data_SMR-6374055c784f3db092cfeeb40c2fd3f8_12 _entry.id SMR-6374055c784f3db092cfeeb40c2fd3f8_12 _struct.entry_id SMR-6374055c784f3db092cfeeb40c2fd3f8_12 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9BV73 (isoform 2)/ CP250_HUMAN, Centrosome-associated protein CEP250 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9BV73 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 317727.061 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CP250_HUMAN Q9BV73 1 ;METRSPGLNNMKPQSLQLVLEEQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQQRQATLVRKLQAKVLQYRSWC QELEKRLEATGGPIPQRWENVEEPNLDELLVRLEEEQQRCESLAEVNTQLRLHMEKADVVNKALREDVEK LTVDWSRARDELMRKESQWQMEQEFFKGYLKGEHGRLLSLWREVVTFRRHFLEMKSATDRDLMELKAEHV RLSGSLLTCCLRLTVGAQSREPNGSGRMDGREPAQLLLLLAKTQELEKEAHERSQELIQLKSQGDLEKAE LQDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMIKALRETVEILETNHTELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKDITQ VMVEEGDNIAQGSGHENSLELDSSIFSQFDYQDADKALTLVRSVLTRRRQAVQDLRQQLAGCQEAVNLLQ QQHDQWEEEGKALRQRLQKLTGERDTLAGQTVDLQGEVDSLSKERELLQKAREELRQQLEVLEQEAWRLR RVNVELQLQGDSAQGQKEEQQEELHLAVRERERLQEMLMGLEAKQSESLSELITLREALESSHLEGELLR QEQTEVTAALARAEQSIAELSSSENTLKTEVADLRAAAVKLSALNEALALDKVGLNQQLLQLEEENQSVC SRMEAAEQARNALQVDLAEAEKRREALWEKNTHLEAQLQKAEEAGAELQADLRDIQEEKEEIQKKLSESR HQQEAATTQLEQLHQEAKRQEEVLARAVQEKEALVREKAALEVRLQAVERDRQDLAEQLQGLSSAKELLE SSLFEAQQQNSVIEVTKGQLEVQIQTVTQAKEVIQGEVRCLKLELDTERSQAEQERDAAARQLAQAEQEG KTALEQQKAAHEKEVNQLREKWMQLETEKERVSLLETLLQTQKELADASQQLERLRQDMKVQKLKEQETT GILQTQLQEAQRELKEAARQHRDDLAALQEESSSLLQDKMDLQKQVEDLKSQLVAQDDSQRLVEQEVQEK LRETQEYNRIQKELEREKASLTLSLMEKEQRLLVLQEADSIRQQELSALRQDMQEAQGEQKELSAQMELL RQEVKEKEADFLAQEAQLLEELEASHITEQQLRASLWAQEAKAAQLQLRLRSTESQLEALAAEQQPGNQA QAQAQLASLYSALQQALGSVCESRPELSGGGDSAPSVWGLEPDQNGARSLFKRGPLLTALSAEAVASALH KLHQDLWKTQQTRDVLRDQVQKLEERLTDTEAEKSQVHTELQDLQRQLSQNQEEKSKWEGKQNSLESELM ELHETMASLQSRLRRAELQRMEAQGERELLQAAKENLTAQVEHLQAAVVEARAQASAAGILEEDLRTARS ALKLKNEEVESERERAQALQEQGELKVAQGKALQENLALLTQTLAEREEEVETLRGQIQELEKQREMQKA ALELLSLDLKKRNQEVDLQQEQIQELEKCRSVLEHLPMAVQEREQKLTVQREQIRELEKDRETQRNVLEH QLLELEKKDQMIESQRGQVQDLKKQLVTLECLALELEENHHKMECQQKLIKELEGQRETQRVALTHLTLD LEERSQELQAQSSQIHDLESHSTVLARELQERDQEVKSQREQIEELQRQKEHLTQDLERRDQELMLQKER IQVLEDQRTRQTKILEEDLEQIKLSLRERGRELTTQRQLMQERAEEGKGPSKAQRGSLEHMKLILRDKEK EVECQQEHIHELQELKDQLEQQLQGLHRKVGETSLLLSQREQEIVVLQQQLQEAREQGELKEQSLQSQLD EAQRALAQRDQELEALQQEQQQAQGQEERVKEKADALQGALEQAHMTLKERHGELQDHKEQARRLEEELA VEGRRVQALEEVLGDLRAESREQEKALLALQQQCAEQAQEHEVETRALQDSWLQAQAVLKERDQELEALR AESQSSRHQEEAARARAEALQEALGKAHAALQGKEQHLLEQAELSRSLEASTATLQASLDACQAHSRQLE EALRIQEGEIQDQDLRYQEDVQQLQQALAQRDEELRHQQEREQLLEKSLAQRVQENMIQEKQNLGQEREE EEIRGLHQSVRELQLTLAQKEQEILELRETQQRNNLEALPHSHKTSPMEEQSLKLDSLEPRLQRELERLQ AALRQTEAREIEWREKAQDLALSLAQTKASVSSLQEVAMFLQASVLERDSEQQRLQDELELTRRALEKER LHSPGATSTAELGSRGEQGVQLGEVSGVEAEPSPDGMEKQSWRQRLEHLQQAVARLEIDRSRLQRHNVQL RSTLEQVERERRKLKREAMRAAQAGSLEISKATASSPTQQDGRGQKNSDAKCVAELQKEVVLLQAQLTLE RKQKQDYITRSAQTSRELAGLHHSLSHSLLAVAQAPEATVLEAETRRLDESLTQSLTSPGPVLLHPSPST TQAASR ; 'Centrosome-associated protein CEP250' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2386 1 2386 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CP250_HUMAN Q9BV73 Q9BV73-2 1 2386 9606 'Homo sapiens (Human)' 2003-05-09 CE22E600206C2CE8 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no C ;METRSPGLNNMKPQSLQLVLEEQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQQRQATLVRKLQAKVLQYRSWC QELEKRLEATGGPIPQRWENVEEPNLDELLVRLEEEQQRCESLAEVNTQLRLHMEKADVVNKALREDVEK LTVDWSRARDELMRKESQWQMEQEFFKGYLKGEHGRLLSLWREVVTFRRHFLEMKSATDRDLMELKAEHV RLSGSLLTCCLRLTVGAQSREPNGSGRMDGREPAQLLLLLAKTQELEKEAHERSQELIQLKSQGDLEKAE LQDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMIKALRETVEILETNHTELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKDITQ VMVEEGDNIAQGSGHENSLELDSSIFSQFDYQDADKALTLVRSVLTRRRQAVQDLRQQLAGCQEAVNLLQ QQHDQWEEEGKALRQRLQKLTGERDTLAGQTVDLQGEVDSLSKERELLQKAREELRQQLEVLEQEAWRLR RVNVELQLQGDSAQGQKEEQQEELHLAVRERERLQEMLMGLEAKQSESLSELITLREALESSHLEGELLR QEQTEVTAALARAEQSIAELSSSENTLKTEVADLRAAAVKLSALNEALALDKVGLNQQLLQLEEENQSVC 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A 1 2307 LEU 2307 ? ? ? C . A 1 2308 THR 2308 ? ? ? C . A 1 2309 LEU 2309 ? ? ? C . A 1 2310 GLU 2310 ? ? ? C . A 1 2311 ARG 2311 ? ? ? C . A 1 2312 LYS 2312 ? ? ? C . A 1 2313 GLN 2313 ? ? ? C . A 1 2314 LYS 2314 ? ? ? C . A 1 2315 GLN 2315 ? ? ? C . A 1 2316 ASP 2316 ? ? ? C . A 1 2317 TYR 2317 ? ? ? C . A 1 2318 ILE 2318 ? ? ? C . A 1 2319 THR 2319 ? ? ? C . A 1 2320 ARG 2320 ? ? ? C . A 1 2321 SER 2321 ? ? ? C . A 1 2322 ALA 2322 ? ? ? C . A 1 2323 GLN 2323 ? ? ? C . A 1 2324 THR 2324 ? ? ? C . A 1 2325 SER 2325 ? ? ? C . A 1 2326 ARG 2326 ? ? ? C . A 1 2327 GLU 2327 ? ? ? C . A 1 2328 LEU 2328 ? ? ? C . A 1 2329 ALA 2329 ? ? ? C . A 1 2330 GLY 2330 ? ? ? C . A 1 2331 LEU 2331 ? ? ? C . A 1 2332 HIS 2332 ? ? ? C . A 1 2333 HIS 2333 ? ? ? C . A 1 2334 SER 2334 ? ? ? C . A 1 2335 LEU 2335 ? ? ? C . A 1 2336 SER 2336 ? ? ? C . A 1 2337 HIS 2337 ? ? ? C . A 1 2338 SER 2338 ? ? ? C . A 1 2339 LEU 2339 ? ? ? C . A 1 2340 LEU 2340 ? ? ? C . A 1 2341 ALA 2341 ? ? ? C . A 1 2342 VAL 2342 ? ? ? C . A 1 2343 ALA 2343 ? ? ? C . A 1 2344 GLN 2344 ? ? ? C . A 1 2345 ALA 2345 ? ? ? C . A 1 2346 PRO 2346 ? ? ? C . A 1 2347 GLU 2347 ? ? ? C . A 1 2348 ALA 2348 ? ? ? C . A 1 2349 THR 2349 ? ? ? C . A 1 2350 VAL 2350 ? ? ? C . A 1 2351 LEU 2351 ? ? ? C . A 1 2352 GLU 2352 ? ? ? C . A 1 2353 ALA 2353 ? ? ? C . A 1 2354 GLU 2354 ? ? ? C . A 1 2355 THR 2355 ? ? ? C . A 1 2356 ARG 2356 ? ? ? C . A 1 2357 ARG 2357 ? ? ? C . A 1 2358 LEU 2358 ? ? ? C . A 1 2359 ASP 2359 ? ? ? C . A 1 2360 GLU 2360 ? ? ? C . A 1 2361 SER 2361 ? ? ? C . A 1 2362 LEU 2362 ? ? ? C . A 1 2363 THR 2363 ? ? ? C . A 1 2364 GLN 2364 ? ? ? C . A 1 2365 SER 2365 ? ? ? C . A 1 2366 LEU 2366 ? ? ? C . A 1 2367 THR 2367 ? ? ? C . A 1 2368 SER 2368 ? ? ? C . A 1 2369 PRO 2369 ? ? ? C . A 1 2370 GLY 2370 ? ? ? C . A 1 2371 PRO 2371 ? ? ? C . A 1 2372 VAL 2372 ? ? ? C . A 1 2373 LEU 2373 ? ? ? C . A 1 2374 LEU 2374 ? ? ? C . A 1 2375 HIS 2375 ? ? ? C . A 1 2376 PRO 2376 ? ? ? C . A 1 2377 SER 2377 ? ? ? C . A 1 2378 PRO 2378 ? ? ? C . A 1 2379 SER 2379 ? ? ? C . A 1 2380 THR 2380 ? ? ? C . A 1 2381 THR 2381 ? ? ? C . A 1 2382 GLN 2382 ? ? ? C . A 1 2383 ALA 2383 ? ? ? C . A 1 2384 ALA 2384 ? ? ? C . A 1 2385 SER 2385 ? ? ? C . A 1 2386 ARG 2386 ? ? ? C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Centrosome-associated protein CEP250 {PDB ID=6oqa, label_asym_id=G, auth_asym_id=G, SMTL ID=6oqa.2.C}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 6oqa, label_asym_id=G' 'target-template alignment' . 4 'model 12' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 2 1 G # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MEEQSLKLDSLEPRLQRELERLQAALRQTEAREIEWREKAQDLALSLAQTKASVSSLQEVAMFLQASVLE RDSEQQRLQDELELTRRALEKERLHSPG ; ;MEEQSLKLDSLEPRLQRELERLQAALRQTEAREIEWREKAQDLALSLAQTKASVSSLQEVAMFLQASVLE RDSEQQRLQDELELTRRALEKERLHSPG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 98 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6oqa 2024-03-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2386 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2386 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.5e-41 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 METRSPGLNNMKPQSLQLVLEEQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQQRQATLVRKLQAKVLQYRSWCQELEKRLEATGGPIPQRWENVEEPNLDELLVRLEEEQQRCESLAEVNTQLRLHMEKADVVNKALREDVEKLTVDWSRARDELMRKESQWQMEQEFFKGYLKGEHGRLLSLWREVVTFRRHFLEMKSATDRDLMELKAEHVRLSGSLLTCCLRLTVGAQSREPNGSGRMDGREPAQLLLLLAKTQELEKEAHERSQELIQLKSQGDLEKAELQDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMIKALRETVEILETNHTELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKDITQVMVEEGDNIAQGSGHENSLELDSSIFSQFDYQDADKALTLVRSVLTRRRQAVQDLRQQLAGCQEAVNLLQQQHDQWEEEGKALRQRLQKLTGERDTLAGQTVDLQGEVDSLSKERELLQKAREELRQQLEVLEQEAWRLRRVNVELQLQGDSAQGQKEEQQEELHLAVRERERLQEMLMGLEAKQSESLSELITLREALESSHLEGELLRQEQTEVTAALARAEQSIAELSSSENTLKTEVADLRAAAVKLSALNEALALDKVGLNQQLLQLEEENQSVCSRMEAAEQARNALQVDLAEAEKRREALWEKNTHLEAQLQKAEEAGAELQADLRDIQEEKEEIQKKLSESRHQQEAATTQLEQLHQEAKRQEEVLARAVQEKEALVREKAALEVRLQAVERDRQDLAEQLQGLSSAKELLESSLFEAQQQNSVIEVTKGQLEVQIQTVTQAKEVIQGEVRCLKLELDTERSQAEQERDAAARQLAQAEQEGKTALEQQKAAHEKEVNQLREKWMQLETEKERVSLLETLLQTQKELADASQQLERLRQDMKVQKLKEQETTGILQTQLQEAQRELKEAARQHRDDLAALQEESSSLLQDKMDLQKQVEDLKSQLVAQDDSQRLVEQEVQEKLRETQEYNRIQKELEREKASLTLSLMEKEQRLLVLQEADSIRQQELSALRQDMQEAQGEQKELSAQMELLRQEVKEKEADFLAQEAQLLEELEASHITEQQLRASLWAQEAKAAQLQLRLRSTESQLEALAAEQQPGNQAQAQAQLASLYSALQQALGSVCESRPELSGGGDSAPSVWGLEPDQNGARSLFKRGPLLTALSAEAVASALHKLHQDLWKTQQTRDVLRDQVQKLEERLTDTEAEKSQVHTELQDLQRQLSQNQEEKSKWEGKQNSLESELMELHETMASLQSRLRRAELQRMEAQGERELLQAAKENLTAQVEHLQAAVVEARAQASAAGILEEDLRTARSALKLKNEEVESERERAQALQEQGELKVAQGKALQENLALLTQTLAEREEEVETLRGQIQELEKQREMQKAALELLSLDLKKRNQEVDLQQEQIQELEKCRSVLEHLPMAVQEREQKLTVQREQIRELEKDRETQRNVLEHQLLELEKKDQMIESQRGQVQDLKKQLVTLECLALELEENHHKMECQQKLIKELEGQRETQRVALTHLTLDLEERSQELQAQSSQIHDLESHSTVLARELQERDQEVKSQREQIEELQRQKEHLTQDLERRDQELMLQKERIQVLEDQRTRQTKILEEDLEQIKLSLRERGRELTTQRQLMQERAEEGKGPSKAQRGSLEHMKLILRDKEKEVECQQEHIHELQELKDQLEQQLQGLHRKVGETSLLLSQREQEIVVLQQQLQEAREQGELKEQSLQSQLDEAQRALAQRDQELEALQQEQQQAQGQEERVKEKADALQGALEQAHMTLKERHGELQDHKEQARRLEEELAVEGRRVQALEEVLGDLRAESREQEKALLALQQQCAEQAQEHEVETRALQDSWLQAQAVLKERDQELEALRAESQSSRHQEEAARARAEALQEALGKAHAALQGKEQHLLEQAELSRSLEASTATLQASLDACQAHSRQLEEALRIQEGEIQDQDLRYQEDVQQLQQALAQRDEELRHQQEREQLLEKSLAQRVQENMIQEKQNLGQEREEEEIRGLHQSVRELQLTLAQKEQEILELRETQQRNNLEALPHSHKTSPMEEQSLKLDSLEPRLQRELERLQAALRQTEAREIEWREKAQDLALSLAQTKASVSSLQEVAMFLQASVLERDSEQQRLQDELELTRRALEKERLHSPGATSTAELGSRGEQGVQLGEVSGVEAEPSPDGMEKQSWRQRLEHLQQAVARLEIDRSRLQRHNVQLRSTLEQVERERRKLKREAMRAAQAGSLEISKATASSPTQQDGRGQKNSDAKCVAELQKEVVLLQAQLTLERKQKQDYITRSAQTSRELAGLHHSLSHSLLAVAQAPEATVLEAETRRLDESLTQSLTSPGPVLLHPSPSTTQAASR 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MEEQSLKLDSLEPRLQRELERLQAALRQTEAREIEWREKAQDLALSLAQTKASVSSLQEVAMFLQASVLERDSEQQRLQDELELTRRALEKERLHSPG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.338}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6oqa.2' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 12' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A -33.386 83.348 14.212 1 1 C SER 0.490 1 ATOM 15 N N . LEU 2088 2088 ? A -30.710 84.361 11.347 1 1 C LEU 0.530 1 ATOM 16 C CA . LEU 2088 2088 ? A -30.747 83.969 9.952 1 1 C LEU 0.530 1 ATOM 17 C C . LEU 2088 2088 ? A -29.384 83.497 9.481 1 1 C LEU 0.530 1 ATOM 18 O O . LEU 2088 2088 ? A -29.238 82.984 8.373 1 1 C LEU 0.530 1 ATOM 19 C CB . LEU 2088 2088 ? A -31.186 85.189 9.108 1 1 C LEU 0.530 1 ATOM 20 C CG . LEU 2088 2088 ? A -32.615 85.676 9.433 1 1 C LEU 0.530 1 ATOM 21 C CD1 . LEU 2088 2088 ? A -32.848 87.072 8.832 1 1 C LEU 0.530 1 ATOM 22 C CD2 . LEU 2088 2088 ? A -33.684 84.672 8.956 1 1 C LEU 0.530 1 ATOM 23 N N . GLU 2089 2089 ? A -28.357 83.606 10.347 1 1 C GLU 0.640 1 ATOM 24 C CA . GLU 2089 2089 ? A -27.021 83.142 10.055 1 1 C GLU 0.640 1 ATOM 25 C C . GLU 2089 2089 ? A -26.933 81.620 10.194 1 1 C GLU 0.640 1 ATOM 26 O O . GLU 2089 2089 ? A -27.239 81.120 11.283 1 1 C GLU 0.640 1 ATOM 27 C CB . GLU 2089 2089 ? A -25.977 83.761 11.020 1 1 C GLU 0.640 1 ATOM 28 C CG . 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A -7.493 -2.887 100.505 1 1 C HIS 0.540 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.564 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2086 ASP 1 0.460 2 1 A 2087 SER 1 0.490 3 1 A 2088 LEU 1 0.530 4 1 A 2089 GLU 1 0.640 5 1 A 2090 PRO 1 0.560 6 1 A 2091 ARG 1 0.490 7 1 A 2092 LEU 1 0.670 8 1 A 2093 GLN 1 0.490 9 1 A 2094 ARG 1 0.470 10 1 A 2095 GLU 1 0.410 11 1 A 2096 LEU 1 0.490 12 1 A 2097 GLU 1 0.410 13 1 A 2098 ARG 1 0.420 14 1 A 2099 LEU 1 0.480 15 1 A 2100 GLN 1 0.420 16 1 A 2101 ALA 1 0.440 17 1 A 2102 ALA 1 0.470 18 1 A 2103 LEU 1 0.540 19 1 A 2104 ARG 1 0.510 20 1 A 2105 GLN 1 0.510 21 1 A 2106 THR 1 0.550 22 1 A 2107 GLU 1 0.520 23 1 A 2108 ALA 1 0.520 24 1 A 2109 ARG 1 0.530 25 1 A 2110 GLU 1 0.480 26 1 A 2111 ILE 1 0.500 27 1 A 2112 GLU 1 0.450 28 1 A 2113 TRP 1 0.540 29 1 A 2114 ARG 1 0.460 30 1 A 2115 GLU 1 0.430 31 1 A 2116 LYS 1 0.430 32 1 A 2117 ALA 1 0.440 33 1 A 2118 GLN 1 0.460 34 1 A 2119 ASP 1 0.500 35 1 A 2120 LEU 1 0.560 36 1 A 2121 ALA 1 0.510 37 1 A 2122 LEU 1 0.610 38 1 A 2123 SER 1 0.580 39 1 A 2124 LEU 1 0.650 40 1 A 2125 ALA 1 0.600 41 1 A 2126 GLN 1 0.650 42 1 A 2127 THR 1 0.680 43 1 A 2128 LYS 1 0.650 44 1 A 2129 ALA 1 0.660 45 1 A 2130 SER 1 0.680 46 1 A 2131 VAL 1 0.660 47 1 A 2132 SER 1 0.650 48 1 A 2133 SER 1 0.650 49 1 A 2134 LEU 1 0.680 50 1 A 2135 GLN 1 0.590 51 1 A 2136 GLU 1 0.590 52 1 A 2137 VAL 1 0.580 53 1 A 2138 ALA 1 0.560 54 1 A 2139 MET 1 0.630 55 1 A 2140 PHE 1 0.680 56 1 A 2141 LEU 1 0.730 57 1 A 2142 GLN 1 0.650 58 1 A 2143 ALA 1 0.730 59 1 A 2144 SER 1 0.780 60 1 A 2145 VAL 1 0.740 61 1 A 2146 LEU 1 0.790 62 1 A 2147 GLU 1 0.730 63 1 A 2148 ARG 1 0.710 64 1 A 2149 ASP 1 0.750 65 1 A 2150 SER 1 0.720 66 1 A 2151 GLU 1 0.590 67 1 A 2152 GLN 1 0.630 68 1 A 2153 GLN 1 0.540 69 1 A 2154 ARG 1 0.560 70 1 A 2155 LEU 1 0.570 71 1 A 2156 GLN 1 0.450 72 1 A 2157 ASP 1 0.490 73 1 A 2158 GLU 1 0.450 74 1 A 2159 LEU 1 0.500 75 1 A 2160 GLU 1 0.440 76 1 A 2161 LEU 1 0.520 77 1 A 2162 THR 1 0.500 78 1 A 2163 ARG 1 0.490 79 1 A 2164 ARG 1 0.510 80 1 A 2165 ALA 1 0.510 81 1 A 2166 LEU 1 0.650 82 1 A 2167 GLU 1 0.550 83 1 A 2168 LYS 1 0.600 84 1 A 2169 GLU 1 0.600 85 1 A 2170 ARG 1 0.650 86 1 A 2171 LEU 1 0.550 87 1 A 2172 HIS 1 0.540 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #