data_SMR-f5c587331224f6e50f3d8ff71025ec2a_5 _entry.id SMR-f5c587331224f6e50f3d8ff71025ec2a_5 _struct.entry_id SMR-f5c587331224f6e50f3d8ff71025ec2a_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5VU43 (isoform 2)/ MYOME_HUMAN, Myomegalin Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5VU43 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 310095.243 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MYOME_HUMAN Q5VU43 1 ;MSNGYRTLSQHLNDLKKENFSLKLRIYFLEERMQQKYEASREDIYKRNIELKVEVESLKRELQDKKQHLD KTWADVENLNSQNEAELRRQFEERQQETEHVYELLENKIQLLQEESRLAKNEAARMAALVEAEKECNLEL SEKLKGVTKNWEDVPGDQVKPDQYTEALAQRDKRIEELNQSLAAQERLVEQLSREKQQLLHLLEEPTSME VQPMTEELLKQQKLNSHETTITQQSVSDSHLAELQEKIQQTEATNKILQEKLNEMSYELKCAQESSQKQD GTIQNLKETLKSRERETEELYQVIEGQNDTMAKLREMLHQSQLGQLHSSEGTSPAQQQVALLDLQSALFC SQLEIQKLQRVVRQKERQLADAKQCVQFVEAAAHESEQQKEASWKHNQELRKALQQLQEELQNKSQQLRA WEAEKYNEIRTQEQNIQHLNHSLSHKEQLLQEFRELLQYRDNSDKTLEANEMLLEKLRQRIHDKAVALER AIDEKFSALEEKEKELRQLRLAVRERDHDLERLRDVLSSNEATMQSMESLLRAKGLEVEQLSTTCQNLQW LKEEMETKFSRWQKEQESIIQQLQTSLHDRNKEVEDLSATLLCKLGPGQSEIAEELCQRLQRKERMLQDL LSDRNKQVLEHEMEIQGLLQSVSTREQESQAAAEKLVQALMERNSELQALRQYLGGRDSLMSQAPISNQQ AEVTPTGRLGKQTDQGSMQIPSRDDSTSLTAKEDVSIPRSTLGDLDTVAGLEKELSNAKEELELMAKKER ESQMELSALQSMMAVQEEELQVQAADMESLTRNIQIKEDLIKDLQMQLVDPEDIPAMERLTQEVLLLREK VASVESQGQEISGNRRQQLLLMLEGLVDERSRLNEALQAERQLYSSLVKFHAHPESSERDRTLQVELEGA QVLRSRLEEVLGRSLERLNRLETLAAIGGAAAGDDTEDTSTEFTDSIEEEAAHHSHQQLVKVALEKSLAT VETQNPSFSPPSPMGGDSNRCLQEEMLHLRAEFHQHLEEKRKAEEELKELKAQIEEAGFSSVSHIRNTML SLCLENAELKEQMGEAMSDGWEIEEDKEKGEVMVETVVTKEGLSESSLQAEFRKLQGKLKNAHNIINLLK EQLVLSSKEGNSKLTPELLVHLTSTIERINTELVGSPGKHQHQEEGNVTVRPFPRPQSLDLGATFTVDAH QLDNQSQPRDPGPQSAFSLPGSTQHLRSQLSQCKQRYQDLQEKLLLSEATVFAQANELEKYRVMLTGESL VKQDSKQIQVDLQDLGYETCGRSENEAEREETTSPECEEHNSLKEMVLMEGLCSEQGRRGSTLASSSERK PLENQLGKQEEFRVYGKSENILVLRKDIKDLKAQLQNANKVIQNLKSRVRSLSVTSDYSSSLERPRKLRA VGTLEGSSPHSVPDEDEGWLSDGTGAFYSPGLQAKKDLESLIQRVSQLEAQLPKNGLEEKLAEELRSASW PGKYDSLIQDQARELSYLRQKIREGRGICYLITRHAKDTVKSFEDLLRSNDIDYYLGQSFREQLAQGSQL TERLTSKLSTKDHKSEKDQAGLEPLALRLSRELQEKEKVIEVLQAKLDARSLTPSSSHALSDSHRSPSST SFLSDELEACSDMDIVSEYTHYEEKKASPSHSDSIHHSSHSAVLSSKPSSTSASQGAKAESNSNPISLPT PQNTPKEANQAHSGFHFHSIPKLASLPQAPLPSAPSSFLPFSPTGPLLLGCCETPVVSLAEAQQELQMLQ KQLGESASTVPPASTATLLSNDLEADSSYYLNSAQPHSPPRGTIELGRILEPGYLGSSGKWDVMRPQKGS VSGDLSSGSSVYQLNSKPTGADLLEEHLGEIRNLRQRLEESICINDRLREQLEHRLTSTARGRGSTSNFY SQGLESIPQLCNENRVLREDNRRLQAQLSHVSREHSQETESLREALLSSRSHLQELEKELEHQKVERQQL LEDLREKQQEVLHFREERLSLQENDSRLQHKLVLLQQQCEEKQQLFESLQSELQIYEALYGNSKKGLKAY SLDACHQIPLSSDLSHLVAEVRALRGQLEQSIQGNNCLRLQLQQQLESGAGKASLSPSSINQNFPASTDP GNKQLLLQDSAVSPPVRDVGMNSPALVFPSSASSTPGSETPIINRANGLGLDTSPVMKTPPKLEGDATDG SFANKHGRHVIGHIDDYSALRQQIAEGKLLVKKIVSLVRSACSFPGLEAQGTEVLGSKGIHELRSSTSAL HHALEESASLLTMFWRAALPSTHIPVLPGKVGESTERELLELRTKVSKQERLLQSTTEHLKNANQQKESM EQFIVSQLTRTHDVLKKARTNLEEPCKKRSHQKSLKQQERWACPPFVQLPIC ; Myomegalin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2362 1 2362 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MYOME_HUMAN Q5VU43 Q5VU43-2 1 2362 9606 'Homo sapiens (Human)' 2018-03-28 C47E0094FB787B0D # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no T ;MSNGYRTLSQHLNDLKKENFSLKLRIYFLEERMQQKYEASREDIYKRNIELKVEVESLKRELQDKKQHLD KTWADVENLNSQNEAELRRQFEERQQETEHVYELLENKIQLLQEESRLAKNEAARMAALVEAEKECNLEL SEKLKGVTKNWEDVPGDQVKPDQYTEALAQRDKRIEELNQSLAAQERLVEQLSREKQQLLHLLEEPTSME VQPMTEELLKQQKLNSHETTITQQSVSDSHLAELQEKIQQTEATNKILQEKLNEMSYELKCAQESSQKQD GTIQNLKETLKSRERETEELYQVIEGQNDTMAKLREMLHQSQLGQLHSSEGTSPAQQQVALLDLQSALFC SQLEIQKLQRVVRQKERQLADAKQCVQFVEAAAHESEQQKEASWKHNQELRKALQQLQEELQNKSQQLRA WEAEKYNEIRTQEQNIQHLNHSLSHKEQLLQEFRELLQYRDNSDKTLEANEMLLEKLRQRIHDKAVALER AIDEKFSALEEKEKELRQLRLAVRERDHDLERLRDVLSSNEATMQSMESLLRAKGLEVEQLSTTCQNLQW LKEEMETKFSRWQKEQESIIQQLQTSLHDRNKEVEDLSATLLCKLGPGQSEIAEELCQRLQRKERMLQDL 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A 1 2292 LEU 2292 ? ? ? T . A 1 2293 LEU 2293 ? ? ? T . A 1 2294 GLN 2294 ? ? ? T . A 1 2295 SER 2295 ? ? ? T . A 1 2296 THR 2296 ? ? ? T . A 1 2297 THR 2297 ? ? ? T . A 1 2298 GLU 2298 ? ? ? T . A 1 2299 HIS 2299 ? ? ? T . A 1 2300 LEU 2300 ? ? ? T . A 1 2301 LYS 2301 ? ? ? T . A 1 2302 ASN 2302 ? ? ? T . A 1 2303 ALA 2303 ? ? ? T . A 1 2304 ASN 2304 ? ? ? T . A 1 2305 GLN 2305 ? ? ? T . A 1 2306 GLN 2306 ? ? ? T . A 1 2307 LYS 2307 ? ? ? T . A 1 2308 GLU 2308 ? ? ? T . A 1 2309 SER 2309 ? ? ? T . A 1 2310 MET 2310 ? ? ? T . A 1 2311 GLU 2311 ? ? ? T . A 1 2312 GLN 2312 ? ? ? T . A 1 2313 PHE 2313 ? ? ? T . A 1 2314 ILE 2314 ? ? ? T . A 1 2315 VAL 2315 ? ? ? T . A 1 2316 SER 2316 ? ? ? T . A 1 2317 GLN 2317 ? ? ? T . A 1 2318 LEU 2318 ? ? ? T . A 1 2319 THR 2319 ? ? ? T . A 1 2320 ARG 2320 ? ? ? T . A 1 2321 THR 2321 ? ? ? T . A 1 2322 HIS 2322 ? ? ? T . A 1 2323 ASP 2323 ? ? ? T . A 1 2324 VAL 2324 ? ? ? T . A 1 2325 LEU 2325 ? ? ? T . A 1 2326 LYS 2326 ? ? ? T . A 1 2327 LYS 2327 ? ? ? T . A 1 2328 ALA 2328 ? ? ? T . A 1 2329 ARG 2329 ? ? ? T . A 1 2330 THR 2330 ? ? ? T . A 1 2331 ASN 2331 ? ? ? T . A 1 2332 LEU 2332 ? ? ? T . A 1 2333 GLU 2333 ? ? ? T . A 1 2334 GLU 2334 ? ? ? T . A 1 2335 PRO 2335 ? ? ? T . A 1 2336 CYS 2336 ? ? ? T . A 1 2337 LYS 2337 ? ? ? T . A 1 2338 LYS 2338 ? ? ? T . A 1 2339 ARG 2339 ? ? ? T . A 1 2340 SER 2340 ? ? ? T . A 1 2341 HIS 2341 ? ? ? T . A 1 2342 GLN 2342 ? ? ? T . A 1 2343 LYS 2343 ? ? ? T . A 1 2344 SER 2344 ? ? ? T . A 1 2345 LEU 2345 ? ? ? T . A 1 2346 LYS 2346 ? ? ? T . A 1 2347 GLN 2347 ? ? ? T . A 1 2348 GLN 2348 ? ? ? T . A 1 2349 GLU 2349 ? ? ? T . A 1 2350 ARG 2350 ? ? ? T . A 1 2351 TRP 2351 ? ? ? T . A 1 2352 ALA 2352 ? ? ? T . A 1 2353 CYS 2353 ? ? ? T . A 1 2354 PRO 2354 ? ? ? T . A 1 2355 PRO 2355 ? ? ? T . A 1 2356 PHE 2356 ? ? ? T . A 1 2357 VAL 2357 ? ? ? T . A 1 2358 GLN 2358 ? ? ? T . A 1 2359 LEU 2359 ? ? ? T . A 1 2360 PRO 2360 ? ? ? T . A 1 2361 ILE 2361 ? ? ? T . A 1 2362 CYS 2362 ? ? ? T . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=7utl, label_asym_id=T, auth_asym_id=b, SMTL ID=7utl.1.T}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7utl, label_asym_id=T' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A T 2 1 b # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 41 206 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7utl 2022-09-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2362 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2362 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.130 14.458 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSNGYRTLSQHLNDLKKENFSLKLRIYFLEERMQQKYEASREDIYKRNIELKVEVESLKRELQDKKQHLDKTWADVENLNSQNEAELRRQFEERQQETEHVYELLENKIQLLQEESRLAKNEAARMAALVEAEKECNLELSEKLKGVTKNWEDVPGDQVKPDQYTEALAQRDKRIEELNQSLAAQERLVEQLSREKQQLLHLLEEPTSMEVQPMTEELLKQQKLNSHETTITQQSVSDSHLAELQEKIQQTEATNKILQEKLNEMSYELKCAQESSQKQDGTIQNLKETLKSRERETEELYQVIEGQNDTMAKLREMLHQSQLGQLHSSEGTSPAQQQVALLDLQSALFCSQLEIQKLQRVVRQKERQLADAKQCVQFVEAAAHESEQQKEASWKHNQELRKALQQLQEELQNKSQQLRAWEAEKYNEIRTQEQNIQHLNHSLSHKEQLLQEFRELLQYRDNSDKTLEANEMLLEKLRQRIHDKAVALERAIDEKFSALEEKEKELRQLRLAVRERDHDLERLRDVLSSNEATMQSMESLLRAKGLEVEQLSTTCQNLQWLKEEMETKFSRWQKEQESIIQQLQTSLHDRNKEVEDLSATLLCKLGPGQSEIAEELCQRLQRKERMLQDLLSDRNKQVLEHEMEIQGLLQSVSTREQESQAAAEKLVQALMERNSELQALRQYLGGRDSLMSQAPISNQQAEVTPTGRLGKQTDQGSMQIPSRDDSTSLTAKEDVSIPRSTLGDLDTVAGLEKELSNAKEELELMAKKERESQMELSALQSMMAVQEEELQVQAADMESLTRNIQIKEDLIKDLQMQLVDPEDIPAMERLTQEVLLLREKVASVESQGQEISGNRRQQLLLMLEGLVDERSRLNEALQAERQLYSSLVKFHAHPESSERDRTLQVELEGAQVLRSRLEEVLGRSLERLNRLETLAAIGGAAAGDDTEDTSTEFTDSIEEEAAHHSHQQLVKVALEKSLATVETQNPSFSPPSPMGGDSNRCLQEEMLHLRAEFHQHLEEKRKAEEELKELKAQIEEAGFSSVSHIRNTMLSLCLENAELKEQMGEAMSDGWEIEEDKEKGEVMVETVVTKEGLSESSLQAEFRKLQGKLKNAHNIINLLKEQLVLSSKEGNSKLTPELLVHLTSTIERINTELVGSPGKHQHQEEGNVTVRPFPRPQSLDLGATFTVDAHQLDNQSQPRDPGPQSAFSLPGSTQHLRSQLSQCKQRYQDLQEKLLLSEATVFAQANELEKYRVMLTGESLVKQDSKQIQVDLQDLGYETCGRSENEAEREETTSPECEEHNSLKEMVLMEGLCSEQGRRGSTLASSSERKPLENQLGKQEEFRVYGKSENILVLRKDIKDLKAQLQNANKVIQNLKSRVRSLSVTSDYSSSLERPRKLRAVGTLEGSSPHSVPDEDEGWLSDGTGAFYSPGLQAKKDLESLIQRVSQLEAQLPKNGLEEKLAEELRSASWPGKYDSLIQDQARELSYLRQKIREGRGICYLITRHAKDTVKSFEDLLRSNDIDYYLGQSFREQLAQGSQLTERLTSKLSTKDHKSEKDQAGLEPLALRLSRELQEKEKVIEVLQAKLDARSLTPSSSHALSDSHRSPSSTSFLSDELEACSDMDIVSEYTHYEEKKASPSHSDSIHHSSHSAVLSSKPSSTSASQGAKAESNSNPISLPTPQNTPKEANQAHSGFHFHSIPKLASLPQAPLPSAPSSFLPFSPTGPLLLGCCETPVVSLAEAQQELQMLQKQLGESASTVPPASTATLLSNDLEADSSYYLNSAQPHSPPRGTIELGRILEPGYLGSSGKWDVMRPQKGSVSGDLSSGSSVYQLNSKPTGADLLEEHLGEIRNLRQRLEESICINDRLREQLEHRLTSTARGRGSTSNFYSQGLESIPQLCNENRVLREDNRRLQAQLSHVSREHSQETESLREALLSSRSHLQELEKELEHQKVERQQLLEDLREKQQEVLHFREERLSLQENDSRLQHKLVLLQQQCEEKQQLFESLQSELQIYEALYGNSKKGLKAYSLDACHQIPLSSDLSHLVAEVRALRGQLEQSIQGNNCLRLQLQQQLESGAGKASLSPSSINQNFPASTDPGNKQLLLQDSAVSPPVRDVGMNSPALVFPSSASSTPGSETPIINRANGLGLDTSPVMKTPPKLEGDATDGSFANKHGRHVIGHIDDYSALRQQIAEGKLLVKKIVSLVRSACSFPGLEAQGTEVLGSKGIHELRSSTSALHHALEESASLLTMFWRAALPSTHIPVLPGKVGESTERELLELRTKVSKQERLLQSTTEHLKNANQQKESMEQFIVSQLTRTHDVLKKARTNLEEPCKKRSHQKSLKQQERWACPPFVQLPIC 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGM-K--------VIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKS----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.134}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7utl.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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HIS 240 240 ? A 236.439 272.450 25.048 1 1 T HIS 0.720 1 ATOM 16 N NE2 . HIS 240 240 ? A 235.337 271.794 24.599 1 1 T HIS 0.720 1 ATOM 17 N N . LEU 241 241 ? A 237.826 267.267 23.598 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 18 C CA . LEU 241 241 ? A 237.089 266.126 24.114 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 19 C C . LEU 241 241 ? A 237.799 265.366 25.232 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 20 O O . LEU 241 241 ? A 237.188 265.031 26.237 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 21 C CB . LEU 241 241 ? A 236.739 265.175 22.943 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 22 C CG . LEU 241 241 ? A 235.737 264.059 23.302 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 23 C CD1 . LEU 241 241 ? A 234.729 263.884 22.156 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 24 C CD2 . LEU 241 241 ? A 236.421 262.717 23.623 1 1 T LEU 0.590 1 ATOM 25 N N . ALA 242 242 ? A 239.124 265.112 25.092 1 1 T ALA 0.680 1 ATOM 26 C CA . ALA 242 242 ? A 239.943 264.445 26.090 1 1 T ALA 0.680 1 ATOM 27 C C . ALA 242 242 ? A 240.001 265.197 27.415 1 1 T ALA 0.680 1 ATOM 28 O O . ALA 242 242 ? 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A 200.587 257.333 133.296 1 1 T HIS 0.680 1 ATOM 657 C CB . HIS 319 319 ? A 202.255 258.491 130.651 1 1 T HIS 0.680 1 ATOM 658 C CG . HIS 319 319 ? A 203.042 259.024 131.798 1 1 T HIS 0.680 1 ATOM 659 N ND1 . HIS 319 319 ? A 204.065 258.254 132.306 1 1 T HIS 0.680 1 ATOM 660 C CD2 . HIS 319 319 ? A 202.896 260.157 132.525 1 1 T HIS 0.680 1 ATOM 661 C CE1 . HIS 319 319 ? A 204.526 258.929 133.330 1 1 T HIS 0.680 1 ATOM 662 N NE2 . HIS 319 319 ? A 203.858 260.097 133.513 1 1 T HIS 0.680 1 ATOM 663 N N . GLN 320 320 ? A 199.275 258.305 131.781 1 1 T GLN 0.660 1 ATOM 664 C CA . GLN 320 320 ? A 198.202 258.572 132.735 1 1 T GLN 0.660 1 ATOM 665 C C . GLN 320 320 ? A 197.535 257.311 133.274 1 1 T GLN 0.660 1 ATOM 666 O O . GLN 320 320 ? A 197.204 257.214 134.454 1 1 T GLN 0.660 1 ATOM 667 C CB . GLN 320 320 ? A 197.146 259.536 132.161 1 1 T GLN 0.660 1 ATOM 668 C CG . GLN 320 320 ? A 197.721 260.954 131.950 1 1 T GLN 0.660 1 ATOM 669 C CD . GLN 320 320 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.698 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 239 SER 1 0.530 2 1 A 240 HIS 1 0.720 3 1 A 241 LEU 1 0.590 4 1 A 242 ALA 1 0.680 5 1 A 243 GLU 1 0.640 6 1 A 244 LEU 1 0.680 7 1 A 245 GLN 1 0.680 8 1 A 246 GLU 1 0.710 9 1 A 247 LYS 1 0.740 10 1 A 248 ILE 1 0.730 11 1 A 249 GLN 1 0.720 12 1 A 250 GLN 1 0.710 13 1 A 251 THR 1 0.740 14 1 A 252 GLU 1 0.730 15 1 A 253 ALA 1 0.780 16 1 A 254 THR 1 0.730 17 1 A 255 ASN 1 0.750 18 1 A 256 LYS 1 0.740 19 1 A 257 ILE 1 0.700 20 1 A 258 LEU 1 0.690 21 1 A 259 GLN 1 0.680 22 1 A 260 GLU 1 0.690 23 1 A 261 LYS 1 0.680 24 1 A 262 LEU 1 0.680 25 1 A 263 ASN 1 0.700 26 1 A 264 GLU 1 0.670 27 1 A 265 MET 1 0.640 28 1 A 266 SER 1 0.690 29 1 A 267 TYR 1 0.660 30 1 A 268 GLU 1 0.670 31 1 A 269 LEU 1 0.690 32 1 A 270 LYS 1 0.720 33 1 A 271 CYS 1 0.710 34 1 A 272 ALA 1 0.760 35 1 A 273 GLN 1 0.700 36 1 A 274 GLU 1 0.730 37 1 A 275 SER 1 0.740 38 1 A 276 SER 1 0.730 39 1 A 277 GLN 1 0.710 40 1 A 278 LYS 1 0.710 41 1 A 279 GLN 1 0.700 42 1 A 280 ASP 1 0.700 43 1 A 281 GLY 1 0.740 44 1 A 282 THR 1 0.700 45 1 A 283 ILE 1 0.670 46 1 A 284 GLN 1 0.680 47 1 A 285 ASN 1 0.730 48 1 A 286 LEU 1 0.700 49 1 A 287 LYS 1 0.710 50 1 A 288 GLU 1 0.710 51 1 A 289 THR 1 0.730 52 1 A 290 LEU 1 0.720 53 1 A 291 LYS 1 0.740 54 1 A 292 SER 1 0.740 55 1 A 293 ARG 1 0.670 56 1 A 294 GLU 1 0.700 57 1 A 295 ARG 1 0.690 58 1 A 296 GLU 1 0.700 59 1 A 297 THR 1 0.710 60 1 A 298 GLU 1 0.680 61 1 A 299 GLU 1 0.670 62 1 A 300 LEU 1 0.670 63 1 A 301 TYR 1 0.660 64 1 A 302 GLN 1 0.640 65 1 A 303 VAL 1 0.680 66 1 A 304 ILE 1 0.680 67 1 A 305 GLU 1 0.680 68 1 A 306 GLY 1 0.740 69 1 A 307 GLN 1 0.700 70 1 A 308 ASN 1 0.720 71 1 A 309 ASP 1 0.720 72 1 A 310 THR 1 0.750 73 1 A 311 MET 1 0.710 74 1 A 312 ALA 1 0.800 75 1 A 313 LYS 1 0.760 76 1 A 314 LEU 1 0.740 77 1 A 315 ARG 1 0.690 78 1 A 316 GLU 1 0.720 79 1 A 317 MET 1 0.720 80 1 A 318 LEU 1 0.730 81 1 A 319 HIS 1 0.680 82 1 A 320 GLN 1 0.660 83 1 A 321 SER 1 0.660 84 1 A 322 GLN 1 0.620 85 1 A 323 LEU 1 0.600 86 1 A 324 GLY 1 0.640 87 1 A 325 GLN 1 0.630 88 1 A 326 LEU 1 0.620 89 1 A 327 HIS 1 0.500 90 1 A 328 SER 1 0.450 91 1 A 329 SER 1 0.530 92 1 A 330 GLU 1 0.530 93 1 A 331 GLY 1 0.510 94 1 A 332 THR 1 0.570 95 1 A 333 SER 1 0.640 96 1 A 334 PRO 1 0.540 97 1 A 335 ALA 1 0.630 98 1 A 336 GLN 1 0.600 99 1 A 337 GLN 1 0.610 100 1 A 338 GLN 1 0.640 101 1 A 339 VAL 1 0.700 102 1 A 340 ALA 1 0.700 103 1 A 341 LEU 1 0.680 104 1 A 342 LEU 1 0.660 105 1 A 343 ASP 1 0.680 106 1 A 344 LEU 1 0.670 107 1 A 345 GLN 1 0.660 108 1 A 346 SER 1 0.670 109 1 A 347 ALA 1 0.690 110 1 A 348 LEU 1 0.650 111 1 A 349 PHE 1 0.630 112 1 A 350 CYS 1 0.670 113 1 A 351 SER 1 0.680 114 1 A 352 GLN 1 0.670 115 1 A 353 LEU 1 0.690 116 1 A 354 GLU 1 0.700 117 1 A 355 ILE 1 0.710 118 1 A 356 GLN 1 0.720 119 1 A 357 LYS 1 0.740 120 1 A 358 LEU 1 0.720 121 1 A 359 GLN 1 0.720 122 1 A 360 ARG 1 0.710 123 1 A 361 VAL 1 0.740 124 1 A 362 VAL 1 0.740 125 1 A 363 ARG 1 0.730 126 1 A 364 GLN 1 0.730 127 1 A 365 LYS 1 0.760 128 1 A 366 GLU 1 0.740 129 1 A 367 ARG 1 0.710 130 1 A 368 GLN 1 0.720 131 1 A 369 LEU 1 0.730 132 1 A 370 ALA 1 0.760 133 1 A 371 ASP 1 0.710 134 1 A 372 ALA 1 0.730 135 1 A 373 LYS 1 0.690 136 1 A 374 GLN 1 0.650 137 1 A 375 CYS 1 0.640 138 1 A 376 VAL 1 0.650 139 1 A 377 GLN 1 0.620 140 1 A 378 PHE 1 0.600 141 1 A 379 VAL 1 0.640 142 1 A 380 GLU 1 0.620 143 1 A 381 ALA 1 0.690 144 1 A 382 ALA 1 0.690 145 1 A 383 ALA 1 0.750 146 1 A 384 HIS 1 0.700 147 1 A 385 GLU 1 0.730 148 1 A 386 SER 1 0.780 149 1 A 387 GLU 1 0.760 150 1 A 388 GLN 1 0.750 151 1 A 389 GLN 1 0.770 152 1 A 390 LYS 1 0.800 153 1 A 391 GLU 1 0.790 154 1 A 392 ALA 1 0.840 155 1 A 393 SER 1 0.800 156 1 A 394 TRP 1 0.710 157 1 A 395 LYS 1 0.790 158 1 A 396 HIS 1 0.790 159 1 A 397 ASN 1 0.810 160 1 A 398 GLN 1 0.780 161 1 A 399 GLU 1 0.780 162 1 A 400 LEU 1 0.780 163 1 A 401 ARG 1 0.730 164 1 A 402 LYS 1 0.790 165 1 A 403 ALA 1 0.800 166 1 A 404 LEU 1 0.750 167 1 A 405 GLN 1 0.730 168 1 A 406 GLN 1 0.780 169 1 A 407 LEU 1 0.810 170 1 A 408 GLN 1 0.780 171 1 A 409 GLU 1 0.780 172 1 A 410 GLU 1 0.720 173 1 A 411 LEU 1 0.760 174 1 A 412 GLN 1 0.720 175 1 A 413 ASN 1 0.630 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #