data_SMR-eced9d0e0ad72508344f7bfe43182ddc_3 _entry.id SMR-eced9d0e0ad72508344f7bfe43182ddc_3 _struct.entry_id SMR-eced9d0e0ad72508344f7bfe43182ddc_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5T1R4/ ZEP3_HUMAN, Transcription factor HIVEP3 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5T1R4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 303156.117 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZEP3_HUMAN Q5T1R4 1 ;MDPEQSVKGTKKAEGSPRKRLTKGEAIQTSVSSSVPYPGSGTAATQESPAQELLAPQPFPGPSSVLREGS QEKTGQQQKPPKRPPIEASVHISQLPQHPLTPAFMSPGKPEHLLEGSTWQLVDPMRPGPSGSFVAPGLHP QSQLLPSHASIIPPEDLPGVPKVFVPRPSQVSLKPTEEAHKKERKPQKPGKYICQYCSRPCAKPSVLQKH IRSHTGERPYPCGPCGFSFKTKSNLYKHRKSHAHRIKAGLASGMGGEMYPHGLEMERIPGEEFEEPTEGE STDSEEETSATSGHPAELSPRPKQPLLSSGLYSSGSHSSSHERCSLSQSSTAQSLEDPPPFVEPSSEHPL SHKPEDTHTIKQKLALRLSERKKVIDEQAFLSPGSKGSTESGYFSRSESAEQQVSPPNTNAKSYAEIIFG KCGRIGQRTAMLTATSTQPLLPLSTEDKPSLVPLSVPRTQVIEHITKLITINEAVVDTSEIDSVKPRRSS LSRRSSMESPKSSLYREPLSSHSEKTKPEQSLLSLQHPPSTAPPVPLLRSHSMPSAACTISTPHHPFRGS YSFDDHITDSEALSHSSHVFTSHPRMLKRQPAIELPLGGEYSSEEPGPSSKDTASKPSDEVEPKESELTK KTKKGLKTKGVIYECNICGARYKKRDNYEAHKKYYCSELQIAKPISAGTHTSPEAEKSQIEHEPWSQMMH YKLGTTLELTPLRKRRKEKSLGDEEEPPAFESTKSQFGSPGPSDAARNLPLESTKSPAEPSKSVPSLEGP TGFQPRTPKPGSGSESGKERRTTSKEISVIQHTSSFEKSDSLEQPSGLEGEDKPLAQFPSPPPAPHGRSA HSLQPKLVRQPNIQVPEILVTEEPDRPDTEPEPPPKEPEKTEEFQWPQRSQTLAQLPAEKLPPKKKRLRL AEMAQSSGESSFESSVPLSRSPSQESNVSLSGSSRSASFERDDHGKAEAPSPSSDMRPKPLGTHMLTVPS HHPHAREMRRSASEQSPNVSHSAHMTETRSKSFDYGSLSLTGPSAPAPVAPPARVAPPERRKCFLVRQAS LSRPPESELEVAPKGRQESEEPQPSSSKPSAKSSLSQISSAATSHGGPPGGKGPGQDRPPLGPTVPYTEA LQVFHHPVAQTPLHEKPYLPPPVSLFSFQHLVQHEPGQSPEFFSTQAMSSLLSSPYSMPPLPPSLFQAPP LPLQPTVLHPGQLHLPQLMPHPANIPFRQPPSFLPMPYPTSSALSSGFFLPLQSQFALQLPGDVESHLPQ IKTSLAPLATGSAGLSPSTEYSSDIRLPPVAPPASSSAPTSAPPLALPACPDTMVSLVVPVRVQTNMPSY GSAMYTTLSQILVTQSQGSSATVALPKFEEPPSKGTTVCGADVHEVGPGPSGLSEEQSRAFPTPYLRVPV TLPERKGTSLSSESILSLEGSSSTAGGSKRVLSPAGSLELTMETQQQKRVKEEEASKADEKLELVKPCSV VLTSTEDGKRPEKSHLGNQGQGRRELEMLSSLSSDPSDTKEIPPLPHPALSHGTAPGSEALKEYPQPSGK PHRRGLTPLSVKKEDSKEQPDLPSLAPPSSLPLSETSSRPAKSQEGTDSKKVLQFPSLHTTTNVSWCYLN YIKPNHIQHADRRSSVYAGWCISLYNPNLPGVSTKAALSLLRSKQKVSKETYTMATAPHPEAGRLVPSSS RKPRMTEVHLPSLVSPEGQKDLARVEKEEERRGEPEEDAPASQRGEPARIKIFEGGYKSNEEYVYVRGRG RGKYVCEECGIRCKKPSMLKKHIRTHTDVRPYVCKHCHFAFKTKGNLTKHMKSKAHSKKCQETGVLEELE AEEGTSDDLFQDSEGREGSEAVEEHQFSDLEDSDSDSDLDEDEDEDEEESQDELSRPSSEAPPPGPPHAL RADSSPILGPQPPDAPASGTEATRGSSVSEAERLTASSCSMSSQSMPGLPWLGPAPLGSVEKDTGSALSY KPVSPRRPWSPSKEAGSRPPLARKHSLTKNDSSPQRCSPAREPQASAPSPPGLHVDPGRGMGALPCGSPR LQLSPLTLCPLGRELAPRAHVLSKLEGTTDPGLPRYSPTRRWSPGQAESPPRSAPPGKWALAGPGSPSAG EHGPGLGLDPRVLFPPAPLPHKLLSRSPETCASPWQKAESRSPSCSPGPAHPLSSRPFSALHDFHGHILA RTEENIFSHLPLHSQHLTRAPCPLIPIGGIQMVQARPGAHPTLLPGPTAAWVSGFSGGGSDLTGAREAQE RGRWSPTESSSASVSPVAKVSKFTLSSELEGGDYPKERERTGGGPGRPPDWTPHGTGAPAEPTPTHSPCT PPDTLPRPPQGRRAAQSWSPRLESPRAPTNPEPSATPPLDRSSSVGCLAEASARFPARTRNLSGEPRTRQ DSPKPSGSGEPRAHPHQPEDRVPPNA ; 'Transcription factor HIVEP3' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2406 1 2406 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZEP3_HUMAN Q5T1R4 . 1 2406 9606 'Homo sapiens (Human)' 2004-12-21 AFCCFDAF87014A7D # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MDPEQSVKGTKKAEGSPRKRLTKGEAIQTSVSSSVPYPGSGTAATQESPAQELLAPQPFPGPSSVLREGS QEKTGQQQKPPKRPPIEASVHISQLPQHPLTPAFMSPGKPEHLLEGSTWQLVDPMRPGPSGSFVAPGLHP QSQLLPSHASIIPPEDLPGVPKVFVPRPSQVSLKPTEEAHKKERKPQKPGKYICQYCSRPCAKPSVLQKH IRSHTGERPYPCGPCGFSFKTKSNLYKHRKSHAHRIKAGLASGMGGEMYPHGLEMERIPGEEFEEPTEGE STDSEEETSATSGHPAELSPRPKQPLLSSGLYSSGSHSSSHERCSLSQSSTAQSLEDPPPFVEPSSEHPL SHKPEDTHTIKQKLALRLSERKKVIDEQAFLSPGSKGSTESGYFSRSESAEQQVSPPNTNAKSYAEIIFG KCGRIGQRTAMLTATSTQPLLPLSTEDKPSLVPLSVPRTQVIEHITKLITINEAVVDTSEIDSVKPRRSS LSRRSSMESPKSSLYREPLSSHSEKTKPEQSLLSLQHPPSTAPPVPLLRSHSMPSAACTISTPHHPFRGS YSFDDHITDSEALSHSSHVFTSHPRMLKRQPAIELPLGGEYSSEEPGPSSKDTASKPSDEVEPKESELTK 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C 2 ZN 1 4 4 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'KRUEPPEL-LIKE FACTOR 4 {PDB ID=2wbs, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2wbs.1.A}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=2wbs, label_asym_id=D, auth_asym_id=A, SMTL ID=2wbs.1._.3}' 'template structure' . 3 'ZINC ION {PDB ID=2wbs, label_asym_id=E, auth_asym_id=A, SMTL ID=2wbs.1._.4}' 'template structure' . 4 . target . 5 'ZINC ION' target . 6 'Target-template alignment by HHblits to 2wbs, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 7 'model 3' 'model coordinates' . 8 SMTL 'reference database' . 9 PDB 'reference database' . 10 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 4 2 1 8 3 1 9 4 2 10 5 3 4 6 3 5 7 3 1 8 3 2 9 3 3 10 3 6 11 4 1 12 4 2 13 4 3 14 4 6 15 4 5 16 5 7 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 8 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 9 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 4 'reference database' 2 5 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . C 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B D 4 1 A 3 3 'reference database' non-polymer 1 3 C E 4 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;KRTATHTCDYAGCGKTYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYHCDWDGCGWKFARSDELTRHYRKHTGHRPFQCQK CDRAFSRSDHLALHMKRHF ; ;KRTATHTCDYAGCGKTYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYHCDWDGCGWKFARSDELTRHYRKHTGHRPFQCQK CDRAFSRSDHLALHMKRHF ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 88 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' 3 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2wbs 2024-05-08 2 PDB . 2wbs 2024-05-08 3 PDB . 2wbs 2024-05-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2406 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 6 1 2408 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 9.9e-08 30.380 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDPEQSVKGTKKAEGSPRKRLTKGEAIQTSVSSSVPYPGSGTAATQESPAQELLAPQPFPGPSSVLREGSQEKTGQQQKPPKRPPIEASVHISQLPQHPLTPAFMSPGKPEHLLEGSTWQLVDPMRPGPSGSFVAPGLHPQSQLLPSHASIIPPEDLPGVPKVFVPRPSQVSLKPTEEAHKKERKPQKPGKYICQY--CSRPCAKPSVLQKHIRSHTGERPYPCGPCGFSFKTKSNLYKHRKSHAHRIKAGLASGMGGEMYPHGLEMERIPGEEFEEPTEGESTDSEEETSATSGHPAELSPRPKQPLLSSGLYSSGSHSSSHERCSLSQSSTAQSLEDPPPFVEPSSEHPLSHKPEDTHTIKQKLALRLSERKKVIDEQAFLSPGSKGSTESGYFSRSESAEQQVSPPNTNAKSYAEIIFGKCGRIGQRTAMLTATSTQPLLPLSTEDKPSLVPLSVPRTQVIEHITKLITINEAVVDTSEIDSVKPRRSSLSRRSSMESPKSSLYREPLSSHSEKTKPEQSLLSLQHPPSTAPPVPLLRSHSMPSAACTISTPHHPFRGSYSFDDHITDSEALSHSSHVFTSHPRMLKRQPAIELPLGGEYSSEEPGPSSKDTASKPSDEVEPKESELTKKTKKGLKTKGVIYECNICGARYKKRDNYEAHKKYYCSELQIAKPISAGTHTSPEAEKSQIEHEPWSQMMHYKLGTTLELTPLRKRRKEKSLGDEEEPPAFESTKSQFGSPGPSDAARNLPLESTKSPAEPSKSVPSLEGPTGFQPRTPKPGSGSESGKERRTTSKEISVIQHTSSFEKSDSLEQPSGLEGEDKPLAQFPSPPPAPHGRSAHSLQPKLVRQPNIQVPEILVTEEPDRPDTEPEPPPKEPEKTEEFQWPQRSQTLAQLPAEKLPPKKKRLRLAEMAQSSGESSFESSVPLSRSPSQESNVSLSGSSRSASFERDDHGKAEAPSPSSDMRPKPLGTHMLTVPSHHPHAREMRRSASEQSPNVSHSAHMTETRSKSFDYGSLSLTGPSAPAPVAPPARVAPPERRKCFLVRQASLSRPPESELEVAPKGRQESEEPQPSSSKPSAKSSLSQISSAATSHGGPPGGKGPGQDRPPLGPTVPYTEALQVFHHPVAQTPLHEKPYLPPPVSLFSFQHLVQHEPGQSPEFFSTQAMSSLLSSPYSMPPLPPSLFQAPPLPLQPTVLHPGQLHLPQLMPHPANIPFRQPPSFLPMPYPTSSALSSGFFLPLQSQFALQLPGDVESHLPQIKTSLAPLATGSAGLSPSTEYSSDIRLPPVAPPASSSAPTSAPPLALPACPDTMVSLVVPVRVQTNMPSYGSAMYTTLSQILVTQSQGSSATVALPKFEEPPSKGTTVCGADVHEVGPGPSGLSEEQSRAFPTPYLRVPVTLPERKGTSLSSESILSLEGSSSTAGGSKRVLSPAGSLELTMETQQQKRVKEEEASKADEKLELVKPCSVVLTSTEDGKRPEKSHLGNQGQGRRELEMLSSLSSDPSDTKEIPPLPHPALSHGTAPGSEALKEYPQPSGKPHRRGLTPLSVKKEDSKEQPDLPSLAPPSSLPLSETSSRPAKSQEGTDSKKVLQFPSLHTTTNVSWCYLNYIKPNHIQHADRRSSVYAGWCISLYNPNLPGVSTKAALSLLRSKQKVSKETYTMATAPHPEAGRLVPSSSRKPRMTEVHLPSLVSPEGQKDLARVEKEEERRGEPEEDAPASQRGEPARIKIFEGGYKSNEEYVYVRGRGRGKYVCEECGIRCKKPSMLKKHIRTHTDVRPYVCKHCHFAFKTKGNLTKHMKSKAHSKKCQETGVLEELEAEEGTSDDLFQDSEGREGSEAVEEHQFSDLEDSDSDSDLDEDEDEDEEESQDELSRPSSEAPPPGPPHALRADSSPILGPQPPDAPASGTEATRGSSVSEAERLTASSCSMSSQSMPGLPWLGPAPLGSVEKDTGSALSYKPVSPRRPWSPSKEAGSRPPLARKHSLTKNDSSPQRCSPAREPQASAPSPPGLHVDPGRGMGALPCGSPRLQLSPLTLCPLGRELAPRAHVLSKLEGTTDPGLPRYSPTRRWSPGQAESPPRSAPPGKWALAGPGSPSAGEHGPGLGLDPRVLFPPAPLPHKLLSRSPETCASPWQKAESRSPSCSPGPAHPLSSRPFSALHDFHGHILARTEENIFSHLPLHSQHLTRAPCPLIPIGGIQMVQARPGAHPTLLPGPTAAWVSGFSGGGSDLTGAREAQERGRWSPTESSSASVSPVAKVSKFTLSSELEGGDYPKERERTGGGPGRPPDWTPHGTGAPAEPTPTHSPCTPPDTLPRPPQGRRAAQSWSPRLESPRAPTNPEPSATPPLDRSSSVGCLAEASARFPARTRNLSGEPRTRQDSPKPSGSGEPRAHPHQPEDRVPPNA 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CDYAGCGKTYTKSSHL-------KAHLRTH--TGEKPYHCDWDGCGWKFARSDELTRHYRKHTGHRPFQCQKCDRAFSRSDHLALHMKRH---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2wbs.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 7 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 155 155 ? A 21.579 34.798 8.259 1 1 A GLU 0.350 1 ATOM 2 C CA . GLU 155 155 ? A 21.672 34.808 9.742 1 1 A GLU 0.350 1 ATOM 3 C C . GLU 155 155 ? A 22.874 35.596 10.197 1 1 A GLU 0.350 1 ATOM 4 O O . GLU 155 155 ? A 23.945 35.356 9.648 1 1 A GLU 0.350 1 ATOM 5 C CB . GLU 155 155 ? A 21.887 33.360 10.226 1 1 A GLU 0.350 1 ATOM 6 C CG . GLU 155 155 ? A 21.689 33.257 11.740 1 1 A GLU 0.350 1 ATOM 7 C CD . GLU 155 155 ? A 20.226 33.549 12.057 1 1 A GLU 0.350 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 155 155 ? A 19.966 34.539 12.784 1 1 A GLU 0.350 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 155 155 ? A 19.367 32.875 11.439 1 1 A GLU 0.350 1 ATOM 10 N N . ASP 156 156 ? A 22.742 36.506 11.187 1 1 A ASP 0.350 1 ATOM 11 C CA . ASP 156 156 ? A 23.822 37.375 11.622 1 1 A ASP 0.350 1 ATOM 12 C C . ASP 156 156 ? A 24.351 36.962 12.987 1 1 A ASP 0.350 1 ATOM 13 O O . ASP 156 156 ? A 25.079 37.670 13.677 1 1 A ASP 0.350 1 ATOM 14 C CB . ASP 156 156 ? A 23.318 38.835 11.646 1 1 A ASP 0.350 1 ATOM 15 C CG . ASP 156 156 ? A 23.467 39.386 10.242 1 1 A ASP 0.350 1 ATOM 16 O OD1 . ASP 156 156 ? A 22.429 39.770 9.647 1 1 A ASP 0.350 1 ATOM 17 O OD2 . ASP 156 156 ? A 24.621 39.382 9.743 1 1 A ASP 0.350 1 ATOM 18 N N . LEU 157 157 ? A 23.995 35.751 13.438 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 19 C CA . LEU 157 157 ? A 24.543 35.181 14.637 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 20 C C . LEU 157 157 ? A 26.061 34.959 14.580 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 21 O O . LEU 157 157 ? A 26.566 34.591 13.519 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 22 C CB . LEU 157 157 ? A 23.871 33.832 14.901 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 23 C CG . LEU 157 157 ? A 22.347 33.906 15.024 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 24 C CD1 . LEU 157 157 ? A 21.816 32.471 15.046 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 25 C CD2 . LEU 157 157 ? A 21.881 34.805 16.167 1 1 A LEU 0.550 1 ATOM 26 N N . PRO 158 158 ? A 26.825 35.129 15.675 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 27 C CA . PRO 158 158 ? A 28.277 35.021 15.688 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 28 C C . PRO 158 158 ? A 28.785 33.764 15.034 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 29 O O . PRO 158 158 ? A 28.405 32.687 15.472 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 30 C CB . PRO 158 158 ? A 28.626 35.025 17.184 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 31 C CG . PRO 158 158 ? A 27.535 35.878 17.834 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 32 C CD . PRO 158 158 ? A 26.348 35.811 16.862 1 1 A PRO 0.630 1 ATOM 33 N N . GLY 159 159 ? A 29.597 33.862 13.972 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 34 C CA . GLY 159 159 ? A 30.245 32.692 13.393 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 35 C C . GLY 159 159 ? A 29.380 31.736 12.577 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 36 O O . GLY 159 159 ? A 29.883 30.720 12.109 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 37 N N . VAL 160 160 ? A 28.078 32.017 12.374 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 38 C CA . VAL 160 160 ? A 27.138 31.250 11.573 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 39 C C . VAL 160 160 ? A 27.199 31.443 10.024 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 40 O O . VAL 160 160 ? A 26.904 30.476 9.373 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 41 C CB . VAL 160 160 ? A 25.742 31.523 12.064 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 42 C CG1 . VAL 160 160 ? A 24.687 30.704 11.313 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 43 C CG2 . VAL 160 160 ? A 25.723 31.109 13.532 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 44 N N . PRO 161 161 ? A 27.346 32.653 9.440 1 1 A PRO 0.460 1 ATOM 45 C CA . PRO 161 161 ? A 26.824 33.121 8.153 1 1 A PRO 0.460 1 ATOM 46 C C . PRO 161 161 ? A 25.740 32.487 7.289 1 1 A PRO 0.460 1 ATOM 47 O O . PRO 161 161 ? A 25.590 32.946 6.166 1 1 A PRO 0.460 1 ATOM 48 C CB . PRO 161 161 ? A 28.098 33.309 7.341 1 1 A PRO 0.460 1 ATOM 49 C CG . PRO 161 161 ? A 29.184 33.739 8.331 1 1 A PRO 0.460 1 ATOM 50 C CD . PRO 161 161 ? A 28.583 33.401 9.699 1 1 A PRO 0.460 1 ATOM 51 N N . LYS 162 162 ? A 24.986 31.457 7.706 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 52 C CA . LYS 162 162 ? A 24.032 30.755 6.870 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 53 C C . LYS 162 162 ? A 22.914 31.609 6.290 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 54 O O . LYS 162 162 ? A 22.301 32.443 6.967 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 55 C CB . LYS 162 162 ? A 23.449 29.556 7.651 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 56 C CG . LYS 162 162 ? A 24.497 28.462 7.944 1 1 A LYS 0.450 1 ATOM 57 C CD . LYS 162 162 ? 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A 9.837 38.334 4.916 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 100 C CZ . ARG 167 167 ? A 9.413 38.678 3.691 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 101 N NH1 . ARG 167 167 ? A 10.244 39.186 2.789 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 102 N NH2 . ARG 167 167 ? A 8.132 38.512 3.358 1 1 A ARG 0.340 1 ATOM 103 N N . PRO 168 168 ? A 10.825 32.839 6.258 1 1 A PRO 0.420 1 ATOM 104 C CA . PRO 168 168 ? A 10.442 31.661 7.039 1 1 A PRO 0.420 1 ATOM 105 C C . PRO 168 168 ? A 11.561 30.756 7.542 1 1 A PRO 0.420 1 ATOM 106 O O . PRO 168 168 ? A 11.562 30.367 8.703 1 1 A PRO 0.420 1 ATOM 107 C CB . PRO 168 168 ? A 9.510 30.885 6.089 1 1 A PRO 0.420 1 ATOM 108 C CG . PRO 168 168 ? A 8.888 31.918 5.140 1 1 A PRO 0.420 1 ATOM 109 C CD . PRO 168 168 ? A 9.803 33.141 5.238 1 1 A PRO 0.420 1 ATOM 110 N N . SER 169 169 ? A 12.506 30.378 6.663 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 111 C CA . SER 169 169 ? A 13.578 29.453 7.008 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 112 C C . SER 169 169 ? A 14.652 30.070 7.874 1 1 A SER 0.470 1 ATOM 113 O O . SER 169 169 ? 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A 19.856 29.141 10.571 1 1 A HIS 0.480 1 ATOM 198 N ND1 . HIS 180 180 ? A 20.294 27.838 10.521 1 1 A HIS 0.480 1 ATOM 199 C CD2 . HIS 180 180 ? A 20.866 29.960 10.830 1 1 A HIS 0.480 1 ATOM 200 C CE1 . HIS 180 180 ? A 21.553 27.911 10.800 1 1 A HIS 0.480 1 ATOM 201 N NE2 . HIS 180 180 ? A 21.985 29.183 10.966 1 1 A HIS 0.480 1 ATOM 202 N N . LYS 181 181 ? A 17.492 30.832 13.261 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 203 C CA . LYS 181 181 ? A 17.620 31.744 14.374 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 204 C C . LYS 181 181 ? A 17.269 31.151 15.738 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 205 O O . LYS 181 181 ? A 17.867 31.455 16.761 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 206 C CB . LYS 181 181 ? A 16.744 32.985 14.114 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 207 C CG . LYS 181 181 ? A 16.942 34.089 15.164 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 208 C CD . LYS 181 181 ? A 16.171 35.370 14.838 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 209 C CE . LYS 181 181 ? A 16.357 36.467 15.880 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 210 N NZ . LYS 181 181 ? A 15.585 37.659 15.473 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 211 N N . LYS 182 182 ? A 16.242 30.278 15.779 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 212 C CA . LYS 182 182 ? A 15.736 29.700 17.012 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 213 C C . LYS 182 182 ? A 16.599 28.574 17.553 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 214 O O . LYS 182 182 ? A 16.522 28.251 18.749 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 215 C CB . LYS 182 182 ? A 14.292 29.189 16.818 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 216 C CG . LYS 182 182 ? A 13.292 30.330 16.574 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 217 C CD . LYS 182 182 ? A 11.856 29.805 16.454 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 218 C CE . LYS 182 182 ? A 10.800 30.909 16.303 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 219 N NZ . LYS 182 182 ? A 9.471 30.317 16.066 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 220 N N . GLU 183 183 ? A 17.486 28.006 16.713 1 1 A GLU 0.480 1 ATOM 221 C CA . GLU 183 183 ? A 18.430 26.962 17.050 1 1 A GLU 0.480 1 ATOM 222 C C . GLU 183 183 ? A 19.601 27.490 17.858 1 1 A GLU 0.480 1 ATOM 223 O O . GLU 183 183 ? A 20.392 26.748 18.435 1 1 A GLU 0.480 1 ATOM 224 C CB . GLU 183 183 ? A 18.985 26.325 15.774 1 1 A GLU 0.480 1 ATOM 225 C CG . GLU 183 183 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.525 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 155 GLU 1 0.350 2 1 A 156 ASP 1 0.350 3 1 A 157 LEU 1 0.550 4 1 A 158 PRO 1 0.630 5 1 A 159 GLY 1 0.620 6 1 A 160 VAL 1 0.560 7 1 A 161 PRO 1 0.460 8 1 A 162 LYS 1 0.450 9 1 A 163 VAL 1 0.360 10 1 A 164 PHE 1 0.320 11 1 A 165 VAL 1 0.270 12 1 A 166 PRO 1 0.330 13 1 A 167 ARG 1 0.340 14 1 A 168 PRO 1 0.420 15 1 A 169 SER 1 0.470 16 1 A 170 GLN 1 0.480 17 1 A 171 VAL 1 0.510 18 1 A 172 SER 1 0.520 19 1 A 173 LEU 1 0.490 20 1 A 174 LYS 1 0.520 21 1 A 175 PRO 1 0.520 22 1 A 176 THR 1 0.530 23 1 A 177 GLU 1 0.280 24 1 A 178 GLU 1 0.280 25 1 A 179 ALA 1 0.530 26 1 A 180 HIS 1 0.480 27 1 A 181 LYS 1 0.510 28 1 A 182 LYS 1 0.510 29 1 A 183 GLU 1 0.480 30 1 A 184 ARG 1 0.470 31 1 A 185 LYS 1 0.430 32 1 A 186 PRO 1 0.320 33 1 A 187 GLN 1 0.300 34 1 A 188 LYS 1 0.330 35 1 A 189 PRO 1 0.370 36 1 A 190 GLY 1 0.450 37 1 A 191 LYS 1 0.460 38 1 A 192 TYR 1 0.510 39 1 A 193 ILE 1 0.560 40 1 A 194 CYS 1 0.650 41 1 A 195 GLN 1 0.560 42 1 A 196 TYR 1 0.460 43 1 A 197 CYS 1 0.510 44 1 A 198 SER 1 0.500 45 1 A 199 ARG 1 0.550 46 1 A 200 PRO 1 0.610 47 1 A 201 CYS 1 0.590 48 1 A 202 ALA 1 0.540 49 1 A 203 LYS 1 0.590 50 1 A 204 PRO 1 0.680 51 1 A 205 SER 1 0.700 52 1 A 206 VAL 1 0.730 53 1 A 207 LEU 1 0.700 54 1 A 208 GLN 1 0.660 55 1 A 209 LYS 1 0.660 56 1 A 210 HIS 1 0.680 57 1 A 211 ILE 1 0.640 58 1 A 212 ARG 1 0.510 59 1 A 213 SER 1 0.640 60 1 A 214 HIS 1 0.580 61 1 A 215 THR 1 0.600 62 1 A 216 GLY 1 0.560 63 1 A 217 GLU 1 0.600 64 1 A 218 ARG 1 0.480 65 1 A 219 PRO 1 0.570 66 1 A 220 TYR 1 0.560 67 1 A 221 PRO 1 0.600 68 1 A 222 CYS 1 0.580 69 1 A 223 GLY 1 0.550 70 1 A 224 PRO 1 0.470 71 1 A 225 CYS 1 0.450 72 1 A 226 GLY 1 0.490 73 1 A 227 PHE 1 0.500 74 1 A 228 SER 1 0.620 75 1 A 229 PHE 1 0.630 76 1 A 230 LYS 1 0.620 77 1 A 231 THR 1 0.640 78 1 A 232 LYS 1 0.670 79 1 A 233 SER 1 0.700 80 1 A 234 ASN 1 0.710 81 1 A 235 LEU 1 0.650 82 1 A 236 TYR 1 0.580 83 1 A 237 LYS 1 0.670 84 1 A 238 HIS 1 0.630 85 1 A 239 ARG 1 0.560 86 1 A 240 LYS 1 0.600 87 1 A 241 SER 1 0.480 88 1 A 242 HIS 1 0.390 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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