data_SMR-72515d28670dc7fb9cd3448af56d9ffd_7 _entry.id SMR-72515d28670dc7fb9cd3448af56d9ffd_7 _struct.entry_id SMR-72515d28670dc7fb9cd3448af56d9ffd_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q66JQ7/ KNL1_MOUSE, Outer kinetochore KNL1 complex subunit KNL1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q66JQ7' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 276655.875 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KNL1_MOUSE Q66JQ7 1 ;MDGVYSEANEENDNTQRPVRRQHSSILKPPRSPLQDLKCGNQTNQEPNPPRKRKSSRRVSFADTIKVFQT ESHMKTERNSEISGMNTLLCAPIQTQMQQKEFSITDCNHERKHANDQTVIFSDENQMDLTASHTVMITKG LSDCTKNENSTKIDTTSFLENLKHHAANSRIKKDLACSTVSLSQNIFSEKINSDNFIKRLKTGKHISSST ELDKENAEIPVYSKDSNSASSTYQMHASLGVDENSSNRTRIFREQDDGMNLTQCHTACIKTWIPPSTEAK IGEFKGDKTIYGNECMELTTNYTIQVLSSENNLSERETQTQNGMNVTTVDGATAPAPEKKTALKDKLNAA FQGSFPNPENKIHIIKCHPIESETHTVTQISSQSASTLAVTSKSICSSPAIEGYKTIFHSSSNDAMELTK CLSAMEEEKKLLKADDKYSKICTNPDAGPLREKTIYLEEDSMDITKSHTVAIDNKIFKHDQENIKKEIIA IPIFEKEMVLRNLMPMSKDEKRDVNYISVPQVSKESLQRSQTNTLSVSLTDKKMEFLADEDMDLTKSHTT KLSQVIPTTFDLASKNVTKSYSHSKSPLNEWESLDKQVVLGQHSKLPLPQRKDRDDPDCSHHKIMYSEEL QTMDLTKSHTIVIGFGPSEVQEHSKINLEHKNSQLTAESIQTAVNVPAANSRVVTTNDMDMLKDRSTHKP ELLKEKQNIKIYGRKSIGRLKIDKTILFSEGNEGDMDITKSCTVKINHRSLLDKHDSHLVSLAGTSKTIL HARGQVEMEINRSHTTPLECKIISPSDITPGDLDKTMMSIDDHEELDMTKSHTVFIDYQAEAKGVLPDRL DFQLSKKESLQKPKVTSLAEEIYISKNSESNHLPAKGSQLTILEEGSNSGLGEETNDAQKPGFLNELLSG KTQRRKSLSLKNKSITFPENDKSYREIPQSSAVEINNETRLEDRKGFSFVPLAGTSKPVLSAYGPEDMEI SIGQTTASEYKTVPPEEITTIPMDKTVMFVDNFGDLDVTRSHTVFIDCQAKEKVLDEYTNLGIQKTKTLS GSEGDTHIQEITKNPAAQHKHHMTTVIPSSTVVSDQSSMKIKFHKADRDEEVKGKEVEANMLKQTKPESC LLNITDGKNVDFTSSYTADVCRSSDKYSSLPNISSSDNSGGNTMSLCDKNKEKAYNCQVPNEFTYAAILP STYHMDSKKLSVFPPCPSKEVTQTESAIALLKDEDPVEEPLGEMATFNSKHVSLNLAKDQTEAFVDVSVA SQPHLSAQQSPSTQKGQDVARRDEGILAKAGKKALPFLLENVAASTWENESKIPTNVEHFAVTYEKELSI SIQTDKCNTNVQSPSNSALTTQVIQTHANAEGALDFLVPSTVSCFSSTKPSLSNLNRKTEEVLDFQTVNL LPPAEQLLEEGSQAHSMSIVQATEIYRLGSRNDRDEESKTFCNEAETTSVPLKTAVKDKTRRCSLGIFLP KLPSKRSCSITGVDDLEQILADAADLTQLETQPVCSKDPGIGSVAAKLNLSPSQFINEENLPVYPGEILS SDSVSLDIEESVLIDTSQRESLPSENKTENCRAQKRTRVEENDVTNEKKIRTHDSAQDQEIFDNHMEEDI NKNVNSVLLKSLSRTPSSCSSSLDSIKSDGLSLDVSTQRNSQMESQFLGDTISEESLKEKLKDGQITIKE FFILLQVHILIQKPRQSTLPAKFTINTLPTTEDLMLRQYVYGPRIQIYKEDCELLRQKIDELKISALNQN KLLADVNRNLWEKVKDYSDEELKNYGIYLNKIKSRYTKMTKVFNHQGKVALYNKLVHSAENEKNKLQIKI NEMDTILKKINNCLAEVETETKNLENEEKNDAMEEWDSEMRDAEKELEQLKTEEEELQRKFLEVETQKTQ TLAQIEFIKEQTTKTEELLDQLSLSEWDVIEWSDDQAVFTFVYDSIELIITFGEPLVGLPFLDKACRKIN ALSFQSLLDEDKAPPSSLLVHKLIFQYIEEQESWKKKCTAQHQVPQMLQELSLVVNHCRLLGEEIEFLKR WGPNYSLMHINVNNTELRLLFSSCAAFAKFEITLSPSAHYPLVPLPFTIHNHIGKTGHDEIAAIISKVPL EENYLKNVVKQIYQDLLKD ; 'Outer kinetochore KNL1 complex subunit KNL1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2119 1 2119 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . KNL1_MOUSE Q66JQ7 . 1 2119 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2024-11-27 2A934FF6CAAE5ED3 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no C ;MDGVYSEANEENDNTQRPVRRQHSSILKPPRSPLQDLKCGNQTNQEPNPPRKRKSSRRVSFADTIKVFQT ESHMKTERNSEISGMNTLLCAPIQTQMQQKEFSITDCNHERKHANDQTVIFSDENQMDLTASHTVMITKG LSDCTKNENSTKIDTTSFLENLKHHAANSRIKKDLACSTVSLSQNIFSEKINSDNFIKRLKTGKHISSST ELDKENAEIPVYSKDSNSASSTYQMHASLGVDENSSNRTRIFREQDDGMNLTQCHTACIKTWIPPSTEAK IGEFKGDKTIYGNECMELTTNYTIQVLSSENNLSERETQTQNGMNVTTVDGATAPAPEKKTALKDKLNAA FQGSFPNPENKIHIIKCHPIESETHTVTQISSQSASTLAVTSKSICSSPAIEGYKTIFHSSSNDAMELTK CLSAMEEEKKLLKADDKYSKICTNPDAGPLREKTIYLEEDSMDITKSHTVAIDNKIFKHDQENIKKEIIA IPIFEKEMVLRNLMPMSKDEKRDVNYISVPQVSKESLQRSQTNTLSVSLTDKKMEFLADEDMDLTKSHTT KLSQVIPTTFDLASKNVTKSYSHSKSPLNEWESLDKQVVLGQHSKLPLPQRKDRDDPDCSHHKIMYSEEL 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A 1 1890 GLN 1890 1890 GLN GLN C . A 1 1891 THR 1891 1891 THR THR C . A 1 1892 LEU 1892 1892 LEU LEU C . A 1 1893 ALA 1893 1893 ALA ALA C . A 1 1894 GLN 1894 1894 GLN GLN C . A 1 1895 ILE 1895 1895 ILE ILE C . A 1 1896 GLU 1896 1896 GLU GLU C . A 1 1897 PHE 1897 1897 PHE PHE C . A 1 1898 ILE 1898 1898 ILE ILE C . A 1 1899 LYS 1899 1899 LYS LYS C . A 1 1900 GLU 1900 1900 GLU GLU C . A 1 1901 GLN 1901 1901 GLN GLN C . A 1 1902 THR 1902 1902 THR THR C . A 1 1903 THR 1903 1903 THR THR C . A 1 1904 LYS 1904 1904 LYS LYS C . A 1 1905 THR 1905 1905 THR THR C . A 1 1906 GLU 1906 1906 GLU GLU C . A 1 1907 GLU 1907 1907 GLU GLU C . A 1 1908 LEU 1908 1908 LEU LEU C . A 1 1909 LEU 1909 1909 LEU LEU C . A 1 1910 ASP 1910 1910 ASP ASP C . A 1 1911 GLN 1911 1911 GLN GLN C . A 1 1912 LEU 1912 ? ? ? C . A 1 1913 SER 1913 ? ? ? C . A 1 1914 LEU 1914 ? ? ? C . A 1 1915 SER 1915 ? ? ? C . A 1 1916 GLU 1916 ? ? ? C . A 1 1917 TRP 1917 ? ? ? C . A 1 1918 ASP 1918 ? ? ? C . A 1 1919 VAL 1919 ? ? ? C . A 1 1920 ILE 1920 ? ? ? C . A 1 1921 GLU 1921 ? ? ? C . A 1 1922 TRP 1922 ? ? ? C . A 1 1923 SER 1923 ? ? ? C . A 1 1924 ASP 1924 ? ? ? C . A 1 1925 ASP 1925 ? ? ? C . A 1 1926 GLN 1926 ? ? ? C . A 1 1927 ALA 1927 ? ? ? C . A 1 1928 VAL 1928 ? ? ? C . A 1 1929 PHE 1929 ? ? ? C . A 1 1930 THR 1930 ? ? ? C . A 1 1931 PHE 1931 ? ? ? C . A 1 1932 VAL 1932 ? ? ? C . A 1 1933 TYR 1933 ? ? ? C . A 1 1934 ASP 1934 ? ? ? C . A 1 1935 SER 1935 ? ? ? C . A 1 1936 ILE 1936 ? ? ? C . A 1 1937 GLU 1937 ? ? ? C . A 1 1938 LEU 1938 ? ? ? C . A 1 1939 ILE 1939 ? ? ? C . A 1 1940 ILE 1940 ? ? ? C . A 1 1941 THR 1941 ? ? ? C . A 1 1942 PHE 1942 ? ? ? C . A 1 1943 GLY 1943 ? ? ? C . A 1 1944 GLU 1944 ? ? ? C . A 1 1945 PRO 1945 ? ? ? C . A 1 1946 LEU 1946 ? ? ? C . A 1 1947 VAL 1947 ? ? ? C . A 1 1948 GLY 1948 ? ? ? C . A 1 1949 LEU 1949 ? ? ? C . A 1 1950 PRO 1950 ? ? ? C . A 1 1951 PHE 1951 ? ? ? C . A 1 1952 LEU 1952 ? ? ? C . A 1 1953 ASP 1953 ? ? ? C . A 1 1954 LYS 1954 ? ? ? C . A 1 1955 ALA 1955 ? ? ? C . A 1 1956 CYS 1956 ? ? ? C . A 1 1957 ARG 1957 ? ? ? C . A 1 1958 LYS 1958 ? ? ? C . A 1 1959 ILE 1959 ? ? ? C . A 1 1960 ASN 1960 ? ? ? C . A 1 1961 ALA 1961 ? ? ? C . A 1 1962 LEU 1962 ? ? ? C . A 1 1963 SER 1963 ? ? ? C . A 1 1964 PHE 1964 ? ? ? C . A 1 1965 GLN 1965 ? ? ? C . A 1 1966 SER 1966 ? ? ? C . A 1 1967 LEU 1967 ? ? ? C . A 1 1968 LEU 1968 ? ? ? C . A 1 1969 ASP 1969 ? ? ? C . A 1 1970 GLU 1970 ? ? ? C . A 1 1971 ASP 1971 ? ? ? C . A 1 1972 LYS 1972 ? ? ? C . A 1 1973 ALA 1973 ? ? ? C . A 1 1974 PRO 1974 ? ? ? C . A 1 1975 PRO 1975 ? ? ? C . A 1 1976 SER 1976 ? ? ? C . A 1 1977 SER 1977 ? ? ? C . A 1 1978 LEU 1978 ? ? ? C . A 1 1979 LEU 1979 ? ? ? C . A 1 1980 VAL 1980 ? ? ? C . A 1 1981 HIS 1981 ? ? ? C . A 1 1982 LYS 1982 ? ? ? C . A 1 1983 LEU 1983 ? ? ? C . A 1 1984 ILE 1984 ? ? ? C . A 1 1985 PHE 1985 ? ? ? C . A 1 1986 GLN 1986 ? ? ? C . A 1 1987 TYR 1987 ? ? ? C . A 1 1988 ILE 1988 ? ? ? C . A 1 1989 GLU 1989 ? ? ? C . A 1 1990 GLU 1990 ? ? ? C . A 1 1991 GLN 1991 ? ? ? C . A 1 1992 GLU 1992 ? ? ? C . A 1 1993 SER 1993 ? ? ? C . A 1 1994 TRP 1994 ? ? ? C . A 1 1995 LYS 1995 ? ? ? C . A 1 1996 LYS 1996 ? ? ? C . A 1 1997 LYS 1997 ? ? ? C . A 1 1998 CYS 1998 ? ? ? C . A 1 1999 THR 1999 ? ? ? C . A 1 2000 ALA 2000 ? ? ? C . A 1 2001 GLN 2001 ? ? ? C . A 1 2002 HIS 2002 ? ? ? C . A 1 2003 GLN 2003 ? ? ? C . A 1 2004 VAL 2004 ? ? ? C . A 1 2005 PRO 2005 ? ? ? C . A 1 2006 GLN 2006 ? ? ? C . A 1 2007 MET 2007 ? ? ? C . A 1 2008 LEU 2008 ? ? ? C . A 1 2009 GLN 2009 ? ? ? C . A 1 2010 GLU 2010 ? ? ? C . A 1 2011 LEU 2011 ? ? ? C . A 1 2012 SER 2012 ? ? ? C . A 1 2013 LEU 2013 ? ? ? C . A 1 2014 VAL 2014 ? ? ? C . A 1 2015 VAL 2015 ? ? ? C . A 1 2016 ASN 2016 ? ? ? C . A 1 2017 HIS 2017 ? ? ? C . A 1 2018 CYS 2018 ? ? ? C . A 1 2019 ARG 2019 ? ? ? C . A 1 2020 LEU 2020 ? ? ? C . A 1 2021 LEU 2021 ? ? ? C . A 1 2022 GLY 2022 ? ? ? C . A 1 2023 GLU 2023 ? ? ? C . A 1 2024 GLU 2024 ? ? ? C . A 1 2025 ILE 2025 ? ? ? C . A 1 2026 GLU 2026 ? ? ? C . A 1 2027 PHE 2027 ? ? ? C . A 1 2028 LEU 2028 ? ? ? C . A 1 2029 LYS 2029 ? ? ? C . A 1 2030 ARG 2030 ? ? ? C . A 1 2031 TRP 2031 ? ? ? C . A 1 2032 GLY 2032 ? ? ? C . A 1 2033 PRO 2033 ? ? ? C . A 1 2034 ASN 2034 ? ? ? C . A 1 2035 TYR 2035 ? ? ? C . A 1 2036 SER 2036 ? ? ? C . A 1 2037 LEU 2037 ? ? ? C . A 1 2038 MET 2038 ? ? ? C . A 1 2039 HIS 2039 ? ? ? C . A 1 2040 ILE 2040 ? ? ? C . A 1 2041 ASN 2041 ? ? ? C . A 1 2042 VAL 2042 ? ? ? C . A 1 2043 ASN 2043 ? ? ? C . A 1 2044 ASN 2044 ? ? ? C . A 1 2045 THR 2045 ? ? ? C . A 1 2046 GLU 2046 ? ? ? C . A 1 2047 LEU 2047 ? ? ? C . A 1 2048 ARG 2048 ? ? ? C . A 1 2049 LEU 2049 ? ? ? C . A 1 2050 LEU 2050 ? ? ? C . A 1 2051 PHE 2051 ? ? ? C . A 1 2052 SER 2052 ? ? ? C . A 1 2053 SER 2053 ? ? ? C . A 1 2054 CYS 2054 ? ? ? C . A 1 2055 ALA 2055 ? ? ? C . A 1 2056 ALA 2056 ? ? ? C . A 1 2057 PHE 2057 ? ? ? C . A 1 2058 ALA 2058 ? ? ? C . A 1 2059 LYS 2059 ? ? ? C . A 1 2060 PHE 2060 ? ? ? C . A 1 2061 GLU 2061 ? ? ? C . A 1 2062 ILE 2062 ? ? ? C . A 1 2063 THR 2063 ? ? ? C . A 1 2064 LEU 2064 ? ? ? C . A 1 2065 SER 2065 ? ? ? C . A 1 2066 PRO 2066 ? ? ? C . A 1 2067 SER 2067 ? ? ? C . A 1 2068 ALA 2068 ? ? ? C . A 1 2069 HIS 2069 ? ? ? C . A 1 2070 TYR 2070 ? ? ? C . A 1 2071 PRO 2071 ? ? ? C . A 1 2072 LEU 2072 ? ? ? C . A 1 2073 VAL 2073 ? ? ? C . A 1 2074 PRO 2074 ? ? ? C . A 1 2075 LEU 2075 ? ? ? C . A 1 2076 PRO 2076 ? ? ? C . A 1 2077 PHE 2077 ? ? ? C . A 1 2078 THR 2078 ? ? ? C . A 1 2079 ILE 2079 ? ? ? C . A 1 2080 HIS 2080 ? ? ? C . A 1 2081 ASN 2081 ? ? ? C . A 1 2082 HIS 2082 ? ? ? C . A 1 2083 ILE 2083 ? ? ? C . A 1 2084 GLY 2084 ? ? ? C . A 1 2085 LYS 2085 ? ? ? C . A 1 2086 THR 2086 ? ? ? C . A 1 2087 GLY 2087 ? ? ? C . A 1 2088 HIS 2088 ? ? ? C . A 1 2089 ASP 2089 ? ? ? C . A 1 2090 GLU 2090 ? ? ? C . A 1 2091 ILE 2091 ? ? ? C . A 1 2092 ALA 2092 ? ? ? C . A 1 2093 ALA 2093 ? ? ? C . A 1 2094 ILE 2094 ? ? ? C . A 1 2095 ILE 2095 ? ? ? C . A 1 2096 SER 2096 ? ? ? C . A 1 2097 LYS 2097 ? ? ? C . A 1 2098 VAL 2098 ? ? ? C . A 1 2099 PRO 2099 ? ? ? C . A 1 2100 LEU 2100 ? ? ? C . A 1 2101 GLU 2101 ? ? ? C . A 1 2102 GLU 2102 ? ? ? C . A 1 2103 ASN 2103 ? ? ? C . A 1 2104 TYR 2104 ? ? ? C . A 1 2105 LEU 2105 ? ? ? C . A 1 2106 LYS 2106 ? ? ? C . A 1 2107 ASN 2107 ? ? ? C . A 1 2108 VAL 2108 ? ? ? C . A 1 2109 VAL 2109 ? ? ? C . A 1 2110 LYS 2110 ? ? ? C . A 1 2111 GLN 2111 ? ? ? C . A 1 2112 ILE 2112 ? ? ? C . A 1 2113 TYR 2113 ? ? ? C . A 1 2114 GLN 2114 ? ? ? C . A 1 2115 ASP 2115 ? ? ? C . A 1 2116 LEU 2116 ? ? ? C . A 1 2117 LEU 2117 ? ? ? C . A 1 2118 LYS 2118 ? ? ? C . A 1 2119 ASP 2119 ? ? ? C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4 {PDB ID=7enj, label_asym_id=C, auth_asym_id=D, SMTL ID=7enj.1.C}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7enj, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 3 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAASSSGEKEKERLGGGLGVAGGNSTRERLLSALEDLEVLSRELIEMLAISRNQKLLQAGEENQVLELLI HRDGEFQELMKLALNQGKIHHEMQVLEKEVEKRDSDIQQLQKQLKEAEQILATAVYQAKEKLKSIEKARK GAISSEEIIKYAHRISASNAVCAPLTWVPGDPRRPYPTDLEMRSGLLGQMNNPSTNGVNGHLPGDALAAG RLPDVLAPQYPWQSNDMSMNMLPPNHSSDFLLEPPGHNKENEDDVEIMSTDSSSSSSESD ; ;MAASSSGEKEKERLGGGLGVAGGNSTRERLLSALEDLEVLSRELIEMLAISRNQKLLQAGEENQVLELLI HRDGEFQELMKLALNQGKIHHEMQVLEKEVEKRDSDIQQLQKQLKEAEQILATAVYQAKEKLKSIEKARK GAISSEEIIKYAHRISASNAVCAPLTWVPGDPRRPYPTDLEMRSGLLGQMNNPSTNGVNGHLPGDALAAG RLPDVLAPQYPWQSNDMSMNMLPPNHSSDFLLEPPGHNKENEDDVEIMSTDSSSSSSESD ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 27 123 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7enj 2024-06-05 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2119 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2122 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 16.000 12.766 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDGVYSEANEENDNTQRPVRRQHSSILKPPRSPLQDLKCGNQTNQEPNPPRKRKSSRRVSFADTIKVFQTESHMKTERNSEISGMNTLLCAPIQTQMQQKEFSITDCNHERKHANDQTVIFSDENQMDLTASHTVMITKGLSDCTKNENSTKIDTTSFLENLKHHAANSRIKKDLACSTVSLSQNIFSEKINSDNFIKRLKTGKHISSSTELDKENAEIPVYSKDSNSASSTYQMHASLGVDENSSNRTRIFREQDDGMNLTQCHTACIKTWIPPSTEAKIGEFKGDKTIYGNECMELTTNYTIQVLSSENNLSERETQTQNGMNVTTVDGATAPAPEKKTALKDKLNAAFQGSFPNPENKIHIIKCHPIESETHTVTQISSQSASTLAVTSKSICSSPAIEGYKTIFHSSSNDAMELTKCLSAMEEEKKLLKADDKYSKICTNPDAGPLREKTIYLEEDSMDITKSHTVAIDNKIFKHDQENIKKEIIAIPIFEKEMVLRNLMPMSKDEKRDVNYISVPQVSKESLQRSQTNTLSVSLTDKKMEFLADEDMDLTKSHTTKLSQVIPTTFDLASKNVTKSYSHSKSPLNEWESLDKQVVLGQHSKLPLPQRKDRDDPDCSHHKIMYSEELQTMDLTKSHTIVIGFGPSEVQEHSKINLEHKNSQLTAESIQTAVNVPAANSRVVTTNDMDMLKDRSTHKPELLKEKQNIKIYGRKSIGRLKIDKTILFSEGNEGDMDITKSCTVKINHRSLLDKHDSHLVSLAGTSKTILHARGQVEMEINRSHTTPLECKIISPSDITPGDLDKTMMSIDDHEELDMTKSHTVFIDYQAEAKGVLPDRLDFQLSKKESLQKPKVTSLAEEIYISKNSESNHLPAKGSQLTILEEGSNSGLGEETNDAQKPGFLNELLSGKTQRRKSLSLKNKSITFPENDKSYREIPQSSAVEINNETRLEDRKGFSFVPLAGTSKPVLSAYGPEDMEISIGQTTASEYKTVPPEEITTIPMDKTVMFVDNFGDLDVTRSHTVFIDCQAKEKVLDEYTNLGIQKTKTLSGSEGDTHIQEITKNPAAQHKHHMTTVIPSSTVVSDQSSMKIKFHKADRDEEVKGKEVEANMLKQTKPESCLLNITDGKNVDFTSSYTADVCRSSDKYSSLPNISSSDNSGGNTMSLCDKNKEKAYNCQVPNEFTYAAILPSTYHMDSKKLSVFPPCPSKEVTQTESAIALLKDEDPVEEPLGEMATFNSKHVSLNLAKDQTEAFVDVSVASQPHLSAQQSPSTQKGQDVARRDEGILAKAGKKALPFLLENVAASTWENESKIPTNVEHFAVTYEKELSISIQTDKCNTNVQSPSNSALTTQVIQTHANAEGALDFLVPSTVSCFSSTKPSLSNLNRKTEEVLDFQTVNLLPPAEQLLEEGSQAHSMSIVQATEIYRLGSRNDRDEESKTFCNEAETTSVPLKTAVKDKTRRCSLGIFLPKLPSKRSCSITGVDDLEQILADAADLTQLETQPVCSKDPGIGSVAAKLNLSPSQFINEENLPVYPGEILSSDSVSLDIEESVLIDTSQRESLPSENKTENCRAQKRTRVEENDVTNEKKIRTHDSAQDQEIFDNHMEEDINKNVNSVLLKSLSRTPSSCSSSLDSIKSDGLSLDVSTQRNSQMESQFLGDTISEESLKEKLKDGQITIKEFFILLQVHILIQKPRQSTLPAKFTINTLPTTEDLMLRQYVYGPRIQIYKEDCELLRQKIDELKISALNQNKLLADVNRNLWEKVKDYSDEELKNYGIYLNKIKSRYTKMTKVFNHQGKVALYNKLVHSAENEKNKLQIKINEMDTILKKINNCLAEVETETKNLENEEKNDAMEEWDSEMRDAEKELEQLK---TEEEELQRKFLEVETQKTQTLAQIEFIKEQTTKTEELLDQLSLSEWDVIEWSDDQAVFTFVYDSIELIITFGEPLVGLPFLDKACRKINALSFQSLLDEDKAPPSSLLVHKLIFQYIEEQESWKKKCTAQHQVPQMLQELSLVVNHCRLLGEEIEFLKRWGPNYSLMHINVNNTELRLLFSSCAAFAKFEITLSPSAHYPLVPLPFTIHNHIGKTGHDEIAAIISKVPLEENYLKNVVKQIYQDLLKD 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RERLLSALEDLEVLSRELIEMLAISRNQ-KLLQ----AGEENQVLELLIHRDGEFQELMKLALNQGKIHHEMQVLEKEVEKRDSDIQQLQKQLKEAEQILAT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7enj.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 1813 1813 ? A 225.826 258.739 314.945 1 1 C LYS 0.420 1 ATOM 2 C CA . LYS 1813 1813 ? A 225.903 259.452 316.264 1 1 C LYS 0.420 1 ATOM 3 C C . LYS 1813 1813 ? A 227.109 260.340 316.437 1 1 C LYS 0.420 1 ATOM 4 O O . LYS 1813 1813 ? A 226.932 261.513 316.720 1 1 C LYS 0.420 1 ATOM 5 C CB . LYS 1813 1813 ? A 225.739 258.472 317.443 1 1 C LYS 0.420 1 ATOM 6 C CG . LYS 1813 1813 ? A 224.355 257.802 317.474 1 1 C LYS 0.420 1 ATOM 7 C CD . LYS 1813 1813 ? A 224.224 256.813 318.643 1 1 C LYS 0.420 1 ATOM 8 C CE . LYS 1813 1813 ? A 222.858 256.118 318.692 1 1 C LYS 0.420 1 ATOM 9 N NZ . LYS 1813 1813 ? A 222.816 255.133 319.797 1 1 C LYS 0.420 1 ATOM 10 N N . ASN 1814 1814 ? A 228.349 259.842 316.216 1 1 C ASN 0.510 1 ATOM 11 C CA . ASN 1814 1814 ? A 229.558 260.652 316.357 1 1 C ASN 0.510 1 ATOM 12 C C . ASN 1814 1814 ? A 229.525 261.935 315.537 1 1 C ASN 0.510 1 ATOM 13 O O . ASN 1814 1814 ? A 229.727 263.019 316.061 1 1 C ASN 0.510 1 ATOM 14 C CB . ASN 1814 1814 ? A 230.790 259.802 315.945 1 1 C ASN 0.510 1 ATOM 15 C CG . ASN 1814 1814 ? A 230.936 258.644 316.932 1 1 C ASN 0.510 1 ATOM 16 O OD1 . ASN 1814 1814 ? A 230.301 258.626 317.983 1 1 C ASN 0.510 1 ATOM 17 N ND2 . ASN 1814 1814 ? A 231.741 257.614 316.588 1 1 C ASN 0.510 1 ATOM 18 N N . LYS 1815 1815 ? A 229.153 261.849 314.240 1 1 C LYS 0.590 1 ATOM 19 C CA . LYS 1815 1815 ? A 228.995 263.029 313.405 1 1 C LYS 0.590 1 ATOM 20 C C . LYS 1815 1815 ? A 227.966 264.026 313.916 1 1 C LYS 0.590 1 ATOM 21 O O . LYS 1815 1815 ? A 228.249 265.215 313.994 1 1 C LYS 0.590 1 ATOM 22 C CB . LYS 1815 1815 ? A 228.667 262.636 311.951 1 1 C LYS 0.590 1 ATOM 23 C CG . LYS 1815 1815 ? A 229.824 261.867 311.300 1 1 C LYS 0.590 1 ATOM 24 C CD . LYS 1815 1815 ? A 229.510 261.447 309.857 1 1 C LYS 0.590 1 ATOM 25 C CE . LYS 1815 1815 ? A 230.670 260.705 309.187 1 1 C LYS 0.590 1 ATOM 26 N NZ . LYS 1815 1815 ? A 230.285 260.294 307.819 1 1 C LYS 0.590 1 ATOM 27 N N . LEU 1816 1816 ? A 226.781 263.546 314.353 1 1 C LEU 0.590 1 ATOM 28 C CA . LEU 1816 1816 ? A 225.767 264.370 314.990 1 1 C LEU 0.590 1 ATOM 29 C C . LEU 1816 1816 ? A 226.288 265.091 316.236 1 1 C LEU 0.590 1 ATOM 30 O O . LEU 1816 1816 ? A 226.211 266.307 316.342 1 1 C LEU 0.590 1 ATOM 31 C CB . LEU 1816 1816 ? A 224.553 263.490 315.405 1 1 C LEU 0.590 1 ATOM 32 C CG . LEU 1816 1816 ? A 223.663 262.989 314.250 1 1 C LEU 0.590 1 ATOM 33 C CD1 . LEU 1816 1816 ? A 222.781 261.799 314.676 1 1 C LEU 0.590 1 ATOM 34 C CD2 . LEU 1816 1816 ? A 222.772 264.127 313.745 1 1 C LEU 0.590 1 ATOM 35 N N . GLN 1817 1817 ? A 226.903 264.351 317.180 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 36 C CA . GLN 1817 1817 ? A 227.470 264.886 318.407 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 37 C C . GLN 1817 1817 ? A 228.641 265.837 318.231 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 38 O O . GLN 1817 1817 ? A 228.770 266.813 318.968 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 39 C CB . GLN 1817 1817 ? A 227.827 263.762 319.397 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 40 C CG . GLN 1817 1817 ? A 226.575 262.986 319.863 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 41 C CD . GLN 1817 1817 ? A 226.977 261.824 320.768 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 42 O OE1 . GLN 1817 1817 ? A 228.087 261.302 320.698 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 43 N NE2 . GLN 1817 1817 ? A 226.048 261.376 321.645 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 44 N N . ILE 1818 1818 ? A 229.521 265.605 317.237 1 1 C ILE 0.610 1 ATOM 45 C CA . ILE 1818 1818 ? A 230.539 266.574 316.862 1 1 C ILE 0.610 1 ATOM 46 C C . ILE 1818 1818 ? A 229.904 267.868 316.362 1 1 C ILE 0.610 1 ATOM 47 O O . ILE 1818 1818 ? A 230.219 268.943 316.863 1 1 C ILE 0.610 1 ATOM 48 C CB . ILE 1818 1818 ? A 231.508 265.964 315.856 1 1 C ILE 0.610 1 ATOM 49 C CG1 . ILE 1818 1818 ? A 232.297 264.828 316.552 1 1 C ILE 0.610 1 ATOM 50 C CG2 . ILE 1818 1818 ? A 232.473 267.027 315.286 1 1 C ILE 0.610 1 ATOM 51 C CD1 . ILE 1818 1818 ? A 233.027 263.908 315.571 1 1 C ILE 0.610 1 ATOM 52 N N . LYS 1819 1819 ? A 228.911 267.781 315.445 1 1 C LYS 0.620 1 ATOM 53 C CA . LYS 1819 1819 ? A 228.179 268.932 314.936 1 1 C LYS 0.620 1 ATOM 54 C C . LYS 1819 1819 ? A 227.403 269.695 316.005 1 1 C LYS 0.620 1 ATOM 55 O O . LYS 1819 1819 ? A 227.396 270.922 315.994 1 1 C LYS 0.620 1 ATOM 56 C CB . LYS 1819 1819 ? A 227.210 268.532 313.796 1 1 C LYS 0.620 1 ATOM 57 C CG . LYS 1819 1819 ? A 227.878 268.050 312.503 1 1 C LYS 0.620 1 ATOM 58 C CD . LYS 1819 1819 ? A 228.667 269.152 311.794 1 1 C LYS 0.620 1 ATOM 59 C CE . LYS 1819 1819 ? A 229.351 268.633 310.538 1 1 C LYS 0.620 1 ATOM 60 N NZ . LYS 1819 1819 ? A 230.020 269.767 309.882 1 1 C LYS 0.620 1 ATOM 61 N N . ILE 1820 1820 ? A 226.758 268.986 316.965 1 1 C ILE 0.640 1 ATOM 62 C CA . ILE 1820 1820 ? A 226.173 269.554 318.186 1 1 C ILE 0.640 1 ATOM 63 C C . ILE 1820 1820 ? A 227.189 270.394 318.953 1 1 C ILE 0.640 1 ATOM 64 O O . ILE 1820 1820 ? A 227.062 271.611 319.023 1 1 C ILE 0.640 1 ATOM 65 C CB . ILE 1820 1820 ? A 225.584 268.461 319.113 1 1 C ILE 0.640 1 ATOM 66 C CG1 . ILE 1820 1820 ? A 224.325 267.800 318.490 1 1 C ILE 0.640 1 ATOM 67 C CG2 . ILE 1820 1820 ? A 225.232 269.003 320.523 1 1 C ILE 0.640 1 ATOM 68 C CD1 . ILE 1820 1820 ? A 223.869 266.497 319.169 1 1 C ILE 0.640 1 ATOM 69 N N . ASN 1821 1821 ? A 228.281 269.782 319.466 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 70 C CA . ASN 1821 1821 ? A 229.223 270.471 320.342 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 71 C C . ASN 1821 1821 ? A 229.997 271.597 319.663 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 72 O O . ASN 1821 1821 ? A 230.318 272.614 320.281 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 73 C CB . ASN 1821 1821 ? A 230.241 269.488 320.967 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 74 C CG . ASN 1821 1821 ? A 229.566 268.574 321.983 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 75 O OD1 . ASN 1821 1821 ? A 228.531 268.869 322.572 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 76 N ND2 . ASN 1821 1821 ? A 230.208 267.414 322.265 1 1 C ASN 0.650 1 ATOM 77 N N . GLU 1822 1822 ? A 230.325 271.414 318.367 1 1 C GLU 0.630 1 ATOM 78 C CA . GLU 1822 1822 ? A 230.919 272.416 317.501 1 1 C GLU 0.630 1 ATOM 79 C C . GLU 1822 1822 ? A 230.000 273.615 317.299 1 1 C GLU 0.630 1 ATOM 80 O O . GLU 1822 1822 ? A 230.408 274.760 317.490 1 1 C GLU 0.630 1 ATOM 81 C CB . GLU 1822 1822 ? A 231.242 271.761 316.130 1 1 C GLU 0.630 1 ATOM 82 C CG . GLU 1822 1822 ? A 231.912 272.677 315.076 1 1 C GLU 0.630 1 ATOM 83 C CD . GLU 1822 1822 ? A 232.134 272.038 313.695 1 1 C GLU 0.630 1 ATOM 84 O OE1 . GLU 1822 1822 ? A 231.682 270.890 313.433 1 1 C GLU 0.630 1 ATOM 85 O OE2 . GLU 1822 1822 ? A 232.738 272.743 312.846 1 1 C GLU 0.630 1 ATOM 86 N N . MET 1823 1823 ? A 228.702 273.377 316.987 1 1 C MET 0.640 1 ATOM 87 C CA . MET 1823 1823 ? A 227.691 274.418 316.882 1 1 C MET 0.640 1 ATOM 88 C C . MET 1823 1823 ? A 227.515 275.146 318.203 1 1 C MET 0.640 1 ATOM 89 O O . MET 1823 1823 ? A 227.589 276.373 318.250 1 1 C MET 0.640 1 ATOM 90 C CB . MET 1823 1823 ? A 226.319 273.819 316.469 1 1 C MET 0.640 1 ATOM 91 C CG . MET 1823 1823 ? A 225.139 274.812 316.367 1 1 C MET 0.640 1 ATOM 92 S SD . MET 1823 1823 ? 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A 207.803 239.442 309.218 1 1 C GLN 0.600 1 ATOM 626 C CD . GLN 1887 1887 ? A 207.608 240.163 307.889 1 1 C GLN 0.600 1 ATOM 627 O OE1 . GLN 1887 1887 ? A 208.549 240.461 307.154 1 1 C GLN 0.600 1 ATOM 628 N NE2 . GLN 1887 1887 ? A 206.332 240.464 307.554 1 1 C GLN 0.600 1 ATOM 629 N N . LYS 1888 1888 ? A 211.697 237.199 310.498 1 1 C LYS 0.600 1 ATOM 630 C CA . LYS 1888 1888 ? A 212.814 236.269 310.516 1 1 C LYS 0.600 1 ATOM 631 C C . LYS 1888 1888 ? A 212.751 235.261 311.665 1 1 C LYS 0.600 1 ATOM 632 O O . LYS 1888 1888 ? A 212.958 234.070 311.464 1 1 C LYS 0.600 1 ATOM 633 C CB . LYS 1888 1888 ? A 214.164 237.035 310.584 1 1 C LYS 0.600 1 ATOM 634 C CG . LYS 1888 1888 ? A 215.424 236.153 310.560 1 1 C LYS 0.600 1 ATOM 635 C CD . LYS 1888 1888 ? A 216.716 236.975 310.704 1 1 C LYS 0.600 1 ATOM 636 C CE . LYS 1888 1888 ? A 217.967 236.094 310.730 1 1 C LYS 0.600 1 ATOM 637 N NZ . LYS 1888 1888 ? A 219.183 236.932 310.831 1 1 C LYS 0.600 1 ATOM 638 N N . THR 1889 1889 ? 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A 205.996 236.106 313.297 1 1 C GLN 0.590 1 ATOM 652 O OE1 . GLN 1890 1890 ? A 205.868 236.485 312.133 1 1 C GLN 0.590 1 ATOM 653 N NE2 . GLN 1890 1890 ? A 205.120 236.492 314.257 1 1 C GLN 0.590 1 ATOM 654 N N . THR 1891 1891 ? A 209.794 232.676 310.904 1 1 C THR 0.610 1 ATOM 655 C CA . THR 1891 1891 ? A 210.221 231.711 309.886 1 1 C THR 0.610 1 ATOM 656 C C . THR 1891 1891 ? A 211.230 230.710 310.414 1 1 C THR 0.610 1 ATOM 657 O O . THR 1891 1891 ? A 211.134 229.516 310.136 1 1 C THR 0.610 1 ATOM 658 C CB . THR 1891 1891 ? A 210.712 232.315 308.571 1 1 C THR 0.610 1 ATOM 659 O OG1 . THR 1891 1891 ? A 211.791 233.224 308.734 1 1 C THR 0.610 1 ATOM 660 C CG2 . THR 1891 1891 ? A 209.558 233.098 307.937 1 1 C THR 0.610 1 ATOM 661 N N . LEU 1892 1892 ? A 212.197 231.156 311.248 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 662 C CA . LEU 1892 1892 ? A 213.117 230.273 311.956 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 663 C C . LEU 1892 1892 ? A 212.425 229.275 312.867 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 664 O O . LEU 1892 1892 ? A 212.742 228.088 312.843 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 665 C CB . LEU 1892 1892 ? A 214.148 231.053 312.807 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 666 C CG . LEU 1892 1892 ? A 215.177 231.862 311.995 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 667 C CD1 . LEU 1892 1892 ? A 215.975 232.787 312.928 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 668 C CD2 . LEU 1892 1892 ? A 216.100 230.972 311.150 1 1 C LEU 0.630 1 ATOM 669 N N . ALA 1893 1893 ? A 211.418 229.710 313.656 1 1 C ALA 0.670 1 ATOM 670 C CA . ALA 1893 1893 ? A 210.619 228.803 314.456 1 1 C ALA 0.670 1 ATOM 671 C C . ALA 1893 1893 ? A 209.898 227.755 313.602 1 1 C ALA 0.670 1 ATOM 672 O O . ALA 1893 1893 ? A 209.959 226.561 313.887 1 1 C ALA 0.670 1 ATOM 673 C CB . ALA 1893 1893 ? A 209.621 229.601 315.324 1 1 C ALA 0.670 1 ATOM 674 N N . GLN 1894 1894 ? A 209.269 228.168 312.478 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 675 C CA . GLN 1894 1894 ? A 208.645 227.259 311.523 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 676 C C . GLN 1894 1894 ? A 209.600 226.227 310.932 1 1 C GLN 0.580 1 ATOM 677 O O . GLN 1894 1894 ? 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A 208.700 220.648 313.318 1 1 C PHE 0.570 1 ATOM 704 C CB . PHE 1897 1897 ? A 207.963 223.624 314.379 1 1 C PHE 0.570 1 ATOM 705 C CG . PHE 1897 1897 ? A 207.845 224.067 315.814 1 1 C PHE 0.570 1 ATOM 706 C CD1 . PHE 1897 1897 ? A 207.567 223.112 316.804 1 1 C PHE 0.570 1 ATOM 707 C CD2 . PHE 1897 1897 ? A 207.998 225.409 316.203 1 1 C PHE 0.570 1 ATOM 708 C CE1 . PHE 1897 1897 ? A 207.455 223.481 318.148 1 1 C PHE 0.570 1 ATOM 709 C CE2 . PHE 1897 1897 ? A 207.914 225.780 317.553 1 1 C PHE 0.570 1 ATOM 710 C CZ . PHE 1897 1897 ? A 207.637 224.814 318.525 1 1 C PHE 0.570 1 ATOM 711 N N . ILE 1898 1898 ? A 209.502 222.095 311.805 1 1 C ILE 0.570 1 ATOM 712 C CA . ILE 1898 1898 ? A 209.669 221.064 310.780 1 1 C ILE 0.570 1 ATOM 713 C C . ILE 1898 1898 ? A 210.784 220.089 311.182 1 1 C ILE 0.570 1 ATOM 714 O O . ILE 1898 1898 ? A 210.559 218.881 311.270 1 1 C ILE 0.570 1 ATOM 715 C CB . ILE 1898 1898 ? A 209.915 221.641 309.372 1 1 C ILE 0.570 1 ATOM 716 C CG1 . ILE 1898 1898 ? 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A 207.456 217.911 314.684 1 1 C GLN 0.560 1 ATOM 743 C CD . GLN 1901 1901 ? A 206.193 218.697 314.302 1 1 C GLN 0.560 1 ATOM 744 O OE1 . GLN 1901 1901 ? A 205.875 219.730 314.890 1 1 C GLN 0.560 1 ATOM 745 N NE2 . GLN 1901 1901 ? A 205.427 218.191 313.311 1 1 C GLN 0.560 1 ATOM 746 N N . THR 1902 1902 ? A 210.553 215.943 311.806 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 747 C CA . THR 1902 1902 ? A 211.229 215.179 310.748 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 748 C C . THR 1902 1902 ? A 212.370 214.325 311.273 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 749 O O . THR 1902 1902 ? A 212.566 213.198 310.833 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 750 C CB . THR 1902 1902 ? A 211.734 215.988 309.548 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 751 O OG1 . THR 1902 1902 ? A 212.608 217.039 309.927 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 752 C CG2 . THR 1902 1902 ? A 210.571 216.657 308.807 1 1 C THR 0.620 1 ATOM 753 N N . THR 1903 1903 ? A 213.140 214.822 312.260 1 1 C THR 0.630 1 ATOM 754 C CA . THR 1903 1903 ? A 214.131 214.020 312.991 1 1 C THR 0.630 1 ATOM 755 C C . THR 1903 1903 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.551 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1813 LYS 1 0.420 2 1 A 1814 ASN 1 0.510 3 1 A 1815 LYS 1 0.590 4 1 A 1816 LEU 1 0.590 5 1 A 1817 GLN 1 0.580 6 1 A 1818 ILE 1 0.610 7 1 A 1819 LYS 1 0.620 8 1 A 1820 ILE 1 0.640 9 1 A 1821 ASN 1 0.650 10 1 A 1822 GLU 1 0.630 11 1 A 1823 MET 1 0.640 12 1 A 1824 ASP 1 0.680 13 1 A 1825 THR 1 0.700 14 1 A 1826 ILE 1 0.620 15 1 A 1827 LEU 1 0.620 16 1 A 1828 LYS 1 0.660 17 1 A 1829 LYS 1 0.640 18 1 A 1830 ILE 1 0.570 19 1 A 1831 ASN 1 0.590 20 1 A 1832 ASN 1 0.580 21 1 A 1833 CYS 1 0.520 22 1 A 1834 LEU 1 0.500 23 1 A 1835 ALA 1 0.550 24 1 A 1836 GLU 1 0.490 25 1 A 1837 VAL 1 0.610 26 1 A 1838 GLU 1 0.400 27 1 A 1839 THR 1 0.380 28 1 A 1840 GLU 1 0.520 29 1 A 1841 THR 1 0.450 30 1 A 1842 LYS 1 0.490 31 1 A 1843 ASN 1 0.390 32 1 A 1844 LEU 1 0.380 33 1 A 1845 GLU 1 0.350 34 1 A 1846 ASN 1 0.360 35 1 A 1847 GLU 1 0.420 36 1 A 1848 GLU 1 0.290 37 1 A 1849 LYS 1 0.310 38 1 A 1850 ASN 1 0.340 39 1 A 1851 ASP 1 0.360 40 1 A 1852 ALA 1 0.400 41 1 A 1853 MET 1 0.430 42 1 A 1854 GLU 1 0.460 43 1 A 1855 GLU 1 0.490 44 1 A 1856 TRP 1 0.500 45 1 A 1857 ASP 1 0.550 46 1 A 1858 SER 1 0.670 47 1 A 1859 GLU 1 0.650 48 1 A 1860 MET 1 0.630 49 1 A 1861 ARG 1 0.670 50 1 A 1862 ASP 1 0.740 51 1 A 1863 ALA 1 0.760 52 1 A 1864 GLU 1 0.690 53 1 A 1865 LYS 1 0.690 54 1 A 1866 GLU 1 0.660 55 1 A 1867 LEU 1 0.610 56 1 A 1868 GLU 1 0.600 57 1 A 1869 GLN 1 0.540 58 1 A 1870 LEU 1 0.460 59 1 A 1871 LYS 1 0.390 60 1 A 1872 THR 1 0.330 61 1 A 1873 GLU 1 0.410 62 1 A 1874 GLU 1 0.450 63 1 A 1875 GLU 1 0.450 64 1 A 1876 GLU 1 0.540 65 1 A 1877 LEU 1 0.560 66 1 A 1878 GLN 1 0.570 67 1 A 1879 ARG 1 0.580 68 1 A 1880 LYS 1 0.630 69 1 A 1881 PHE 1 0.630 70 1 A 1882 LEU 1 0.660 71 1 A 1883 GLU 1 0.610 72 1 A 1884 VAL 1 0.660 73 1 A 1885 GLU 1 0.600 74 1 A 1886 THR 1 0.630 75 1 A 1887 GLN 1 0.600 76 1 A 1888 LYS 1 0.600 77 1 A 1889 THR 1 0.620 78 1 A 1890 GLN 1 0.590 79 1 A 1891 THR 1 0.610 80 1 A 1892 LEU 1 0.630 81 1 A 1893 ALA 1 0.670 82 1 A 1894 GLN 1 0.580 83 1 A 1895 ILE 1 0.600 84 1 A 1896 GLU 1 0.620 85 1 A 1897 PHE 1 0.570 86 1 A 1898 ILE 1 0.570 87 1 A 1899 LYS 1 0.600 88 1 A 1900 GLU 1 0.570 89 1 A 1901 GLN 1 0.560 90 1 A 1902 THR 1 0.620 91 1 A 1903 THR 1 0.630 92 1 A 1904 LYS 1 0.570 93 1 A 1905 THR 1 0.590 94 1 A 1906 GLU 1 0.570 95 1 A 1907 GLU 1 0.530 96 1 A 1908 LEU 1 0.530 97 1 A 1909 LEU 1 0.510 98 1 A 1910 ASP 1 0.430 99 1 A 1911 GLN 1 0.460 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #