data_SMR-68b94d961d24059e4b184830aa100aa8_3 _entry.id SMR-68b94d961d24059e4b184830aa100aa8_3 _struct.entry_id SMR-68b94d961d24059e4b184830aa100aa8_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q96JI7 (isoform 2)/ SPTCS_HUMAN, Spatacsin Estimated model accuracy of this model is 0.014, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q96JI7 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 274182.425 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SPTCS_HUMAN Q96JI7 1 ;MAAEEGVASAASAGGSWGTAAMGRVLPMLLVPVPAEAMGQLGSRAQLRTQPEALGSLTAAGSLQVLSLTP GSRGGGRCCLEGPFWHFLWEDSRNSSTPTEKPKLLALGENYELLIYEFNLKDGRCDATILYSCSREALQK LIDDQDISISLLSLRILSFHNNTSLLFINKCVILHIIFPERDAAIRVLNCFTLPLPAQAVDMIIDTQLCR GILFVLSSLGWIYIFDVVDGTYVAHVDLALHKEDMCNEQQQEPAKISSFTSLKVSQDLDVAVIVSSSNSA VALNLNLYFRQHPGHLLCERILEDLPIQGPKGVDEDDPVNSAYNMKLAKFSFQIDRSWKAQLSSLNETIK NSKLEVSCCAPWFQDILHLESPESGNHSTSVQSWAFIPQDIMHGQYNVLQKDHAKTSDPGRSWKIMHISE QEEPIELKCVSVTGFTALFTWEVERMGYTITLWDLETQGMQCFSLGTKCIPVDSSGDQQLCFVLTENGLS LILFGLTQEEFLNRLMIHGSASTVDTLCHLNGWGRCSIPIHALEAGIENRQLDTVNFFLKSKENLFNPSS KSSVSDQFDHLSSHLYLRNVEELIPALDLLCSAIRESYSEPQSKHFSEQLLNLTLSFLNNQIKELFIHTE ELDEHLQKGVNILTSYINELRTFMIKFPWKLTDAIDEYDVHENVPKVKESNIWKKLSFEEVIASAILNNK IPEAQTFFRIDSHSAQKLEELIGIGLNLVFDNLKKNNIKEASELLKNMGFDVKGQLLKICFYTTNKNIRD FLVEILKEKNYFSEKEKRTIDFVHQVEKLYLGHFQENMQIQSFPRYWIKEQDFFKHKSVLDSFLKYDCKD EFNKQDHRIVLNWALWWDQLTQESILLPRISPEEYKSYSPEALWRYLTARHDWLNIILWIGEFQTQHSYA SLQQNKWPLLTVDVINQNTSCNNYMRNEILDKLARNGVFLASELEDFECFLLRLSRIGGVIQDTLPVQNY KTKEGWDFHSQFILYCLEHSLQHLLYVYLDCYKLSPENCPFLEKKELHEAHPWFEFLVQCRQVASNLTDP KLIFQASLANAQILIPTNQASVSSMLLEGHTLLALATTMYSPGGVSQVVQNEENENCLKKVDPQLLKMAL TPYPKLKTALFPQCTPPSVLPSDITIYHLIQSLSPFDPSRLFGWQSANTLAIGDAWSHLPHFSSPDLVNK YAIVERLNFAYYLHNGRPSFAFGTFLVQELIKSKTPKQLIQQVGNEAYVIGLSSFHIPSIGAACVCFLEL LGLDSLKLRVDMKVANIILSYKCRNEDAQYSFIRESVAEKLSKLADGEKTTTEELLVLLEEGTWNSIQQQ EIKRLSSESSSQWALVVQFCRLHNMKLSISYLRECAKANDWLQFIIHSQLHNYHPAEVKSLIQYFSPVIQ DHLRLAFENLPSVPTSKMDSDQVCNKCPQELQGSKQEMTDLFEILLQCSEEPDSWHWLLVEAVKQQAPIL SVLASCLQGASAISCLCVWIITSVEDNVATEAMGHIQDSTEDHTWNLEDLSVIWRTLLTRQKSKTLIRGF QLFFKDSPLLLVMEMYELCMFFRNYKEAEAKLLEFQKSLETLNTAATKVHPVIPAMWLEDQVCFLLKLML QQCKTQYELGKLLQLFVEREHLFSDGPDVKKLCILCQILKDTSIAINHTIITSYSIENLQHECRSILERL QTDGQFALARRVAELAELPVDNLVIKEITQEMQTLKHIEQWSLKQARIDFWKKCHENFKKNSISSKAASS FFSTQAHVACEHPTGWSSMEERHLLLTLAGHWLAQEDVVPLDKLEELEKQIWLCRITQHTLGRNQEETEP RFSRQISTSGELSFDSLASEFSFSKLAALNTSKYLELNSLPSKETCENRLDWKEQESLNFLIGRLLDDGC VHEASRVCRYFHFYNPDVALVLHCRALASGEASMEDLHPEIHALLQSAELLEEEAPDIPLRRVHSTSSLD SQKFVTVPSSNEVVTNLEVLTSKCLHGKNYCRQVLCLYDLAKELGCSYTDVAAQDGEAMLRKILASQQPD RCKRAQAFISTQGLKPDTVAELVAEEVTRELLTSSQGTGALPPGDSQPL ; Spatacsin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2079 1 2079 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SPTCS_HUMAN Q96JI7 Q96JI7-2 1 2079 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-05-18 8CAED80B0AD1AA98 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAAEEGVASAASAGGSWGTAAMGRVLPMLLVPVPAEAMGQLGSRAQLRTQPEALGSLTAAGSLQVLSLTP GSRGGGRCCLEGPFWHFLWEDSRNSSTPTEKPKLLALGENYELLIYEFNLKDGRCDATILYSCSREALQK LIDDQDISISLLSLRILSFHNNTSLLFINKCVILHIIFPERDAAIRVLNCFTLPLPAQAVDMIIDTQLCR GILFVLSSLGWIYIFDVVDGTYVAHVDLALHKEDMCNEQQQEPAKISSFTSLKVSQDLDVAVIVSSSNSA VALNLNLYFRQHPGHLLCERILEDLPIQGPKGVDEDDPVNSAYNMKLAKFSFQIDRSWKAQLSSLNETIK NSKLEVSCCAPWFQDILHLESPESGNHSTSVQSWAFIPQDIMHGQYNVLQKDHAKTSDPGRSWKIMHISE QEEPIELKCVSVTGFTALFTWEVERMGYTITLWDLETQGMQCFSLGTKCIPVDSSGDQQLCFVLTENGLS LILFGLTQEEFLNRLMIHGSASTVDTLCHLNGWGRCSIPIHALEAGIENRQLDTVNFFLKSKENLFNPSS KSSVSDQFDHLSSHLYLRNVEELIPALDLLCSAIRESYSEPQSKHFSEQLLNLTLSFLNNQIKELFIHTE 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Calmodulin-dependent protein kinase {PDB ID=7lsv, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=7lsv.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7lsv, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SNAELESEALGLQAYKNQMSKQQLLGEIQGFKENYWNMKDLLTLTNRHHLRVFLEYLDNICSAFKDDKTD EKSARAAYDFLNAQINKLFEDNSKNSKPSFESFSEDVQRFLIHIDTYLMKNPSACSNSIASTIQLLKQLD NKKSFNPEQSFKDFCSYKEITIQLLLKPFETPVAEMAS ; ;SNAELESEALGLQAYKNQMSKQQLLGEIQGFKENYWNMKDLLTLTNRHHLRVFLEYLDNICSAFKDDKTD EKSARAAYDFLNAQINKLFEDNSKNSKPSFESFSEDVQRFLIHIDTYLMKNPSACSNSIASTIQLLKQLD NKKSFNPEQSFKDFCSYKEITIQLLLKPFETPVAEMAS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 53 129 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7lsv 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2079 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2080 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 41.000 22.368 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAAEEGVASAASAGGSWGTAAMGRVLPMLLVPVPAEAMGQLGSRAQLRTQPEALGSLTAAGSLQVLSLTPGSRGGGRCCLEGPFWHFLWEDSRNSSTPTEKPKLLALGENYELLIYEFNLKDGRCDATILYSCSREALQKLIDDQDISISLLSLRILSFHNNTSLLFINKCVILHIIFPERDAAIRVLNCFTLPLPAQAVDMIIDTQLCRGILFVLSSLGWIYIFDVVDGTYVAHVDLALHKEDMCNEQQQEPAKISSFTSLKVSQDLDVAVIVSSSNSAVALNLNLYFRQHPGHLLCERILEDLPIQGPKGVDEDDPVNSAYNMKLAKFSFQIDRSWKAQLSSLNETIKNSKLEVSCCAPWFQDILHLESPESGNHSTSVQSWAFIPQDIMHGQYNVLQKDHAKTSDPGRSWKIMHISEQEEPIELKCVSVTGFTALFTWEVERMGYTITLWDLETQGMQCFSLGTKCIPVDSSGDQQLCFVLTENGLSLILFGLTQEEFLNRLMIHGSASTVDTLCHLNGWGRCSIPIHALEAGIENRQLDTVNFFLKSKENLFNPSSKSSVSDQFDHLSSHLYLRNVEELIPALDLLCSAIRESYSEPQSKHFSEQLLNLTLSFLNNQIKELFIHTE-ELDEHLQKGVNILTSYINELRTFMIKFPWKLTDAIDEYDVHENVPKVKESNIWKKLSFEEVIASAILNNKIPEAQTFFRIDSHSAQKLEELIGIGLNLVFDNLKKNNIKEASELLKNMGFDVKGQLLKICFYTTNKNIRDFLVEILKEKNYFSEKEKRTIDFVHQVEKLYLGHFQENMQIQSFPRYWIKEQDFFKHKSVLDSFLKYDCKDEFNKQDHRIVLNWALWWDQLTQESILLPRISPEEYKSYSPEALWRYLTARHDWLNIILWIGEFQTQHSYASLQQNKWPLLTVDVINQNTSCNNYMRNEILDKLARNGVFLASELEDFECFLLRLSRIGGVIQDTLPVQNYKTKEGWDFHSQFILYCLEHSLQHLLYVYLDCYKLSPENCPFLEKKELHEAHPWFEFLVQCRQVASNLTDPKLIFQASLANAQILIPTNQASVSSMLLEGHTLLALATTMYSPGGVSQVVQNEENENCLKKVDPQLLKMALTPYPKLKTALFPQCTPPSVLPSDITIYHLIQSLSPFDPSRLFGWQSANTLAIGDAWSHLPHFSSPDLVNKYAIVERLNFAYYLHNGRPSFAFGTFLVQELIKSKTPKQLIQQVGNEAYVIGLSSFHIPSIGAACVCFLELLGLDSLKLRVDMKVANIILSYKCRNEDAQYSFIRESVAEKLSKLADGEKTTTEELLVLLEEGTWNSIQQQEIKRLSSESSSQWALVVQFCRLHNMKLSISYLRECAKANDWLQFIIHSQLHNYHPAEVKSLIQYFSPVIQDHLRLAFENLPSVPTSKMDSDQVCNKCPQELQGSKQEMTDLFEILLQCSEEPDSWHWLLVEAVKQQAPILSVLASCLQGASAISCLCVWIITSVEDNVATEAMGHIQDSTEDHTWNLEDLSVIWRTLLTRQKSKTLIRGFQLFFKDSPLLLVMEMYELCMFFRNYKEAEAKLLEFQKSLETLNTAATKVHPVIPAMWLEDQVCFLLKLMLQQCKTQYELGKLLQLFVEREHLFSDGPDVKKLCILCQILKDTSIAINHTIITSYSIENLQHECRSILERLQTDGQFALARRVAELAELPVDNLVIKEITQEMQTLKHIEQWSLKQARIDFWKKCHENFKKNSISSKAASSFFSTQAHVACEHPTGWSSMEERHLLLTLAGHWLAQEDVVPLDKLEELEKQIWLCRITQHTLGRNQEETEPRFSRQISTSGELSFDSLASEFSFSKLAALNTSKYLELNSLPSKETCENRLDWKEQESLNFLIGRLLDDGCVHEASRVCRYFHFYNPDVALVLHCRALASGEASMEDLHPEIHALLQSAELLEEEAPDIPLRRVHSTSSLDSQKFVTVPSSNEVVTNLEVLTSKCLHGKNYCRQVLCLYDLAKELGCSYTDVAAQDGEAMLRKILASQQPDRCKRAQAFISTQGLKPDTVAELVAEEVTRELLTSSQGTGALPPGDSQPL 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FLEYLDNICSAFKDDKT-------DEKSARAAYDFLNAQINKLFEDNSKNSKPSFESFSEDVQRFLIHIDTYLMKNPSACSNSI---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7lsv.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 583 583 ? A 8.131 40.297 17.175 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 2 C CA . LEU 583 583 ? A 6.899 39.816 16.451 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 3 C C . LEU 583 583 ? A 6.269 40.811 15.491 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 4 O O . LEU 583 583 ? A 5.925 40.445 14.384 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 5 C CB . LEU 583 583 ? A 5.861 39.319 17.480 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 6 C CG . LEU 583 583 ? A 6.326 38.111 18.320 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 583 583 ? A 5.298 37.774 19.401 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 583 583 ? A 6.501 36.850 17.467 1 1 A LEU 0.260 1 ATOM 9 N N . ILE 584 584 ? A 6.168 42.111 15.859 1 1 A ILE 0.250 1 ATOM 10 C CA . ILE 584 584 ? A 5.766 43.167 14.930 1 1 A ILE 0.250 1 ATOM 11 C C . ILE 584 584 ? A 6.708 43.286 13.720 1 1 A ILE 0.250 1 ATOM 12 O O . ILE 584 584 ? A 6.181 43.287 12.621 1 1 A ILE 0.250 1 ATOM 13 C CB . ILE 584 584 ? A 5.494 44.469 15.694 1 1 A ILE 0.250 1 ATOM 14 C CG1 . ILE 584 584 ? A 4.372 44.220 16.741 1 1 A ILE 0.250 1 ATOM 15 C CG2 . ILE 584 584 ? A 5.078 45.576 14.701 1 1 A ILE 0.250 1 ATOM 16 C CD1 . ILE 584 584 ? A 4.196 45.376 17.733 1 1 A ILE 0.250 1 ATOM 17 N N . PRO 585 585 ? A 8.051 43.232 13.791 1 1 A PRO 0.520 1 ATOM 18 C CA . PRO 585 585 ? A 8.876 43.139 12.584 1 1 A PRO 0.520 1 ATOM 19 C C . PRO 585 585 ? A 8.542 41.971 11.656 1 1 A PRO 0.520 1 ATOM 20 O O . PRO 585 585 ? A 8.636 42.112 10.447 1 1 A PRO 0.520 1 ATOM 21 C CB . PRO 585 585 ? A 10.316 43.018 13.109 1 1 A PRO 0.520 1 ATOM 22 C CG . PRO 585 585 ? A 10.309 43.650 14.510 1 1 A PRO 0.520 1 ATOM 23 C CD . PRO 585 585 ? A 8.840 43.646 14.958 1 1 A PRO 0.520 1 ATOM 24 N N . ALA 586 586 ? A 8.156 40.795 12.207 1 1 A ALA 0.720 1 ATOM 25 C CA . ALA 586 586 ? A 7.667 39.671 11.432 1 1 A ALA 0.720 1 ATOM 26 C C . ALA 586 586 ? A 6.351 39.982 10.723 1 1 A ALA 0.720 1 ATOM 27 O O . ALA 586 586 ? A 6.200 39.656 9.558 1 1 A ALA 0.720 1 ATOM 28 C CB . ALA 586 586 ? A 7.553 38.388 12.287 1 1 A ALA 0.720 1 ATOM 29 N N . LEU 587 587 ? A 5.397 40.681 11.382 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 30 C CA . LEU 587 587 ? A 4.197 41.213 10.741 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 31 C C . LEU 587 587 ? A 4.492 42.187 9.597 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 32 O O . LEU 587 587 ? A 3.897 42.096 8.528 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 33 C CB . LEU 587 587 ? A 3.270 41.937 11.753 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 34 C CG . LEU 587 587 ? A 2.430 41.037 12.679 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 35 C CD1 . LEU 587 587 ? A 1.504 41.928 13.519 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 36 C CD2 . LEU 587 587 ? A 1.566 40.058 11.879 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 37 N N . ASP 588 588 ? A 5.462 43.105 9.773 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 38 C CA . ASP 588 588 ? A 5.938 43.987 8.719 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 39 C C . ASP 588 588 ? A 6.509 43.232 7.511 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 40 O O . ASP 588 588 ? A 6.207 43.554 6.364 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 41 C CB . ASP 588 588 ? A 7.027 44.942 9.270 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 42 C CG . ASP 588 588 ? A 6.450 46.009 10.189 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 43 O OD1 . ASP 588 588 ? A 5.229 46.290 10.100 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 44 O OD2 . ASP 588 588 ? A 7.254 46.569 10.977 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 45 N N . LEU 589 589 ? A 7.310 42.163 7.749 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 46 C CA . LEU 589 589 ? A 7.853 41.279 6.718 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 47 C C . LEU 589 589 ? A 6.781 40.590 5.915 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 48 O O . LEU 589 589 ? A 6.853 40.454 4.698 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 49 C CB . LEU 589 589 ? A 8.734 40.144 7.307 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 50 C CG . LEU 589 589 ? A 10.075 40.612 7.885 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 51 C CD1 . LEU 589 589 ? A 10.779 39.437 8.583 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 52 C CD2 . LEU 589 589 ? A 10.963 41.223 6.792 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 53 N N . LEU 590 590 ? A 5.738 40.138 6.617 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 54 C CA . LEU 590 590 ? A 4.570 39.566 6.016 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 55 C C . LEU 590 590 ? A 3.819 40.553 5.106 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 56 O O . LEU 590 590 ? A 3.506 40.242 3.960 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 57 C CB . LEU 590 590 ? A 3.676 39.082 7.177 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 58 C CG . LEU 590 590 ? A 4.126 37.844 7.966 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 59 C CD1 . LEU 590 590 ? A 2.987 37.535 8.945 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 60 C CD2 . LEU 590 590 ? A 4.457 36.705 7.007 1 1 A LEU 0.650 1 ATOM 61 N N . CYS 591 591 ? A 3.585 41.798 5.588 1 1 A CYS 0.670 1 ATOM 62 C CA . CYS 591 591 ? A 2.998 42.905 4.839 1 1 A CYS 0.670 1 ATOM 63 C C . CYS 591 591 ? A 3.815 43.420 3.653 1 1 A CYS 0.670 1 ATOM 64 O O . CYS 591 591 ? A 3.261 43.799 2.630 1 1 A CYS 0.670 1 ATOM 65 C CB . CYS 591 591 ? A 2.656 44.119 5.736 1 1 A CYS 0.670 1 ATOM 66 S SG . CYS 591 591 ? A 1.333 43.775 6.932 1 1 A CYS 0.670 1 ATOM 67 N N . SER 592 592 ? A 5.156 43.489 3.744 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 68 C CA . SER 592 592 ? A 6.002 43.828 2.607 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 69 C C . SER 592 592 ? A 6.069 42.732 1.556 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 70 O O . SER 592 592 ? A 5.935 43.011 0.370 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 71 C CB . SER 592 592 ? A 7.429 44.272 3.023 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 72 O OG . SER 592 592 ? A 8.143 43.234 3.694 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 73 N N . ALA 593 593 ? A 6.209 41.446 1.952 1 1 A ALA 0.690 1 ATOM 74 C CA . ALA 593 593 ? A 6.214 40.322 1.033 1 1 A ALA 0.690 1 ATOM 75 C C . ALA 593 593 ? A 4.917 40.192 0.243 1 1 A ALA 0.690 1 ATOM 76 O O . ALA 593 593 ? A 4.925 39.981 -0.962 1 1 A ALA 0.690 1 ATOM 77 C CB . ALA 593 593 ? A 6.475 39.007 1.797 1 1 A ALA 0.690 1 ATOM 78 N N . ILE 594 594 ? A 3.748 40.355 0.890 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 79 C CA . ILE 594 594 ? A 2.463 40.344 0.195 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 80 C C . ILE 594 594 ? A 2.225 41.496 -0.748 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 81 O O . ILE 594 594 ? A 1.708 41.309 -1.844 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 82 C CB . ILE 594 594 ? A 1.285 40.244 1.137 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 83 C CG1 . ILE 594 594 ? A -0.052 39.898 0.433 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 84 C CG2 . ILE 594 594 ? A 1.147 41.494 2.036 1 1 A ILE 0.550 1 ATOM 85 C CD1 . ILE 594 594 ? 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A 0.715 36.142 15.944 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 282 O O . LEU 618 618 ? A 1.093 36.510 17.051 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 283 C CB . LEU 618 618 ? A 2.273 36.622 14.089 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 284 C CG . LEU 618 618 ? A 3.610 36.258 13.426 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 285 C CD1 . LEU 618 618 ? A 4.035 37.429 12.542 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 286 C CD2 . LEU 618 618 ? A 4.717 35.995 14.456 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 287 N N . ASN 619 619 ? A -0.570 36.259 15.558 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 288 C CA . ASN 619 619 ? A -1.654 36.722 16.406 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 289 C C . ASN 619 619 ? A -1.744 35.897 17.691 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 290 O O . ASN 619 619 ? A -1.790 36.448 18.786 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 291 C CB . ASN 619 619 ? A -2.962 36.623 15.561 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 292 C CG . ASN 619 619 ? A -4.262 37.008 16.266 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 293 O OD1 . ASN 619 619 ? A -4.365 37.316 17.448 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 294 N ND2 . ASN 619 619 ? A -5.376 36.974 15.497 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 295 N N . ASN 620 620 ? A -1.684 34.551 17.576 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 296 C CA . ASN 620 620 ? A -1.636 33.665 18.725 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 297 C C . ASN 620 620 ? A -0.416 33.920 19.610 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 298 O O . ASN 620 620 ? A -0.551 34.177 20.791 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 299 C CB . ASN 620 620 ? A -1.699 32.193 18.255 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 300 C CG . ASN 620 620 ? A -3.081 31.983 17.647 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 301 O OD1 . ASN 620 620 ? A -4.089 32.494 18.134 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 302 N ND2 . ASN 620 620 ? A -3.153 31.230 16.524 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 303 N N . GLN 621 621 ? A 0.799 33.984 19.011 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 304 C CA . GLN 621 621 ? A 2.038 34.183 19.754 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 305 C C . GLN 621 621 ? A 2.108 35.539 20.470 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 306 O O . GLN 621 621 ? A 2.580 35.651 21.599 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 307 C CB . GLN 621 621 ? A 3.312 33.997 18.873 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 308 C CG . GLN 621 621 ? A 3.413 32.699 18.022 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 309 C CD . GLN 621 621 ? 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A -1.129 36.720 24.897 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 324 C CB . LYS 623 623 ? A -2.924 36.558 22.133 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 325 C CG . LYS 623 623 ? A -3.682 37.590 21.288 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 326 C CD . LYS 623 623 ? A -5.033 37.057 20.813 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 327 C CE . LYS 623 623 ? A -5.837 38.106 20.050 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 328 N NZ . LYS 623 623 ? A -7.007 37.439 19.453 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 329 N N . GLU 624 624 ? A -0.262 35.219 23.470 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 330 C CA . GLU 624 624 ? A 0.462 34.432 24.461 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 331 C C . GLU 624 624 ? A 1.520 35.203 25.239 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 332 O O . GLU 624 624 ? A 1.720 34.990 26.431 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 333 C CB . GLU 624 624 ? A 1.077 33.171 23.830 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 334 C CG . GLU 624 624 ? A 0.004 32.143 23.396 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 335 C CD . GLU 624 624 ? A 0.618 30.868 22.823 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 336 O OE1 . GLU 624 624 ? A 1.867 30.797 22.721 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 337 O OE2 . GLU 624 624 ? 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A 9.628 21.213 13.003 1 1 A ILE 0.210 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #