958 TYR 1958 ? ? ? B . A 1 1959 GLU 1959 ? ? ? B . A 1 1960 PRO 1960 ? ? ? B . A 1 1961 GLY 1961 ? ? ? B . A 1 1962 ALA 1962 ? ? ? B . A 1 1963 GLY 1963 ? ? ? B . A 1 1964 THR 1964 ? ? ? B . A 1 1965 ASP 1965 ? ? ? B . A 1 1966 ALA 1966 ? ? ? B . A 1 1967 ASN 1967 ? ? ? B . A 1 1968 VAL 1968 ? ? ? B . A 1 1969 PHE 1969 ? ? ? B . A 1 1970 VAL 1970 ? ? ? B . A 1 1971 THR 1971 ? ? ? B . A 1 1972 ILE 1972 ? ? ? B . A 1 1973 PHE 1973 ? ? ? B . A 1 1974 GLY 1974 ? ? ? B . A 1 1975 ALA 1975 ? ? ? B . A 1 1976 ASN 1976 ? ? ? B . A 1 1977 GLY 1977 ? ? ? B . A 1 1978 ASP 1978 ? ? ? B . A 1 1979 THR 1979 ? ? ? B . A 1 1980 GLY 1980 ? ? ? B . A 1 1981 LYS 1981 ? ? ? B . A 1 1982 ARG 1982 ? ? ? B . A 1 1983 GLU 1983 ? ? ? B . A 1 1984 LEU 1984 ? ? ? B . A 1 1985 LYS 1985 ? ? ? B . A 1 1986 GLN 1986 ? ? ? B . A 1 1987 LYS 1987 ? ? ? B . A 1 1988 MET 1988 ? ? ? B . A 1 1989 ARG 1989 ? ? ? B . A 1 1990 ASN 1990 ? ? ? B . A 1 1991 LEU 1991 ? ? ? B . A 1 1992 PHE 1992 ? ? ? B . A 1 1993 GLU 1993 ? ? ? B . A 1 1994 ARG 1994 ? ? ? B . A 1 1995 GLY 1995 ? ? ? B . A 1 1996 SER 1996 ? ? ? B . A 1 1997 THR 1997 ? ? ? B . A 1 1998 ASP 1998 ? ? ? B . A 1 1999 ARG 1999 ? ? ? B . A 1 2000 PHE 2000 ? ? ? B . A 1 2001 PHE 2001 ? ? ? B . A 1 2002 LEU 2002 ? ? ? B . A 1 2003 GLU 2003 ? ? ? B . A 1 2004 THR 2004 ? ? ? B . A 1 2005 LEU 2005 ? ? ? B . A 1 2006 GLU 2006 ? ? ? B . A 1 2007 LEU 2007 ? ? ? B . A 1 2008 GLY 2008 ? ? ? B . A 1 2009 GLU 2009 ? ? ? B . A 1 2010 LEU 2010 ? ? ? B . A 1 2011 ARG 2011 ? ? ? B . A 1 2012 LYS 2012 ? ? ? B . A 1 2013 VAL 2013 ? ? ? B . A 1 2014 ARG 2014 ? ? ? B . A 1 2015 LEU 2015 ? ? ? B . A 1 2016 GLU 2016 ? ? ? B . A 1 2017 HIS 2017 ? ? ? B . A 1 2018 ASP 2018 ? ? ? B . A 1 2019 SER 2019 ? ? ? B . A 1 2020 SER 2020 ? ? ? B . A 1 2021 GLY 2021 ? ? ? B . A 1 2022 TYR 2022 ? ? ? B . A 1 2023 CYS 2023 ? ? ? B . A 1 2024 SER 2024 ? ? ? B . A 1 2025 GLY 2025 ? ? ? B . A 1 2026 TRP 2026 ? ? ? B . A 1 2027 LEU 2027 ? ? ? B . A 1 2028 VAL 2028 ? ? ? B . A 1 2029 GLU 2029 ? ? ? B . A 1 2030 LYS 2030 ? ? ? B . A 1 2031 VAL 2031 ? ? ? B . A 1 2032 GLU 2032 ? ? ? B . A 1 2033 VAL 2033 ? ? ? B . A 1 2034 THR 2034 ? ? ? B . A 1 2035 ASN 2035 ? ? ? B . A 1 2036 THR 2036 ? ? ? B . A 1 2037 SER 2037 ? ? ? B . A 1 2038 THR 2038 ? ? ? B . A 1 2039 GLY 2039 ? ? ? B . A 1 2040 VAL 2040 ? ? ? B . A 1 2041 ALA 2041 ? ? ? B . A 1 2042 THR 2042 ? ? ? B . A 1 2043 ILE 2043 ? ? ? B . A 1 2044 PHE 2044 ? ? ? B . A 1 2045 ASN 2045 ? ? ? B . A 1 2046 CYS 2046 ? ? ? B . A 1 2047 GLY 2047 ? ? ? B . A 1 2048 ARG 2048 ? ? ? B . A 1 2049 TRP 2049 ? ? ? B . A 1 2050 LEU 2050 ? ? ? B . A 1 2051 ASP 2051 ? ? ? B . A 1 2052 LYS 2052 ? ? ? B . A 1 2053 LYS 2053 ? ? ? B . A 1 2054 ARG 2054 ? ? ? B . A 1 2055 GLY 2055 ? ? ? B . A 1 2056 ASP 2056 ? ? ? B . A 1 2057 GLY 2057 ? ? ? B . A 1 2058 LEU 2058 ? ? ? B . A 1 2059 THR 2059 ? ? ? B . A 1 2060 TRP 2060 ? ? ? B . A 1 2061 ARG 2061 ? ? ? B . A 1 2062 ASP 2062 ? ? ? B . A 1 2063 LEU 2063 ? ? ? B . A 1 2064 PHE 2064 ? ? ? B . A 1 2065 PRO 2065 ? ? ? B . A 1 2066 SER 2066 ? ? ? B . A 1 2067 VAL 2067 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Rab6-interacting protein 1 {PDB ID=3cwz, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=3cwz.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 3cwz, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;EHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVE LGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLSTSGILLDS ERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYK RYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET QILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGS LERVLVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIR ; ;EHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVE LGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLSTSGILLDS ERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYK RYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET QILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGS LERVLVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 244 358 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3cwz 2024-02-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2067 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2068 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.2e-17 29.825 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMPQKKRRRKKDIDFLALYEAELLNYASEDDEGELEHEYYKARVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGENGLSPKLQLTSKSKSAFEKGNVDVFRVRTNNVGLIYKVRIEHDNTGLNASWYLDHVIVTDMKRPHLRYYFNCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFNPMDMPRGNKYEVKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLENEKDNFEKGAEDRFILDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSQIVIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDGKIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDVRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHIELAVLLSPLSRVSVGHGNVGVNRGWFCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKKRLKKFPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGQKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRIELPDLGRFYKIRVWHDKRSSGSGWHLERMTLMNTLNKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYHVTVCTGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRNVRRVRIRHDGKGSGSGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSSATLKNFRYHISLKTGDVSGASTDSRVYIKLYGDKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGNINRLVIGHDSTGMHASWFLGSVQIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEVEIWTGDVGGAGTSARVYMQIYGEKGKTEVLFLSSRSKVFERASKDTFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRAGWFLDRIDITDMNNEITYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPQSEEGRGGGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGVKKNAGTDANVFITLFGTQDDTGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRLGHDNTGKAPGWFVDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIIRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDANIFIIIYGCDAVCTQQKYLCTNKREQKQFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHNNTGMNPGWHCSHVDIRRLLPDKDGAETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQIFTGNIPG-AGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFERGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNSKWCADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKMADVDISTVTGPMADYVQEGPIIPYYVSVTTGKHKDAATDSRAFIFLIGEDDERSKRIWLDYPRGKRGFSRGSVEEFYVAGLDVGIIKKIELGHDGASPESCWLVEELCLAVPTQGTKYMLNCNCWLAKDRGDGITSRVFDLLDAMVVNIGVKVLYEMTVWTGDVVGGGTDSNIFMTLYGINGSTEEMQLDKKKARFEREQNDTFIMEILDIAPFTKMRIRIDGLGSRPEWFLERILLKNMNTGDLTMFYYGDWLSQRKGKKTLVCEMCAVIDEEEMMEWTSYTVAVKTSDILGAGTDANVFIIIFGENGDSGTLALKQSANWNKFERNNTDTFNFPDMLSLGHLCKLRVWHDNKGIFPGWHLSYVDVKDNSRDETFHFQCDCWLSKSEGDGQTVRDFACANNKICDELEETTYEIVIETGNGGETRENVWLILEGRKNRSKEFLMENSSRQRAFRKGTTDTFEFDSIYLGDIASLCVGHLAREDRFIPKRELAWHVKTITITEMEYGNVYFFNCDCLIPLKRKRKYFKVFEVTKTTESFASKVQSLVPVKYEVIVTTGYEPGAGTDANVFVTIFGANGDTGKRELKQKMRNLFERGSTDRFFLETLELGELRKVRLEHDSSGYCSGWLVEKVEVTNTSTGVATIFNCGRWLDKKRGDGLTWRDLFPSV 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGETQILQIPR-----------NVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERVLVGE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3cwz.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 1250 1250 ? A -8.700 32.535 157.867 1 1 B PRO 0.250 1 ATOM 2 C CA . PRO 1250 1250 ? A -10.181 32.612 157.707 1 1 B PRO 0.250 1 ATOM 3 C C . PRO 1250 1250 ? A -10.906 31.833 158.776 1 1 B PRO 0.250 1 ATOM 4 O O . PRO 1250 1250 ? A -12.125 31.894 158.761 1 1 B PRO 0.250 1 ATOM 5 C CB . PRO 1250 1250 ? A -10.410 32.020 156.309 1 1 B PRO 0.250 1 ATOM 6 C CG . PRO 1250 1250 ? A -9.288 30.995 156.096 1 1 B PRO 0.250 1 ATOM 7 C CD . PRO 1250 1250 ? A -8.120 31.479 156.960 1 1 B PRO 0.250 1 ATOM 8 N N . LEU 1251 1251 ? A -10.250 31.078 159.690 1 1 B LEU 0.170 1 ATOM 9 C CA . LEU 1251 1251 ? A -11.016 30.329 160.682 1 1 B LEU 0.170 1 ATOM 10 C C . LEU 1251 1251 ? A -10.717 30.727 162.109 1 1 B LEU 0.170 1 ATOM 11 O O . LEU 1251 1251 ? A -11.299 30.181 163.043 1 1 B LEU 0.170 1 ATOM 12 C CB . LEU 1251 1251 ? A -10.809 28.800 160.535 1 1 B LEU 0.170 1 ATOM 13 C CG . LEU 1251 1251 ? A -11.374 28.187 159.236 1 1 B LEU 0.170 1 ATOM 14 C CD1 . LEU 1251 1251 ? A -11.047 26.690 159.153 1 1 B LEU 0.170 1 ATOM 15 C CD2 . LEU 1251 1251 ? A -12.892 28.380 159.110 1 1 B LEU 0.170 1 ATOM 16 N N . ASP 1252 1252 ? A -9.843 31.720 162.319 1 1 B ASP 0.310 1 ATOM 17 C CA . ASP 1252 1252 ? A -9.541 32.220 163.638 1 1 B ASP 0.310 1 ATOM 18 C C . ASP 1252 1252 ? A -10.635 33.119 164.195 1 1 B ASP 0.310 1 ATOM 19 O O . ASP 1252 1252 ? A -11.405 33.754 163.474 1 1 B ASP 0.310 1 ATOM 20 C CB . ASP 1252 1252 ? A -8.195 32.974 163.650 1 1 B ASP 0.310 1 ATOM 21 C CG . ASP 1252 1252 ? A -7.109 32.065 163.109 1 1 B ASP 0.310 1 ATOM 22 O OD1 . ASP 1252 1252 ? A -7.001 30.920 163.612 1 1 B ASP 0.310 1 ATOM 23 O OD2 . ASP 1252 1252 ? A -6.418 32.482 162.143 1 1 B ASP 0.310 1 ATOM 24 N N . ILE 1253 1253 ? A -10.727 33.182 165.532 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 25 C CA . ILE 1253 1253 ? A -11.598 34.104 166.228 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 26 C C . ILE 1253 1253 ? A -11.038 35.517 166.195 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 27 O O . ILE 1253 1253 ? A -9.866 35.768 166.469 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 28 C CB . ILE 1253 1253 ? A -11.876 33.655 167.647 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 29 C CG1 . ILE 1253 1253 ? A -10.572 33.318 168.402 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 30 C CG2 . ILE 1253 1253 ? A -12.795 32.421 167.552 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 31 C CD1 . ILE 1253 1253 ? A -10.790 33.106 169.897 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 32 N N . VAL 1254 1254 ? A -11.875 36.488 165.801 1 1 B VAL 0.510 1 ATOM 33 C CA . VAL 1254 1254 ? A -11.472 37.876 165.672 1 1 B VAL 0.510 1 ATOM 34 C C . VAL 1254 1254 ? A -12.493 38.714 166.399 1 1 B VAL 0.510 1 ATOM 35 O O . VAL 1254 1254 ? A -13.698 38.479 166.336 1 1 B VAL 0.510 1 ATOM 36 C CB . VAL 1254 1254 ? A -11.295 38.355 164.233 1 1 B VAL 0.510 1 ATOM 37 C CG1 . VAL 1254 1254 ? A -10.814 39.819 164.191 1 1 B VAL 0.510 1 ATOM 38 C CG2 . VAL 1254 1254 ? A -10.240 37.473 163.545 1 1 B VAL 0.510 1 ATOM 39 N N . LEU 1255 1255 ? A -12.020 39.707 167.168 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 40 C CA . LEU 1255 1255 ? A -12.869 40.529 167.985 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 41 C C . LEU 1255 1255 ? A -13.173 41.801 167.212 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 42 O O . LEU 1255 1255 ? A -12.298 42.437 166.626 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 43 C CB . LEU 1255 1255 ? A -12.205 40.805 169.359 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 44 C CG . LEU 1255 1255 ? A -12.064 39.580 170.301 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 45 C CD1 . LEU 1255 1255 ? A -11.023 38.546 169.843 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 46 C CD2 . LEU 1255 1255 ? A -11.706 40.027 171.725 1 1 B LEU 0.570 1 ATOM 47 N N . TYR 1256 1256 ? A -14.464 42.158 167.135 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 48 C CA . TYR 1256 1256 ? A -14.924 43.294 166.381 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 49 C C . TYR 1256 1256 ? A -15.536 44.275 167.352 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 50 O O . TYR 1256 1256 ? A -16.588 44.039 167.949 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 51 C CB . TYR 1256 1256 ? A -15.963 42.892 165.300 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 52 C CG . TYR 1256 1256 ? A -15.306 42.087 164.206 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 53 C CD1 . TYR 1256 1256 ? A -15.232 40.688 164.306 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 54 C CD2 . TYR 1256 1256 ? A -14.753 42.714 163.073 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 55 C CE1 . TYR 1256 1256 ? A -14.604 39.930 163.308 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 56 C CE2 . TYR 1256 1256 ? A -14.120 41.957 162.073 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 57 C CZ . TYR 1256 1256 ? A -14.043 40.567 162.197 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 58 O OH . TYR 1256 1256 ? A -13.394 39.801 161.211 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 59 N N . SER 1257 1257 ? A -14.863 45.421 167.531 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 60 C CA . SER 1257 1257 ? A -15.331 46.512 168.361 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 61 C C . SER 1257 1257 ? A -16.414 47.284 167.648 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 62 O O . SER 1257 1257 ? A -16.199 47.808 166.557 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 63 C CB . SER 1257 1257 ? A -14.164 47.446 168.757 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 64 O OG . SER 1257 1257 ? A -14.579 48.520 169.605 1 1 B SER 0.670 1 ATOM 65 N N . VAL 1258 1258 ? A -17.629 47.340 168.225 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 66 C CA . VAL 1258 1258 ? A -18.751 48.026 167.617 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 67 C C . VAL 1258 1258 ? A -18.955 49.329 168.331 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 68 O O . VAL 1258 1258 ? A -18.955 49.368 169.556 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 69 C CB . VAL 1258 1258 ? A -20.072 47.236 167.557 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 70 C CG1 . VAL 1258 1258 ? A -19.756 45.753 167.318 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 71 C CG2 . VAL 1258 1258 ? A -20.981 47.378 168.797 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 72 N N . GLN 1259 1259 ? A -19.137 50.431 167.586 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 73 C CA . GLN 1259 1259 ? A -19.517 51.707 168.156 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 74 C C . GLN 1259 1259 ? A -20.639 52.310 167.323 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 75 O O . GLN 1259 1259 ? A -20.529 52.474 166.112 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 76 C CB . GLN 1259 1259 ? A -18.308 52.672 168.232 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 77 C CG . GLN 1259 1259 ? A -18.578 54.024 168.935 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 78 C CD . GLN 1259 1259 ? A -17.285 54.836 169.042 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 79 O OE1 . GLN 1259 1259 ? A -16.241 54.354 169.485 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 80 N NE2 . GLN 1259 1259 ? A -17.342 56.123 168.632 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 81 N N . ILE 1260 1260 ? A -21.782 52.637 167.948 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 82 C CA . ILE 1260 1260 ? A -22.949 53.219 167.307 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 83 C C . ILE 1260 1260 ? A -22.994 54.685 167.637 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 84 O O . ILE 1260 1260 ? A -23.232 55.096 168.768 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 85 C CB . ILE 1260 1260 ? A -24.255 52.583 167.780 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 86 C CG1 . ILE 1260 1260 ? A -24.259 51.096 167.376 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 87 C CG2 . ILE 1260 1260 ? A -25.491 53.322 167.208 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 88 C CD1 . ILE 1260 1260 ? A -25.429 50.302 167.953 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 89 N N . PHE 1261 1261 ? A -22.794 55.547 166.634 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 90 C CA . PHE 1261 1261 ? A -22.769 56.968 166.870 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 91 C C . PHE 1261 1261 ? A -24.156 57.542 166.614 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 92 O O . PHE 1261 1261 ? A -24.623 57.661 165.483 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 93 C CB . PHE 1261 1261 ? A -21.674 57.615 165.989 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 94 C CG . PHE 1261 1261 ? A -21.447 59.063 166.306 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 95 C CD1 . PHE 1261 1261 ? A -21.166 59.485 167.617 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 96 C CD2 . PHE 1261 1261 ? A -21.490 60.016 165.280 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 97 C CE1 . PHE 1261 1261 ? A -20.948 60.841 167.895 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 98 C CE2 . PHE 1261 1261 ? A -21.281 61.370 165.555 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 99 C CZ . PHE 1261 1261 ? A -21.008 61.783 166.862 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 100 N N . THR 1262 1262 ? A -24.879 57.897 167.691 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 101 C CA . THR 1262 1262 ? A -26.223 58.440 167.574 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 102 C C . THR 1262 1262 ? A -26.116 59.937 167.405 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 103 O O . THR 1262 1262 ? A -25.250 60.572 168.003 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 104 C CB . THR 1262 1262 ? A -27.161 58.117 168.721 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 105 O OG1 . THR 1262 1262 ? 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A -25.179 64.056 173.019 1 1 B ASN 0.380 1 ATOM 119 N N . ILE 1265 1265 ? A -28.705 65.450 169.465 1 1 B ILE 0.260 1 ATOM 120 C CA . ILE 1265 1265 ? A -29.506 66.642 169.300 1 1 B ILE 0.260 1 ATOM 121 C C . ILE 1265 1265 ? A -30.809 66.277 170.030 1 1 B ILE 0.260 1 ATOM 122 O O . ILE 1265 1265 ? A -31.121 65.079 170.054 1 1 B ILE 0.260 1 ATOM 123 C CB . ILE 1265 1265 ? A -29.694 66.998 167.816 1 1 B ILE 0.260 1 ATOM 124 C CG1 . ILE 1265 1265 ? A -30.186 68.446 167.575 1 1 B ILE 0.260 1 ATOM 125 C CG2 . ILE 1265 1265 ? A -30.591 65.953 167.125 1 1 B ILE 0.260 1 ATOM 126 C CD1 . ILE 1265 1265 ? A -30.063 68.903 166.115 1 1 B ILE 0.260 1 ATOM 127 N N . PRO 1266 1266 ? A -31.598 67.148 170.667 1 1 B PRO 0.270 1 ATOM 128 C CA . PRO 1266 1266 ? A -32.512 66.691 171.714 1 1 B PRO 0.270 1 ATOM 129 C C . PRO 1266 1266 ? A -33.969 66.582 171.279 1 1 B PRO 0.270 1 ATOM 130 O O . PRO 1266 1266 ? A -34.543 67.519 170.730 1 1 B PRO 0.270 1 ATOM 131 C CB . PRO 1266 1266 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.526 2 1 3 0.024 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1250 PRO 1 0.250 2 1 A 1251 LEU 1 0.170 3 1 A 1252 ASP 1 0.310 4 1 A 1253 ILE 1 0.400 5 1 A 1254 VAL 1 0.510 6 1 A 1255 LEU 1 0.570 7 1 A 1256 TYR 1 0.620 8 1 A 1257 SER 1 0.670 9 1 A 1258 VAL 1 0.710 10 1 A 1259 GLN 1 0.660 11 1 A 1260 ILE 1 0.660 12 1 A 1261 PHE 1 0.600 13 1 A 1262 THR 1 0.580 14 1 A 1263 GLY 1 0.520 15 1 A 1264 ASN 1 0.380 16 1 A 1265 ILE 1 0.260 17 1 A 1266 PRO 1 0.270 18 1 A 1267 GLY 1 0.290 19 1 A 1268 ALA 1 0.310 20 1 A 1269 GLY 1 0.360 21 1 A 1270 THR 1 0.480 22 1 A 1271 ASP 1 0.440 23 1 A 1272 ALA 1 0.590 24 1 A 1273 LYS 1 0.580 25 1 A 1274 VAL 1 0.650 26 1 A 1275 TYR 1 0.660 27 1 A 1276 ILE 1 0.670 28 1 A 1277 THR 1 0.680 29 1 A 1278 ILE 1 0.650 30 1 A 1279 TYR 1 0.610 31 1 A 1280 GLY 1 0.630 32 1 A 1281 ASP 1 0.560 33 1 A 1282 LEU 1 0.540 34 1 A 1283 GLY 1 0.620 35 1 A 1284 ASP 1 0.620 36 1 A 1285 THR 1 0.620 37 1 A 1286 GLY 1 0.590 38 1 A 1287 GLU 1 0.580 39 1 A 1288 ARG 1 0.570 40 1 A 1289 TYR 1 0.530 41 1 A 1290 LEU 1 0.560 42 1 A 1291 GLY 1 0.520 43 1 A 1292 LYS 1 0.450 44 1 A 1293 SER 1 0.390 45 1 A 1294 GLU 1 0.470 46 1 A 1295 ASN 1 0.460 47 1 A 1296 ARG 1 0.280 48 1 A 1297 THR 1 0.280 49 1 A 1298 ASN 1 0.330 50 1 A 1299 LYS 1 0.270 51 1 A 1300 PHE 1 0.210 52 1 A 1301 GLU 1 0.300 53 1 A 1302 ARG 1 0.330 54 1 A 1303 GLY 1 0.390 55 1 A 1304 THR 1 0.460 56 1 A 1305 ALA 1 0.480 57 1 A 1306 ASP 1 0.570 58 1 A 1307 THR 1 0.640 59 1 A 1308 PHE 1 0.550 60 1 A 1309 ILE 1 0.600 61 1 A 1310 ILE 1 0.630 62 1 A 1311 GLU 1 0.570 63 1 A 1312 ALA 1 0.570 64 1 A 1313 ALA 1 0.470 65 1 A 1314 ASP 1 0.520 66 1 A 1315 LEU 1 0.580 67 1 A 1316 GLY 1 0.610 68 1 A 1317 VAL 1 0.590 69 1 A 1318 ILE 1 0.580 70 1 A 1319 TYR 1 0.510 71 1 A 1320 LYS 1 0.620 72 1 A 1321 ILE 1 0.680 73 1 A 1322 LYS 1 0.650 74 1 A 1323 LEU 1 0.660 75 1 A 1324 ARG 1 0.580 76 1 A 1325 HIS 1 0.610 77 1 A 1326 ASP 1 0.620 78 1 A 1327 ASN 1 0.530 79 1 A 1328 SER 1 0.480 80 1 A 1329 LYS 1 0.350 81 1 A 1330 TRP 1 0.320 82 1 A 1331 CYS 1 0.410 83 1 A 1332 ALA 1 0.510 84 1 A 1333 ASP 1 0.530 85 1 A 1334 TRP 1 0.570 86 1 A 1335 TYR 1 0.580 87 1 A 1336 VAL 1 0.650 88 1 A 1337 GLU 1 0.630 89 1 A 1338 LYS 1 0.640 90 1 A 1339 VAL 1 0.700 91 1 A 1340 GLU 1 0.670 92 1 A 1341 ILE 1 0.670 93 1 A 1342 TRP 1 0.640 94 1 A 1343 ASN 1 0.610 95 1 A 1344 ASP 1 0.530 96 1 A 1345 THR 1 0.520 97 1 A 1346 ASN 1 0.510 98 1 A 1347 GLU 1 0.510 99 1 A 1348 ASP 1 0.550 100 1 A 1349 GLU 1 0.590 101 1 A 1350 PHE 1 0.610 102 1 A 1351 LEU 1 0.610 103 1 A 1352 PHE 1 0.610 104 1 A 1353 LEU 1 0.570 105 1 A 1354 CYS 1 0.640 106 1 A 1355 GLY 1 0.630 107 1 A 1356 ARG 1 0.530 108 1 A 1357 TRP 1 0.540 109 1 A 1358 LEU 1 0.580 110 1 A 1359 SER 1 0.520 111 1 A 1360 LEU 1 0.410 112 1 A 1361 LYS 1 0.380 113 1 A 1362 LYS 1 0.420 114 1 A 1363 GLU 1 0.410 115 1 A 1364 ASP 1 0.480 116 1 A 1365 GLY 1 0.530 117 1 A 1366 ARG 1 0.500 118 1 A 1367 LEU 1 0.610 119 1 A 1368 GLU 1 0.670 120 1 A 1369 ARG 1 0.650 121 1 A 1370 LEU 1 0.670 122 1 A 1371 PHE 1 0.620 123 1 A 1372 TYR 1 0.490 124 1 A 1373 GLU 1 0.400 125 1 A 1374 LYS 1 0.370 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #