data_SMR-728c2906d3728eed8023bb350785133a_1 _entry.id SMR-728c2906d3728eed8023bb350785133a_1 _struct.entry_id SMR-728c2906d3728eed8023bb350785133a_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P56716/ RP1_MOUSE, Oxygen-regulated protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.034, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P56716' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 272439.923 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RP1_MOUSE P56716 1 ;MSDTPSTSFSMIHLTSEGQVPSPRHSNITHPVVAKRISFYKSGDPQFGGVRVVVNPRSFKTFDALLDSLS RKVPLPFGVRNISTPRGRHSITRLEELEDGKSYVCSHNKKVLPVDLDKARRRPRPWLSSRSISTHVQLCP ATANMSTMAPGMLRAPRRLVVFRNGDPKNKHVVLLSRRITQSFEAFLQYLTQVMQCPVAKLYATDGRKVP SLQAVILSSGAVVAAGREPFKPGNYDIQKYLLPAKLPGISHRVHQKGKAKIEKRKMSTHMPSDLRPQTDS LISEKTYDCFSDFSVAPENYLALETHESQSLSTYPSEDDVEKSIVFNQDGTMTVVMKVRFKIKEEETVKW TTTVNRAGLSNNDEKNKKSSYPGKTDYGPSSLKLEACSLPEDIVDTTQQGSLTEEENTQMTEQQALSCSS ASWENASMETDIQESQKQVKHFYRPPTPGPRRMRQKKSVIGTVTVVSETEVQEKQFSYSEERKGGEKSEY HMFTHSCSKMSSVSNKLVQIGSDNEMESALERTRESGSLKSQAINAGAIEITSQKVLKMCHNNALPSTAP ENSVVEEGTDNSAVSGTATIKHFRTCGNANDSFSSITADSTPTSVNNYSNDRNISELPSVGSPVLTMRLV NEFAHCGLTEKPENRKKVLSSSASKKKKKKSQQRMITSNDKKKVIETKGPPNIAGKIPRAGTTAQERLLQ ESDCPDKGGRVCEQGLNISPMAIESNNFFPKSNPTFSKNFYKNKLNTFQNPKTQKLLAKRKSRPRKIVST ERLRKQEIGQEDKILLHSDSKLCESHLEKQSLFHVFNILEEDQKVLHRPPFQVEKVARNLKGMAKKSLVP KVNDLHIMLRNQKKQMGVKLKSGAEVSEQHVTTRADPLASLKKPDFPEGIPHHSGKSYVKRWLQNINSYP DFEHRKSGPLCQNRSDVVNYNRNGFLGNNLHTTSSKGNGFLMESNKSKTKNDNWSGNTNQETGKSLVAKD NGEELNKHHCESQNGSLYDSYLVSLHDNCTLSQTTINEPSTKSHLSIEKSRPEVKLVYQEMNFATKRQSI EVAIQVDTMGENVLKDYLPALLLRHLEAFVPNNQKHQNGISQIPGSLAEVVFPSVIDNSSTNLLLAWLLV LNLKRTMNSFCQSDAHKMTNRPSETAALLEVLKHVAITEEADDLKAAVANLMESTKTCSGSSGREQDMLP VNCTASSLHSVDECNENGSAQKTLLDEGYSVMGDCTSEMVSKSCNSSCEMHMVSKTNPPKQVDDQSDGLL TSNSCTVSQRSTGACFLTDGVYSHEACAQKEGVYEGACLSDETHIPIRDCHTIHSVHSKENKCTDDLEST EELKTVDKVPKGLSILADSMYKNDSNVSTFQNVNKLSSQRTLLSKTYLDSDKDYSPLEEFQNCPRKKIVN KKKSISSDKEESRTSEEPRSITNSMTSSERNAISELESFEELESQDTSIFNMNVRAEKKSTKETMQKQSE ARMSSELINVSGRKIIEQERRNTAILETTARGQVTPPSLAFCYDSNKNTEKEISEGETKMRVKKMVDSME NESYSESSLNFKKHHRSPGTLDWSDYGSDSESGYPCKASSNSHNDDSGQEKEPTRGIVKRAIEKLYGKAE IIKPPFFHGSIHKSQVCPYNSVEVQCAKKTNFYESECQSLVSSEQVSRSSLIFQEFPQVDANGMGDSFGD SSIENVTKSSAHDRVFTEKENGKLIDNGKWLLRENHLWRVSSDNPGMYGNADTTSVDTLIDKNSIEVPYS HFGELAPGPTMAELSSSEIEEMTQPLEVKCNYFNFPHGSDSEPFGEDFPDAQNKTCPKEKIPNHHTEEKG NYPSERLCTSVTQAFVSAGNKVHPVCSDAIKTQPLPGSNITHGALQEGDSLDKLYALCGQHCPILTVIIQ PVNEESRGFAYRKDSDIENSLDFQLWMKIYPFMPQSKKHVFRSDGRNVSVGEEFAGNVIGDLCDQLYFKS MIDLVDQRANSLGKEINLKKFQLYLKKSFSDPLSTSLLVVENRNSVSLSPSSWTDNFKSIDENNNFLNRL PNSSKNPNQVVRENTNFQFHLELFGQVYLLDICQVEKPLNIKTRSKLEMYYILEGEVLFIWEEEK ; 'Oxygen-regulated protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2095 1 2095 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . RP1_MOUSE P56716 . 1 2095 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2002-06-06 CA5301316633BD62 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no I ;MSDTPSTSFSMIHLTSEGQVPSPRHSNITHPVVAKRISFYKSGDPQFGGVRVVVNPRSFKTFDALLDSLS RKVPLPFGVRNISTPRGRHSITRLEELEDGKSYVCSHNKKVLPVDLDKARRRPRPWLSSRSISTHVQLCP ATANMSTMAPGMLRAPRRLVVFRNGDPKNKHVVLLSRRITQSFEAFLQYLTQVMQCPVAKLYATDGRKVP SLQAVILSSGAVVAAGREPFKPGNYDIQKYLLPAKLPGISHRVHQKGKAKIEKRKMSTHMPSDLRPQTDS LISEKTYDCFSDFSVAPENYLALETHESQSLSTYPSEDDVEKSIVFNQDGTMTVVMKVRFKIKEEETVKW TTTVNRAGLSNNDEKNKKSSYPGKTDYGPSSLKLEACSLPEDIVDTTQQGSLTEEENTQMTEQQALSCSS ASWENASMETDIQESQKQVKHFYRPPTPGPRRMRQKKSVIGTVTVVSETEVQEKQFSYSEERKGGEKSEY HMFTHSCSKMSSVSNKLVQIGSDNEMESALERTRESGSLKSQAINAGAIEITSQKVLKMCHNNALPSTAP ENSVVEEGTDNSAVSGTATIKHFRTCGNANDSFSSITADSTPTSVNNYSNDRNISELPSVGSPVLTMRLV 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A 1 1924 PRO 1924 ? ? ? I . A 1 1925 GLN 1925 ? ? ? I . A 1 1926 SER 1926 ? ? ? I . A 1 1927 LYS 1927 ? ? ? I . A 1 1928 LYS 1928 ? ? ? I . A 1 1929 HIS 1929 ? ? ? I . A 1 1930 VAL 1930 ? ? ? I . A 1 1931 PHE 1931 ? ? ? I . A 1 1932 ARG 1932 ? ? ? I . A 1 1933 SER 1933 ? ? ? I . A 1 1934 ASP 1934 ? ? ? I . A 1 1935 GLY 1935 ? ? ? I . A 1 1936 ARG 1936 ? ? ? I . A 1 1937 ASN 1937 ? ? ? I . A 1 1938 VAL 1938 ? ? ? I . A 1 1939 SER 1939 ? ? ? I . A 1 1940 VAL 1940 ? ? ? I . A 1 1941 GLY 1941 ? ? ? I . A 1 1942 GLU 1942 ? ? ? I . A 1 1943 GLU 1943 ? ? ? I . A 1 1944 PHE 1944 ? ? ? I . A 1 1945 ALA 1945 ? ? ? I . A 1 1946 GLY 1946 ? ? ? I . A 1 1947 ASN 1947 ? ? ? I . A 1 1948 VAL 1948 ? ? ? I . A 1 1949 ILE 1949 ? ? ? I . A 1 1950 GLY 1950 ? ? ? I . A 1 1951 ASP 1951 ? ? ? I . A 1 1952 LEU 1952 ? ? ? I . A 1 1953 CYS 1953 ? ? ? I . A 1 1954 ASP 1954 ? ? ? I . A 1 1955 GLN 1955 ? ? ? I . A 1 1956 LEU 1956 ? ? ? I . A 1 1957 TYR 1957 ? ? ? I . A 1 1958 PHE 1958 ? ? ? I . A 1 1959 LYS 1959 ? ? ? I . A 1 1960 SER 1960 ? ? ? I . A 1 1961 MET 1961 ? ? ? I . A 1 1962 ILE 1962 ? ? ? I . A 1 1963 ASP 1963 ? ? ? I . A 1 1964 LEU 1964 ? ? ? I . A 1 1965 VAL 1965 ? ? ? I . A 1 1966 ASP 1966 ? ? ? I . A 1 1967 GLN 1967 ? ? ? I . A 1 1968 ARG 1968 ? ? ? I . A 1 1969 ALA 1969 ? ? ? I . A 1 1970 ASN 1970 ? ? ? I . A 1 1971 SER 1971 ? ? ? I . A 1 1972 LEU 1972 ? ? ? I . A 1 1973 GLY 1973 ? ? ? I . A 1 1974 LYS 1974 ? ? ? I . A 1 1975 GLU 1975 ? ? ? I . A 1 1976 ILE 1976 ? ? ? I . A 1 1977 ASN 1977 ? ? ? I . A 1 1978 LEU 1978 ? ? ? I . A 1 1979 LYS 1979 ? ? ? I . A 1 1980 LYS 1980 ? ? ? I . A 1 1981 PHE 1981 ? ? ? I . A 1 1982 GLN 1982 ? ? ? I . A 1 1983 LEU 1983 ? ? ? I . A 1 1984 TYR 1984 ? ? ? I . A 1 1985 LEU 1985 ? ? ? I . A 1 1986 LYS 1986 ? ? ? I . A 1 1987 LYS 1987 ? ? ? I . A 1 1988 SER 1988 ? ? ? I . A 1 1989 PHE 1989 ? ? ? I . A 1 1990 SER 1990 ? ? ? I . A 1 1991 ASP 1991 ? ? ? I . A 1 1992 PRO 1992 ? ? ? I . A 1 1993 LEU 1993 ? ? ? I . A 1 1994 SER 1994 ? ? ? I . A 1 1995 THR 1995 ? ? ? I . A 1 1996 SER 1996 ? ? ? I . A 1 1997 LEU 1997 ? ? ? I . A 1 1998 LEU 1998 ? ? ? I . A 1 1999 VAL 1999 ? ? ? I . A 1 2000 VAL 2000 ? ? ? I . A 1 2001 GLU 2001 ? ? ? I . A 1 2002 ASN 2002 ? ? ? I . A 1 2003 ARG 2003 ? ? ? I . A 1 2004 ASN 2004 ? ? ? I . A 1 2005 SER 2005 ? ? ? I . A 1 2006 VAL 2006 ? ? ? I . A 1 2007 SER 2007 ? ? ? I . A 1 2008 LEU 2008 ? ? ? I . A 1 2009 SER 2009 ? ? ? I . A 1 2010 PRO 2010 ? ? ? I . A 1 2011 SER 2011 ? ? ? I . A 1 2012 SER 2012 ? ? ? I . A 1 2013 TRP 2013 ? ? ? I . A 1 2014 THR 2014 ? ? ? I . A 1 2015 ASP 2015 ? ? ? I . A 1 2016 ASN 2016 ? ? ? I . A 1 2017 PHE 2017 ? ? ? I . A 1 2018 LYS 2018 ? ? ? I . A 1 2019 SER 2019 ? ? ? I . A 1 2020 ILE 2020 ? ? ? I . A 1 2021 ASP 2021 ? ? ? I . A 1 2022 GLU 2022 ? ? ? I . A 1 2023 ASN 2023 ? ? ? I . A 1 2024 ASN 2024 ? ? ? I . A 1 2025 ASN 2025 ? ? ? I . A 1 2026 PHE 2026 ? ? ? I . A 1 2027 LEU 2027 ? ? ? I . A 1 2028 ASN 2028 ? ? ? I . A 1 2029 ARG 2029 ? ? ? I . A 1 2030 LEU 2030 ? ? ? I . A 1 2031 PRO 2031 ? ? ? I . A 1 2032 ASN 2032 ? ? ? I . A 1 2033 SER 2033 ? ? ? I . A 1 2034 SER 2034 ? ? ? I . A 1 2035 LYS 2035 ? ? ? I . A 1 2036 ASN 2036 ? ? ? I . A 1 2037 PRO 2037 ? ? ? I . A 1 2038 ASN 2038 ? ? ? I . A 1 2039 GLN 2039 ? ? ? I . A 1 2040 VAL 2040 ? ? ? I . A 1 2041 VAL 2041 ? ? ? I . A 1 2042 ARG 2042 ? ? ? I . A 1 2043 GLU 2043 ? ? ? I . A 1 2044 ASN 2044 ? ? ? I . A 1 2045 THR 2045 ? ? ? I . A 1 2046 ASN 2046 ? ? ? I . A 1 2047 PHE 2047 ? ? ? I . A 1 2048 GLN 2048 ? ? ? I . A 1 2049 PHE 2049 ? ? ? I . A 1 2050 HIS 2050 ? ? ? I . A 1 2051 LEU 2051 ? ? ? I . A 1 2052 GLU 2052 ? ? ? I . A 1 2053 LEU 2053 ? ? ? I . A 1 2054 PHE 2054 ? ? ? I . A 1 2055 GLY 2055 ? ? ? I . A 1 2056 GLN 2056 ? ? ? I . A 1 2057 VAL 2057 ? ? ? I . A 1 2058 TYR 2058 ? ? ? I . A 1 2059 LEU 2059 ? ? ? I . A 1 2060 LEU 2060 ? ? ? I . A 1 2061 ASP 2061 ? ? ? I . A 1 2062 ILE 2062 ? ? ? I . A 1 2063 CYS 2063 ? ? ? I . A 1 2064 GLN 2064 ? ? ? I . A 1 2065 VAL 2065 ? ? ? I . A 1 2066 GLU 2066 ? ? ? I . A 1 2067 LYS 2067 ? ? ? I . A 1 2068 PRO 2068 ? ? ? I . A 1 2069 LEU 2069 ? ? ? I . A 1 2070 ASN 2070 ? ? ? I . A 1 2071 ILE 2071 ? ? ? I . A 1 2072 LYS 2072 ? ? ? I . A 1 2073 THR 2073 ? ? ? I . A 1 2074 ARG 2074 ? ? ? I . A 1 2075 SER 2075 ? ? ? I . A 1 2076 LYS 2076 ? ? ? I . A 1 2077 LEU 2077 ? ? ? I . A 1 2078 GLU 2078 ? ? ? I . A 1 2079 MET 2079 ? ? ? I . A 1 2080 TYR 2080 ? ? ? I . A 1 2081 TYR 2081 ? ? ? I . A 1 2082 ILE 2082 ? ? ? I . A 1 2083 LEU 2083 ? ? ? I . A 1 2084 GLU 2084 ? ? ? I . A 1 2085 GLY 2085 ? ? ? I . A 1 2086 GLU 2086 ? ? ? I . A 1 2087 VAL 2087 ? ? ? I . A 1 2088 LEU 2088 ? ? ? I . A 1 2089 PHE 2089 ? ? ? I . A 1 2090 ILE 2090 ? ? ? I . A 1 2091 TRP 2091 ? ? ? I . A 1 2092 GLU 2092 ? ? ? I . A 1 2093 GLU 2093 ? ? ? I . A 1 2094 GLU 2094 ? ? ? I . A 1 2095 LYS 2095 ? ? ? I . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'NEURONAL MIGRATION PROTEIN DOUBLECORTIN {PDB ID=4atu, label_asym_id=I, auth_asym_id=I, SMTL ID=4atu.1.I}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 4atu, label_asym_id=I' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A I 3 1 I # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GAMDYKDDDDKICRELDFGHFDERDKTSRNMRGSRMNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQALSNEKKAKKVRF YRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGVRYIYTIDGSRKIGSMDELEEGESYVC SSDNFFKKVEYTKNVNPNWSVNVKTSANMKAPQSLASSNSAQARENKDFVRPKLVTIIRSGVKPRKAVRV LLNKKTAHSFEQVLTDITEAIKLETGVVKKLYTLDGKQVTCLHDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFSLD ENECRVMKGNPSATAGPKASPTPQKTSAKSPGPMRRSKSPADSANGTSSSQLSTPKSKQSPISTPTSPGS LRKHKDLYLPLSLDDSDSLGDSM ; ;GAMDYKDDDDKICRELDFGHFDERDKTSRNMRGSRMNGLPSPTHSAHCSFYRTRTLQALSNEKKAKKVRF YRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGVRYIYTIDGSRKIGSMDELEEGESYVC SSDNFFKKVEYTKNVNPNWSVNVKTSANMKAPQSLASSNSAQARENKDFVRPKLVTIIRSGVKPRKAVRV LLNKKTAHSFEQVLTDITEAIKLETGVVKKLYTLDGKQVTCLHDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFSLD ENECRVMKGNPSATAGPKASPTPQKTSAKSPGPMRRSKSPADSANGTSSSQLSTPKSKQSPISTPTSPGS LRKHKDLYLPLSLDDSDSLGDSM ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 60 373 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4atu 2024-05-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2095 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2111 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4.8e-48 24.832 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSDTPSTSFSMIHLTSEGQVPSPRHSNITHPVVAKRISFYKSGDPQFGGVRVVVNPRSFKTFDALLDSLSRK----VPLPFGVRNISTPRGRHSITRLEELEDGKSYVCSHNKKVLPVDLDKARRRPRPWLSSRSISTHVQLC---PATANMSTMAPGMLRAPRRLVVFRNGDPKNKHV-VLLSRRITQSFEAFLQYLTQVMQ---CPVAKLYATDGRKVPSLQAVILSSGAVVAAGREPFKPGNYDIQKYLLPAKLPGISHRVHQ--KGKAKIEKRKMSTHMPSDLRPQTDSLISEKTYDCFSDFSVAPENYLALETHE---SQSLSTYPSEDDVEKSIVFNQDGTMTVVMKVRFKIKEEETVKWTTTVNRAGLSNNDEKNKKSSYPGKTDYGPSSLKLEACSLPEDIVDTTQQGSLTEEENTQMTEQQALSCSSASWENASMETDIQESQKQVKHFYRPPTPGPRRMRQKKSVIGTVTVVSETEVQEKQFSYSEERKGGEKSEYHMFTHSCSKMSSVSNKLVQIGSDNEMESALERTRESGSLKSQAINAGAIEITSQKVLKMCHNNALPSTAPENSVVEEGTDNSAVSGTATIKHFRTCGNANDSFSSITADSTPTSVNNYSNDRNISELPSVGSPVLTMRLVNEFAHCGLTEKPENRKKVLSSSASKKKKKKSQQRMITSNDKKKVIETKGPPNIAGKIPRAGTTAQERLLQESDCPDKGGRVCEQGLNISPMAIESNNFFPKSNPTFSKNFYKNKLNTFQNPKTQKLLAKRKSRPRKIVSTERLRKQEIGQEDKILLHSDSKLCESHLEKQSLFHVFNILEEDQKVLHRPPFQVEKVARNLKGMAKKSLVPKVNDLHIMLRNQKKQMGVKLKSGAEVSEQHVTTRADPLASLKKPDFPEGIPHHSGKSYVKRWLQNINSYPDFEHRKSGPLCQNRSDVVNYNRNGFLGNNLHTTSSKGNGFLMESNKSKTKNDNWSGNTNQETGKSLVAKDNGEELNKHHCESQNGSLYDSYLVSLHDNCTLSQTTINEPSTKSHLSIEKSRPEVKLVYQEMNFATKRQSIEVAIQVDTMGENVLKDYLPALLLRHLEAFVPNNQKHQNGISQIPGSLAEVVFPSVIDNSSTNLLLAWLLVLNLKRTMNSFCQSDAHKMTNRPSETAALLEVLKHVAITEEADDLKAAVANLMESTKTCSGSSGREQDMLPVNCTASSLHSVDECNENGSAQKTLLDEGYSVMGDCTSEMVSKSCNSSCEMHMVSKTNPPKQVDDQSDGLLTSNSCTVSQRSTGACFLTDGVYSHEACAQKEGVYEGACLSDETHIPIRDCHTIHSVHSKENKCTDDLESTEELKTVDKVPKGLSILADSMYKNDSNVSTFQNVNKLSSQRTLLSKTYLDSDKDYSPLEEFQNCPRKKIVNKKKSISSDKEESRTSEEPRSITNSMTSSERNAISELESFEELESQDTSIFNMNVRAEKKSTKETMQKQSEARMSSELINVSGRKIIEQERRNTAILETTARGQVTPPSLAFCYDSNKNTEKEISEGETKMRVKKMVDSMENESYSESSLNFKKHHRSPGTLDWSDYGSDSESGYPCKASSNSHNDDSGQEKEPTRGIVKRAIEKLYGKAEIIKPPFFHGSIHKSQVCPYNSVEVQCAKKTNFYESECQSLVSSEQVSRSSLIFQEFPQVDANGMGDSFGDSSIENVTKSSAHDRVFTEKENGKLIDNGKWLLRENHLWRVSSDNPGMYGNADTTSVDTLIDKNSIEVPYSHFGELAPGPTMAELSSSEIEEMTQPLEVKCNYFNFPHGSDSEPFGEDFPDAQNKTCPKEKIPNHHTEEKGNYPSERLCTSVTQAFVSAGNKVHPVCSDAIKTQPLPGSNITHGALQEGDSLDKLYALCGQHCPILTVIIQPVNEESRGFAYRKDSDIENSLDFQLWMKIYPFMPQSKKHVFRSDGRNVSVGEEFAGNVIGDLCDQLYFKSMIDLVDQRANSLGKEINLKKFQLYLKKSFSDPLSTSLLVVENRNSVSLSPSSWTDNFKSIDENNNFLNRLPNSSKNPNQVVRENTNFQFHLELFGQVYLLDICQVEKPLNIKTRSKLEMYYILEGEVLFIWEEEK 2 1 2 ----------------------------SNEKKAKKVRFYRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGVRYIYTIDGSRKIGSMDELEEGESYVCSSDNFFKKVEYTKNV--NPNWSVNVKTSANMKAPQSLASSNSAQARENKDFVRPKLVTIIRSGVKPRKAVRVLLNKKTAHSFEQVLTDITEAIKLETGVVKKLYTLDGKQVTCLHDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFSLDENECR--VMKGNPSATAGPKAS--PTPQKTSAKSPGP-MRRSKSPADSAN--GTSSSQLS-TPKSKQSPISTPTSPGSLRKHKDLYLPLSLDDSDSLGDSM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4atu.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . VAL 33 33 ? A 319.609 165.657 382.998 1 1 I VAL 0.270 1 ATOM 2 C CA . VAL 33 33 ? A 319.100 166.847 382.239 1 1 I VAL 0.270 1 ATOM 3 C C . VAL 33 33 ? A 317.605 167.027 382.429 1 1 I VAL 0.270 1 ATOM 4 O O . VAL 33 33 ? A 317.057 166.474 383.375 1 1 I VAL 0.270 1 ATOM 5 C CB . VAL 33 33 ? A 319.437 166.703 380.756 1 1 I VAL 0.270 1 ATOM 6 C CG1 . VAL 33 33 ? A 320.956 166.812 380.551 1 1 I VAL 0.270 1 ATOM 7 C CG2 . VAL 33 33 ? A 318.876 165.405 380.131 1 1 I VAL 0.270 1 ATOM 8 N N . ALA 34 34 ? A 316.923 167.798 381.555 1 1 I ALA 0.440 1 ATOM 9 C CA . ALA 34 34 ? A 315.490 167.949 381.503 1 1 I ALA 0.440 1 ATOM 10 C C . ALA 34 34 ? A 314.868 166.914 380.589 1 1 I ALA 0.440 1 ATOM 11 O O . ALA 34 34 ? A 315.530 165.995 380.127 1 1 I ALA 0.440 1 ATOM 12 C CB . ALA 34 34 ? A 315.151 169.392 381.045 1 1 I ALA 0.440 1 ATOM 13 N N . LYS 35 35 ? A 313.554 167.009 380.365 1 1 I LYS 0.600 1 ATOM 14 C CA . LYS 35 35 ? A 312.816 166.106 379.515 1 1 I LYS 0.600 1 ATOM 15 C C . LYS 35 35 ? A 312.180 166.921 378.407 1 1 I LYS 0.600 1 ATOM 16 O O . LYS 35 35 ? A 311.550 167.943 378.680 1 1 I LYS 0.600 1 ATOM 17 C CB . LYS 35 35 ? A 311.687 165.476 380.360 1 1 I LYS 0.600 1 ATOM 18 C CG . LYS 35 35 ? A 312.157 164.747 381.634 1 1 I LYS 0.600 1 ATOM 19 C CD . LYS 35 35 ? A 312.586 163.291 381.393 1 1 I LYS 0.600 1 ATOM 20 C CE . LYS 35 35 ? A 312.779 162.513 382.706 1 1 I LYS 0.600 1 ATOM 21 N NZ . LYS 35 35 ? A 312.011 161.248 382.685 1 1 I LYS 0.600 1 ATOM 22 N N . ARG 36 36 ? A 312.334 166.530 377.128 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 23 C CA . ARG 36 36 ? A 311.760 167.274 376.026 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 24 C C . ARG 36 36 ? A 310.389 166.755 375.710 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 25 O O . ARG 36 36 ? A 310.200 165.558 375.525 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 26 C CB . ARG 36 36 ? A 312.611 167.114 374.751 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 27 C CG . ARG 36 36 ? A 313.953 167.849 374.880 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 28 C CD . ARG 36 36 ? A 314.868 167.706 373.669 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 29 N NE . ARG 36 36 ? A 315.363 166.298 373.701 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 30 C CZ . ARG 36 36 ? A 316.279 165.813 372.859 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 31 N NH1 . ARG 36 36 ? A 316.825 166.601 371.940 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 32 N NH2 . ARG 36 36 ? A 316.547 164.513 372.848 1 1 I ARG 0.600 1 ATOM 33 N N . ILE 37 37 ? A 309.374 167.633 375.631 1 1 I ILE 0.670 1 ATOM 34 C CA . ILE 37 37 ? A 308.027 167.163 375.412 1 1 I ILE 0.670 1 ATOM 35 C C . ILE 37 37 ? A 307.275 168.047 374.429 1 1 I ILE 0.670 1 ATOM 36 O O . ILE 37 37 ? A 307.465 169.259 374.406 1 1 I ILE 0.670 1 ATOM 37 C CB . ILE 37 37 ? A 307.306 167.121 376.731 1 1 I ILE 0.670 1 ATOM 38 C CG1 . ILE 37 37 ? A 308.033 166.265 377.787 1 1 I ILE 0.670 1 ATOM 39 C CG2 . ILE 37 37 ? A 305.959 166.462 376.509 1 1 I ILE 0.670 1 ATOM 40 C CD1 . ILE 37 37 ? A 307.381 166.350 379.158 1 1 I ILE 0.670 1 ATOM 41 N N . SER 38 38 ? A 306.408 167.458 373.573 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 42 C CA . SER 38 38 ? A 305.517 168.186 372.681 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 43 C C . SER 38 38 ? A 304.137 168.228 373.320 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 44 O O . SER 38 38 ? A 303.511 167.198 373.578 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 45 C CB . SER 38 38 ? A 305.477 167.511 371.285 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 46 O OG . SER 38 38 ? A 304.860 168.314 370.280 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 47 N N . PHE 39 39 ? A 303.662 169.441 373.670 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 48 C CA . PHE 39 39 ? A 302.434 169.672 374.405 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 49 C C . PHE 39 39 ? A 301.367 170.211 373.480 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 50 O O . PHE 39 39 ? A 301.413 171.350 373.014 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 51 C CB . PHE 39 39 ? A 302.660 170.689 375.559 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 52 C CG . PHE 39 39 ? A 303.445 170.153 376.730 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 53 C CD1 . PHE 39 39 ? A 303.541 168.785 377.027 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 54 C CD2 . PHE 39 39 ? A 303.962 171.063 377.663 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 55 C CE1 . PHE 39 39 ? A 304.047 168.355 378.258 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 56 C CE2 . PHE 39 39 ? A 304.571 170.619 378.847 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 57 C CZ . PHE 39 39 ? A 304.611 169.261 379.145 1 1 I PHE 0.710 1 ATOM 58 N N . TYR 40 40 ? A 300.354 169.375 373.206 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 59 C CA . TYR 40 40 ? A 299.245 169.679 372.329 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 60 C C . TYR 40 40 ? A 298.126 170.154 373.193 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 61 O O . TYR 40 40 ? A 298.092 169.884 374.389 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 62 C CB . TYR 40 40 ? A 298.723 168.442 371.566 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 63 C CG . TYR 40 40 ? A 299.860 167.799 370.861 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 64 C CD1 . TYR 40 40 ? A 300.456 168.390 369.738 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 65 C CD2 . TYR 40 40 ? A 300.374 166.604 371.364 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 66 C CE1 . TYR 40 40 ? A 301.596 167.814 369.158 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 67 C CE2 . TYR 40 40 ? A 301.488 166.026 370.775 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 68 C CZ . TYR 40 40 ? A 302.117 166.632 369.702 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 69 O OH . TYR 40 40 ? A 303.277 165.995 369.244 1 1 I TYR 0.660 1 ATOM 70 N N . LYS 41 41 ? A 297.154 170.875 372.638 1 1 I LYS 0.620 1 ATOM 71 C CA . LYS 41 41 ? 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A 297.216 154.945 372.504 1 1 I ARG 0.540 1 ATOM 424 C CZ . ARG 86 86 ? A 297.482 153.636 372.388 1 1 I ARG 0.540 1 ATOM 425 N NH1 . ARG 86 86 ? A 296.931 152.743 373.203 1 1 I ARG 0.540 1 ATOM 426 N NH2 . ARG 86 86 ? A 298.322 153.178 371.461 1 1 I ARG 0.540 1 ATOM 427 N N . GLY 87 87 ? A 294.610 160.572 376.182 1 1 I GLY 0.620 1 ATOM 428 C CA . GLY 87 87 ? A 293.669 161.102 377.168 1 1 I GLY 0.620 1 ATOM 429 C C . GLY 87 87 ? A 293.147 160.155 378.219 1 1 I GLY 0.620 1 ATOM 430 O O . GLY 87 87 ? A 292.254 160.502 378.980 1 1 I GLY 0.620 1 ATOM 431 N N . ARG 88 88 ? A 293.701 158.934 378.289 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 432 C CA . ARG 88 88 ? A 293.327 157.893 379.232 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 433 C C . ARG 88 88 ? A 293.644 158.200 380.682 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 434 O O . ARG 88 88 ? A 292.912 157.785 381.571 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 435 C CB . ARG 88 88 ? A 293.998 156.548 378.876 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 436 C CG . ARG 88 88 ? A 293.497 155.948 377.552 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 437 C CD . ARG 88 88 ? A 294.251 154.666 377.217 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 438 N NE . ARG 88 88 ? A 293.739 154.167 375.900 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 439 C CZ . ARG 88 88 ? A 294.214 153.073 375.298 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 440 N NH1 . ARG 88 88 ? A 295.249 152.421 375.819 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 441 N NH2 . ARG 88 88 ? A 293.667 152.626 374.173 1 1 I ARG 0.500 1 ATOM 442 N N . HIS 89 89 ? A 294.761 158.892 380.970 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 443 C CA . HIS 89 89 ? A 295.101 159.200 382.341 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 444 C C . HIS 89 89 ? A 295.843 160.504 382.351 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 445 O O . HIS 89 89 ? A 296.590 160.818 381.422 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 446 C CB . HIS 89 89 ? A 295.987 158.128 383.022 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 447 C CG . HIS 89 89 ? A 296.340 158.431 384.444 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 448 N ND1 . HIS 89 89 ? A 295.326 158.448 385.376 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 449 C CD2 . HIS 89 89 ? A 297.538 158.673 385.038 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 450 C CE1 . HIS 89 89 ? A 295.926 158.690 386.525 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 451 N NE2 . HIS 89 89 ? A 297.263 158.836 386.376 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 452 N N . SER 90 90 ? A 295.632 161.301 383.408 1 1 I SER 0.670 1 ATOM 453 C CA . SER 90 90 ? A 296.261 162.599 383.557 1 1 I SER 0.670 1 ATOM 454 C C . SER 90 90 ? A 297.411 162.531 384.506 1 1 I SER 0.670 1 ATOM 455 O O . SER 90 90 ? A 297.325 161.971 385.594 1 1 I SER 0.670 1 ATOM 456 C CB . SER 90 90 ? A 295.341 163.719 384.077 1 1 I SER 0.670 1 ATOM 457 O OG . SER 90 90 ? A 294.292 163.966 383.141 1 1 I SER 0.670 1 ATOM 458 N N . ILE 91 91 ? A 298.536 163.130 384.098 1 1 I ILE 0.680 1 ATOM 459 C CA . ILE 91 91 ? A 299.764 163.124 384.852 1 1 I ILE 0.680 1 ATOM 460 C C . ILE 91 91 ? A 299.650 164.050 386.053 1 1 I ILE 0.680 1 ATOM 461 O O . ILE 91 91 ? A 299.092 165.143 385.956 1 1 I ILE 0.680 1 ATOM 462 C CB . ILE 91 91 ? A 300.925 163.571 383.985 1 1 I ILE 0.680 1 ATOM 463 C CG1 . ILE 91 91 ? A 301.034 162.770 382.670 1 1 I ILE 0.680 1 ATOM 464 C CG2 . ILE 91 91 ? A 302.234 163.514 384.792 1 1 I ILE 0.680 1 ATOM 465 C CD1 . ILE 91 91 ? A 301.539 161.334 382.829 1 1 I ILE 0.680 1 ATOM 466 N N . THR 92 92 ? A 300.178 163.643 387.224 1 1 I THR 0.660 1 ATOM 467 C CA . THR 92 92 ? A 300.176 164.476 388.419 1 1 I THR 0.660 1 ATOM 468 C C . THR 92 92 ? A 301.578 164.751 388.912 1 1 I THR 0.660 1 ATOM 469 O O . THR 92 92 ? A 301.802 165.601 389.773 1 1 I THR 0.660 1 ATOM 470 C CB . THR 92 92 ? A 299.428 163.803 389.556 1 1 I THR 0.660 1 ATOM 471 O OG1 . THR 92 92 ? A 299.961 162.516 389.842 1 1 I THR 0.660 1 ATOM 472 C CG2 . THR 92 92 ? A 297.973 163.595 389.119 1 1 I THR 0.660 1 ATOM 473 N N . ARG 93 93 ? A 302.577 164.041 388.364 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 474 C CA . ARG 93 93 ? A 303.940 164.110 388.824 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 475 C C . ARG 93 93 ? A 304.907 164.217 387.659 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 476 O O . ARG 93 93 ? A 304.720 163.633 386.597 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 477 C CB . ARG 93 93 ? A 304.301 162.824 389.601 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 478 C CG . ARG 93 93 ? A 303.618 162.626 390.972 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 479 C CD . ARG 93 93 ? A 303.912 163.693 392.030 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 480 N NE . ARG 93 93 ? A 305.400 163.758 392.206 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 481 C CZ . ARG 93 93 ? A 306.048 164.639 392.977 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 482 N NH1 . ARG 93 93 ? A 305.372 165.515 393.714 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 483 N NH2 . ARG 93 93 ? A 307.376 164.658 392.991 1 1 I ARG 0.610 1 ATOM 484 N N . LEU 94 94 ? A 306.019 164.956 387.848 1 1 I LEU 0.660 1 ATOM 485 C CA . LEU 94 94 ? A 307.023 165.169 386.822 1 1 I LEU 0.660 1 ATOM 486 C C . LEU 94 94 ? A 307.805 163.917 386.468 1 1 I LEU 0.660 1 ATOM 487 O O . LEU 94 94 ? A 308.346 163.787 385.371 1 1 I LEU 0.660 1 ATOM 488 C CB . LEU 94 94 ? A 308.025 166.246 387.282 1 1 I LEU 0.660 1 ATOM 489 C CG . LEU 94 94 ? A 307.426 167.654 387.429 1 1 I LEU 0.660 1 ATOM 490 C CD1 . LEU 94 94 ? A 308.487 168.603 387.993 1 1 I LEU 0.660 1 ATOM 491 C CD2 . 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GLU 98 98 ? A 308.449 161.445 380.299 1 1 I GLU 0.610 1 ATOM 519 C CA . GLU 98 98 ? A 309.595 160.833 379.653 1 1 I GLU 0.610 1 ATOM 520 C C . GLU 98 98 ? A 310.175 161.779 378.595 1 1 I GLU 0.610 1 ATOM 521 O O . GLU 98 98 ? A 309.517 162.731 378.186 1 1 I GLU 0.610 1 ATOM 522 C CB . GLU 98 98 ? A 309.179 159.498 379.004 1 1 I GLU 0.610 1 ATOM 523 C CG . GLU 98 98 ? A 308.361 158.531 379.904 1 1 I GLU 0.610 1 ATOM 524 C CD . GLU 98 98 ? A 307.226 157.902 379.111 1 1 I GLU 0.610 1 ATOM 525 O OE1 . GLU 98 98 ? A 307.454 157.440 377.961 1 1 I GLU 0.610 1 ATOM 526 O OE2 . GLU 98 98 ? A 306.054 157.958 379.558 1 1 I GLU 0.610 1 ATOM 527 N N . ASP 99 99 ? A 311.443 161.577 378.143 1 1 I ASP 0.600 1 ATOM 528 C CA . ASP 99 99 ? A 312.016 162.322 377.024 1 1 I ASP 0.600 1 ATOM 529 C C . ASP 99 99 ? A 311.237 161.939 375.773 1 1 I ASP 0.600 1 ATOM 530 O O . ASP 99 99 ? A 310.740 160.823 375.651 1 1 I ASP 0.600 1 ATOM 531 C CB . ASP 99 99 ? A 313.570 162.134 376.851 1 1 I ASP 0.600 1 ATOM 532 C CG . ASP 99 99 ? A 314.178 163.207 375.938 1 1 I ASP 0.600 1 ATOM 533 O OD1 . ASP 99 99 ? A 313.744 164.382 376.083 1 1 I ASP 0.600 1 ATOM 534 O OD2 . ASP 99 99 ? A 315.064 162.926 375.084 1 1 I ASP 0.600 1 ATOM 535 N N . GLY 100 100 ? A 311.054 162.888 374.850 1 1 I GLY 0.620 1 ATOM 536 C CA . GLY 100 100 ? A 310.381 162.665 373.583 1 1 I GLY 0.620 1 ATOM 537 C C . GLY 100 100 ? A 308.923 162.351 373.617 1 1 I GLY 0.620 1 ATOM 538 O O . GLY 100 100 ? A 308.375 161.708 372.722 1 1 I GLY 0.620 1 ATOM 539 N N . LYS 101 101 ? A 308.240 162.835 374.653 1 1 I LYS 0.610 1 ATOM 540 C CA . LYS 101 101 ? A 306.876 162.470 374.877 1 1 I LYS 0.610 1 ATOM 541 C C . LYS 101 101 ? A 305.891 163.419 374.222 1 1 I LYS 0.610 1 ATOM 542 O O . LYS 101 101 ? A 306.184 164.569 373.899 1 1 I LYS 0.610 1 ATOM 543 C CB . LYS 101 101 ? A 306.685 162.349 376.395 1 1 I LYS 0.610 1 ATOM 544 C CG . LYS 101 101 ? A 305.542 161.445 376.852 1 1 I LYS 0.610 1 ATOM 545 C CD . LYS 101 101 ? A 305.794 159.966 376.559 1 1 I LYS 0.610 1 ATOM 546 C CE . LYS 101 101 ? A 304.677 159.082 377.102 1 1 I LYS 0.610 1 ATOM 547 N NZ . LYS 101 101 ? A 305.082 157.676 376.989 1 1 I LYS 0.610 1 ATOM 548 N N . SER 102 102 ? A 304.660 162.941 374.012 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 549 C CA . SER 102 102 ? A 303.581 163.717 373.457 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 550 C C . SER 102 102 ? A 302.529 163.751 374.540 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 551 O O . SER 102 102 ? A 302.158 162.706 375.062 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 552 C CB . SER 102 102 ? A 303.024 163.035 372.178 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 553 O OG . SER 102 102 ? A 303.786 163.411 371.022 1 1 I SER 0.700 1 ATOM 554 N N . TYR 103 103 ? A 302.054 164.946 374.937 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 555 C CA . TYR 103 103 ? A 301.029 165.100 375.955 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 556 C C . TYR 103 103 ? A 300.006 166.120 375.522 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 557 O O . TYR 103 103 ? A 300.241 166.948 374.647 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 558 C CB . TYR 103 103 ? A 301.590 165.633 377.284 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 559 C CG . TYR 103 103 ? A 302.182 164.553 378.124 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 560 C CD1 . TYR 103 103 ? A 301.453 163.597 378.839 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 561 C CD2 . TYR 103 103 ? A 303.564 164.506 378.189 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 562 C CE1 . TYR 103 103 ? A 302.126 162.598 379.546 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 563 C CE2 . TYR 103 103 ? A 304.253 163.585 378.977 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 564 C CZ . TYR 103 103 ? A 303.517 162.591 379.631 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 565 O OH . TYR 103 103 ? A 304.065 161.484 380.303 1 1 I TYR 0.700 1 ATOM 566 N N . VAL 104 104 ? A 298.838 166.081 376.176 1 1 I VAL 0.710 1 ATOM 567 C CA . VAL 104 104 ? A 297.680 166.877 375.847 1 1 I VAL 0.710 1 ATOM 568 C C . VAL 104 104 ? A 297.322 167.756 377.023 1 1 I VAL 0.710 1 ATOM 569 O O . VAL 104 104 ? A 297.325 167.325 378.167 1 1 I VAL 0.710 1 ATOM 570 C CB . VAL 104 104 ? A 296.518 165.954 375.503 1 1 I VAL 0.710 1 ATOM 571 C CG1 . VAL 104 104 ? A 295.175 166.695 375.438 1 1 I VAL 0.710 1 ATOM 572 C CG2 . VAL 104 104 ? A 296.817 165.317 374.136 1 1 I VAL 0.710 1 ATOM 573 N N . CYS 105 105 ? A 297.002 169.035 376.779 1 1 I CYS 0.710 1 ATOM 574 C CA . CYS 105 105 ? A 296.592 169.966 377.813 1 1 I CYS 0.710 1 ATOM 575 C C . CYS 105 105 ? A 295.080 170.056 377.969 1 1 I CYS 0.710 1 ATOM 576 O O . CYS 105 105 ? A 294.326 170.210 377.007 1 1 I CYS 0.710 1 ATOM 577 C CB . CYS 105 105 ? A 297.168 171.378 377.549 1 1 I CYS 0.710 1 ATOM 578 S SG . CYS 105 105 ? A 298.991 171.425 377.585 1 1 I CYS 0.710 1 ATOM 579 N N . SER 106 106 ? A 294.615 169.978 379.230 1 1 I SER 0.640 1 ATOM 580 C CA . SER 106 106 ? A 293.219 169.817 379.590 1 1 I SER 0.640 1 ATOM 581 C C . SER 106 106 ? A 292.807 170.817 380.660 1 1 I SER 0.640 1 ATOM 582 O O . SER 106 106 ? A 293.649 171.371 381.360 1 1 I SER 0.640 1 ATOM 583 C CB . SER 106 106 ? A 292.954 168.361 380.062 1 1 I SER 0.640 1 ATOM 584 O OG . SER 106 106 ? A 292.855 167.489 378.933 1 1 I SER 0.640 1 ATOM 585 N N . HIS 107 107 ? A 291.486 171.096 380.825 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 586 C CA . HIS 107 107 ? A 291.022 171.964 381.915 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 587 C C . HIS 107 107 ? A 289.840 171.338 382.625 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 588 O O . HIS 107 107 ? A 289.987 170.987 383.789 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 589 C CB . HIS 107 107 ? A 290.833 173.466 381.606 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 590 C CG . HIS 107 107 ? A 290.471 174.313 382.808 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 591 N ND1 . HIS 107 107 ? A 290.697 175.644 382.624 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 592 C CD2 . HIS 107 107 ? A 289.910 174.108 384.038 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 593 C CE1 . HIS 107 107 ? A 290.284 176.239 383.714 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 594 N NE2 . HIS 107 107 ? A 289.791 175.358 384.611 1 1 I HIS 0.560 1 ATOM 595 N N . ASN 108 108 ? A 288.686 171.059 381.955 1 1 I ASN 0.500 1 ATOM 596 C CA . ASN 108 108 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.548 2 1 3 0.034 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 33 VAL 1 0.270 2 1 A 34 ALA 1 0.440 3 1 A 35 LYS 1 0.600 4 1 A 36 ARG 1 0.600 5 1 A 37 ILE 1 0.670 6 1 A 38 SER 1 0.700 7 1 A 39 PHE 1 0.710 8 1 A 40 TYR 1 0.660 9 1 A 41 LYS 1 0.620 10 1 A 42 SER 1 0.620 11 1 A 43 GLY 1 0.560 12 1 A 44 ASP 1 0.490 13 1 A 45 PRO 1 0.410 14 1 A 46 GLN 1 0.370 15 1 A 47 PHE 1 0.440 16 1 A 48 GLY 1 0.530 17 1 A 49 GLY 1 0.620 18 1 A 50 VAL 1 0.670 19 1 A 51 ARG 1 0.630 20 1 A 52 VAL 1 0.700 21 1 A 53 VAL 1 0.670 22 1 A 54 VAL 1 0.670 23 1 A 55 ASN 1 0.570 24 1 A 56 PRO 1 0.540 25 1 A 57 ARG 1 0.420 26 1 A 58 SER 1 0.580 27 1 A 59 PHE 1 0.600 28 1 A 60 LYS 1 0.550 29 1 A 61 THR 1 0.600 30 1 A 62 PHE 1 0.650 31 1 A 63 ASP 1 0.690 32 1 A 64 ALA 1 0.720 33 1 A 65 LEU 1 0.710 34 1 A 66 LEU 1 0.720 35 1 A 67 ASP 1 0.700 36 1 A 68 SER 1 0.740 37 1 A 69 LEU 1 0.720 38 1 A 70 SER 1 0.720 39 1 A 71 ARG 1 0.630 40 1 A 72 LYS 1 0.670 41 1 A 73 VAL 1 0.640 42 1 A 74 PRO 1 0.470 43 1 A 75 LEU 1 0.480 44 1 A 76 PRO 1 0.500 45 1 A 77 PHE 1 0.460 46 1 A 78 GLY 1 0.640 47 1 A 79 VAL 1 0.710 48 1 A 80 ARG 1 0.620 49 1 A 81 ASN 1 0.670 50 1 A 82 ILE 1 0.710 51 1 A 83 SER 1 0.700 52 1 A 84 THR 1 0.660 53 1 A 85 PRO 1 0.650 54 1 A 86 ARG 1 0.540 55 1 A 87 GLY 1 0.620 56 1 A 88 ARG 1 0.500 57 1 A 89 HIS 1 0.560 58 1 A 90 SER 1 0.670 59 1 A 91 ILE 1 0.680 60 1 A 92 THR 1 0.660 61 1 A 93 ARG 1 0.610 62 1 A 94 LEU 1 0.660 63 1 A 95 GLU 1 0.640 64 1 A 96 GLU 1 0.660 65 1 A 97 LEU 1 0.650 66 1 A 98 GLU 1 0.610 67 1 A 99 ASP 1 0.600 68 1 A 100 GLY 1 0.620 69 1 A 101 LYS 1 0.610 70 1 A 102 SER 1 0.700 71 1 A 103 TYR 1 0.700 72 1 A 104 VAL 1 0.710 73 1 A 105 CYS 1 0.710 74 1 A 106 SER 1 0.640 75 1 A 107 HIS 1 0.560 76 1 A 108 ASN 1 0.500 77 1 A 109 LYS 1 0.490 78 1 A 110 LYS 1 0.460 79 1 A 111 VAL 1 0.460 80 1 A 112 LEU 1 0.340 81 1 A 113 PRO 1 0.500 82 1 A 114 VAL 1 0.480 83 1 A 115 ASP 1 0.440 84 1 A 116 LEU 1 0.440 85 1 A 117 ASP 1 0.430 86 1 A 118 LYS 1 0.400 87 1 A 119 ALA 1 0.450 88 1 A 120 ARG 1 0.340 89 1 A 121 ARG 1 0.450 90 1 A 122 ARG 1 0.240 91 1 A 123 PRO 1 0.310 92 1 A 124 ARG 1 0.390 93 1 A 125 PRO 1 0.420 94 1 A 126 TRP 1 0.430 95 1 A 127 LEU 1 0.460 96 1 A 128 SER 1 0.440 97 1 A 129 SER 1 0.330 98 1 A 130 ARG 1 0.350 99 1 A 131 SER 1 0.290 100 1 A 132 ILE 1 0.260 101 1 A 133 SER 1 0.240 102 1 A 134 THR 1 0.170 103 1 A 135 HIS 1 0.260 104 1 A 136 VAL 1 0.190 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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