data_SMR-f8c0aded714e329dbc388a1dc0eba459_8 _entry.id SMR-f8c0aded714e329dbc388a1dc0eba459_8 _struct.entry_id SMR-f8c0aded714e329dbc388a1dc0eba459_8 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - F6ZDS4/ TPR_MOUSE, Nucleoprotein TPR Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries F6ZDS4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 318135.074 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP TPR_MOUSE F6ZDS4 1 ;MTSGGSASRSGHRGVPMTSRGFDGSRRGSLRRAGARETASEAADGAAPAAGLRASPCSLASPSAAAAVAA IPADMAAVLQQVLERPELNKLPKSTQNKLEKFLAEQQSEIDCLKGRHEKFKVESEQQYFEIEKRLSQSQE RLVTETRECQNLRLELEKLNNQVKVLTEKTKELETAQDRNLGIQSQFTRAKEELEAEKRDLIRTNERLSQ EVEYLTEDVKRLNEKLKESNTTKGELQLKLDELQASDVAVKYREKRLEQEKELLHNQNSWLNTELKTKTD ELLALGREKGNEILELKCNLENKKEEVLRLEEQMNGLKTSNEHLQKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFH NELNAHIKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKTIQDHLLQVEESKDQMEKEMLEKI GKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKQEN KRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSAKLEQAMKEIQRLQEDTDKANKHSSVLERDN QRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLFA LRELGETREREEQETTSSKIAELQHKLENSLAELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGMAI PLQASSLDDISLLSTPKRSSTSQTVSTPAPEPVIDSTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKIDSEKLQNEQ LEKLQEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLQERNQKLTATTQKQEQIINTMTQD LRGANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQQRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETETKQR LNSQIEKLEHEISHLKKKLENEVEQRHTLTRNLDVQLLDTKRQLDTEINLHLNTKELLKNAQKDIATLKQ HLNNMEAQLASQSTQRTGKGQPGDRDDVDDLKSQLRQAEEQVNDLKERLKTSTSNVEQYRAMVTSLEDSL NKEKQVTEEVHKNIEVRLKESAEFQTQLEKKLMEVEKEKQELQDDKRKAIESMEQQLSELKKTLSTVQNE VQEALQRASTALSNEQQARRDCQEQAKIAVEAQNKYERELMLHAADVEALQAAKEQVSKMTSIRQHLEET TQKAESQLLECKASWEERERVLKDEVSKSVSRCEDLEKQNRLLHDQIEKLSDKVVTSMKDAVQAPLNVSL NEEGKSQEQILEILRFIRREKEIAETRFEVAQVESLRYRQRVELLERELQELQDSLNVEREKVQVTAKTM AQHEELMKKTETMNVVMETNKMLREEKERLEQNLQQMQAKVRKLELDILPLQEANAELSEKSGMLQAEKK LLEEDVKRWKARNQQLINQQKDPDTEEYRKLLSEKEIHTKRIQQLNEEVGRLKAEIARSNASLTNNQNLI QSLREDLSKARTEKEGIQKDLDAKIIDIQEKVKTITQVKKIGRRYKTQFEELKAQQNKAMETSTQSSGDH QEQHISVQEMQELKDTLSQSETKTKSLEGQVENLQKTLSEKETEARSLQEQTVQLQSELSRLRQDLQDKT TEEQLRQQMNEKTWKTLALAKSKITHLSGVKDQLTKEIEELKQRNGALDQQKDELDVRMTALKSQYEGRI SRLERELREHQERHLEQRDEPQEPTNKAPEQQRQITLKTTPASGERGIASTSDPPTANIKPTPVVSTPSK VTAAAMAGNKSTPRASIRPMVTPATVTNPTTTPTATVMPTTQVESQEAMQSEGPVEHVPVFGNASGSVRS TSPNVQPSISQPILTVQQQTQATAFVQPTQQSHPQIEPTNQELSPNIVEVVQSSPVERPSTSTAVFGTVS ATPSSSLPKRTREEEEDSTMEAGDQVSEDTVEMPLPKKLKMVTPVGTEEEVMAEESTDGEAETQAYNQDS QDSIGEGVTQGDYTPMEDSEETSQSLQIDLGPLQSDQQTTSSQDGQGKGDDVIVIDSDDEDDDEENDGEH EDYEEDEDDDDDEEDDTGMGDEGEDSNEGTGSADGNDGYEADDAEGGDGTDPGTETEESMGGAESHQRAA DSQNSGEGNTSAAESSFSQEVAREQQPTSASERQTPQAPQSPRRPPHPLPPRLTIHAPPQELGPPVQRIQ MTRRQSVGRGLQLTPGIGGMQQHFFDDEDRTVPSTPTLVVPHRTDGFAEAIHSPQVAGVPRFRFGPPEDM PQTSSSHSDLGQLASQGGLGMYETPLFLAHEEESGGRSVPTTPLQVAAPVTVFTESTTSDASEHASQSVP MVTTSTGTLSTTNETAAGDDGDEVFVEAESEGISSEAGLEIDSQQEEEPVQASDESDLPSTSQDPPSSSS VDTSSSQPKPFRRVRLQTTLRQGVRGRQFNRQRGISHAMGGRGGINRGNIN ; 'Nucleoprotein TPR' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2431 1 2431 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . TPR_MOUSE F6ZDS4 . 1 2431 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2012-04-18 D21CEA4F9C2C27C5 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no F ;MTSGGSASRSGHRGVPMTSRGFDGSRRGSLRRAGARETASEAADGAAPAAGLRASPCSLASPSAAAAVAA IPADMAAVLQQVLERPELNKLPKSTQNKLEKFLAEQQSEIDCLKGRHEKFKVESEQQYFEIEKRLSQSQE RLVTETRECQNLRLELEKLNNQVKVLTEKTKELETAQDRNLGIQSQFTRAKEELEAEKRDLIRTNERLSQ EVEYLTEDVKRLNEKLKESNTTKGELQLKLDELQASDVAVKYREKRLEQEKELLHNQNSWLNTELKTKTD ELLALGREKGNEILELKCNLENKKEEVLRLEEQMNGLKTSNEHLQKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFH NELNAHIKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKTIQDHLLQVEESKDQMEKEMLEKI GKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKQEN KRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSAKLEQAMKEIQRLQEDTDKANKHSSVLERDN QRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLFA LRELGETREREEQETTSSKIAELQHKLENSLAELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGMAI PLQASSLDDISLLSTPKRSSTSQTVSTPAPEPVIDSTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKIDSEKLQNEQ LEKLQEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLQERNQKLTATTQKQEQIINTMTQD LRGANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQQRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETETKQR LNSQIEKLEHEISHLKKKLENEVEQRHTLTRNLDVQLLDTKRQLDTEINLHLNTKELLKNAQKDIATLKQ HLNNMEAQLASQSTQRTGKGQPGDRDDVDDLKSQLRQAEEQVNDLKERLKTSTSNVEQYRAMVTSLEDSL NKEKQVTEEVHKNIEVRLKESAEFQTQLEKKLMEVEKEKQELQDDKRKAIESMEQQLSELKKTLSTVQNE VQEALQRASTALSNEQQARRDCQEQAKIAVEAQNKYERELMLHAADVEALQAAKEQVSKMTSIRQHLEET TQKAESQLLECKASWEERERVLKDEVSKSVSRCEDLEKQNRLLHDQIEKLSDKVVTSMKDAVQAPLNVSL NEEGKSQEQILEILRFIRREKEIAETRFEVAQVESLRYRQRVELLERELQELQDSLNVEREKVQVTAKTM AQHEELMKKTETMNVVMETNKMLREEKERLEQNLQQMQAKVRKLELDILPLQEANAELSEKSGMLQAEKK LLEEDVKRWKARNQQLINQQKDPDTEEYRKLLSEKEIHTKRIQQLNEEVGRLKAEIARSNASLTNNQNLI QSLREDLSKARTEKEGIQKDLDAKIIDIQEKVKTITQVKKIGRRYKTQFEELKAQQNKAMETSTQSSGDH QEQHISVQEMQELKDTLSQSETKTKSLEGQVENLQKTLSEKETEARSLQEQTVQLQSELSRLRQDLQDKT 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A 1 2344 SER 2344 ? ? ? F . A 1 2345 SER 2345 ? ? ? F . A 1 2346 GLU 2346 ? ? ? F . A 1 2347 ALA 2347 ? ? ? F . A 1 2348 GLY 2348 ? ? ? F . A 1 2349 LEU 2349 ? ? ? F . A 1 2350 GLU 2350 ? ? ? F . A 1 2351 ILE 2351 ? ? ? F . A 1 2352 ASP 2352 ? ? ? F . A 1 2353 SER 2353 ? ? ? F . A 1 2354 GLN 2354 ? ? ? F . A 1 2355 GLN 2355 ? ? ? F . A 1 2356 GLU 2356 ? ? ? F . A 1 2357 GLU 2357 ? ? ? F . A 1 2358 GLU 2358 ? ? ? F . A 1 2359 PRO 2359 ? ? ? F . A 1 2360 VAL 2360 ? ? ? F . A 1 2361 GLN 2361 ? ? ? F . A 1 2362 ALA 2362 ? ? ? F . A 1 2363 SER 2363 ? ? ? F . A 1 2364 ASP 2364 ? ? ? F . A 1 2365 GLU 2365 ? ? ? F . A 1 2366 SER 2366 ? ? ? F . A 1 2367 ASP 2367 ? ? ? F . A 1 2368 LEU 2368 ? ? ? F . A 1 2369 PRO 2369 ? ? ? F . A 1 2370 SER 2370 ? ? ? F . A 1 2371 THR 2371 ? ? ? F . A 1 2372 SER 2372 ? ? ? F . A 1 2373 GLN 2373 ? ? ? F . A 1 2374 ASP 2374 ? ? ? F . A 1 2375 PRO 2375 ? ? ? F . A 1 2376 PRO 2376 ? ? ? F . A 1 2377 SER 2377 ? ? ? F . A 1 2378 SER 2378 ? ? ? F . A 1 2379 SER 2379 ? ? ? F . A 1 2380 SER 2380 ? ? ? F . A 1 2381 VAL 2381 ? ? ? F . A 1 2382 ASP 2382 ? ? ? F . A 1 2383 THR 2383 ? ? ? F . A 1 2384 SER 2384 ? ? ? F . A 1 2385 SER 2385 ? ? ? F . A 1 2386 SER 2386 ? ? ? F . A 1 2387 GLN 2387 ? ? ? F . A 1 2388 PRO 2388 ? ? ? F . A 1 2389 LYS 2389 ? ? ? F . A 1 2390 PRO 2390 ? ? ? F . A 1 2391 PHE 2391 ? ? ? F . A 1 2392 ARG 2392 ? ? ? F . A 1 2393 ARG 2393 ? ? ? F . A 1 2394 VAL 2394 ? ? ? F . A 1 2395 ARG 2395 ? ? ? F . A 1 2396 LEU 2396 ? ? ? F . A 1 2397 GLN 2397 ? ? ? F . A 1 2398 THR 2398 ? ? ? F . A 1 2399 THR 2399 ? ? ? F . A 1 2400 LEU 2400 ? ? ? F . A 1 2401 ARG 2401 ? ? ? F . A 1 2402 GLN 2402 ? ? ? F . A 1 2403 GLY 2403 ? ? ? F . A 1 2404 VAL 2404 ? ? ? F . A 1 2405 ARG 2405 ? ? ? F . A 1 2406 GLY 2406 ? ? ? F . A 1 2407 ARG 2407 ? ? ? F . A 1 2408 GLN 2408 ? ? ? F . A 1 2409 PHE 2409 ? ? ? F . A 1 2410 ASN 2410 ? ? ? F . A 1 2411 ARG 2411 ? ? ? F . A 1 2412 GLN 2412 ? ? ? F . A 1 2413 ARG 2413 ? ? ? F . A 1 2414 GLY 2414 ? ? ? F . A 1 2415 ILE 2415 ? ? ? F . A 1 2416 SER 2416 ? ? ? F . A 1 2417 HIS 2417 ? ? ? F . A 1 2418 ALA 2418 ? ? ? F . A 1 2419 MET 2419 ? ? ? F . A 1 2420 GLY 2420 ? ? ? F . A 1 2421 GLY 2421 ? ? ? F . A 1 2422 ARG 2422 ? ? ? F . A 1 2423 GLY 2423 ? ? ? F . A 1 2424 GLY 2424 ? ? ? F . A 1 2425 ILE 2425 ? ? ? F . A 1 2426 ASN 2426 ? ? ? F . A 1 2427 ARG 2427 ? ? ? F . A 1 2428 GLY 2428 ? ? ? F . A 1 2429 ASN 2429 ? ? ? F . A 1 2430 ILE 2430 ? ? ? F . A 1 2431 ASN 2431 ? ? ? F . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=8uww, label_asym_id=F, auth_asym_id=F, SMTL ID=8uww.1.F}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8uww, label_asym_id=F' 'target-template alignment' . 4 'model 8' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A F 5 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKRLEDELVSLQKKLKATEDELDKYSEAPKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKRLEDELVSLQKKLKATEDELDKYSEAPKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 45 282 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8uww 2024-03-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2431 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2431 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.3e-07 13.025 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTSGGSASRSGHRGVPMTSRGFDGSRRGSLRRAGARETASEAADGAAPAAGLRASPCSLASPSAAAAVAAIPADMAAVLQQVLERPELNKLPKSTQNKLEKFLAEQQSEIDCLKGRHEKFKVESEQQYFEIEKRLSQSQERLVTETRECQNLRLELEKLNNQVKVLTEKTKELETAQDRNLGIQSQFTRAKEELEAEKRDLIRTNERLSQEVEYLTEDVKRLNEKLKESNTTKGELQLKLDELQASDVAVKYREKRLEQEKELLHNQNSWLNTELKTKTDELLALGREKGNEILELKCNLENKKEEVLRLEEQMNGLKTSNEHLQKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFHNELNAHIKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKTIQDHLLQVEESKDQMEKEMLEKIGKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKQENKRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSAKLEQAMKEIQRLQEDTDKANKHSSVLERDNQRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLFALRELGETREREEQETTSSKIAELQHKLENSLAELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGMAIPLQASSLDDISLLSTPKRSSTSQTVSTPAPEPVIDSTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKIDSEKLQNEQLEKLQEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLQERNQKLTATTQKQEQIINTMTQDLRGANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQQRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETETKQRLNSQIEKLEHEISHLKKKLENEVEQRHTLTRNLDVQLLDTKRQLDTEINLHLNTKELLKNAQKDIATLKQHLNNMEAQLASQSTQRTGKGQPGDRDDVDDLKSQLRQAEEQVNDLKERLKTSTSNVEQYRAMVTSLEDSLNKEKQVTEEVHKNIEVRLKESAEFQTQLEKKLMEVEKEKQELQDDKRKAIESMEQQLSELKKTLSTVQNEVQEALQRASTALSNEQQARRDCQEQAKIAVEAQNKYERELMLHAADVEALQAAKEQVSKMTSIRQHLEETTQKAESQLLECKASWEERERVLKDEVSKSVSRCEDLEKQNRLLHDQIEKLSDKVVTSMKDAVQAPLNVSLNEEGKSQEQILEILRFIRREKEIAETRFEVAQVESLRYRQRVELLERELQELQDSLNVEREKVQVTAKTMAQHEELMKKTETMNVVMETNKMLREEKERLEQNLQQMQAKVRKLELDILPLQEANAELSEKSGMLQAEKKLLEEDVKRWKARNQQLINQQKDPDTEEYRKLLSEKEIHTKRIQQLNEEVGRLKAEIARSNASLTNNQNLIQSLREDLSKARTEKEGIQKDLDAKIIDIQEKVKTITQVKKIGRRYKTQFEELKAQQNKAMETSTQSSGDHQEQHISVQEMQELKDTLSQSETKTKSLEGQVENLQKTLSEKETEARSLQEQTVQLQSELSRLRQDLQDKTTEEQLRQQMNEKTWKTLALAKSKITHLSGVKDQLTKEIEELKQRNGALDQQKDELDVRMTALKSQYEGRISRLERELREHQERHLEQRDEPQEPTNKAPEQQRQITLKTTPASGERGIASTSDPPTANIKPTPVVSTPSKVTAAAMAGNKSTPRASIRPMVTPATVTNPTTTPTATVMPTTQVESQEAMQSEGPVEHVPVFGNASGSVRSTSPNVQPSISQPILTVQQQTQATAFVQPTQQSHPQIEPTNQELSPNIVEVVQSSPVERPSTSTAVFGTVSATPSSSLPKRTREEEEDSTMEAGDQVSEDTVEMPLPKKLKMVTPVGTEEEVMAEESTDGEAETQAYNQDSQDSIGEGVTQGDYTPMEDSEETSQSLQIDLGPLQSDQQTTSSQDGQGKGDDVIVIDSDDEDDDEENDGEHEDYEEDEDDDDDEEDDTGMGDEGEDSNEGTGSADGNDGYEADDAEGGDGTDPGTETEESMGGAESHQRAADSQNSGEGNTSAAESSFSQEVAREQQPTSASERQTPQAPQSPRRPPHPLPPRLTIHAPPQELGPPVQRIQMTRRQSVGRGLQLTPGIGGMQQHFFDDEDRTVPSTPTLVVPHRTDGFAEAIHSPQVAGVPRFRFGPPEDMPQTSSSHSDLGQLASQGGLGMYETPLFLAHEEESGGRSVPTTPLQVAAPVTVFTESTTSDASEHASQSVPMVTTSTGTLSTTNETAAGDDGDEVFVEAESEGISSEAGLEIDSQQEEEPVQASDESDLPSTSQDPPSSSSVDTSSSQPKPFRRVRLQTTLRQGVRGRQFNRQRGISHAMGGRGGINRGNIN 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SLQKKLKATEDELDKYSEAPK-------DAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAE--------KAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDK----------YEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.015}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8uww.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 8' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . VAL 1449 1449 ? A 196.323 252.128 312.437 1 1 F VAL 0.600 1 ATOM 2 C CA . VAL 1449 1449 ? A 195.237 252.087 311.387 1 1 F VAL 0.600 1 ATOM 3 C C . VAL 1449 1449 ? A 194.989 253.420 310.698 1 1 F VAL 0.600 1 ATOM 4 O O . VAL 1449 1449 ? A 194.940 253.465 309.482 1 1 F VAL 0.600 1 ATOM 5 C CB . VAL 1449 1449 ? A 193.952 251.500 311.972 1 1 F VAL 0.600 1 ATOM 6 C CG1 . VAL 1449 1449 ? A 192.809 251.474 310.926 1 1 F VAL 0.600 1 ATOM 7 C CG2 . VAL 1449 1449 ? A 194.232 250.055 312.443 1 1 F VAL 0.600 1 ATOM 8 N N . GLY 1450 1450 ? A 194.877 254.562 311.436 1 1 F GLY 0.620 1 ATOM 9 C CA . GLY 1450 1450 ? A 194.663 255.871 310.802 1 1 F GLY 0.620 1 ATOM 10 C C . GLY 1450 1450 ? A 195.759 256.329 309.862 1 1 F GLY 0.620 1 ATOM 11 O O . GLY 1450 1450 ? A 195.485 256.839 308.789 1 1 F GLY 0.620 1 ATOM 12 N N . ARG 1451 1451 ? A 197.039 256.069 310.226 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 13 C CA . ARG 1451 1451 ? A 198.186 256.268 309.349 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 14 C C . ARG 1451 1451 ? A 198.161 255.428 308.085 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 15 O O . ARG 1451 1451 ? A 198.496 255.893 307.012 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 16 C CB . ARG 1451 1451 ? A 199.522 255.934 310.058 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 17 C CG . ARG 1451 1451 ? A 199.902 256.934 311.163 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 18 C CD . ARG 1451 1451 ? A 201.372 256.826 311.597 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 19 N NE . ARG 1451 1451 ? A 201.567 255.464 312.216 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 20 C CZ . ARG 1451 1451 ? A 201.353 255.167 313.506 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 21 N NH1 . ARG 1451 1451 ? A 200.933 256.083 314.369 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 22 N NH2 . ARG 1451 1451 ? A 201.595 253.932 313.948 1 1 F ARG 0.590 1 ATOM 23 N N . LEU 1452 1452 ? A 197.750 254.144 308.210 1 1 F LEU 0.620 1 ATOM 24 C CA . LEU 1452 1452 ? A 197.570 253.268 307.070 1 1 F LEU 0.620 1 ATOM 25 C C . LEU 1452 1452 ? A 196.499 253.784 306.123 1 1 F LEU 0.620 1 ATOM 26 O O . LEU 1452 1452 ? A 196.733 253.876 304.935 1 1 F LEU 0.620 1 ATOM 27 C CB . LEU 1452 1452 ? 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A 235.122 260.407 196.112 1 1 F MET 0.590 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.667 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1449 VAL 1 0.600 2 1 A 1450 GLY 1 0.620 3 1 A 1451 ARG 1 0.590 4 1 A 1452 LEU 1 0.620 5 1 A 1453 LYS 1 0.600 6 1 A 1454 ALA 1 0.640 7 1 A 1455 GLU 1 0.600 8 1 A 1456 ILE 1 0.610 9 1 A 1457 ALA 1 0.660 10 1 A 1458 ARG 1 0.590 11 1 A 1459 SER 1 0.650 12 1 A 1460 ASN 1 0.650 13 1 A 1461 ALA 1 0.670 14 1 A 1462 SER 1 0.650 15 1 A 1463 LEU 1 0.630 16 1 A 1464 THR 1 0.650 17 1 A 1465 ASN 1 0.640 18 1 A 1466 ASN 1 0.670 19 1 A 1467 GLN 1 0.640 20 1 A 1468 ASN 1 0.670 21 1 A 1469 LEU 1 0.640 22 1 A 1470 ILE 1 0.630 23 1 A 1471 GLN 1 0.650 24 1 A 1472 SER 1 0.660 25 1 A 1473 LEU 1 0.650 26 1 A 1474 ARG 1 0.620 27 1 A 1475 GLU 1 0.670 28 1 A 1476 ASP 1 0.660 29 1 A 1477 LEU 1 0.670 30 1 A 1478 SER 1 0.700 31 1 A 1479 LYS 1 0.690 32 1 A 1480 ALA 1 0.700 33 1 A 1481 ARG 1 0.580 34 1 A 1482 THR 1 0.670 35 1 A 1483 GLU 1 0.640 36 1 A 1484 LYS 1 0.680 37 1 A 1485 GLU 1 0.660 38 1 A 1486 GLY 1 0.710 39 1 A 1487 ILE 1 0.650 40 1 A 1488 GLN 1 0.670 41 1 A 1489 LYS 1 0.710 42 1 A 1490 ASP 1 0.680 43 1 A 1491 LEU 1 0.700 44 1 A 1492 ASP 1 0.700 45 1 A 1493 ALA 1 0.720 46 1 A 1494 LYS 1 0.690 47 1 A 1495 ILE 1 0.710 48 1 A 1496 ILE 1 0.680 49 1 A 1497 ASP 1 0.680 50 1 A 1498 ILE 1 0.670 51 1 A 1499 GLN 1 0.700 52 1 A 1500 GLU 1 0.690 53 1 A 1501 LYS 1 0.710 54 1 A 1502 VAL 1 0.690 55 1 A 1503 LYS 1 0.730 56 1 A 1504 THR 1 0.710 57 1 A 1505 ILE 1 0.670 58 1 A 1506 THR 1 0.690 59 1 A 1507 GLN 1 0.660 60 1 A 1508 VAL 1 0.660 61 1 A 1509 LYS 1 0.670 62 1 A 1510 LYS 1 0.680 63 1 A 1511 ILE 1 0.640 64 1 A 1512 GLY 1 0.700 65 1 A 1513 ARG 1 0.620 66 1 A 1514 ARG 1 0.620 67 1 A 1515 TYR 1 0.630 68 1 A 1516 LYS 1 0.690 69 1 A 1517 THR 1 0.720 70 1 A 1518 GLN 1 0.690 71 1 A 1519 PHE 1 0.670 72 1 A 1520 GLU 1 0.720 73 1 A 1521 GLU 1 0.740 74 1 A 1522 LEU 1 0.730 75 1 A 1523 LYS 1 0.730 76 1 A 1524 ALA 1 0.800 77 1 A 1525 GLN 1 0.730 78 1 A 1526 GLN 1 0.690 79 1 A 1527 ASN 1 0.680 80 1 A 1528 LYS 1 0.660 81 1 A 1529 ALA 1 0.630 82 1 A 1530 MET 1 0.590 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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