data_SMR-edfba432030db6d5009d64c0386de18b_3 _entry.id SMR-edfba432030db6d5009d64c0386de18b_3 _struct.entry_id SMR-edfba432030db6d5009d64c0386de18b_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9H2D6 (isoform 2)/ TARA_HUMAN, TRIO and F-actin-binding protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9H2D6 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 291905.059 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP TARA_HUMAN Q9H2D6 1 ;MEEVPGDALCEHFEANILTQNRCQNCFHPEEAHGARYQELRSPSGAEVPYCDLPRCPPAPEDPLSASTSG CQSVVDPGLRPGPKRGPSPSAGLPEEGPTAAPRSRSRELEAVPYLEGLTTSLCGSCNEDPGSDPTSSPDS ATPDDTSNSSSVDWDTVERQEEEAPSWDELAVMIPRRPREGPRADSSQRAPSLLTRSPVGGDAAGQKKED TGGGGRSAGQHWARLRGESGLSLERHRSTLTQASSMTPHSGPRSTTSQASPAQRDTAQAASTREIPRASS PHRITQRDTSRASSTQQEISRASSTQQETSRASSTQEDTPRASSTQEDTPRASSTQWNTPRASSPSRSTQ LDNPRTSSTQQDNPQTSFPTCTPQRENPRTPCVQQDDPRASSPNRTTQRENSRTSCAQRDNPKASRTSSP NRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRAS SPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRAARDNPTTSCAQRDNPR ASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQ RDNPRASSPNRTTQQDSPRTSCARRDDPRASSPNRTIQQENPRTSCALRDNPRASSPSRTIQQENPRTSC AQRDDPRASSPNRTTQQENPRTSCARRDNPRASSRNRTIQRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTIQQENLRT SCTRQDNPRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNLRASSPIRATQQDNPRTCIQQNIPRSSSTQQDNPKTSCTK RDNLRPTCTQRDRTQSFSFQRDNPGTSSSQCCTQKENLRPSSPHRSTQWNNPRNSSPHRTNKDIPWASFP LRPTQSDGPRTSSPSRSKQSEVPWASIALRPTQGDRPQTSSPSRPAQHDPPQSSFGPTQYNLPSRATSSS HNPGHQSTSRTSSPVYPAAYGAPLTSPEPSQPPCAVCIGHRDAPRASSPPRYLQHDPFPFFPEPRAPESE PPHHEPPYIPPAVCIGHRDAPRASSPPRHTQFDPFPFLPDTSDAEHQCQSPQHEPLQLPAPVCIGYRDAP RASSPPRQAPEPSLLFQDLPRASTESLVPSMDSLHECPHIPTPVCIGHRDAPSFSSPPRQAPEPSLFFQD PPGTSMESLAPSTDSLHGSPVLIPQVCIGHRDAPRASSPPRHPPSDLAFLAPSPSPGSSGGSRGSAPPGE TRHNLEREEYTVLADLPPPRRLAQRQPGPQAQCSSGGRTHSPGRAEVERLFGQERRTMLPAKQAELTRRS QAEPPHPWSPEKRPEGDRQLQGSPLPPRTSARTPERELRTQRPLESGQAGPRQPLGVWQSQEEPPGSQGP HRHLERSWSSQEGGLGPGGWWGCGEPSLGAAKAPEGAWGGTSREYKESWGQPEAWEEKPTHELPRELGKR SPLTSPPENWGGPAESSQSWHSGTPTAVGWGAEGACPYPRGSERRPELDWRDLLGLLRAPGEGVWARVPS LDWEGLLELLQARLPRKDPAGHRDDLARALGPELGPPGTNDVPEQESHSQPEGWAEATPVNGHSPALQSQ SPVQLPSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAGLEQTGPLGSRSTAKGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDP LTDQKQADSPDLLNFKKGWMSILDEPGEWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEY AVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKA GEQRAGSEVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLAQRSEERRK WFEATDSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQSRGERR GPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEE LQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRELSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEAL KRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMG NGCGRSNERSSCELEVLLRVKENELQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTRSERE IEQLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE ; 'TRIO and F-actin-binding protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2267 1 2267 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . TARA_HUMAN Q9H2D6 Q9H2D6-2 1 2267 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-03-21 A0055359F5C3D655 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MEEVPGDALCEHFEANILTQNRCQNCFHPEEAHGARYQELRSPSGAEVPYCDLPRCPPAPEDPLSASTSG CQSVVDPGLRPGPKRGPSPSAGLPEEGPTAAPRSRSRELEAVPYLEGLTTSLCGSCNEDPGSDPTSSPDS ATPDDTSNSSSVDWDTVERQEEEAPSWDELAVMIPRRPREGPRADSSQRAPSLLTRSPVGGDAAGQKKED TGGGGRSAGQHWARLRGESGLSLERHRSTLTQASSMTPHSGPRSTTSQASPAQRDTAQAASTREIPRASS PHRITQRDTSRASSTQQEISRASSTQQETSRASSTQEDTPRASSTQEDTPRASSTQWNTPRASSPSRSTQ LDNPRTSSTQQDNPQTSFPTCTPQRENPRTPCVQQDDPRASSPNRTTQRENSRTSCAQRDNPKASRTSSP NRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRAS SPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRAARDNPTTSCAQRDNPR ASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQ 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A 1 2173 CYS 2173 2173 CYS CYS A . A 1 2174 GLY 2174 2174 GLY GLY A . A 1 2175 ARG 2175 2175 ARG ARG A . A 1 2176 SER 2176 2176 SER SER A . A 1 2177 ASN 2177 2177 ASN ASN A . A 1 2178 GLU 2178 2178 GLU GLU A . A 1 2179 ARG 2179 2179 ARG ARG A . A 1 2180 SER 2180 2180 SER SER A . A 1 2181 SER 2181 2181 SER SER A . A 1 2182 CYS 2182 2182 CYS CYS A . A 1 2183 GLU 2183 2183 GLU GLU A . A 1 2184 LEU 2184 2184 LEU LEU A . A 1 2185 GLU 2185 2185 GLU GLU A . A 1 2186 VAL 2186 2186 VAL VAL A . A 1 2187 LEU 2187 2187 LEU LEU A . A 1 2188 LEU 2188 2188 LEU LEU A . A 1 2189 ARG 2189 2189 ARG ARG A . A 1 2190 VAL 2190 2190 VAL VAL A . A 1 2191 LYS 2191 2191 LYS LYS A . A 1 2192 GLU 2192 2192 GLU GLU A . A 1 2193 ASN 2193 2193 ASN ASN A . A 1 2194 GLU 2194 2194 GLU GLU A . A 1 2195 LEU 2195 2195 LEU LEU A . A 1 2196 GLN 2196 2196 GLN GLN A . A 1 2197 TYR 2197 2197 TYR TYR A . A 1 2198 LEU 2198 2198 LEU LEU A . A 1 2199 LYS 2199 2199 LYS LYS A . A 1 2200 LYS 2200 2200 LYS LYS A . A 1 2201 GLU 2201 2201 GLU GLU A . A 1 2202 VAL 2202 2202 VAL VAL A . A 1 2203 GLN 2203 2203 GLN GLN A . A 1 2204 CYS 2204 2204 CYS CYS A . A 1 2205 LEU 2205 2205 LEU LEU A . A 1 2206 ARG 2206 2206 ARG ARG A . A 1 2207 ASP 2207 2207 ASP ASP A . A 1 2208 GLU 2208 2208 GLU GLU A . A 1 2209 LEU 2209 2209 LEU LEU A . A 1 2210 GLN 2210 2210 GLN GLN A . A 1 2211 MET 2211 2211 MET MET A . A 1 2212 MET 2212 2212 MET MET A . A 1 2213 GLN 2213 2213 GLN GLN A . A 1 2214 LYS 2214 2214 LYS LYS A . A 1 2215 ASP 2215 2215 ASP ASP A . A 1 2216 LYS 2216 2216 LYS LYS A . A 1 2217 ARG 2217 2217 ARG ARG A . A 1 2218 PHE 2218 2218 PHE PHE A . A 1 2219 THR 2219 2219 THR THR A . A 1 2220 SER 2220 2220 SER SER A . A 1 2221 GLY 2221 2221 GLY GLY A . A 1 2222 LYS 2222 2222 LYS LYS A . A 1 2223 TYR 2223 2223 TYR TYR A . A 1 2224 GLN 2224 2224 GLN GLN A . A 1 2225 ASP 2225 2225 ASP ASP A . A 1 2226 VAL 2226 2226 VAL VAL A . A 1 2227 TYR 2227 2227 TYR TYR A . A 1 2228 VAL 2228 2228 VAL VAL A . A 1 2229 GLU 2229 2229 GLU GLU A . A 1 2230 LEU 2230 2230 LEU LEU A . A 1 2231 SER 2231 2231 SER SER A . A 1 2232 HIS 2232 2232 HIS HIS A . A 1 2233 ILE 2233 2233 ILE ILE A . A 1 2234 LYS 2234 2234 LYS LYS A . A 1 2235 THR 2235 2235 THR THR A . A 1 2236 ARG 2236 2236 ARG ARG A . A 1 2237 SER 2237 2237 SER SER A . A 1 2238 GLU 2238 2238 GLU GLU A . A 1 2239 ARG 2239 2239 ARG ARG A . A 1 2240 GLU 2240 2240 GLU GLU A . A 1 2241 ILE 2241 2241 ILE ILE A . A 1 2242 GLU 2242 2242 GLU GLU A . A 1 2243 GLN 2243 2243 GLN GLN A . A 1 2244 LEU 2244 2244 LEU LEU A . A 1 2245 LYS 2245 2245 LYS LYS A . A 1 2246 GLU 2246 2246 GLU GLU A . A 1 2247 HIS 2247 2247 HIS HIS A . A 1 2248 LEU 2248 2248 LEU LEU A . A 1 2249 ARG 2249 2249 ARG ARG A . A 1 2250 LEU 2250 ? ? ? A . A 1 2251 ALA 2251 ? ? ? A . A 1 2252 MET 2252 ? ? ? A . A 1 2253 ALA 2253 ? ? ? A . A 1 2254 ALA 2254 ? ? ? A . A 1 2255 LEU 2255 ? ? ? A . A 1 2256 GLN 2256 ? ? ? A . A 1 2257 GLU 2257 ? ? ? A . A 1 2258 LYS 2258 ? ? ? A . A 1 2259 GLU 2259 ? ? ? A . A 1 2260 SER 2260 ? ? ? A . A 1 2261 MET 2261 ? ? ? A . A 1 2262 ARG 2262 ? ? ? A . A 1 2263 ASN 2263 ? ? ? A . A 1 2264 SER 2264 ? ? ? A . A 1 2265 LEU 2265 ? ? ? A . A 1 2266 ALA 2266 ? ? ? A . A 1 2267 GLU 2267 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'NUCLEAR DISTRIBUTION PROTEIN NUDE-LIKE 1 {PDB ID=2v71, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2v71.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2v71, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GAMDFSSLKEETAYWKELSMKYKQSFQEARDELVEFQEGSRELEAELEAQLVQAEQRNRDLQADNQRLKY EVEALKEKLEHQYAQSYKQVSVLEDDLSQTRAIKEQLHKYVRELEQANDDLERAKRATIMSLEDFEQRLN QAIERNAFLESELDEKESLLVSVQRLKDEARDLRQELAVRERQQEVTRK ; ;GAMDFSSLKEETAYWKELSMKYKQSFQEARDELVEFQEGSRELEAELEAQLVQAEQRNRDLQADNQRLKY EVEALKEKLEHQYAQSYKQVSVLEDDLSQTRAIKEQLHKYVRELEQANDDLERAKRATIMSLEDFEQRLN QAIERNAFLESELDEKESLLVSVQRLKDEARDLRQELAVRERQQEVTRK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 140 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2v71 2024-11-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2267 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2271 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.100 16.667 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEEVPGDALCEHFEANILTQNRCQNCFHPEEAHGARYQELRSPSGAEVPYCDLPRCPPAPEDPLSASTSGCQSVVDPGLRPGPKRGPSPSAGLPEEGPTAAPRSRSRELEAVPYLEGLTTSLCGSCNEDPGSDPTSSPDSATPDDTSNSSSVDWDTVERQEEEAPSWDELAVMIPRRPREGPRADSSQRAPSLLTRSPVGGDAAGQKKEDTGGGGRSAGQHWARLRGESGLSLERHRSTLTQASSMTPHSGPRSTTSQASPAQRDTAQAASTREIPRASSPHRITQRDTSRASSTQQEISRASSTQQETSRASSTQEDTPRASSTQEDTPRASSTQWNTPRASSPSRSTQLDNPRTSSTQQDNPQTSFPTCTPQRENPRTPCVQQDDPRASSPNRTTQRENSRTSCAQRDNPKASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPSRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRAARDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRATRDNPTTSCAQRDNPRASRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTTQQDSPRTSCARRDDPRASSPNRTIQQENPRTSCALRDNPRASSPSRTIQQENPRTSCAQRDDPRASSPNRTTQQENPRTSCARRDNPRASSRNRTIQRDNPRTSCAQRDNPRASSPNRTIQQENLRTSCTRQDNPRTSSPNRATRDNPRTSCAQRDNLRASSPIRATQQDNPRTCIQQNIPRSSSTQQDNPKTSCTKRDNLRPTCTQRDRTQSFSFQRDNPGTSSSQCCTQKENLRPSSPHRSTQWNNPRNSSPHRTNKDIPWASFPLRPTQSDGPRTSSPSRSKQSEVPWASIALRPTQGDRPQTSSPSRPAQHDPPQSSFGPTQYNLPSRATSSSHNPGHQSTSRTSSPVYPAAYGAPLTSPEPSQPPCAVCIGHRDAPRASSPPRYLQHDPFPFFPEPRAPESEPPHHEPPYIPPAVCIGHRDAPRASSPPRHTQFDPFPFLPDTSDAEHQCQSPQHEPLQLPAPVCIGYRDAPRASSPPRQAPEPSLLFQDLPRASTESLVPSMDSLHECPHIPTPVCIGHRDAPSFSSPPRQAPEPSLFFQDPPGTSMESLAPSTDSLHGSPVLIPQVCIGHRDAPRASSPPRHPPSDLAFLAPSPSPGSSGGSRGSAPPGETRHNLEREEYTVLADLPPPRRLAQRQPGPQAQCSSGGRTHSPGRAEVERLFGQERRTMLPAKQAELTRRSQAEPPHPWSPEKRPEGDRQLQGSPLPPRTSARTPERELRTQRPLESGQAGPRQPLGVWQSQEEPPGSQGPHRHLERSWSSQEGGLGPGGWWGCGEPSLGAAKAPEGAWGGTSREYKESWGQPEAWEEKPTHELPRELGKRSPLTSPPENWGGPAESSQSWHSGTPTAVGWGAEGACPYPRGSERRPELDWRDLLGLLRAPGEGVWARVPSLDWEGLLELLQARLPRKDPAGHRDDLARALGPELGPPGTNDVPEQESHSQPEGWAEATPVNGHSPALQSQSPVQLPSPACTSTQWPKIKVTRGPATATLAGLEQTGPLGSRSTAKGPSLPELQFQPEEPEESEPSRGQDPLTDQKQADSPDLLNFKKGWMSILDEPGEWKKHWFVLTDSSLKYYRDSTAEEADELDGEIDLRSCTDVTEYAVQRNYGFQIHTKDAVYTLSAMTSGIRRNWIEALRKTVRPTSAPDVTKLSDSNKENALHSYSTQKGPLKAGEQRAGSEVISRGGPRKADGQRQALDYVELSPLTQASPQRARTPARTPDRLAKQEELERDLAQRSEERRKWFEATDSRTPEVPAGEGPRRGLGAPLTEDQQNRLSEEIEKKWQELEKLPLRENKRVPLTALLNQSRGERRGPPSDGHEALEKEVQALRAQLEAWRLQGEAPQSALRSQEDGHIPPGYISQEACERSLAEMESSHQQVMEELQRHHERELQRLQQEKEWLLAEETAATASAIEAMKKAYQEELSRELSKTRSLQQGPDGLRKQHQSDVEALKRELQVLSEQYSQKCLEIGALMRQAEEREHTLRRCQQEGQELLRHNQELHGRLSEEIDQLRGFIASQGMGNGCGRSNERSSCELEVLLRVKENE-LQYLKKEVQCLRDELQMMQKDKRFTSGKYQDVYVELSHIKTR---SEREIEQLKEHLRLAMAALQEKESMRNSLAE 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FSSLKEETAYWKELSMKYKQSFQEARDELVEFQEGSRELEAELEAQLVQAEQRNRDLQAD------NQRLKYEVEA-LKEKLEHQYAQSYKQVSVLEDDLSQTRAIKEQLHKYVRELEQANDDLERAKRATIMSLEDFEQRLN------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2v71.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.547 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2111 TYR 1 0.240 2 1 A 2112 SER 1 0.370 3 1 A 2113 GLN 1 0.420 4 1 A 2114 LYS 1 0.390 5 1 A 2115 CYS 1 0.360 6 1 A 2116 LEU 1 0.390 7 1 A 2117 GLU 1 0.440 8 1 A 2118 ILE 1 0.470 9 1 A 2119 GLY 1 0.520 10 1 A 2120 ALA 1 0.560 11 1 A 2121 LEU 1 0.540 12 1 A 2122 MET 1 0.560 13 1 A 2123 ARG 1 0.600 14 1 A 2124 GLN 1 0.630 15 1 A 2125 ALA 1 0.690 16 1 A 2126 GLU 1 0.670 17 1 A 2127 GLU 1 0.680 18 1 A 2128 ARG 1 0.650 19 1 A 2129 GLU 1 0.690 20 1 A 2130 HIS 1 0.680 21 1 A 2131 THR 1 0.670 22 1 A 2132 LEU 1 0.660 23 1 A 2133 ARG 1 0.640 24 1 A 2134 ARG 1 0.630 25 1 A 2135 CYS 1 0.640 26 1 A 2136 GLN 1 0.650 27 1 A 2137 GLN 1 0.660 28 1 A 2138 GLU 1 0.650 29 1 A 2139 GLY 1 0.680 30 1 A 2140 GLN 1 0.650 31 1 A 2141 GLU 1 0.650 32 1 A 2142 LEU 1 0.640 33 1 A 2143 LEU 1 0.640 34 1 A 2144 ARG 1 0.610 35 1 A 2145 HIS 1 0.620 36 1 A 2146 ASN 1 0.640 37 1 A 2147 GLN 1 0.620 38 1 A 2148 GLU 1 0.640 39 1 A 2149 LEU 1 0.650 40 1 A 2150 HIS 1 0.640 41 1 A 2151 GLY 1 0.700 42 1 A 2152 ARG 1 0.650 43 1 A 2153 LEU 1 0.670 44 1 A 2154 SER 1 0.670 45 1 A 2155 GLU 1 0.660 46 1 A 2156 GLU 1 0.650 47 1 A 2157 ILE 1 0.630 48 1 A 2158 ASP 1 0.640 49 1 A 2159 GLN 1 0.550 50 1 A 2160 LEU 1 0.590 51 1 A 2161 ARG 1 0.510 52 1 A 2162 GLY 1 0.590 53 1 A 2163 PHE 1 0.510 54 1 A 2164 ILE 1 0.550 55 1 A 2165 ALA 1 0.610 56 1 A 2166 SER 1 0.570 57 1 A 2167 GLN 1 0.540 58 1 A 2168 GLY 1 0.650 59 1 A 2169 MET 1 0.510 60 1 A 2170 GLY 1 0.610 61 1 A 2171 ASN 1 0.550 62 1 A 2172 GLY 1 0.580 63 1 A 2173 CYS 1 0.610 64 1 A 2174 GLY 1 0.310 65 1 A 2175 ARG 1 0.330 66 1 A 2176 SER 1 0.620 67 1 A 2177 ASN 1 0.520 68 1 A 2178 GLU 1 0.480 69 1 A 2179 ARG 1 0.500 70 1 A 2180 SER 1 0.540 71 1 A 2181 SER 1 0.490 72 1 A 2182 CYS 1 0.520 73 1 A 2183 GLU 1 0.510 74 1 A 2184 LEU 1 0.570 75 1 A 2185 GLU 1 0.540 76 1 A 2186 VAL 1 0.510 77 1 A 2187 LEU 1 0.540 78 1 A 2188 LEU 1 0.470 79 1 A 2189 ARG 1 0.390 80 1 A 2190 VAL 1 0.470 81 1 A 2191 LYS 1 0.450 82 1 A 2192 GLU 1 0.400 83 1 A 2193 ASN 1 0.390 84 1 A 2194 GLU 1 0.470 85 1 A 2195 LEU 1 0.480 86 1 A 2196 GLN 1 0.430 87 1 A 2197 TYR 1 0.440 88 1 A 2198 LEU 1 0.490 89 1 A 2199 LYS 1 0.560 90 1 A 2200 LYS 1 0.580 91 1 A 2201 GLU 1 0.590 92 1 A 2202 VAL 1 0.630 93 1 A 2203 GLN 1 0.620 94 1 A 2204 CYS 1 0.630 95 1 A 2205 LEU 1 0.630 96 1 A 2206 ARG 1 0.620 97 1 A 2207 ASP 1 0.620 98 1 A 2208 GLU 1 0.630 99 1 A 2209 LEU 1 0.640 100 1 A 2210 GLN 1 0.620 101 1 A 2211 MET 1 0.610 102 1 A 2212 MET 1 0.600 103 1 A 2213 GLN 1 0.590 104 1 A 2214 LYS 1 0.600 105 1 A 2215 ASP 1 0.560 106 1 A 2216 LYS 1 0.550 107 1 A 2217 ARG 1 0.510 108 1 A 2218 PHE 1 0.510 109 1 A 2219 THR 1 0.550 110 1 A 2220 SER 1 0.530 111 1 A 2221 GLY 1 0.560 112 1 A 2222 LYS 1 0.540 113 1 A 2223 TYR 1 0.510 114 1 A 2224 GLN 1 0.500 115 1 A 2225 ASP 1 0.530 116 1 A 2226 VAL 1 0.530 117 1 A 2227 TYR 1 0.500 118 1 A 2228 VAL 1 0.530 119 1 A 2229 GLU 1 0.500 120 1 A 2230 LEU 1 0.470 121 1 A 2231 SER 1 0.510 122 1 A 2232 HIS 1 0.440 123 1 A 2233 ILE 1 0.390 124 1 A 2234 LYS 1 0.420 125 1 A 2235 THR 1 0.380 126 1 A 2236 ARG 1 0.280 127 1 A 2237 SER 1 0.280 128 1 A 2238 GLU 1 0.430 129 1 A 2239 ARG 1 0.430 130 1 A 2240 GLU 1 0.450 131 1 A 2241 ILE 1 0.480 132 1 A 2242 GLU 1 0.530 133 1 A 2243 GLN 1 0.510 134 1 A 2244 LEU 1 0.510 135 1 A 2245 LYS 1 0.530 136 1 A 2246 GLU 1 0.490 137 1 A 2247 HIS 1 0.460 138 1 A 2248 LEU 1 0.670 139 1 A 2249 ARG 1 0.580 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #