data_SMR-c7becc3aa2f1c57c21ab85affde89bd6_5 _entry.id SMR-c7becc3aa2f1c57c21ab85affde89bd6_5 _struct.entry_id SMR-c7becc3aa2f1c57c21ab85affde89bd6_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9BZ29 (isoform 5)/ DOCK9_HUMAN, Dedicator of cytokinesis protein 9 Estimated model accuracy of this model is 0.061, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9BZ29 (isoform 5)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 272792.460 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DOCK9_HUMAN Q9BZ29 1 ;MSQPPLLPASAETRKFTRALSKPGTAAELRQSVSEVVRGSVLLAKPKLIEPLDYENVIVQKKTQILNDCL REMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPN KVVKLDKLPVHVYEVDEEVDKDEDAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDG SYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKIL QLNFEAAMQEKRNGDSHEDDEQSKLEGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSESRVKLFYLDPDAQKLDF SSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDL NHFSVRQMLATTSPALMNGSGQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHC AEPYMKSSDSSKVAQKVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSND DMLKLLADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEFVPCIP KHTQPYTIYTNHLYVYPKYLKYDSQKSFAKARNIAICIEFKDSDEEDSQPLKCIYGRPGGPVFTRSAFAA VLHHHQNPEFYDEIKIELPTQLHEKHHLLLTFFHVSCDNSSKGSTKKRDVVETQVGYSWLPLLKDGRVVT SEQHIPVSANLPSGYLGYQELGMGRHYGPEIKWVDGGKPLLKISTHLVSTVYTQDQHLHNFFQYCQKTES GAQALGNELVKYLKSLHAMEGHVMIAFLPTILNQLFRVLTRATQEEVAVNVTRVIIHVVAQCHEEGLESH LRSYVKYAYKAEPYVASEYKTVHEELTKSMTTILKPSADFLTSNKLLKYSWFFFDVLIKSMAQHLIENSK VKLLRNQRFPASYHHAVETVVNMLMPHITQKFRDNPEASKNANHSLAVFIKRCFTFMDRGFVFKQINNYI SCFAPGDPKTLFEYKFEFLRVVCNHEHYIPLNLPMPFGKGRIQRYQDLQLDYSLTDEFCRNHFLVGLLLR EVGTALQEFREVRLIAISVLKNLLIKHSFDDRYASRSHQARIATLYLPLFGLLIENVQRINVRDVSPFPV NAGMTVKDESLALPAVNPLVTPQKGSTLDNSLHKDLLGAISGIASPYTTSTPNINSVRNADSRGSLISTD SGNSLPERNSEKSNSLDKHQQSSTLGNSVVRCDKLDQSEIKSLLMCFLYILKSMSDDALFTYWNKASTSE LMDFFTISEVCLHQFQYMGKRYIASVRKISSVLGISVDNGYGHSDADVLHQSLLEANIATEVCLTALDTL SLFTLAFKNQLLADHGHNPLMKKVFDVYLCFLQKHQSETALKNVFTALRSLIYKFPSTFYEGRADMCAAL CYEILKCCNSKLSSIRTEASQLLYFLMRNNFDYTGKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGGTRFQQSLS IINNCANSDRLIKHTSFSSDVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHENDPEMLVDLQYSLAKSYASTPELRKTWL DSMARIHVKNGDLSEAAMCYVHVTALVAEYLTRKEAVQWEPPLLPHSHSACLRRSRGGVFRQGCTAFRVI TPNIDEEASMMEDVGMQDVHFNEDVLMELLEQCADGLWKAERYELIADIYKLIIPIYEKRRDFERLAHLY DTLHRAYSKVTEVMHSGRRLLGTYFRVAFFGQAAQYQFTDSETDVEGFFEDEDGKEYIYKEPKLTPLSEI SQRLLKLYSDKFGSENVKMIQDSGKVNPKDLDSKYAYIQVTHVIPFFDEKELQERKTEFERSHNIRRFMF EMPFTQTGKRQGGVEEQCKRRTILTAIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAELRQLCSS AEVDMIKLQLKLQGSVSVQVNAGPLAYARAFLDDTNTKRYPDNKVKLLKEVFRQFVEACGQALAVNERLI KEDQLEYQEEMKANYREMAKELSEIMHEQLG ; 'Dedicator of cytokinesis protein 9' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2061 1 2061 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DOCK9_HUMAN Q9BZ29 Q9BZ29-5 1 2061 9606 'Homo sapiens (Human)' 2002-10-19 DEB17F98C3573D68 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSQPPLLPASAETRKFTRALSKPGTAAELRQSVSEVVRGSVLLAKPKLIEPLDYENVIVQKKTQILNDCL REMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPN KVVKLDKLPVHVYEVDEEVDKDEDAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDG SYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKIL QLNFEAAMQEKRNGDSHEDDEQSKLEGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSESRVKLFYLDPDAQKLDF SSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDL NHFSVRQMLATTSPALMNGSGQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHC AEPYMKSSDSSKVAQKVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSND DMLKLLADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEFVPCIP 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A 1 1918 HIS 1918 ? ? ? A . A 1 1919 CYS 1919 ? ? ? A . A 1 1920 PHE 1920 ? ? ? A . A 1 1921 PRO 1921 ? ? ? A . A 1 1922 TYR 1922 ? ? ? A . A 1 1923 VAL 1923 ? ? ? A . A 1 1924 LYS 1924 ? ? ? A . A 1 1925 LYS 1925 ? ? ? A . A 1 1926 ARG 1926 ? ? ? A . A 1 1927 ILE 1927 ? ? ? A . A 1 1928 PRO 1928 ? ? ? A . A 1 1929 VAL 1929 ? ? ? A . A 1 1930 MET 1930 ? ? ? A . A 1 1931 TYR 1931 ? ? ? A . A 1 1932 GLN 1932 ? ? ? A . A 1 1933 HIS 1933 ? ? ? A . A 1 1934 HIS 1934 ? ? ? A . A 1 1935 THR 1935 ? ? ? A . A 1 1936 ASP 1936 ? ? ? A . A 1 1937 LEU 1937 ? ? ? A . A 1 1938 ASN 1938 ? ? ? A . A 1 1939 PRO 1939 ? ? ? A . A 1 1940 ILE 1940 ? ? ? A . A 1 1941 GLU 1941 ? ? ? A . A 1 1942 VAL 1942 ? ? ? A . A 1 1943 ALA 1943 ? ? ? A . A 1 1944 ILE 1944 ? ? ? A . A 1 1945 ASP 1945 ? ? ? A . A 1 1946 GLU 1946 ? ? ? A . A 1 1947 MET 1947 ? ? ? A . A 1 1948 SER 1948 ? ? ? A . A 1 1949 LYS 1949 ? ? ? A . A 1 1950 LYS 1950 ? ? ? A . A 1 1951 VAL 1951 ? ? ? A . A 1 1952 ALA 1952 ? ? ? A . A 1 1953 GLU 1953 ? ? ? A . A 1 1954 LEU 1954 ? ? ? A . A 1 1955 ARG 1955 ? ? ? A . A 1 1956 GLN 1956 ? ? ? A . A 1 1957 LEU 1957 ? ? ? A . A 1 1958 CYS 1958 ? ? ? A . A 1 1959 SER 1959 ? ? ? A . A 1 1960 SER 1960 ? ? ? A . A 1 1961 ALA 1961 ? ? ? A . A 1 1962 GLU 1962 ? ? ? A . A 1 1963 VAL 1963 ? ? ? A . A 1 1964 ASP 1964 ? ? ? A . A 1 1965 MET 1965 ? ? ? A . A 1 1966 ILE 1966 ? ? ? A . A 1 1967 LYS 1967 ? ? ? A . A 1 1968 LEU 1968 ? ? ? A . A 1 1969 GLN 1969 ? ? ? A . A 1 1970 LEU 1970 ? ? ? A . A 1 1971 LYS 1971 ? ? ? A . A 1 1972 LEU 1972 ? ? ? A . A 1 1973 GLN 1973 ? ? ? A . A 1 1974 GLY 1974 ? ? ? A . A 1 1975 SER 1975 ? ? ? A . A 1 1976 VAL 1976 ? ? ? A . A 1 1977 SER 1977 ? ? ? A . A 1 1978 VAL 1978 ? ? ? A . A 1 1979 GLN 1979 ? ? ? A . A 1 1980 VAL 1980 ? ? ? A . A 1 1981 ASN 1981 ? ? ? A . A 1 1982 ALA 1982 ? ? ? A . A 1 1983 GLY 1983 ? ? ? A . A 1 1984 PRO 1984 ? ? ? A . A 1 1985 LEU 1985 ? ? ? A . A 1 1986 ALA 1986 ? ? ? A . A 1 1987 TYR 1987 ? ? ? A . 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A 1 2023 LEU 2023 ? ? ? A . A 1 2024 ALA 2024 ? ? ? A . A 1 2025 VAL 2025 ? ? ? A . A 1 2026 ASN 2026 ? ? ? A . A 1 2027 GLU 2027 ? ? ? A . A 1 2028 ARG 2028 ? ? ? A . A 1 2029 LEU 2029 ? ? ? A . A 1 2030 ILE 2030 ? ? ? A . A 1 2031 LYS 2031 ? ? ? A . A 1 2032 GLU 2032 ? ? ? A . A 1 2033 ASP 2033 ? ? ? A . A 1 2034 GLN 2034 ? ? ? A . A 1 2035 LEU 2035 ? ? ? A . A 1 2036 GLU 2036 ? ? ? A . A 1 2037 TYR 2037 ? ? ? A . A 1 2038 GLN 2038 ? ? ? A . A 1 2039 GLU 2039 ? ? ? A . A 1 2040 GLU 2040 ? ? ? A . A 1 2041 MET 2041 ? ? ? A . A 1 2042 LYS 2042 ? ? ? A . A 1 2043 ALA 2043 ? ? ? A . A 1 2044 ASN 2044 ? ? ? A . A 1 2045 TYR 2045 ? ? ? A . A 1 2046 ARG 2046 ? ? ? A . A 1 2047 GLU 2047 ? ? ? A . A 1 2048 MET 2048 ? ? ? A . A 1 2049 ALA 2049 ? ? ? A . A 1 2050 LYS 2050 ? ? ? A . A 1 2051 GLU 2051 ? ? ? A . A 1 2052 LEU 2052 ? ? ? A . A 1 2053 SER 2053 ? ? ? A . A 1 2054 GLU 2054 ? ? ? A . A 1 2055 ILE 2055 ? ? ? A . A 1 2056 MET 2056 ? ? ? A . A 1 2057 HIS 2057 ? ? ? A . A 1 2058 GLU 2058 ? ? ? A . A 1 2059 GLN 2059 ? ? ? A . A 1 2060 LEU 2060 ? ? ? A . A 1 2061 GLY 2061 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dedicator of cytokinesis protein 9 {PDB ID=1wg7, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1wg7.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1wg7, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPK GSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSH EDDESGPSSG ; ;GSSGSSGAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPK GSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSH EDDESGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 13 129 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1wg7 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2061 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2061 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.5e-07 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSQPPLLPASAETRKFTRALSKPGTAAELRQSVSEVVRGSVLLAKPKLIEPLDYENVIVQKKTQILNDCLREMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPNKVVKLDKLPVHVYEVDEEVDKDEDAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSHEDDEQSKLEGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSESRVKLFYLDPDAQKLDFSSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDLNHFSVRQMLATTSPALMNGSGQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHCAEPYMKSSDSSKVAQKVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSNDDMLKLLADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEFVPCIPKHTQPYTIYTNHLYVYPKYLKYDSQKSFAKARNIAICIEFKDSDEEDSQPLKCIYGRPGGPVFTRSAFAAVLHHHQNPEFYDEIKIELPTQLHEKHHLLLTFFHVSCDNSSKGSTKKRDVVETQVGYSWLPLLKDGRVVTSEQHIPVSANLPSGYLGYQELGMGRHYGPEIKWVDGGKPLLKISTHLVSTVYTQDQHLHNFFQYCQKTESGAQALGNELVKYLKSLHAMEGHVMIAFLPTILNQLFRVLTRATQEEVAVNVTRVIIHVVAQCHEEGLESHLRSYVKYAYKAEPYVASEYKTVHEELTKSMTTILKPSADFLTSNKLLKYSWFFFDVLIKSMAQHLIENSKVKLLRNQRFPASYHHAVETVVNMLMPHITQKFRDNPEASKNANHSLAVFIKRCFTFMDRGFVFKQINNYISCFAPGDPKTLFEYKFEFLRVVCNHEHYIPLNLPMPFGKGRIQRYQDLQLDYSLTDEFCRNHFLVGLLLREVGTALQEFREVRLIAISVLKNLLIKHSFDDRYASRSHQARIATLYLPLFGLLIENVQRINVRDVSPFPVNAGMTVKDESLALPAVNPLVTPQKGSTLDNSLHKDLLGAISGIASPYTTSTPNINSVRNADSRGSLISTDSGNSLPERNSEKSNSLDKHQQSSTLGNSVVRCDKLDQSEIKSLLMCFLYILKSMSDDALFTYWNKASTSELMDFFTISEVCLHQFQYMGKRYIASVRKISSVLGISVDNGYGHSDADVLHQSLLEANIATEVCLTALDTLSLFTLAFKNQLLADHGHNPLMKKVFDVYLCFLQKHQSETALKNVFTALRSLIYKFPSTFYEGRADMCAALCYEILKCCNSKLSSIRTEASQLLYFLMRNNFDYTGKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGGTRFQQSLSIINNCANSDRLIKHTSFSSDVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHENDPEMLVDLQYSLAKSYASTPELRKTWLDSMARIHVKNGDLSEAAMCYVHVTALVAEYLTRKEAVQWEPPLLPHSHSACLRRSRGGVFRQGCTAFRVITPNIDEEASMMEDVGMQDVHFNEDVLMELLEQCADGLWKAERYELIADIYKLIIPIYEKRRDFERLAHLYDTLHRAYSKVTEVMHSGRRLLGTYFRVAFFGQAAQYQFTDSETDVEGFFEDEDGKEYIYKEPKLTPLSEISQRLLKLYSDKFGSENVKMIQDSGKVNPKDLDSKYAYIQVTHVIPFFDEKELQERKTEFERSHNIRRFMFEMPFTQTGKRQGGVEEQCKRRTILTAIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAELRQLCSSAEVDMIKLQLKLQGSVSVQVNAGPLAYARAFLDDTNTKRYPDNKVKLLKEVFRQFVEACGQALAVNERLIKEDQLEYQEEMKANYREMAKELSEIMHEQLG 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1wg7.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 8.674 -17.434 16.039 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 142 N N . SER 188 188 ? A 13.092 -18.402 13.445 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 143 C CA . SER 188 188 ? A 14.330 -19.062 13.013 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 144 C C . SER 188 188 ? A 14.224 -20.394 12.256 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 145 O O . SER 188 188 ? A 14.586 -20.499 11.094 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 146 C CB . SER 188 188 ? A 15.215 -19.387 14.244 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 147 O OG . SER 188 188 ? A 15.895 -18.228 14.710 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 148 N N . ALA 189 189 ? A 13.738 -21.475 12.918 1 1 A ALA 0.490 1 ATOM 149 C CA . ALA 189 189 ? A 13.445 -22.768 12.305 1 1 A ALA 0.490 1 ATOM 150 C C . ALA 189 189 ? A 12.284 -22.714 11.299 1 1 A ALA 0.490 1 ATOM 151 O O . ALA 189 189 ? A 11.517 -21.762 11.237 1 1 A ALA 0.490 1 ATOM 152 C CB . ALA 189 189 ? A 13.189 -23.857 13.383 1 1 A ALA 0.490 1 ATOM 153 N N . ILE 190 190 ? A 12.093 -23.738 10.446 1 1 A ILE 0.520 1 ATOM 154 C CA . ILE 190 190 ? A 11.032 -23.691 9.449 1 1 A ILE 0.520 1 ATOM 155 C C . ILE 190 190 ? 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A 7.896 -21.169 12.842 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 170 O O . VAL 192 192 ? A 7.099 -20.311 13.198 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 171 C CB . VAL 192 192 ? A 9.220 -22.101 14.760 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 172 C CG1 . VAL 192 192 ? A 10.502 -21.686 14.040 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 173 C CG2 . VAL 192 192 ? A 8.690 -21.097 15.797 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 174 N N . THR 193 193 ? A 8.533 -21.031 11.650 1 1 A THR 0.700 1 ATOM 175 C CA . THR 193 193 ? A 8.276 -19.932 10.720 1 1 A THR 0.700 1 ATOM 176 C C . THR 193 193 ? A 6.880 -19.975 10.198 1 1 A THR 0.700 1 ATOM 177 O O . THR 193 193 ? A 6.145 -18.986 10.173 1 1 A THR 0.700 1 ATOM 178 C CB . THR 193 193 ? A 9.287 -19.862 9.568 1 1 A THR 0.700 1 ATOM 179 O OG1 . THR 193 193 ? A 9.707 -18.534 9.347 1 1 A THR 0.700 1 ATOM 180 C CG2 . THR 193 193 ? A 8.854 -20.376 8.189 1 1 A THR 0.700 1 ATOM 181 N N . MET 194 194 ? A 6.432 -21.182 9.833 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 182 C CA . MET 194 194 ? A 5.078 -21.375 9.432 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 183 C C . MET 194 194 ? A 4.183 -21.453 10.658 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 184 O O . MET 194 194 ? A 3.187 -20.756 10.734 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 185 C CB . MET 194 194 ? A 4.949 -22.582 8.469 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 186 C CG . MET 194 194 ? A 5.684 -23.864 8.902 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 187 S SD . MET 194 194 ? A 4.947 -25.420 8.333 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 188 C CE . MET 194 194 ? A 6.186 -25.619 7.022 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 189 N N . ARG 195 195 ? A 4.580 -22.260 11.673 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 190 C CA . ARG 195 195 ? A 3.799 -22.607 12.852 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 191 C C . ARG 195 195 ? A 2.380 -23.041 12.560 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 192 O O . ARG 195 195 ? A 1.437 -22.613 13.229 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 193 C CB . ARG 195 195 ? A 3.868 -21.504 13.930 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 194 C CG . ARG 195 195 ? A 4.911 -21.743 15.028 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 195 C CD . ARG 195 195 ? A 4.319 -21.714 16.427 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 196 N NE . ARG 195 195 ? A 5.393 -21.174 17.317 1 1 A ARG 0.600 1 ATOM 197 C CZ . ARG 195 195 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #