data_SMR-3a39047e2e4ccb4af103d429accc53ce_1 _entry.id SMR-3a39047e2e4ccb4af103d429accc53ce_1 _struct.entry_id SMR-3a39047e2e4ccb4af103d429accc53ce_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O75376 (isoform 2)/ NCOR1_HUMAN, Nuclear receptor corepressor 1 Estimated model accuracy of this model is 0.035, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O75376 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 301044.347 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NCOR1_HUMAN O75376 1 ;MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQQQQQLRRRPS LLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQRVSAAVLPLVHPLPEGLRAS ADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLE EEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIK TNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIR KQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYLTKKNENYKAL VRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDEKEDSKENTKEKDKIDGTAEE TEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTE EEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCE SVASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELE PTTETAPSTSPSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCSADEDVDGEPE RQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCTPCNIPIGTPVSGYALYQRHI KAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREWEVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPP PLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPY IKQEEFSPRSQNSQPEGLLVRAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQ TGIPTEALVKGSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLK RSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRATTESFEDGLKY PKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQESRKTPEVVQSTRPIIEGSISQ GTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVPENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSS GPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRTPVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPT QRESIPAKSPVPGVDPVVSHSPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPT PGYPSQYQLYAMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILV PHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLAAAASAEREREREREKERERERIAAASS DLYLRPGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVITPLDPTAQLRIMPLPAGGPS ISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKEISSHRYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQ PEVVKANQAENDPTRQYEGPLHHYRPQQESPSPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLITLADHICQIITQDF ARNQVSSQTPQQPPTSTFQNSPSALVSTPVRTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRP GKSPERSHVSSEPYEPISPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLENTSP MVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPASNLGLEDIIRKALMG SFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKPKLISKSNSRKSKSPIPGQG YLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQFPYNPLTMRMLSSTPPTPIACAPSAVNQAAP HQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD ; 'Nuclear receptor corepressor 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2337 1 2337 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NCOR1_HUMAN O75376 O75376-2 1 2337 9606 'Homo sapiens (Human)' 2004-05-10 6837EA3886E1E03C # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQQQQQLRRRPS LLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQRVSAAVLPLVHPLPEGLRAS ADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLE EEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIK TNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIR KQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINM NGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYLTKKNENYKAL VRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDEKEDSKENTKEKDKIDGTAEE TEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTE EEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCE SVASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELE PTTETAPSTSPSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDV EVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCSADEDVDGEPE RQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCTPCNIPIGTPVSGYALYQRHI KAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREWEVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPP PLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPY IKQEEFSPRSQNSQPEGLLVRAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQ TGIPTEALVKGSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLK RSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRATTESFEDGLKY PKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQESRKTPEVVQSTRPIIEGSISQ GTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVPENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSS GPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRTPVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPT QRESIPAKSPVPGVDPVVSHSPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPT 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A 1 2105 LYS 2105 ? ? ? A . A 1 2106 LYS 2106 ? ? ? A . A 1 2107 GLN 2107 ? ? ? A . A 1 2108 GLU 2108 ? ? ? A . A 1 2109 ILE 2109 ? ? ? A . A 1 2110 PHE 2110 ? ? ? A . A 1 2111 ARG 2111 ? ? ? A . A 1 2112 LYS 2112 ? ? ? A . A 1 2113 LEU 2113 ? ? ? A . A 1 2114 ASN 2114 ? ? ? A . A 1 2115 SER 2115 ? ? ? A . A 1 2116 SER 2116 ? ? ? A . A 1 2117 GLY 2117 ? ? ? A . A 1 2118 GLY 2118 ? ? ? A . A 1 2119 GLY 2119 ? ? ? A . A 1 2120 ASP 2120 ? ? ? A . A 1 2121 SER 2121 ? ? ? A . A 1 2122 ASP 2122 ? ? ? A . A 1 2123 MET 2123 ? ? ? A . A 1 2124 ALA 2124 ? ? ? A . A 1 2125 ALA 2125 ? ? ? A . A 1 2126 ALA 2126 ? ? ? A . A 1 2127 GLN 2127 ? ? ? A . A 1 2128 PRO 2128 ? ? ? A . A 1 2129 GLY 2129 ? ? ? A . A 1 2130 THR 2130 ? ? ? A . A 1 2131 GLU 2131 ? ? ? A . A 1 2132 ILE 2132 ? ? ? A . A 1 2133 PHE 2133 ? ? ? A . A 1 2134 ASN 2134 ? ? ? A . A 1 2135 LEU 2135 ? ? ? A . A 1 2136 PRO 2136 ? ? ? A . A 1 2137 ALA 2137 ? ? ? A . A 1 2138 VAL 2138 ? ? ? A . A 1 2139 THR 2139 ? ? ? A . A 1 2140 THR 2140 ? ? ? A . A 1 2141 SER 2141 ? ? ? A . A 1 2142 GLY 2142 ? ? ? A . A 1 2143 SER 2143 ? ? ? A . A 1 2144 VAL 2144 ? ? ? A . A 1 2145 SER 2145 ? ? ? A . A 1 2146 SER 2146 ? ? ? A . A 1 2147 ARG 2147 ? ? ? A . A 1 2148 GLY 2148 ? ? ? A . A 1 2149 HIS 2149 ? ? ? A . A 1 2150 SER 2150 ? ? ? A . A 1 2151 PHE 2151 ? ? ? A . A 1 2152 ALA 2152 ? ? ? A . A 1 2153 ASP 2153 ? ? ? A . A 1 2154 PRO 2154 ? ? ? A . A 1 2155 ALA 2155 ? ? ? A . A 1 2156 SER 2156 ? ? ? A . A 1 2157 ASN 2157 ? ? ? A . A 1 2158 LEU 2158 ? ? ? A . A 1 2159 GLY 2159 ? ? ? A . A 1 2160 LEU 2160 ? ? ? A . A 1 2161 GLU 2161 ? ? ? A . A 1 2162 ASP 2162 ? ? ? A . A 1 2163 ILE 2163 ? ? ? A . A 1 2164 ILE 2164 ? ? ? A . A 1 2165 ARG 2165 ? ? ? A . A 1 2166 LYS 2166 ? ? ? A . A 1 2167 ALA 2167 ? ? ? A . A 1 2168 LEU 2168 ? ? ? A . A 1 2169 MET 2169 ? ? ? A . A 1 2170 GLY 2170 ? ? ? A . A 1 2171 SER 2171 ? ? ? A . A 1 2172 PHE 2172 ? ? ? A . A 1 2173 ASP 2173 ? ? ? A . A 1 2174 ASP 2174 ? ? ? A . A 1 2175 LYS 2175 ? ? ? A . A 1 2176 VAL 2176 ? ? ? A . A 1 2177 GLU 2177 ? ? ? A . A 1 2178 ASP 2178 ? ? ? A . A 1 2179 HIS 2179 ? ? ? A . A 1 2180 GLY 2180 ? ? ? A . A 1 2181 VAL 2181 ? ? ? A . A 1 2182 VAL 2182 ? ? ? A . A 1 2183 MET 2183 ? ? ? A . A 1 2184 SER 2184 ? ? ? A . A 1 2185 GLN 2185 ? ? ? A . A 1 2186 PRO 2186 ? ? ? A . A 1 2187 MET 2187 ? ? ? A . A 1 2188 GLY 2188 ? ? ? A . A 1 2189 VAL 2189 ? ? ? A . A 1 2190 VAL 2190 ? ? ? A . A 1 2191 PRO 2191 ? ? ? A . A 1 2192 GLY 2192 ? ? ? A . A 1 2193 THR 2193 ? ? ? A . A 1 2194 ALA 2194 ? ? ? A . A 1 2195 ASN 2195 ? ? ? A . A 1 2196 THR 2196 ? ? ? A . A 1 2197 SER 2197 ? ? ? A . A 1 2198 VAL 2198 ? ? ? A . A 1 2199 VAL 2199 ? ? ? A . A 1 2200 THR 2200 ? ? ? A . A 1 2201 SER 2201 ? ? ? A . A 1 2202 GLY 2202 ? ? ? A . A 1 2203 GLU 2203 ? ? ? A . A 1 2204 THR 2204 ? ? ? A . A 1 2205 ARG 2205 ? ? ? A . A 1 2206 ARG 2206 ? ? ? A . A 1 2207 GLU 2207 ? ? ? A . A 1 2208 GLU 2208 ? ? ? A . A 1 2209 GLY 2209 ? ? ? A . A 1 2210 ASP 2210 ? ? ? A . A 1 2211 PRO 2211 ? ? ? A . A 1 2212 SER 2212 ? ? ? A . A 1 2213 PRO 2213 ? ? ? A . A 1 2214 HIS 2214 ? ? ? A . A 1 2215 SER 2215 ? ? ? A . A 1 2216 GLY 2216 ? ? ? A . A 1 2217 GLY 2217 ? ? ? A . A 1 2218 VAL 2218 ? ? ? A . A 1 2219 CYS 2219 ? ? ? A . A 1 2220 LYS 2220 ? ? ? A . A 1 2221 PRO 2221 ? ? ? A . A 1 2222 LYS 2222 ? ? ? A . A 1 2223 LEU 2223 ? ? ? A . A 1 2224 ILE 2224 ? ? ? A . A 1 2225 SER 2225 ? ? ? A . A 1 2226 LYS 2226 ? ? ? A . A 1 2227 SER 2227 ? ? ? A . A 1 2228 ASN 2228 ? ? ? A . A 1 2229 SER 2229 ? ? ? A . A 1 2230 ARG 2230 ? ? ? A . A 1 2231 LYS 2231 ? ? ? A . A 1 2232 SER 2232 ? ? ? A . A 1 2233 LYS 2233 ? ? ? A . A 1 2234 SER 2234 ? ? ? A . A 1 2235 PRO 2235 ? ? ? A . A 1 2236 ILE 2236 ? ? ? A . A 1 2237 PRO 2237 ? ? ? A . A 1 2238 GLY 2238 ? ? ? A . A 1 2239 GLN 2239 ? ? ? A . A 1 2240 GLY 2240 ? ? ? A . A 1 2241 TYR 2241 ? ? ? A . A 1 2242 LEU 2242 ? ? ? A . A 1 2243 GLY 2243 ? ? ? A . A 1 2244 THR 2244 ? ? ? A . 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A 1 2315 ARG 2315 ? ? ? A . A 1 2316 ILE 2316 ? ? ? A . A 1 2317 TRP 2317 ? ? ? A . A 1 2318 GLU 2318 ? ? ? A . A 1 2319 ARG 2319 ? ? ? A . A 1 2320 GLU 2320 ? ? ? A . A 1 2321 PRO 2321 ? ? ? A . A 1 2322 ALA 2322 ? ? ? A . A 1 2323 PRO 2323 ? ? ? A . A 1 2324 LEU 2324 ? ? ? A . A 1 2325 LEU 2325 ? ? ? A . A 1 2326 SER 2326 ? ? ? A . A 1 2327 ALA 2327 ? ? ? A . A 1 2328 GLN 2328 ? ? ? A . A 1 2329 TYR 2329 ? ? ? A . A 1 2330 GLU 2330 ? ? ? A . A 1 2331 THR 2331 ? ? ? A . A 1 2332 LEU 2332 ? ? ? A . A 1 2333 SER 2333 ? ? ? A . A 1 2334 ASP 2334 ? ? ? A . A 1 2335 SER 2335 ? ? ? A . A 1 2336 ASP 2336 ? ? ? A . A 1 2337 ASP 2337 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nuclear receptor corepressor 2 {PDB ID=2ltp, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2ltp.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 2ltp, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MHHHHHHSSGRENLYFQGWTEEEMGTAKKGLLEHGRNWSAIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEIL QQHKLKMEKERNARRKKKK ; ;MHHHHHHSSGRENLYFQGWTEEEMGTAKKGLLEHGRNWSAIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEIL QQHKLKMEKERNARRKKKK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 19 85 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2ltp 2024-05-15 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2337 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2337 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.13e-24 67.164 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSSSGYPPNQGAFSTEQSRYPPHSVQYTFPNTRHQQEFAVPDYRSSHLEVSQASQLLQQQQQQQLRRRPSLLSEFHPGSDRPQERRTSYEPFHPGPSPVDHDSLESKRPRLEQVSDSHFQRVSAAVLPLVHPLPEGLRASADAKKDPAFGGKHEAPSSPISGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVPDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDKAEKTEKKEEEKKDEEEKDEKEDSKENTKEKDKIDGTAEETEEREQATPRGRKTANSQGRRKGRITRSMTNEAAAASAAAAAATEEPPPPLPPPPEPISTEPVETSRWTEEEMEVAKKGLVEHGRNWAAIAKMVGTKSEAQCKNFYFNYKRRHNLDNLLQQHKQKTSRKPREERDVSQCESVASTVSAQEDEDIEASNEEENPEDSEGAENSSDTESAPSPSPVEAVKPSEDSPENATSRGNTEPAVELEPTTETAPSTSPSLAVPSTKPAEDESVETQVNDSISAETAEQMDVDQQEHSAEEGSVCDPPPATKADSVDVEVRVPENHASKVEGDNTKERDLDRASEKVEPRDEDLVVAQQINAQRPEPQSDNDSSATCSADEDVDGEPERQRMFPMDSKPSLLNPTGSILVSSPLKPNPLDLPQLQHRAAVIPPMVSCTPCNIPIGTPVSGYALYQRHIKAMHESALLEEQRQRQEQIDLECRSSTSPCGTSKSPNREWEVLQPAPHQVITNLPEGVRLPTTRPTRPPPPLIPSSKTTVASEKPSFIMGGSISQGTPGTYLTSHNQASYTQETPKPSVGSISLGLPRQQESAKSATLPYIKQEEFSPRSQNSQPEGLLVRAQHEGVVRGTAGAIQEGSITRGTPTSKISVESIPSLRGSITQGTPALPQTGIPTEALVKGSISRMPIEDSSPEKGREEAASKGHVIYEGKSGHILSYDNIKNAREGTRSPRTAHEISLKRSYESVEGNIKQGMSMRESPVSAPLEGLICRALPRGSPHSDLKERTVLSGSIMQGTPRATTESFEDGLKYPKQIKRESPPIRAFEGAITKGKPYDGITTIKEMGRSIHEIPRQDILTQESRKTPEVVQSTRPIIEGSISQGTPIKFDNNSGQSAIKHNVKSLITGPSKLSRGMPPLEIVPENIKVVERGKYEDVKAGETVRSRHTSVVSSGPSVLRSTLHEAPKAQLSPGIYDDTSARRTPVSYQNTMSRGSPMMNRTSDVTISSNKSTNHERKSTLTPTQRESIPAKSPVPGVDPVVSHSPFDPHHRGSTAGEVYRSHLPTHLDPAMPFHRALDPAAAAYLFQRQLSPTPGYPSQYQLYAMENTRQTILNDYITSQQMQVNLRPDVARGLSPREQPLGLPYPATRGIIDLTNMPPTILVPHPGGTSTPPMDRITYIPGTQITFPPRPYNSASMSPGHPTHLAAAASAEREREREREKERERERIAAASSDLYLRPGSEQPGRPGSHGYVRSPSPSVRTQETMLQQRPSVFQGTNGTSVITPLDPTAQLRIMPLPAGGPSISQGLPASRYNTAADALAALVDAAASAPQMDVSKTKEISSHRYETPSDAIEVISPASSPAPPQEKLQTYQPEVVKANQAENDPTRQYEGPLHHYRPQQESPSPQQQLPPSSQAEGMGQVPRTHRLITLADHICQIITQDFARNQVSSQTPQQPPTSTFQNSPSALVSTPVRTKTSNRYSPESQAQSVHHQRPGSRVSPENLVDKSRGSRPGKSPERSHVSSEPYEPISPPQVPVVHEKQDSLLLLSQRGAEPAEQRNDARSPGSISYLPSFFTKLENTSPMVKSKKQEIFRKLNSSGGGDSDMAAAQPGTEIFNLPAVTTSGSVSSRGHSFADPASNLGLEDIIRKALMGSFDDKVEDHGVVMSQPMGVVPGTANTSVVTSGETRREEGDPSPHSGGVCKPKLISKSNSRKSKSPIPGQGYLGTERPSSVSSVHSEGDYHRQTPGWAWEDRPSSTGSTQFPYNPLTMRMLSSTPPTPIACAPSAVNQAAPHQQNRIWEREPAPLLSAQYETLSDSDD 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------WTEEEMGTAKKGLLEHGRNWSAIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2ltp.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . TRP 628 628 ? A 1.633 0.118 -0.959 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 2 C CA . TRP 628 628 ? A 2.430 0.054 -2.213 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 3 C C . TRP 628 628 ? A 2.423 -1.365 -2.715 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 4 O O . TRP 628 628 ? A 2.887 -2.252 -2.007 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 5 C CB . TRP 628 628 ? A 3.886 0.544 -1.962 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 6 C CG . TRP 628 628 ? A 4.051 2.036 -1.718 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 7 C CD1 . TRP 628 628 ? A 3.437 2.843 -0.800 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 8 C CD2 . TRP 628 628 ? A 4.880 2.899 -2.515 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 9 N NE1 . TRP 628 628 ? A 3.793 4.152 -0.992 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 10 C CE2 . TRP 628 628 ? A 4.675 4.208 -2.040 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 11 C CE3 . TRP 628 628 ? A 5.734 2.653 -3.591 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 12 C CZ2 . TRP 628 628 ? A 5.311 5.282 -2.624 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 13 C CZ3 . TRP 628 628 ? A 6.369 3.748 -4.190 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 14 C CH2 . TRP 628 628 ? A 6.161 5.042 -3.703 1 1 A TRP 0.660 1 ATOM 15 N N . THR 629 629 ? A 1.837 -1.623 -3.895 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 16 C CA . THR 629 629 ? A 1.822 -2.921 -4.566 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 17 C C . THR 629 629 ? A 3.221 -3.325 -4.985 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 18 O O . THR 629 629 ? A 4.059 -2.469 -5.248 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 19 C CB . THR 629 629 ? A 0.867 -2.904 -5.749 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 20 O OG1 . THR 629 629 ? A -0.437 -2.641 -5.268 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 21 C CG2 . THR 629 629 ? A 0.746 -4.240 -6.488 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 22 N N . GLU 630 630 ? A 3.554 -4.633 -5.063 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 23 C CA . GLU 630 630 ? A 4.880 -5.090 -5.448 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 24 C C . GLU 630 630 ? A 5.394 -4.542 -6.781 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 25 O O . GLU 630 630 ? A 6.583 -4.331 -6.959 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 26 C CB . GLU 630 630 ? A 4.984 -6.621 -5.390 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 27 C CG . GLU 630 630 ? A 4.851 -7.155 -3.947 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 28 C CD . GLU 630 630 ? A 4.835 -8.676 -3.946 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 29 O OE1 . GLU 630 630 ? A 5.902 -9.275 -4.230 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 30 O OE2 . GLU 630 630 ? A 3.745 -9.236 -3.666 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 31 N N . GLU 631 631 ? A 4.492 -4.213 -7.728 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 32 C CA . GLU 631 631 ? A 4.830 -3.542 -8.963 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 33 C C . GLU 631 631 ? A 5.422 -2.147 -8.784 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 34 O O . GLU 631 631 ? A 6.493 -1.845 -9.296 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 35 C CB . GLU 631 631 ? A 3.548 -3.423 -9.804 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 36 C CG . GLU 631 631 ? A 2.779 -4.755 -9.941 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 37 C CD . GLU 631 631 ? A 1.481 -4.532 -10.702 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 38 O OE1 . GLU 631 631 ? A 1.559 -4.267 -11.926 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 39 O OE2 . GLU 631 631 ? A 0.412 -4.610 -10.043 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 40 N N . GLU 632 632 ? A 4.795 -1.255 -7.984 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 41 C CA . GLU 632 632 ? A 5.354 0.059 -7.722 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 42 C C . GLU 632 632 ? A 6.482 0.005 -6.697 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 43 O O . GLU 632 632 ? A 7.387 0.833 -6.706 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 44 C CB . GLU 632 632 ? A 4.248 1.050 -7.277 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 45 C CG . GLU 632 632 ? A 3.589 0.623 -5.946 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 46 C CD . GLU 632 632 ? A 2.427 1.463 -5.431 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 47 O OE1 . GLU 632 632 ? A 2.578 2.694 -5.278 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 48 O OE2 . GLU 632 632 ? A 1.414 0.817 -5.051 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 49 N N . MET 633 633 ? A 6.518 -1.034 -5.831 1 1 A MET 0.750 1 ATOM 50 C CA . MET 633 633 ? A 7.673 -1.349 -5.008 1 1 A MET 0.750 1 ATOM 51 C C . MET 633 633 ? A 8.887 -1.713 -5.845 1 1 A MET 0.750 1 ATOM 52 O O . MET 633 633 ? A 9.984 -1.283 -5.531 1 1 A MET 0.750 1 ATOM 53 C CB . MET 633 633 ? A 7.397 -2.506 -4.018 1 1 A MET 0.750 1 ATOM 54 C CG . MET 633 633 ? A 6.300 -2.222 -2.973 1 1 A MET 0.750 1 ATOM 55 S SD . MET 633 633 ? A 6.875 -1.854 -1.281 1 1 A MET 0.750 1 ATOM 56 C CE . MET 633 633 ? A 7.752 -0.296 -1.590 1 1 A MET 0.750 1 ATOM 57 N N . GLU 634 634 ? A 8.702 -2.469 -6.951 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 58 C CA . GLU 634 634 ? A 9.714 -2.784 -7.942 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 59 C C . GLU 634 634 ? A 10.199 -1.540 -8.672 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 60 O O . GLU 634 634 ? A 11.381 -1.329 -8.890 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 61 C CB . GLU 634 634 ? A 9.190 -3.851 -8.937 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 62 C CG . GLU 634 634 ? A 10.246 -4.417 -9.929 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 63 C CD . GLU 634 634 ? A 11.445 -5.098 -9.266 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 64 O OE1 . GLU 634 634 ? A 12.514 -5.158 -9.937 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 65 O OE2 . GLU 634 634 ? A 11.340 -5.518 -8.088 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 66 N N . VAL 635 635 ? A 9.282 -0.613 -9.011 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 67 C CA . VAL 635 635 ? A 9.628 0.692 -9.559 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 68 C C . VAL 635 635 ? A 10.411 1.542 -8.554 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 69 O O . VAL 635 635 ? A 11.388 2.194 -8.902 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 70 C CB . VAL 635 635 ? A 8.402 1.416 -10.099 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 71 C CG1 . VAL 635 635 ? A 8.772 2.754 -10.764 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 72 C CG2 . VAL 635 635 ? A 7.726 0.556 -11.188 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 73 N N . ALA 636 636 ? A 10.045 1.516 -7.258 1 1 A ALA 0.800 1 ATOM 74 C CA . ALA 636 636 ? A 10.794 2.126 -6.180 1 1 A ALA 0.800 1 ATOM 75 C C . ALA 636 636 ? A 12.138 1.472 -5.928 1 1 A ALA 0.800 1 ATOM 76 O O . ALA 636 636 ? A 13.133 2.151 -5.701 1 1 A ALA 0.800 1 ATOM 77 C CB . ALA 636 636 ? A 9.931 2.153 -4.908 1 1 A ALA 0.800 1 ATOM 78 N N . LYS 637 637 ? A 12.209 0.131 -6.027 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 79 C CA . LYS 637 637 ? A 13.432 -0.631 -6.042 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 80 C C . LYS 637 637 ? A 14.303 -0.216 -7.203 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 81 O O . LYS 637 637 ? A 15.473 0.085 -7.023 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 82 C CB . LYS 637 637 ? A 13.092 -2.145 -6.120 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 83 C CG . LYS 637 637 ? A 14.260 -3.146 -6.181 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 84 C CD . LYS 637 637 ? A 14.774 -3.423 -7.614 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 85 C CE . LYS 637 637 ? A 15.837 -4.504 -7.747 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 86 N NZ . LYS 637 637 ? A 16.923 -4.112 -6.854 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 87 N N . LYS 638 638 ? A 13.751 -0.116 -8.426 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 88 C CA . LYS 638 638 ? A 14.450 0.382 -9.584 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 89 C C . LYS 638 638 ? A 14.926 1.803 -9.398 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 90 O O . LYS 638 638 ? A 16.067 2.126 -9.700 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 91 C CB . LYS 638 638 ? A 13.520 0.292 -10.817 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 92 C CG . LYS 638 638 ? A 14.124 0.737 -12.159 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 93 C CD . LYS 638 638 ? A 15.245 -0.165 -12.698 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 94 C CE . LYS 638 638 ? A 14.763 -1.562 -13.090 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 95 N NZ . LYS 638 638 ? A 15.881 -2.331 -13.674 1 1 A LYS 0.750 1 ATOM 96 N N . GLY 639 639 ? A 14.076 2.678 -8.837 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 97 C CA . GLY 639 639 ? A 14.434 4.050 -8.559 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 98 C C . GLY 639 639 ? A 15.552 4.242 -7.590 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 99 O O . GLY 639 639 ? A 16.506 4.958 -7.877 1 1 A GLY 0.790 1 ATOM 100 N N . LEU 640 640 ? A 15.452 3.601 -6.414 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 101 C CA . LEU 640 640 ? A 16.448 3.687 -5.374 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 102 C C . LEU 640 640 ? A 17.734 2.960 -5.727 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 103 O O . LEU 640 640 ? A 18.796 3.295 -5.212 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 104 C CB . LEU 640 640 ? A 15.866 3.148 -4.045 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 105 C CG . LEU 640 640 ? A 14.817 4.073 -3.392 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 106 C CD1 . LEU 640 640 ? A 14.008 3.347 -2.307 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 107 C CD2 . LEU 640 640 ? A 15.465 5.319 -2.776 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 108 N N . VAL 641 641 ? A 17.694 1.972 -6.648 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 109 C CA . VAL 641 641 ? A 18.906 1.463 -7.274 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 110 C C . VAL 641 641 ? A 19.526 2.476 -8.227 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 111 O O . VAL 641 641 ? A 20.645 2.915 -8.000 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 112 C CB . VAL 641 641 ? A 18.620 0.160 -8.020 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 113 C CG1 . VAL 641 641 ? A 19.753 -0.312 -8.959 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 114 C CG2 . VAL 641 641 ? A 18.363 -0.965 -7.004 1 1 A VAL 0.790 1 ATOM 115 N N . GLU 642 642 ? A 18.809 2.922 -9.284 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 116 C CA . GLU 642 642 ? A 19.412 3.696 -10.356 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 117 C C . GLU 642 642 ? A 19.776 5.133 -10.004 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 118 O O . GLU 642 642 ? A 20.884 5.612 -10.233 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 119 C CB . GLU 642 642 ? A 18.412 3.766 -11.534 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 120 C CG . GLU 642 642 ? A 18.067 2.408 -12.196 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 121 C CD . GLU 642 642 ? A 19.204 1.751 -12.969 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 122 O OE1 . GLU 642 642 ? A 19.584 2.305 -14.030 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 123 O OE2 . GLU 642 642 ? A 19.600 0.630 -12.556 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 124 N N . HIS 643 643 ? A 18.825 5.863 -9.387 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 125 C CA . HIS 643 643 ? A 19.003 7.267 -9.067 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 126 C C . HIS 643 643 ? A 19.557 7.418 -7.662 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 127 O O . HIS 643 643 ? A 19.863 8.514 -7.194 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 128 C CB . HIS 643 643 ? A 17.650 8.010 -9.073 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 129 C CG . HIS 643 643 ? A 16.895 7.909 -10.351 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 130 N ND1 . HIS 643 643 ? A 17.139 8.802 -11.370 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 131 C CD2 . HIS 643 643 ? A 15.928 7.031 -10.714 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 132 C CE1 . HIS 643 643 ? A 16.318 8.446 -12.336 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 133 N NE2 . HIS 643 643 ? A 15.560 7.378 -11.992 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 134 N N . GLY 644 644 ? A 19.710 6.288 -6.943 1 1 A GLY 0.820 1 ATOM 135 C CA . GLY 644 644 ? A 20.172 6.265 -5.570 1 1 A GLY 0.820 1 ATOM 136 C C . GLY 644 644 ? A 19.172 6.794 -4.581 1 1 A GLY 0.820 1 ATOM 137 O O . GLY 644 644 ? A 17.968 6.707 -4.766 1 1 A GLY 0.820 1 ATOM 138 N N . ARG 645 645 ? A 19.636 7.384 -3.467 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 139 C CA . ARG 645 645 ? A 18.738 7.846 -2.421 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 140 C C . ARG 645 645 ? A 18.369 9.316 -2.600 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 141 O O . ARG 645 645 ? A 18.003 9.996 -1.648 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 142 C CB . ARG 645 645 ? A 19.365 7.627 -1.019 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 143 C CG . ARG 645 645 ? A 19.768 6.162 -0.750 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 144 C CD . ARG 645 645 ? A 20.614 5.921 0.506 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 145 N NE . ARG 645 645 ? A 19.734 6.060 1.703 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 146 C CZ . ARG 645 645 ? A 20.169 5.876 2.958 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 147 N NH1 . ARG 645 645 ? A 21.449 5.648 3.228 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 148 N NH2 . ARG 645 645 ? A 19.306 5.918 3.969 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 149 N N . ASN 646 646 ? A 18.467 9.862 -3.834 1 1 A ASN 0.770 1 ATOM 150 C CA . ASN 646 646 ? A 18.064 11.221 -4.134 1 1 A ASN 0.770 1 ATOM 151 C C . ASN 646 646 ? A 16.545 11.336 -4.123 1 1 A ASN 0.770 1 ATOM 152 O O . ASN 646 646 ? A 15.893 11.078 -5.130 1 1 A ASN 0.770 1 ATOM 153 C CB . ASN 646 646 ? A 18.639 11.649 -5.518 1 1 A ASN 0.770 1 ATOM 154 C CG . ASN 646 646 ? A 18.293 13.094 -5.861 1 1 A ASN 0.770 1 ATOM 155 O OD1 . ASN 646 646 ? A 17.294 13.377 -6.521 1 1 A ASN 0.770 1 ATOM 156 N ND2 . ASN 646 646 ? A 19.113 14.054 -5.384 1 1 A ASN 0.770 1 ATOM 157 N N . TRP 647 647 ? A 15.951 11.753 -2.983 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 158 C CA . TRP 647 647 ? A 14.522 11.725 -2.742 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 159 C C . TRP 647 647 ? A 13.699 12.474 -3.776 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 160 O O . TRP 647 647 ? A 12.606 12.045 -4.131 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 161 C CB . TRP 647 647 ? A 14.200 12.233 -1.310 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 162 C CG . TRP 647 647 ? A 15.075 11.677 -0.188 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 163 C CD1 . TRP 647 647 ? A 15.835 12.394 0.692 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 164 C CD2 . TRP 647 647 ? A 15.297 10.290 0.130 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 165 N NE1 . TRP 647 647 ? A 16.511 11.551 1.550 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 166 C CE2 . TRP 647 647 ? A 16.197 10.251 1.215 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 167 C CE3 . TRP 647 647 ? A 14.807 9.118 -0.429 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 168 C CZ2 . TRP 647 647 ? A 16.613 9.035 1.749 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 169 C CZ3 . TRP 647 647 ? A 15.202 7.896 0.126 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 170 C CH2 . TRP 647 647 ? A 16.099 7.851 1.197 1 1 A TRP 0.670 1 ATOM 171 N N . ALA 648 648 ? A 14.254 13.577 -4.321 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 172 C CA . ALA 648 648 ? A 13.684 14.353 -5.392 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 173 C C . ALA 648 648 ? A 13.470 13.560 -6.677 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 174 O O . ALA 648 648 ? A 12.385 13.581 -7.249 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 175 C CB . ALA 648 648 ? A 14.632 15.533 -5.692 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 176 N N . ALA 649 649 ? A 14.480 12.798 -7.151 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 177 C CA . ALA 649 649 ? A 14.364 11.926 -8.301 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 178 C C . ALA 649 649 ? A 13.400 10.777 -8.087 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 179 O O . ALA 649 649 ? A 12.551 10.492 -8.928 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 180 C CB . ALA 649 649 ? A 15.755 11.372 -8.661 1 1 A ALA 0.790 1 ATOM 181 N N . ILE 650 650 ? A 13.461 10.116 -6.915 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 182 C CA . ILE 650 650 ? A 12.561 9.018 -6.601 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 183 C C . ILE 650 650 ? A 11.123 9.478 -6.516 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 184 O O . ILE 650 650 ? A 10.235 8.919 -7.147 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 185 C CB . ILE 650 650 ? A 12.920 8.334 -5.295 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 186 C CG1 . ILE 650 650 ? A 14.431 8.090 -5.148 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 187 C CG2 . ILE 650 650 ? A 12.159 6.996 -5.144 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 188 C CD1 . ILE 650 650 ? A 15.051 7.317 -6.308 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 189 N N . ALA 651 651 ? A 10.855 10.583 -5.802 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 190 C CA . ALA 651 651 ? A 9.521 11.093 -5.641 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 191 C C . ALA 651 651 ? A 8.963 11.775 -6.879 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 192 O O . ALA 651 651 ? A 7.762 12.000 -6.972 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 193 C CB . ALA 651 651 ? A 9.515 12.104 -4.500 1 1 A ALA 0.770 1 ATOM 194 N N . LYS 652 652 ? A 9.807 12.102 -7.872 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 195 C CA . LYS 652 652 ? A 9.356 12.448 -9.202 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 196 C C . LYS 652 652 ? A 9.091 11.233 -10.080 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 197 O O . LYS 652 652 ? 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A 8.382 7.669 -8.876 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 212 C CA . VAL 654 654 ? A 7.317 6.842 -8.332 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 213 C C . VAL 654 654 ? A 6.160 7.669 -7.824 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 214 O O . VAL 654 654 ? A 4.999 7.306 -7.980 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 215 C CB . VAL 654 654 ? A 7.793 5.884 -7.241 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 216 C CG1 . VAL 654 654 ? A 8.865 4.979 -7.848 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 217 C CG2 . VAL 654 654 ? A 8.366 6.555 -5.981 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 218 N N . GLY 655 655 ? A 6.458 8.828 -7.199 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 219 C CA . GLY 655 655 ? A 5.440 9.658 -6.562 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 220 C C . GLY 655 655 ? A 4.796 10.683 -7.453 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 221 O O . GLY 655 655 ? A 3.659 11.087 -7.241 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 222 N N . THR 656 656 ? A 5.569 11.143 -8.453 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 223 C CA . THR 656 656 ? A 5.197 12.028 -9.546 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 224 C C . THR 656 656 ? A 4.774 13.420 -9.096 1 1 A THR 0.620 1 ATOM 225 O O . THR 656 656 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.692 2 1 3 0.035 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 628 TRP 1 0.660 2 1 A 629 THR 1 0.650 3 1 A 630 GLU 1 0.670 4 1 A 631 GLU 1 0.670 5 1 A 632 GLU 1 0.700 6 1 A 633 MET 1 0.750 7 1 A 634 GLU 1 0.710 8 1 A 635 VAL 1 0.750 9 1 A 636 ALA 1 0.800 10 1 A 637 LYS 1 0.750 11 1 A 638 LYS 1 0.750 12 1 A 639 GLY 1 0.790 13 1 A 640 LEU 1 0.800 14 1 A 641 VAL 1 0.790 15 1 A 642 GLU 1 0.760 16 1 A 643 HIS 1 0.770 17 1 A 644 GLY 1 0.820 18 1 A 645 ARG 1 0.700 19 1 A 646 ASN 1 0.770 20 1 A 647 TRP 1 0.670 21 1 A 648 ALA 1 0.770 22 1 A 649 ALA 1 0.790 23 1 A 650 ILE 1 0.770 24 1 A 651 ALA 1 0.770 25 1 A 652 LYS 1 0.610 26 1 A 653 MET 1 0.630 27 1 A 654 VAL 1 0.700 28 1 A 655 GLY 1 0.710 29 1 A 656 THR 1 0.620 30 1 A 657 LYS 1 0.580 31 1 A 658 SER 1 0.670 32 1 A 659 GLU 1 0.680 33 1 A 660 ALA 1 0.770 34 1 A 661 GLN 1 0.700 35 1 A 662 CYS 1 0.790 36 1 A 663 LYS 1 0.710 37 1 A 664 ASN 1 0.720 38 1 A 665 PHE 1 0.710 39 1 A 666 TYR 1 0.600 40 1 A 667 PHE 1 0.620 41 1 A 668 ASN 1 0.620 42 1 A 669 TYR 1 0.590 43 1 A 670 LYS 1 0.530 44 1 A 671 ARG 1 0.540 45 1 A 672 ARG 1 0.590 46 1 A 673 HIS 1 0.660 47 1 A 674 ASN 1 0.740 48 1 A 675 LEU 1 0.760 49 1 A 676 ASP 1 0.760 50 1 A 677 ASN 1 0.760 51 1 A 678 LEU 1 0.790 52 1 A 679 LEU 1 0.800 53 1 A 680 GLN 1 0.780 54 1 A 681 GLN 1 0.760 55 1 A 682 HIS 1 0.730 56 1 A 683 LYS 1 0.750 57 1 A 684 GLN 1 0.720 58 1 A 685 LYS 1 0.700 59 1 A 686 THR 1 0.660 60 1 A 687 SER 1 0.680 61 1 A 688 ARG 1 0.600 62 1 A 689 LYS 1 0.620 63 1 A 690 PRO 1 0.590 64 1 A 691 ARG 1 0.520 65 1 A 692 GLU 1 0.590 66 1 A 693 GLU 1 0.480 67 1 A 694 ARG 1 0.390 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #