data_SMR-c14d4740af7b4275271c76d3c4c589b4_7 _entry.id SMR-c14d4740af7b4275271c76d3c4c589b4_7 _struct.entry_id SMR-c14d4740af7b4275271c76d3c4c589b4_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q13439 (isoform 3)/ GOGA4_HUMAN, Golgin subfamily A member 4 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q13439 (isoform 3)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 303144.790 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP GOGA4_HUMAN Q13439 1 ;MFKKLKQKISEEQQQLQQALAPAQASSNSSTPTRMRSRTSSFTEQLDEGTPNRENASTHASKSPDSVNGS EPSIPQSGDTQSFAQKLQLRVPSVESLFRSPIKESLFRSSSKESLVRTSSRESLNRLDLDSSTASFDPPS DMDSEAEDLVGNSDSLNKEQLIQRLRRMERSLSSYRGKYSELVTAYQMLQREKKKLQGILSQSQDKSLRR IAELREELQMDQQAKKHLQEEFDASLEEKDQYISVLQTQVSLLKQRLRNGPMNVDVLKPLPQLEPQAEVF TKEENPESDGEPVVEDGTSVKTLETLQQRVKRQENLLKRCKETIQSHKEQCTLLTSEKEALQEQLDERLQ ELEKIKDLHMAEKTKLITQLRDAKNLIEQLEQDKGMVIAETKRQMHETLEMKEEEIAQLRSRIKQMTTQG EELREQKEKSERAAFEELEKALSTAQKTEEARRKLKAEMDEQIKTIEKTSEEERISLQQELSRVKQEVVD VMKKSSEEQIAKLQKLHEKELARKEQELTKKLQTREREFQEQMKVALEKSQSEYLKISQEKEQQESLALE ELELQKKAILTESENKLRDLQQEAETYRTRILELESSLEKSLQENKNQSKDLAVHLEAEKNKHNKEITVM VEKHKTELESLKHQQDALWTEKLQVLKQQYQTEMEKLREKCEQEKETLLKDKEIIFQAHIEEMNEKTLEK LDVKQTELESLSSELSEVLKARHKLEEELSVLKDQTDKMKQELEAKMDEQKNHHQQQVDSIIKEHEVSIQ RTEKALKDQINQLELLLKERDKHLKEHQAHVENLEADIKRSEGELQQASAKLDVFQSYQSATHEQTKAYE EQLAQLQQKLLDLETERILLTKQVAEVEAQKKDVCTELDAHKIQVQDLMQQLEKQNSEMEQKVKSLTQVY ESKLEDGNKEQEQTKQILVEKENMILQMREGQKKEIEILTQKLSAKEDSIHILNEEYETKFKNQEKKMEK VKQKAKEMQETLKKKLLDQEAKLKKELENTALELSQKEKQFNAKMLEMAQANSAGISDAVSRLETNQKEQ IESLTEVHRRELNDVISIWEKKLNQQAEELQEIHEIQLQEKEQEVAELKQKILLFGCEKEEMNKEITWLK EEGVKQDTTLNELQEQLKQKSAHVNSLAQDETKLKAHLEKLEVDLNKSLKENTFLQEQLVELKMLAEEDK RKVSELTSKLKTTDEEFQSLKSSHEKSNKSLEDKSLEFKKLSEELAIQLDICCKKTEALLEAKTNELINI SSSKTNAILSRISHCQHRTTKVKEALLIKTCTVSELEAQLRQLTEEQNTLNISFQQATHQLEEKENQIKS MKADIESLVTEKEALQKEGGNQQQAASEKESCITQLKKELSENINAVTLMKEELKEKKVEISSLSKQLTD LNVQLQNSISLSEKEAAISSLRKQYDEEKCELLDQVQDLSFKVDTLSKEKISALEQVDDWSNKFSEWKKK AQSRFTQHQNTVKELQIQLELKSKEAYEKDEQINLLKEELDQQNKRFDCLKGEMEDDKSKMEKKESNLET ELKSQTARIMELEDHITQKTIEIESLNEVLKNYNQQKDIEHKELVQKLQHFQELGEEKDNRVKEAEEKIL TLENQVYSMKAELETKKKELEHVNLSVKSKEEELKALEDRLESESAAKLAELKRKAEQKIAAIKKQLLSQ MEEKEEQYKKGTESHLSELNTKLQEREREVHILEEKLKSVESSQSETLIVPRSAKNVAAYTEQEEADSQG CVQKTYEEKISVLQRNLTEKEKLLQRVGQEKEETVSSHFEMRCQYQERLIKLEHAEAKQHEDQSMIGHLQ EELEEKNKKYSLIVAQHVEKEGGKNNIQAKQNLENVFDDVQKTLQEKELTCQILEQKIKELDSCLVRQKE VHRVEMEELTSKYEKLQALQQMDGRNKPTELLEENTEEKSKSHLVQPKLLSNMEAQHNDLEFKLAGAERE KQKLGKEIVRLQKDLRMLRKEHQQELEILKKEYDQEREEKIKQEQEDLELKHNSTLKQLMREFNTQLAQK EQELEMTIKETINKAQEVEAELLESHQEETNQLLKKIAEKDDDLKRTAKRYEEILDAREEEMTAKVRDLQ TQLEELQKKYQQKLEQEENPGNDNTQLAQKTTLISDSKLKEQEFREQIHNLEDRLKKYEKNVYATTVGTP YKGGNLYHTDVSLFGEPTEFEYLRKVLFEYMMGRETKTMAKVITTVLKFPDDQTQKILEREDARLMSWLR SSS ; 'Golgin subfamily A member 4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2243 1 2243 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . GOGA4_HUMAN Q13439 Q13439-3 1 2243 9606 'Homo sapiens (Human)' 1996-11-01 EDD8BCB88E02B9A4 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MFKKLKQKISEEQQQLQQALAPAQASSNSSTPTRMRSRTSSFTEQLDEGTPNRENASTHASKSPDSVNGS EPSIPQSGDTQSFAQKLQLRVPSVESLFRSPIKESLFRSSSKESLVRTSSRESLNRLDLDSSTASFDPPS DMDSEAEDLVGNSDSLNKEQLIQRLRRMERSLSSYRGKYSELVTAYQMLQREKKKLQGILSQSQDKSLRR IAELREELQMDQQAKKHLQEEFDASLEEKDQYISVLQTQVSLLKQRLRNGPMNVDVLKPLPQLEPQAEVF TKEENPESDGEPVVEDGTSVKTLETLQQRVKRQENLLKRCKETIQSHKEQCTLLTSEKEALQEQLDERLQ ELEKIKDLHMAEKTKLITQLRDAKNLIEQLEQDKGMVIAETKRQMHETLEMKEEEIAQLRSRIKQMTTQG EELREQKEKSERAAFEELEKALSTAQKTEEARRKLKAEMDEQIKTIEKTSEEERISLQQELSRVKQEVVD VMKKSSEEQIAKLQKLHEKELARKEQELTKKLQTREREFQEQMKVALEKSQSEYLKISQEKEQQESLALE ELELQKKAILTESENKLRDLQQEAETYRTRILELESSLEKSLQENKNQSKDLAVHLEAEKNKHNKEITVM 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_entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 PHE . 1 3 LYS . 1 4 LYS . 1 5 LEU . 1 6 LYS . 1 7 GLN . 1 8 LYS . 1 9 ILE . 1 10 SER . 1 11 GLU . 1 12 GLU . 1 13 GLN . 1 14 GLN . 1 15 GLN . 1 16 LEU . 1 17 GLN . 1 18 GLN . 1 19 ALA . 1 20 LEU . 1 21 ALA . 1 22 PRO . 1 23 ALA . 1 24 GLN . 1 25 ALA . 1 26 SER . 1 27 SER . 1 28 ASN . 1 29 SER . 1 30 SER . 1 31 THR . 1 32 PRO . 1 33 THR . 1 34 ARG . 1 35 MET . 1 36 ARG . 1 37 SER . 1 38 ARG . 1 39 THR . 1 40 SER . 1 41 SER . 1 42 PHE . 1 43 THR . 1 44 GLU . 1 45 GLN . 1 46 LEU . 1 47 ASP . 1 48 GLU . 1 49 GLY . 1 50 THR . 1 51 PRO . 1 52 ASN . 1 53 ARG . 1 54 GLU . 1 55 ASN . 1 56 ALA . 1 57 SER . 1 58 THR . 1 59 HIS . 1 60 ALA . 1 61 SER . 1 62 LYS . 1 63 SER . 1 64 PRO . 1 65 ASP . 1 66 SER . 1 67 VAL . 1 68 ASN . 1 69 GLY . 1 70 SER . 1 71 GLU . 1 72 PRO . 1 73 SER . 1 74 ILE . 1 75 PRO . 1 76 GLN . 1 77 SER . 1 78 GLY . 1 79 ASP . 1 80 THR . 1 81 GLN . 1 82 SER . 1 83 PHE . 1 84 ALA . 1 85 GLN . 1 86 LYS . 1 87 LEU . 1 88 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A 1 2070 LYS 2070 ? ? ? D . A 1 2071 ASP 2071 ? ? ? D . A 1 2072 ASP 2072 ? ? ? D . A 1 2073 ASP 2073 ? ? ? D . A 1 2074 LEU 2074 ? ? ? D . A 1 2075 LYS 2075 ? ? ? D . A 1 2076 ARG 2076 ? ? ? D . A 1 2077 THR 2077 ? ? ? D . A 1 2078 ALA 2078 ? ? ? D . A 1 2079 LYS 2079 ? ? ? D . A 1 2080 ARG 2080 ? ? ? D . A 1 2081 TYR 2081 ? ? ? D . A 1 2082 GLU 2082 ? ? ? D . A 1 2083 GLU 2083 ? ? ? D . A 1 2084 ILE 2084 ? ? ? D . A 1 2085 LEU 2085 ? ? ? D . A 1 2086 ASP 2086 ? ? ? D . A 1 2087 ALA 2087 ? ? ? D . A 1 2088 ARG 2088 ? ? ? D . A 1 2089 GLU 2089 ? ? ? D . A 1 2090 GLU 2090 ? ? ? D . A 1 2091 GLU 2091 ? ? ? D . A 1 2092 MET 2092 ? ? ? D . A 1 2093 THR 2093 ? ? ? D . A 1 2094 ALA 2094 ? ? ? D . A 1 2095 LYS 2095 ? ? ? D . A 1 2096 VAL 2096 ? ? ? D . A 1 2097 ARG 2097 ? ? ? D . A 1 2098 ASP 2098 ? ? ? D . A 1 2099 LEU 2099 ? ? ? D . A 1 2100 GLN 2100 ? ? ? D . A 1 2101 THR 2101 ? ? ? D . A 1 2102 GLN 2102 ? ? ? D . A 1 2103 LEU 2103 ? ? ? D . A 1 2104 GLU 2104 ? ? ? D . A 1 2105 GLU 2105 ? ? ? D . A 1 2106 LEU 2106 ? ? ? D . A 1 2107 GLN 2107 ? ? ? D . A 1 2108 LYS 2108 ? ? ? D . A 1 2109 LYS 2109 ? ? ? D . A 1 2110 TYR 2110 ? ? ? D . A 1 2111 GLN 2111 ? ? ? D . A 1 2112 GLN 2112 ? ? ? D . A 1 2113 LYS 2113 ? ? ? D . A 1 2114 LEU 2114 ? ? ? D . A 1 2115 GLU 2115 ? ? ? D . A 1 2116 GLN 2116 ? ? ? D . A 1 2117 GLU 2117 ? ? ? D . A 1 2118 GLU 2118 ? ? ? D . A 1 2119 ASN 2119 ? ? ? D . A 1 2120 PRO 2120 ? ? ? D . A 1 2121 GLY 2121 ? ? ? D . A 1 2122 ASN 2122 ? ? ? D . A 1 2123 ASP 2123 ? ? ? D . A 1 2124 ASN 2124 ? ? ? D . A 1 2125 THR 2125 ? ? ? D . A 1 2126 GLN 2126 ? ? ? D . A 1 2127 LEU 2127 ? ? ? D . A 1 2128 ALA 2128 ? ? ? D . A 1 2129 GLN 2129 ? ? ? D . A 1 2130 LYS 2130 ? ? ? D . A 1 2131 THR 2131 ? ? ? D . A 1 2132 THR 2132 ? ? ? D . A 1 2133 LEU 2133 ? ? ? D . A 1 2134 ILE 2134 ? ? ? D . A 1 2135 SER 2135 ? ? ? D . A 1 2136 ASP 2136 ? ? ? D . A 1 2137 SER 2137 ? ? ? D . A 1 2138 LYS 2138 ? ? ? D . A 1 2139 LEU 2139 ? ? ? D . A 1 2140 LYS 2140 ? ? ? D . A 1 2141 GLU 2141 ? ? ? D . A 1 2142 GLN 2142 ? ? ? D . A 1 2143 GLU 2143 ? ? ? D . A 1 2144 PHE 2144 ? ? ? D . A 1 2145 ARG 2145 ? ? ? D . A 1 2146 GLU 2146 ? ? ? D . A 1 2147 GLN 2147 ? ? ? D . A 1 2148 ILE 2148 ? ? ? D . A 1 2149 HIS 2149 ? ? ? D . A 1 2150 ASN 2150 ? ? ? D . A 1 2151 LEU 2151 ? ? ? D . A 1 2152 GLU 2152 ? ? ? D . A 1 2153 ASP 2153 ? ? ? D . A 1 2154 ARG 2154 ? ? ? D . A 1 2155 LEU 2155 ? ? ? D . A 1 2156 LYS 2156 ? ? ? D . A 1 2157 LYS 2157 ? ? ? D . A 1 2158 TYR 2158 ? ? ? D . A 1 2159 GLU 2159 ? ? ? D . A 1 2160 LYS 2160 ? ? ? D . A 1 2161 ASN 2161 ? ? ? D . A 1 2162 VAL 2162 ? ? ? D . A 1 2163 TYR 2163 ? ? ? D . A 1 2164 ALA 2164 ? ? ? D . A 1 2165 THR 2165 ? ? ? D . A 1 2166 THR 2166 ? ? ? D . A 1 2167 VAL 2167 ? ? ? D . A 1 2168 GLY 2168 ? ? ? D . A 1 2169 THR 2169 ? ? ? D . A 1 2170 PRO 2170 ? ? ? D . A 1 2171 TYR 2171 ? ? ? D . A 1 2172 LYS 2172 ? ? ? D . A 1 2173 GLY 2173 ? ? ? D . A 1 2174 GLY 2174 ? ? ? D . A 1 2175 ASN 2175 ? ? ? D . A 1 2176 LEU 2176 ? ? ? D . A 1 2177 TYR 2177 ? ? ? D . A 1 2178 HIS 2178 ? ? ? D . A 1 2179 THR 2179 ? ? ? D . A 1 2180 ASP 2180 ? ? ? D . A 1 2181 VAL 2181 ? ? ? D . A 1 2182 SER 2182 ? ? ? D . A 1 2183 LEU 2183 ? ? ? D . A 1 2184 PHE 2184 ? ? ? D . A 1 2185 GLY 2185 ? ? ? D . A 1 2186 GLU 2186 ? ? ? D . A 1 2187 PRO 2187 ? ? ? D . A 1 2188 THR 2188 ? ? ? D . A 1 2189 GLU 2189 ? ? ? D . A 1 2190 PHE 2190 ? ? ? D . A 1 2191 GLU 2191 ? ? ? D . A 1 2192 TYR 2192 ? ? ? D . A 1 2193 LEU 2193 ? ? ? D . A 1 2194 ARG 2194 ? ? ? D . A 1 2195 LYS 2195 ? ? ? D . A 1 2196 VAL 2196 ? ? ? D . A 1 2197 LEU 2197 ? ? ? D . A 1 2198 PHE 2198 ? ? ? D . A 1 2199 GLU 2199 ? ? ? D . A 1 2200 TYR 2200 ? ? ? D . A 1 2201 MET 2201 ? ? ? D . A 1 2202 MET 2202 ? ? ? D . A 1 2203 GLY 2203 ? ? ? D . A 1 2204 ARG 2204 ? ? ? D . A 1 2205 GLU 2205 ? ? ? D . A 1 2206 THR 2206 ? ? ? D . A 1 2207 LYS 2207 ? ? ? D . A 1 2208 THR 2208 ? ? ? D . A 1 2209 MET 2209 ? ? ? D . A 1 2210 ALA 2210 ? ? ? D . A 1 2211 LYS 2211 ? ? ? D . A 1 2212 VAL 2212 ? ? ? D . A 1 2213 ILE 2213 ? ? ? D . A 1 2214 THR 2214 ? ? ? D . A 1 2215 THR 2215 ? ? ? D . A 1 2216 VAL 2216 ? ? ? D . A 1 2217 LEU 2217 ? ? ? D . A 1 2218 LYS 2218 ? ? ? D . A 1 2219 PHE 2219 ? ? ? D . A 1 2220 PRO 2220 ? ? ? D . A 1 2221 ASP 2221 ? ? ? D . A 1 2222 ASP 2222 ? ? ? D . A 1 2223 GLN 2223 ? ? ? D . A 1 2224 THR 2224 ? ? ? D . A 1 2225 GLN 2225 ? ? ? D . A 1 2226 LYS 2226 ? ? ? D . A 1 2227 ILE 2227 ? ? ? D . A 1 2228 LEU 2228 ? ? ? D . A 1 2229 GLU 2229 ? ? ? D . A 1 2230 ARG 2230 ? ? ? D . A 1 2231 GLU 2231 ? ? ? D . A 1 2232 ASP 2232 ? ? ? D . A 1 2233 ALA 2233 ? ? ? D . A 1 2234 ARG 2234 ? ? ? D . A 1 2235 LEU 2235 ? ? ? D . A 1 2236 MET 2236 ? ? ? D . A 1 2237 SER 2237 ? ? ? D . A 1 2238 TRP 2238 ? ? ? D . A 1 2239 LEU 2239 ? ? ? D . A 1 2240 ARG 2240 ? ? ? D . A 1 2241 SER 2241 ? ? ? D . A 1 2242 SER 2242 ? ? ? D . A 1 2243 SER 2243 ? ? ? D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Growth-arrest-specific microtubule-binding protein {PDB ID=8th8, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=8th8.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8th8, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 4 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSKAAKAKKNVPVVSKLEADARKAAEGVNDNESEEFKKAMRKEARALVEQFNEEKKLLAFYQQERQKINY NWIIAKKELEDKKSELINKEREIQDLQENHFMTLNVYKQKIKHLLFQNQDQQSELKKDVEVTLKQLEDQH RIKSRELKTDVRSLKVTKKEQEISQQDYLFALKSEHDKQMTLMRQDYERQVNDIKRKYDLKMQNLTKEME EARAAMIKQLEDNKNQKIAEIIKEHTQKYNDIKNYYSEITATNLDYRKTLKNEIKELQTKDEEYKKTLQQ TEKGYKELNEPLQALGIEIIQLKKQDEEQEAIIKEKEELKQKIDNQERLFRKLEYEYEVKLQQFQYLERE RNALYAKFNQTVFEIHQKSGLENLILEKKVTNLREDLEIKDLQIHQVLTAANIDPNSVGSINKSLEEVES LKNELISELQAQLKQIRKAHSHMVKAYEGKLSEFVIPVEELGFDPLVPTNTD ; ;MSKAAKAKKNVPVVSKLEADARKAAEGVNDNESEEFKKAMRKEARALVEQFNEEKKLLAFYQQERQKINY NWIIAKKELEDKKSELINKEREIQDLQENHFMTLNVYKQKIKHLLFQNQDQQSELKKDVEVTLKQLEDQH RIKSRELKTDVRSLKVTKKEQEISQQDYLFALKSEHDKQMTLMRQDYERQVNDIKRKYDLKMQNLTKEME EARAAMIKQLEDNKNQKIAEIIKEHTQKYNDIKNYYSEITATNLDYRKTLKNEIKELQTKDEEYKKTLQQ TEKGYKELNEPLQALGIEIIQLKKQDEEQEAIIKEKEELKQKIDNQERLFRKLEYEYEVKLQQFQYLERE RNALYAKFNQTVFEIHQKSGLENLILEKKVTNLREDLEIKDLQIHQVLTAANIDPNSVGSINKSLEEVES LKNELISELQAQLKQIRKAHSHMVKAYEGKLSEFVIPVEELGFDPLVPTNTD ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 217 388 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8th8 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2243 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2253 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 7.000 17.901 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MFKKLKQKISEEQQQLQQALAPAQASSNSSTPTRMRSRTSSFTEQLDEGTPNRENASTHASKSPDSVNGSEPSIPQSGDTQSFAQKLQLRVPSVESLFRSPIKESLFRSSSKESLVRTSSRESLNRLDLDSSTASFDPPSDMDSEAEDLVGNSDSLNKEQLIQRLRRMERSLSSYRGKYSELVTAYQMLQREKKKLQGILSQSQDKSLRRIAELREELQMDQQAKKHLQEEFDASLEEKDQYISVLQTQVSLLKQRLRNGPMNVDVLKPLPQLEPQAEVFTKEENPESDGEPVVEDGTSVKTLETLQQRVKRQENLLKRCKETIQSHKEQCTLLTSEKEALQEQLDERLQELEKIKDLHMAEKTKLITQLRDAKNLIEQLEQDKGMVIAETKRQMHETLEMKEEEIAQLRSRIKQMTTQGEELREQKEKSERAAFEELEKALSTAQKTEEARRKLKAEMDEQIKTIEKTSEEERISLQQELSRVKQEVVDVMKKSSEEQIAKLQKLHEKELARKEQELTKKLQTREREFQEQMKVALEKSQSEYLKISQEKEQQESLALEELELQKKAILTESENKLRDLQQEAETYRTRILELESSLEKSLQENKNQSKDLAVHLEAEKNKHNKEITVMVEKHKTELESLKHQQDALWTEKLQVLKQQYQTEMEKLREKCEQEKETLLKDKEIIFQAHIEEMNEKTLEKLDVKQTELESLSSELSEVLKARHKLEEELSVLKDQTDKMKQELEAKMDEQKNHHQQQVDSIIKEHEVSIQRTEKALKDQ-------INQLELLLKERDKHLKEHQAHVENLEADIKRSEGELQQASAKLDVFQSY---QSATHEQTKAYEEQLAQLQQKLLDLETERILLTKQVAEVEAQKKDVCTELDAHKIQVQDLMQQLEKQNSEMEQKVKSLTQVYESKLEDGNKEQEQTKQILVEKENMILQMREGQKKEIEILTQKLSAKEDSIHILNEEYETKFKNQEKKMEKVKQKAKEMQETLKKKLLDQEAKLKKELENTALELSQKEKQFNAKMLEMAQANSAGISDAVSRLETNQKEQIESLTEVHRRELNDVISIWEKKLNQQAEELQEIHEIQLQEKEQEVAELKQKILLFGCEKEEMNKEITWLKEEGVKQDTTLNELQEQLKQKSAHVNSLAQDETKLKAHLEKLEVDLNKSLKENTFLQEQLVELKMLAEEDKRKVSELTSKLKTTDEEFQSLKSSHEKSNKSLEDKSLEFKKLSEELAIQLDICCKKTEALLEAKTNELINISSSKTNAILSRISHCQHRTTKVKEALLIKTCTVSELEAQLRQLTEEQNTLNISFQQATHQLEEKENQIKSMKADIESLVTEKEALQKEGGNQQQAASEKESCITQLKKELSENINAVTLMKEELKEKKVEISSLSKQLTDLNVQLQNSISLSEKEAAISSLRKQYDEEKCELLDQVQDLSFKVDTLSKEKISALEQVDDWSNKFSEWKKKAQSRFTQHQNTVKELQIQLELKSKEAYEKDEQINLLKEELDQQNKRFDCLKGEMEDDKSKMEKKESNLETELKSQTARIMELEDHITQKTIEIESLNEVLKNYNQQKDIEHKELVQKLQHFQELGEEKDNRVKEAEEKILTLENQVYSMKAELETKKKELEHVNLSVKSKEEELKALEDRLESESAAKLAELKRKAEQKIAAIKKQLLSQMEEKEEQYKKGTESHLSELNTKLQEREREVHILEEKLKSVESSQSETLIVPRSAKNVAAYTEQEEADSQGCVQKTYEEKISVLQRNLTEKEKLLQRVGQEKEETVSSHFEMRCQYQERLIKLEHAEAKQHEDQSMIGHLQEELEEKNKKYSLIVAQHVEKEGGKNNIQAKQNLENVFDDVQKTLQEKELTCQILEQKIKELDSCLVRQKEVHRVEMEELTSKYEKLQALQQMDGRNKPTELLEENTEEKSKSHLVQPKLLSNMEAQHNDLEFKLAGAEREKQKLGKEIVRLQKDLRMLRKEHQQELEILKKEYDQEREEKIKQEQEDLELKHNSTLKQLMREFNTQLAQKEQELEMTIKETINKAQEVEAELLESHQEETNQLLKKIAEKDDDLKRTAKRYEEILDAREEEMTAKVRDLQTQLEELQKKYQQKLEQEENPGNDNTQLAQKTTLISDSKLKEQEFREQIHNLEDRLKKYEKNVYATTVGTPYKGGNLYHTDVSLFGEPTEFEYLRKVLFEYMMGRETKTMAKVITTVLKFPDDQTQKILEREDARLMSWLRSSS 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IKQLEDNKNQKIAEIIKEHTQKYNDIKNYYSEITATNLDYRKTLKNEIKELQTKDEEYKKTLQQTEKGYKELNEPLQALGIEIIQLKKQDEEQEAIIKEKEELKQKIDNQERLFRKLEYEYEVKLQQFQYLERERNALYAKF---NQTVFEIHQKSGLENLILEKKVTNLREDLE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8th8.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . MET 747 747 ? A 309.153 191.350 255.834 1 1 D MET 0.330 1 ATOM 2 C CA . MET 747 747 ? A 310.450 191.610 255.117 1 1 D MET 0.330 1 ATOM 3 C C . MET 747 747 ? A 311.452 192.394 255.943 1 1 D MET 0.330 1 ATOM 4 O O . MET 747 747 ? A 312.539 191.895 256.181 1 1 D MET 0.330 1 ATOM 5 C CB . MET 747 747 ? A 310.175 192.283 253.755 1 1 D MET 0.330 1 ATOM 6 C CG . MET 747 747 ? A 309.413 191.384 252.757 1 1 D MET 0.330 1 ATOM 7 S SD . MET 747 747 ? A 308.904 192.238 251.235 1 1 D MET 0.330 1 ATOM 8 C CE . MET 747 747 ? A 310.557 192.447 250.510 1 1 D MET 0.330 1 ATOM 9 N N . ASP 748 748 ? A 311.088 193.589 256.469 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 10 C CA . ASP 748 748 ? A 311.952 194.410 257.304 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 11 C C . ASP 748 748 ? A 312.433 193.736 258.577 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 12 O O . ASP 748 748 ? A 313.600 193.824 258.929 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 13 C CB . ASP 748 748 ? A 311.224 195.736 257.626 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 14 C CG . ASP 748 748 ? A 311.038 196.519 256.335 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 15 O OD1 . ASP 748 748 ? A 311.682 196.151 255.318 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 16 O OD2 . ASP 748 748 ? A 310.203 197.448 256.349 1 1 D ASP 0.390 1 ATOM 17 N N . GLU 749 749 ? A 311.557 192.976 259.269 1 1 D GLU 0.450 1 ATOM 18 C CA . GLU 749 749 ? A 311.945 192.223 260.449 1 1 D GLU 0.450 1 ATOM 19 C C . GLU 749 749 ? A 313.048 191.192 260.217 1 1 D GLU 0.450 1 ATOM 20 O O . GLU 749 749 ? A 314.063 191.175 260.907 1 1 D GLU 0.450 1 ATOM 21 C CB . GLU 749 749 ? A 310.721 191.485 261.007 1 1 D GLU 0.450 1 ATOM 22 C CG . GLU 749 749 ? A 311.019 190.686 262.295 1 1 D GLU 0.450 1 ATOM 23 C CD . GLU 749 749 ? A 309.769 189.978 262.800 1 1 D GLU 0.450 1 ATOM 24 O OE1 . GLU 749 749 ? A 308.717 190.087 262.117 1 1 D GLU 0.450 1 ATOM 25 O OE2 . GLU 749 749 ? A 309.880 189.305 263.852 1 1 D GLU 0.450 1 ATOM 26 N N . GLN 750 750 ? A 312.892 190.348 259.166 1 1 D GLN 0.510 1 ATOM 27 C CA . GLN 750 750 ? A 313.909 189.410 258.728 1 1 D GLN 0.510 1 ATOM 28 C C . GLN 750 750 ? A 315.156 190.131 258.253 1 1 D GLN 0.510 1 ATOM 29 O O . GLN 750 750 ? A 316.254 189.820 258.677 1 1 D GLN 0.510 1 ATOM 30 C CB . GLN 750 750 ? A 313.353 188.435 257.658 1 1 D GLN 0.510 1 ATOM 31 C CG . GLN 750 750 ? A 312.271 187.491 258.245 1 1 D GLN 0.510 1 ATOM 32 C CD . GLN 750 750 ? A 311.670 186.577 257.173 1 1 D GLN 0.510 1 ATOM 33 O OE1 . GLN 750 750 ? A 311.551 186.952 256.015 1 1 D GLN 0.510 1 ATOM 34 N NE2 . GLN 750 750 ? A 311.229 185.361 257.588 1 1 D GLN 0.510 1 ATOM 35 N N . LYS 751 751 ? A 315.012 191.209 257.450 1 1 D LYS 0.520 1 ATOM 36 C CA . LYS 751 751 ? A 316.147 191.997 257.022 1 1 D LYS 0.520 1 ATOM 37 C C . LYS 751 751 ? A 316.961 192.575 258.176 1 1 D LYS 0.520 1 ATOM 38 O O . LYS 751 751 ? A 318.182 192.488 258.172 1 1 D LYS 0.520 1 ATOM 39 C CB . LYS 751 751 ? A 315.673 193.148 256.114 1 1 D LYS 0.520 1 ATOM 40 C CG . LYS 751 751 ? A 316.832 193.979 255.555 1 1 D LYS 0.520 1 ATOM 41 C CD . LYS 751 751 ? A 316.344 195.072 254.605 1 1 D LYS 0.520 1 ATOM 42 C CE . LYS 751 751 ? A 317.498 195.917 254.074 1 1 D LYS 0.520 1 ATOM 43 N NZ . LYS 751 751 ? A 316.962 196.950 253.169 1 1 D LYS 0.520 1 ATOM 44 N N . ASN 752 752 ? A 316.300 193.127 259.217 1 1 D ASN 0.560 1 ATOM 45 C CA . ASN 752 752 ? A 316.957 193.605 260.424 1 1 D ASN 0.560 1 ATOM 46 C C . ASN 752 752 ? A 317.680 192.517 261.205 1 1 D ASN 0.560 1 ATOM 47 O O . ASN 752 752 ? A 318.815 192.715 261.624 1 1 D ASN 0.560 1 ATOM 48 C CB . ASN 752 752 ? A 315.950 194.282 261.385 1 1 D ASN 0.560 1 ATOM 49 C CG . ASN 752 752 ? A 315.507 195.617 260.801 1 1 D ASN 0.560 1 ATOM 50 O OD1 . ASN 752 752 ? A 316.148 196.204 259.945 1 1 D ASN 0.560 1 ATOM 51 N ND2 . ASN 752 752 ? A 314.371 196.142 261.327 1 1 D ASN 0.560 1 ATOM 52 N N . HIS 753 753 ? A 317.050 191.334 261.392 1 1 D HIS 0.510 1 ATOM 53 C CA . HIS 753 753 ? A 317.663 190.189 262.051 1 1 D HIS 0.510 1 ATOM 54 C C . HIS 753 753 ? A 318.903 189.686 261.335 1 1 D HIS 0.510 1 ATOM 55 O O . HIS 753 753 ? A 319.968 189.527 261.919 1 1 D HIS 0.510 1 ATOM 56 C CB . HIS 753 753 ? A 316.669 189.002 262.085 1 1 D HIS 0.510 1 ATOM 57 C CG . HIS 753 753 ? A 317.206 187.758 262.709 1 1 D HIS 0.510 1 ATOM 58 N ND1 . HIS 753 753 ? A 317.365 187.725 264.079 1 1 D HIS 0.510 1 ATOM 59 C CD2 . HIS 753 753 ? A 317.616 186.594 262.158 1 1 D HIS 0.510 1 ATOM 60 C CE1 . HIS 753 753 ? A 317.864 186.545 264.334 1 1 D HIS 0.510 1 ATOM 61 N NE2 . HIS 753 753 ? A 318.040 185.804 263.207 1 1 D HIS 0.510 1 ATOM 62 N N . HIS 754 754 ? A 318.803 189.465 260.010 1 1 D HIS 0.530 1 ATOM 63 C CA . HIS 754 754 ? A 319.926 189.032 259.211 1 1 D HIS 0.530 1 ATOM 64 C C . HIS 754 754 ? A 321.009 190.095 259.057 1 1 D HIS 0.530 1 ATOM 65 O O . HIS 754 754 ? A 322.189 189.774 259.078 1 1 D HIS 0.530 1 ATOM 66 C CB . HIS 754 754 ? A 319.487 188.421 257.866 1 1 D HIS 0.530 1 ATOM 67 C CG . HIS 754 754 ? A 318.730 187.133 258.048 1 1 D HIS 0.530 1 ATOM 68 N ND1 . HIS 754 754 ? A 317.382 187.163 258.357 1 1 D HIS 0.530 1 ATOM 69 C CD2 . HIS 754 754 ? A 319.151 185.850 257.962 1 1 D HIS 0.530 1 ATOM 70 C CE1 . HIS 754 754 ? A 317.018 185.912 258.447 1 1 D HIS 0.530 1 ATOM 71 N NE2 . HIS 754 754 ? A 318.048 185.058 258.217 1 1 D HIS 0.530 1 ATOM 72 N N . GLN 755 755 ? A 320.662 191.399 258.954 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 73 C CA . GLN 755 755 ? A 321.635 192.487 258.949 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 74 C C . GLN 755 755 ? A 322.446 192.555 260.242 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 75 O O . GLN 755 755 ? A 323.665 192.686 260.218 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 76 C CB . GLN 755 755 ? A 320.962 193.860 258.679 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 77 C CG . GLN 755 755 ? A 321.941 195.058 258.525 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 78 C CD . GLN 755 755 ? A 322.857 194.890 257.308 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 79 O OE1 . GLN 755 755 ? A 322.426 194.418 256.258 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 80 N NE2 . GLN 755 755 ? A 324.143 195.297 257.434 1 1 D GLN 0.630 1 ATOM 81 N N . GLN 756 756 ? A 321.790 192.379 261.416 1 1 D GLN 0.620 1 ATOM 82 C CA . GLN 756 756 ? A 322.459 192.271 262.705 1 1 D GLN 0.620 1 ATOM 83 C C . GLN 756 756 ? A 323.430 191.114 262.769 1 1 D GLN 0.620 1 ATOM 84 O O . GLN 756 756 ? A 324.532 191.252 263.294 1 1 D GLN 0.620 1 ATOM 85 C CB . GLN 756 756 ? A 321.454 192.033 263.854 1 1 D GLN 0.620 1 ATOM 86 C CG . GLN 756 756 ? A 320.645 193.279 264.253 1 1 D GLN 0.620 1 ATOM 87 C CD . GLN 756 756 ? A 319.644 192.914 265.349 1 1 D GLN 0.620 1 ATOM 88 O OE1 . GLN 756 756 ? A 319.514 191.781 265.783 1 1 D GLN 0.620 1 ATOM 89 N NE2 . GLN 756 756 ? A 318.911 193.945 265.840 1 1 D GLN 0.620 1 ATOM 90 N N . GLN 757 757 ? A 323.028 189.951 262.210 1 1 D GLN 0.650 1 ATOM 91 C CA . GLN 757 757 ? A 323.893 188.805 262.034 1 1 D GLN 0.650 1 ATOM 92 C C . GLN 757 757 ? 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A 341.954 187.192 265.859 1 1 D SER 0.610 1 ATOM 184 C CB . SER 768 768 ? A 338.889 186.368 265.721 1 1 D SER 0.610 1 ATOM 185 O OG . SER 768 768 ? A 337.944 185.897 266.680 1 1 D SER 0.610 1 ATOM 186 N N . ILE 769 769 ? A 340.871 188.344 264.238 1 1 D ILE 0.540 1 ATOM 187 C CA . ILE 769 769 ? A 342.038 188.674 263.424 1 1 D ILE 0.540 1 ATOM 188 C C . ILE 769 769 ? A 342.988 189.575 264.200 1 1 D ILE 0.540 1 ATOM 189 O O . ILE 769 769 ? A 344.145 189.226 264.387 1 1 D ILE 0.540 1 ATOM 190 C CB . ILE 769 769 ? A 341.629 189.302 262.084 1 1 D ILE 0.540 1 ATOM 191 C CG1 . ILE 769 769 ? A 340.901 188.254 261.202 1 1 D ILE 0.540 1 ATOM 192 C CG2 . ILE 769 769 ? A 342.844 189.892 261.327 1 1 D ILE 0.540 1 ATOM 193 C CD1 . ILE 769 769 ? A 340.188 188.871 259.990 1 1 D ILE 0.540 1 ATOM 194 N N . GLN 770 770 ? A 342.474 190.681 264.797 1 1 D GLN 0.490 1 ATOM 195 C CA . GLN 770 770 ? A 343.265 191.629 265.570 1 1 D GLN 0.490 1 ATOM 196 C C . GLN 770 770 ? A 343.982 191.020 266.763 1 1 D GLN 0.490 1 ATOM 197 O O . GLN 770 770 ? A 345.132 191.340 267.048 1 1 D GLN 0.490 1 ATOM 198 C CB . GLN 770 770 ? A 342.382 192.778 266.110 1 1 D GLN 0.490 1 ATOM 199 C CG . GLN 770 770 ? A 341.889 193.723 264.999 1 1 D GLN 0.490 1 ATOM 200 C CD . GLN 770 770 ? A 340.950 194.784 265.561 1 1 D GLN 0.490 1 ATOM 201 O OE1 . GLN 770 770 ? A 340.838 195.000 266.767 1 1 D GLN 0.490 1 ATOM 202 N NE2 . GLN 770 770 ? A 340.229 195.474 264.648 1 1 D GLN 0.490 1 ATOM 203 N N . ARG 771 771 ? A 343.311 190.112 267.499 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 204 C CA . ARG 771 771 ? A 343.909 189.371 268.592 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 205 C C . ARG 771 771 ? A 345.048 188.450 268.180 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 206 O O . ARG 771 771 ? A 346.061 188.376 268.858 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 207 C CB . ARG 771 771 ? A 342.853 188.480 269.294 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 208 C CG . ARG 771 771 ? A 343.412 187.707 270.515 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 209 C CD . ARG 771 771 ? A 342.420 186.773 271.215 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 210 N NE . ARG 771 771 ? A 342.029 185.687 270.246 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 211 C CZ . ARG 771 771 ? A 342.741 184.578 269.987 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 212 N NH1 . ARG 771 771 ? A 343.905 184.337 270.578 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 213 N NH2 . ARG 771 771 ? A 342.290 183.701 269.091 1 1 D ARG 0.400 1 ATOM 214 N N . THR 772 772 ? A 344.872 187.689 267.077 1 1 D THR 0.410 1 ATOM 215 C CA . THR 772 772 ? A 345.906 186.812 266.525 1 1 D THR 0.410 1 ATOM 216 C C . THR 772 772 ? A 347.096 187.556 265.937 1 1 D THR 0.410 1 ATOM 217 O O . THR 772 772 ? A 348.234 187.142 266.110 1 1 D THR 0.410 1 ATOM 218 C CB . THR 772 772 ? A 345.374 185.863 265.458 1 1 D THR 0.410 1 ATOM 219 O OG1 . THR 772 772 ? A 344.409 184.976 266.006 1 1 D THR 0.410 1 ATOM 220 C CG2 . THR 772 772 ? A 346.462 184.950 264.866 1 1 D THR 0.410 1 ATOM 221 N N . GLU 773 773 ? A 346.857 188.664 265.197 1 1 D GLU 0.360 1 ATOM 222 C CA . GLU 773 773 ? 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A 348.320 192.864 269.971 1 1 D LYS 0.340 1 ATOM 236 C CD . LYS 774 774 ? A 347.284 193.535 270.881 1 1 D LYS 0.340 1 ATOM 237 C CE . LYS 774 774 ? A 347.927 194.360 271.996 1 1 D LYS 0.340 1 ATOM 238 N NZ . LYS 774 774 ? A 346.875 194.980 272.827 1 1 D LYS 0.340 1 ATOM 239 N N . ALA 775 775 ? A 350.850 190.571 268.712 1 1 D ALA 0.290 1 ATOM 240 C CA . ALA 775 775 ? A 351.792 189.680 269.322 1 1 D ALA 0.290 1 ATOM 241 C C . ALA 775 775 ? A 352.978 190.504 269.763 1 1 D ALA 0.290 1 ATOM 242 O O . ALA 775 775 ? A 352.973 191.734 269.697 1 1 D ALA 0.290 1 ATOM 243 C CB . ALA 775 775 ? A 352.199 188.554 268.341 1 1 D ALA 0.290 1 ATOM 244 N N . LEU 776 776 ? A 354.008 189.822 270.277 1 1 D LEU 0.170 1 ATOM 245 C CA . LEU 776 776 ? A 355.213 190.420 270.795 1 1 D LEU 0.170 1 ATOM 246 C C . LEU 776 776 ? A 356.385 189.876 270.016 1 1 D LEU 0.170 1 ATOM 247 O O . LEU 776 776 ? A 356.242 189.020 269.146 1 1 D LEU 0.170 1 ATOM 248 C CB . LEU 776 776 ? A 355.403 190.126 272.304 1 1 D LEU 0.170 1 ATOM 249 C CG . LEU 776 776 ? A 354.251 190.637 273.190 1 1 D LEU 0.170 1 ATOM 250 C CD1 . LEU 776 776 ? A 354.461 190.139 274.628 1 1 D LEU 0.170 1 ATOM 251 C CD2 . LEU 776 776 ? A 354.116 192.170 273.145 1 1 D LEU 0.170 1 ATOM 252 N N . LYS 777 777 ? A 357.576 190.418 270.302 1 1 D LYS 0.210 1 ATOM 253 C CA . LYS 777 777 ? A 358.820 190.073 269.655 1 1 D LYS 0.210 1 ATOM 254 C C . LYS 777 777 ? A 359.689 189.247 270.564 1 1 D LYS 0.210 1 ATOM 255 O O . LYS 777 777 ? A 359.480 189.205 271.780 1 1 D LYS 0.210 1 ATOM 256 C CB . LYS 777 777 ? A 359.612 191.342 269.270 1 1 D LYS 0.210 1 ATOM 257 C CG . LYS 777 777 ? A 358.848 192.195 268.255 1 1 D LYS 0.210 1 ATOM 258 C CD . LYS 777 777 ? A 359.657 193.416 267.812 1 1 D LYS 0.210 1 ATOM 259 C CE . LYS 777 777 ? A 358.918 194.261 266.775 1 1 D LYS 0.210 1 ATOM 260 N NZ . LYS 777 777 ? A 359.742 195.430 266.406 1 1 D LYS 0.210 1 ATOM 261 N N . ASP 778 778 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.511 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 747 MET 1 0.330 2 1 A 748 ASP 1 0.390 3 1 A 749 GLU 1 0.450 4 1 A 750 GLN 1 0.510 5 1 A 751 LYS 1 0.520 6 1 A 752 ASN 1 0.560 7 1 A 753 HIS 1 0.510 8 1 A 754 HIS 1 0.530 9 1 A 755 GLN 1 0.630 10 1 A 756 GLN 1 0.620 11 1 A 757 GLN 1 0.650 12 1 A 758 VAL 1 0.700 13 1 A 759 ASP 1 0.660 14 1 A 760 SER 1 0.660 15 1 A 761 ILE 1 0.610 16 1 A 762 ILE 1 0.600 17 1 A 763 LYS 1 0.600 18 1 A 764 GLU 1 0.590 19 1 A 765 HIS 1 0.520 20 1 A 766 GLU 1 0.550 21 1 A 767 VAL 1 0.570 22 1 A 768 SER 1 0.610 23 1 A 769 ILE 1 0.540 24 1 A 770 GLN 1 0.490 25 1 A 771 ARG 1 0.400 26 1 A 772 THR 1 0.410 27 1 A 773 GLU 1 0.360 28 1 A 774 LYS 1 0.340 29 1 A 775 ALA 1 0.290 30 1 A 776 LEU 1 0.170 31 1 A 777 LYS 1 0.210 32 1 A 778 ASP 1 0.240 33 1 A 779 GLN 1 0.320 34 1 A 780 ILE 1 0.460 35 1 A 781 ASN 1 0.470 36 1 A 782 GLN 1 0.480 37 1 A 783 LEU 1 0.490 38 1 A 784 GLU 1 0.520 39 1 A 785 LEU 1 0.550 40 1 A 786 LEU 1 0.550 41 1 A 787 LEU 1 0.570 42 1 A 788 LYS 1 0.620 43 1 A 789 GLU 1 0.600 44 1 A 790 ARG 1 0.540 45 1 A 791 ASP 1 0.610 46 1 A 792 LYS 1 0.630 47 1 A 793 HIS 1 0.540 48 1 A 794 LEU 1 0.600 49 1 A 795 LYS 1 0.630 50 1 A 796 GLU 1 0.630 51 1 A 797 HIS 1 0.590 52 1 A 798 GLN 1 0.630 53 1 A 799 ALA 1 0.690 54 1 A 800 HIS 1 0.580 55 1 A 801 VAL 1 0.660 56 1 A 802 GLU 1 0.620 57 1 A 803 ASN 1 0.620 58 1 A 804 LEU 1 0.570 59 1 A 805 GLU 1 0.550 60 1 A 806 ALA 1 0.620 61 1 A 807 ASP 1 0.480 62 1 A 808 ILE 1 0.450 63 1 A 809 LYS 1 0.470 64 1 A 810 ARG 1 0.380 65 1 A 811 SER 1 0.400 66 1 A 812 GLU 1 0.360 67 1 A 813 GLY 1 0.390 68 1 A 814 GLU 1 0.310 69 1 A 815 LEU 1 0.270 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #