data_SMR-c0762b17205b3d948333fffc80fdc6ab_4 _entry.id SMR-c0762b17205b3d948333fffc80fdc6ab_4 _struct.entry_id SMR-c0762b17205b3d948333fffc80fdc6ab_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q96BY6 (isoform 2)/ DOC10_HUMAN, Dedicator of cytokinesis protein 10 Estimated model accuracy of this model is 0.048, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q96BY6 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 289080.929 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DOC10_HUMAN Q96BY6 1 ;MSFRGKVFKREPSEFWKKRRTVRRVNQEEIHRFSSQEKPRLLEPLDYETVIEELEKTYRNDPLQDLLFFP SDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQWHVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEK LPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGTGVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQL PDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIFLDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLN RILQISPEGPLQGRRSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMER LNLFSLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNIEPFFVS VALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHIKGLPEEWLKFPKQAVF SVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVRSVFK DNQGNVDRDSRFSPLFRQESSKISTEDLVKLVSDYRRADRISKMQTIPGSLDIAVDNVPLEHPNCVTSSF IPVKPFNMMAQTEPTVEVEEFVYDSTKYCRPYRVYKNQIYIYPKHLKYDSQKCFNKARNITVCIEFKNSD EESAKPLKCIYGKPGGPLFTSAAYTAVLHHSQNPDFSDEVKIELPTQLHEKHHILFSFYHVTCDINAKAN AKKKEALETSVGYAWLPLMKHDQIASQEYNIPIATSLPPNYLSFQDSASGKHGGSDIKWVDGGKPLFKVS TFVVSTVNTQDPHVNAFFQECQKREKDMSQSPTSNFIRSCKNLLNVEKIHAIMSFLPIILNQLFKVLVQN EEDEITTTVTRVLTDIVAKCHEEQLDHSVQSYIKFVFKTRACKERTVHEELAKNVTGLLKSNDSTTVKHV LKHSWFFFAIILKSMAQHLIDTNKIQLPRPQRFPESYQNELDNLVMVLSDHVIWKYKDALEETRRANHSV ARFLKRCFTFMDRGYVFKMVNNYISMFSSGDLKTLCQYKFDFLQEVCQHEHFIPLCLPIRSANIPDPLTP SESTQELHASDMPEYSVTNEFCRKHFLIGILLREVGFALQEDQDVRHLALAVLKNLMAKHSFDDRYREPR KQAQIASLYMPLYGMLLDNMPRIYLKDLYPFTVNTSNQGSRDDLSTNGGFQSQTAIKHANSVDTSFSKDV LNSIAAFSSIAISTVNHADSRASLASLDSNPSTNEKSSEKTDNCEKIPRPLSLIGSTLRFDKLDQAETRS LLMCFLHIMKTISYETLIAYWQRAPSPEVSDFFSILDVCLQNFRYLGKRNIIRKIAAAFKFVQSTQNNGT LKGSNPSCQTSGLLSQWMHSTSSHEGHKQHRSQTLPIIRGKNALSNPKLLQMLDNTMTSNSNEIDIVHHV DTEANIATEVCLTILDLLSLFTQTHQRQLQQCDCQNSLMKRVFDTYMLFFQVNQSATALKHVFASLRLFV CKFPSAFFQGPADLCGSFCYEVLKCCNHRSRSTQTEASALLYFFMRKNFEFNKQKSIVRSHLQLIKAVSQ LIADAGIGGSRFQHSLAITNNFANGDKQMKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQY SLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGYWKVEKICTASLLSEDTH PCDSNSLLTTPSGGSMFSMGWPAFLSITPNIKEEGAMKEDSGMQDTPYNENILVEQLYMCVEFLWKSERY ELIADVNKPIIAVFEKQRDFKKLSDLYYDIHRSYLKVAEVVNSEKRLFGRYYRVAFYGQGFFEEEEGKEY IYKEPKLTGLSEISQRLLKLYADKFGADNVKIIQDSNKVNPKDLDPKYAYIQVTYVTPFFEEKEIEDRKT DFEMHHNINRFVFETPFTLSGKKHGGVAEQCKRRTILTTSHLFPYVKKRIQVISQSSTELNPIEVAIDEM SKKVSELNQLCTMEEVDMIRLQLKLQGSVSVKVNAGPMAYARAFLEETNAKKYPDNQVKLLKEIFRQFAD ACGQALDVNERLIKEDQLEYQEELRSHYKDMLSELSTVMNEQITGRDDLSKRGVDQTCTRVISKATPALP TVSISSSAEV ; 'Dedicator of cytokinesis protein 10' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2180 1 2180 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DOC10_HUMAN Q96BY6 Q96BY6-2 1 2180 9606 'Homo sapiens (Human)' 2011-05-03 E4A9EA93C9537982 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSFRGKVFKREPSEFWKKRRTVRRVNQEEIHRFSSQEKPRLLEPLDYETVIEELEKTYRNDPLQDLLFFP SDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQWHVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEK LPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGTGVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQL PDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIFLDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLN RILQISPEGPLQGRRSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMER LNLFSLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNIEPFFVS VALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHIKGLPEEWLKFPKQAVF SVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVRSVFK DNQGNVDRDSRFSPLFRQESSKISTEDLVKLVSDYRRADRISKMQTIPGSLDIAVDNVPLEHPNCVTSSF 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dedicator of cytokinesis protein 9 {PDB ID=1wg7, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1wg7.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1wg7, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPK GSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSH EDDESGPSSG ; ;GSSGSSGAASLGSQKGGITKHGWLYKGNMNSAISVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPK GSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQEKRNGDSH EDDESGPSSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 14 129 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1wg7 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2180 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2180 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.1e-06 62.931 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSFRGKVFKREPSEFWKKRRTVRRVNQEEIHRFSSQEKPRLLEPLDYETVIEELEKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQWHVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGTGVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIFLDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGRRSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNIEPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHIKGLPEEWLKFPKQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVRSVFKDNQGNVDRDSRFSPLFRQESSKISTEDLVKLVSDYRRADRISKMQTIPGSLDIAVDNVPLEHPNCVTSSFIPVKPFNMMAQTEPTVEVEEFVYDSTKYCRPYRVYKNQIYIYPKHLKYDSQKCFNKARNITVCIEFKNSDEESAKPLKCIYGKPGGPLFTSAAYTAVLHHSQNPDFSDEVKIELPTQLHEKHHILFSFYHVTCDINAKANAKKKEALETSVGYAWLPLMKHDQIASQEYNIPIATSLPPNYLSFQDSASGKHGGSDIKWVDGGKPLFKVSTFVVSTVNTQDPHVNAFFQECQKREKDMSQSPTSNFIRSCKNLLNVEKIHAIMSFLPIILNQLFKVLVQNEEDEITTTVTRVLTDIVAKCHEEQLDHSVQSYIKFVFKTRACKERTVHEELAKNVTGLLKSNDSTTVKHVLKHSWFFFAIILKSMAQHLIDTNKIQLPRPQRFPESYQNELDNLVMVLSDHVIWKYKDALEETRRANHSVARFLKRCFTFMDRGYVFKMVNNYISMFSSGDLKTLCQYKFDFLQEVCQHEHFIPLCLPIRSANIPDPLTPSESTQELHASDMPEYSVTNEFCRKHFLIGILLREVGFALQEDQDVRHLALAVLKNLMAKHSFDDRYREPRKQAQIASLYMPLYGMLLDNMPRIYLKDLYPFTVNTSNQGSRDDLSTNGGFQSQTAIKHANSVDTSFSKDVLNSIAAFSSIAISTVNHADSRASLASLDSNPSTNEKSSEKTDNCEKIPRPLSLIGSTLRFDKLDQAETRSLLMCFLHIMKTISYETLIAYWQRAPSPEVSDFFSILDVCLQNFRYLGKRNIIRKIAAAFKFVQSTQNNGTLKGSNPSCQTSGLLSQWMHSTSSHEGHKQHRSQTLPIIRGKNALSNPKLLQMLDNTMTSNSNEIDIVHHVDTEANIATEVCLTILDLLSLFTQTHQRQLQQCDCQNSLMKRVFDTYMLFFQVNQSATALKHVFASLRLFVCKFPSAFFQGPADLCGSFCYEVLKCCNHRSRSTQTEASALLYFFMRKNFEFNKQKSIVRSHLQLIKAVSQLIADAGIGGSRFQHSLAITNNFANGDKQMKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQYSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGYWKVEKICTASLLSEDTHPCDSNSLLTTPSGGSMFSMGWPAFLSITPNIKEEGAMKEDSGMQDTPYNENILVEQLYMCVEFLWKSERYELIADVNKPIIAVFEKQRDFKKLSDLYYDIHRSYLKVAEVVNSEKRLFGRYYRVAFYGQGFFEEEEGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLLKLYADKFGADNVKIIQDSNKVNPKDLDPKYAYIQVTYVTPFFEEKEIEDRKTDFEMHHNINRFVFETPFTLSGKKHGGVAEQCKRRTILTTSHLFPYVKKRIQVISQSSTELNPIEVAIDEMSKKVSELNQLCTMEEVDMIRLQLKLQGSVSVKVNAGPMAYARAFLEETNAKKYPDNQVKLLKEIFRQFADACGQALDVNERLIKEDQLEYQEELRSHYKDMLSELSTVMNEQITGRDDLSKRGVDQTCTRVISKATPALPTVSISSSAEV 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QKGGITKHGWLYKGNMNSAI--SVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1wg7.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 172 172 ? A -7.371 12.646 -0.757 1 1 A GLY 0.260 1 ATOM 2 C CA . GLY 172 172 ? A -7.784 13.277 -2.063 1 1 A GLY 0.260 1 ATOM 3 C C . GLY 172 172 ? A -7.564 12.317 -3.180 1 1 A GLY 0.260 1 ATOM 4 O O . GLY 172 172 ? A -6.628 11.534 -3.100 1 1 A GLY 0.260 1 ATOM 5 N N . GLY 173 173 ? A -8.403 12.335 -4.237 1 1 A GLY 0.180 1 ATOM 6 C CA . GLY 173 173 ? A -8.389 11.245 -5.211 1 1 A GLY 0.180 1 ATOM 7 C C . GLY 173 173 ? A -8.921 9.938 -4.672 1 1 A GLY 0.180 1 ATOM 8 O O . GLY 173 173 ? A -9.479 9.881 -3.579 1 1 A GLY 0.180 1 ATOM 9 N N . THR 174 174 ? A -8.781 8.864 -5.469 1 1 A THR 0.420 1 ATOM 10 C CA . THR 174 174 ? A -9.126 7.499 -5.087 1 1 A THR 0.420 1 ATOM 11 C C . THR 174 174 ? A -7.939 6.864 -4.367 1 1 A THR 0.420 1 ATOM 12 O O . THR 174 174 ? A -7.389 7.410 -3.416 1 1 A THR 0.420 1 ATOM 13 C CB . THR 174 174 ? A -9.560 6.622 -6.272 1 1 A THR 0.420 1 ATOM 14 O OG1 . THR 174 174 ? A -8.574 6.610 -7.302 1 1 A THR 0.420 1 ATOM 15 C CG2 . THR 174 174 ? A -10.836 7.189 -6.903 1 1 A THR 0.420 1 ATOM 16 N N . GLY 175 175 ? A -7.496 5.674 -4.804 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 17 C CA . GLY 175 175 ? A -6.365 5.003 -4.215 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 18 C C . GLY 175 175 ? A -6.243 3.635 -4.797 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 19 O O . GLY 175 175 ? A -6.691 3.355 -5.904 1 1 A GLY 0.630 1 ATOM 20 N N . VAL 176 176 ? A -5.626 2.727 -4.044 1 1 A VAL 0.690 1 ATOM 21 C CA . VAL 176 176 ? A -5.512 1.333 -4.424 1 1 A VAL 0.690 1 ATOM 22 C C . VAL 176 176 ? A -6.420 0.526 -3.509 1 1 A VAL 0.690 1 ATOM 23 O O . VAL 176 176 ? A -7.219 1.104 -2.781 1 1 A VAL 0.690 1 ATOM 24 C CB . VAL 176 176 ? A -4.055 0.893 -4.397 1 1 A VAL 0.690 1 ATOM 25 C CG1 . VAL 176 176 ? A -3.303 1.582 -5.555 1 1 A VAL 0.690 1 ATOM 26 C CG2 . VAL 176 176 ? A -3.422 1.276 -3.051 1 1 A VAL 0.690 1 ATOM 27 N N . PHE 177 177 ? A -6.355 -0.815 -3.520 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 28 C CA . PHE 177 177 ? A -7.203 -1.687 -2.722 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 29 C C . PHE 177 177 ? A -6.874 -3.095 -3.150 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 30 O O . PHE 177 177 ? A -6.224 -3.291 -4.172 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 31 C CB . PHE 177 177 ? A -8.752 -1.437 -2.802 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 32 C CG . PHE 177 177 ? A -9.368 -1.730 -4.152 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 33 C CD1 . PHE 177 177 ? A -9.283 -0.791 -5.194 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 34 C CD2 . PHE 177 177 ? A -10.033 -2.947 -4.392 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 35 C CE1 . PHE 177 177 ? A -9.782 -1.087 -6.468 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 36 C CE2 . PHE 177 177 ? A -10.539 -3.245 -5.666 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 37 C CZ . PHE 177 177 ? A -10.393 -2.323 -6.709 1 1 A PHE 0.690 1 ATOM 38 N N . LYS 178 178 ? A -7.287 -4.091 -2.353 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 39 C CA . LYS 178 178 ? A -7.118 -5.481 -2.679 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 40 C C . LYS 178 178 ? A -7.741 -6.247 -1.537 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 41 O O . LYS 178 178 ? A -7.692 -5.844 -0.376 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 42 C CB . LYS 178 178 ? A -5.639 -5.926 -2.888 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 43 C CG . LYS 178 178 ? A -5.448 -7.439 -3.075 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 44 C CD . LYS 178 178 ? A -4.612 -7.892 -4.270 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 45 C CE . LYS 178 178 ? A -4.860 -9.375 -4.590 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 46 N NZ . LYS 178 178 ? A -6.125 -9.577 -5.321 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 47 N N . SER 179 179 ? A -8.385 -7.370 -1.861 1 1 A SER 0.830 1 ATOM 48 C CA . SER 179 179 ? A -8.873 -8.309 -0.886 1 1 A SER 0.830 1 ATOM 49 C C . SER 179 179 ? A -8.552 -9.707 -1.368 1 1 A SER 0.830 1 ATOM 50 O O . SER 179 179 ? A -8.158 -9.905 -2.523 1 1 A SER 0.830 1 ATOM 51 C CB . SER 179 179 ? A -10.383 -8.153 -0.608 1 1 A SER 0.830 1 ATOM 52 O OG . SER 179 179 ? A -11.174 -8.305 -1.787 1 1 A SER 0.830 1 ATOM 53 N N . GLY 180 180 ? A -8.662 -10.711 -0.475 1 1 A GLY 0.820 1 ATOM 54 C CA . GLY 180 180 ? A -8.470 -12.111 -0.830 1 1 A GLY 0.820 1 ATOM 55 C C . GLY 180 180 ? A -8.033 -12.933 0.348 1 1 A GLY 0.820 1 ATOM 56 O O . GLY 180 180 ? A -7.647 -12.409 1.389 1 1 A GLY 0.820 1 ATOM 57 N N . TRP 181 181 ? A -8.081 -14.273 0.229 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 58 C CA . TRP 181 181 ? A -7.672 -15.144 1.316 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 59 C C . TRP 181 181 ? A -6.175 -15.428 1.232 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 60 O O . TRP 181 181 ? A -5.651 -15.902 0.228 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 61 C CB . TRP 181 181 ? A -8.507 -16.455 1.396 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 62 C CG . TRP 181 181 ? A -10.013 -16.282 1.661 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 63 C CD1 . TRP 181 181 ? A -10.970 -15.776 0.817 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 64 C CD2 . TRP 181 181 ? A -10.701 -16.748 2.836 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 65 N NE1 . TRP 181 181 ? A -12.202 -15.855 1.415 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 66 C CE2 . TRP 181 181 ? A -12.098 -16.493 2.617 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 67 C CE3 . TRP 181 181 ? A -10.282 -17.392 3.994 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 68 C CZ2 . TRP 181 181 ? A -13.028 -16.862 3.569 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 69 C CZ3 . TRP 181 181 ? A -11.237 -17.768 4.946 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 70 C CH2 . TRP 181 181 ? A -12.601 -17.511 4.732 1 1 A TRP 0.780 1 ATOM 71 N N . LEU 182 182 ? 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A 10.312 -18.292 14.615 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 128 C CG . ASN 188 188 ? A 11.224 -18.333 15.828 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 129 O OD1 . ASN 188 188 ? A 12.441 -18.226 15.739 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 130 N ND2 . ASN 188 188 ? A 10.605 -18.462 17.025 1 1 A ASN 0.580 1 ATOM 131 N N . SER 189 189 ? A 12.949 -17.370 12.066 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 132 C CA . SER 189 189 ? A 14.087 -17.912 11.300 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 133 C C . SER 189 189 ? A 15.241 -18.416 12.129 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 134 O O . SER 189 189 ? A 16.186 -18.979 11.592 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 135 C CB . SER 189 189 ? A 14.777 -16.855 10.390 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 136 O OG . SER 189 189 ? A 13.961 -16.517 9.281 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 137 N N . THR 190 190 ? A 15.275 -18.189 13.445 1 1 A THR 0.330 1 ATOM 138 C CA . THR 190 190 ? A 16.394 -18.647 14.260 1 1 A THR 0.330 1 ATOM 139 C C . THR 190 190 ? A 16.224 -20.102 14.658 1 1 A THR 0.330 1 ATOM 140 O O . THR 190 190 ? A 17.150 -20.758 15.127 1 1 A THR 0.330 1 ATOM 141 C CB . THR 190 190 ? A 16.535 -17.845 15.542 1 1 A THR 0.330 1 ATOM 142 O OG1 . THR 190 190 ? A 15.269 -17.736 16.177 1 1 A THR 0.330 1 ATOM 143 C CG2 . THR 190 190 ? A 16.985 -16.415 15.219 1 1 A THR 0.330 1 ATOM 144 N N . VAL 191 191 ? A 15.004 -20.624 14.479 1 1 A VAL 0.280 1 ATOM 145 C CA . VAL 191 191 ? A 14.592 -21.966 14.834 1 1 A VAL 0.280 1 ATOM 146 C C . VAL 191 191 ? A 14.330 -22.711 13.512 1 1 A VAL 0.280 1 ATOM 147 O O . VAL 191 191 ? A 14.644 -22.250 12.423 1 1 A VAL 0.280 1 ATOM 148 C CB . VAL 191 191 ? A 13.353 -21.871 15.723 1 1 A VAL 0.280 1 ATOM 149 C CG1 . VAL 191 191 ? A 12.728 -23.215 16.164 1 1 A VAL 0.280 1 ATOM 150 C CG2 . VAL 191 191 ? A 13.664 -21.052 16.984 1 1 A VAL 0.280 1 ATOM 151 N N . ASN 192 192 ? A 13.774 -23.929 13.542 1 1 A ASN 0.290 1 ATOM 152 C CA . ASN 192 192 ? A 13.431 -24.720 12.391 1 1 A ASN 0.290 1 ATOM 153 C C . ASN 192 192 ? A 12.336 -24.185 11.455 1 1 A ASN 0.290 1 ATOM 154 O O . ASN 192 192 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.674 2 1 3 0.048 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 172 GLY 1 0.260 2 1 A 173 GLY 1 0.180 3 1 A 174 THR 1 0.420 4 1 A 175 GLY 1 0.630 5 1 A 176 VAL 1 0.690 6 1 A 177 PHE 1 0.690 7 1 A 178 LYS 1 0.760 8 1 A 179 SER 1 0.830 9 1 A 180 GLY 1 0.820 10 1 A 181 TRP 1 0.780 11 1 A 182 LEU 1 0.790 12 1 A 183 TYR 1 0.730 13 1 A 184 LYS 1 0.720 14 1 A 185 GLY 1 0.690 15 1 A 186 ASN 1 0.640 16 1 A 187 PHE 1 0.610 17 1 A 188 ASN 1 0.580 18 1 A 189 SER 1 0.470 19 1 A 190 THR 1 0.330 20 1 A 191 VAL 1 0.280 21 1 A 192 ASN 1 0.290 22 1 A 193 ASN 1 0.330 23 1 A 194 THR 1 0.580 24 1 A 195 VAL 1 0.580 25 1 A 196 THR 1 0.590 26 1 A 197 VAL 1 0.630 27 1 A 198 ARG 1 0.510 28 1 A 199 SER 1 0.540 29 1 A 200 PHE 1 0.610 30 1 A 201 LYS 1 0.640 31 1 A 202 LYS 1 0.700 32 1 A 203 ARG 1 0.690 33 1 A 204 TYR 1 0.770 34 1 A 205 PHE 1 0.800 35 1 A 206 GLN 1 0.780 36 1 A 207 LEU 1 0.810 37 1 A 208 THR 1 0.760 38 1 A 209 GLN 1 0.690 39 1 A 210 LEU 1 0.660 40 1 A 211 PRO 1 0.510 41 1 A 212 ASP 1 0.510 42 1 A 213 ASN 1 0.550 43 1 A 214 SER 1 0.670 44 1 A 215 TYR 1 0.720 45 1 A 216 ILE 1 0.800 46 1 A 217 MET 1 0.820 47 1 A 218 ASN 1 0.810 48 1 A 219 PHE 1 0.780 49 1 A 220 TYR 1 0.710 50 1 A 221 LYS 1 0.690 51 1 A 222 ASP 1 0.700 52 1 A 223 GLU 1 0.660 53 1 A 224 LYS 1 0.580 54 1 A 225 ILE 1 0.590 55 1 A 226 SER 1 0.500 56 1 A 227 LYS 1 0.480 57 1 A 228 GLU 1 0.570 58 1 A 229 PRO 1 0.720 59 1 A 230 LYS 1 0.720 60 1 A 231 GLY 1 0.800 61 1 A 232 CYS 1 0.820 62 1 A 233 ILE 1 0.790 63 1 A 234 PHE 1 0.780 64 1 A 235 LEU 1 0.780 65 1 A 236 ASP 1 0.740 66 1 A 237 SER 1 0.740 67 1 A 238 CYS 1 0.770 68 1 A 239 THR 1 0.740 69 1 A 240 GLY 1 0.800 70 1 A 241 VAL 1 0.810 71 1 A 242 VAL 1 0.790 72 1 A 243 GLN 1 0.730 73 1 A 244 ASN 1 0.710 74 1 A 245 ASN 1 0.640 75 1 A 246 ARG 1 0.550 76 1 A 247 LEU 1 0.630 77 1 A 248 ARG 1 0.590 78 1 A 249 LYS 1 0.650 79 1 A 250 TYR 1 0.700 80 1 A 251 ALA 1 0.780 81 1 A 252 PHE 1 0.770 82 1 A 253 GLU 1 0.760 83 1 A 254 LEU 1 0.790 84 1 A 255 LYS 1 0.740 85 1 A 256 MET 1 0.710 86 1 A 257 ASN 1 0.670 87 1 A 258 ASP 1 0.580 88 1 A 259 LEU 1 0.470 89 1 A 260 THR 1 0.630 90 1 A 261 TYR 1 0.680 91 1 A 262 PHE 1 0.770 92 1 A 263 VAL 1 0.770 93 1 A 264 LEU 1 0.800 94 1 A 265 ALA 1 0.800 95 1 A 266 ALA 1 0.790 96 1 A 267 GLU 1 0.710 97 1 A 268 THR 1 0.720 98 1 A 269 GLU 1 0.700 99 1 A 270 SER 1 0.760 100 1 A 271 ASP 1 0.780 101 1 A 272 MET 1 0.750 102 1 A 273 ASP 1 0.790 103 1 A 274 GLU 1 0.770 104 1 A 275 TRP 1 0.800 105 1 A 276 ILE 1 0.790 106 1 A 277 HIS 1 0.770 107 1 A 278 THR 1 0.790 108 1 A 279 LEU 1 0.800 109 1 A 280 ASN 1 0.780 110 1 A 281 ARG 1 0.710 111 1 A 282 ILE 1 0.760 112 1 A 283 LEU 1 0.770 113 1 A 284 GLN 1 0.710 114 1 A 285 ILE 1 0.680 115 1 A 286 SER 1 0.700 116 1 A 287 PRO 1 0.660 117 1 A 288 GLU 1 0.370 118 1 A 289 GLY 1 0.400 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #