data_SMR-670c9b62de0082a915531acae6b219e8_4 _entry.id SMR-670c9b62de0082a915531acae6b219e8_4 _struct.entry_id SMR-670c9b62de0082a915531acae6b219e8_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9BZ29 (isoform 5)/ DOCK9_HUMAN, Dedicator of cytokinesis protein 9 Estimated model accuracy of this model is 0.06, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9BZ29 (isoform 5)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 276858.141 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DOCK9_HUMAN Q9BZ29 1 ;MSQPPLLPASAETRKFTRALSKPGTAAELRQSVSEVVRGSVLLAKPKLIEPLDYENVIVQKKTQILNDCL REMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPN KVVKLDKLPVHVYEVDEEVDKDEDAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDG SYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKIL QLNFEAAMQEKRNGDSHEDDEQSKLEGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSESRVKLFYLDPDAQKLDF SSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDL NHFSVRQMLATTSPALMNGSGQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHC AEPYMKSSDSSKVAQKVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSND DMLKLLADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEFVPCIP KHTQPYTIYTNHLYVYPKYLKYDSQKSFAKARNIAICIEFKDSDEEDSQPLKCIYGRPGGPVFTRSAFAA VLHHHQNPEFYDEIKIELPTQLHEKHHLLLTFFHVSCDNSSKGSTKKRDVVETQVGYSWLPLLKDGRVVT SEQHIPVSANLPSGYLGYQELGMGRHYGPEIKWVDGGKPLLKISTHLVSTVYTQDQHLHNFFQYCQKTES GAQALGNELVKYLKSLHAMEGHVMIAFLPTILNQLFRVLTRATQEEVAVNVTRVIIHVVAQCHEEGLESH LRSYVKYAYKAEPYVASEYKTVHEELTKSMTTILKPSADFLTSNKLLKYSWFFFDVLIKSMAQHLIENSK VKLLRNQRFPASYHHAVETVVNMLMPHITQKFRDNPEASKNANHSLAVFIKRCFTFMDRGFVFKQINNYI SCFAPGDPKTLFEYKFEFLRVVCNHEHYIPLNLPMPFGKGRIQRYQDLQLDYSLTDEFCRNHFLVGLLLR EVGTALQEFREVRLIAISVLKNLLIKHSFDDRYASRSHQARIATLYLPLFGLLIENVQRINVRDVSPFPV NAGMTVKDESLALPAVNPLVTPQKGSTLDNSLHKDLLGAISGIASPYTTSTPNINSVRNADSRGSLISTD SGNSLPERNSEKSNSLDKHQQSSTLGNSVVRCDKLDQSEIKSLLMCFLYILKSMSDDALFTYWNKASTSE LMDFFTISEVCLHQFQYMGKRYIARTGMMHARLQQLGSLDNSLTFNHSYGHSDADVLHQSLLEANIATEV CLTALDTLSLFTLAFKNQLLADHGHNPLMKKVFDVYLCFLQKHQSETALKNVFTALRSLIYKFPSTFYEG RADMCAALCYEILKCCNSKLSSIRTEASQLLYFLMRNNFDYTGKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGG TRFQQSLSIINNCANSDRLIKHTSFSSDVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHENDPEMLVDLQYSLAKSYAST PELRKTWLDSMARIHVKNGDLSEAAMCYVHVTALVAEYLTRKEAVQWEPPLLPHSHSACLRRSRGGVFRQ GCTAFRVITPNIDEEASMMEDVGMQDVHFNEDVLMELLEQCADGLWKAERYELIADIYKLIIPIYEKRRD FERLAHLYDTLHRAYSKVTEVMHSGRRLLGTYFRVAFFGQGFFEDEDGKEYIYKEPKLTPLSEISQRLLK LYSDKFGSENVKMIQDSGKVNPKDLDSKYAYIQVTHVIPFFDEKELQERKTEFERSHNIRRFMFEMPFTQ TGKRQGGVEEQCKRRTILTAIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAELRQLCSSAEVDMI KLQLKLQGSVSVQVNAGPLAYARAFLDDTNTKRYPDNKVKLLKEVFRQFVEACGQALAVNERLIKEDQLE YQEEMKANYREMAKELSEIMHEQICPLEEKTSVLPNSLHIFNAISGTPTSTMVHGMTSSSSVV ; 'Dedicator of cytokinesis protein 9' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2093 1 2093 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DOCK9_HUMAN Q9BZ29 Q9BZ29-5 1 2093 9606 'Homo sapiens (Human)' 2002-10-19 A540EC1EDDCFFDB5 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSQPPLLPASAETRKFTRALSKPGTAAELRQSVSEVVRGSVLLAKPKLIEPLDYENVIVQKKTQILNDCL REMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPN KVVKLDKLPVHVYEVDEEVDKDEDAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDG SYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKIL QLNFEAAMQEKRNGDSHEDDEQSKLEGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSESRVKLFYLDPDAQKLDF SSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDL NHFSVRQMLATTSPALMNGSGQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHC AEPYMKSSDSSKVAQKVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSND DMLKLLADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEFVPCIP 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A 1 2093 VAL 2093 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dedicator of cytokinesis protein 9 {PDB ID=1wg7, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1wg7.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1wg7, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPK GSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSH EDDESGPSSG ; ;GSSGSSGAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPK GSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSH EDDESGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 13 129 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1wg7 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2093 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2093 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.4e-07 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSQPPLLPASAETRKFTRALSKPGTAAELRQSVSEVVRGSVLLAKPKLIEPLDYENVIVQKKTQILNDCLREMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPNKVVKLDKLPVHVYEVDEEVDKDEDAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSHEDDEQSKLEGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSESRVKLFYLDPDAQKLDFSSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDLNHFSVRQMLATTSPALMNGSGQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHCAEPYMKSSDSSKVAQKVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSNDDMLKLLADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEFVPCIPKHTQPYTIYTNHLYVYPKYLKYDSQKSFAKARNIAICIEFKDSDEEDSQPLKCIYGRPGGPVFTRSAFAAVLHHHQNPEFYDEIKIELPTQLHEKHHLLLTFFHVSCDNSSKGSTKKRDVVETQVGYSWLPLLKDGRVVTSEQHIPVSANLPSGYLGYQELGMGRHYGPEIKWVDGGKPLLKISTHLVSTVYTQDQHLHNFFQYCQKTESGAQALGNELVKYLKSLHAMEGHVMIAFLPTILNQLFRVLTRATQEEVAVNVTRVIIHVVAQCHEEGLESHLRSYVKYAYKAEPYVASEYKTVHEELTKSMTTILKPSADFLTSNKLLKYSWFFFDVLIKSMAQHLIENSKVKLLRNQRFPASYHHAVETVVNMLMPHITQKFRDNPEASKNANHSLAVFIKRCFTFMDRGFVFKQINNYISCFAPGDPKTLFEYKFEFLRVVCNHEHYIPLNLPMPFGKGRIQRYQDLQLDYSLTDEFCRNHFLVGLLLREVGTALQEFREVRLIAISVLKNLLIKHSFDDRYASRSHQARIATLYLPLFGLLIENVQRINVRDVSPFPVNAGMTVKDESLALPAVNPLVTPQKGSTLDNSLHKDLLGAISGIASPYTTSTPNINSVRNADSRGSLISTDSGNSLPERNSEKSNSLDKHQQSSTLGNSVVRCDKLDQSEIKSLLMCFLYILKSMSDDALFTYWNKASTSELMDFFTISEVCLHQFQYMGKRYIARTGMMHARLQQLGSLDNSLTFNHSYGHSDADVLHQSLLEANIATEVCLTALDTLSLFTLAFKNQLLADHGHNPLMKKVFDVYLCFLQKHQSETALKNVFTALRSLIYKFPSTFYEGRADMCAALCYEILKCCNSKLSSIRTEASQLLYFLMRNNFDYTGKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGGTRFQQSLSIINNCANSDRLIKHTSFSSDVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHENDPEMLVDLQYSLAKSYASTPELRKTWLDSMARIHVKNGDLSEAAMCYVHVTALVAEYLTRKEAVQWEPPLLPHSHSACLRRSRGGVFRQGCTAFRVITPNIDEEASMMEDVGMQDVHFNEDVLMELLEQCADGLWKAERYELIADIYKLIIPIYEKRRDFERLAHLYDTLHRAYSKVTEVMHSGRRLLGTYFRVAFFGQGFFEDEDGKEYIYKEPKLTPLSEISQRLLKLYSDKFGSENVKMIQDSGKVNPKDLDSKYAYIQVTHVIPFFDEKELQERKTEFERSHNIRRFMFEMPFTQTGKRQGGVEEQCKRRTILTAIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAELRQLCSSAEVDMIKLQLKLQGSVSVQVNAGPLAYARAFLDDTNTKRYPDNKVKLLKEVFRQFVEACGQALAVNERLIKEDQLEYQEEMKANYREMAKELSEIMHEQICPLEEKTSVLPNSLHIFNAISGTPTSTMVHGMTSSSSVV 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1wg7.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A -7.080 18.186 -2.381 1 1 A GLN 0.370 1 ATOM 16 N N . LYS 172 172 ? A -8.337 12.233 -4.184 1 1 A LYS 0.350 1 ATOM 17 C CA . LYS 172 172 ? A -8.433 11.204 -5.191 1 1 A LYS 0.350 1 ATOM 18 C C . LYS 172 172 ? A -8.945 9.859 -4.656 1 1 A LYS 0.350 1 ATOM 19 O O . LYS 172 172 ? A -9.432 9.775 -3.540 1 1 A LYS 0.350 1 ATOM 20 C CB . LYS 172 172 ? A -7.109 11.120 -5.996 1 1 A LYS 0.350 1 ATOM 21 C CG . LYS 172 172 ? A -7.281 10.964 -7.514 1 1 A LYS 0.350 1 ATOM 22 C CD . LYS 172 172 ? A -6.038 10.359 -8.194 1 1 A LYS 0.350 1 ATOM 23 C CE . LYS 172 172 ? A -5.833 10.801 -9.650 1 1 A LYS 0.350 1 ATOM 24 N NZ . LYS 172 172 ? A -4.813 11.874 -9.719 1 1 A LYS 0.350 1 ATOM 25 N N . GLY 173 173 ? A -8.912 8.777 -5.465 1 1 A GLY 0.480 1 ATOM 26 C CA . GLY 173 173 ? A -9.178 7.420 -4.996 1 1 A GLY 0.480 1 ATOM 27 C C . GLY 173 173 ? A -7.968 6.797 -4.362 1 1 A GLY 0.480 1 ATOM 28 O O . GLY 173 173 ? A -7.367 7.321 -3.432 1 1 A GLY 0.480 1 ATOM 29 N N . GLY 174 174 ? A -7.558 5.620 -4.844 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 30 C CA . GLY 174 174 ? A -6.411 4.976 -4.262 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 31 C C . GLY 174 174 ? A -6.328 3.610 -4.851 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 32 O O . GLY 174 174 ? A -6.788 3.362 -5.958 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 33 N N . ILE 175 175 ? A -5.741 2.689 -4.082 1 1 A ILE 0.760 1 ATOM 34 C CA . ILE 175 175 ? A -5.550 1.290 -4.398 1 1 A ILE 0.760 1 ATOM 35 C C . ILE 175 175 ? A -6.473 0.504 -3.470 1 1 A ILE 0.760 1 ATOM 36 O O . ILE 175 175 ? A -7.312 1.079 -2.787 1 1 A ILE 0.760 1 ATOM 37 C CB . ILE 175 175 ? A -4.099 0.866 -4.208 1 1 A ILE 0.760 1 ATOM 38 C CG1 . ILE 175 175 ? A -3.171 2.082 -4.406 1 1 A ILE 0.760 1 ATOM 39 C CG2 . ILE 175 175 ? A -3.771 -0.274 -5.208 1 1 A ILE 0.760 1 ATOM 40 C CD1 . ILE 175 175 ? A -1.734 1.736 -4.089 1 1 A ILE 0.760 1 ATOM 41 N N . THR 176 176 ? A -6.359 -0.827 -3.379 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 42 C CA . THR 176 176 ? A -7.306 -1.698 -2.699 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 43 C C . THR 176 176 ? A -6.937 -3.073 -3.179 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 44 O O . THR 176 176 ? A -6.279 -3.203 -4.214 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 45 C CB . THR 176 176 ? A -8.820 -1.413 -2.860 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 46 O OG1 . THR 176 176 ? A -9.654 -2.433 -2.330 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 47 C CG2 . THR 176 176 ? A -9.225 -1.187 -4.322 1 1 A THR 0.780 1 ATOM 48 N N . LYS 177 177 ? A -7.291 -4.098 -2.384 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 49 C CA . LYS 177 177 ? A -7.123 -5.510 -2.644 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 50 C C . LYS 177 177 ? A -7.721 -6.287 -1.478 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 51 O O . LYS 177 177 ? A -7.699 -5.866 -0.324 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 52 C CB . LYS 177 177 ? A -5.641 -5.925 -2.901 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 53 C CG . LYS 177 177 ? A -5.353 -7.427 -3.044 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 54 C CD . LYS 177 177 ? A -4.489 -7.844 -4.234 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 55 C CE . LYS 177 177 ? A -4.836 -9.268 -4.690 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 56 N NZ . LYS 177 177 ? A -6.230 -9.383 -5.181 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 57 N N . HIS 178 178 ? 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A -8.038 -14.272 0.283 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 72 C CA . TRP 180 180 ? A -7.670 -15.122 1.389 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 73 C C . TRP 180 180 ? A -6.206 -15.524 1.291 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 74 O O . TRP 180 180 ? A -5.800 -16.260 0.397 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 75 C CB . TRP 180 180 ? A -8.527 -16.406 1.444 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 76 C CG . TRP 180 180 ? A -10.004 -16.249 1.685 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 77 C CD1 . TRP 180 180 ? A -10.966 -15.702 0.882 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 78 C CD2 . TRP 180 180 ? A -10.736 -16.746 2.852 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 79 N NE1 . TRP 180 180 ? A -12.225 -15.777 1.457 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 80 C CE2 . TRP 180 180 ? A -12.053 -16.453 2.665 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 81 C CE3 . TRP 180 180 ? A -10.273 -17.462 3.972 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 82 C CZ2 . TRP 180 180 ? A -13.026 -16.764 3.635 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 83 C CZ3 . TRP 180 180 ? A -11.246 -17.831 4.927 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 84 C CH2 . TRP 180 180 ? A -12.586 -17.493 4.760 1 1 A TRP 0.760 1 ATOM 85 N N . LEU 181 181 ? 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A -3.197 -19.553 2.612 1 1 A TYR 0.770 1 ATOM 100 C CD2 . TYR 182 182 ? A -1.692 -21.038 3.767 1 1 A TYR 0.770 1 ATOM 101 C CE1 . TYR 182 182 ? A -3.983 -20.652 2.243 1 1 A TYR 0.770 1 ATOM 102 C CE2 . TYR 182 182 ? A -2.475 -22.137 3.412 1 1 A TYR 0.770 1 ATOM 103 C CZ . TYR 182 182 ? A -3.653 -21.933 2.688 1 1 A TYR 0.770 1 ATOM 104 O OH . TYR 182 182 ? A -4.521 -23.004 2.413 1 1 A TYR 0.770 1 ATOM 105 N N . LYS 183 183 ? A -1.403 -16.294 6.616 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 106 C CA . LYS 183 183 ? A -0.568 -15.696 7.630 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 107 C C . LYS 183 183 ? A 0.186 -16.752 8.436 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 108 O O . LYS 183 183 ? A -0.322 -17.832 8.729 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 109 C CB . LYS 183 183 ? A -1.360 -14.780 8.593 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 110 C CG . LYS 183 183 ? A -0.531 -13.573 9.070 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 111 C CD . LYS 183 183 ? A -1.256 -12.706 10.108 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 112 C CE . LYS 183 183 ? A -1.119 -13.304 11.512 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 113 N NZ . LYS 183 183 ? A -0.878 -12.243 12.511 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 114 N N . GLY 184 184 ? A 1.428 -16.438 8.838 1 1 A GLY 0.800 1 ATOM 115 C CA . GLY 184 184 ? A 2.264 -17.298 9.652 1 1 A GLY 0.800 1 ATOM 116 C C . GLY 184 184 ? A 2.722 -16.585 10.877 1 1 A GLY 0.800 1 ATOM 117 O O . GLY 184 184 ? A 2.303 -15.463 11.162 1 1 A GLY 0.800 1 ATOM 118 N N . ASN 185 185 ? A 3.631 -17.239 11.623 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 119 C CA . ASN 185 185 ? A 4.157 -16.699 12.858 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 120 C C . ASN 185 185 ? A 5.526 -16.074 12.667 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 121 O O . ASN 185 185 ? A 5.827 -15.066 13.291 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 122 C CB . ASN 185 185 ? A 4.258 -17.845 13.897 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 123 C CG . ASN 185 185 ? A 4.037 -17.315 15.305 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 124 O OD1 . ASN 185 185 ? A 3.297 -16.361 15.537 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 125 N ND2 . ASN 185 185 ? A 4.642 -17.978 16.315 1 1 A ASN 0.740 1 ATOM 126 N N . MET 186 186 ? A 6.356 -16.661 11.777 1 1 A MET 0.690 1 ATOM 127 C CA . MET 186 186 ? A 7.698 -16.214 11.451 1 1 A MET 0.690 1 ATOM 128 C C . MET 186 186 ? A 8.741 -16.430 12.543 1 1 A MET 0.690 1 ATOM 129 O O . MET 186 186 ? A 8.564 -16.000 13.673 1 1 A MET 0.690 1 ATOM 130 C CB . MET 186 186 ? A 7.746 -14.799 10.836 1 1 A MET 0.690 1 ATOM 131 C CG . MET 186 186 ? A 8.316 -14.865 9.419 1 1 A MET 0.690 1 ATOM 132 S SD . MET 186 186 ? A 10.075 -15.310 9.357 1 1 A MET 0.690 1 ATOM 133 C CE . MET 186 186 ? A 10.041 -15.798 7.616 1 1 A MET 0.690 1 ATOM 134 N N . ASN 187 187 ? A 9.845 -17.167 12.283 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 135 C CA . ASN 187 187 ? A 10.831 -17.432 13.308 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 136 C C . ASN 187 187 ? A 12.045 -18.079 12.647 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 137 O O . ASN 187 187 ? A 12.057 -18.290 11.440 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 138 C CB . ASN 187 187 ? A 10.271 -18.378 14.405 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 139 C CG . ASN 187 187 ? A 9.963 -17.715 15.742 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 140 O OD1 . ASN 187 187 ? A 10.864 -17.527 16.556 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 141 N ND2 . ASN 187 187 ? A 8.674 -17.434 16.039 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 142 N N . SER 188 188 ? A 13.092 -18.402 13.445 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 143 C CA . SER 188 188 ? A 14.330 -19.062 13.013 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 144 C C . SER 188 188 ? A 14.224 -20.394 12.256 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 145 O O . SER 188 188 ? A 14.586 -20.499 11.094 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 146 C CB . SER 188 188 ? A 15.215 -19.387 14.244 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 147 O OG . SER 188 188 ? A 15.895 -18.228 14.710 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 148 N N . ALA 189 189 ? A 13.738 -21.475 12.918 1 1 A ALA 0.490 1 ATOM 149 C CA . ALA 189 189 ? A 13.445 -22.768 12.305 1 1 A ALA 0.490 1 ATOM 150 C C . ALA 189 189 ? A 12.284 -22.714 11.299 1 1 A ALA 0.490 1 ATOM 151 O O . ALA 189 189 ? A 11.517 -21.762 11.237 1 1 A ALA 0.490 1 ATOM 152 C CB . ALA 189 189 ? A 13.189 -23.857 13.383 1 1 A ALA 0.490 1 ATOM 153 N N . ILE 190 190 ? A 12.093 -23.738 10.446 1 1 A ILE 0.520 1 ATOM 154 C CA . ILE 190 190 ? A 11.032 -23.691 9.449 1 1 A ILE 0.520 1 ATOM 155 C C . ILE 190 190 ? A 9.640 -23.985 10.007 1 1 A ILE 0.520 1 ATOM 156 O O . ILE 190 190 ? A 8.675 -23.286 9.723 1 1 A ILE 0.520 1 ATOM 157 C CB . ILE 190 190 ? A 11.360 -24.549 8.243 1 1 A ILE 0.520 1 ATOM 158 C CG1 . ILE 190 190 ? A 10.545 -24.080 7.015 1 1 A ILE 0.520 1 ATOM 159 C CG2 . ILE 190 190 ? A 11.244 -26.061 8.537 1 1 A ILE 0.520 1 ATOM 160 C CD1 . ILE 190 190 ? A 11.339 -23.077 6.167 1 1 A ILE 0.520 1 ATOM 161 N N . SER 191 191 ? A 9.514 -25.002 10.887 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 162 C CA . SER 191 191 ? A 8.284 -25.480 11.517 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 163 C C . SER 191 191 ? A 7.677 -24.455 12.432 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 164 O O . SER 191 191 ? A 6.472 -24.413 12.663 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 165 C CB . SER 191 191 ? A 8.565 -26.753 12.350 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 166 O OG . SER 191 191 ? A 9.057 -27.776 11.486 1 1 A SER 0.530 1 ATOM 167 N N . VAL 192 192 ? A 8.532 -23.567 12.952 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 168 C CA . VAL 192 192 ? A 8.161 -22.406 13.719 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 169 C C . VAL 192 192 ? A 7.896 -21.169 12.842 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 170 O O . VAL 192 192 ? A 7.099 -20.311 13.198 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 171 C CB . VAL 192 192 ? A 9.220 -22.101 14.760 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 172 C CG1 . VAL 192 192 ? A 10.502 -21.686 14.040 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 173 C CG2 . VAL 192 192 ? A 8.690 -21.097 15.797 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 174 N N . THR 193 193 ? A 8.533 -21.031 11.650 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 175 C CA . THR 193 193 ? A 8.276 -19.932 10.720 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 176 C C . THR 193 193 ? A 6.880 -19.975 10.198 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 177 O O . THR 193 193 ? A 6.145 -18.986 10.173 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 178 C CB . THR 193 193 ? A 9.287 -19.862 9.568 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 179 O OG1 . THR 193 193 ? A 9.707 -18.534 9.347 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 180 C CG2 . THR 193 193 ? A 8.854 -20.376 8.189 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 181 N N . MET 194 194 ? A 6.432 -21.182 9.833 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 182 C CA . MET 194 194 ? A 5.078 -21.375 9.432 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 183 C C . MET 194 194 ? A 4.183 -21.453 10.658 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 184 O O . MET 194 194 ? A 3.187 -20.756 10.734 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 185 C CB . MET 194 194 ? A 4.949 -22.582 8.469 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 186 C CG . MET 194 194 ? A 5.684 -23.864 8.902 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 187 S SD . MET 194 194 ? A 4.947 -25.420 8.333 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 188 C CE . MET 194 194 ? A 6.186 -25.619 7.022 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 189 N N . ARG 195 195 ? A 4.580 -22.260 11.673 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 190 C CA . ARG 195 195 ? A 3.799 -22.607 12.852 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 191 C C . ARG 195 195 ? A 2.380 -23.041 12.560 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 192 O O . ARG 195 195 ? A 1.437 -22.613 13.229 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 193 C CB . ARG 195 195 ? A 3.868 -21.504 13.930 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 194 C CG . ARG 195 195 ? A 4.911 -21.743 15.028 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 195 C CD . ARG 195 195 ? A 4.319 -21.714 16.427 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 196 N NE . ARG 195 195 ? A 5.393 -21.174 17.317 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 197 C CZ . ARG 195 195 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #