data_SMR-416f62700a0206653eb0ed7cfd345b38_1 _entry.id SMR-416f62700a0206653eb0ed7cfd345b38_1 _struct.entry_id SMR-416f62700a0206653eb0ed7cfd345b38_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8IVL1 (isoform 2)/ NAV2_HUMAN, Neuron navigator 2 Estimated model accuracy of this model is 0.047, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8IVL1 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 305567.130 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NAV2_HUMAN Q8IVL1 1 ;MQECDSKFFLPSGSNSGFTLLSNQQIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANEKIE DINGCPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRYKQQQQQPQKQHLSS PLPPAVSQVAGAPSQCQAGTPQQQVPVTPQAPCQPHQPAPHQQSKAQAEMQSSASSKDSSQSKIIRFTLG QKKISRLPGPTARVSAAGSEAKTRGGSTTANNRRSQSFNNYDKSKPVTSPPPPPSSHEKEPLASSASSHP GMSDNAPASLESGSSSTPTNCSTSSAIPQPGAATKPWRSKSLSVKHSATVSMLSVKPPGPEAPRPTPEAM KPAPNNQKSMLEKLKLFNSKGGSKAGEGPGSRDTSCERLETLPSFEESEELEAASRMLTTVGPASSSPKI ALKGIAQRTFSRALTNKKSSLKGNEKEKEKQQREKDKEKSKDLAKRASVTERLDLKEEPKEDPSGAAVPE MPKKSSKIASFIPKGGKLNSAKKEPMAPSHSGIPKPGMKSMPGKSPSAPAPSKEGERSRSGKLSSGLPQQ KPQLDGRHSSSSSSLASSEGKGPGGTTLNHSISSQTVSGSVGTTQTTGSNTVSVQLPQPQQQYNHPNTAT VAPFLYRSQTDTEGNVTAESSSTGVSVEPSHFTKTGQPALEELTGEDPEARRLRTVKNIADLRQNLEETM SSLRGTQVTHSTLETTFDTNVTTEMSGRSILSLTGRPTPLSWRLGQSSPRLQAGDAPSMGNGYPPRANAS RFINTESGRYVYSAPLRRQLASRGSSVCHVDVSDKAGDEMDLEGISMDAPGYMSDGDVLSKNIRTDDITS GYMTDGGLGLYTRRLNRLPDGMAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSSSVSSGISDTIDNLSTDDINTSSS ISSYANTPASSRKNLDVQTDAEKHSQVERNSLWSGDDVKKSDGGSDSGIKMEPGSKWRRNPSDVSDESDK STSGKKNPVISQTGSWRRGMTAQVGITMPRTKPSAPAGALKTPGTGKTDDAKVSEKGRLSPKASQVKRSP SDAGRSSGDESKKPLPSSSRTPTANANSFGFKKQSGSAAGLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSALVSR SAGRKSSMDGAQNQDDGYLALSSRTNLQYRSLPRPSKSNSRNGAGNRSSTSSIDSNISSKSAGLPVPKLR EPSKTALGSSLPGLVNQTDKEKGISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQPGAKYPDVASPTLRR LFGGKPTKQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPSGSGVLSSGSSSPLYSKNVDLNQSPLASSP SSAHSAPSNSLTWGTNASSSSAVSKDGLGFQSVSSLHTSCESIDISLSSGGVPSHNSSTGLIASSKDDSL TPFVRTNSVKTTLSESPLSSPAASPKFCRSTLPRKQDSDPHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDAKEWL RSHSAGGLQDTAANSPFSSGSSVTSPSGTRFNFSQLASPTTVTQMSLSNPTMLRTHSLSNADGQYDPYTD SRFRNSSMSLDEKSRTMSRSGSFRDGFEEESWEKSSVDNFVSRLHSSLHFSLPLFHHARYELVHGSSLSL VSSTSSVYSTPEEKCQSEIRKLRRELDASQEKVSALTTQLTANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQ KDSELNELRKTIELLKKQNAAAQAAINGVINTPELNCKGNGTAQSADLRIRRQHSSDSVSSINSATSHSS VGSNIESDSKKKKRKNWVNELRSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMTDSSLPSSPKLPHNGSTGSTPLL RNSHSNSLISECMDSEAETVMQLRNELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQLREAMNRMQSEIEKLKAEND RLKSESQGSGCSRAPSQVSISASPRQSMGLSQHSLNLTESTSLDMLLDDTGECSARKEGGRHVKIVVSFQ EEMKWKEDSRPHLFLIGCIGVSGKTKWDVLDGVVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSVLGYSIGEIKRSN TSETPELLPCGYLVGENTTISVTVKGLAENSLDSLVFESLIPKPILQRYVSLLIEHRRIILSGPSGTGKT YLANRLSEYIVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQYLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVSS LGEIFNGLLNCKYHKCPYIIGTMNQATSSTPNLQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRFLRRKLMETEISG RVRNMELVKIIDWIPKVWHHLNRFLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPIDVDGSRVWFTDLWNYSIIPYLLEAV REGLQLYGRRAPWEDPAKWVMDTYPWAASPQQHEWPPLLQLRPEDVGFDGYSMPREGSTSKQMPPSDAEG DPLMNMLMRLQEAANYSSPQSYDSDSNSNSHHDDILDSSLESTL ; 'Neuron navigator 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2424 1 2424 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 2377 ASP 2377 ? ? ? A . A 1 2378 ALA 2378 ? ? ? A . A 1 2379 GLU 2379 ? ? ? A . A 1 2380 GLY 2380 ? ? ? A . A 1 2381 ASP 2381 ? ? ? A . A 1 2382 PRO 2382 ? ? ? A . A 1 2383 LEU 2383 ? ? ? A . A 1 2384 MET 2384 ? ? ? A . A 1 2385 ASN 2385 ? ? ? A . A 1 2386 MET 2386 ? ? ? A . A 1 2387 LEU 2387 ? ? ? A . A 1 2388 MET 2388 ? ? ? A . A 1 2389 ARG 2389 ? ? ? A . A 1 2390 LEU 2390 ? ? ? A . A 1 2391 GLN 2391 ? ? ? A . A 1 2392 GLU 2392 ? ? ? A . A 1 2393 ALA 2393 ? ? ? A . A 1 2394 ALA 2394 ? ? ? A . A 1 2395 ASN 2395 ? ? ? A . A 1 2396 TYR 2396 ? ? ? A . A 1 2397 SER 2397 ? ? ? A . A 1 2398 SER 2398 ? ? ? A . A 1 2399 PRO 2399 ? ? ? A . A 1 2400 GLN 2400 ? ? ? A . A 1 2401 SER 2401 ? ? ? A . A 1 2402 TYR 2402 ? ? ? A . A 1 2403 ASP 2403 ? ? ? A . A 1 2404 SER 2404 ? ? ? A . A 1 2405 ASP 2405 ? ? ? A . A 1 2406 SER 2406 ? ? ? A . A 1 2407 ASN 2407 ? ? ? A . A 1 2408 SER 2408 ? ? ? A . A 1 2409 ASN 2409 ? ? ? A . A 1 2410 SER 2410 ? ? ? A . A 1 2411 HIS 2411 ? ? ? A . A 1 2412 HIS 2412 ? ? ? A . A 1 2413 ASP 2413 ? ? ? A . A 1 2414 ASP 2414 ? ? ? A . A 1 2415 ILE 2415 ? ? ? A . A 1 2416 LEU 2416 ? ? ? A . A 1 2417 ASP 2417 ? ? ? A . A 1 2418 SER 2418 ? ? ? A . A 1 2419 SER 2419 ? ? ? A . A 1 2420 LEU 2420 ? ? ? A . A 1 2421 GLU 2421 ? ? ? A . A 1 2422 SER 2422 ? ? ? A . A 1 2423 THR 2423 ? ? ? A . A 1 2424 LEU 2424 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Neuron navigator 2 isoform 4 {PDB ID=2yrn, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2yrn.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2yrn, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGKRKPVIHGLEDQKRIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANEKIEDING CPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRYKQQQQQP ; ;GSSGSSGKRKPVIHGLEDQKRIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANEKIEDING CPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRYKQQQQQP ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 12 124 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2yrn 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2424 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2424 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.5e-21 92.035 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MQECDSKFFLPSGSNSGFTLLSNQQIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANEKIEDINGCPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRYKQQQQQPQKQHLSSPLPPAVSQVAGAPSQCQAGTPQQQVPVTPQAPCQPHQPAPHQQSKAQAEMQSSASSKDSSQSKIIRFTLGQKKISRLPGPTARVSAAGSEAKTRGGSTTANNRRSQSFNNYDKSKPVTSPPPPPSSHEKEPLASSASSHPGMSDNAPASLESGSSSTPTNCSTSSAIPQPGAATKPWRSKSLSVKHSATVSMLSVKPPGPEAPRPTPEAMKPAPNNQKSMLEKLKLFNSKGGSKAGEGPGSRDTSCERLETLPSFEESEELEAASRMLTTVGPASSSPKIALKGIAQRTFSRALTNKKSSLKGNEKEKEKQQREKDKEKSKDLAKRASVTERLDLKEEPKEDPSGAAVPEMPKKSSKIASFIPKGGKLNSAKKEPMAPSHSGIPKPGMKSMPGKSPSAPAPSKEGERSRSGKLSSGLPQQKPQLDGRHSSSSSSLASSEGKGPGGTTLNHSISSQTVSGSVGTTQTTGSNTVSVQLPQPQQQYNHPNTATVAPFLYRSQTDTEGNVTAESSSTGVSVEPSHFTKTGQPALEELTGEDPEARRLRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQVTHSTLETTFDTNVTTEMSGRSILSLTGRPTPLSWRLGQSSPRLQAGDAPSMGNGYPPRANASRFINTESGRYVYSAPLRRQLASRGSSVCHVDVSDKAGDEMDLEGISMDAPGYMSDGDVLSKNIRTDDITSGYMTDGGLGLYTRRLNRLPDGMAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSSSVSSGISDTIDNLSTDDINTSSSISSYANTPASSRKNLDVQTDAEKHSQVERNSLWSGDDVKKSDGGSDSGIKMEPGSKWRRNPSDVSDESDKSTSGKKNPVISQTGSWRRGMTAQVGITMPRTKPSAPAGALKTPGTGKTDDAKVSEKGRLSPKASQVKRSPSDAGRSSGDESKKPLPSSSRTPTANANSFGFKKQSGSAAGLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSALVSRSAGRKSSMDGAQNQDDGYLALSSRTNLQYRSLPRPSKSNSRNGAGNRSSTSSIDSNISSKSAGLPVPKLREPSKTALGSSLPGLVNQTDKEKGISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQPGAKYPDVASPTLRRLFGGKPTKQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPSGSGVLSSGSSSPLYSKNVDLNQSPLASSPSSAHSAPSNSLTWGTNASSSSAVSKDGLGFQSVSSLHTSCESIDISLSSGGVPSHNSSTGLIASSKDDSLTPFVRTNSVKTTLSESPLSSPAASPKFCRSTLPRKQDSDPHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDAKEWLRSHSAGGLQDTAANSPFSSGSSVTSPSGTRFNFSQLASPTTVTQMSLSNPTMLRTHSLSNADGQYDPYTDSRFRNSSMSLDEKSRTMSRSGSFRDGFEEESWEKSSVDNFVSRLHSSLHFSLPLFHHARYELVHGSSLSLVSSTSSVYSTPEEKCQSEIRKLRRELDASQEKVSALTTQLTANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQKDSELNELRKTIELLKKQNAAAQAAINGVINTPELNCKGNGTAQSADLRIRRQHSSDSVSSINSATSHSSVGSNIESDSKKKKRKNWVNELRSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMTDSSLPSSPKLPHNGSTGSTPLLRNSHSNSLISECMDSEAETVMQLRNELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQLREAMNRMQSEIEKLKAENDRLKSESQGSGCSRAPSQVSISASPRQSMGLSQHSLNLTESTSLDMLLDDTGECSARKEGGRHVKIVVSFQEEMKWKEDSRPHLFLIGCIGVSGKTKWDVLDGVVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSVLGYSIGEIKRSNTSETPELLPCGYLVGENTTISVTVKGLAENSLDSLVFESLIPKPILQRYVSLLIEHRRIILSGPSGTGKTYLANRLSEYIVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQYLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVSSLGEIFNGLLNCKYHKCPYIIGTMNQATSSTPNLQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRFLRRKLMETEISGRVRNMELVKIIDWIPKVWHHLNRFLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPIDVDGSRVWFTDLWNYSIIPYLLEAVREGLQLYGRRAPWEDPAKWVMDTYPWAASPQQHEWPPLLQLRPEDVGFDGYSMPREGSTSKQMPPSDAEGDPLMNMLMRLQEAANYSSPQSYDSDSNSNSHHDDILDSSLESTL 2 1 2 ---------------VIHGLEDQKRIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANEKIEDINGCPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRYKQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2yrn.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 16 16 ? A 8.913 17.429 -12.243 1 1 A SER 0.370 1 ATOM 2 C CA . SER 16 16 ? A 7.545 17.905 -11.795 1 1 A SER 0.370 1 ATOM 3 C C . SER 16 16 ? A 7.337 17.457 -10.366 1 1 A SER 0.370 1 ATOM 4 O O . SER 16 16 ? A 7.861 16.411 -10.001 1 1 A SER 0.370 1 ATOM 5 C CB . SER 16 16 ? A 6.411 17.381 -12.736 1 1 A SER 0.370 1 ATOM 6 O OG . SER 16 16 ? A 5.152 17.947 -12.382 1 1 A SER 0.370 1 ATOM 7 N N . GLY 17 17 ? A 6.652 18.260 -9.518 1 1 A GLY 0.360 1 ATOM 8 C CA . GLY 17 17 ? A 6.345 17.899 -8.142 1 1 A GLY 0.360 1 ATOM 9 C C . GLY 17 17 ? A 5.052 17.167 -8.099 1 1 A GLY 0.360 1 ATOM 10 O O . GLY 17 17 ? A 4.136 17.451 -8.868 1 1 A GLY 0.360 1 ATOM 11 N N . PHE 18 18 ? A 4.941 16.238 -7.150 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 12 C CA . PHE 18 18 ? A 3.748 15.496 -6.906 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 13 C C . PHE 18 18 ? A 3.437 15.840 -5.463 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 14 O O . PHE 18 18 ? A 4.071 15.376 -4.533 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 15 C CB . PHE 18 18 ? A 3.979 13.986 -7.150 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 16 C CG . PHE 18 18 ? A 4.454 13.761 -8.567 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 17 C CD1 . PHE 18 18 ? A 3.549 13.618 -9.632 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 18 C CD2 . PHE 18 18 ? A 5.822 13.564 -8.819 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 19 C CE1 . PHE 18 18 ? A 3.998 13.275 -10.914 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 20 C CE2 . PHE 18 18 ? A 6.277 13.230 -10.098 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 21 C CZ . PHE 18 18 ? A 5.364 13.084 -11.148 1 1 A PHE 0.510 1 ATOM 22 N N . THR 19 19 ? A 2.459 16.755 -5.280 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 23 C CA . THR 19 19 ? A 1.732 17.064 -4.049 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 24 C C . THR 19 19 ? A 1.165 15.825 -3.361 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 25 O O . THR 19 19 ? A 1.147 14.732 -3.918 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 26 C CB . THR 19 19 ? A 0.622 18.116 -4.230 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 27 O OG1 . THR 19 19 ? A -0.418 17.665 -5.083 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 28 C CG2 . THR 19 19 ? A 1.202 19.389 -4.866 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 29 N N . LEU 20 20 ? A 0.642 15.929 -2.123 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 30 C CA . LEU 20 20 ? A 0.049 14.807 -1.410 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 31 C C . LEU 20 20 ? A -1.052 14.048 -2.180 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 32 O O . LEU 20 20 ? A -1.046 12.833 -2.294 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 33 C CB . LEU 20 20 ? A -0.559 15.319 -0.079 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 34 C CG . LEU 20 20 ? A 0.364 16.198 0.795 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 35 C CD1 . LEU 20 20 ? A -0.457 16.731 1.980 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 36 C CD2 . LEU 20 20 ? A 1.637 15.458 1.251 1 1 A LEU 0.530 1 ATOM 37 N N . LEU 21 21 ? A -1.996 14.782 -2.795 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 38 C CA . LEU 21 21 ? A -3.007 14.233 -3.685 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 39 C C . LEU 21 21 ? A -2.454 13.554 -4.933 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 40 O O . LEU 21 21 ? A -2.908 12.493 -5.341 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 41 C CB . LEU 21 21 ? A -3.943 15.381 -4.114 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 42 C CG . LEU 21 21 ? A -4.803 15.967 -2.977 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 43 C CD1 . LEU 21 21 ? A -5.581 17.183 -3.503 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 44 C CD2 . LEU 21 21 ? A -5.782 14.914 -2.427 1 1 A LEU 0.510 1 ATOM 45 N N . SER 22 22 ? A -1.423 14.137 -5.567 1 1 A SER 0.540 1 ATOM 46 C CA . SER 22 22 ? A -0.721 13.541 -6.692 1 1 A SER 0.540 1 ATOM 47 C C . SER 22 22 ? A 0.033 12.250 -6.334 1 1 A SER 0.540 1 ATOM 48 O O . SER 22 22 ? A 0.067 11.297 -7.105 1 1 A SER 0.540 1 ATOM 49 C CB . SER 22 22 ? A 0.312 14.530 -7.267 1 1 A SER 0.540 1 ATOM 50 O OG . SER 22 22 ? A -0.285 15.739 -7.735 1 1 A SER 0.540 1 ATOM 51 N N . ASN 23 23 ? A 0.657 12.179 -5.126 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 52 C CA . ASN 23 23 ? A 1.351 10.992 -4.606 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 53 C C . ASN 23 23 ? A 0.468 9.780 -4.435 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 54 O O . ASN 23 23 ? A 0.908 8.648 -4.576 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 55 C CB . ASN 23 23 ? A 1.952 11.168 -3.192 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 56 C CG . ASN 23 23 ? A 3.219 11.999 -3.263 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 57 O OD1 . ASN 23 23 ? A 3.910 12.049 -4.254 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 58 N ND2 . ASN 23 23 ? A 3.558 12.621 -2.102 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 59 N N . GLN 24 24 ? 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GLN 25 25 ? A -3.434 10.876 -9.873 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 75 O OE1 . GLN 25 25 ? A -2.450 11.450 -10.294 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 76 N NE2 . GLN 25 25 ? A -4.673 11.114 -10.371 1 1 A GLN 0.740 1 ATOM 77 N N . ILE 26 26 ? A 0.649 7.888 -7.771 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 78 C CA . ILE 26 26 ? A 1.943 7.246 -8.012 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 79 C C . ILE 26 26 ? A 2.054 5.910 -7.286 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 80 O O . ILE 26 26 ? A 2.441 4.887 -7.832 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 81 C CB . ILE 26 26 ? A 3.097 8.131 -7.524 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 82 C CG1 . ILE 26 26 ? A 3.138 9.469 -8.287 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 83 C CG2 . ILE 26 26 ? A 4.473 7.415 -7.635 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 84 C CD1 . ILE 26 26 ? A 4.114 10.459 -7.648 1 1 A ILE 0.740 1 ATOM 85 N N . TYR 27 27 ? A 1.655 5.905 -5.999 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 86 C CA . TYR 27 27 ? A 1.581 4.703 -5.192 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 87 C C . TYR 27 27 ? A 0.534 3.687 -5.589 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 88 O O . TYR 27 27 ? A 0.771 2.486 -5.498 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 89 C CB . TYR 27 27 ? A 1.268 5.067 -3.744 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 90 C CG . TYR 27 27 ? A 2.391 5.844 -3.153 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 91 C CD1 . TYR 27 27 ? A 3.730 5.419 -3.234 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 92 C CD2 . TYR 27 27 ? A 2.079 6.968 -2.390 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 93 C CE1 . TYR 27 27 ? A 4.741 6.154 -2.607 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 94 C CE2 . TYR 27 27 ? A 3.085 7.698 -1.754 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 95 C CZ . TYR 27 27 ? A 4.417 7.316 -1.909 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 96 O OH . TYR 27 27 ? A 5.422 8.097 -1.329 1 1 A TYR 0.820 1 ATOM 97 N N . THR 28 28 ? A -0.651 4.155 -6.038 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 98 C CA . THR 28 28 ? A -1.725 3.336 -6.595 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 99 C C . THR 28 28 ? A -1.241 2.501 -7.768 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 100 O O . THR 28 28 ? A -1.457 1.295 -7.797 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 101 C CB . THR 28 28 ? A -2.919 4.191 -7.060 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 102 O OG1 . THR 28 28 ? A -3.662 4.702 -5.975 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 103 C CG2 . THR 28 28 ? A -3.970 3.448 -7.874 1 1 A THR 0.860 1 ATOM 104 N N . ASP 29 29 ? A -0.510 3.103 -8.740 1 1 A ASP 0.860 1 ATOM 105 C CA . ASP 29 29 ? A 0.073 2.398 -9.871 1 1 A ASP 0.860 1 ATOM 106 C C . ASP 29 29 ? A 1.125 1.361 -9.454 1 1 A ASP 0.860 1 ATOM 107 O O . ASP 29 29 ? A 1.076 0.193 -9.844 1 1 A ASP 0.860 1 ATOM 108 C CB . ASP 29 29 ? A 0.658 3.442 -10.861 1 1 A ASP 0.860 1 ATOM 109 C CG . ASP 29 29 ? A 0.930 2.797 -12.210 1 1 A ASP 0.860 1 ATOM 110 O OD1 . ASP 29 29 ? A 0.136 1.898 -12.588 1 1 A ASP 0.860 1 ATOM 111 O OD2 . ASP 29 29 ? A 1.919 3.204 -12.864 1 1 A ASP 0.860 1 ATOM 112 N N . TRP 30 30 ? A 2.040 1.756 -8.529 1 1 A TRP 0.840 1 ATOM 113 C CA . TRP 30 30 ? A 3.092 0.910 -7.985 1 1 A TRP 0.840 1 ATOM 114 C C . TRP 30 30 ? A 2.521 -0.378 -7.386 1 1 A TRP 0.840 1 ATOM 115 O O . TRP 30 30 ? A 3.014 -1.473 -7.620 1 1 A TRP 0.840 1 ATOM 116 C CB . TRP 30 30 ? A 3.908 1.685 -6.894 1 1 A TRP 0.840 1 ATOM 117 C CG . TRP 30 30 ? A 5.082 0.919 -6.289 1 1 A TRP 0.840 1 ATOM 118 C CD1 . 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A 7.460 -4.013 -6.504 1 1 A TYR 0.840 1 ATOM 161 N N . LEU 35 35 ? A -0.770 -6.299 -8.043 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 162 C CA . LEU 35 35 ? A -2.034 -6.973 -8.198 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 163 C C . LEU 35 35 ? A -2.242 -7.546 -9.591 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 164 O O . LEU 35 35 ? A -2.460 -8.738 -9.766 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 165 C CB . LEU 35 35 ? A -3.161 -5.968 -7.904 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 166 C CG . LEU 35 35 ? A -3.338 -5.674 -6.405 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 167 C CD1 . LEU 35 35 ? A -4.363 -4.552 -6.206 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 168 C CD2 . LEU 35 35 ? A -3.716 -6.915 -5.567 1 1 A LEU 0.850 1 ATOM 169 N N . ALA 36 36 ? A -2.148 -6.734 -10.658 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 170 C CA . ALA 36 36 ? A -2.462 -7.179 -12.000 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 171 C C . ALA 36 36 ? A -1.551 -8.297 -12.511 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 172 O O . ALA 36 36 ? A -1.970 -9.177 -13.246 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 173 C CB . ALA 36 36 ? A -2.383 -6.000 -12.979 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 174 N N . LYS 37 37 ? A -0.266 -8.283 -12.080 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 175 C CA . LYS 37 37 ? A 0.718 -9.316 -12.344 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 176 C C . LYS 37 37 ? A 0.323 -10.692 -11.792 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 177 O O . LYS 37 37 ? A 0.702 -11.714 -12.342 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 178 C CB . LYS 37 37 ? A 2.135 -8.942 -11.787 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 179 C CG . LYS 37 37 ? A 2.328 -9.249 -10.286 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 180 C CD . LYS 37 37 ? A 3.689 -8.896 -9.680 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 181 C CE . LYS 37 37 ? A 4.786 -9.764 -10.281 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 182 N NZ . LYS 37 37 ? A 5.876 -9.938 -9.306 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 183 N N . SER 38 38 ? A -0.436 -10.734 -10.659 1 1 A SER 0.800 1 ATOM 184 C CA . SER 38 38 ? A -0.832 -11.940 -9.941 1 1 A SER 0.800 1 ATOM 185 C C . SER 38 38 ? A -2.213 -12.395 -10.407 1 1 A SER 0.800 1 ATOM 186 O O . SER 38 38 ? A -2.839 -13.255 -9.796 1 1 A SER 0.800 1 ATOM 187 C CB . SER 38 38 ? A -0.748 -11.774 -8.376 1 1 A SER 0.800 1 ATOM 188 O OG . SER 38 38 ? A -1.640 -10.799 -7.839 1 1 A SER 0.800 1 ATOM 189 N N . GLY 39 39 ? A -2.704 -11.825 -11.542 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 190 C CA . GLY 39 39 ? A -4.008 -12.079 -12.146 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 191 C C . GLY 39 39 ? A -5.171 -11.550 -11.358 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 192 O O . GLY 39 39 ? A -6.193 -12.206 -11.223 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 193 N N . HIS 40 40 ? A -5.043 -10.322 -10.831 1 1 A HIS 0.710 1 ATOM 194 C CA . HIS 40 40 ? A -6.063 -9.708 -10.025 1 1 A HIS 0.710 1 ATOM 195 C C . HIS 40 40 ? A -6.754 -8.654 -10.876 1 1 A HIS 0.710 1 ATOM 196 O O . HIS 40 40 ? A -6.204 -7.597 -11.140 1 1 A HIS 0.710 1 ATOM 197 C CB . HIS 40 40 ? A -5.429 -9.052 -8.790 1 1 A HIS 0.710 1 ATOM 198 C CG . HIS 40 40 ? A -6.394 -8.480 -7.832 1 1 A HIS 0.710 1 ATOM 199 N ND1 . HIS 40 40 ? A -7.215 -9.287 -7.066 1 1 A HIS 0.710 1 ATOM 200 C CD2 . HIS 40 40 ? A -6.551 -7.198 -7.487 1 1 A HIS 0.710 1 ATOM 201 C CE1 . HIS 40 40 ? A -7.835 -8.465 -6.267 1 1 A HIS 0.710 1 ATOM 202 N NE2 . HIS 40 40 ? A -7.483 -7.164 -6.474 1 1 A HIS 0.710 1 ATOM 203 N N . LYS 41 41 ? A -7.973 -8.961 -11.366 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 204 C CA . LYS 41 41 ? A -8.790 -8.099 -12.217 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 205 C C . LYS 41 41 ? A -9.202 -6.738 -11.654 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 206 O O . LYS 41 41 ? A -9.177 -5.724 -12.327 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 207 C CB . LYS 41 41 ? A -10.149 -8.787 -12.486 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 208 C CG . LYS 41 41 ? A -10.076 -10.030 -13.370 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 209 C CD . LYS 41 41 ? A -11.438 -10.298 -14.033 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 210 C CE . LYS 41 41 ? A -11.635 -11.769 -14.403 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 211 N NZ . LYS 41 41 ? A -12.842 -11.934 -15.242 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 212 N N . ARG 42 42 ? A -9.676 -6.744 -10.390 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 213 C CA . ARG 42 42 ? A -9.943 -5.581 -9.571 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 214 C C . ARG 42 42 ? A -8.692 -4.744 -9.360 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 215 O O . ARG 42 42 ? A -7.590 -5.261 -9.253 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 216 C CB . ARG 42 42 ? A -10.512 -6.044 -8.192 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 217 C CG . ARG 42 42 ? A -10.638 -4.923 -7.126 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 218 C CD . ARG 42 42 ? A -11.008 -5.327 -5.699 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 219 N NE . ARG 42 42 ? A -12.348 -5.974 -5.783 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 220 C CZ . ARG 42 42 ? A -13.082 -6.313 -4.715 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 221 N NH1 . ARG 42 42 ? A -12.657 -6.038 -3.488 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 222 N NH2 . ARG 42 42 ? A -14.252 -6.924 -4.880 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 223 N N . LEU 43 43 ? A -8.827 -3.417 -9.273 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 224 C CA . LEU 43 43 ? A -7.709 -2.532 -9.111 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 225 C C . LEU 43 43 ? A -8.035 -1.585 -7.993 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 226 O O . LEU 43 43 ? A -9.150 -1.564 -7.452 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 227 C CB . LEU 43 43 ? A -7.442 -1.772 -10.431 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 228 C CG . LEU 43 43 ? A -6.776 -2.633 -11.527 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 229 C CD1 . LEU 43 43 ? A -6.820 -1.868 -12.855 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 230 C CD2 . LEU 43 43 ? A -5.315 -2.980 -11.198 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 231 N N . ILE 44 44 ? A -7.032 -0.803 -7.598 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 232 C CA . ILE 44 44 ? A -7.113 0.247 -6.619 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 233 C C . ILE 44 44 ? A -7.626 1.490 -7.284 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 234 O O . ILE 44 44 ? A -6.973 2.074 -8.150 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 235 C CB . ILE 44 44 ? A -5.751 0.498 -6.026 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 236 C CG1 . ILE 44 44 ? A -5.343 -0.798 -5.312 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 237 C CG2 . ILE 44 44 ? A -5.777 1.719 -5.075 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 238 C CD1 . ILE 44 44 ? A -3.914 -0.758 -4.795 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 239 N N . ARG 45 45 ? A -8.839 1.919 -6.903 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 240 C CA . ARG 45 45 ? A -9.383 3.184 -7.342 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 241 C C . ARG 45 45 ? A -8.965 4.337 -6.467 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 242 O O . ARG 45 45 ? A -8.289 5.251 -6.914 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 243 C CB . ARG 45 45 ? A -10.925 3.086 -7.387 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 244 C CG . ARG 45 45 ? A -11.384 2.516 -8.740 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 245 C CD . ARG 45 45 ? A -11.297 3.535 -9.894 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 246 N NE . ARG 45 45 ? A -12.521 4.411 -9.845 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 247 C CZ . ARG 45 45 ? A -13.741 4.039 -10.261 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 248 N NH1 . ARG 45 45 ? A -13.970 2.814 -10.724 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 249 N NH2 . ARG 45 45 ? A -14.760 4.892 -10.185 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 250 N N . ASP 46 46 ? A -9.306 4.261 -5.176 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 251 C CA . ASP 46 46 ? A -9.025 5.298 -4.240 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 252 C C . ASP 46 46 ? A -8.082 4.657 -3.267 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 253 O O . ASP 46 46 ? A -8.481 3.784 -2.525 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 254 C CB . ASP 46 46 ? A -10.319 5.674 -3.488 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 255 C CG . ASP 46 46 ? A -11.028 6.765 -4.254 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 256 O OD1 . ASP 46 46 ? A -11.623 6.459 -5.317 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 257 O OD2 . ASP 46 46 ? A -10.974 7.913 -3.751 1 1 A ASP 0.830 1 ATOM 258 N N . LEU 47 47 ? A -6.804 5.090 -3.231 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 259 C CA . LEU 47 47 ? A -5.803 4.585 -2.305 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 260 C C . LEU 47 47 ? A -6.189 4.705 -0.823 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 261 O O . LEU 47 47 ? A -5.950 3.836 -0.012 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 262 C CB . LEU 47 47 ? A -4.496 5.372 -2.506 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 263 C CG . LEU 47 47 ? A -3.218 4.675 -2.009 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 264 C CD1 . LEU 47 47 ? A -2.849 3.468 -2.879 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 265 C CD2 . LEU 47 47 ? A -2.061 5.688 -1.964 1 1 A LEU 0.860 1 ATOM 266 N N . GLN 48 48 ? A -6.859 5.825 -0.455 1 1 A GLN 0.840 1 ATOM 267 C CA . GLN 48 48 ? A -7.452 6.052 0.852 1 1 A GLN 0.840 1 ATOM 268 C C . GLN 48 48 ? A -8.526 5.055 1.238 1 1 A GLN 0.840 1 ATOM 269 O O . GLN 48 48 ? A -8.662 4.748 2.412 1 1 A GLN 0.840 1 ATOM 270 C CB . GLN 48 48 ? A -8.051 7.466 0.894 1 1 A GLN 0.840 1 ATOM 271 C CG . GLN 48 48 ? A -6.962 8.545 0.905 1 1 A GLN 0.840 1 ATOM 272 C CD . GLN 48 48 ? A -7.587 9.874 0.499 1 1 A GLN 0.840 1 ATOM 273 O OE1 . 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A -1.072 -8.651 0.746 1 1 A ALA 0.940 1 ATOM 345 C CB . ALA 58 58 ? A -2.892 -8.089 3.330 1 1 A ALA 0.940 1 ATOM 346 N N . GLN 59 59 ? A -3.119 -7.999 0.052 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 347 C CA . GLN 59 59 ? A -3.104 -8.558 -1.292 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 348 C C . GLN 59 59 ? A -1.965 -8.061 -2.180 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 349 O O . GLN 59 59 ? A -1.625 -8.698 -3.151 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 350 C CB . GLN 59 59 ? A -4.418 -8.298 -2.084 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 351 C CG . GLN 59 59 ? A -5.650 -9.062 -1.560 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 352 C CD . GLN 59 59 ? A -6.711 -9.235 -2.644 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 353 O OE1 . GLN 59 59 ? A -6.896 -10.304 -3.193 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 354 N NE2 . GLN 59 59 ? A -7.453 -8.143 -2.967 1 1 A GLN 0.860 1 ATOM 355 N N . ILE 60 60 ? A -1.367 -6.891 -1.866 1 1 A ILE 0.890 1 ATOM 356 C CA . ILE 60 60 ? A -0.190 -6.375 -2.539 1 1 A ILE 0.890 1 ATOM 357 C C . ILE 60 60 ? A 1.068 -6.678 -1.772 1 1 A ILE 0.890 1 ATOM 358 O O . ILE 60 60 ? 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A -3.719 -5.763 8.333 1 1 A ASN 0.860 1 ATOM 555 C CB . ASN 85 85 ? A -6.991 -6.105 8.165 1 1 A ASN 0.860 1 ATOM 556 C CG . ASN 85 85 ? A -8.235 -6.947 8.373 1 1 A ASN 0.860 1 ATOM 557 O OD1 . ASN 85 85 ? A -8.655 -7.243 9.465 1 1 A ASN 0.860 1 ATOM 558 N ND2 . ASN 85 85 ? A -8.939 -7.288 7.266 1 1 A ASN 0.860 1 ATOM 559 N N . ILE 86 86 ? A -4.981 -4.021 8.987 1 1 A ILE 0.900 1 ATOM 560 C CA . ILE 86 86 ? A -3.978 -2.992 8.721 1 1 A ILE 0.900 1 ATOM 561 C C . ILE 86 86 ? A -2.815 -3.131 9.690 1 1 A ILE 0.900 1 ATOM 562 O O . ILE 86 86 ? A -1.659 -3.077 9.287 1 1 A ILE 0.900 1 ATOM 563 C CB . ILE 86 86 ? A -4.544 -1.566 8.774 1 1 A ILE 0.900 1 ATOM 564 C CG1 . ILE 86 86 ? A -5.728 -1.359 7.796 1 1 A ILE 0.900 1 ATOM 565 C CG2 . ILE 86 86 ? A -3.439 -0.513 8.479 1 1 A ILE 0.900 1 ATOM 566 C CD1 . ILE 86 86 ? A -6.703 -0.278 8.283 1 1 A ILE 0.900 1 ATOM 567 N N . ASP 87 87 ? A -3.098 -3.375 10.990 1 1 A ASP 0.890 1 ATOM 568 C CA . ASP 87 87 ? 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A 16.300 -0.260 -3.777 1 1 A GLN 0.560 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.800 2 1 3 0.047 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 16 SER 1 0.370 2 1 A 17 GLY 1 0.360 3 1 A 18 PHE 1 0.510 4 1 A 19 THR 1 0.440 5 1 A 20 LEU 1 0.530 6 1 A 21 LEU 1 0.510 7 1 A 22 SER 1 0.540 8 1 A 23 ASN 1 0.640 9 1 A 24 GLN 1 0.750 10 1 A 25 GLN 1 0.740 11 1 A 26 ILE 1 0.740 12 1 A 27 TYR 1 0.820 13 1 A 28 THR 1 0.860 14 1 A 29 ASP 1 0.860 15 1 A 30 TRP 1 0.840 16 1 A 31 ALA 1 0.920 17 1 A 32 ASN 1 0.860 18 1 A 33 HIS 1 0.830 19 1 A 34 TYR 1 0.840 20 1 A 35 LEU 1 0.850 21 1 A 36 ALA 1 0.820 22 1 A 37 LYS 1 0.770 23 1 A 38 SER 1 0.800 24 1 A 39 GLY 1 0.700 25 1 A 40 HIS 1 0.710 26 1 A 41 LYS 1 0.570 27 1 A 42 ARG 1 0.560 28 1 A 43 LEU 1 0.760 29 1 A 44 ILE 1 0.810 30 1 A 45 ARG 1 0.720 31 1 A 46 ASP 1 0.830 32 1 A 47 LEU 1 0.860 33 1 A 48 GLN 1 0.840 34 1 A 49 GLN 1 0.820 35 1 A 50 ASP 1 0.870 36 1 A 51 VAL 1 0.910 37 1 A 52 THR 1 0.870 38 1 A 53 ASP 1 0.860 39 1 A 54 GLY 1 0.940 40 1 A 55 VAL 1 0.880 41 1 A 56 LEU 1 0.890 42 1 A 57 LEU 1 0.930 43 1 A 58 ALA 1 0.940 44 1 A 59 GLN 1 0.860 45 1 A 60 ILE 1 0.890 46 1 A 61 ILE 1 0.890 47 1 A 62 GLN 1 0.830 48 1 A 63 VAL 1 0.870 49 1 A 64 VAL 1 0.880 50 1 A 65 ALA 1 0.900 51 1 A 66 ASN 1 0.830 52 1 A 67 GLU 1 0.780 53 1 A 68 LYS 1 0.780 54 1 A 69 ILE 1 0.830 55 1 A 70 GLU 1 0.790 56 1 A 71 ASP 1 0.840 57 1 A 72 ILE 1 0.830 58 1 A 73 ASN 1 0.780 59 1 A 74 GLY 1 0.770 60 1 A 75 CYS 1 0.570 61 1 A 76 PRO 1 0.720 62 1 A 77 LYS 1 0.550 63 1 A 78 ASN 1 0.600 64 1 A 79 ARG 1 0.600 65 1 A 80 SER 1 0.720 66 1 A 81 GLN 1 0.700 67 1 A 82 MET 1 0.760 68 1 A 83 ILE 1 0.820 69 1 A 84 GLU 1 0.820 70 1 A 85 ASN 1 0.860 71 1 A 86 ILE 1 0.900 72 1 A 87 ASP 1 0.890 73 1 A 88 ALA 1 0.920 74 1 A 89 CYS 1 0.920 75 1 A 90 LEU 1 0.910 76 1 A 91 ASN 1 0.870 77 1 A 92 PHE 1 0.870 78 1 A 93 LEU 1 0.880 79 1 A 94 ALA 1 0.900 80 1 A 95 ALA 1 0.870 81 1 A 96 LYS 1 0.840 82 1 A 97 GLY 1 0.870 83 1 A 98 ILE 1 0.850 84 1 A 99 ASN 1 0.850 85 1 A 100 ILE 1 0.830 86 1 A 101 GLN 1 0.790 87 1 A 102 GLY 1 0.840 88 1 A 103 LEU 1 0.870 89 1 A 104 SER 1 0.900 90 1 A 105 ALA 1 0.910 91 1 A 106 GLU 1 0.830 92 1 A 107 GLU 1 0.850 93 1 A 108 ILE 1 0.890 94 1 A 109 ARG 1 0.800 95 1 A 110 ASN 1 0.860 96 1 A 111 GLY 1 0.900 97 1 A 112 ASN 1 0.880 98 1 A 113 LEU 1 0.860 99 1 A 114 LYS 1 0.830 100 1 A 115 ALA 1 0.910 101 1 A 116 ILE 1 0.900 102 1 A 117 LEU 1 0.860 103 1 A 118 GLY 1 0.920 104 1 A 119 LEU 1 0.910 105 1 A 120 PHE 1 0.880 106 1 A 121 PHE 1 0.850 107 1 A 122 SER 1 0.890 108 1 A 123 LEU 1 0.890 109 1 A 124 SER 1 0.870 110 1 A 125 ARG 1 0.760 111 1 A 126 TYR 1 0.810 112 1 A 127 LYS 1 0.690 113 1 A 128 GLN 1 0.560 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #