data_SMR-c14d4740af7b4275271c76d3c4c589b4_3 _entry.id SMR-c14d4740af7b4275271c76d3c4c589b4_3 _struct.entry_id SMR-c14d4740af7b4275271c76d3c4c589b4_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q13439 (isoform 3)/ GOGA4_HUMAN, Golgin subfamily A member 4 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q13439 (isoform 3)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 303144.790 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP GOGA4_HUMAN Q13439 1 ;MFKKLKQKISEEQQQLQQALAPAQASSNSSTPTRMRSRTSSFTEQLDEGTPNRENASTHASKSPDSVNGS EPSIPQSGDTQSFAQKLQLRVPSVESLFRSPIKESLFRSSSKESLVRTSSRESLNRLDLDSSTASFDPPS DMDSEAEDLVGNSDSLNKEQLIQRLRRMERSLSSYRGKYSELVTAYQMLQREKKKLQGILSQSQDKSLRR IAELREELQMDQQAKKHLQEEFDASLEEKDQYISVLQTQVSLLKQRLRNGPMNVDVLKPLPQLEPQAEVF TKEENPESDGEPVVEDGTSVKTLETLQQRVKRQENLLKRCKETIQSHKEQCTLLTSEKEALQEQLDERLQ ELEKIKDLHMAEKTKLITQLRDAKNLIEQLEQDKGMVIAETKRQMHETLEMKEEEIAQLRSRIKQMTTQG EELREQKEKSERAAFEELEKALSTAQKTEEARRKLKAEMDEQIKTIEKTSEEERISLQQELSRVKQEVVD VMKKSSEEQIAKLQKLHEKELARKEQELTKKLQTREREFQEQMKVALEKSQSEYLKISQEKEQQESLALE ELELQKKAILTESENKLRDLQQEAETYRTRILELESSLEKSLQENKNQSKDLAVHLEAEKNKHNKEITVM VEKHKTELESLKHQQDALWTEKLQVLKQQYQTEMEKLREKCEQEKETLLKDKEIIFQAHIEEMNEKTLEK LDVKQTELESLSSELSEVLKARHKLEEELSVLKDQTDKMKQELEAKMDEQKNHHQQQVDSIIKEHEVSIQ RTEKALKDQINQLELLLKERDKHLKEHQAHVENLEADIKRSEGELQQASAKLDVFQSYQSATHEQTKAYE EQLAQLQQKLLDLETERILLTKQVAEVEAQKKDVCTELDAHKIQVQDLMQQLEKQNSEMEQKVKSLTQVY ESKLEDGNKEQEQTKQILVEKENMILQMREGQKKEIEILTQKLSAKEDSIHILNEEYETKFKNQEKKMEK VKQKAKEMQETLKKKLLDQEAKLKKELENTALELSQKEKQFNAKMLEMAQANSAGISDAVSRLETNQKEQ IESLTEVHRRELNDVISIWEKKLNQQAEELQEIHEIQLQEKEQEVAELKQKILLFGCEKEEMNKEITWLK EEGVKQDTTLNELQEQLKQKSAHVNSLAQDETKLKAHLEKLEVDLNKSLKENTFLQEQLVELKMLAEEDK RKVSELTSKLKTTDEEFQSLKSSHEKSNKSLEDKSLEFKKLSEELAIQLDICCKKTEALLEAKTNELINI SSSKTNAILSRISHCQHRTTKVKEALLIKTCTVSELEAQLRQLTEEQNTLNISFQQATHQLEEKENQIKS MKADIESLVTEKEALQKEGGNQQQAASEKESCITQLKKELSENINAVTLMKEELKEKKVEISSLSKQLTD LNVQLQNSISLSEKEAAISSLRKQYDEEKCELLDQVQDLSFKVDTLSKEKISALEQVDDWSNKFSEWKKK AQSRFTQHQNTVKELQIQLELKSKEAYEKDEQINLLKEELDQQNKRFDCLKGEMEDDKSKMEKKESNLET ELKSQTARIMELEDHITQKTIEIESLNEVLKNYNQQKDIEHKELVQKLQHFQELGEEKDNRVKEAEEKIL TLENQVYSMKAELETKKKELEHVNLSVKSKEEELKALEDRLESESAAKLAELKRKAEQKIAAIKKQLLSQ MEEKEEQYKKGTESHLSELNTKLQEREREVHILEEKLKSVESSQSETLIVPRSAKNVAAYTEQEEADSQG CVQKTYEEKISVLQRNLTEKEKLLQRVGQEKEETVSSHFEMRCQYQERLIKLEHAEAKQHEDQSMIGHLQ EELEEKNKKYSLIVAQHVEKEGGKNNIQAKQNLENVFDDVQKTLQEKELTCQILEQKIKELDSCLVRQKE VHRVEMEELTSKYEKLQALQQMDGRNKPTELLEENTEEKSKSHLVQPKLLSNMEAQHNDLEFKLAGAERE KQKLGKEIVRLQKDLRMLRKEHQQELEILKKEYDQEREEKIKQEQEDLELKHNSTLKQLMREFNTQLAQK EQELEMTIKETINKAQEVEAELLESHQEETNQLLKKIAEKDDDLKRTAKRYEEILDAREEEMTAKVRDLQ TQLEELQKKYQQKLEQEENPGNDNTQLAQKTTLISDSKLKEQEFREQIHNLEDRLKKYEKNVYATTVGTP YKGGNLYHTDVSLFGEPTEFEYLRKVLFEYMMGRETKTMAKVITTVLKFPDDQTQKILEREDARLMSWLR SSS ; 'Golgin subfamily A member 4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2243 1 2243 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . GOGA4_HUMAN Q13439 Q13439-3 1 2243 9606 'Homo sapiens (Human)' 1996-11-01 EDD8BCB88E02B9A4 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no I ;MFKKLKQKISEEQQQLQQALAPAQASSNSSTPTRMRSRTSSFTEQLDEGTPNRENASTHASKSPDSVNGS EPSIPQSGDTQSFAQKLQLRVPSVESLFRSPIKESLFRSSSKESLVRTSSRESLNRLDLDSSTASFDPPS DMDSEAEDLVGNSDSLNKEQLIQRLRRMERSLSSYRGKYSELVTAYQMLQREKKKLQGILSQSQDKSLRR IAELREELQMDQQAKKHLQEEFDASLEEKDQYISVLQTQVSLLKQRLRNGPMNVDVLKPLPQLEPQAEVF TKEENPESDGEPVVEDGTSVKTLETLQQRVKRQENLLKRCKETIQSHKEQCTLLTSEKEALQEQLDERLQ ELEKIKDLHMAEKTKLITQLRDAKNLIEQLEQDKGMVIAETKRQMHETLEMKEEEIAQLRSRIKQMTTQG EELREQKEKSERAAFEELEKALSTAQKTEEARRKLKAEMDEQIKTIEKTSEEERISLQQELSRVKQEVVD VMKKSSEEQIAKLQKLHEKELARKEQELTKKLQTREREFQEQMKVALEKSQSEYLKISQEKEQQESLALE ELELQKKAILTESENKLRDLQQEAETYRTRILELESSLEKSLQENKNQSKDLAVHLEAEKNKHNKEITVM 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_entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 PHE . 1 3 LYS . 1 4 LYS . 1 5 LEU . 1 6 LYS . 1 7 GLN . 1 8 LYS . 1 9 ILE . 1 10 SER . 1 11 GLU . 1 12 GLU . 1 13 GLN . 1 14 GLN . 1 15 GLN . 1 16 LEU . 1 17 GLN . 1 18 GLN . 1 19 ALA . 1 20 LEU . 1 21 ALA . 1 22 PRO . 1 23 ALA . 1 24 GLN . 1 25 ALA . 1 26 SER . 1 27 SER . 1 28 ASN . 1 29 SER . 1 30 SER . 1 31 THR . 1 32 PRO . 1 33 THR . 1 34 ARG . 1 35 MET . 1 36 ARG . 1 37 SER . 1 38 ARG . 1 39 THR . 1 40 SER . 1 41 SER . 1 42 PHE . 1 43 THR . 1 44 GLU . 1 45 GLN . 1 46 LEU . 1 47 ASP . 1 48 GLU . 1 49 GLY . 1 50 THR . 1 51 PRO . 1 52 ASN . 1 53 ARG . 1 54 GLU . 1 55 ASN . 1 56 ALA . 1 57 SER . 1 58 THR . 1 59 HIS . 1 60 ALA . 1 61 SER . 1 62 LYS . 1 63 SER . 1 64 PRO . 1 65 ASP . 1 66 SER . 1 67 VAL . 1 68 ASN . 1 69 GLY . 1 70 SER . 1 71 GLU . 1 72 PRO . 1 73 SER . 1 74 ILE . 1 75 PRO . 1 76 GLN . 1 77 SER . 1 78 GLY . 1 79 ASP . 1 80 THR . 1 81 GLN . 1 82 SER . 1 83 PHE . 1 84 ALA . 1 85 GLN . 1 86 LYS . 1 87 LEU . 1 88 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A 1 2073 ASP 2073 ? ? ? I . A 1 2074 LEU 2074 ? ? ? I . A 1 2075 LYS 2075 ? ? ? I . A 1 2076 ARG 2076 ? ? ? I . A 1 2077 THR 2077 ? ? ? I . A 1 2078 ALA 2078 ? ? ? I . A 1 2079 LYS 2079 ? ? ? I . A 1 2080 ARG 2080 ? ? ? I . A 1 2081 TYR 2081 ? ? ? I . A 1 2082 GLU 2082 ? ? ? I . A 1 2083 GLU 2083 ? ? ? I . A 1 2084 ILE 2084 ? ? ? I . A 1 2085 LEU 2085 ? ? ? I . A 1 2086 ASP 2086 ? ? ? I . A 1 2087 ALA 2087 ? ? ? I . A 1 2088 ARG 2088 ? ? ? I . A 1 2089 GLU 2089 ? ? ? I . A 1 2090 GLU 2090 ? ? ? I . A 1 2091 GLU 2091 ? ? ? I . A 1 2092 MET 2092 ? ? ? I . A 1 2093 THR 2093 ? ? ? I . A 1 2094 ALA 2094 ? ? ? I . A 1 2095 LYS 2095 ? ? ? I . A 1 2096 VAL 2096 ? ? ? I . A 1 2097 ARG 2097 ? ? ? I . A 1 2098 ASP 2098 ? ? ? I . A 1 2099 LEU 2099 ? ? ? I . A 1 2100 GLN 2100 ? ? ? I . A 1 2101 THR 2101 ? ? ? I . A 1 2102 GLN 2102 ? ? ? I . A 1 2103 LEU 2103 ? ? ? I . A 1 2104 GLU 2104 ? ? ? I . A 1 2105 GLU 2105 ? ? ? I . A 1 2106 LEU 2106 ? ? ? I . A 1 2107 GLN 2107 ? ? ? I . A 1 2108 LYS 2108 ? ? ? I . A 1 2109 LYS 2109 ? ? ? I . A 1 2110 TYR 2110 ? ? ? I . A 1 2111 GLN 2111 ? ? ? I . A 1 2112 GLN 2112 ? ? ? I . A 1 2113 LYS 2113 ? ? ? I . A 1 2114 LEU 2114 ? ? ? I . A 1 2115 GLU 2115 ? ? ? I . A 1 2116 GLN 2116 ? ? ? I . A 1 2117 GLU 2117 ? ? ? I . A 1 2118 GLU 2118 ? ? ? I . A 1 2119 ASN 2119 ? ? ? I . A 1 2120 PRO 2120 ? ? ? I . A 1 2121 GLY 2121 ? ? ? I . A 1 2122 ASN 2122 ? ? ? I . A 1 2123 ASP 2123 ? ? ? I . A 1 2124 ASN 2124 ? ? ? I . A 1 2125 THR 2125 ? ? ? I . A 1 2126 GLN 2126 ? ? ? I . A 1 2127 LEU 2127 ? ? ? I . A 1 2128 ALA 2128 ? ? ? I . A 1 2129 GLN 2129 ? ? ? I . A 1 2130 LYS 2130 ? ? ? I . A 1 2131 THR 2131 ? ? ? I . A 1 2132 THR 2132 ? ? ? I . A 1 2133 LEU 2133 ? ? ? I . A 1 2134 ILE 2134 ? ? ? I . A 1 2135 SER 2135 ? ? ? I . A 1 2136 ASP 2136 ? ? ? I . A 1 2137 SER 2137 ? ? ? I . A 1 2138 LYS 2138 ? ? ? I . A 1 2139 LEU 2139 ? ? ? I . A 1 2140 LYS 2140 ? ? ? I . A 1 2141 GLU 2141 ? ? ? I . A 1 2142 GLN 2142 ? ? ? I . A 1 2143 GLU 2143 ? ? ? I . A 1 2144 PHE 2144 ? ? ? I . A 1 2145 ARG 2145 ? ? ? I . A 1 2146 GLU 2146 ? ? ? I . A 1 2147 GLN 2147 ? ? ? I . A 1 2148 ILE 2148 ? ? ? I . A 1 2149 HIS 2149 ? ? ? I . A 1 2150 ASN 2150 ? ? ? I . A 1 2151 LEU 2151 ? ? ? I . A 1 2152 GLU 2152 ? ? ? I . A 1 2153 ASP 2153 ? ? ? I . A 1 2154 ARG 2154 ? ? ? I . A 1 2155 LEU 2155 ? ? ? I . A 1 2156 LYS 2156 ? ? ? I . A 1 2157 LYS 2157 ? ? ? I . A 1 2158 TYR 2158 ? ? ? I . A 1 2159 GLU 2159 ? ? ? I . A 1 2160 LYS 2160 ? ? ? I . A 1 2161 ASN 2161 ? ? ? I . A 1 2162 VAL 2162 ? ? ? I . A 1 2163 TYR 2163 ? ? ? I . A 1 2164 ALA 2164 ? ? ? I . A 1 2165 THR 2165 ? ? ? I . A 1 2166 THR 2166 ? ? ? I . A 1 2167 VAL 2167 ? ? ? I . A 1 2168 GLY 2168 ? ? ? I . A 1 2169 THR 2169 ? ? ? I . A 1 2170 PRO 2170 ? ? ? I . A 1 2171 TYR 2171 ? ? ? I . A 1 2172 LYS 2172 ? ? ? I . A 1 2173 GLY 2173 ? ? ? I . A 1 2174 GLY 2174 ? ? ? I . A 1 2175 ASN 2175 ? ? ? I . A 1 2176 LEU 2176 ? ? ? I . A 1 2177 TYR 2177 ? ? ? I . A 1 2178 HIS 2178 ? ? ? I . A 1 2179 THR 2179 ? ? ? I . A 1 2180 ASP 2180 ? ? ? I . A 1 2181 VAL 2181 ? ? ? I . A 1 2182 SER 2182 ? ? ? I . A 1 2183 LEU 2183 ? ? ? I . A 1 2184 PHE 2184 ? ? ? I . A 1 2185 GLY 2185 ? ? ? I . A 1 2186 GLU 2186 ? ? ? I . A 1 2187 PRO 2187 ? ? ? I . A 1 2188 THR 2188 ? ? ? I . A 1 2189 GLU 2189 ? ? ? I . A 1 2190 PHE 2190 ? ? ? I . A 1 2191 GLU 2191 ? ? ? I . A 1 2192 TYR 2192 ? ? ? I . A 1 2193 LEU 2193 ? ? ? I . A 1 2194 ARG 2194 ? ? ? I . A 1 2195 LYS 2195 ? ? ? I . A 1 2196 VAL 2196 ? ? ? I . A 1 2197 LEU 2197 ? ? ? I . A 1 2198 PHE 2198 ? ? ? I . A 1 2199 GLU 2199 ? ? ? I . A 1 2200 TYR 2200 ? ? ? I . A 1 2201 MET 2201 ? ? ? I . A 1 2202 MET 2202 ? ? ? I . A 1 2203 GLY 2203 ? ? ? I . A 1 2204 ARG 2204 ? ? ? I . A 1 2205 GLU 2205 ? ? ? I . A 1 2206 THR 2206 ? ? ? I . A 1 2207 LYS 2207 ? ? ? I . A 1 2208 THR 2208 ? ? ? I . A 1 2209 MET 2209 ? ? ? I . A 1 2210 ALA 2210 ? ? ? I . A 1 2211 LYS 2211 ? ? ? I . A 1 2212 VAL 2212 ? ? ? I . A 1 2213 ILE 2213 ? ? ? I . A 1 2214 THR 2214 ? ? ? I . A 1 2215 THR 2215 ? ? ? I . A 1 2216 VAL 2216 ? ? ? I . A 1 2217 LEU 2217 ? ? ? I . A 1 2218 LYS 2218 ? ? ? I . A 1 2219 PHE 2219 ? ? ? I . A 1 2220 PRO 2220 ? ? ? I . A 1 2221 ASP 2221 ? ? ? I . A 1 2222 ASP 2222 ? ? ? I . A 1 2223 GLN 2223 ? ? ? I . A 1 2224 THR 2224 ? ? ? I . A 1 2225 GLN 2225 ? ? ? I . A 1 2226 LYS 2226 ? ? ? I . A 1 2227 ILE 2227 ? ? ? I . A 1 2228 LEU 2228 ? ? ? I . A 1 2229 GLU 2229 ? ? ? I . A 1 2230 ARG 2230 ? ? ? I . A 1 2231 GLU 2231 ? ? ? I . A 1 2232 ASP 2232 ? ? ? I . A 1 2233 ALA 2233 ? ? ? I . A 1 2234 ARG 2234 ? ? ? I . A 1 2235 LEU 2235 ? ? ? I . A 1 2236 MET 2236 ? ? ? I . A 1 2237 SER 2237 ? ? ? I . A 1 2238 TRP 2238 ? ? ? I . A 1 2239 LEU 2239 ? ? ? I . A 1 2240 ARG 2240 ? ? ? I . A 1 2241 SER 2241 ? ? ? I . A 1 2242 SER 2242 ? ? ? I . A 1 2243 SER 2243 ? ? ? I . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Flagellar associated protein {PDB ID=8tek, label_asym_id=I, auth_asym_id=T, SMTL ID=8tek.1.I}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8tek, label_asym_id=I' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A I 9 1 T # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MNQDKHPEITDEEQELITVEELSQKLELLYKDMEQIRRENLLFEAYLARNRKEIAKEDEVSEDKKGKGKK KDKNVDKKSLLLTNEEKFEIAQQEQDALKKQIDDGRIKSDQILETLRAILEETDMAITEIRKDAFDFQRE ILVGGENSRTGKIEAEKIIKFFEEKERQKDALIAKYSSKRTNLERQILKTNNQIQKKEEMGDDLKFIDFY QLQIENKKYVKEIDDKNKKLLALKISTNRISQTLKDEKQNLKQELDKGKEYASQMSERKKKISKIDAQIK SVKKVTSKLEKDRKIYDKQKEIFVQDNQDDVPQIMKYVQYKSKEQQLLYAIQNLERKIEIAELAYKKANR ILQSSQQFQQK ; ;MNQDKHPEITDEEQELITVEELSQKLELLYKDMEQIRRENLLFEAYLARNRKEIAKEDEVSEDKKGKGKK KDKNVDKKSLLLTNEEKFEIAQQEQDALKKQIDDGRIKSDQILETLRAILEETDMAITEIRKDAFDFQRE ILVGGENSRTGKIEAEKIIKFFEEKERQKDALIAKYSSKRTNLERQILKTNNQIQKKEEMGDDLKFIDFY QLQIENKKYVKEIDDKNKKLLALKISTNRISQTLKDEKQNLKQELDKGKEYASQMSERKKKISKIDAQIK SVKKVTSKLEKDRKIYDKQKEIFVQDNQDDVPQIMKYVQYKSKEQQLLYAIQNLERKIEIAELAYKKANR ILQSSQQFQQK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 82 257 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8tek 2023-09-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2243 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2251 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 67.000 15.476 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MFKKLKQKISEEQQQLQQALAPAQASSNSSTPTRMRSRTSSFTEQLDEGTPNRENASTHASKSPDSVNGSEPSIPQSGDTQSFAQKLQLRVPSVESLFRSPIKESLFRSSSKESLVRTSSRESLNRLDLDSSTASFDPPSDMDSEAEDLVGNSDSLNKEQLIQRLRRMERSLSSYRGKYSELVTAYQMLQREKKKLQGILSQSQDKSLRRIAELREELQMDQQAKKHLQEEFDASLEEKDQYISVLQTQVSLLKQRLRNGPMNVDVLKPLPQLEPQAEVFTKEENPESDGEPVVEDGTSVKTLE-------TLQQRVKRQENLLKRCKETIQS-HKEQCTLLTSEKEALQEQLDERLQELEKIKDLHMAEKTKLITQLRDAKNLIEQLEQDKGMVIAETKRQMHETLEMKEEEIAQLRSRIKQMTTQGEELREQKEKSERAAFEELEKALSTAQKTEEARRKLKAEMDEQIKTIEKTSEEERISLQQELSRVKQEVVDVMKKSSEEQIAKLQKLHEKELARKEQELTKKLQTREREFQEQMKVALEKSQSEYLKISQEKEQQESLALEELELQKKAILTESENKLRDLQQEAETYRTRILELESSLEKSLQENKNQSKDLAVHLEAEKNKHNKEITVMVEKHKTELESLKHQQDALWTEKLQVLKQQYQTEMEKLREKCEQEKETLLKDKEIIFQAHIEEMNEKTLEKLDVKQTELESLSSELSEVLKARHKLEEELSVLKDQTDKMKQELEAKMDEQKNHHQQQVDSIIKEHEVSIQRTEKALKDQINQLELLLKERDKHLKEHQAHVENLEADIKRSEGELQQASAKLDVFQSYQSATHEQTKAYEEQLAQLQQKLLDLETERILLTKQVAEVEAQKKDVCTELDAHKIQVQDLMQQLEKQNSEMEQKVKSLTQVYESKLEDGNKEQEQTKQILVEKENMILQMREGQKKEIEILTQKLSAKEDSIHILNEEYETKFKNQEKKMEKVKQKAKEMQETLKKKLLDQEAKLKKELENTALELSQKEKQFNAKMLEMAQANSAGISDAVSRLETNQKEQIESLTEVHRRELNDVISIWEKKLNQQAEELQEIHEIQLQEKEQEVAELKQKILLFGCEKEEMNKEITWLKEEGVKQDTTLNELQEQLKQKSAHVNSLAQDETKLKAHLEKLEVDLNKSLKENTFLQEQLVELKMLAEEDKRKVSELTSKLKTTDEEFQSLKSSHEKSNKSLEDKSLEFKKLSEELAIQLDICCKKTEALLEAKTNELINISSSKTNAILSRISHCQHRTTKVKEALLIKTCTVSELEAQLRQLTEEQNTLNISFQQATHQLEEKENQIKSMKADIESLVTEKEALQKEGGNQQQAASEKESCITQLKKELSENINAVTLMKEELKEKKVEISSLSKQLTDLNVQLQNSISLSEKEAAISSLRKQYDEEKCELLDQVQDLSFKVDTLSKEKISALEQVDDWSNKFSEWKKKAQSRFTQHQNTVKELQIQLELKSKEAYEKDEQINLLKEELDQQNKRFDCLKGEMEDDKSKMEKKESNLETELKSQTARIMELEDHITQKTIEIESLNEVLKNYNQQKDIEHKELVQKLQHFQELGEEKDNRVKEAEEKILTLENQVYSMKAELETKKKELEHVNLSVKSKEEELKALEDRLESESAAKLAELKRKAEQKIAAIKKQLLSQMEEKEEQYKKGTESHLSELNTKLQEREREVHILEEKLKSVESSQSETLIVPRSAKNVAAYTEQEEADSQGCVQKTYEEKISVLQRNLTEKEKLLQRVGQEKEETVSSHFEMRCQYQERLIKLEHAEAKQHEDQSMIGHLQEELEEKNKKYSLIVAQHVEKEGGKNNIQAKQNLENVFDDVQKTLQEKELTCQILEQKIKELDSCLVRQKEVHRVEMEELTSKYEKLQALQQMDGRNKPTELLEENTEEKSKSHLVQPKLLSNMEAQHNDLEFKLAGAEREKQKLGKEIVRLQKDLRMLRKEHQQELEILKKEYDQEREEKIKQEQEDLELKHNSTLKQLMREFNTQLAQKEQELEMTIKETINKAQEVEAELLESHQEETNQLLKKIAEKDDDLKRTAKRYEEILDAREEEMTAKVRDLQTQLEELQKKYQQKLEQEENPGNDNTQLAQKTTLISDSKLKEQEFREQIHNLEDRLKKYEKNVYATTVGTPYKGGNLYHTDVSLFGEPTEFEYLRKVLFEYMMGRETKTMAKVITTVLKFPDDQTQKILEREDARLMSWLRSSS 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LTNEEKFEIAQQEQDALKKQIDDGRIKSDQILETLRAILEETDMAITEIRKDAFDFQREILVGGENSRTGKI--EAEKIIKFFEEKE-------RQ-----KDALIAKYSSKRTNLERQILKTNNQIQKKEEMGDDLKFIDFYQLQIENKKYVKEIDDKNKKLLALKIST----NRISQTLKDEKQNLKQELDK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8tek.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 334 334 ? A 148.419 238.684 337.824 1 1 I LEU 0.620 1 ATOM 2 C CA . LEU 334 334 ? A 149.676 237.853 337.901 1 1 I LEU 0.620 1 ATOM 3 C C . LEU 334 334 ? A 150.183 237.205 336.607 1 1 I LEU 0.620 1 ATOM 4 O O . LEU 334 334 ? A 150.938 236.246 336.641 1 1 I LEU 0.620 1 ATOM 5 C CB . LEU 334 334 ? A 149.478 236.757 338.989 1 1 I LEU 0.620 1 ATOM 6 C CG . LEU 334 334 ? A 149.777 237.202 340.437 1 1 I LEU 0.620 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 334 334 ? A 149.348 236.116 341.434 1 1 I LEU 0.620 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 334 334 ? A 151.272 237.486 340.635 1 1 I LEU 0.620 1 ATOM 9 N N . THR 335 335 ? A 149.792 237.681 335.415 1 1 I THR 0.590 1 ATOM 10 C CA . THR 335 335 ? A 150.136 237.071 334.133 1 1 I THR 0.590 1 ATOM 11 C C . THR 335 335 ? A 151.589 237.289 333.735 1 1 I THR 0.590 1 ATOM 12 O O . THR 335 335 ? A 152.206 236.414 333.141 1 1 I THR 0.590 1 ATOM 13 C CB . THR 335 335 ? A 149.184 237.574 333.070 1 1 I THR 0.590 1 ATOM 14 O OG1 . THR 335 335 ? A 149.114 238.998 333.149 1 1 I THR 0.590 1 ATOM 15 C CG2 . THR 335 335 ? A 147.761 237.061 333.375 1 1 I THR 0.590 1 ATOM 16 N N . SER 336 336 ? A 152.187 238.428 334.130 1 1 I SER 0.520 1 ATOM 17 C CA . SER 336 336 ? A 153.582 238.775 333.861 1 1 I SER 0.520 1 ATOM 18 C C . SER 336 336 ? A 154.614 237.771 334.370 1 1 I SER 0.520 1 ATOM 19 O O . SER 336 336 ? A 155.511 237.359 333.643 1 1 I SER 0.520 1 ATOM 20 C CB . SER 336 336 ? A 153.933 240.150 334.488 1 1 I SER 0.520 1 ATOM 21 O OG . SER 336 336 ? A 152.955 241.150 334.162 1 1 I SER 0.520 1 ATOM 22 N N . GLU 337 337 ? A 154.473 237.302 335.629 1 1 I GLU 0.540 1 ATOM 23 C CA . GLU 337 337 ? A 155.285 236.236 336.203 1 1 I GLU 0.540 1 ATOM 24 C C . GLU 337 337 ? A 155.070 234.881 335.527 1 1 I GLU 0.540 1 ATOM 25 O O . GLU 337 337 ? A 155.989 234.081 335.372 1 1 I GLU 0.540 1 ATOM 26 C CB . GLU 337 337 ? A 155.058 236.129 337.739 1 1 I GLU 0.540 1 ATOM 27 C CG . GLU 337 337 ? A 155.573 237.350 338.542 1 1 I GLU 0.540 1 ATOM 28 C CD . GLU 337 337 ? A 157.070 237.538 338.305 1 1 I GLU 0.540 1 ATOM 29 O OE1 . GLU 337 337 ? A 157.858 236.712 338.828 1 1 I GLU 0.540 1 ATOM 30 O OE2 . GLU 337 337 ? A 157.415 238.496 337.568 1 1 I GLU 0.540 1 ATOM 31 N N . LYS 338 338 ? A 153.827 234.583 335.079 1 1 I LYS 0.560 1 ATOM 32 C CA . LYS 338 338 ? A 153.476 233.311 334.455 1 1 I LYS 0.560 1 ATOM 33 C C . LYS 338 338 ? A 154.251 233.007 333.181 1 1 I LYS 0.560 1 ATOM 34 O O . LYS 338 338 ? A 154.718 231.884 332.988 1 1 I LYS 0.560 1 ATOM 35 C CB . LYS 338 338 ? A 151.960 233.214 334.141 1 1 I LYS 0.560 1 ATOM 36 C CG . LYS 338 338 ? A 151.081 233.095 335.393 1 1 I LYS 0.560 1 ATOM 37 C CD . LYS 338 338 ? A 149.578 233.075 335.067 1 1 I LYS 0.560 1 ATOM 38 C CE . LYS 338 338 ? A 148.691 233.002 336.312 1 1 I LYS 0.560 1 ATOM 39 N NZ . LYS 338 338 ? A 147.263 232.968 335.919 1 1 I LYS 0.560 1 ATOM 40 N N . GLU 339 339 ? A 154.415 234.021 332.303 1 1 I GLU 0.600 1 ATOM 41 C CA . GLU 339 339 ? A 155.206 233.925 331.086 1 1 I GLU 0.600 1 ATOM 42 C C . GLU 339 339 ? A 156.672 233.629 331.399 1 1 I GLU 0.600 1 ATOM 43 O O . GLU 339 339 ? A 157.271 232.713 330.834 1 1 I GLU 0.600 1 ATOM 44 C CB . GLU 339 339 ? A 155.034 235.208 330.227 1 1 I GLU 0.600 1 ATOM 45 C CG . GLU 339 339 ? A 153.603 235.358 329.641 1 1 I GLU 0.600 1 ATOM 46 C CD . GLU 339 339 ? A 153.386 236.598 328.764 1 1 I GLU 0.600 1 ATOM 47 O OE1 . GLU 339 339 ? A 154.290 237.466 328.681 1 1 I GLU 0.600 1 ATOM 48 O OE2 . GLU 339 339 ? A 152.273 236.683 328.180 1 1 I GLU 0.600 1 ATOM 49 N N . ALA 340 340 ? A 157.257 234.324 332.399 1 1 I ALA 0.750 1 ATOM 50 C CA . ALA 340 340 ? A 158.629 234.124 332.832 1 1 I ALA 0.750 1 ATOM 51 C C . ALA 340 340 ? A 158.907 232.715 333.371 1 1 I ALA 0.750 1 ATOM 52 O O . ALA 340 340 ? A 159.922 232.099 333.064 1 1 I ALA 0.750 1 ATOM 53 C CB . ALA 340 340 ? A 159.009 235.188 333.885 1 1 I ALA 0.750 1 ATOM 54 N N . LEU 341 341 ? A 157.997 232.139 334.185 1 1 I LEU 0.650 1 ATOM 55 C CA . LEU 341 341 ? A 158.171 230.816 334.778 1 1 I LEU 0.650 1 ATOM 56 C C . LEU 341 341 ? A 158.271 229.647 333.812 1 1 I LEU 0.650 1 ATOM 57 O O . LEU 341 341 ? A 159.030 228.710 334.049 1 1 I LEU 0.650 1 ATOM 58 C CB . LEU 341 341 ? A 157.087 230.489 335.821 1 1 I LEU 0.650 1 ATOM 59 C CG . LEU 341 341 ? A 157.134 231.379 337.074 1 1 I LEU 0.650 1 ATOM 60 C CD1 . LEU 341 341 ? A 155.894 231.103 337.929 1 1 I LEU 0.650 1 ATOM 61 C CD2 . LEU 341 341 ? A 158.419 231.198 337.898 1 1 I LEU 0.650 1 ATOM 62 N N . GLN 342 342 ? A 157.526 229.661 332.692 1 1 I GLN 0.690 1 ATOM 63 C CA . GLN 342 342 ? A 157.645 228.652 331.649 1 1 I GLN 0.690 1 ATOM 64 C C . GLN 342 342 ? A 159.049 228.646 331.033 1 1 I GLN 0.690 1 ATOM 65 O O . GLN 342 342 ? A 159.677 227.595 330.895 1 1 I GLN 0.690 1 ATOM 66 C CB . GLN 342 342 ? 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A 160.305 234.033 327.537 1 1 I GLU 0.710 1 ATOM 80 N N . GLN 344 344 ? A 161.688 229.306 332.610 1 1 I GLN 0.710 1 ATOM 81 C CA . GLN 344 344 ? A 162.579 228.826 333.642 1 1 I GLN 0.710 1 ATOM 82 C C . GLN 344 344 ? A 162.586 227.313 333.747 1 1 I GLN 0.710 1 ATOM 83 O O . GLN 344 344 ? A 163.414 226.750 334.467 1 1 I GLN 0.710 1 ATOM 84 C CB . GLN 344 344 ? A 162.218 229.419 335.032 1 1 I GLN 0.710 1 ATOM 85 C CG . GLN 344 344 ? A 162.373 230.952 335.114 1 1 I GLN 0.710 1 ATOM 86 C CD . GLN 344 344 ? A 163.821 231.331 334.820 1 1 I GLN 0.710 1 ATOM 87 O OE1 . GLN 344 344 ? A 164.744 230.798 335.451 1 1 I GLN 0.710 1 ATOM 88 N NE2 . GLN 344 344 ? A 164.027 232.230 333.831 1 1 I GLN 0.710 1 ATOM 89 N N . LEU 345 345 ? A 161.695 226.618 333.011 1 1 I LEU 0.690 1 ATOM 90 C CA . LEU 345 345 ? A 161.725 225.175 332.916 1 1 I LEU 0.690 1 ATOM 91 C C . LEU 345 345 ? A 162.215 224.744 331.569 1 1 I LEU 0.690 1 ATOM 92 O O . LEU 345 345 ? 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A 170.979 211.298 325.396 1 1 I ASP 0.480 1 ATOM 197 O O . ASP 357 357 ? A 170.160 211.196 326.304 1 1 I ASP 0.480 1 ATOM 198 C CB . ASP 357 357 ? A 173.093 209.842 325.761 1 1 I ASP 0.480 1 ATOM 199 C CG . ASP 357 357 ? A 173.225 209.240 324.383 1 1 I ASP 0.480 1 ATOM 200 O OD1 . ASP 357 357 ? A 172.159 208.918 323.809 1 1 I ASP 0.480 1 ATOM 201 O OD2 . ASP 357 357 ? A 174.386 209.083 323.921 1 1 I ASP 0.480 1 ATOM 202 N N . LEU 358 358 ? A 170.560 211.438 324.119 1 1 I LEU 0.330 1 ATOM 203 C CA . LEU 358 358 ? A 169.165 211.488 323.696 1 1 I LEU 0.330 1 ATOM 204 C C . LEU 358 358 ? A 168.369 210.242 324.047 1 1 I LEU 0.330 1 ATOM 205 O O . LEU 358 358 ? A 167.213 210.314 324.458 1 1 I LEU 0.330 1 ATOM 206 C CB . LEU 358 358 ? A 169.070 211.677 322.162 1 1 I LEU 0.330 1 ATOM 207 C CG . LEU 358 358 ? A 169.493 213.064 321.647 1 1 I LEU 0.330 1 ATOM 208 C CD1 . LEU 358 358 ? A 169.554 213.051 320.112 1 1 I LEU 0.330 1 ATOM 209 C CD2 . LEU 358 358 ? A 168.540 214.160 322.140 1 1 I LEU 0.330 1 ATOM 210 N N . HIS 359 359 ? A 168.968 209.050 323.875 1 1 I HIS 0.300 1 ATOM 211 C CA . HIS 359 359 ? A 168.291 207.793 324.137 1 1 I HIS 0.300 1 ATOM 212 C C . HIS 359 359 ? A 168.099 207.474 325.611 1 1 I HIS 0.300 1 ATOM 213 O O . HIS 359 359 ? A 167.069 206.935 326.006 1 1 I HIS 0.300 1 ATOM 214 C CB . HIS 359 359 ? A 168.985 206.608 323.432 1 1 I HIS 0.300 1 ATOM 215 C CG . HIS 359 359 ? A 169.184 206.855 321.965 1 1 I HIS 0.300 1 ATOM 216 N ND1 . HIS 359 359 ? A 170.282 207.595 321.596 1 1 I HIS 0.300 1 ATOM 217 C CD2 . HIS 359 359 ? A 168.455 206.530 320.864 1 1 I HIS 0.300 1 ATOM 218 C CE1 . HIS 359 359 ? A 170.218 207.713 320.297 1 1 I HIS 0.300 1 ATOM 219 N NE2 . HIS 359 359 ? A 169.129 207.085 319.793 1 1 I HIS 0.300 1 ATOM 220 N N . MET 360 360 ? A 169.095 207.786 326.466 1 1 I MET 0.320 1 ATOM 221 C CA . MET 360 360 ? A 169.056 207.405 327.869 1 1 I MET 0.320 1 ATOM 222 C C . MET 360 360 ? A 168.605 208.522 328.782 1 1 I MET 0.320 1 ATOM 223 O O . MET 360 360 ? A 168.160 208.279 329.893 1 1 I MET 0.320 1 ATOM 224 C CB . MET 360 360 ? A 170.469 206.971 328.358 1 1 I MET 0.320 1 ATOM 225 C CG . MET 360 360 ? A 170.926 205.615 327.793 1 1 I MET 0.320 1 ATOM 226 S SD . MET 360 360 ? A 169.772 204.242 328.123 1 1 I MET 0.320 1 ATOM 227 C CE . MET 360 360 ? A 169.926 204.214 329.934 1 1 I MET 0.320 1 ATOM 228 N N . ALA 361 361 ? A 168.769 209.782 328.335 1 1 I ALA 0.380 1 ATOM 229 C CA . ALA 361 361 ? A 168.730 210.967 329.161 1 1 I ALA 0.380 1 ATOM 230 C C . ALA 361 361 ? A 169.722 210.916 330.309 1 1 I ALA 0.380 1 ATOM 231 O O . ALA 361 361 ? A 169.508 211.518 331.349 1 1 I ALA 0.380 1 ATOM 232 C CB . ALA 361 361 ? A 167.306 211.463 329.503 1 1 I ALA 0.380 1 ATOM 233 N N . GLU 362 362 ? A 170.883 210.226 330.081 1 1 I GLU 0.350 1 ATOM 234 C CA . GLU 362 362 ? A 171.988 210.121 331.009 1 1 I GLU 0.350 1 ATOM 235 C C . GLU 362 362 ? A 173.358 210.280 330.397 1 1 I GLU 0.350 1 ATOM 236 O O . GLU 362 362 ? A 173.514 210.267 329.166 1 1 I GLU 0.350 1 ATOM 237 C CB . GLU 362 362 ? A 171.894 208.964 332.045 1 1 I GLU 0.350 1 ATOM 238 C CG . GLU 362 362 ? A 170.798 209.260 333.117 1 1 I GLU 0.350 1 ATOM 239 C CD . GLU 362 362 ? A 171.112 210.476 333.979 1 1 I GLU 0.350 1 ATOM 240 O OE1 . GLU 362 362 ? A 172.238 211.012 333.776 1 1 I GLU 0.350 1 ATOM 241 O OE2 . GLU 362 362 ? A 170.315 210.895 334.863 1 1 I GLU 0.350 1 ATOM 242 N N . LYS 363 363 ? A 174.405 210.527 331.208 1 1 I LYS 0.470 1 ATOM 243 C CA . LYS 363 363 ? A 175.799 210.536 330.767 1 1 I LYS 0.470 1 ATOM 244 C C . LYS 363 363 ? A 176.237 209.160 330.257 1 1 I LYS 0.470 1 ATOM 245 O O . LYS 363 363 ? A 176.181 208.183 330.997 1 1 I LYS 0.470 1 ATOM 246 C CB . LYS 363 363 ? A 176.782 210.927 331.906 1 1 I LYS 0.470 1 ATOM 247 C CG . LYS 363 363 ? A 176.717 212.398 332.350 1 1 I LYS 0.470 1 ATOM 248 C CD . LYS 363 363 ? A 177.716 212.713 333.483 1 1 I LYS 0.470 1 ATOM 249 C CE . LYS 363 363 ? A 177.686 214.177 333.940 1 1 I LYS 0.470 1 ATOM 250 N NZ . LYS 363 363 ? A 178.646 214.403 335.048 1 1 I LYS 0.470 1 ATOM 251 N N . THR 364 364 ? A 176.710 209.053 328.994 1 1 I THR 0.540 1 ATOM 252 C CA . THR 364 364 ? A 177.056 207.763 328.389 1 1 I THR 0.540 1 ATOM 253 C C . THR 364 364 ? A 178.477 207.728 327.837 1 1 I THR 0.540 1 ATOM 254 O O . THR 364 364 ? A 179.155 206.702 327.866 1 1 I THR 0.540 1 ATOM 255 C CB . THR 364 364 ? A 176.131 207.434 327.221 1 1 I THR 0.540 1 ATOM 256 O OG1 . THR 364 364 ? A 176.132 208.511 326.285 1 1 I THR 0.540 1 ATOM 257 C CG2 . THR 364 364 ? A 174.704 207.244 327.755 1 1 I THR 0.540 1 ATOM 258 N N . LYS 365 365 ? A 178.997 208.873 327.349 1 1 I LYS 0.630 1 ATOM 259 C CA . LYS 365 365 ? A 180.310 208.968 326.716 1 1 I LYS 0.630 1 ATOM 260 C C . LYS 365 365 ? A 181.470 208.574 327.621 1 1 I LYS 0.630 1 ATOM 261 O O . LYS 365 365 ? A 182.340 207.799 327.235 1 1 I LYS 0.630 1 ATOM 262 C CB . LYS 365 365 ? A 180.561 210.386 326.142 1 1 I LYS 0.630 1 ATOM 263 C CG . LYS 365 365 ? A 179.666 210.698 324.934 1 1 I LYS 0.630 1 ATOM 264 C CD . LYS 365 365 ? A 179.928 212.095 324.346 1 1 I LYS 0.630 1 ATOM 265 C CE . LYS 365 365 ? A 179.050 212.409 323.130 1 1 I LYS 0.630 1 ATOM 266 N NZ . LYS 365 365 ? A 179.311 213.791 322.666 1 1 I LYS 0.630 1 ATOM 267 N N . LEU 366 366 ? A 181.449 209.048 328.882 1 1 I LEU 0.700 1 ATOM 268 C CA . LEU 366 366 ? A 182.449 208.747 329.891 1 1 I LEU 0.700 1 ATOM 269 C C . LEU 366 366 ? A 182.451 207.279 330.305 1 1 I LEU 0.700 1 ATOM 270 O O . LEU 366 366 ? A 183.472 206.733 330.712 1 1 I LEU 0.700 1 ATOM 271 C CB . LEU 366 366 ? A 182.242 209.652 331.136 1 1 I LEU 0.700 1 ATOM 272 C CG . LEU 366 366 ? A 182.471 211.162 330.897 1 1 I LEU 0.700 1 ATOM 273 C CD1 . LEU 366 366 ? A 182.142 211.974 332.161 1 1 I LEU 0.700 1 ATOM 274 C CD2 . LEU 366 366 ? 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A 205.197 194.950 325.538 1 1 I ASP 0.610 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #