data_SMR-3ceaea15d0db184625760586d008193c_3 _entry.id SMR-3ceaea15d0db184625760586d008193c_3 _struct.entry_id SMR-3ceaea15d0db184625760586d008193c_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5JSL3/ DOC11_HUMAN, Dedicator of cytokinesis protein 11 Estimated model accuracy of this model is 0.04, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5JSL3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 275325.092 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DOC11_HUMAN Q5JSL3 1 ;MAEVRKFTKRLSKPGTAAELRQSVSEAVRGSVVLEKAKVVEPLDYENVIAQRKTQIYSDPLRDLLMFPME DISISVIGRQRRTVQSTVPEDAEKRAQSLFVKECIKTYSTDWHVVNYKYEDFSGDFRMLPCKSLRPEKIP NHVFEIDEDCEKDEDSSSLCSQKGGVIKQGWLHKANVNSTITVTMKVFKRRYFYLTQLPDGSYILNSYKD EKNSKESKGCIYLDACIDVVQCPKMRRHAFELKMLDKYSHYLAAETEQEMEEWLITLKKIIQINTDSLVQ EKKETVETAQDDETSSQGKAENIMASLERSMHPELMKYGRETEQLNKLSRGDGRQNLFSFDSEVQRLDFS GIEPDIKPFEEKCNKRFLVNCHDLTFNILGQIGDNAKGPPTNVEPFFINLALFDVKNNCKISADFHVDLN PPSVREMLWGSSTQLASDGSPKGSSPESYIHGIAESQLRYIQQGIFSVTNPHPEIFLVARIEKVLQGNIT HCAEPYIKNSDPVKTAQKVHRTAKQVCSRLGQYRMPFAWAARPIFKDTQGSLDLDGRFSPLYKQDSSKLS SEDILKLLSEYKKPEKTKLQIIPGQLNITVECVPVDLSNCITSSYVPLKPFEKNCQNITVEVEEFVPEMT KYCYPFTIYKNHLYVYPLQLKYDSQKTFAKARNIAVCVEFRDSDESDASALKCIYGKPAGSVFTTNAYAV VSHHNQNPEFYDEIKIELPIHLHQKHHLLFTFYHVSCEINTKGTTKKQDTVETPVGFAWVPLLKDGRIIT FEQQLPVSANLPPGYLNLNDAESRRQCNVDIKWVDGAKPLLKIKSHLESTIYTQDLHVHKFFHHCQLIQS GSKEVPGELIKYLKCLHAMEIQVMIQFLPVILMQLFRVLTNMTHEDDVPINCTMVLLHIVSKCHEEGLDS YLRSFIKYSFRPEKPSAPQAQLIHETLATTMIAILKQSADFLSINKLLKYSWFFFEIIAKSMATYLLEEN KIKLPRGQRFPETYHHVLHSLLLAIIPHVTIRYAEIPDESRNVNYSLASFLKRCLTLMDRGFIFNLINDY ISGFSPKDPKVLAEYKFEFLQTICNHEHYIPLNLPMAFAKPKLQRVQDSNLEYSLSDEYCKHHFLVGLLL RETSIALQDNYEIRYTAISVIKNLLIKHAFDTRYQHKNQQAKIAQLYLPFVGLLLENIQRLAGRDTLYSC AAMPNSASRDEFPCGFTSPANRGSLSTDKDTAYGSFQNGHGIKREDSRGSLIPEGATGFPDQGNTGENTR QSSTRSSVSQYNRLDQYEIRSLLMCYLYIVKMISEDTLLTYWNKVSPQELINILILLEVCLFHFRYMGKR NIARVHDAWLSKHFGIDRKSQTMPALRNRSGVMQARLQHLSSLESSFTLNHSSTTTEADIFHQALLEGNT ATEVSLTVLDTISFFTQCFKTQLLNNDGHNPLMKKVFDIHLAFLKNGQSEVSLKHVFASLRAFISKFPSA FFKGRVNMCAAFCYEVLKCCTSKISSTRNEASALLYLLMRNNFEYTKRKTFLRTHLQIIIAVSQLIADVA LSGGSRFQESLFIINNFANSDRPMKATAFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLIDLQYSLAKS YASTPELRKTWLDSMAKIHVKNGDFSEAAMCYVHVAALVAEFLHRKKLFPNGCSAFKKITPNIDEEGAMK EDAGMMDVHYSEEVLLELLEQCVDGLWKAERYEIISEISKLIVPIYEKRREFEKLTQVYRTLHGAYTKIL EVMHTKKRLLGTFFRVAFYGQSFFEEEDGKEYIYKEPKLTGLSEISLRLVKLYGEKFGTENVKIIQDSDK VNAKELDPKYAHIQVTYVKPYFDDKELTERKTEFERNHNISRFVFEAPYTLSGKKQGCIEEQCKRRTILT TSNSFPYVKKRIPINCEQQINLKPIDVATDEIKDKTAELQKLCSSTDVDMIQLQLKLQGCVSVQVNAGPL AYARAFLNDSQASKYPPKKVSELKDMFRKFIQACSIALELNERLIKEDQVEYHEGLKSNFRDMVKELSDI IHEQILQEDTMHSPWMSNTLHVFCAISGTSSDRGYGSPRYAEV ; 'Dedicator of cytokinesis protein 11' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2073 1 2073 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DOC11_HUMAN Q5JSL3 . 1 2073 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-09-11 558FC01EE5D23B6E # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAEVRKFTKRLSKPGTAAELRQSVSEAVRGSVVLEKAKVVEPLDYENVIAQRKTQIYSDPLRDLLMFPME DISISVIGRQRRTVQSTVPEDAEKRAQSLFVKECIKTYSTDWHVVNYKYEDFSGDFRMLPCKSLRPEKIP NHVFEIDEDCEKDEDSSSLCSQKGGVIKQGWLHKANVNSTITVTMKVFKRRYFYLTQLPDGSYILNSYKD EKNSKESKGCIYLDACIDVVQCPKMRRHAFELKMLDKYSHYLAAETEQEMEEWLITLKKIIQINTDSLVQ EKKETVETAQDDETSSQGKAENIMASLERSMHPELMKYGRETEQLNKLSRGDGRQNLFSFDSEVQRLDFS GIEPDIKPFEEKCNKRFLVNCHDLTFNILGQIGDNAKGPPTNVEPFFINLALFDVKNNCKISADFHVDLN PPSVREMLWGSSTQLASDGSPKGSSPESYIHGIAESQLRYIQQGIFSVTNPHPEIFLVARIEKVLQGNIT HCAEPYIKNSDPVKTAQKVHRTAKQVCSRLGQYRMPFAWAARPIFKDTQGSLDLDGRFSPLYKQDSSKLS SEDILKLLSEYKKPEKTKLQIIPGQLNITVECVPVDLSNCITSSYVPLKPFEKNCQNITVEVEEFVPEMT 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A 1 1884 LYS 1884 ? ? ? A . A 1 1885 ARG 1885 ? ? ? A . A 1 1886 ARG 1886 ? ? ? A . A 1 1887 THR 1887 ? ? ? A . A 1 1888 ILE 1888 ? ? ? A . A 1 1889 LEU 1889 ? ? ? A . A 1 1890 THR 1890 ? ? ? A . A 1 1891 THR 1891 ? ? ? A . A 1 1892 SER 1892 ? ? ? A . A 1 1893 ASN 1893 ? ? ? A . A 1 1894 SER 1894 ? ? ? A . A 1 1895 PHE 1895 ? ? ? A . A 1 1896 PRO 1896 ? ? ? A . A 1 1897 TYR 1897 ? ? ? A . A 1 1898 VAL 1898 ? ? ? A . A 1 1899 LYS 1899 ? ? ? A . A 1 1900 LYS 1900 ? ? ? A . A 1 1901 ARG 1901 ? ? ? A . A 1 1902 ILE 1902 ? ? ? A . A 1 1903 PRO 1903 ? ? ? A . A 1 1904 ILE 1904 ? ? ? A . A 1 1905 ASN 1905 ? ? ? A . A 1 1906 CYS 1906 ? ? ? A . A 1 1907 GLU 1907 ? ? ? A . A 1 1908 GLN 1908 ? ? ? A . A 1 1909 GLN 1909 ? ? ? A . A 1 1910 ILE 1910 ? ? ? A . A 1 1911 ASN 1911 ? ? ? A . A 1 1912 LEU 1912 ? ? ? A . A 1 1913 LYS 1913 ? ? ? A . A 1 1914 PRO 1914 ? ? ? A . A 1 1915 ILE 1915 ? ? ? A . A 1 1916 ASP 1916 ? ? ? A . A 1 1917 VAL 1917 ? ? ? A . A 1 1918 ALA 1918 ? ? ? A . A 1 1919 THR 1919 ? ? ? A . A 1 1920 ASP 1920 ? ? ? A . A 1 1921 GLU 1921 ? ? ? A . A 1 1922 ILE 1922 ? ? ? A . A 1 1923 LYS 1923 ? ? ? A . A 1 1924 ASP 1924 ? ? ? A . A 1 1925 LYS 1925 ? ? ? A . A 1 1926 THR 1926 ? ? ? A . A 1 1927 ALA 1927 ? ? ? A . A 1 1928 GLU 1928 ? ? ? A . A 1 1929 LEU 1929 ? ? ? A . A 1 1930 GLN 1930 ? ? ? A . A 1 1931 LYS 1931 ? ? ? A . A 1 1932 LEU 1932 ? ? ? A . A 1 1933 CYS 1933 ? ? ? A . A 1 1934 SER 1934 ? ? ? A . A 1 1935 SER 1935 ? ? ? A . A 1 1936 THR 1936 ? ? ? A . A 1 1937 ASP 1937 ? ? ? A . A 1 1938 VAL 1938 ? ? ? A . A 1 1939 ASP 1939 ? ? ? A . A 1 1940 MET 1940 ? ? ? A . A 1 1941 ILE 1941 ? ? ? A . A 1 1942 GLN 1942 ? ? ? A . A 1 1943 LEU 1943 ? ? ? A . A 1 1944 GLN 1944 ? ? ? A . A 1 1945 LEU 1945 ? ? ? A . A 1 1946 LYS 1946 ? ? ? A . A 1 1947 LEU 1947 ? ? ? A . A 1 1948 GLN 1948 ? ? ? A . A 1 1949 GLY 1949 ? ? ? A . A 1 1950 CYS 1950 ? ? ? A . A 1 1951 VAL 1951 ? ? ? A . A 1 1952 SER 1952 ? ? ? A . A 1 1953 VAL 1953 ? ? ? A . A 1 1954 GLN 1954 ? ? ? A . A 1 1955 VAL 1955 ? ? ? A . A 1 1956 ASN 1956 ? ? ? A . A 1 1957 ALA 1957 ? ? ? A . A 1 1958 GLY 1958 ? ? ? A . A 1 1959 PRO 1959 ? ? ? A . A 1 1960 LEU 1960 ? ? ? A . A 1 1961 ALA 1961 ? ? ? A . A 1 1962 TYR 1962 ? ? ? A . A 1 1963 ALA 1963 ? ? ? A . A 1 1964 ARG 1964 ? ? ? A . A 1 1965 ALA 1965 ? ? ? A . A 1 1966 PHE 1966 ? ? ? A . A 1 1967 LEU 1967 ? ? ? A . A 1 1968 ASN 1968 ? ? ? A . A 1 1969 ASP 1969 ? ? ? A . A 1 1970 SER 1970 ? ? ? A . A 1 1971 GLN 1971 ? ? ? A . A 1 1972 ALA 1972 ? ? ? A . A 1 1973 SER 1973 ? ? ? A . A 1 1974 LYS 1974 ? ? ? A . A 1 1975 TYR 1975 ? ? ? A . A 1 1976 PRO 1976 ? ? ? A . A 1 1977 PRO 1977 ? ? ? A . A 1 1978 LYS 1978 ? ? ? A . A 1 1979 LYS 1979 ? ? ? A . A 1 1980 VAL 1980 ? ? ? A . A 1 1981 SER 1981 ? ? ? A . A 1 1982 GLU 1982 ? ? ? A . A 1 1983 LEU 1983 ? ? ? A . A 1 1984 LYS 1984 ? ? ? A . A 1 1985 ASP 1985 ? ? ? A . A 1 1986 MET 1986 ? ? ? A . A 1 1987 PHE 1987 ? ? ? A . A 1 1988 ARG 1988 ? ? ? A . A 1 1989 LYS 1989 ? ? ? A . A 1 1990 PHE 1990 ? ? ? A . A 1 1991 ILE 1991 ? ? ? A . A 1 1992 GLN 1992 ? ? ? A . A 1 1993 ALA 1993 ? ? ? A . A 1 1994 CYS 1994 ? ? ? A . A 1 1995 SER 1995 ? ? ? A . A 1 1996 ILE 1996 ? ? ? A . A 1 1997 ALA 1997 ? ? ? A . A 1 1998 LEU 1998 ? ? ? A . A 1 1999 GLU 1999 ? ? ? A . A 1 2000 LEU 2000 ? ? ? A . A 1 2001 ASN 2001 ? ? ? A . A 1 2002 GLU 2002 ? ? ? A . A 1 2003 ARG 2003 ? ? ? A . A 1 2004 LEU 2004 ? ? ? A . A 1 2005 ILE 2005 ? ? ? A . A 1 2006 LYS 2006 ? ? ? A . A 1 2007 GLU 2007 ? ? ? A . A 1 2008 ASP 2008 ? ? ? A . A 1 2009 GLN 2009 ? ? ? A . A 1 2010 VAL 2010 ? ? ? A . A 1 2011 GLU 2011 ? ? ? A . A 1 2012 TYR 2012 ? ? ? A . A 1 2013 HIS 2013 ? ? ? A . A 1 2014 GLU 2014 ? ? ? A . A 1 2015 GLY 2015 ? ? ? A . A 1 2016 LEU 2016 ? ? ? A . A 1 2017 LYS 2017 ? ? ? A . A 1 2018 SER 2018 ? ? ? A . A 1 2019 ASN 2019 ? ? ? A . A 1 2020 PHE 2020 ? ? ? A . A 1 2021 ARG 2021 ? ? ? A . A 1 2022 ASP 2022 ? ? ? A . A 1 2023 MET 2023 ? ? ? A . A 1 2024 VAL 2024 ? ? ? A . A 1 2025 LYS 2025 ? ? ? A . A 1 2026 GLU 2026 ? ? ? A . A 1 2027 LEU 2027 ? ? ? A . A 1 2028 SER 2028 ? ? ? A . A 1 2029 ASP 2029 ? ? ? A . A 1 2030 ILE 2030 ? ? ? A . A 1 2031 ILE 2031 ? ? ? A . A 1 2032 HIS 2032 ? ? ? A . A 1 2033 GLU 2033 ? ? ? A . A 1 2034 GLN 2034 ? ? ? A . A 1 2035 ILE 2035 ? ? ? A . A 1 2036 LEU 2036 ? ? ? A . A 1 2037 GLN 2037 ? ? ? A . A 1 2038 GLU 2038 ? ? ? A . A 1 2039 ASP 2039 ? ? ? A . A 1 2040 THR 2040 ? ? ? A . A 1 2041 MET 2041 ? ? ? A . A 1 2042 HIS 2042 ? ? ? A . A 1 2043 SER 2043 ? ? ? A . A 1 2044 PRO 2044 ? ? ? A . A 1 2045 TRP 2045 ? ? ? A . A 1 2046 MET 2046 ? ? ? A . A 1 2047 SER 2047 ? ? ? A . A 1 2048 ASN 2048 ? ? ? A . A 1 2049 THR 2049 ? ? ? A . A 1 2050 LEU 2050 ? ? ? A . A 1 2051 HIS 2051 ? ? ? A . A 1 2052 VAL 2052 ? ? ? A . A 1 2053 PHE 2053 ? ? ? A . A 1 2054 CYS 2054 ? ? ? A . A 1 2055 ALA 2055 ? ? ? A . A 1 2056 ILE 2056 ? ? ? A . A 1 2057 SER 2057 ? ? ? A . A 1 2058 GLY 2058 ? ? ? A . A 1 2059 THR 2059 ? ? ? A . A 1 2060 SER 2060 ? ? ? A . A 1 2061 SER 2061 ? ? ? A . A 1 2062 ASP 2062 ? ? ? A . A 1 2063 ARG 2063 ? ? ? A . A 1 2064 GLY 2064 ? ? ? A . A 1 2065 TYR 2065 ? ? ? A . A 1 2066 GLY 2066 ? ? ? A . A 1 2067 SER 2067 ? ? ? A . A 1 2068 PRO 2068 ? ? ? A . A 1 2069 ARG 2069 ? ? ? A . A 1 2070 TYR 2070 ? ? ? A . A 1 2071 ALA 2071 ? ? ? A . A 1 2072 GLU 2072 ? ? ? A . A 1 2073 VAL 2073 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dedicator of cytokinesis protein 9 {PDB ID=1wg7, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1wg7.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1wg7, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPK GSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSH EDDESGPSSG ; ;GSSGSSGAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPK GSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSH EDDESGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 14 130 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1wg7 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2073 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2073 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.8e-07 62.393 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAEVRKFTKRLSKPGTAAELRQSVSEAVRGSVVLEKAKVVEPLDYENVIAQRKTQIYSDPLRDLLMFPMEDISISVIGRQRRTVQSTVPEDAEKRAQSLFVKECIKTYSTDWHVVNYKYEDFSGDFRMLPCKSLRPEKIPNHVFEIDEDCEKDEDSSSLCSQKGGVIKQGWLHKANVNSTITVTMKVFKRRYFYLTQLPDGSYILNSYKDEKNSKESKGCIYLDACIDVVQCPKMRRHAFELKMLDKYSHYLAAETEQEMEEWLITLKKIIQINTDSLVQEKKETVETAQDDETSSQGKAENIMASLERSMHPELMKYGRETEQLNKLSRGDGRQNLFSFDSEVQRLDFSGIEPDIKPFEEKCNKRFLVNCHDLTFNILGQIGDNAKGPPTNVEPFFINLALFDVKNNCKISADFHVDLNPPSVREMLWGSSTQLASDGSPKGSSPESYIHGIAESQLRYIQQGIFSVTNPHPEIFLVARIEKVLQGNITHCAEPYIKNSDPVKTAQKVHRTAKQVCSRLGQYRMPFAWAARPIFKDTQGSLDLDGRFSPLYKQDSSKLSSEDILKLLSEYKKPEKTKLQIIPGQLNITVECVPVDLSNCITSSYVPLKPFEKNCQNITVEVEEFVPEMTKYCYPFTIYKNHLYVYPLQLKYDSQKTFAKARNIAVCVEFRDSDESDASALKCIYGKPAGSVFTTNAYAVVSHHNQNPEFYDEIKIELPIHLHQKHHLLFTFYHVSCEINTKGTTKKQDTVETPVGFAWVPLLKDGRIITFEQQLPVSANLPPGYLNLNDAESRRQCNVDIKWVDGAKPLLKIKSHLESTIYTQDLHVHKFFHHCQLIQSGSKEVPGELIKYLKCLHAMEIQVMIQFLPVILMQLFRVLTNMTHEDDVPINCTMVLLHIVSKCHEEGLDSYLRSFIKYSFRPEKPSAPQAQLIHETLATTMIAILKQSADFLSINKLLKYSWFFFEIIAKSMATYLLEENKIKLPRGQRFPETYHHVLHSLLLAIIPHVTIRYAEIPDESRNVNYSLASFLKRCLTLMDRGFIFNLINDYISGFSPKDPKVLAEYKFEFLQTICNHEHYIPLNLPMAFAKPKLQRVQDSNLEYSLSDEYCKHHFLVGLLLRETSIALQDNYEIRYTAISVIKNLLIKHAFDTRYQHKNQQAKIAQLYLPFVGLLLENIQRLAGRDTLYSCAAMPNSASRDEFPCGFTSPANRGSLSTDKDTAYGSFQNGHGIKREDSRGSLIPEGATGFPDQGNTGENTRQSSTRSSVSQYNRLDQYEIRSLLMCYLYIVKMISEDTLLTYWNKVSPQELINILILLEVCLFHFRYMGKRNIARVHDAWLSKHFGIDRKSQTMPALRNRSGVMQARLQHLSSLESSFTLNHSSTTTEADIFHQALLEGNTATEVSLTVLDTISFFTQCFKTQLLNNDGHNPLMKKVFDIHLAFLKNGQSEVSLKHVFASLRAFISKFPSAFFKGRVNMCAAFCYEVLKCCTSKISSTRNEASALLYLLMRNNFEYTKRKTFLRTHLQIIIAVSQLIADVALSGGSRFQESLFIINNFANSDRPMKATAFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLIDLQYSLAKSYASTPELRKTWLDSMAKIHVKNGDFSEAAMCYVHVAALVAEFLHRKKLFPNGCSAFKKITPNIDEEGAMKEDAGMMDVHYSEEVLLELLEQCVDGLWKAERYEIISEISKLIVPIYEKRREFEKLTQVYRTLHGAYTKILEVMHTKKRLLGTFFRVAFYGQSFFEEEDGKEYIYKEPKLTGLSEISLRLVKLYGEKFGTENVKIIQDSDKVNAKELDPKYAHIQVTYVKPYFDDKELTERKTEFERNHNISRFVFEAPYTLSGKKQGCIEEQCKRRTILTTSNSFPYVKKRIPINCEQQINLKPIDVATDEIKDKTAELQKLCSSTDVDMIQLQLKLQGCVSVQVNAGPLAYARAFLNDSQASKYPPKKVSELKDMFRKFIQACSIALELNERLIKEDQVEYHEGLKSNFRDMVKELSDIIHEQILQEDTMHSPWMSNTLHVFCAISGTSSDRGYGSPRYAEV 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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_atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A -10.727 -16.736 2.850 1 1 A TRP 0.790 1 ATOM 72 N NE1 . TRP 171 171 ? A -12.230 -15.797 1.458 1 1 A TRP 0.790 1 ATOM 73 C CE2 . TRP 171 171 ? A -12.094 -16.435 2.670 1 1 A TRP 0.790 1 ATOM 74 C CE3 . TRP 171 171 ? A -10.285 -17.427 3.979 1 1 A TRP 0.790 1 ATOM 75 C CZ2 . TRP 171 171 ? A -13.038 -16.806 3.619 1 1 A TRP 0.790 1 ATOM 76 C CZ3 . TRP 171 171 ? A -11.240 -17.811 4.930 1 1 A TRP 0.790 1 ATOM 77 C CH2 . TRP 171 171 ? A -12.597 -17.504 4.754 1 1 A TRP 0.790 1 ATOM 78 N N . LEU 172 172 ? A -5.420 -15.070 2.242 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 79 C CA . LEU 172 172 ? A -3.987 -15.213 2.318 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 80 C C . LEU 172 172 ? A -3.650 -16.082 3.501 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 81 O O . LEU 172 172 ? A -4.461 -16.312 4.394 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 82 C CB . LEU 172 172 ? A -3.304 -13.839 2.525 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 83 C CG . LEU 172 172 ? A -2.806 -13.106 1.271 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 84 C CD1 . LEU 172 172 ? A -2.198 -11.770 1.703 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 85 C CD2 . LEU 172 172 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #