data_SMR-edfba432030db6d5009d64c0386de18b_1 _entry.id SMR-edfba432030db6d5009d64c0386de18b_1 _struct.entry_id SMR-edfba432030db6d5009d64c0386de18b_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9H2D6 (isoform 2)/ TARA_HUMAN, TRIO and F-actin-binding protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9H2D6 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 291905.059 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP TARA_HUMAN Q9H2D6 1 ;MEEVPGDALCEHFEANILTQNRCQNCFHPEEAHGARYQELRSPSGAEVPYCDLPRCPPAPEDPLSASTSG CQSVVDPGLRPGPKRGPSPSAGLPEEGPTAAPRSRSRELEAVPYLEGLTTSLCGSCNEDPGSDPTSSPDS ATPDDTSNSSSVDWDTVERQEEEAPSWDELAVMIPRRPREGPRADSSQRAPSLLTRSPVGGDAAGQKKED TGGGGRSAGQHWARLRGESGLSLERHRSTLTQASSMTPHSGPRSTTSQASPAQRDTAQAASTREIPRASS PHRITQRDTSRASSTQQEISRASSTQQETSRASSTQEDTPRASSTQEDTPRASSTQWNTPRASSPSRSTQ LDNPRTSSTQQDNPQTSFPTCTPQRENPRTPCVQQDDPRASSPNRTTQRENSRTSCAQRDNPKASRTSSP NRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRAS SPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRAARDNPTTSCAQRDNPR ASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQ RDNPRASSPNRTTQQDSPRTSCARRDDPRASSPNRTIQQENPRTSCALRDNPRASSPSRTIQQENPRTSC AQRDDPRASSPNRTTQQENPRTSCARRDNPRASSRNRTIQRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTIQQENLRT SCTRQDNPRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNLRASSPIRATQQDNPRTCIQQNIPRSSSTQQDNPKTSCTK RDNLRPTCTQRDRTQSFSFQRDNPGTSSSQCCTQKENLRPSSPHRSTQWNNPRNSSPHRTNKDIPWASFP LRPTQSDGPRTSSPSRSKQSEVPWASIALRPTQGDRPQTSSPSRPAQHDPPQSSFGPTQYNLPSRATSSS HNPGHQSTSRTSSPVYPAAYGAPLTSPEPSQPPCAVCIGHRDAPRASSPPRYLQHDPFPFFPEPRAPESE PPHHEPPYIPPAVCIGHRDAPRASSPPRHTQFDPFPFLPDTSDAEHQCQSPQHEPLQLPAPVCIGYRDAP RASSPPRQAPEPSLLFQDLPRASTESLVPSMDSLHECPHIPTPVCIGHRDAPSFSSPPRQAPEPSLFFQD PPGTSMESLAPSTDSLHGSPVLIPQVCIGHRDAPRASSPPRHPPSDLAFLAPSPSPGSSGGSRGSAPPGE TRHNLEREEYTVLADLPPPRRLAQRQPGPQAQCSSGGRTHSPGRAEVERLFGQERRTMLPAKQAELTRRS QAEPPHPWSPEKRPEGDRQLQGSPLPPRTSARTPERELRTQRPLESGQAGPRQPLGVWQSQEEPPGSQGP HRHLERSWSSQEGGLGPGGWWGCGEPSLGAAKAPEGAWGGTSREYKESWGQPEAWEEKPTHELPRELGKR SPLTSPPENWGGPAESSQSWHSGTPTAVGWGAEGACPYPRGSERRPELDWRDLLGLLRAPGEGVWARVPS LDWEGLLELLQARLPRKDPAGHRDDLARALGPELGPPGTNDVPEQESHSQPEGWAEATPVNGHSPALQSQ SPVQLPSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAGLEQTGPLGSRSTAKGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDP LTDQKQADSPDLLNFKKGWMSILDEPGEWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEY AVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKA GEQRAGSEVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLAQRSEERRK WFEATDSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQSRGERR GPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEE LQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRELSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEAL KRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMG NGCGRSNERSSCELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSERE IEQLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE ; 'TRIO and F-actin-binding protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2267 1 2267 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . TARA_HUMAN Q9H2D6 Q9H2D6-2 1 2267 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-03-21 A0055359F5C3D655 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no E ;MEEVPGDALCEHFEANILTQNRCQNCFHPEEAHGARYQELRSPSGAEVPYCDLPRCPPAPEDPLSASTSG CQSVVDPGLRPGPKRGPSPSAGLPEEGPTAAPRSRSRELEAVPYLEGLTTSLCGSCNEDPGSDPTSSPDS ATPDDTSNSSSVDWDTVERQEEEAPSWDELAVMIPRRPREGPRADSSQRAPSLLTRSPVGGDAAGQKKED TGGGGRSAGQHWARLRGESGLSLERHRSTLTQASSMTPHSGPRSTTSQASPAQRDTAQAASTREIPRASS PHRITQRDTSRASSTQQEISRASSTQQETSRASSTQEDTPRASSTQEDTPRASSTQWNTPRASSPSRSTQ LDNPRTSSTQQDNPQTSFPTCTPQRENPRTPCVQQDDPRASSPNRTTQRENSRTSCAQRDNPKASRTSSP NRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRAS SPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRAARDNPTTSCAQRDNPR ASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQ 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A 1 2155 GLU 2155 2155 GLU GLU E . A 1 2156 GLU 2156 2156 GLU GLU E . A 1 2157 ILE 2157 2157 ILE ILE E . A 1 2158 ASP 2158 2158 ASP ASP E . A 1 2159 GLN 2159 2159 GLN GLN E . A 1 2160 LEU 2160 2160 LEU LEU E . A 1 2161 ARG 2161 2161 ARG ARG E . A 1 2162 GLY 2162 ? ? ? E . A 1 2163 PHE 2163 ? ? ? E . A 1 2164 ILE 2164 ? ? ? E . A 1 2165 ALA 2165 ? ? ? E . A 1 2166 SER 2166 ? ? ? E . A 1 2167 GLN 2167 ? ? ? E . A 1 2168 GLY 2168 ? ? ? E . A 1 2169 MET 2169 ? ? ? E . A 1 2170 GLY 2170 ? ? ? E . A 1 2171 ASN 2171 ? ? ? E . A 1 2172 GLY 2172 ? ? ? E . A 1 2173 CYS 2173 ? ? ? E . A 1 2174 GLY 2174 ? ? ? E . A 1 2175 ARG 2175 ? ? ? E . A 1 2176 SER 2176 ? ? ? E . A 1 2177 ASN 2177 ? ? ? E . A 1 2178 GLU 2178 ? ? ? E . A 1 2179 ARG 2179 ? ? ? E . A 1 2180 SER 2180 ? ? ? E . A 1 2181 SER 2181 ? ? ? E . A 1 2182 CYS 2182 ? ? ? E . A 1 2183 GLU 2183 ? ? ? E . A 1 2184 LEU 2184 ? ? ? E . A 1 2185 GLU 2185 ? ? ? E . A 1 2186 VAL 2186 ? ? ? E . A 1 2187 LEU 2187 ? ? ? E . A 1 2188 LEU 2188 ? ? ? E . A 1 2189 ARG 2189 ? ? ? E . A 1 2190 VAL 2190 ? ? ? E . A 1 2191 LYS 2191 ? ? ? E . A 1 2192 GLU 2192 ? ? ? E . A 1 2193 ASN 2193 ? ? ? E . A 1 2194 GLU 2194 ? ? ? E . A 1 2195 LEU 2195 ? ? ? E . A 1 2196 GLN 2196 ? ? ? E . A 1 2197 TYR 2197 ? ? ? E . A 1 2198 LEU 2198 ? ? ? E . A 1 2199 LYS 2199 ? ? ? E . A 1 2200 LYS 2200 ? ? ? E . A 1 2201 GLU 2201 ? ? ? E . A 1 2202 VAL 2202 ? ? ? E . A 1 2203 GLN 2203 ? ? ? E . A 1 2204 CYS 2204 ? ? ? E . A 1 2205 LEU 2205 ? ? ? E . A 1 2206 ARG 2206 ? ? ? E . A 1 2207 ASP 2207 ? ? ? E . A 1 2208 GLU 2208 ? ? ? E . A 1 2209 LEU 2209 ? ? ? E . A 1 2210 GLN 2210 ? ? ? E . A 1 2211 MET 2211 ? ? ? E . A 1 2212 MET 2212 ? ? ? E . A 1 2213 GLN 2213 ? ? ? E . A 1 2214 LYS 2214 ? ? ? E . A 1 2215 ASP 2215 ? ? ? E . A 1 2216 LYS 2216 ? ? ? E . A 1 2217 ARG 2217 ? ? ? E . A 1 2218 PHE 2218 ? ? ? E . A 1 2219 THR 2219 ? ? ? E . A 1 2220 SER 2220 ? ? ? E . A 1 2221 GLY 2221 ? ? ? E . A 1 2222 LYS 2222 ? ? ? E . A 1 2223 TYR 2223 ? ? ? E . A 1 2224 GLN 2224 ? ? ? E . A 1 2225 ASP 2225 ? ? ? E . A 1 2226 VAL 2226 ? ? ? E . A 1 2227 TYR 2227 ? ? ? E . A 1 2228 VAL 2228 ? ? ? E . A 1 2229 GLU 2229 ? ? ? E . A 1 2230 LEU 2230 ? ? ? E . A 1 2231 SER 2231 ? ? ? E . A 1 2232 HIS 2232 ? ? ? E . A 1 2233 ILE 2233 ? ? ? E . A 1 2234 LYS 2234 ? ? ? E . A 1 2235 THR 2235 ? ? ? E . A 1 2236 ARG 2236 ? ? ? E . A 1 2237 SER 2237 ? ? ? E . A 1 2238 GLU 2238 ? ? ? E . A 1 2239 ARG 2239 ? ? ? E . A 1 2240 GLU 2240 ? ? ? E . A 1 2241 ILE 2241 ? ? ? E . A 1 2242 GLU 2242 ? ? ? E . A 1 2243 GLN 2243 ? ? ? E . A 1 2244 LEU 2244 ? ? ? E . A 1 2245 LYS 2245 ? ? ? E . A 1 2246 GLU 2246 ? ? ? E . A 1 2247 HIS 2247 ? ? ? E . A 1 2248 LEU 2248 ? ? ? E . A 1 2249 ARG 2249 ? ? ? E . A 1 2250 LEU 2250 ? ? ? E . A 1 2251 ALA 2251 ? ? ? E . A 1 2252 MET 2252 ? ? ? E . A 1 2253 ALA 2253 ? ? ? E . A 1 2254 ALA 2254 ? ? ? E . A 1 2255 LEU 2255 ? ? ? E . A 1 2256 GLN 2256 ? ? ? E . A 1 2257 GLU 2257 ? ? ? E . A 1 2258 LYS 2258 ? ? ? E . A 1 2259 GLU 2259 ? ? ? E . A 1 2260 SER 2260 ? ? ? E . A 1 2261 MET 2261 ? ? ? E . A 1 2262 ARG 2262 ? ? ? E . A 1 2263 ASN 2263 ? ? ? E . A 1 2264 SER 2264 ? ? ? E . A 1 2265 LEU 2265 ? ? ? E . A 1 2266 ALA 2266 ? ? ? E . A 1 2267 GLU 2267 ? ? ? E . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Growth-arrest-specific microtubule-binding protein {PDB ID=8th8, label_asym_id=E, auth_asym_id=E, SMTL ID=8th8.1.E}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8th8, label_asym_id=E' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 5 1 E # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MPPKKAKGKKKKEEEPDDEYKSMTGADLTQTLEKLKERVNEMRTNRNYIQMDRDMVENFYHNTLKEISEV KTKISNKETEAEEKESKHRIDVKVFLQKVKHLEYEQEKSNLNIEDDGKKAKEKEDAYFEDITKNMKQLKT QLKSEYLEKEKANIQQVQEEKKDHQSLLKIQQKKFDELINNLIIKYEERLAKLKEDLELKLKVEIHELEE RKNLHINELMNNHEKAFAELKKYYNDITAENLNLIKAHKEKIAQIYANIQLNTKNVADNQAKNEQLKEPL AKHREIRNKLKEDLKQFAKHKMSLQNLKSKAITLKDKITKLERDGKDLDEKYEKVVREKQELEKKFEDIT QEVKKNADLNNNVLSNRLQILLKEYNNKEEELRTIIDNAGLDHNLHEQLKQRVQQSIEAKNTLIKNLKYS IHHATKAYNDAIRVYEAKLVEFGIPIEELGFQPLETITSSMPAGLVSS ; ;MPPKKAKGKKKKEEEPDDEYKSMTGADLTQTLEKLKERVNEMRTNRNYIQMDRDMVENFYHNTLKEISEV KTKISNKETEAEEKESKHRIDVKVFLQKVKHLEYEQEKSNLNIEDDGKKAKEKEDAYFEDITKNMKQLKT QLKSEYLEKEKANIQQVQEEKKDHQSLLKIQQKKFDELINNLIIKYEERLAKLKEDLELKLKVEIHELEE RKNLHINELMNNHEKAFAELKKYYNDITAENLNLIKAHKEKIAQIYANIQLNTKNVADNQAKNEQLKEPL AKHREIRNKLKEDLKQFAKHKMSLQNLKSKAITLKDKITKLERDGKDLDEKYEKVVREKQELEKKFEDIT QEVKKNADLNNNVLSNRLQILLKEYNNKEEELRTIIDNAGLDHNLHEQLKQRVQQSIEAKNTLIKNLKYS IHHATKAYNDAIRVYEAKLVEFGIPIEELGFQPLETITSSMPAGLVSS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 146 350 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8th8 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2267 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2271 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.5e-05 14.428 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEEVPGDALCEHFEANILTQNRCQNCFHPEEAHGARYQELRSPSGAEVPYCDLPRCPPAPEDPLSASTSGCQSVVDPGLRPGPKRGPSPSAGLPEEGPTAAPRSRSRELEAVPYLEGLTTSLCGSCNEDPGSDPTSSPDSATPDDTSNSSSVDWDTVERQEEEAPSWDELAVMIPRRPREGPRADSSQRAPSLLTRSPVGGDAAGQKKEDTGGGGRSAGQHWARLRGESGLSLERHRSTLTQASSMTPHSGPRSTTSQASPAQRDTAQAASTREIPRASSPHRITQRDTSRASSTQQEISRASSTQQETSRASSTQEDTPRASSTQEDTPRASSTQWNTPRASSPSRSTQLDNPRTSSTQQDNPQTSFPTCTPQRENPRTPCVQQDDPRASSPNRTTQRENSRTSCAQRDNPKASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRAARDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTTQQDSPRTSCARRDDPRASSPNRTIQQENPRTSCALRDNPRASSPSRTIQQENPRTSCAQRDDPRASSPNRTTQQENPRTSCARRDNPRASSRNRTIQRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTIQQENLRTSCTRQDNPRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNLRASSPIRATQQDNPRTCIQQNIPRSSSTQQDNPKTSCTKRDNLRPTCTQRDRTQSFSFQRDNPGTSSSQCCTQKENLRPSSPHRSTQWNNPRNSSPHRTNKDIPWASFPLRPTQSDGPRTSSPSRSKQSEVPWASIALRPTQGDRPQTSSPSRPAQHDPPQSSFGPTQYNLPSRATSSSHNPGHQSTSRTSSPVYPAAYGAPLTSPEPSQPPCAVCIGHRDAPRASSPPRYLQHDPFPFFPEPRAPESEPPHHEPPYIPPAVCIGHRDAPRASSPPRHTQFDPFPFLPDTSDAEHQCQSPQHEPLQLPAPVCIGYRDAPRASSPPRQAPEPSLLFQDLPRASTESLVPSMDSLHECPHIPTPVCIGHRDAPSFSSPPRQAPEPSLFFQDPPGTSMESLAPSTDSLHGSPVLIPQVCIGHRDAPRASSPPRHPPSDLAFLAPSPSPGSSGGSRGSAPPGETRHNLEREEYTVLADLPPPRRLAQRQPGPQAQCSSGGRTHSPGRAEVERLFGQERRTMLPAKQAELTRRSQAEPPHPWSPEKRPEGDRQLQGSPLPPRTSARTPERELRTQRPLESGQAGPRQPLGVWQSQEEPPGSQGPHRHLERSWSSQEGGLGPGGWWGCGEPSLGAAKAPEGAWGGTSREYKESWGQPEAWEEKPTHELPRELGKRSPLTSPPENWGGPAESSQSWHSGTPTAVGWGAEGACPYPRGSERRPELDWRDLLGLLRAPGEGVWARVPSLDWEGLLELLQARLPRKDPAGHRDDLARALGPELGPPGTNDVPEQESHSQPEGWAEATPVNGHSPALQSQSPVQLPSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAGLEQTGPLGSRSTAKGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDPLTDQKQADSPDLLNFKKGWMSILDEPGEWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAGSEVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLAQRSEERRKWFEATDSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRELSKTRSL-QQGPDGLRKQHQSDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRL---SEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSCELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSEREIEQLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YLEKEKANIQQVQEEKKDHQSLLKIQQKKFDELINNLIIKYEERLAKLKEDLELKLKVEIHELEERKNLHINELMNNHEKAFAELKKYYNDIT---AENLNLIKAHKEKIAQIYANIQLNTKNVADNQAKNEQLKEPLAKHREIRNKLKEDLKQFAKH-------KMSLQNLKSKAITLKDKITKLERDGKDLDEKYEKVVREKQELEKKFEDIT---------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8th8.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 2017 2017 ? A 235.497 199.307 209.230 1 1 E LEU 0.440 1 ATOM 2 C CA . LEU 2017 2017 ? A 236.044 200.155 210.349 1 1 E LEU 0.440 1 ATOM 3 C C . LEU 2017 2017 ? A 236.083 199.442 211.689 1 1 E LEU 0.440 1 ATOM 4 O O . LEU 2017 2017 ? A 237.165 199.236 212.204 1 1 E LEU 0.440 1 ATOM 5 C CB . LEU 2017 2017 ? A 235.280 201.497 210.435 1 1 E LEU 0.440 1 ATOM 6 C CG . LEU 2017 2017 ? A 235.824 202.490 211.493 1 1 E LEU 0.440 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 2017 2017 ? A 237.289 202.899 211.245 1 1 E LEU 0.440 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 2017 2017 ? A 234.921 203.734 211.547 1 1 E LEU 0.440 1 ATOM 9 N N . ALA 2018 2018 ? A 234.925 198.973 212.230 1 1 E ALA 0.570 1 ATOM 10 C CA . ALA 2018 2018 ? A 234.849 198.255 213.494 1 1 E ALA 0.570 1 ATOM 11 C C . ALA 2018 2018 ? A 235.694 196.972 213.522 1 1 E ALA 0.570 1 ATOM 12 O O . ALA 2018 2018 ? A 236.426 196.722 214.464 1 1 E ALA 0.570 1 ATOM 13 C CB . ALA 2018 2018 ? A 233.363 197.959 213.803 1 1 E ALA 0.570 1 ATOM 14 N N . GLU 2019 2019 ? A 235.699 196.181 212.417 1 1 E GLU 0.530 1 ATOM 15 C CA . GLU 2019 2019 ? A 236.562 195.016 212.266 1 1 E GLU 0.530 1 ATOM 16 C C . GLU 2019 2019 ? A 238.052 195.339 212.392 1 1 E GLU 0.530 1 ATOM 17 O O . GLU 2019 2019 ? A 238.815 194.692 213.092 1 1 E GLU 0.530 1 ATOM 18 C CB . GLU 2019 2019 ? A 236.309 194.350 210.881 1 1 E GLU 0.530 1 ATOM 19 C CG . GLU 2019 2019 ? A 234.844 193.906 210.634 1 1 E GLU 0.530 1 ATOM 20 C CD . GLU 2019 2019 ? A 234.367 192.928 211.705 1 1 E GLU 0.530 1 ATOM 21 O OE1 . GLU 2019 2019 ? A 235.199 192.127 212.195 1 1 E GLU 0.530 1 ATOM 22 O OE2 . GLU 2019 2019 ? A 233.163 193.021 212.048 1 1 E GLU 0.530 1 ATOM 23 N N . MET 2020 2020 ? A 238.484 196.439 211.738 1 1 E MET 0.530 1 ATOM 24 C CA . MET 2020 2020 ? A 239.826 196.981 211.841 1 1 E MET 0.530 1 ATOM 25 C C . MET 2020 2020 ? A 240.181 197.522 213.216 1 1 E MET 0.530 1 ATOM 26 O O . MET 2020 2020 ? A 241.311 197.357 213.663 1 1 E MET 0.530 1 ATOM 27 C CB . MET 2020 2020 ? A 240.089 198.066 210.767 1 1 E MET 0.530 1 ATOM 28 C CG . MET 2020 2020 ? A 240.088 197.515 209.326 1 1 E MET 0.530 1 ATOM 29 S SD . MET 2020 2020 ? A 241.266 196.149 209.047 1 1 E MET 0.530 1 ATOM 30 C CE . MET 2020 2020 ? A 242.804 197.082 209.311 1 1 E MET 0.530 1 ATOM 31 N N . GLU 2021 2021 ? A 239.234 198.166 213.931 1 1 E GLU 0.580 1 ATOM 32 C CA . GLU 2021 2021 ? A 239.399 198.558 215.319 1 1 E GLU 0.580 1 ATOM 33 C C . GLU 2021 2021 ? A 239.616 197.352 216.231 1 1 E GLU 0.580 1 ATOM 34 O O . GLU 2021 2021 ? A 240.551 197.329 217.029 1 1 E GLU 0.580 1 ATOM 35 C CB . GLU 2021 2021 ? A 238.163 199.341 215.805 1 1 E GLU 0.580 1 ATOM 36 C CG . GLU 2021 2021 ? A 238.262 199.821 217.273 1 1 E GLU 0.580 1 ATOM 37 C CD . GLU 2021 2021 ? A 236.972 200.477 217.758 1 1 E GLU 0.580 1 ATOM 38 O OE1 . GLU 2021 2021 ? A 236.027 200.626 216.939 1 1 E GLU 0.580 1 ATOM 39 O OE2 . GLU 2021 2021 ? A 236.935 200.824 218.965 1 1 E GLU 0.580 1 ATOM 40 N N . SER 2022 2022 ? A 238.806 196.275 216.056 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 41 C CA . SER 2022 2022 ? A 238.972 194.995 216.747 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 42 C C . SER 2022 2022 ? A 240.321 194.365 216.474 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 43 O O . SER 2022 2022 ? A 240.998 193.915 217.396 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 44 C CB . SER 2022 2022 ? A 237.904 193.933 216.368 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 45 O OG . SER 2022 2022 ? A 236.622 194.295 216.878 1 1 E SER 0.650 1 ATOM 46 N N . SER 2023 2023 ? A 240.770 194.380 215.196 1 1 E SER 0.670 1 ATOM 47 C CA . SER 2023 2023 ? A 242.117 193.986 214.797 1 1 E SER 0.670 1 ATOM 48 C C . SER 2023 2023 ? A 243.194 194.820 215.451 1 1 E SER 0.670 1 ATOM 49 O O . SER 2023 2023 ? A 244.132 194.274 216.009 1 1 E SER 0.670 1 ATOM 50 C CB . SER 2023 2023 ? A 242.367 194.054 213.266 1 1 E SER 0.670 1 ATOM 51 O OG . SER 2023 2023 ? A 241.536 193.110 212.592 1 1 E SER 0.670 1 ATOM 52 N N . HIS 2024 2024 ? A 243.066 196.169 215.465 1 1 E HIS 0.650 1 ATOM 53 C CA . HIS 2024 2024 ? A 244.015 197.052 216.125 1 1 E HIS 0.650 1 ATOM 54 C C . HIS 2024 2024 ? A 244.131 196.760 217.608 1 1 E HIS 0.650 1 ATOM 55 O O . HIS 2024 2024 ? A 245.226 196.548 218.109 1 1 E HIS 0.650 1 ATOM 56 C CB . HIS 2024 2024 ? A 243.620 198.542 215.944 1 1 E HIS 0.650 1 ATOM 57 C CG . HIS 2024 2024 ? A 244.561 199.520 216.576 1 1 E HIS 0.650 1 ATOM 58 N ND1 . HIS 2024 2024 ? A 245.787 199.736 215.979 1 1 E HIS 0.650 1 ATOM 59 C CD2 . HIS 2024 2024 ? A 244.451 200.259 217.707 1 1 E HIS 0.650 1 ATOM 60 C CE1 . HIS 2024 2024 ? A 246.395 200.601 216.756 1 1 E HIS 0.650 1 ATOM 61 N NE2 . HIS 2024 2024 ? A 245.634 200.961 217.824 1 1 E HIS 0.650 1 ATOM 62 N N . GLN 2025 2025 ? A 242.998 196.653 218.337 1 1 E GLN 0.670 1 ATOM 63 C CA . GLN 2025 2025 ? A 243.018 196.365 219.760 1 1 E GLN 0.670 1 ATOM 64 C C . GLN 2025 2025 ? A 243.644 195.017 220.099 1 1 E GLN 0.670 1 ATOM 65 O O . GLN 2025 2025 ? A 244.505 194.932 220.969 1 1 E GLN 0.670 1 ATOM 66 C CB . GLN 2025 2025 ? A 241.594 196.459 220.361 1 1 E GLN 0.670 1 ATOM 67 C CG . GLN 2025 2025 ? A 241.536 196.310 221.904 1 1 E GLN 0.670 1 ATOM 68 C CD . GLN 2025 2025 ? A 242.303 197.420 222.631 1 1 E GLN 0.670 1 ATOM 69 O OE1 . GLN 2025 2025 ? A 242.521 198.520 222.127 1 1 E GLN 0.670 1 ATOM 70 N NE2 . GLN 2025 2025 ? A 242.735 197.114 223.876 1 1 E GLN 0.670 1 ATOM 71 N N . GLN 2026 2026 ? A 243.287 193.945 219.348 1 1 E GLN 0.690 1 ATOM 72 C CA . GLN 2026 2026 ? A 243.903 192.635 219.491 1 1 E GLN 0.690 1 ATOM 73 C C . GLN 2026 2026 ? A 245.395 192.646 219.229 1 1 E GLN 0.690 1 ATOM 74 O O . GLN 2026 2026 ? A 246.173 192.128 220.022 1 1 E GLN 0.690 1 ATOM 75 C CB . GLN 2026 2026 ? A 243.246 191.608 218.537 1 1 E GLN 0.690 1 ATOM 76 C CG . GLN 2026 2026 ? A 241.932 191.040 219.112 1 1 E GLN 0.690 1 ATOM 77 C CD . GLN 2026 2026 ? A 241.357 189.959 218.199 1 1 E GLN 0.690 1 ATOM 78 O OE1 . GLN 2026 2026 ? A 241.682 189.825 217.027 1 1 E GLN 0.690 1 ATOM 79 N NE2 . GLN 2026 2026 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #