data_SMR-8152a71e90ecc3d6fdbb8c4d2fd22b5f_7 _entry.id SMR-8152a71e90ecc3d6fdbb8c4d2fd22b5f_7 _struct.entry_id SMR-8152a71e90ecc3d6fdbb8c4d2fd22b5f_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8NG31/ KNL1_HUMAN, Outer kinetochore KNL1 complex subunit KNL1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8NG31' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' UNK 'L-peptide linking' UNKNOWN . . 'CCD local' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 307898.585 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KNL1_HUMAN Q8NG31 1 ;MDGVSSEANEENDNIERPVRRRHSSILKPPRSPLQDLRGGNERVQESNALRNKKNSRRVSFADTIKVFQT ESHMKIVRKSEMEGCSAMVPSQLQLLPPGFKRFSCLSLPETETGENLLLIQNKKLEDNYCEITGMNTLLS APIHTQMQQKEFSIIEHTRERKHANDQTVIFSDENQMDLTSSHTVMITKGLLDNPISEKSTKIDTTSFLA NLKLHTEDSRMKKEVNFSVDQNTSSENKIDFNDFIKRLKTGKCSAFPDVPDKENFEIPIYSKEPNSASST HQMHVSLKEDENNSNITRLFREKDDGMNFTQCHTANIQTLIPTSSETNSRESKGNDITIYGNDFMDLTFN HTLQILPATGNFSEIENQTQNAMDVTTGYGTKASGNKTVFKSKQNTAFQDLSINSADKIHITRSHIMGAE THIVSQTCNQDARILAMTPESIYSNPSIQGCKTVFYSSCNDAMEMTKCLSNMREEKNLLKHDSNYAKMYC NPDAMSSLTEKTIYSGEENMDITKSHTVAIDNQIFKQDQSNVQIAAAPTPEKEMMLQNLMTTSEDGKMNV NCNSVPHVSKERIQQSLSNPLSISLTDRKTELLSGENMDLTESHTSNLGSQVPLAAYNLAPESTSESHSQ SKSSSDECEEITKSRNEPFQRSDIIAKNSLTDTWNKDKDWVLKILPYLDKDSPQSADCNQEIATSHNIVY CGGVLDKQITNRNTVSWEQSLFSTTKPLFSSGQFSMKNHDTAISSHTVKSVLGQNSKLAEPLRKSLSNPT PDYCHDKMIICSEEEQNMDLTKSHTVVIGFGPSELQELGKTNLEHTTGQLTTMNRQIAVKVEKCGKSPIE KSGVLKSNCIMDVLEDESVQKPKFPKEKQNVKIWGRKSVGGPKIDKTIVFSEDDKNDMDITKSYTIEINH RPLLEKRDCHLVPLAGTSETILYTCRQDDMEITRSHTTALECKTVSPDEITTRPMDKTVVFVDNHVELEM TESHTVFIDYQEKERTDRPNFELSQRKSLGTPTVICTPTEESVFFPGNGESDRLVANDSQLTPLEEWSNN RGPVEVADNMELSKSATCKNIKDVQSPGFLNEPLSSKSQRRKSLKLKNDKTIVFSENHKNDMDITQSCMV EIDNESALEDKEDFHLAGASKTILYSCGQDDMEITRSHTTALECKTLLPNEIAIRPMDKTVLFTDNYSDL EVTDSHTVFIDCQATEKILEENPKFGIGKGKNLGVSFPKDNSCVQEIAEKQALAVGNKIVLHTEQKQQLF AATNRTTNEIIKFHSAAMDEKVIGKVVDQACTLEKAQVESCQLNNRDRRNVDFTSSHATAVCGSSDNYSC LPNVISCTDNLEGSAMLLCDKDEEKANYCPVQNDLAYANDFASEYYLESEGQPLSAPCPLLEKEEVIQTS TKGQLDCVITLHKDQDLIKDPRNLLANQTLVYSQDLGEMTKLNSKRVSFKLPKDQMKVYVDDIYVIPQPH FSTDQPPLPKKGQSSINKEEVILSKAGNKSLNIIENSSAPICENKPKILNSEEWFAAACKKELKENIQTT NYNTALDFHSNSDVTKQVIQTHVNAGEAPDPVITSNVPCFHSIKPNLNNLNGKTGEFLAFQTVHLPPLPE QLLELGNKAHNDMHIVQATEIHNINIISSNAKDSRDEENKKSHNGAETTSLPPKTVFKDKVRRCSLGIFL PRLPNKRNCSVTGIDDLEQIPADTTDINHLETQPVSSKDSGIGSVAGKLNLSPSQYINEENLPVYPDEIN SSDSINIETEEKALIETYQKEISPYENKMGKTCNSQKRTWVQEEEDIHKEKKIRKNEIKFSDTTQDREIF DHHTEEDIDKSANSVLIKNLSRTPSSCSSSLDSIKADGTSLDFSTYRSSQMESQFLRDTICEESLREKLQ DGRITIREFFILLQVHILIQKPRQSNLPGNFTVNTPPTPEDLMLSQYVYRPKIQIYREDCEARRQKIEEL KLSASNQDKLLVDINKNLWEKMRHCSDKELKAFGIYLNKIKSCFTKMTKVFTHQGKVALYGKLVQSAQNE REKLQIKIDEMDKILKKIDNCLTEMETETKNLEDEEKNNPVEEWDSEMRAAEKELEQLKTEEEELQRNLL ELEVQKEQTLAQIDFMQKQRNRTEELLDQLSLSEWDVVEWSDDQAVFTFVYDTIQLTITFEESVVGFPFL DKRYRKIVDVNFQSLLDEDQAPPSSLLVHKLIFQYVEEKESWKKTCTTQHQLPKMLEEFSLVVHHCRLLG EEIEYLKRWGPNYNLMNIDINNNELRLLFSSSAAFAKFEITLFLSAYYPSVPLPSTIQNHVGNTSQDDIA TILSKVPLENNYLKNVVKQIYQDLFQDCHFYH ; 'Outer kinetochore KNL1 complex subunit KNL1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2342 1 2342 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . KNL1_HUMAN Q8NG31 . 1 2342 9606 'Homo sapiens (Human)' 2009-02-10 8E29150CA4F5B5C1 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no Q ;MDGVSSEANEENDNIERPVRRRHSSILKPPRSPLQDLRGGNERVQESNALRNKKNSRRVSFADTIKVFQT ESHMKIVRKSEMEGCSAMVPSQLQLLPPGFKRFSCLSLPETETGENLLLIQNKKLEDNYCEITGMNTLLS APIHTQMQQKEFSIIEHTRERKHANDQTVIFSDENQMDLTSSHTVMITKGLLDNPISEKSTKIDTTSFLA NLKLHTEDSRMKKEVNFSVDQNTSSENKIDFNDFIKRLKTGKCSAFPDVPDKENFEIPIYSKEPNSASST HQMHVSLKEDENNSNITRLFREKDDGMNFTQCHTANIQTLIPTSSETNSRESKGNDITIYGNDFMDLTFN HTLQILPATGNFSEIENQTQNAMDVTTGYGTKASGNKTVFKSKQNTAFQDLSINSADKIHITRSHIMGAE THIVSQTCNQDARILAMTPESIYSNPSIQGCKTVFYSSCNDAMEMTKCLSNMREEKNLLKHDSNYAKMYC NPDAMSSLTEKTIYSGEENMDITKSHTVAIDNQIFKQDQSNVQIAAAPTPEKEMMLQNLMTTSEDGKMNV NCNSVPHVSKERIQQSLSNPLSISLTDRKTELLSGENMDLTESHTSNLGSQVPLAAYNLAPESTSESHSQ 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Q . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=7uti, label_asym_id=Q, auth_asym_id=e, SMTL ID=7uti.1.Q}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7uti, label_asym_id=Q' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A Q 2 1 e # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;(UNK)MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALK DAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQ KDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLK SLEAQAEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELD HALNDMTSI ; ;XMDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQE KLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEE KMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEA QAEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALN DMTSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 11 122 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7uti 2022-09-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2342 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2351 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.800 13.592 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDGVSSEANEENDNIERPVRRRHSSILKPPRSPLQDLRGGNERVQESNALRNKKNSRRVSFADTIKVFQTESHMKIVRKSEMEGCSAMVPSQLQLLPPGFKRFSCLSLPETETGENLLLIQNKKLEDNYCEITGMNTLLSAPIHTQMQQKEFSIIEHTRERKHANDQTVIFSDENQMDLTSSHTVMITKGLLDNPISEKSTKIDTTSFLANLKLHTEDSRMKKEVNFSVDQNTSSENKIDFNDFIKRLKTGKCSAFPDVPDKENFEIPIYSKEPNSASSTHQMHVSLKEDENNSNITRLFREKDDGMNFTQCHTANIQTLIPTSSETNSRESKGNDITIYGNDFMDLTFNHTLQILPATGNFSEIENQTQNAMDVTTGYGTKASGNKTVFKSKQNTAFQDLSINSADKIHITRSHIMGAETHIVSQTCNQDARILAMTPESIYSNPSIQGCKTVFYSSCNDAMEMTKCLSNMREEKNLLKHDSNYAKMYCNPDAMSSLTEKTIYSGEENMDITKSHTVAIDNQIFKQDQSNVQIAAAPTPEKEMMLQNLMTTSEDGKMNVNCNSVPHVSKERIQQSLSNPLSISLTDRKTELLSGENMDLTESHTSNLGSQVPLAAYNLAPESTSESHSQSKSSSDECEEITKSRNEPFQRSDIIAKNSLTDTWNKDKDWVLKILPYLDKDSPQSADCNQEIATSHNIVYCGGVLDKQITNRNTVSWEQSLFSTTKPLFSSGQFSMKNHDTAISSHTVKSVLGQNSKLAEPLRKSLSNPTPDYCHDKMIICSEEEQNMDLTKSHTVVIGFGPSELQELGKTNLEHTTGQLTTMNRQIAVKVEKCGKSPIEKSGVLKSNCIMDVLEDESVQKPKFPKEKQNVKIWGRKSVGGPKIDKTIVFSEDDKNDMDITKSYTIEINHRPLLEKRDCHLVPLAGTSETILYTCRQDDMEITRSHTTALECKTVSPDEITTRPMDKTVVFVDNHVELEMTESHTVFIDYQEKERTDRPNFELSQRKSLGTPTVICTPTEESVFFPGNGESDRLVANDSQLTPLEEWSNNRGPVEVADNMELSKSATCKNIKDVQSPGFLNEPLSSKSQRRKSLKLKNDKTIVFSENHKNDMDITQSCMVEIDNESALEDKEDFHLAGASKTILYSCGQDDMEITRSHTTALECKTLLPNEIAIRPMDKTVLFTDNYSDLEVTDSHTVFIDCQATEKILEENPKFGIGKGKNLGVSFPKDNSCVQEIAEKQALAVGNKIVLHTEQKQQLFAATNRTTNEIIKFHSAAMDEKVIGKVVDQACTLEKAQVESCQLNNRDRRNVDFTSSHATAVCGSSDNYSCLPNVISCTDNLEGSAMLLCDKDEEKANYCPVQNDLAYANDFASEYYLESEGQPLSAPCPLLEKEEVIQTSTKGQLDCVITLHKDQDLIKDPRNLLANQTLVYSQDLGEMTKLNSKRVSFKLPKDQMKVYVDDIYVIPQPHFSTDQPPLPKKGQSSINKEEVILSKAGNKSLNIIENSSAPICENKPKILNSEEWFAAACKKELKENIQTTNYNTALDFHSNSDVTKQVIQTHVNAGEAPDPVITSNVPCFHSIKPNLNNLNGKTGEFLAFQTVHLPPLPEQLLELGNKAHNDMHIVQATEIHNINIISSNAKDSRDEENKKSHNGAETTSLPPKTVFKDKVRRCSLGIFLPRLPNKRNCSVTGIDDLEQIPADTTDINHLETQPVSSKDSGIGSVAGKLNLSPSQYINEENLPVYPDEINSSDSINIETEEKALIETYQKEISPYENKMGKTCNSQKRTWVQEEEDIHKEKKIRKNEIKFSDTTQDREIFDHHTEEDIDKSANSVLIKNLSRTPSSCSSSLDSIKADGTSLDFSTYRSSQMESQFLRDTICEESLREKLQDGRITIREFFILLQVHILIQKPRQSNLPGNFTVNTPPTPEDLMLSQYVYRPKIQIYREDCEARRQKIEELKLSASNQDKLLVDINKNLWEKMRHCSDKELKAFGIYLNKIKSCFTKMTKVFTHQGKVALYGKLVQSAQNEREKLQIKIDEMDKILKKIDNCLTEMETETKNLEDEEK--NNPVEEW-------DSEMRAAEKELEQLKTEEEELQRNLLELEVQKEQTLAQIDFMQKQRNRTEELLDQLSLSEWDVVEWSDDQAVFTFVYDTIQLTITFEESVVGFPFLDKRYRKIVDVNFQSLLDEDQAPPSSLLVHKLIFQYVEEKESWKKTCTTQHQLPKMLEEFSLVVHHCRLLGEEIEYLKRWGPNYNLMNIDINNNELRLLFSSSAAFAKFEITLFLSAYYPSVPLPSTIQNHVGNTSQDDIATILSKVPLENNYLKNVVKQIYQDLFQDCHFYH 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAAD---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.050}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7uti.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 2034 2034 ? A 242.649 264.695 -12.632 1 1 Q LEU 0.690 1 ATOM 2 C CA . LEU 2034 2034 ? A 241.299 265.000 -12.051 1 1 Q LEU 0.690 1 ATOM 3 C C . LEU 2034 2034 ? A 240.799 263.883 -11.157 1 1 Q LEU 0.690 1 ATOM 4 O O . LEU 2034 2034 ? A 240.656 264.116 -9.970 1 1 Q LEU 0.690 1 ATOM 5 C CB . LEU 2034 2034 ? A 240.294 265.390 -13.158 1 1 Q LEU 0.690 1 ATOM 6 C CG . LEU 2034 2034 ? A 238.904 265.862 -12.664 1 1 Q LEU 0.690 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 2034 2034 ? A 238.937 267.095 -11.744 1 1 Q LEU 0.690 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 2034 2034 ? A 237.988 266.132 -13.866 1 1 Q LEU 0.690 1 ATOM 9 N N . GLN 2035 2035 ? A 240.615 262.641 -11.672 1 1 Q GLN 0.590 1 ATOM 10 C CA . GLN 2035 2035 ? A 240.108 261.503 -10.905 1 1 Q GLN 0.590 1 ATOM 11 C C . GLN 2035 2035 ? A 240.842 261.247 -9.591 1 1 Q GLN 0.590 1 ATOM 12 O O . GLN 2035 2035 ? A 240.210 261.135 -8.557 1 1 Q GLN 0.590 1 ATOM 13 C CB . GLN 2035 2035 ? A 240.106 260.233 -11.797 1 1 Q GLN 0.590 1 ATOM 14 C CG . GLN 2035 2035 ? A 239.178 259.100 -11.296 1 1 Q GLN 0.590 1 ATOM 15 C CD . GLN 2035 2035 ? A 237.733 259.595 -11.309 1 1 Q GLN 0.590 1 ATOM 16 O OE1 . GLN 2035 2035 ? A 237.287 260.162 -12.312 1 1 Q GLN 0.590 1 ATOM 17 N NE2 . GLN 2035 2035 ? A 236.998 259.431 -10.191 1 1 Q GLN 0.590 1 ATOM 18 N N . ILE 2036 2036 ? A 242.194 261.295 -9.577 1 1 Q ILE 0.530 1 ATOM 19 C CA . ILE 2036 2036 ? A 243.000 261.167 -8.357 1 1 Q ILE 0.530 1 ATOM 20 C C . ILE 2036 2036 ? A 242.605 262.156 -7.257 1 1 Q ILE 0.530 1 ATOM 21 O O . ILE 2036 2036 ? A 242.348 261.770 -6.122 1 1 Q ILE 0.530 1 ATOM 22 C CB . ILE 2036 2036 ? A 244.487 261.325 -8.703 1 1 Q ILE 0.530 1 ATOM 23 C CG1 . ILE 2036 2036 ? A 244.933 260.183 -9.650 1 1 Q ILE 0.530 1 ATOM 24 C CG2 . ILE 2036 2036 ? A 245.361 261.357 -7.427 1 1 Q ILE 0.530 1 ATOM 25 C CD1 . ILE 2036 2036 ? A 246.321 260.381 -10.271 1 1 Q ILE 0.530 1 ATOM 26 N N . LYS 2037 2037 ? A 242.460 263.456 -7.601 1 1 Q LYS 0.550 1 ATOM 27 C CA . LYS 2037 2037 ? A 242.008 264.497 -6.690 1 1 Q LYS 0.550 1 ATOM 28 C C . LYS 2037 2037 ? A 240.594 264.272 -6.184 1 1 Q LYS 0.550 1 ATOM 29 O O . LYS 2037 2037 ? A 240.315 264.476 -5.008 1 1 Q LYS 0.550 1 ATOM 30 C CB . LYS 2037 2037 ? A 242.073 265.900 -7.348 1 1 Q LYS 0.550 1 ATOM 31 C CG . LYS 2037 2037 ? A 243.506 266.397 -7.595 1 1 Q LYS 0.550 1 ATOM 32 C CD . LYS 2037 2037 ? A 243.552 267.799 -8.231 1 1 Q LYS 0.550 1 ATOM 33 C CE . LYS 2037 2037 ? A 244.977 268.330 -8.427 1 1 Q LYS 0.550 1 ATOM 34 N NZ . LYS 2037 2037 ? A 244.956 269.669 -9.066 1 1 Q LYS 0.550 1 ATOM 35 N N . ILE 2038 2038 ? A 239.670 263.826 -7.063 1 1 Q ILE 0.570 1 ATOM 36 C CA . ILE 2038 2038 ? A 238.315 263.424 -6.688 1 1 Q ILE 0.570 1 ATOM 37 C C . ILE 2038 2038 ? A 238.358 262.288 -5.670 1 1 Q ILE 0.570 1 ATOM 38 O O . ILE 2038 2038 ? A 237.851 262.433 -4.564 1 1 Q ILE 0.570 1 ATOM 39 C CB . ILE 2038 2038 ? A 237.487 263.039 -7.924 1 1 Q ILE 0.570 1 ATOM 40 C CG1 . ILE 2038 2038 ? A 237.248 264.270 -8.831 1 1 Q ILE 0.570 1 ATOM 41 C CG2 . ILE 2038 2038 ? A 236.144 262.383 -7.531 1 1 Q ILE 0.570 1 ATOM 42 C CD1 . ILE 2038 2038 ? A 236.706 263.925 -10.224 1 1 Q ILE 0.570 1 ATOM 43 N N . ASP 2039 2039 ? A 239.084 261.189 -5.965 1 1 Q ASP 0.630 1 ATOM 44 C CA . ASP 2039 2039 ? A 239.221 260.045 -5.085 1 1 Q ASP 0.630 1 ATOM 45 C C . ASP 2039 2039 ? A 239.842 260.407 -3.717 1 1 Q ASP 0.630 1 ATOM 46 O O . ASP 2039 2039 ? A 239.394 259.938 -2.670 1 1 Q ASP 0.630 1 ATOM 47 C CB . ASP 2039 2039 ? A 240.063 258.917 -5.760 1 1 Q ASP 0.630 1 ATOM 48 C CG . ASP 2039 2039 ? A 239.555 258.377 -7.104 1 1 Q ASP 0.630 1 ATOM 49 O OD1 . ASP 2039 2039 ? A 238.421 258.678 -7.553 1 1 Q ASP 0.630 1 ATOM 50 O OD2 . ASP 2039 2039 ? A 240.359 257.616 -7.708 1 1 Q ASP 0.630 1 ATOM 51 N N . GLU 2040 2040 ? A 240.882 261.272 -3.673 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 52 C CA . GLU 2040 2040 ? A 241.455 261.823 -2.446 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 53 C C . GLU 2040 2040 ? A 240.484 262.662 -1.635 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 54 O O . GLU 2040 2040 ? A 240.367 262.492 -0.419 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 55 C CB . GLU 2040 2040 ? A 242.685 262.707 -2.749 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 56 C CG . GLU 2040 2040 ? A 243.913 261.912 -3.247 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 57 C CD . GLU 2040 2040 ? A 245.074 262.809 -3.687 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 58 O OE1 . GLU 2040 2040 ? A 244.903 264.054 -3.756 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 59 O OE2 . GLU 2040 2040 ? A 246.151 262.226 -3.976 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 60 N N . MET 2041 2041 ? A 239.727 263.562 -2.295 1 1 Q MET 0.600 1 ATOM 61 C CA . MET 2041 2041 ? A 238.669 264.328 -1.664 1 1 Q MET 0.600 1 ATOM 62 C C . MET 2041 2041 ? A 237.576 263.423 -1.103 1 1 Q MET 0.600 1 ATOM 63 O O . MET 2041 2041 ? A 237.247 263.519 0.075 1 1 Q MET 0.600 1 ATOM 64 C CB . MET 2041 2041 ? A 238.066 265.375 -2.635 1 1 Q MET 0.600 1 ATOM 65 C CG . MET 2041 2041 ? A 239.032 266.532 -2.971 1 1 Q MET 0.600 1 ATOM 66 S SD . MET 2041 2041 ? 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A 233.714 256.683 14.497 1 1 Q GLU 0.610 1 ATOM 171 O OE1 . GLU 2054 2054 ? A 234.568 257.518 14.889 1 1 Q GLU 0.610 1 ATOM 172 O OE2 . GLU 2054 2054 ? A 234.005 255.586 13.947 1 1 Q GLU 0.610 1 ATOM 173 N N . MET 2055 2055 ? A 230.465 260.895 16.424 1 1 Q MET 0.590 1 ATOM 174 C CA . MET 2055 2055 ? A 230.175 261.980 17.350 1 1 Q MET 0.590 1 ATOM 175 C C . MET 2055 2055 ? A 228.680 262.183 17.598 1 1 Q MET 0.590 1 ATOM 176 O O . MET 2055 2055 ? A 228.246 262.323 18.736 1 1 Q MET 0.590 1 ATOM 177 C CB . MET 2055 2055 ? A 230.817 263.315 16.880 1 1 Q MET 0.590 1 ATOM 178 C CG . MET 2055 2055 ? A 232.362 263.345 16.934 1 1 Q MET 0.590 1 ATOM 179 S SD . MET 2055 2055 ? A 233.107 263.027 18.561 1 1 Q MET 0.590 1 ATOM 180 C CE . MET 2055 2055 ? A 232.501 264.506 19.412 1 1 Q MET 0.590 1 ATOM 181 N N . GLU 2056 2056 ? A 227.822 262.151 16.559 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 182 C CA . GLU 2056 2056 ? A 226.373 262.200 16.714 1 1 Q GLU 0.620 1 ATOM 183 C C . GLU 2056 2056 ? 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A 196.590 237.531 129.143 1 1 Q ASP 0.510 1 ATOM 795 O O . ASP 2128 2128 ? A 196.980 238.526 129.811 1 1 Q ASP 0.510 1 ATOM 796 C CB . ASP 2128 2128 ? A 196.978 236.975 126.711 1 1 Q ASP 0.510 1 ATOM 797 C CG . ASP 2128 2128 ? A 196.458 236.822 125.288 1 1 Q ASP 0.510 1 ATOM 798 O OD1 . ASP 2128 2128 ? A 195.218 236.804 125.072 1 1 Q ASP 0.510 1 ATOM 799 O OD2 . ASP 2128 2128 ? A 197.330 236.635 124.396 1 1 Q ASP 0.510 1 ATOM 800 O OXT . ASP 2128 2128 ? A 196.636 236.350 129.602 1 1 Q ASP 0.510 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.603 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2034 LEU 1 0.690 2 1 A 2035 GLN 1 0.590 3 1 A 2036 ILE 1 0.530 4 1 A 2037 LYS 1 0.550 5 1 A 2038 ILE 1 0.570 6 1 A 2039 ASP 1 0.630 7 1 A 2040 GLU 1 0.620 8 1 A 2041 MET 1 0.600 9 1 A 2042 ASP 1 0.640 10 1 A 2043 LYS 1 0.650 11 1 A 2044 ILE 1 0.620 12 1 A 2045 LEU 1 0.620 13 1 A 2046 LYS 1 0.640 14 1 A 2047 LYS 1 0.630 15 1 A 2048 ILE 1 0.620 16 1 A 2049 ASP 1 0.620 17 1 A 2050 ASN 1 0.630 18 1 A 2051 CYS 1 0.610 19 1 A 2052 LEU 1 0.610 20 1 A 2053 THR 1 0.630 21 1 A 2054 GLU 1 0.610 22 1 A 2055 MET 1 0.590 23 1 A 2056 GLU 1 0.620 24 1 A 2057 THR 1 0.630 25 1 A 2058 GLU 1 0.600 26 1 A 2059 THR 1 0.620 27 1 A 2060 LYS 1 0.600 28 1 A 2061 ASN 1 0.600 29 1 A 2062 LEU 1 0.580 30 1 A 2063 GLU 1 0.560 31 1 A 2064 ASP 1 0.580 32 1 A 2065 GLU 1 0.620 33 1 A 2066 GLU 1 0.390 34 1 A 2067 LYS 1 0.460 35 1 A 2068 ASN 1 0.490 36 1 A 2069 ASN 1 0.490 37 1 A 2070 PRO 1 0.460 38 1 A 2071 VAL 1 0.460 39 1 A 2072 GLU 1 0.460 40 1 A 2073 GLU 1 0.460 41 1 A 2074 TRP 1 0.200 42 1 A 2075 ASP 1 0.400 43 1 A 2076 SER 1 0.350 44 1 A 2077 GLU 1 0.250 45 1 A 2078 MET 1 0.300 46 1 A 2079 ARG 1 0.540 47 1 A 2080 ALA 1 0.590 48 1 A 2081 ALA 1 0.610 49 1 A 2082 GLU 1 0.590 50 1 A 2083 LYS 1 0.650 51 1 A 2084 GLU 1 0.650 52 1 A 2085 LEU 1 0.680 53 1 A 2086 GLU 1 0.700 54 1 A 2087 GLN 1 0.710 55 1 A 2088 LEU 1 0.720 56 1 A 2089 LYS 1 0.740 57 1 A 2090 THR 1 0.760 58 1 A 2091 GLU 1 0.730 59 1 A 2092 GLU 1 0.720 60 1 A 2093 GLU 1 0.720 61 1 A 2094 GLU 1 0.710 62 1 A 2095 LEU 1 0.690 63 1 A 2096 GLN 1 0.660 64 1 A 2097 ARG 1 0.650 65 1 A 2098 ASN 1 0.710 66 1 A 2099 LEU 1 0.690 67 1 A 2100 LEU 1 0.700 68 1 A 2101 GLU 1 0.690 69 1 A 2102 LEU 1 0.720 70 1 A 2103 GLU 1 0.700 71 1 A 2104 VAL 1 0.740 72 1 A 2105 GLN 1 0.680 73 1 A 2106 LYS 1 0.630 74 1 A 2107 GLU 1 0.610 75 1 A 2108 GLN 1 0.630 76 1 A 2109 THR 1 0.710 77 1 A 2110 LEU 1 0.690 78 1 A 2111 ALA 1 0.720 79 1 A 2112 GLN 1 0.660 80 1 A 2113 ILE 1 0.700 81 1 A 2114 ASP 1 0.680 82 1 A 2115 PHE 1 0.670 83 1 A 2116 MET 1 0.660 84 1 A 2117 GLN 1 0.620 85 1 A 2118 LYS 1 0.600 86 1 A 2119 GLN 1 0.600 87 1 A 2120 ARG 1 0.510 88 1 A 2121 ASN 1 0.600 89 1 A 2122 ARG 1 0.490 90 1 A 2123 THR 1 0.620 91 1 A 2124 GLU 1 0.540 92 1 A 2125 GLU 1 0.530 93 1 A 2126 LEU 1 0.670 94 1 A 2127 LEU 1 0.480 95 1 A 2128 ASP 1 0.510 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #