data_SMR-5a6c391c531ecd33bc7456cb0fac23a7_5 _entry.id SMR-5a6c391c531ecd33bc7456cb0fac23a7_5 _struct.entry_id SMR-5a6c391c531ecd33bc7456cb0fac23a7_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9BZ29 (isoform 5)/ DOCK9_HUMAN, Dedicator of cytokinesis protein 9 Estimated model accuracy of this model is 0.059, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9BZ29 (isoform 5)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 273984.580 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DOCK9_HUMAN Q9BZ29 1 ;MQADKCRTSSRSVKKELVIESPLQYKDAAQGEVEAESPGPVPAKPKLIEPLDYENVIVQKKTQILNDCLR EMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPNK VVKLDKLPVHVYEVDEEVDKDEDAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGS YNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQ LNFEAAMQEKRNGDSHEDDEQSKLEGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSESRVKLFYLDPDAQKLDFS SAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDLN HFSVRQMLATTSPALMNGSGQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHCA EPYMKSSDSSKVAQKVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSNDD MLKLLADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEFVPCIPK HTQPYTIYTNHLYVYPKYLKYDSQKSFAKARNIAICIEFKDSDEEDSQPLKCIYGRPGGPVFTRSAFAAV LHHHQNPEFYDEIKIELPTQLHEKHHLLLTFFHVSCDNSSKGSTKKRDVVETQVGYSWLPLLKDGRVVTS EQHIPVSANLPSGYLGYQELGMGRHYGPEIKWVDGGKPLLKISTHLVSTVYTQDQHLHNFFQYCQKTESG AQALGNELVKYLKSLHAMEGHVMIAFLPTILNQLFRVLTRATQEEVAVNVTRVIIHVVAQCHEEGLESHL RSYVKYAYKAEPYVASEYKTVHEELTKSMTTILKPSADFLTSNKLLKYSWFFFDVLIKSMAQHLIENSKV KLLRNQRFPASYHHAVETVVNMLMPHITQKFRDNPEASKNANHSLAVFIKRCFTFMDRGFVFKQINNYIS CFAPGDPKTLFEYKFEFLRVVCNHEHYIPLNLPMPFGKGRIQRYQDLQLDYSLTDEFCRNHFLVGLLLRE VGTALQEFREVRLIAISVLKNLLIKHSFDDRYASRSHQARIATLYLPLFGLLIENVQRINVRDVSPFPVN AGMTVKDESLALPAVNPLVTPQKGSTLDNSLHKDLLGAISGIASPYTTSTPNINSVRNADSRGSLISTDS GNSLPERNSEKSNSLDKHQQSSTLGNSVVRCDKLDQSEIKSLLMCFLYILKSMSDDALFTYWNKASTSEL MDFFTISEVCLHQFQYMGKRYIARTGMMHARLQQLGSLDNSLTFNHSYGHSDADVLHQSLLEANIATEVC LTALDTLSLFTLAFKNQLLADHGHNPLMKKVFDVYLCFLQKHQSETALKNVFTALRSLIYKFPSTFYEGR ADMCAALCYEILKCCNSKLSSIRTEASQLLYFLMRNNFDYTGKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGGT RFQQSLSIINNCANSDRLIKHTSFSSDVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHENDPEMLVDLQYSLAKSYASTP ELRKTWLDSMARIHVKNGDLSEAAMCYVHVTALVAEYLTRKEAVQWEPPLLPHSHSACLRRSRGGVFRQG CTAFRVITPNIDEEASMMEDVGMQDVHFNEDVLMELLEQCADGLWKAERYELIADIYKLIIPIYEKRRDF ERLAHLYDTLHRAYSKVTEVMHSGRRLLGTYFRVAFFGQAAQYQFTDSETDVEGFFEDEDGKEYIYKEPK LTPLSEISQRLLKLYSDKFGSENVKMIQDSGKVNPKDLDSKYAYIQVTHVIPFFDEKELQERKTEFERSH NIRRFMFEMPFTQTGKRQGGVEEQCKRRTILTAIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAE LRQLCSSAEVDMIKLQLKLQGSVSVQVNAGPLAYARAFLDDTNTKRYPDNKVKLLKEVFRQFVEACGQAL AVNERLIKEDQLEYQEEMKANYREMAKELSEIMHEQLG ; 'Dedicator of cytokinesis protein 9' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2068 1 2068 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DOCK9_HUMAN Q9BZ29 Q9BZ29-5 1 2068 9606 'Homo sapiens (Human)' 2002-10-19 C2654DB8162F26F1 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MQADKCRTSSRSVKKELVIESPLQYKDAAQGEVEAESPGPVPAKPKLIEPLDYENVIVQKKTQILNDCLR EMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPNK VVKLDKLPVHVYEVDEEVDKDEDAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGS YNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQ LNFEAAMQEKRNGDSHEDDEQSKLEGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSESRVKLFYLDPDAQKLDFS SAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDLN HFSVRQMLATTSPALMNGSGQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHCA EPYMKSSDSSKVAQKVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSNDD MLKLLADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEFVPCIPK 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A 1 1883 LYS 1883 ? ? ? A . A 1 1884 THR 1884 ? ? ? A . A 1 1885 GLU 1885 ? ? ? A . A 1 1886 PHE 1886 ? ? ? A . A 1 1887 GLU 1887 ? ? ? A . A 1 1888 ARG 1888 ? ? ? A . A 1 1889 SER 1889 ? ? ? A . A 1 1890 HIS 1890 ? ? ? A . A 1 1891 ASN 1891 ? ? ? A . A 1 1892 ILE 1892 ? ? ? A . A 1 1893 ARG 1893 ? ? ? A . A 1 1894 ARG 1894 ? ? ? A . A 1 1895 PHE 1895 ? ? ? A . A 1 1896 MET 1896 ? ? ? A . A 1 1897 PHE 1897 ? ? ? A . A 1 1898 GLU 1898 ? ? ? A . A 1 1899 MET 1899 ? ? ? A . A 1 1900 PRO 1900 ? ? ? A . A 1 1901 PHE 1901 ? ? ? A . A 1 1902 THR 1902 ? ? ? A . A 1 1903 GLN 1903 ? ? ? A . A 1 1904 THR 1904 ? ? ? A . A 1 1905 GLY 1905 ? ? ? A . A 1 1906 LYS 1906 ? ? ? A . A 1 1907 ARG 1907 ? ? ? A . A 1 1908 GLN 1908 ? ? ? A . A 1 1909 GLY 1909 ? ? ? A . A 1 1910 GLY 1910 ? ? ? A . A 1 1911 VAL 1911 ? ? ? A . A 1 1912 GLU 1912 ? ? ? A . A 1 1913 GLU 1913 ? ? ? A . A 1 1914 GLN 1914 ? ? ? A . A 1 1915 CYS 1915 ? ? ? A . A 1 1916 LYS 1916 ? ? ? A . A 1 1917 ARG 1917 ? ? ? A . A 1 1918 ARG 1918 ? ? ? A . A 1 1919 THR 1919 ? ? ? A . A 1 1920 ILE 1920 ? ? ? A . A 1 1921 LEU 1921 ? ? ? A . A 1 1922 THR 1922 ? ? ? A . A 1 1923 ALA 1923 ? ? ? A . A 1 1924 ILE 1924 ? ? ? A . A 1 1925 HIS 1925 ? ? ? A . A 1 1926 CYS 1926 ? ? ? A . A 1 1927 PHE 1927 ? ? ? A . A 1 1928 PRO 1928 ? ? ? A . A 1 1929 TYR 1929 ? ? ? A . A 1 1930 VAL 1930 ? ? ? A . A 1 1931 LYS 1931 ? ? ? A . A 1 1932 LYS 1932 ? ? ? A . A 1 1933 ARG 1933 ? ? ? A . A 1 1934 ILE 1934 ? ? ? A . A 1 1935 PRO 1935 ? ? ? A . A 1 1936 VAL 1936 ? ? ? A . A 1 1937 MET 1937 ? ? ? A . A 1 1938 TYR 1938 ? ? ? A . A 1 1939 GLN 1939 ? ? ? A . A 1 1940 HIS 1940 ? ? ? A . A 1 1941 HIS 1941 ? ? ? A . A 1 1942 THR 1942 ? ? ? A . A 1 1943 ASP 1943 ? ? ? A . A 1 1944 LEU 1944 ? ? ? A . A 1 1945 ASN 1945 ? ? ? A . A 1 1946 PRO 1946 ? ? ? A . A 1 1947 ILE 1947 ? ? ? A . A 1 1948 GLU 1948 ? ? ? A . A 1 1949 VAL 1949 ? ? ? A . A 1 1950 ALA 1950 ? ? ? A . A 1 1951 ILE 1951 ? ? ? A . A 1 1952 ASP 1952 ? ? ? A . A 1 1953 GLU 1953 ? ? ? A . A 1 1954 MET 1954 ? ? ? A . A 1 1955 SER 1955 ? ? ? A . A 1 1956 LYS 1956 ? ? ? A . A 1 1957 LYS 1957 ? ? ? A . A 1 1958 VAL 1958 ? ? ? A . A 1 1959 ALA 1959 ? ? ? A . A 1 1960 GLU 1960 ? ? ? A . A 1 1961 LEU 1961 ? ? ? A . A 1 1962 ARG 1962 ? ? ? A . A 1 1963 GLN 1963 ? ? ? A . A 1 1964 LEU 1964 ? ? ? A . A 1 1965 CYS 1965 ? ? ? A . A 1 1966 SER 1966 ? ? ? A . A 1 1967 SER 1967 ? ? ? A . A 1 1968 ALA 1968 ? ? ? A . A 1 1969 GLU 1969 ? ? ? A . A 1 1970 VAL 1970 ? ? ? A . A 1 1971 ASP 1971 ? ? ? A . A 1 1972 MET 1972 ? ? ? A . A 1 1973 ILE 1973 ? ? ? A . A 1 1974 LYS 1974 ? ? ? A . A 1 1975 LEU 1975 ? ? ? A . A 1 1976 GLN 1976 ? ? ? A . A 1 1977 LEU 1977 ? ? ? A . A 1 1978 LYS 1978 ? ? ? A . A 1 1979 LEU 1979 ? ? ? A . A 1 1980 GLN 1980 ? ? ? A . A 1 1981 GLY 1981 ? ? ? A . A 1 1982 SER 1982 ? ? ? A . A 1 1983 VAL 1983 ? ? ? A . A 1 1984 SER 1984 ? ? ? A . A 1 1985 VAL 1985 ? ? ? A . A 1 1986 GLN 1986 ? ? ? A . A 1 1987 VAL 1987 ? ? ? A . A 1 1988 ASN 1988 ? ? ? A . A 1 1989 ALA 1989 ? ? ? A . A 1 1990 GLY 1990 ? ? ? A . A 1 1991 PRO 1991 ? ? ? A . A 1 1992 LEU 1992 ? ? ? A . A 1 1993 ALA 1993 ? ? ? A . A 1 1994 TYR 1994 ? ? ? A . A 1 1995 ALA 1995 ? ? ? A . A 1 1996 ARG 1996 ? ? ? A . A 1 1997 ALA 1997 ? ? ? A . A 1 1998 PHE 1998 ? ? ? A . A 1 1999 LEU 1999 ? ? ? A . A 1 2000 ASP 2000 ? ? ? A . A 1 2001 ASP 2001 ? ? ? A . A 1 2002 THR 2002 ? ? ? A . A 1 2003 ASN 2003 ? ? ? A . A 1 2004 THR 2004 ? ? ? A . A 1 2005 LYS 2005 ? ? ? A . A 1 2006 ARG 2006 ? ? ? A . A 1 2007 TYR 2007 ? ? ? A . A 1 2008 PRO 2008 ? ? ? A . A 1 2009 ASP 2009 ? ? ? A . A 1 2010 ASN 2010 ? ? ? A . A 1 2011 LYS 2011 ? ? ? A . A 1 2012 VAL 2012 ? ? ? A . A 1 2013 LYS 2013 ? ? ? A . A 1 2014 LEU 2014 ? ? ? A . A 1 2015 LEU 2015 ? ? ? A . A 1 2016 LYS 2016 ? ? ? A . A 1 2017 GLU 2017 ? ? ? A . A 1 2018 VAL 2018 ? ? ? A . A 1 2019 PHE 2019 ? ? ? A . A 1 2020 ARG 2020 ? ? ? A . A 1 2021 GLN 2021 ? ? ? A . A 1 2022 PHE 2022 ? ? ? A . 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A 1 2058 GLU 2058 ? ? ? A . A 1 2059 LEU 2059 ? ? ? A . A 1 2060 SER 2060 ? ? ? A . A 1 2061 GLU 2061 ? ? ? A . A 1 2062 ILE 2062 ? ? ? A . A 1 2063 MET 2063 ? ? ? A . A 1 2064 HIS 2064 ? ? ? A . A 1 2065 GLU 2065 ? ? ? A . A 1 2066 GLN 2066 ? ? ? A . A 1 2067 LEU 2067 ? ? ? A . A 1 2068 GLY 2068 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dedicator of cytokinesis protein 9 {PDB ID=1wg7, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1wg7.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1wg7, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPK GSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSH EDDESGPSSG ; ;GSSGSSGAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPK GSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSH EDDESGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 13 129 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1wg7 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2068 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2068 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3e-07 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MQADKCRTSSRSVKKELVIESPLQYKDAAQGEVEAESPGPVPAKPKLIEPLDYENVIVQKKTQILNDCLREMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPNKVVKLDKLPVHVYEVDEEVDKDEDAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSHEDDEQSKLEGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSESRVKLFYLDPDAQKLDFSSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDLNHFSVRQMLATTSPALMNGSGQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHCAEPYMKSSDSSKVAQKVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSNDDMLKLLADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEFVPCIPKHTQPYTIYTNHLYVYPKYLKYDSQKSFAKARNIAICIEFKDSDEEDSQPLKCIYGRPGGPVFTRSAFAAVLHHHQNPEFYDEIKIELPTQLHEKHHLLLTFFHVSCDNSSKGSTKKRDVVETQVGYSWLPLLKDGRVVTSEQHIPVSANLPSGYLGYQELGMGRHYGPEIKWVDGGKPLLKISTHLVSTVYTQDQHLHNFFQYCQKTESGAQALGNELVKYLKSLHAMEGHVMIAFLPTILNQLFRVLTRATQEEVAVNVTRVIIHVVAQCHEEGLESHLRSYVKYAYKAEPYVASEYKTVHEELTKSMTTILKPSADFLTSNKLLKYSWFFFDVLIKSMAQHLIENSKVKLLRNQRFPASYHHAVETVVNMLMPHITQKFRDNPEASKNANHSLAVFIKRCFTFMDRGFVFKQINNYISCFAPGDPKTLFEYKFEFLRVVCNHEHYIPLNLPMPFGKGRIQRYQDLQLDYSLTDEFCRNHFLVGLLLREVGTALQEFREVRLIAISVLKNLLIKHSFDDRYASRSHQARIATLYLPLFGLLIENVQRINVRDVSPFPVNAGMTVKDESLALPAVNPLVTPQKGSTLDNSLHKDLLGAISGIASPYTTSTPNINSVRNADSRGSLISTDSGNSLPERNSEKSNSLDKHQQSSTLGNSVVRCDKLDQSEIKSLLMCFLYILKSMSDDALFTYWNKASTSELMDFFTISEVCLHQFQYMGKRYIARTGMMHARLQQLGSLDNSLTFNHSYGHSDADVLHQSLLEANIATEVCLTALDTLSLFTLAFKNQLLADHGHNPLMKKVFDVYLCFLQKHQSETALKNVFTALRSLIYKFPSTFYEGRADMCAALCYEILKCCNSKLSSIRTEASQLLYFLMRNNFDYTGKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGGTRFQQSLSIINNCANSDRLIKHTSFSSDVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHENDPEMLVDLQYSLAKSYASTPELRKTWLDSMARIHVKNGDLSEAAMCYVHVTALVAEYLTRKEAVQWEPPLLPHSHSACLRRSRGGVFRQGCTAFRVITPNIDEEASMMEDVGMQDVHFNEDVLMELLEQCADGLWKAERYELIADIYKLIIPIYEKRRDFERLAHLYDTLHRAYSKVTEVMHSGRRLLGTYFRVAFFGQAAQYQFTDSETDVEGFFEDEDGKEYIYKEPKLTPLSEISQRLLKLYSDKFGSENVKMIQDSGKVNPKDLDSKYAYIQVTHVIPFFDEKELQERKTEFERSHNIRRFMFEMPFTQTGKRQGGVEEQCKRRTILTAIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAELRQLCSSAEVDMIKLQLKLQGSVSVQVNAGPLAYARAFLDDTNTKRYPDNKVKLLKEVFRQFVEACGQALAVNERLIKEDQLEYQEEMKANYREMAKELSEIMHEQLG 2 1 2 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A 4.183 -21.453 10.658 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 184 O O . MET 193 193 ? A 3.187 -20.756 10.734 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 185 C CB . MET 193 193 ? A 4.949 -22.582 8.469 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 186 C CG . MET 193 193 ? A 5.684 -23.864 8.902 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 187 S SD . MET 193 193 ? A 4.947 -25.420 8.333 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 188 C CE . MET 193 193 ? A 6.186 -25.619 7.022 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 189 N N . ARG 194 194 ? A 4.580 -22.260 11.673 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 190 C CA . ARG 194 194 ? A 3.799 -22.607 12.852 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 191 C C . ARG 194 194 ? A 2.380 -23.041 12.560 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 192 O O . ARG 194 194 ? A 1.437 -22.613 13.229 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 193 C CB . ARG 194 194 ? A 3.868 -21.504 13.930 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 194 C CG . ARG 194 194 ? A 4.911 -21.743 15.028 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 195 C CD . ARG 194 194 ? A 4.319 -21.714 16.427 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 196 N NE . ARG 194 194 ? A 5.393 -21.174 17.317 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 197 C CZ . ARG 194 194 ? 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A -7.670 -14.747 5.547 1 1 A ARG 0.760 1 ATOM 240 O O . ARG 199 199 ? A -6.989 -14.713 4.531 1 1 A ARG 0.760 1 ATOM 241 C CB . ARG 199 199 ? A -6.691 -14.858 7.866 1 1 A ARG 0.760 1 ATOM 242 C CG . ARG 199 199 ? A -7.593 -14.893 9.107 1 1 A ARG 0.760 1 ATOM 243 C CD . ARG 199 199 ? A -7.072 -15.833 10.182 1 1 A ARG 0.760 1 ATOM 244 N NE . ARG 199 199 ? A -8.211 -16.040 11.132 1 1 A ARG 0.760 1 ATOM 245 C CZ . ARG 199 199 ? A -8.289 -17.090 11.956 1 1 A ARG 0.760 1 ATOM 246 N NH1 . ARG 199 199 ? A -7.327 -18.002 11.979 1 1 A ARG 0.760 1 ATOM 247 N NH2 . ARG 199 199 ? A -9.349 -17.256 12.746 1 1 A ARG 0.760 1 ATOM 248 N N . PHE 200 200 ? A -8.765 -13.979 5.672 1 1 A PHE 0.780 1 ATOM 249 C CA . PHE 200 200 ? A -9.193 -13.041 4.661 1 1 A PHE 0.780 1 ATOM 250 C C . PHE 200 200 ? A -8.554 -11.685 4.902 1 1 A PHE 0.780 1 ATOM 251 O O . PHE 200 200 ? A -8.903 -10.977 5.841 1 1 A PHE 0.780 1 ATOM 252 C CB . PHE 200 200 ? A -10.724 -12.893 4.729 1 1 A PHE 0.780 1 ATOM 253 C CG . PHE 200 200 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #