data_SMR-c14d4740af7b4275271c76d3c4c589b4_4 _entry.id SMR-c14d4740af7b4275271c76d3c4c589b4_4 _struct.entry_id SMR-c14d4740af7b4275271c76d3c4c589b4_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q13439 (isoform 3)/ GOGA4_HUMAN, Golgin subfamily A member 4 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q13439 (isoform 3)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 303144.790 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP GOGA4_HUMAN Q13439 1 ;MFKKLKQKISEEQQQLQQALAPAQASSNSSTPTRMRSRTSSFTEQLDEGTPNRENASTHASKSPDSVNGS EPSIPQSGDTQSFAQKLQLRVPSVESLFRSPIKESLFRSSSKESLVRTSSRESLNRLDLDSSTASFDPPS DMDSEAEDLVGNSDSLNKEQLIQRLRRMERSLSSYRGKYSELVTAYQMLQREKKKLQGILSQSQDKSLRR IAELREELQMDQQAKKHLQEEFDASLEEKDQYISVLQTQVSLLKQRLRNGPMNVDVLKPLPQLEPQAEVF TKEENPESDGEPVVEDGTSVKTLETLQQRVKRQENLLKRCKETIQSHKEQCTLLTSEKEALQEQLDERLQ ELEKIKDLHMAEKTKLITQLRDAKNLIEQLEQDKGMVIAETKRQMHETLEMKEEEIAQLRSRIKQMTTQG EELREQKEKSERAAFEELEKALSTAQKTEEARRKLKAEMDEQIKTIEKTSEEERISLQQELSRVKQEVVD VMKKSSEEQIAKLQKLHEKELARKEQELTKKLQTREREFQEQMKVALEKSQSEYLKISQEKEQQESLALE ELELQKKAILTESENKLRDLQQEAETYRTRILELESSLEKSLQENKNQSKDLAVHLEAEKNKHNKEITVM VEKHKTELESLKHQQDALWTEKLQVLKQQYQTEMEKLREKCEQEKETLLKDKEIIFQAHIEEMNEKTLEK LDVKQTELESLSSELSEVLKARHKLEEELSVLKDQTDKMKQELEAKMDEQKNHHQQQVDSIIKEHEVSIQ RTEKALKDQINQLELLLKERDKHLKEHQAHVENLEADIKRSEGELQQASAKLDVFQSYQSATHEQTKAYE EQLAQLQQKLLDLETERILLTKQVAEVEAQKKDVCTELDAHKIQVQDLMQQLEKQNSEMEQKVKSLTQVY ESKLEDGNKEQEQTKQILVEKENMILQMREGQKKEIEILTQKLSAKEDSIHILNEEYETKFKNQEKKMEK VKQKAKEMQETLKKKLLDQEAKLKKELENTALELSQKEKQFNAKMLEMAQANSAGISDAVSRLETNQKEQ IESLTEVHRRELNDVISIWEKKLNQQAEELQEIHEIQLQEKEQEVAELKQKILLFGCEKEEMNKEITWLK EEGVKQDTTLNELQEQLKQKSAHVNSLAQDETKLKAHLEKLEVDLNKSLKENTFLQEQLVELKMLAEEDK RKVSELTSKLKTTDEEFQSLKSSHEKSNKSLEDKSLEFKKLSEELAIQLDICCKKTEALLEAKTNELINI SSSKTNAILSRISHCQHRTTKVKEALLIKTCTVSELEAQLRQLTEEQNTLNISFQQATHQLEEKENQIKS MKADIESLVTEKEALQKEGGNQQQAASEKESCITQLKKELSENINAVTLMKEELKEKKVEISSLSKQLTD LNVQLQNSISLSEKEAAISSLRKQYDEEKCELLDQVQDLSFKVDTLSKEKISALEQVDDWSNKFSEWKKK AQSRFTQHQNTVKELQIQLELKSKEAYEKDEQINLLKEELDQQNKRFDCLKGEMEDDKSKMEKKESNLET ELKSQTARIMELEDHITQKTIEIESLNEVLKNYNQQKDIEHKELVQKLQHFQELGEEKDNRVKEAEEKIL TLENQVYSMKAELETKKKELEHVNLSVKSKEEELKALEDRLESESAAKLAELKRKAEQKIAAIKKQLLSQ MEEKEEQYKKGTESHLSELNTKLQEREREVHILEEKLKSVESSQSETLIVPRSAKNVAAYTEQEEADSQG CVQKTYEEKISVLQRNLTEKEKLLQRVGQEKEETVSSHFEMRCQYQERLIKLEHAEAKQHEDQSMIGHLQ EELEEKNKKYSLIVAQHVEKEGGKNNIQAKQNLENVFDDVQKTLQEKELTCQILEQKIKELDSCLVRQKE VHRVEMEELTSKYEKLQALQQMDGRNKPTELLEENTEEKSKSHLVQPKLLSNMEAQHNDLEFKLAGAERE KQKLGKEIVRLQKDLRMLRKEHQQELEILKKEYDQEREEKIKQEQEDLELKHNSTLKQLMREFNTQLAQK EQELEMTIKETINKAQEVEAELLESHQEETNQLLKKIAEKDDDLKRTAKRYEEILDAREEEMTAKVRDLQ TQLEELQKKYQQKLEQEENPGNDNTQLAQKTTLISDSKLKEQEFREQIHNLEDRLKKYEKNVYATTVGTP YKGGNLYHTDVSLFGEPTEFEYLRKVLFEYMMGRETKTMAKVITTVLKFPDDQTQKILEREDARLMSWLR SSS ; 'Golgin subfamily A member 4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2243 1 2243 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . GOGA4_HUMAN Q13439 Q13439-3 1 2243 9606 'Homo sapiens (Human)' 1996-11-01 EDD8BCB88E02B9A4 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no T ;MFKKLKQKISEEQQQLQQALAPAQASSNSSTPTRMRSRTSSFTEQLDEGTPNRENASTHASKSPDSVNGS EPSIPQSGDTQSFAQKLQLRVPSVESLFRSPIKESLFRSSSKESLVRTSSRESLNRLDLDSSTASFDPPS DMDSEAEDLVGNSDSLNKEQLIQRLRRMERSLSSYRGKYSELVTAYQMLQREKKKLQGILSQSQDKSLRR IAELREELQMDQQAKKHLQEEFDASLEEKDQYISVLQTQVSLLKQRLRNGPMNVDVLKPLPQLEPQAEVF TKEENPESDGEPVVEDGTSVKTLETLQQRVKRQENLLKRCKETIQSHKEQCTLLTSEKEALQEQLDERLQ ELEKIKDLHMAEKTKLITQLRDAKNLIEQLEQDKGMVIAETKRQMHETLEMKEEEIAQLRSRIKQMTTQG EELREQKEKSERAAFEELEKALSTAQKTEEARRKLKAEMDEQIKTIEKTSEEERISLQQELSRVKQEVVD VMKKSSEEQIAKLQKLHEKELARKEQELTKKLQTREREFQEQMKVALEKSQSEYLKISQEKEQQESLALE ELELQKKAILTESENKLRDLQQEAETYRTRILELESSLEKSLQENKNQSKDLAVHLEAEKNKHNKEITVM 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_entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 PHE . 1 3 LYS . 1 4 LYS . 1 5 LEU . 1 6 LYS . 1 7 GLN . 1 8 LYS . 1 9 ILE . 1 10 SER . 1 11 GLU . 1 12 GLU . 1 13 GLN . 1 14 GLN . 1 15 GLN . 1 16 LEU . 1 17 GLN . 1 18 GLN . 1 19 ALA . 1 20 LEU . 1 21 ALA . 1 22 PRO . 1 23 ALA . 1 24 GLN . 1 25 ALA . 1 26 SER . 1 27 SER . 1 28 ASN . 1 29 SER . 1 30 SER . 1 31 THR . 1 32 PRO . 1 33 THR . 1 34 ARG . 1 35 MET . 1 36 ARG . 1 37 SER . 1 38 ARG . 1 39 THR . 1 40 SER . 1 41 SER . 1 42 PHE . 1 43 THR . 1 44 GLU . 1 45 GLN . 1 46 LEU . 1 47 ASP . 1 48 GLU . 1 49 GLY . 1 50 THR . 1 51 PRO . 1 52 ASN . 1 53 ARG . 1 54 GLU . 1 55 ASN . 1 56 ALA . 1 57 SER . 1 58 THR . 1 59 HIS . 1 60 ALA . 1 61 SER . 1 62 LYS . 1 63 SER . 1 64 PRO . 1 65 ASP . 1 66 SER . 1 67 VAL . 1 68 ASN . 1 69 GLY . 1 70 SER . 1 71 GLU . 1 72 PRO . 1 73 SER . 1 74 ILE . 1 75 PRO . 1 76 GLN . 1 77 SER . 1 78 GLY . 1 79 ASP . 1 80 THR . 1 81 GLN . 1 82 SER . 1 83 PHE . 1 84 ALA . 1 85 GLN . 1 86 LYS . 1 87 LEU . 1 88 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A 1 2045 ALA 2045 ? ? ? T . A 1 2046 GLN 2046 ? ? ? T . A 1 2047 GLU 2047 ? ? ? T . A 1 2048 VAL 2048 ? ? ? T . A 1 2049 GLU 2049 ? ? ? T . A 1 2050 ALA 2050 ? ? ? T . A 1 2051 GLU 2051 ? ? ? T . A 1 2052 LEU 2052 ? ? ? T . A 1 2053 LEU 2053 ? ? ? T . A 1 2054 GLU 2054 ? ? ? T . A 1 2055 SER 2055 ? ? ? T . A 1 2056 HIS 2056 ? ? ? T . A 1 2057 GLN 2057 ? ? ? T . A 1 2058 GLU 2058 ? ? ? T . A 1 2059 GLU 2059 ? ? ? T . A 1 2060 THR 2060 ? ? ? T . A 1 2061 ASN 2061 ? ? ? T . A 1 2062 GLN 2062 ? ? ? T . A 1 2063 LEU 2063 ? ? ? T . A 1 2064 LEU 2064 ? ? ? T . A 1 2065 LYS 2065 ? ? ? T . A 1 2066 LYS 2066 ? ? ? T . A 1 2067 ILE 2067 ? ? ? T . A 1 2068 ALA 2068 ? ? ? T . A 1 2069 GLU 2069 ? ? ? T . A 1 2070 LYS 2070 ? ? ? T . A 1 2071 ASP 2071 ? ? ? T . A 1 2072 ASP 2072 ? ? ? T . A 1 2073 ASP 2073 ? ? ? T . A 1 2074 LEU 2074 ? ? ? T . A 1 2075 LYS 2075 ? ? ? T . A 1 2076 ARG 2076 ? ? ? T . A 1 2077 THR 2077 ? ? ? T . A 1 2078 ALA 2078 ? ? ? T . A 1 2079 LYS 2079 ? ? ? T . A 1 2080 ARG 2080 ? ? ? T . A 1 2081 TYR 2081 ? ? ? T . A 1 2082 GLU 2082 ? ? ? T . A 1 2083 GLU 2083 ? ? ? T . A 1 2084 ILE 2084 ? ? ? T . A 1 2085 LEU 2085 ? ? ? T . A 1 2086 ASP 2086 ? ? ? T . A 1 2087 ALA 2087 ? ? ? T . A 1 2088 ARG 2088 ? ? ? T . A 1 2089 GLU 2089 ? ? ? T . A 1 2090 GLU 2090 ? ? ? T . A 1 2091 GLU 2091 ? ? ? T . A 1 2092 MET 2092 ? ? ? T . A 1 2093 THR 2093 ? ? ? T . A 1 2094 ALA 2094 ? ? ? T . A 1 2095 LYS 2095 ? ? ? T . A 1 2096 VAL 2096 ? ? ? T . A 1 2097 ARG 2097 ? ? ? T . A 1 2098 ASP 2098 ? ? ? T . A 1 2099 LEU 2099 ? ? ? T . A 1 2100 GLN 2100 ? ? ? T . A 1 2101 THR 2101 ? ? ? T . A 1 2102 GLN 2102 ? ? ? T . A 1 2103 LEU 2103 ? ? ? T . A 1 2104 GLU 2104 ? ? ? T . A 1 2105 GLU 2105 ? ? ? T . A 1 2106 LEU 2106 ? ? ? T . A 1 2107 GLN 2107 ? ? ? T . A 1 2108 LYS 2108 ? ? ? T . A 1 2109 LYS 2109 ? ? ? T . A 1 2110 TYR 2110 ? ? ? T . A 1 2111 GLN 2111 ? ? ? T . A 1 2112 GLN 2112 ? ? ? T . A 1 2113 LYS 2113 ? ? ? T . A 1 2114 LEU 2114 ? ? ? T . A 1 2115 GLU 2115 ? ? ? T . A 1 2116 GLN 2116 ? ? ? T . A 1 2117 GLU 2117 ? ? ? T . A 1 2118 GLU 2118 ? ? ? T . A 1 2119 ASN 2119 ? ? ? T . A 1 2120 PRO 2120 ? ? ? T . A 1 2121 GLY 2121 ? ? ? T . A 1 2122 ASN 2122 ? ? ? T . A 1 2123 ASP 2123 ? ? ? T . A 1 2124 ASN 2124 ? ? ? T . A 1 2125 THR 2125 ? ? ? T . A 1 2126 GLN 2126 ? ? ? T . A 1 2127 LEU 2127 ? ? ? T . A 1 2128 ALA 2128 ? ? ? T . A 1 2129 GLN 2129 ? ? ? T . A 1 2130 LYS 2130 ? ? ? T . A 1 2131 THR 2131 ? ? ? T . A 1 2132 THR 2132 ? ? ? T . A 1 2133 LEU 2133 ? ? ? T . A 1 2134 ILE 2134 ? ? ? T . A 1 2135 SER 2135 ? ? ? T . A 1 2136 ASP 2136 ? ? ? T . A 1 2137 SER 2137 ? ? ? T . A 1 2138 LYS 2138 ? ? ? T . A 1 2139 LEU 2139 ? ? ? T . A 1 2140 LYS 2140 ? ? ? T . A 1 2141 GLU 2141 ? ? ? T . A 1 2142 GLN 2142 ? ? ? T . A 1 2143 GLU 2143 ? ? ? T . A 1 2144 PHE 2144 ? ? ? T . A 1 2145 ARG 2145 ? ? ? T . A 1 2146 GLU 2146 ? ? ? T . A 1 2147 GLN 2147 ? ? ? T . A 1 2148 ILE 2148 ? ? ? T . A 1 2149 HIS 2149 ? ? ? T . A 1 2150 ASN 2150 ? ? ? T . A 1 2151 LEU 2151 ? ? ? T . A 1 2152 GLU 2152 ? ? ? T . A 1 2153 ASP 2153 ? ? ? T . A 1 2154 ARG 2154 ? ? ? T . A 1 2155 LEU 2155 ? ? ? T . A 1 2156 LYS 2156 ? ? ? T . A 1 2157 LYS 2157 ? ? ? T . A 1 2158 TYR 2158 ? ? ? T . A 1 2159 GLU 2159 ? ? ? T . A 1 2160 LYS 2160 ? ? ? T . A 1 2161 ASN 2161 ? ? ? T . A 1 2162 VAL 2162 ? ? ? T . A 1 2163 TYR 2163 ? ? ? T . A 1 2164 ALA 2164 ? ? ? T . A 1 2165 THR 2165 ? ? ? T . A 1 2166 THR 2166 ? ? ? T . A 1 2167 VAL 2167 ? ? ? T . A 1 2168 GLY 2168 ? ? ? T . A 1 2169 THR 2169 ? ? ? T . A 1 2170 PRO 2170 ? ? ? T . A 1 2171 TYR 2171 ? ? ? T . A 1 2172 LYS 2172 ? ? ? T . A 1 2173 GLY 2173 ? ? ? T . A 1 2174 GLY 2174 ? ? ? T . A 1 2175 ASN 2175 ? ? ? T . A 1 2176 LEU 2176 ? ? ? T . A 1 2177 TYR 2177 ? ? ? T . A 1 2178 HIS 2178 ? ? ? T . A 1 2179 THR 2179 ? ? ? T . A 1 2180 ASP 2180 ? ? ? T . A 1 2181 VAL 2181 ? ? ? T . A 1 2182 SER 2182 ? ? ? T . A 1 2183 LEU 2183 ? ? ? T . A 1 2184 PHE 2184 ? ? ? T . A 1 2185 GLY 2185 ? ? ? T . A 1 2186 GLU 2186 ? ? ? T . A 1 2187 PRO 2187 ? ? ? T . A 1 2188 THR 2188 ? ? ? T . A 1 2189 GLU 2189 ? ? ? T . A 1 2190 PHE 2190 ? ? ? T . A 1 2191 GLU 2191 ? ? ? T . A 1 2192 TYR 2192 ? ? ? T . A 1 2193 LEU 2193 ? ? ? T . A 1 2194 ARG 2194 ? ? ? T . A 1 2195 LYS 2195 ? ? ? T . A 1 2196 VAL 2196 ? ? ? T . A 1 2197 LEU 2197 ? ? ? T . A 1 2198 PHE 2198 ? ? ? T . A 1 2199 GLU 2199 ? ? ? T . A 1 2200 TYR 2200 ? ? ? T . A 1 2201 MET 2201 ? ? ? T . A 1 2202 MET 2202 ? ? ? T . A 1 2203 GLY 2203 ? ? ? T . A 1 2204 ARG 2204 ? ? ? T . A 1 2205 GLU 2205 ? ? ? T . A 1 2206 THR 2206 ? ? ? T . A 1 2207 LYS 2207 ? ? ? T . A 1 2208 THR 2208 ? ? ? T . A 1 2209 MET 2209 ? ? ? T . A 1 2210 ALA 2210 ? ? ? T . A 1 2211 LYS 2211 ? ? ? T . A 1 2212 VAL 2212 ? ? ? T . A 1 2213 ILE 2213 ? ? ? T . A 1 2214 THR 2214 ? ? ? T . A 1 2215 THR 2215 ? ? ? T . A 1 2216 VAL 2216 ? ? ? T . A 1 2217 LEU 2217 ? ? ? T . A 1 2218 LYS 2218 ? ? ? T . A 1 2219 PHE 2219 ? ? ? T . A 1 2220 PRO 2220 ? ? ? T . A 1 2221 ASP 2221 ? ? ? T . A 1 2222 ASP 2222 ? ? ? T . A 1 2223 GLN 2223 ? ? ? T . A 1 2224 THR 2224 ? ? ? T . A 1 2225 GLN 2225 ? ? ? T . A 1 2226 LYS 2226 ? ? ? T . A 1 2227 ILE 2227 ? ? ? T . A 1 2228 LEU 2228 ? ? ? T . A 1 2229 GLU 2229 ? ? ? T . A 1 2230 ARG 2230 ? ? ? T . A 1 2231 GLU 2231 ? ? ? T . A 1 2232 ASP 2232 ? ? ? T . A 1 2233 ALA 2233 ? ? ? T . A 1 2234 ARG 2234 ? ? ? T . A 1 2235 LEU 2235 ? ? ? T . A 1 2236 MET 2236 ? ? ? T . A 1 2237 SER 2237 ? ? ? T . A 1 2238 TRP 2238 ? ? ? T . A 1 2239 LEU 2239 ? ? ? T . A 1 2240 ARG 2240 ? ? ? T . A 1 2241 SER 2241 ? ? ? T . A 1 2242 SER 2242 ? ? ? T . A 1 2243 SER 2243 ? ? ? T . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Flagellar associated protein {PDB ID=8tid, label_asym_id=T, auth_asym_id=T, SMTL ID=8tid.1.T}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8tid, label_asym_id=T' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A T 19 1 T # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MNQDKHPEITDEEQELITVEELSQKLELLYKDMEQIRRENLLFEAYLARNRKEIAKEDEVSEDKKGKGKK KDKNVDKKSLLLTNEEKFEIAQQEQDALKKQIDDGRIKSDQILETLRAILEETDMAITEIRKDAFDFQRE ILVGGENSRTGKIEAEKIIKFFEEKERQKDALIAKYSSKRTNLERQILKTNNQIQKKEEMGDDLKFIDFY QLQIENKKYVKEIDDKNKKLLALKISTNRISQTLKDEKQNLKQELDKGKEYASQMSERKKKISKIDAQIK SVKKVTSKLEKDRKIYDKQKEIFVQDNQDDVPQIMKYVQYKSKEQQLLYAIQNLERKIEIAELAYKKANR ILQSSQQFQQK ; ;MNQDKHPEITDEEQELITVEELSQKLELLYKDMEQIRRENLLFEAYLARNRKEIAKEDEVSEDKKGKGKK KDKNVDKKSLLLTNEEKFEIAQQEQDALKKQIDDGRIKSDQILETLRAILEETDMAITEIRKDAFDFQRE ILVGGENSRTGKIEAEKIIKFFEEKERQKDALIAKYSSKRTNLERQILKTNNQIQKKEEMGDDLKFIDFY QLQIENKKYVKEIDDKNKKLLALKISTNRISQTLKDEKQNLKQELDKGKEYASQMSERKKKISKIDAQIK SVKKVTSKLEKDRKIYDKQKEIFVQDNQDDVPQIMKYVQYKSKEQQLLYAIQNLERKIEIAELAYKKANR ILQSSQQFQQK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 82 257 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8tid 2024-11-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2243 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2251 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 67.000 15.476 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MFKKLKQKISEEQQQLQQALAPAQASSNSSTPTRMRSRTSSFTEQLDEGTPNRENASTHASKSPDSVNGSEPSIPQSGDTQSFAQKLQLRVPSVESLFRSPIKESLFRSSSKESLVRTSSRESLNRLDLDSSTASFDPPSDMDSEAEDLVGNSDSLNKEQLIQRLRRMERSLSSYRGKYSELVTAYQMLQREKKKLQGILSQSQDKSLRRIAELREELQMDQQAKKHLQEEFDASLEEKDQYISVLQTQVSLLKQRLRNGPMNVDVLKPLPQLEPQAEVFTKEENPESDGEPVVEDGTSVKTLE-------TLQQRVKRQENLLKRCKETIQS-HKEQCTLLTSEKEALQEQLDERLQELEKIKDLHMAEKTKLITQLRDAKNLIEQLEQDKGMVIAETKRQMHETLEMKEEEIAQLRSRIKQMTTQGEELREQKEKSERAAFEELEKALSTAQKTEEARRKLKAEMDEQIKTIEKTSEEERISLQQELSRVKQEVVDVMKKSSEEQIAKLQKLHEKELARKEQELTKKLQTREREFQEQMKVALEKSQSEYLKISQEKEQQESLALEELELQKKAILTESENKLRDLQQEAETYRTRILELESSLEKSLQENKNQSKDLAVHLEAEKNKHNKEITVMVEKHKTELESLKHQQDALWTEKLQVLKQQYQTEMEKLREKCEQEKETLLKDKEIIFQAHIEEMNEKTLEKLDVKQTELESLSSELSEVLKARHKLEEELSVLKDQTDKMKQELEAKMDEQKNHHQQQVDSIIKEHEVSIQRTEKALKDQINQLELLLKERDKHLKEHQAHVENLEADIKRSEGELQQASAKLDVFQSYQSATHEQTKAYEEQLAQLQQKLLDLETERILLTKQVAEVEAQKKDVCTELDAHKIQVQDLMQQLEKQNSEMEQKVKSLTQVYESKLEDGNKEQEQTKQILVEKENMILQMREGQKKEIEILTQKLSAKEDSIHILNEEYETKFKNQEKKMEKVKQKAKEMQETLKKKLLDQEAKLKKELENTALELSQKEKQFNAKMLEMAQANSAGISDAVSRLETNQKEQIESLTEVHRRELNDVISIWEKKLNQQAEELQEIHEIQLQEKEQEVAELKQKILLFGCEKEEMNKEITWLKEEGVKQDTTLNELQEQLKQKSAHVNSLAQDETKLKAHLEKLEVDLNKSLKENTFLQEQLVELKMLAEEDKRKVSELTSKLKTTDEEFQSLKSSHEKSNKSLEDKSLEFKKLSEELAIQLDICCKKTEALLEAKTNELINISSSKTNAILSRISHCQHRTTKVKEALLIKTCTVSELEAQLRQLTEEQNTLNISFQQATHQLEEKENQIKSMKADIESLVTEKEALQKEGGNQQQAASEKESCITQLKKELSENINAVTLMKEELKEKKVEISSLSKQLTDLNVQLQNSISLSEKEAAISSLRKQYDEEKCELLDQVQDLSFKVDTLSKEKISALEQVDDWSNKFSEWKKKAQSRFTQHQNTVKELQIQLELKSKEAYEKDEQINLLKEELDQQNKRFDCLKGEMEDDKSKMEKKESNLETELKSQTARIMELEDHITQKTIEIESLNEVLKNYNQQKDIEHKELVQKLQHFQELGEEKDNRVKEAEEKILTLENQVYSMKAELETKKKELEHVNLSVKSKEEELKALEDRLESESAAKLAELKRKAEQKIAAIKKQLLSQMEEKEEQYKKGTESHLSELNTKLQEREREVHILEEKLKSVESSQSETLIVPRSAKNVAAYTEQEEADSQGCVQKTYEEKISVLQRNLTEKEKLLQRVGQEKEETVSSHFEMRCQYQERLIKLEHAEAKQHEDQSMIGHLQEELEEKNKKYSLIVAQHVEKEGGKNNIQAKQNLENVFDDVQKTLQEKELTCQILEQKIKELDSCLVRQKEVHRVEMEELTSKYEKLQALQQMDGRNKPTELLEENTEEKSKSHLVQPKLLSNMEAQHNDLEFKLAGAEREKQKLGKEIVRLQKDLRMLRKEHQQELEILKKEYDQEREEKIKQEQEDLELKHNSTLKQLMREFNTQLAQKEQELEMTIKETINKAQEVEAELLESHQEETNQLLKKIAEKDDDLKRTAKRYEEILDAREEEMTAKVRDLQTQLEELQKKYQQKLEQEENPGNDNTQLAQKTTLISDSKLKEQEFREQIHNLEDRLKKYEKNVYATTVGTPYKGGNLYHTDVSLFGEPTEFEYLRKVLFEYMMGRETKTMAKVITTVLKFPDDQTQKILEREDARLMSWLRSSS 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LTNEEKFEIAQQEQDALKKQIDDGRIKSDQILETLRAILEETDMAITEIRKDAFDFQREILVGGENSRTGKI--EAEKIIKFFEEKE-------RQ-----KDALIAKYSSKRTNLERQILKTNNQIQKKEEMGDDLKFIDFYQLQIENKKYVKEIDDKNKKLLALKIST----NRISQTLKDEKQNLKQELDK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8tid.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 198 198 ? A 385.676 519.986 722.991 1 1 T GLY 0.480 1 ATOM 2 C CA . GLY 198 198 ? A 387.082 519.756 722.476 1 1 T GLY 0.480 1 ATOM 3 C C . GLY 198 198 ? A 387.552 518.418 722.926 1 1 T GLY 0.480 1 ATOM 4 O O . GLY 198 198 ? A 387.391 518.125 724.102 1 1 T GLY 0.480 1 ATOM 5 N N . ILE 199 199 ? A 388.117 517.590 722.026 1 1 T ILE 0.470 1 ATOM 6 C CA . ILE 199 199 ? A 388.779 516.337 722.362 1 1 T ILE 0.470 1 ATOM 7 C C . ILE 199 199 ? A 390.104 516.605 723.060 1 1 T ILE 0.470 1 ATOM 8 O O . ILE 199 199 ? A 390.494 517.760 723.211 1 1 T ILE 0.470 1 ATOM 9 C CB . ILE 199 199 ? A 389.037 515.483 721.118 1 1 T ILE 0.470 1 ATOM 10 C CG1 . ILE 199 199 ? A 390.043 516.159 720.154 1 1 T ILE 0.470 1 ATOM 11 C CG2 . ILE 199 199 ? A 387.679 515.218 720.435 1 1 T ILE 0.470 1 ATOM 12 C CD1 . ILE 199 199 ? A 390.505 515.295 718.976 1 1 T ILE 0.470 1 ATOM 13 N N . LEU 200 200 ? A 390.850 515.554 723.465 1 1 T LEU 0.320 1 ATOM 14 C CA . LEU 200 200 ? A 392.162 515.693 724.072 1 1 T LEU 0.320 1 ATOM 15 C C . LEU 200 200 ? A 393.203 516.390 723.203 1 1 T LEU 0.320 1 ATOM 16 O O . LEU 200 200 ? A 393.892 517.297 723.654 1 1 T LEU 0.320 1 ATOM 17 C CB . LEU 200 200 ? A 392.703 514.296 724.443 1 1 T LEU 0.320 1 ATOM 18 C CG . LEU 200 200 ? A 394.064 514.304 725.169 1 1 T LEU 0.320 1 ATOM 19 C CD1 . LEU 200 200 ? A 394.006 515.084 726.494 1 1 T LEU 0.320 1 ATOM 20 C CD2 . LEU 200 200 ? A 394.555 512.867 725.391 1 1 T LEU 0.320 1 ATOM 21 N N . SER 201 201 ? A 393.331 516.022 721.913 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 22 C CA . SER 201 201 ? A 394.272 516.687 721.017 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 23 C C . SER 201 201 ? A 393.943 518.151 720.770 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 24 O O . SER 201 201 ? A 394.777 519.036 720.912 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 25 C CB . SER 201 201 ? A 394.366 515.944 719.662 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 26 O OG . SER 201 201 ? A 394.707 514.572 719.873 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 27 N N . GLN 202 202 ? A 392.661 518.459 720.490 1 1 T GLN 0.410 1 ATOM 28 C CA . GLN 202 202 ? A 392.181 519.814 720.301 1 1 T GLN 0.410 1 ATOM 29 C C . GLN 202 202 ? A 392.273 520.680 721.546 1 1 T GLN 0.410 1 ATOM 30 O O . GLN 202 202 ? A 392.514 521.880 721.449 1 1 T GLN 0.410 1 ATOM 31 C CB . GLN 202 202 ? A 390.712 519.837 719.834 1 1 T GLN 0.410 1 ATOM 32 C CG . GLN 202 202 ? A 390.507 519.287 718.412 1 1 T GLN 0.410 1 ATOM 33 C CD . GLN 202 202 ? A 389.019 519.327 718.080 1 1 T GLN 0.410 1 ATOM 34 O OE1 . GLN 202 202 ? A 388.179 518.945 718.906 1 1 T GLN 0.410 1 ATOM 35 N NE2 . GLN 202 202 ? A 388.680 519.837 716.875 1 1 T GLN 0.410 1 ATOM 36 N N . SER 203 203 ? A 392.030 520.118 722.755 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 37 C CA . SER 203 203 ? A 392.243 520.815 724.019 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 38 C C . SER 203 203 ? A 393.701 521.161 724.239 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 39 O O . SER 203 203 ? A 394.009 522.300 724.582 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 40 C CB . SER 203 203 ? A 391.677 520.073 725.275 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 41 O OG . SER 203 203 ? A 392.368 518.864 725.583 1 1 T SER 0.450 1 ATOM 42 N N . GLN 204 204 ? A 394.633 520.216 723.971 1 1 T GLN 0.530 1 ATOM 43 C CA . GLN 204 204 ? A 396.066 520.448 724.017 1 1 T GLN 0.530 1 ATOM 44 C C . GLN 204 204 ? A 396.532 521.509 723.037 1 1 T GLN 0.530 1 ATOM 45 O O . GLN 204 204 ? A 397.253 522.424 723.436 1 1 T GLN 0.530 1 ATOM 46 C CB . GLN 204 204 ? A 396.860 519.137 723.803 1 1 T GLN 0.530 1 ATOM 47 C CG . GLN 204 204 ? A 396.699 518.151 724.982 1 1 T GLN 0.530 1 ATOM 48 C CD . GLN 204 204 ? A 397.426 516.834 724.724 1 1 T GLN 0.530 1 ATOM 49 O OE1 . GLN 204 204 ? A 397.650 516.392 723.599 1 1 T GLN 0.530 1 ATOM 50 N NE2 . GLN 204 204 ? A 397.821 516.149 725.823 1 1 T GLN 0.530 1 ATOM 51 N N . ASP 205 205 ? A 396.066 521.474 721.770 1 1 T ASP 0.580 1 ATOM 52 C CA . ASP 205 205 ? A 396.360 522.478 720.761 1 1 T ASP 0.580 1 ATOM 53 C C . ASP 205 205 ? A 395.884 523.874 721.152 1 1 T ASP 0.580 1 ATOM 54 O O . ASP 205 205 ? A 396.592 524.872 721.009 1 1 T ASP 0.580 1 ATOM 55 C CB . ASP 205 205 ? A 395.692 522.107 719.410 1 1 T ASP 0.580 1 ATOM 56 C CG . ASP 205 205 ? A 396.341 520.901 718.751 1 1 T ASP 0.580 1 ATOM 57 O OD1 . ASP 205 205 ? A 397.488 520.559 719.127 1 1 T ASP 0.580 1 ATOM 58 O OD2 . ASP 205 205 ? A 395.690 520.349 717.826 1 1 T ASP 0.580 1 ATOM 59 N N . LYS 206 206 ? A 394.656 523.984 721.704 1 1 T LYS 0.560 1 ATOM 60 C CA . LYS 206 206 ? A 394.143 525.227 722.254 1 1 T LYS 0.560 1 ATOM 61 C C . LYS 206 206 ? A 394.917 525.733 723.441 1 1 T LYS 0.560 1 ATOM 62 O O . LYS 206 206 ? A 395.173 526.933 723.530 1 1 T LYS 0.560 1 ATOM 63 C CB . LYS 206 206 ? A 392.673 525.124 722.708 1 1 T LYS 0.560 1 ATOM 64 C CG . LYS 206 206 ? A 391.703 524.984 721.537 1 1 T LYS 0.560 1 ATOM 65 C CD . LYS 206 206 ? A 390.250 524.836 722.000 1 1 T LYS 0.560 1 ATOM 66 C CE . LYS 206 206 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.539 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 198 GLY 1 0.480 2 1 A 199 ILE 1 0.470 3 1 A 200 LEU 1 0.320 4 1 A 201 SER 1 0.450 5 1 A 202 GLN 1 0.410 6 1 A 203 SER 1 0.450 7 1 A 204 GLN 1 0.530 8 1 A 205 ASP 1 0.580 9 1 A 206 LYS 1 0.560 10 1 A 207 SER 1 0.590 11 1 A 208 LEU 1 0.600 12 1 A 209 ARG 1 0.610 13 1 A 210 ARG 1 0.610 14 1 A 211 ILE 1 0.640 15 1 A 212 ALA 1 0.700 16 1 A 213 GLU 1 0.630 17 1 A 214 LEU 1 0.630 18 1 A 215 ARG 1 0.570 19 1 A 216 GLU 1 0.610 20 1 A 217 GLU 1 0.610 21 1 A 218 LEU 1 0.620 22 1 A 219 GLN 1 0.620 23 1 A 220 MET 1 0.580 24 1 A 221 ASP 1 0.580 25 1 A 222 GLN 1 0.590 26 1 A 223 GLN 1 0.550 27 1 A 224 ALA 1 0.640 28 1 A 225 LYS 1 0.610 29 1 A 226 LYS 1 0.610 30 1 A 227 HIS 1 0.570 31 1 A 228 LEU 1 0.610 32 1 A 229 GLN 1 0.620 33 1 A 230 GLU 1 0.610 34 1 A 231 GLU 1 0.600 35 1 A 232 PHE 1 0.570 36 1 A 233 ASP 1 0.580 37 1 A 234 ALA 1 0.640 38 1 A 235 SER 1 0.610 39 1 A 236 LEU 1 0.580 40 1 A 237 GLU 1 0.580 41 1 A 238 GLU 1 0.570 42 1 A 239 LYS 1 0.600 43 1 A 240 ASP 1 0.580 44 1 A 241 GLN 1 0.550 45 1 A 242 TYR 1 0.520 46 1 A 243 ILE 1 0.580 47 1 A 244 SER 1 0.580 48 1 A 245 VAL 1 0.570 49 1 A 246 LEU 1 0.570 50 1 A 247 GLN 1 0.560 51 1 A 248 THR 1 0.590 52 1 A 249 GLN 1 0.580 53 1 A 250 VAL 1 0.610 54 1 A 251 SER 1 0.590 55 1 A 252 LEU 1 0.610 56 1 A 253 LEU 1 0.610 57 1 A 254 LYS 1 0.480 58 1 A 255 GLN 1 0.500 59 1 A 256 ARG 1 0.550 60 1 A 257 LEU 1 0.620 61 1 A 258 ARG 1 0.550 62 1 A 259 ASN 1 0.610 63 1 A 260 GLY 1 0.590 64 1 A 261 PRO 1 0.580 65 1 A 262 MET 1 0.520 66 1 A 263 ASN 1 0.590 67 1 A 264 VAL 1 0.450 68 1 A 265 ASP 1 0.380 69 1 A 266 VAL 1 0.420 70 1 A 267 LEU 1 0.420 71 1 A 268 LYS 1 0.560 72 1 A 269 PRO 1 0.500 73 1 A 270 LEU 1 0.390 74 1 A 271 PRO 1 0.470 75 1 A 272 GLN 1 0.560 76 1 A 273 LEU 1 0.530 77 1 A 274 GLU 1 0.610 78 1 A 275 PRO 1 0.670 79 1 A 276 GLN 1 0.630 80 1 A 277 ALA 1 0.620 81 1 A 278 GLU 1 0.580 82 1 A 279 VAL 1 0.640 83 1 A 280 PHE 1 0.590 84 1 A 281 THR 1 0.600 85 1 A 282 LYS 1 0.600 86 1 A 283 GLU 1 0.630 87 1 A 284 GLU 1 0.600 88 1 A 285 ASN 1 0.580 89 1 A 286 PRO 1 0.470 90 1 A 287 GLU 1 0.520 91 1 A 288 SER 1 0.450 92 1 A 289 ASP 1 0.400 93 1 A 290 GLY 1 0.510 94 1 A 291 GLU 1 0.490 95 1 A 292 PRO 1 0.520 96 1 A 293 VAL 1 0.580 97 1 A 294 VAL 1 0.590 98 1 A 295 GLU 1 0.490 99 1 A 296 ASP 1 0.460 100 1 A 297 GLY 1 0.470 101 1 A 298 THR 1 0.470 102 1 A 299 SER 1 0.470 103 1 A 300 VAL 1 0.260 104 1 A 301 LYS 1 0.230 105 1 A 302 THR 1 0.190 106 1 A 303 LEU 1 0.180 107 1 A 304 GLU 1 0.270 108 1 A 305 THR 1 0.400 109 1 A 306 LEU 1 0.320 110 1 A 307 GLN 1 0.430 111 1 A 308 GLN 1 0.470 112 1 A 309 ARG 1 0.470 113 1 A 310 VAL 1 0.570 114 1 A 311 LYS 1 0.600 115 1 A 312 ARG 1 0.560 116 1 A 313 GLN 1 0.590 117 1 A 314 GLU 1 0.620 118 1 A 315 ASN 1 0.640 119 1 A 316 LEU 1 0.600 120 1 A 317 LEU 1 0.600 121 1 A 318 LYS 1 0.600 122 1 A 319 ARG 1 0.540 123 1 A 320 CYS 1 0.570 124 1 A 321 LYS 1 0.540 125 1 A 322 GLU 1 0.490 126 1 A 323 THR 1 0.490 127 1 A 324 ILE 1 0.420 128 1 A 325 GLN 1 0.410 129 1 A 326 SER 1 0.430 130 1 A 327 HIS 1 0.370 131 1 A 328 LYS 1 0.420 132 1 A 329 GLU 1 0.400 133 1 A 330 GLN 1 0.420 134 1 A 331 CYS 1 0.390 135 1 A 332 THR 1 0.370 136 1 A 333 LEU 1 0.310 137 1 A 334 LEU 1 0.320 138 1 A 335 THR 1 0.390 139 1 A 336 SER 1 0.390 140 1 A 337 GLU 1 0.390 141 1 A 338 LYS 1 0.440 142 1 A 339 GLU 1 0.420 143 1 A 340 ALA 1 0.420 144 1 A 341 LEU 1 0.430 145 1 A 342 GLN 1 0.480 146 1 A 343 GLU 1 0.460 147 1 A 344 GLN 1 0.450 148 1 A 345 LEU 1 0.470 149 1 A 346 ASP 1 0.540 150 1 A 347 GLU 1 0.560 151 1 A 348 ARG 1 0.540 152 1 A 349 LEU 1 0.610 153 1 A 350 GLN 1 0.640 154 1 A 351 GLU 1 0.640 155 1 A 352 LEU 1 0.610 156 1 A 353 GLU 1 0.600 157 1 A 354 LYS 1 0.580 158 1 A 355 ILE 1 0.650 159 1 A 356 LYS 1 0.640 160 1 A 357 ASP 1 0.640 161 1 A 358 LEU 1 0.610 162 1 A 359 HIS 1 0.540 163 1 A 360 MET 1 0.430 164 1 A 361 ALA 1 0.610 165 1 A 362 GLU 1 0.440 166 1 A 363 LYS 1 0.500 167 1 A 364 THR 1 0.640 168 1 A 365 LYS 1 0.610 169 1 A 366 LEU 1 0.590 170 1 A 367 ILE 1 0.610 171 1 A 368 THR 1 0.640 172 1 A 369 GLN 1 0.570 173 1 A 370 LEU 1 0.580 174 1 A 371 ARG 1 0.590 175 1 A 372 ASP 1 0.670 176 1 A 373 ALA 1 0.730 177 1 A 374 LYS 1 0.730 178 1 A 375 ASN 1 0.670 179 1 A 376 LEU 1 0.690 180 1 A 377 ILE 1 0.680 181 1 A 378 GLU 1 0.730 182 1 A 379 GLN 1 0.690 183 1 A 380 LEU 1 0.690 184 1 A 381 GLU 1 0.680 185 1 A 382 GLN 1 0.540 186 1 A 383 ASP 1 0.490 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #