data_SMR-583b1592c01b4fc7826c977e296b28af_1 _entry.id SMR-583b1592c01b4fc7826c977e296b28af_1 _struct.entry_id SMR-583b1592c01b4fc7826c977e296b28af_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P07897/ PGCA_RAT, Aggrecan core protein Estimated model accuracy of this model is 0.059, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P07897' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CA non-polymer 'CALCIUM ION' Ca 40.078 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 259497.538 1 . 2 non-polymer man 'CALCIUM ION' 40.078 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PGCA_RAT P07897 1 ;MTTLLLVFVTLRVIAAVISEEVPDHDNSLSVSIPQPSPLKALLGTSLTIPCYFIDPMHPVTTAPSTAPLT PRIKWSRVSKEKEVVLLVATEGQVRVNSIYQDKVSLPNYPAIPSDATLEIQNLRSNDSGIYRCEVMHGIE DSEATLEVIVKGIVFHYRAISTRYTLDFDRAQRACLQNSAIIATPEQLQAAYEDGFHQCDAGWLADQTVR YPIHTPREGCYGDKDEFPGVRTYGIRDTNETYDVYCFAEEMEGEVFYATSPEKFTFQEAANECRTVGARL ATTGQLYLAWQGGMDMCSAGWLADRSVRYPISKARPNCGGNLLGVRTVYLHANQTGYPDPSSRYDAICYT GEDFVDIPENFFGVGGEEDITIQTVTWPDLELPLPRNITEGEARGNVILTAKPIFDMSPTVSEPGEALTL APEVGTTVFPEAGERTEKTTRPWGFPEEATRGPDSATAFASEDLVVRVTISPGAVEVPGQPRLPGGVVFH YRPGSTRYSLTFEEAQQACIRTGAAIASPEQLQAAYEAGYEQCDAGWLQDQTVRYPIVSPRTPCVGDKDS SPGVRTYGVRPSSETYDVYCYVDKLEGEVFFATQMEQFTFQEAQAFCAAQNATLASTGQLYAAWSQGLDK CYAGWLADGTLRYPIVNPRPACGGDKPGVRTVYLYPNQTGLPDPLSKHHAFCFRGVSVVPSPGGTPTSPS DIEDWIVTRVEPGVDAVPLEPETTEVPYFTTEPEKQTEWEPAYTPVGTSPLPGIPPTWLPTVPAAEEHTE SPSASQEPSASQVPSTSEEPYTPSLAVPSGTELPSSGDTSGAPDLSGDFTGSTDTSGRLDSSGEPSGGSE SGLPSGDLDSSGLGPTVSSGLPVESGSASGDGEIPWSSTPTVDRLPSGGESLEGSASASGTGDLSGLPSG GEITETSASGTEEISGLPSGGDDLETSTSGIDGASVLPTGRGGLETSASGVEDLSGLPSGEEGSETSTSG IEDISVLPTGESPETSASGVGDLSGLPSGGESLETSASGVEDVTQLPTERGGLETSASGIEDITVLPTGR ENLETSASGVEDVSGLPSGKEGLETSASGIEDISVFPTEAEGLETSASGGYVSGIPSGEDGTETSTSGVE GVSGLPSGGEGLETSASGVEDLGLPTRDSLETSASGVDVTGYPSGREDTETSVPGVGDDLSGLPSGQEGL ETSASGAEDLGGLPSGKEDLVGSASGALDFGKLPSGTLGSGQTPEASGLPSGFSGEYSGVDIGSGPSSGL PDFSGLPSGFPTVSLVDSTLVEVITATTASELEGRGTISVSGSGEESGPPLSELDSSADISGLPSGTELS GQTSGSLDVSGETSGFFDVSGQPFGSSGTGEGTSGIPEVSGQAVRSPDTTEISELSGLSSGQPDVSGEGS GILFGSGQSSGITSVSGETSGISDLSGQPSGFPVLSGTTPGTPDLASGAMSGSGDSSGITFVDTSLIEVT PTTFREEEGLGSVELSGLPSGETDLSGTSGMVDVSGQSSGAIDSSGLISPTPEFSGLPSGVAEVSGEVSG VETGSSLSSGAFDGSGLVSGFPTVSLVDRTLVESITLAPTAQEAGEGPSSILEFSGAHSGTPDISGDLSG SLDQSTWQPGWTEASTEPPSSPYFSGDFSSTTDASGESITAPTGSGETSGLPEVTLITSELVEGVTEPTV SQELGHGPSMTYTPRLFEASGEASASGDLGGPVTIFPGSGVEASVPEGSSDPSAYPEAGVGVSAAPEASS QLSEFPDLHGITSASRETDLEMTTPGTEVSSNPWTFQEGTREGSAAPEVSGESSTTSDIDAGTSGVPFAT PMTSGDRTEISGEWSDHTSEVNVTVSTTVPESRWAQSTQHPTETLQEIGSPNPSYSGEETQTAETAKSLT DTPTLASPEGSGETESTAADQEQCEEGWTKFQGHCYRHFPDRETWVDAERRCREQQSHLSSIVTPEEQEF VNKNAQDYQWIGLNDRTIEGDFRWSDGHSLQFEKWRPNQPDNFFATGEDCVVMIWHERGEWNDVPCNYQL PFTCKKGTVACGEPPAVEHARTLGQKKDRYEISSLVRYQCTEGFVQRHVPTIRCQPSADWEEPRITCTDP NTYKHRLQKRTMRPTRRSRPSMAH ; 'Aggrecan core protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2124 1 2124 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PGCA_RAT P07897 . 1 2124 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 1989-07-01 E30BBE61593A34B1 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MTTLLLVFVTLRVIAAVISEEVPDHDNSLSVSIPQPSPLKALLGTSLTIPCYFIDPMHPVTTAPSTAPLT PRIKWSRVSKEKEVVLLVATEGQVRVNSIYQDKVSLPNYPAIPSDATLEIQNLRSNDSGIYRCEVMHGIE DSEATLEVIVKGIVFHYRAISTRYTLDFDRAQRACLQNSAIIATPEQLQAAYEDGFHQCDAGWLADQTVR YPIHTPREGCYGDKDEFPGVRTYGIRDTNETYDVYCFAEEMEGEVFYATSPEKFTFQEAANECRTVGARL ATTGQLYLAWQGGMDMCSAGWLADRSVRYPISKARPNCGGNLLGVRTVYLHANQTGYPDPSSRYDAICYT GEDFVDIPENFFGVGGEEDITIQTVTWPDLELPLPRNITEGEARGNVILTAKPIFDMSPTVSEPGEALTL APEVGTTVFPEAGERTEKTTRPWGFPEEATRGPDSATAFASEDLVVRVTISPGAVEVPGQPRLPGGVVFH YRPGSTRYSLTFEEAQQACIRTGAAIASPEQLQAAYEAGYEQCDAGWLQDQTVRYPIVSPRTPCVGDKDS SPGVRTYGVRPSSETYDVYCYVDKLEGEVFFATQMEQFTFQEAQAFCAAQNATLASTGQLYAAWSQGLDK 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A 1 1927 ARG 1927 1927 ARG ARG B . A 1 1928 HIS 1928 1928 HIS HIS B . A 1 1929 PHE 1929 1929 PHE PHE B . A 1 1930 PRO 1930 1930 PRO PRO B . A 1 1931 ASP 1931 1931 ASP ASP B . A 1 1932 ARG 1932 1932 ARG ARG B . A 1 1933 GLU 1933 1933 GLU GLU B . A 1 1934 THR 1934 1934 THR THR B . A 1 1935 TRP 1935 1935 TRP TRP B . A 1 1936 VAL 1936 1936 VAL VAL B . A 1 1937 ASP 1937 1937 ASP ASP B . A 1 1938 ALA 1938 1938 ALA ALA B . A 1 1939 GLU 1939 1939 GLU GLU B . A 1 1940 ARG 1940 1940 ARG ARG B . A 1 1941 ARG 1941 1941 ARG ARG B . A 1 1942 CYS 1942 1942 CYS CYS B . A 1 1943 ARG 1943 1943 ARG ARG B . A 1 1944 GLU 1944 1944 GLU GLU B . A 1 1945 GLN 1945 1945 GLN GLN B . A 1 1946 GLN 1946 1946 GLN GLN B . A 1 1947 SER 1947 1947 SER SER B . A 1 1948 HIS 1948 1948 HIS HIS B . A 1 1949 LEU 1949 1949 LEU LEU B . A 1 1950 SER 1950 1950 SER SER B . A 1 1951 SER 1951 1951 SER SER B . A 1 1952 ILE 1952 1952 ILE ILE B . A 1 1953 VAL 1953 1953 VAL VAL B . A 1 1954 THR 1954 1954 THR THR B . A 1 1955 PRO 1955 1955 PRO PRO B . A 1 1956 GLU 1956 1956 GLU GLU B . A 1 1957 GLU 1957 1957 GLU GLU B . A 1 1958 GLN 1958 1958 GLN GLN B . A 1 1959 GLU 1959 1959 GLU GLU B . A 1 1960 PHE 1960 1960 PHE PHE B . A 1 1961 VAL 1961 1961 VAL VAL B . A 1 1962 ASN 1962 1962 ASN ASN B . A 1 1963 LYS 1963 1963 LYS LYS B . A 1 1964 ASN 1964 1964 ASN ASN B . A 1 1965 ALA 1965 1965 ALA ALA B . A 1 1966 GLN 1966 1966 GLN GLN B . A 1 1967 ASP 1967 1967 ASP ASP B . A 1 1968 TYR 1968 1968 TYR TYR B . A 1 1969 GLN 1969 1969 GLN GLN B . A 1 1970 TRP 1970 1970 TRP TRP B . A 1 1971 ILE 1971 1971 ILE ILE B . A 1 1972 GLY 1972 1972 GLY GLY B . A 1 1973 LEU 1973 1973 LEU LEU B . A 1 1974 ASN 1974 1974 ASN ASN B . A 1 1975 ASP 1975 1975 ASP ASP B . A 1 1976 ARG 1976 1976 ARG ARG B . A 1 1977 THR 1977 1977 THR THR B . A 1 1978 ILE 1978 1978 ILE ILE B . A 1 1979 GLU 1979 1979 GLU GLU B . A 1 1980 GLY 1980 1980 GLY GLY B . A 1 1981 ASP 1981 1981 ASP ASP B . A 1 1982 PHE 1982 1982 PHE PHE B . A 1 1983 ARG 1983 1983 ARG ARG B . A 1 1984 TRP 1984 1984 TRP TRP B . A 1 1985 SER 1985 1985 SER SER B . A 1 1986 ASP 1986 1986 ASP ASP B . A 1 1987 GLY 1987 1987 GLY GLY B . A 1 1988 HIS 1988 1988 HIS HIS B . A 1 1989 SER 1989 1989 SER SER B . A 1 1990 LEU 1990 1990 LEU LEU B . A 1 1991 GLN 1991 1991 GLN GLN B . A 1 1992 PHE 1992 1992 PHE PHE B . A 1 1993 GLU 1993 1993 GLU GLU B . A 1 1994 LYS 1994 1994 LYS LYS B . A 1 1995 TRP 1995 1995 TRP TRP B . A 1 1996 ARG 1996 1996 ARG ARG B . A 1 1997 PRO 1997 1997 PRO PRO B . A 1 1998 ASN 1998 1998 ASN ASN B . A 1 1999 GLN 1999 1999 GLN GLN B . A 1 2000 PRO 2000 2000 PRO PRO B . A 1 2001 ASP 2001 2001 ASP ASP B . A 1 2002 ASN 2002 2002 ASN ASN B . A 1 2003 PHE 2003 2003 PHE PHE B . A 1 2004 PHE 2004 2004 PHE PHE B . A 1 2005 ALA 2005 2005 ALA ALA B . A 1 2006 THR 2006 2006 THR THR B . A 1 2007 GLY 2007 2007 GLY GLY B . A 1 2008 GLU 2008 2008 GLU GLU B . A 1 2009 ASP 2009 2009 ASP ASP B . A 1 2010 CYS 2010 2010 CYS CYS B . A 1 2011 VAL 2011 2011 VAL VAL B . A 1 2012 VAL 2012 2012 VAL VAL B . A 1 2013 MET 2013 2013 MET MET B . A 1 2014 ILE 2014 2014 ILE ILE B . A 1 2015 TRP 2015 2015 TRP TRP B . A 1 2016 HIS 2016 2016 HIS HIS B . A 1 2017 GLU 2017 2017 GLU GLU B . A 1 2018 ARG 2018 2018 ARG ARG B . A 1 2019 GLY 2019 2019 GLY GLY B . A 1 2020 GLU 2020 2020 GLU GLU B . A 1 2021 TRP 2021 2021 TRP TRP B . A 1 2022 ASN 2022 2022 ASN ASN B . A 1 2023 ASP 2023 2023 ASP ASP B . A 1 2024 VAL 2024 2024 VAL VAL B . A 1 2025 PRO 2025 2025 PRO PRO B . A 1 2026 CYS 2026 2026 CYS CYS B . A 1 2027 ASN 2027 2027 ASN ASN B . A 1 2028 TYR 2028 2028 TYR TYR B . A 1 2029 GLN 2029 2029 GLN GLN B . A 1 2030 LEU 2030 2030 LEU LEU B . A 1 2031 PRO 2031 2031 PRO PRO B . A 1 2032 PHE 2032 2032 PHE PHE B . A 1 2033 THR 2033 2033 THR THR B . A 1 2034 CYS 2034 2034 CYS CYS B . A 1 2035 LYS 2035 2035 LYS LYS B . A 1 2036 LYS 2036 2036 LYS LYS B . A 1 2037 GLY 2037 2037 GLY GLY B . A 1 2038 THR 2038 ? ? ? B . A 1 2039 VAL 2039 ? ? ? B . A 1 2040 ALA 2040 ? ? ? B . A 1 2041 CYS 2041 ? ? ? B . A 1 2042 GLY 2042 ? ? ? B . A 1 2043 GLU 2043 ? ? ? B . A 1 2044 PRO 2044 ? ? ? B . A 1 2045 PRO 2045 ? ? ? B . A 1 2046 ALA 2046 ? ? ? B . A 1 2047 VAL 2047 ? ? ? B . A 1 2048 GLU 2048 ? ? ? B . A 1 2049 HIS 2049 ? ? ? B . A 1 2050 ALA 2050 ? ? ? B . A 1 2051 ARG 2051 ? ? ? B . A 1 2052 THR 2052 ? ? ? B . A 1 2053 LEU 2053 ? ? ? B . A 1 2054 GLY 2054 ? ? ? B . A 1 2055 GLN 2055 ? ? ? B . A 1 2056 LYS 2056 ? ? ? B . A 1 2057 LYS 2057 ? ? ? B . A 1 2058 ASP 2058 ? ? ? B . A 1 2059 ARG 2059 ? ? ? B . A 1 2060 TYR 2060 ? ? ? B . A 1 2061 GLU 2061 ? ? ? B . A 1 2062 ILE 2062 ? ? ? B . A 1 2063 SER 2063 ? ? ? B . A 1 2064 SER 2064 ? ? ? B . A 1 2065 LEU 2065 ? ? ? B . A 1 2066 VAL 2066 ? ? ? B . A 1 2067 ARG 2067 ? ? ? B . A 1 2068 TYR 2068 ? ? ? B . A 1 2069 GLN 2069 ? ? ? B . A 1 2070 CYS 2070 ? ? ? B . A 1 2071 THR 2071 ? ? ? B . A 1 2072 GLU 2072 ? ? ? B . A 1 2073 GLY 2073 ? ? ? B . A 1 2074 PHE 2074 ? ? ? B . A 1 2075 VAL 2075 ? ? ? B . A 1 2076 GLN 2076 ? ? ? B . A 1 2077 ARG 2077 ? ? ? B . A 1 2078 HIS 2078 ? ? ? B . A 1 2079 VAL 2079 ? ? ? B . A 1 2080 PRO 2080 ? ? ? B . A 1 2081 THR 2081 ? ? ? B . A 1 2082 ILE 2082 ? ? ? B . A 1 2083 ARG 2083 ? ? ? B . A 1 2084 CYS 2084 ? ? ? B . A 1 2085 GLN 2085 ? ? ? B . A 1 2086 PRO 2086 ? ? ? B . A 1 2087 SER 2087 ? ? ? B . A 1 2088 ALA 2088 ? ? ? B . A 1 2089 ASP 2089 ? ? ? B . A 1 2090 TRP 2090 ? ? ? B . A 1 2091 GLU 2091 ? ? ? B . A 1 2092 GLU 2092 ? ? ? B . A 1 2093 PRO 2093 ? ? ? B . A 1 2094 ARG 2094 ? ? ? B . A 1 2095 ILE 2095 ? ? ? B . A 1 2096 THR 2096 ? ? ? B . A 1 2097 CYS 2097 ? ? ? B . A 1 2098 THR 2098 ? ? ? B . A 1 2099 ASP 2099 ? ? ? B . A 1 2100 PRO 2100 ? ? ? B . A 1 2101 ASN 2101 ? ? ? B . A 1 2102 THR 2102 ? ? ? B . A 1 2103 TYR 2103 ? ? ? B . A 1 2104 LYS 2104 ? ? ? B . A 1 2105 HIS 2105 ? ? ? B . A 1 2106 ARG 2106 ? ? ? B . A 1 2107 LEU 2107 ? ? ? B . A 1 2108 GLN 2108 ? ? ? B . A 1 2109 LYS 2109 ? ? ? B . A 1 2110 ARG 2110 ? ? ? B . A 1 2111 THR 2111 ? ? ? B . A 1 2112 MET 2112 ? ? ? B . A 1 2113 ARG 2113 ? ? ? B . A 1 2114 PRO 2114 ? ? ? B . A 1 2115 THR 2115 ? ? ? B . A 1 2116 ARG 2116 ? ? ? B . A 1 2117 ARG 2117 ? ? ? B . A 1 2118 SER 2118 ? ? ? B . A 1 2119 ARG 2119 ? ? ? B . A 1 2120 PRO 2120 ? ? ? B . A 1 2121 SER 2121 ? ? ? B . A 1 2122 MET 2122 ? ? ? B . A 1 2123 ALA 2123 ? ? ? B . A 1 2124 HIS 2124 ? ? ? B . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA 1 1 1 CA '_' . C 2 CA 1 2 2 CA '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Aggrecan core protein {PDB ID=1tdq, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=1tdq.1.B}' 'template structure' . 2 'CALCIUM ION {PDB ID=1tdq, label_asym_id=C, auth_asym_id=B, SMTL ID=1tdq.1._.1}' 'template structure' . 3 'CALCIUM ION {PDB ID=1tdq, label_asym_id=D, auth_asym_id=B, SMTL ID=1tdq.1._.2}' 'template structure' . 4 . target . 5 'CALCIUM ION' target . 6 'Target-template alignment by HHblits to 1tdq, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 7 'model 1' 'model coordinates' . 8 SMTL 'reference database' . 9 PDB 'reference database' . 10 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 4 2 1 8 3 1 9 4 2 10 5 3 4 6 3 5 7 3 1 8 3 2 9 3 3 10 3 6 11 4 1 12 4 2 13 4 3 14 4 6 15 4 5 16 5 7 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 8 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 9 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 4 'reference database' 2 5 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . C 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B C 3 1 B 3 3 'reference database' non-polymer 1 3 C D 3 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;RADQEQCEEGWTKFQGHCYRHFPDRETWVDAERRCREQQSHLSSIVTPEEQEFVNKNAQDYQWIGLNDRT IEGDFRWSDGHSLQFEKWRPNQPDNFFATGEDCVVMIWHERGEWNDVPCNYQLPFTCKKG ; ;RADQEQCEEGWTKFQGHCYRHFPDRETWVDAERRCREQQSHLSSIVTPEEQEFVNKNAQDYQWIGLNDRT IEGDFRWSDGHSLQFEKWRPNQPDNFFATGEDCVVMIWHERGEWNDVPCNYQLPFTCKKG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 4 130 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 CA 'CALCIUM ION' 3 CA 'CALCIUM ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1tdq 2024-10-30 2 PDB . 1tdq 2024-10-30 3 PDB . 1tdq 2024-10-30 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2124 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 6 1 2124 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2e-17 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTTLLLVFVTLRVIAAVISEEVPDHDNSLSVSIPQPSPLKALLGTSLTIPCYFIDPMHPVTTAPSTAPLTPRIKWSRVSKEKEVVLLVATEGQVRVNSIYQDKVSLPNYPAIPSDATLEIQNLRSNDSGIYRCEVMHGIEDSEATLEVIVKGIVFHYRAISTRYTLDFDRAQRACLQNSAIIATPEQLQAAYEDGFHQCDAGWLADQTVRYPIHTPREGCYGDKDEFPGVRTYGIRDTNETYDVYCFAEEMEGEVFYATSPEKFTFQEAANECRTVGARLATTGQLYLAWQGGMDMCSAGWLADRSVRYPISKARPNCGGNLLGVRTVYLHANQTGYPDPSSRYDAICYTGEDFVDIPENFFGVGGEEDITIQTVTWPDLELPLPRNITEGEARGNVILTAKPIFDMSPTVSEPGEALTLAPEVGTTVFPEAGERTEKTTRPWGFPEEATRGPDSATAFASEDLVVRVTISPGAVEVPGQPRLPGGVVFHYRPGSTRYSLTFEEAQQACIRTGAAIASPEQLQAAYEAGYEQCDAGWLQDQTVRYPIVSPRTPCVGDKDSSPGVRTYGVRPSSETYDVYCYVDKLEGEVFFATQMEQFTFQEAQAFCAAQNATLASTGQLYAAWSQGLDKCYAGWLADGTLRYPIVNPRPACGGDKPGVRTVYLYPNQTGLPDPLSKHHAFCFRGVSVVPSPGGTPTSPSDIEDWIVTRVEPGVDAVPLEPETTEVPYFTTEPEKQTEWEPAYTPVGTSPLPGIPPTWLPTVPAAEEHTESPSASQEPSASQVPSTSEEPYTPSLAVPSGTELPSSGDTSGAPDLSGDFTGSTDTSGRLDSSGEPSGGSESGLPSGDLDSSGLGPTVSSGLPVESGSASGDGEIPWSSTPTVDRLPSGGESLEGSASASGTGDLSGLPSGGEITETSASGTEEISGLPSGGDDLETSTSGIDGASVLPTGRGGLETSASGVEDLSGLPSGEEGSETSTSGIEDISVLPTGESPETSASGVGDLSGLPSGGESLETSASGVEDVTQLPTERGGLETSASGIEDITVLPTGRENLETSASGVEDVSGLPSGKEGLETSASGIEDISVFPTEAEGLETSASGGYVSGIPSGEDGTETSTSGVEGVSGLPSGGEGLETSASGVEDLGLPTRDSLETSASGVDVTGYPSGREDTETSVPGVGDDLSGLPSGQEGLETSASGAEDLGGLPSGKEDLVGSASGALDFGKLPSGTLGSGQTPEASGLPSGFSGEYSGVDIGSGPSSGLPDFSGLPSGFPTVSLVDSTLVEVITATTASELEGRGTISVSGSGEESGPPLSELDSSADISGLPSGTELSGQTSGSLDVSGETSGFFDVSGQPFGSSGTGEGTSGIPEVSGQAVRSPDTTEISELSGLSSGQPDVSGEGSGILFGSGQSSGITSVSGETSGISDLSGQPSGFPVLSGTTPGTPDLASGAMSGSGDSSGITFVDTSLIEVTPTTFREEEGLGSVELSGLPSGETDLSGTSGMVDVSGQSSGAIDSSGLISPTPEFSGLPSGVAEVSGEVSGVETGSSLSSGAFDGSGLVSGFPTVSLVDRTLVESITLAPTAQEAGEGPSSILEFSGAHSGTPDISGDLSGSLDQSTWQPGWTEASTEPPSSPYFSGDFSSTTDASGESITAPTGSGETSGLPEVTLITSELVEGVTEPTVSQELGHGPSMTYTPRLFEASGEASASGDLGGPVTIFPGSGVEASVPEGSSDPSAYPEAGVGVSAAPEASSQLSEFPDLHGITSASRETDLEMTTPGTEVSSNPWTFQEGTREGSAAPEVSGESSTTSDIDAGTSGVPFATPMTSGDRTEISGEWSDHTSEVNVTVSTTVPESRWAQSTQHPTETLQEIGSPNPSYSGEETQTAETAKSLTDTPTLASPEGSGETESTAADQEQCEEGWTKFQGHCYRHFPDRETWVDAERRCREQQSHLSSIVTPEEQEFVNKNAQDYQWIGLNDRTIEGDFRWSDGHSLQFEKWRPNQPDNFFATGEDCVVMIWHERGEWNDVPCNYQLPFTCKKGTVACGEPPAVEHARTLGQKKDRYEISSLVRYQCTEGFVQRHVPTIRCQPSADWEEPRITCTDPNTYKHRLQKRTMRPTRRSRPSMAH 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QEQCEEGWTKFQGHCYRHFPDRETWVDAERRCREQQSHLSSIVTPEEQEFVNKNAQDYQWIGLNDRTIEGDFRWSDGHSLQFEKWRPNQPDNFFATGEDCVVMIWHERGEWNDVPCNYQLPFTCKKG--------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1tdq.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 7 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 1912 1912 ? A 41.138 20.277 119.947 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 2 C CA . GLU 1912 1912 ? A 41.727 21.350 120.843 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 3 C C . GLU 1912 1912 ? A 40.844 21.917 121.961 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 4 O O . GLU 1912 1912 ? A 41.160 21.815 123.143 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 5 C CB . GLU 1912 1912 ? A 42.304 22.494 119.945 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 6 C CG . GLU 1912 1912 ? A 43.295 22.009 118.853 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 7 C CD . GLU 1912 1912 ? A 44.574 21.555 119.544 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 1912 1912 ? A 45.621 22.208 119.349 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 1912 1912 ? A 44.473 20.575 120.323 1 1 B GLU 0.460 1 ATOM 10 N N . GLN 1913 1913 ? A 39.664 22.501 121.665 1 1 B GLN 0.510 1 ATOM 11 C CA . GLN 1913 1913 ? A 38.779 22.994 122.709 1 1 B GLN 0.510 1 ATOM 12 C C . GLN 1913 1913 ? A 37.399 22.460 122.377 1 1 B GLN 0.510 1 ATOM 13 O O . GLN 1913 1913 ? A 36.951 21.550 123.077 1 1 B GLN 0.510 1 ATOM 14 C CB . GLN 1913 1913 ? A 38.856 24.533 122.946 1 1 B GLN 0.510 1 ATOM 15 C CG . GLN 1913 1913 ? A 38.613 24.904 124.432 1 1 B GLN 0.510 1 ATOM 16 C CD . GLN 1913 1913 ? A 39.909 25.041 125.236 1 1 B GLN 0.510 1 ATOM 17 O OE1 . GLN 1913 1913 ? A 40.153 26.093 125.827 1 1 B GLN 0.510 1 ATOM 18 N NE2 . GLN 1913 1913 ? A 40.792 24.030 125.280 1 1 B GLN 0.510 1 ATOM 19 N N . CYS 1914 1914 ? A 36.805 22.953 121.262 1 1 B CYS 0.540 1 ATOM 20 C CA . CYS 1914 1914 ? A 35.682 22.456 120.461 1 1 B CYS 0.540 1 ATOM 21 C C . CYS 1914 1914 ? A 35.137 23.619 119.610 1 1 B CYS 0.540 1 ATOM 22 O O . CYS 1914 1914 ? A 34.983 24.725 120.112 1 1 B CYS 0.540 1 ATOM 23 C CB . CYS 1914 1914 ? A 34.540 21.719 121.226 1 1 B CYS 0.540 1 ATOM 24 S SG . CYS 1914 1914 ? A 33.543 20.693 120.137 1 1 B CYS 0.540 1 ATOM 25 N N . GLU 1915 1915 ? A 34.914 23.414 118.284 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 26 C CA . GLU 1915 1915 ? A 34.367 24.380 117.335 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 27 C C . GLU 1915 1915 ? A 32.851 24.537 117.426 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 28 O O . GLU 1915 1915 ? A 32.131 23.700 117.964 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 29 C CB . GLU 1915 1915 ? A 34.686 23.966 115.861 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 30 C CG . GLU 1915 1915 ? A 36.201 23.911 115.515 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 31 C CD . GLU 1915 1915 ? A 36.546 23.329 114.136 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 32 O OE1 . GLU 1915 1915 ? A 36.333 22.110 113.902 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 33 O OE2 . GLU 1915 1915 ? A 37.105 24.080 113.302 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 34 N N . GLU 1916 1916 ? A 32.319 25.633 116.843 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 35 C CA . GLU 1916 1916 ? A 30.898 25.871 116.688 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 36 C C . GLU 1916 1916 ? A 30.183 24.771 115.895 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 37 O O . GLU 1916 1916 ? A 30.494 24.453 114.746 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 38 C CB . GLU 1916 1916 ? A 30.669 27.272 116.072 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 39 C CG . GLU 1916 1916 ? A 29.221 27.557 115.606 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 40 C CD . GLU 1916 1916 ? A 29.022 29.005 115.168 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 41 O OE1 . GLU 1916 1916 ? A 27.876 29.309 114.754 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 42 O OE2 . GLU 1916 1916 ? A 29.992 29.800 115.241 1 1 B GLU 0.660 1 ATOM 43 N N . GLY 1917 1917 ? A 29.198 24.118 116.551 1 1 B GLY 0.810 1 ATOM 44 C CA . GLY 1917 1917 ? A 28.417 23.026 115.988 1 1 B GLY 0.810 1 ATOM 45 C C . GLY 1917 1917 ? A 28.990 21.663 116.258 1 1 B GLY 0.810 1 ATOM 46 O O . GLY 1917 1917 ? A 28.407 20.670 115.838 1 1 B GLY 0.810 1 ATOM 47 N N . TRP 1918 1918 ? A 30.132 21.559 116.964 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 48 C CA . TRP 1918 1918 ? A 30.745 20.287 117.295 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 49 C C . TRP 1918 1918 ? A 30.604 20.079 118.799 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 50 O O . TRP 1918 1918 ? A 30.336 21.004 119.560 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 51 C CB . TRP 1918 1918 ? A 32.231 20.191 116.805 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 52 C CG . TRP 1918 1918 ? A 32.413 20.305 115.277 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 53 C CD1 . TRP 1918 1918 ? A 32.128 21.378 114.478 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 54 C CD2 . TRP 1918 1918 ? A 32.922 19.277 114.411 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 55 N NE1 . TRP 1918 1918 ? A 32.356 21.064 113.162 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 56 C CE2 . TRP 1918 1918 ? A 32.835 19.782 113.079 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 57 C CE3 . TRP 1918 1918 ? A 33.426 18.004 114.650 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 58 C CZ2 . TRP 1918 1918 ? A 33.244 19.001 112.011 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 59 C CZ3 . TRP 1918 1918 ? A 33.820 17.212 113.565 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 60 C CH2 . TRP 1918 1918 ? A 33.727 17.707 112.253 1 1 B TRP 0.730 1 ATOM 61 N N . THR 1919 1919 ? A 30.745 18.833 119.287 1 1 B THR 0.810 1 ATOM 62 C CA . THR 1919 1919 ? A 30.655 18.538 120.714 1 1 B THR 0.810 1 ATOM 63 C C . THR 1919 1919 ? A 31.826 17.627 121.034 1 1 B THR 0.810 1 ATOM 64 O O . THR 1919 1919 ? A 32.338 16.932 120.166 1 1 B THR 0.810 1 ATOM 65 C CB . THR 1919 1919 ? A 29.236 18.127 121.195 1 1 B THR 0.810 1 ATOM 66 O OG1 . THR 1919 1919 ? A 29.174 16.989 122.036 1 1 B THR 0.810 1 ATOM 67 C CG2 . THR 1919 1919 ? A 28.291 17.863 120.010 1 1 B THR 0.810 1 ATOM 68 N N . LYS 1920 1920 ? A 32.359 17.705 122.271 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 69 C CA . LYS 1920 1920 ? A 33.598 17.060 122.667 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 70 C C . LYS 1920 1920 ? A 33.330 15.805 123.477 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 71 O O . LYS 1920 1920 ? A 32.567 15.834 124.437 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 72 C CB . LYS 1920 1920 ? A 34.442 17.995 123.571 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 73 C CG . LYS 1920 1920 ? A 35.925 17.588 123.641 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 74 C CD . LYS 1920 1920 ? A 36.665 18.289 124.790 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 75 C CE . LYS 1920 1920 ? A 38.092 18.706 124.425 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 76 N NZ . LYS 1920 1920 ? A 38.613 19.616 125.467 1 1 B LYS 0.740 1 ATOM 77 N N . PHE 1921 1921 ? A 33.990 14.679 123.151 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 78 C CA . PHE 1921 1921 ? A 33.916 13.491 123.968 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 79 C C . PHE 1921 1921 ? A 35.310 12.865 124.006 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 80 O O . PHE 1921 1921 ? A 35.878 12.560 122.964 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 81 C CB . PHE 1921 1921 ? A 32.869 12.516 123.369 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 82 C CG . PHE 1921 1921 ? A 32.676 11.308 124.233 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 83 C CD1 . PHE 1921 1921 ? A 31.982 11.421 125.445 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 84 C CD2 . PHE 1921 1921 ? A 33.198 10.062 123.851 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 85 C CE1 . PHE 1921 1921 ? A 31.777 10.297 126.252 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 86 C CE2 . PHE 1921 1921 ? A 33.006 8.938 124.662 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 87 C CZ . PHE 1921 1921 ? A 32.281 9.054 125.855 1 1 B PHE 0.720 1 ATOM 88 N N . GLN 1922 1922 ? A 35.914 12.684 125.208 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 89 C CA . GLN 1922 1922 ? A 37.136 11.900 125.424 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 90 C C . GLN 1922 1922 ? A 38.345 12.165 124.512 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 91 O O . GLN 1922 1922 ? A 39.056 11.265 124.080 1 1 B GLN 0.680 1 ATOM 92 C CB . GLN 1922 1922 ? 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A 32.580 20.652 108.366 1 1 B GLN 0.790 1 ATOM 301 O OE1 . GLN 1945 1945 ? A 31.360 20.498 108.280 1 1 B GLN 0.790 1 ATOM 302 N NE2 . GLN 1945 1945 ? A 33.097 21.610 109.165 1 1 B GLN 0.790 1 ATOM 303 N N . GLN 1946 1946 ? A 38.303 18.396 107.491 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 304 C CA . GLN 1946 1946 ? A 39.511 17.796 108.054 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 305 C C . GLN 1946 1946 ? A 39.178 16.709 109.063 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 306 O O . GLN 1946 1946 ? A 39.640 16.707 110.198 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 307 C CB . GLN 1946 1946 ? A 40.550 18.813 108.623 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 308 C CG . GLN 1946 1946 ? A 41.261 19.685 107.553 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 309 C CD . GLN 1946 1946 ? A 40.331 20.752 106.978 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 310 O OE1 . GLN 1946 1946 ? A 39.977 21.706 107.678 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 311 N NE2 . GLN 1946 1946 ? A 39.880 20.604 105.715 1 1 B GLN 0.760 1 ATOM 312 N N . SER 1947 1947 ? A 38.322 15.763 108.652 1 1 B SER 0.820 1 ATOM 313 C CA . SER 1947 1947 ? 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A 29.341 9.158 123.282 1 1 B PHE 0.840 1 ATOM 418 C CG . PHE 1960 1960 ? A 29.415 10.614 122.882 1 1 B PHE 0.840 1 ATOM 419 C CD1 . PHE 1960 1960 ? A 28.855 11.625 123.679 1 1 B PHE 0.840 1 ATOM 420 C CD2 . PHE 1960 1960 ? A 29.957 10.961 121.633 1 1 B PHE 0.840 1 ATOM 421 C CE1 . PHE 1960 1960 ? A 28.853 12.958 123.242 1 1 B PHE 0.840 1 ATOM 422 C CE2 . PHE 1960 1960 ? A 29.928 12.284 121.181 1 1 B PHE 0.840 1 ATOM 423 C CZ . PHE 1960 1960 ? A 29.389 13.287 121.991 1 1 B PHE 0.840 1 ATOM 424 N N . VAL 1961 1961 ? A 28.187 8.157 120.482 1 1 B VAL 0.890 1 ATOM 425 C CA . VAL 1961 1961 ? A 27.875 8.443 119.081 1 1 B VAL 0.890 1 ATOM 426 C C . VAL 1961 1961 ? A 26.433 8.069 118.756 1 1 B VAL 0.890 1 ATOM 427 O O . VAL 1961 1961 ? A 25.699 8.881 118.192 1 1 B VAL 0.890 1 ATOM 428 C CB . VAL 1961 1961 ? A 28.912 7.863 118.109 1 1 B VAL 0.890 1 ATOM 429 C CG1 . VAL 1961 1961 ? A 28.554 8.156 116.637 1 1 B VAL 0.890 1 ATOM 430 C CG2 . VAL 1961 1961 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.768 2 1 3 0.059 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1912 GLU 1 0.460 2 1 A 1913 GLN 1 0.510 3 1 A 1914 CYS 1 0.540 4 1 A 1915 GLU 1 0.660 5 1 A 1916 GLU 1 0.660 6 1 A 1917 GLY 1 0.810 7 1 A 1918 TRP 1 0.730 8 1 A 1919 THR 1 0.810 9 1 A 1920 LYS 1 0.740 10 1 A 1921 PHE 1 0.720 11 1 A 1922 GLN 1 0.680 12 1 A 1923 GLY 1 0.690 13 1 A 1924 HIS 1 0.760 14 1 A 1925 CYS 1 0.770 15 1 A 1926 TYR 1 0.830 16 1 A 1927 ARG 1 0.830 17 1 A 1928 HIS 1 0.860 18 1 A 1929 PHE 1 0.840 19 1 A 1930 PRO 1 0.810 20 1 A 1931 ASP 1 0.670 21 1 A 1932 ARG 1 0.650 22 1 A 1933 GLU 1 0.710 23 1 A 1934 THR 1 0.780 24 1 A 1935 TRP 1 0.790 25 1 A 1936 VAL 1 0.820 26 1 A 1937 ASP 1 0.770 27 1 A 1938 ALA 1 0.870 28 1 A 1939 GLU 1 0.840 29 1 A 1940 ARG 1 0.800 30 1 A 1941 ARG 1 0.800 31 1 A 1942 CYS 1 0.830 32 1 A 1943 ARG 1 0.790 33 1 A 1944 GLU 1 0.760 34 1 A 1945 GLN 1 0.790 35 1 A 1946 GLN 1 0.760 36 1 A 1947 SER 1 0.820 37 1 A 1948 HIS 1 0.850 38 1 A 1949 LEU 1 0.890 39 1 A 1950 SER 1 0.930 40 1 A 1951 SER 1 0.920 41 1 A 1952 ILE 1 0.900 42 1 A 1953 VAL 1 0.870 43 1 A 1954 THR 1 0.850 44 1 A 1955 PRO 1 0.870 45 1 A 1956 GLU 1 0.820 46 1 A 1957 GLU 1 0.840 47 1 A 1958 GLN 1 0.840 48 1 A 1959 GLU 1 0.830 49 1 A 1960 PHE 1 0.840 50 1 A 1961 VAL 1 0.890 51 1 A 1962 ASN 1 0.880 52 1 A 1963 LYS 1 0.830 53 1 A 1964 ASN 1 0.900 54 1 A 1965 ALA 1 0.920 55 1 A 1966 GLN 1 0.840 56 1 A 1967 ASP 1 0.780 57 1 A 1968 TYR 1 0.800 58 1 A 1969 GLN 1 0.850 59 1 A 1970 TRP 1 0.880 60 1 A 1971 ILE 1 0.920 61 1 A 1972 GLY 1 0.920 62 1 A 1973 LEU 1 0.890 63 1 A 1974 ASN 1 0.880 64 1 A 1975 ASP 1 0.740 65 1 A 1976 ARG 1 0.710 66 1 A 1977 THR 1 0.590 67 1 A 1978 ILE 1 0.510 68 1 A 1979 GLU 1 0.610 69 1 A 1980 GLY 1 0.710 70 1 A 1981 ASP 1 0.670 71 1 A 1982 PHE 1 0.760 72 1 A 1983 ARG 1 0.780 73 1 A 1984 TRP 1 0.800 74 1 A 1985 SER 1 0.890 75 1 A 1986 ASP 1 0.830 76 1 A 1987 GLY 1 0.800 77 1 A 1988 HIS 1 0.780 78 1 A 1989 SER 1 0.710 79 1 A 1990 LEU 1 0.740 80 1 A 1991 GLN 1 0.680 81 1 A 1992 PHE 1 0.750 82 1 A 1993 GLU 1 0.790 83 1 A 1994 LYS 1 0.780 84 1 A 1995 TRP 1 0.760 85 1 A 1996 ARG 1 0.740 86 1 A 1997 PRO 1 0.690 87 1 A 1998 ASN 1 0.660 88 1 A 1999 GLN 1 0.730 89 1 A 2000 PRO 1 0.810 90 1 A 2001 ASP 1 0.650 91 1 A 2002 ASN 1 0.610 92 1 A 2003 PHE 1 0.380 93 1 A 2004 PHE 1 0.300 94 1 A 2005 ALA 1 0.370 95 1 A 2006 THR 1 0.420 96 1 A 2007 GLY 1 0.660 97 1 A 2008 GLU 1 0.720 98 1 A 2009 ASP 1 0.760 99 1 A 2010 CYS 1 0.890 100 1 A 2011 VAL 1 0.910 101 1 A 2012 VAL 1 0.900 102 1 A 2013 MET 1 0.840 103 1 A 2014 ILE 1 0.800 104 1 A 2015 TRP 1 0.720 105 1 A 2016 HIS 1 0.690 106 1 A 2017 GLU 1 0.750 107 1 A 2018 ARG 1 0.710 108 1 A 2019 GLY 1 0.840 109 1 A 2020 GLU 1 0.790 110 1 A 2021 TRP 1 0.790 111 1 A 2022 ASN 1 0.870 112 1 A 2023 ASP 1 0.820 113 1 A 2024 VAL 1 0.780 114 1 A 2025 PRO 1 0.760 115 1 A 2026 CYS 1 0.800 116 1 A 2027 ASN 1 0.740 117 1 A 2028 TYR 1 0.690 118 1 A 2029 GLN 1 0.690 119 1 A 2030 LEU 1 0.780 120 1 A 2031 PRO 1 0.850 121 1 A 2032 PHE 1 0.880 122 1 A 2033 THR 1 0.900 123 1 A 2034 CYS 1 0.900 124 1 A 2035 LYS 1 0.850 125 1 A 2036 LYS 1 0.830 126 1 A 2037 GLY 1 0.750 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #