data_SMR-f8c0aded714e329dbc388a1dc0eba459_2 _entry.id SMR-f8c0aded714e329dbc388a1dc0eba459_2 _struct.entry_id SMR-f8c0aded714e329dbc388a1dc0eba459_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - F6ZDS4/ TPR_MOUSE, Nucleoprotein TPR Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries F6ZDS4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 318135.074 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP TPR_MOUSE F6ZDS4 1 ;MTSGGSASRSGHRGVPMTSRGFDGSRRGSLRRAGARETASEAADGAAPAAGLRASPCSLASPSAAAAVAA IPADMAAVLQQVLERPELNKLPKSTQNKLEKFLAEQQSEIDCLKGRHEKFKVESEQQYFEIEKRLSQSQE RLVTETRECQNLRLELEKLNNQVKVLTEKTKELETAQDRNLGIQSQFTRAKEELEAEKRDLIRTNERLSQ EVEYLTEDVKRLNEKLKESNTTKGELQLKLDELQASDVAVKYREKRLEQEKELLHNQNSWLNTELKTKTD ELLALGREKGNEILELKCNLENKKEEVLRLEEQMNGLKTSNEHLQKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFH NELNAHIKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKTIQDHLLQVEESKDQMEKEMLEKI GKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKQEN KRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSAKLEQAMKEIQRLQEDTDKANKHSSVLERDN QRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLFA LRELGETREREEQETTSSKIAELQHKLENSLAELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGMAI PLQASSLDDISLLSTPKRSSTSQTVSTPAPEPVIDSTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKIDSEKLQNEQ LEKLQEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLQERNQKLTATTQKQEQIINTMTQD LRGANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQQRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETETKQR LNSQIEKLEHEISHLKKKLENEVEQRHTLTRNLDVQLLDTKRQLDTEINLHLNTKELLKNAQKDIATLKQ HLNNMEAQLASQSTQRTGKGQPGDRDDVDDLKSQLRQAEEQVNDLKERLKTSTSNVEQYRAMVTSLEDSL NKEKQVTEEVHKNIEVRLKESAEFQTQLEKKLMEVEKEKQELQDDKRKAIESMEQQLSELKKTLSTVQNE VQEALQRASTALSNEQQARRDCQEQAKIAVEAQNKYERELMLHAADVEALQAAKEQVSKMTSIRQHLEET TQKAESQLLECKASWEERERVLKDEVSKSVSRCEDLEKQNRLLHDQIEKLSDKVVTSMKDAVQAPLNVSL NEEGKSQEQILEILRFIRREKEIAETRFEVAQVESLRYRQRVELLERELQELQDSLNVEREKVQVTAKTM AQHEELMKKTETMNVVMETNKMLREEKERLEQNLQQMQAKVRKLELDILPLQEANAELSEKSGMLQAEKK LLEEDVKRWKARNQQLINQQKDPDTEEYRKLLSEKEIHTKRIQQLNEEVGRLKAEIARSNASLTNNQNLI QSLREDLSKARTEKEGIQKDLDAKIIDIQEKVKTITQVKKIGRRYKTQFEELKAQQNKAMETSTQSSGDH QEQHISVQEMQELKDTLSQSETKTKSLEGQVENLQKTLSEKETEARSLQEQTVQLQSELSRLRQDLQDKT TEEQLRQQMNEKTWKTLALAKSKITHLSGVKDQLTKEIEELKQRNGALDQQKDELDVRMTALKSQYEGRI SRLERELREHQERHLEQRDEPQEPTNKAPEQQRQITLKTTPASGERGIASTSDPPTANIKPTPVVSTPSK VTAAAMAGNKSTPRASIRPMVTPATVTNPTTTPTATVMPTTQVESQEAMQSEGPVEHVPVFGNASGSVRS TSPNVQPSISQPILTVQQQTQATAFVQPTQQSHPQIEPTNQELSPNIVEVVQSSPVERPSTSTAVFGTVS ATPSSSLPKRTREEEEDSTMEAGDQVSEDTVEMPLPKKLKMVTPVGTEEEVMAEESTDGEAETQAYNQDS QDSIGEGVTQGDYTPMEDSEETSQSLQIDLGPLQSDQQTTSSQDGQGKGDDVIVIDSDDEDDDEENDGEH EDYEEDEDDDDDEEDDTGMGDEGEDSNEGTGSADGNDGYEADDAEGGDGTDPGTETEESMGGAESHQRAA DSQNSGEGNTSAAESSFSQEVAREQQPTSASERQTPQAPQSPRRPPHPLPPRLTIHAPPQELGPPVQRIQ MTRRQSVGRGLQLTPGIGGMQQHFFDDEDRTVPSTPTLVVPHRTDGFAEAIHSPQVAGVPRFRFGPPEDM PQTSSSHSDLGQLASQGGLGMYETPLFLAHEEESGGRSVPTTPLQVAAPVTVFTESTTSDASEHASQSVP MVTTSTGTLSTTNETAAGDDGDEVFVEAESEGISSEAGLEIDSQQEEEPVQASDESDLPSTSQDPPSSSS VDTSSSQPKPFRRVRLQTTLRQGVRGRQFNRQRGISHAMGGRGGINRGNIN ; 'Nucleoprotein TPR' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2431 1 2431 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . TPR_MOUSE F6ZDS4 . 1 2431 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2012-04-18 D21CEA4F9C2C27C5 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MTSGGSASRSGHRGVPMTSRGFDGSRRGSLRRAGARETASEAADGAAPAAGLRASPCSLASPSAAAAVAA IPADMAAVLQQVLERPELNKLPKSTQNKLEKFLAEQQSEIDCLKGRHEKFKVESEQQYFEIEKRLSQSQE RLVTETRECQNLRLELEKLNNQVKVLTEKTKELETAQDRNLGIQSQFTRAKEELEAEKRDLIRTNERLSQ EVEYLTEDVKRLNEKLKESNTTKGELQLKLDELQASDVAVKYREKRLEQEKELLHNQNSWLNTELKTKTD ELLALGREKGNEILELKCNLENKKEEVLRLEEQMNGLKTSNEHLQKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFH NELNAHIKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKTIQDHLLQVEESKDQMEKEMLEKI GKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKQEN KRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSAKLEQAMKEIQRLQEDTDKANKHSSVLERDN QRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLFA LRELGETREREEQETTSSKIAELQHKLENSLAELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGMAI PLQASSLDDISLLSTPKRSSTSQTVSTPAPEPVIDSTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKIDSEKLQNEQ LEKLQEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLQERNQKLTATTQKQEQIINTMTQD LRGANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQQRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETETKQR LNSQIEKLEHEISHLKKKLENEVEQRHTLTRNLDVQLLDTKRQLDTEINLHLNTKELLKNAQKDIATLKQ HLNNMEAQLASQSTQRTGKGQPGDRDDVDDLKSQLRQAEEQVNDLKERLKTSTSNVEQYRAMVTSLEDSL NKEKQVTEEVHKNIEVRLKESAEFQTQLEKKLMEVEKEKQELQDDKRKAIESMEQQLSELKKTLSTVQNE VQEALQRASTALSNEQQARRDCQEQAKIAVEAQNKYERELMLHAADVEALQAAKEQVSKMTSIRQHLEET TQKAESQLLECKASWEERERVLKDEVSKSVSRCEDLEKQNRLLHDQIEKLSDKVVTSMKDAVQAPLNVSL NEEGKSQEQILEILRFIRREKEIAETRFEVAQVESLRYRQRVELLERELQELQDSLNVEREKVQVTAKTM AQHEELMKKTETMNVVMETNKMLREEKERLEQNLQQMQAKVRKLELDILPLQEANAELSEKSGMLQAEKK LLEEDVKRWKARNQQLINQQKDPDTEEYRKLLSEKEIHTKRIQQLNEEVGRLKAEIARSNASLTNNQNLI QSLREDLSKARTEKEGIQKDLDAKIIDIQEKVKTITQVKKIGRRYKTQFEELKAQQNKAMETSTQSSGDH QEQHISVQEMQELKDTLSQSETKTKSLEGQVENLQKTLSEKETEARSLQEQTVQLQSELSRLRQDLQDKT 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A 1 2349 LEU 2349 ? ? ? A . A 1 2350 GLU 2350 ? ? ? A . A 1 2351 ILE 2351 ? ? ? A . A 1 2352 ASP 2352 ? ? ? A . A 1 2353 SER 2353 ? ? ? A . A 1 2354 GLN 2354 ? ? ? A . A 1 2355 GLN 2355 ? ? ? A . A 1 2356 GLU 2356 ? ? ? A . A 1 2357 GLU 2357 ? ? ? A . A 1 2358 GLU 2358 ? ? ? A . A 1 2359 PRO 2359 ? ? ? A . A 1 2360 VAL 2360 ? ? ? A . A 1 2361 GLN 2361 ? ? ? A . A 1 2362 ALA 2362 ? ? ? A . A 1 2363 SER 2363 ? ? ? A . A 1 2364 ASP 2364 ? ? ? A . A 1 2365 GLU 2365 ? ? ? A . A 1 2366 SER 2366 ? ? ? A . A 1 2367 ASP 2367 ? ? ? A . A 1 2368 LEU 2368 ? ? ? A . A 1 2369 PRO 2369 ? ? ? A . A 1 2370 SER 2370 ? ? ? A . A 1 2371 THR 2371 ? ? ? A . A 1 2372 SER 2372 ? ? ? A . A 1 2373 GLN 2373 ? ? ? A . A 1 2374 ASP 2374 ? ? ? A . A 1 2375 PRO 2375 ? ? ? A . A 1 2376 PRO 2376 ? ? ? A . A 1 2377 SER 2377 ? ? ? A . A 1 2378 SER 2378 ? ? ? A . A 1 2379 SER 2379 ? ? ? A . A 1 2380 SER 2380 ? ? ? A . A 1 2381 VAL 2381 ? ? ? A . A 1 2382 ASP 2382 ? ? ? A . A 1 2383 THR 2383 ? ? ? A . A 1 2384 SER 2384 ? ? ? A . A 1 2385 SER 2385 ? ? ? A . A 1 2386 SER 2386 ? ? ? A . A 1 2387 GLN 2387 ? ? ? A . A 1 2388 PRO 2388 ? ? ? A . A 1 2389 LYS 2389 ? ? ? A . A 1 2390 PRO 2390 ? ? ? A . A 1 2391 PHE 2391 ? ? ? A . A 1 2392 ARG 2392 ? ? ? A . A 1 2393 ARG 2393 ? ? ? A . A 1 2394 VAL 2394 ? ? ? A . A 1 2395 ARG 2395 ? ? ? A . A 1 2396 LEU 2396 ? ? ? A . A 1 2397 GLN 2397 ? ? ? A . A 1 2398 THR 2398 ? ? ? A . A 1 2399 THR 2399 ? ? ? A . A 1 2400 LEU 2400 ? ? ? A . A 1 2401 ARG 2401 ? ? ? A . A 1 2402 GLN 2402 ? ? ? A . A 1 2403 GLY 2403 ? ? ? A . A 1 2404 VAL 2404 ? ? ? A . A 1 2405 ARG 2405 ? ? ? A . A 1 2406 GLY 2406 ? ? ? A . A 1 2407 ARG 2407 ? ? ? A . A 1 2408 GLN 2408 ? ? ? A . A 1 2409 PHE 2409 ? ? ? A . A 1 2410 ASN 2410 ? ? ? A . A 1 2411 ARG 2411 ? ? ? A . A 1 2412 GLN 2412 ? ? ? A . A 1 2413 ARG 2413 ? ? ? A . A 1 2414 GLY 2414 ? ? ? A . A 1 2415 ILE 2415 ? ? ? A . A 1 2416 SER 2416 ? ? ? A . A 1 2417 HIS 2417 ? ? ? A . A 1 2418 ALA 2418 ? ? ? A . A 1 2419 MET 2419 ? ? ? A . A 1 2420 GLY 2420 ? ? ? A . A 1 2421 GLY 2421 ? ? ? A . A 1 2422 ARG 2422 ? ? ? A . A 1 2423 GLY 2423 ? ? ? A . A 1 2424 GLY 2424 ? ? ? A . A 1 2425 ILE 2425 ? ? ? A . A 1 2426 ASN 2426 ? ? ? A . A 1 2427 ARG 2427 ? ? ? A . A 1 2428 GLY 2428 ? ? ? A . A 1 2429 ASN 2429 ? ? ? A . A 1 2430 ILE 2430 ? ? ? A . A 1 2431 ASN 2431 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Flagellar-associated protein 59 {PDB ID=8glv, label_asym_id=UFA, auth_asym_id=Kp, SMTL ID=8glv.853.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8glv, label_asym_id=UFA' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A UFA 112 1 Kp # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MANIDPYRTEEELVEDDEEVDMSFLPPFAKGTENEVLYVENARMERRLERTERALETNMDRLHIMDEHLK NVQQELKYTQTRVEAKNKEIESEKHLNAMAEREMGRLKKDIGKMEAERQELADKINGLQNQIYKNNEKLD QFKMLMNWNQEELEQWALAERQKAEDNAALEKYRHADDGKVKELTLALERVSKQVVGRKEELEAEVVETQ AAQIQLDKAAEDFRKLHVERQDLIRQWEEAVEAMRHRDAAIAAASEQFAMQKDVLRERKRELDAQARFLE NETLNTKEADARVAYYEREVGKQRDVLAREQARTEELNNQVELVKATLSKAATELAQRTVENKQAREDLD AKRQKLDAARKRFVVLKRKLENEFGNLDSMEAKASELEAMRRGEEARLKAILKEHELLKKEQYKRSQVLF DLRQKERELISEISGGQGQNKNLAARIHALDEQVVRQQELLYNVEFQLQQMERKVARAGGVRSEEETRAL NARIEKLTAILEGVNAEYSMLLEQVKRAEDDLLAARRANTSLRADRAKLDETISTLKLENDMVSRQVKGS VEAREKALVDHDVLALEVKRLRDILAAHADEVFSLENRKQQLALSMEERKQEVEVHRDGLRAELRLLRED VHRITLELKERLLRCEKLQAKFEIISAKHRGSGEDDGEERTQAYYVIKAAQEREALQREGDDLDGRIRVA EKEVAALEATLAQLMAVNTNFAASYKKVGSKEAFEERAALRDKLDKAYDKLKARRADEAAIAGDIQVSEA RLSNLGQEQRSLQALVDDMTRRKAEAQRQLDEQREKLGRALGRTDKLRQKLGLANSPQGADVELAEVRDV TRAMLLELKALALANPGAMIAEACEAAGIRLPSGGSNPPSLGGSRPGSARSQTSLGSVRSARSVASQQRG GMGGSPAVRTIQLGA ; ;MANIDPYRTEEELVEDDEEVDMSFLPPFAKGTENEVLYVENARMERRLERTERALETNMDRLHIMDEHLK NVQQELKYTQTRVEAKNKEIESEKHLNAMAEREMGRLKKDIGKMEAERQELADKINGLQNQIYKNNEKLD QFKMLMNWNQEELEQWALAERQKAEDNAALEKYRHADDGKVKELTLALERVSKQVVGRKEELEAEVVETQ AAQIQLDKAAEDFRKLHVERQDLIRQWEEAVEAMRHRDAAIAAASEQFAMQKDVLRERKRELDAQARFLE NETLNTKEADARVAYYEREVGKQRDVLAREQARTEELNNQVELVKATLSKAATELAQRTVENKQAREDLD AKRQKLDAARKRFVVLKRKLENEFGNLDSMEAKASELEAMRRGEEARLKAILKEHELLKKEQYKRSQVLF DLRQKERELISEISGGQGQNKNLAARIHALDEQVVRQQELLYNVEFQLQQMERKVARAGGVRSEEETRAL NARIEKLTAILEGVNAEYSMLLEQVKRAEDDLLAARRANTSLRADRAKLDETISTLKLENDMVSRQVKGS VEAREKALVDHDVLALEVKRLRDILAAHADEVFSLENRKQQLALSMEERKQEVEVHRDGLRAELRLLRED VHRITLELKERLLRCEKLQAKFEIISAKHRGSGEDDGEERTQAYYVIKAAQEREALQREGDDLDGRIRVA EKEVAALEATLAQLMAVNTNFAASYKKVGSKEAFEERAALRDKLDKAYDKLKARRADEAAIAGDIQVSEA RLSNLGQEQRSLQALVDDMTRRKAEAQRQLDEQREKLGRALGRTDKLRQKLGLANSPQGADVELAEVRDV TRAMLLELKALALANPGAMIAEACEAAGIRLPSGGSNPPSLGGSRPGSARSQTSLGSVRSARSVASQQRG GMGGSPAVRTIQLGA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 384 769 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8glv 2023-06-28 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2431 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2466 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.5e-07 14.815 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTSGGSASRSGHRGVPMTSRGFDGSRRGSLRRAGARETASEAADGAAPAAGLRASPCSLASPSAAAAVAAIPADMAAVLQQVLERPELNKLPKSTQNKLEKFLAEQQSEIDCLKGRHEKFKVESEQQYFEIEKRLSQSQERLVTETRECQNLRLELEKLNNQVKVLTEKTKELETAQDRNLGIQSQFTRAKEELEAEKRDLIRTNERLSQEVEYLTEDVKRLNEKLKESNTTKGELQLKLDELQASDVAVKYREKRLEQEKELLHNQNSWLNTELKTKTDELLALGREKGNEILELKCNLENKKEEVLRLEEQMNGLKTSNEHLQKHVEDLLTKLKEAKEQQASMEEKFHNELNAHIKLSNLYKSAADDSEAKSNELTRAVDELHKLLKEAGEANKTIQDHLLQVEESKDQMEKEMLEKIGKLEKELENANDLLSATKRKGAILSEEELAAMSPTAAAVAKIVKPGMKLTELYNAYVETQDQLLLEKQENKRINKYLDEIVKEVEAKAPILKRQREEYERAQKAVASLSAKLEQAMKEIQRLQEDTDKANKHSSVLERDNQRMEIQIKDLSQQIRVLLMELEEARGNHVIRDEEVSSADISSSSEVISQHLVSYRNIEELQQQNQRLLFALRELGETREREEQETTSSKIAELQHKLENSLAELEQLRESRQHQMQLVDSIVRQRDMYRILLSQTTGMAIPLQASSLDDISLLSTPKRSSTSQTVSTPAPEPVIDSTEAIEAKAALKQLQEIFENYKKEKIDSEKLQNEQLEKLQEQVTDLRSQNTKISTQLDFASKRYEMLQDNVEGYRREITSLQERNQKLTATTQKQEQIINTMTQDLRGANEKLAVAEVRAENLKKEKEMLKLSEVRLSQQRESLLAEQRGQNLLLTNLQTIQGILERSETETKQRLNSQIEKLEHEISHLKKKLENEVEQRHTLTRNLDVQLLDTKRQLDTEINLHLNTKELLKNAQKDIATLKQHLNNMEAQLASQSTQRTGKGQPGDRDDVDDLKSQLRQAEEQVNDLKERLKTSTSNVEQYRAMVTSLEDSLNKEKQVTEEVHKNIEVRLKESAEFQTQLEKKLMEVEKEKQELQDDKRKAIESMEQQLSELKKTLSTVQNEVQEALQRASTALSNEQQARRDCQEQAKIAVEAQNKYERELMLHAADVEALQAAKEQVSKMTSIRQHLEETTQKAESQLLECKASWEERERVLKDEVSKSVSRCEDLEKQNRLLHDQIEKLSDKVVTSMKDAV------QAPLNVSLNEE-GKSQEQILEILRFIRREKEIAETRFEVAQVESLRYRQRVELLERELQELQDSLNVEREKVQVTAKTMAQHEELMKKT----ETMNVVMETNKMLREEKERLEQNLQQMQAKVRKLELDILPLQ-----------------EANAELSEKSGMLQAEKKLLEEDVK-------RWKARNQQLINQQKDPDTEEYRKLLSEKEIHTKRIQQLNEEVGRLKAEIARSNASLTNNQNLIQSLREDLSKARTEKEGIQKDLDAKIIDIQEKVKTITQVKKIGRRYKTQFEELKAQQNKAMETSTQSSGDHQEQHISVQEMQELKDTLSQSETKTKSLEGQVENLQKTLSEKETEARSLQEQTVQLQSELSRLRQDLQDKTTEEQLRQQMNEKTWKTLALAKSKITHLSGVKDQLTKEIEELKQRNGALDQQKDELDVRMTALKSQYEGRISRLERELREHQERHLEQRDEPQEPTNKAPEQQRQITLKTTPASGERGIASTSDPPTANIKPTPVVSTPSKVTAAAMAGNKSTPRASIRPMVTPATVTNPTTTPTATVMPTTQVESQEAMQSEGPVEHVPVFGNASGSVRSTSPNVQPSISQPILTVQQQTQATAFVQPTQQSHPQIEPTNQELSPNIVEVVQSSPVERPSTSTAVFGTVSATPSSSLPKRTREEEEDSTMEAGDQVSEDTVEMPLPKKLKMVTPVGTEEEVMAEESTDGEAETQAYNQDSQDSIGEGVTQGDYTPMEDSEETSQSLQIDLGPLQSDQQTTSSQDGQGKGDDVIVIDSDDEDDDEENDGEHEDYEEDEDDDDDEEDDTGMGDEGEDSNEGTGSADGNDGYEADDAEGGDGTDPGTETEESMGGAESHQRAADSQNSGEGNTSAAESSFSQEVAREQQPTSASERQTPQAPQSPRRPPHPLPPRLTIHAPPQELGPPVQRIQMTRRQSVGRGLQLTPGIGGMQQHFFDDEDRTVPSTPTLVVPHRTDGFAEAIHSPQVAGVPRFRFGPPEDMPQTSSSHSDLGQLASQGGLGMYETPLFLAHEEESGGRSVPTTPLQVAAPVTVFTESTTSDASEHASQSVPMVTTSTGTLSTTNETAAGDDGDEVFVEAESEGISSEAGLEIDSQQEEEPVQASDESDLPSTSQDPPSSSSVDTSSSQPKPFRRVRLQTTLRQGVRGRQFNRQRGISHAMGGRGGINRGNIN 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ASELEAMRRGEEARLKAILKEHELLKKEQYKRSQVLF----DLRQKERELISEISGGQGQNKNLAARIHALDEQVVRQ------QELLYN-------VEFQ-LQQMERKVARAGGVRS--------------------EEETRALNARIEKLTAILEGVNAEYSMLLEQVKRAEDDLLA-ARRANTSLRADRAKLD-ETISTLKLENDMVSRQVKGSVEAREKALVDHDVLALEVKRLRDILAAH------ADEVFSLENRKQQLALSMEERKQEVEVHRDGLRAELRLLREDVHRITLELKERLLRCEKLQAKFEIISAKHRGSGEDDGEERTQAYYVIKAAQEREALQREGDDLDGRIRVAEKEVAALEATLAQLMAVNTNFAASYKKVGS---KEAFEERAALRDKLDKAYDKLKARRADEAAIAGDIQVSE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8glv.853' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 436.803 444.585 87.426 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 210 C CD1 . LEU 1092 1092 ? A 436.097 445.119 88.679 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 211 C CD2 . LEU 1092 1092 ? A 435.799 443.876 86.508 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 212 N N . GLN 1093 1093 ? A 439.229 447.605 85.035 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 213 C CA . GLN 1093 1093 ? A 439.357 448.747 84.152 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 214 C C . GLN 1093 1093 ? A 440.296 448.495 82.990 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 215 O O . GLN 1093 1093 ? A 440.002 448.835 81.841 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 216 C CB . GLN 1093 1093 ? A 439.857 449.983 84.927 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 217 C CG . GLN 1093 1093 ? A 438.802 450.563 85.894 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 218 C CD . GLN 1093 1093 ? A 439.374 451.730 86.698 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 219 O OE1 . GLN 1093 1093 ? A 440.573 451.874 86.916 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 220 N NE2 . GLN 1093 1093 ? A 438.472 452.627 87.168 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 221 N N . ASP 1094 1094 ? A 441.461 447.880 83.258 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 222 C CA . ASP 1094 1094 ? 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A 442.628 442.866 82.996 1 1 A ASP 0.700 1 ATOM 236 O OD2 . ASP 1095 1095 ? A 442.818 442.258 80.899 1 1 A ASP 0.700 1 ATOM 237 N N . LYS 1096 1096 ? A 438.668 445.599 80.577 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 238 C CA . LYS 1096 1096 ? A 437.631 446.231 79.768 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 239 C C . LYS 1096 1096 ? A 438.236 447.137 78.700 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 240 O O . LYS 1096 1096 ? A 437.879 447.070 77.535 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 241 C CB . LYS 1096 1096 ? A 436.555 446.984 80.593 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 242 C CG . LYS 1096 1096 ? A 435.635 446.038 81.386 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 243 C CD . LYS 1096 1096 ? A 434.511 446.785 82.123 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 244 C CE . LYS 1096 1096 ? A 433.593 445.845 82.904 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 245 N NZ . LYS 1096 1096 ? A 432.572 446.631 83.631 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 246 N N . ARG 1097 1097 ? A 439.254 447.954 79.022 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 247 C CA . ARG 1097 1097 ? A 439.926 448.767 78.021 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 248 C C . ARG 1097 1097 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.654 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1068 LEU 1 0.890 2 1 A 1069 LYS 1 0.760 3 1 A 1070 GLU 1 0.550 4 1 A 1071 SER 1 0.560 5 1 A 1072 ALA 1 0.660 6 1 A 1073 GLU 1 0.640 7 1 A 1074 PHE 1 0.610 8 1 A 1075 GLN 1 0.660 9 1 A 1076 THR 1 0.710 10 1 A 1077 GLN 1 0.710 11 1 A 1078 LEU 1 0.690 12 1 A 1079 GLU 1 0.710 13 1 A 1080 LYS 1 0.730 14 1 A 1081 LYS 1 0.730 15 1 A 1082 LEU 1 0.700 16 1 A 1083 MET 1 0.680 17 1 A 1084 GLU 1 0.710 18 1 A 1085 VAL 1 0.750 19 1 A 1086 GLU 1 0.700 20 1 A 1087 LYS 1 0.740 21 1 A 1088 GLU 1 0.720 22 1 A 1089 LYS 1 0.730 23 1 A 1090 GLN 1 0.730 24 1 A 1091 GLU 1 0.720 25 1 A 1092 LEU 1 0.720 26 1 A 1093 GLN 1 0.720 27 1 A 1094 ASP 1 0.720 28 1 A 1095 ASP 1 0.700 29 1 A 1096 LYS 1 0.680 30 1 A 1097 ARG 1 0.590 31 1 A 1098 LYS 1 0.610 32 1 A 1099 ALA 1 0.610 33 1 A 1100 ILE 1 0.560 34 1 A 1101 GLU 1 0.540 35 1 A 1102 SER 1 0.580 36 1 A 1103 MET 1 0.480 37 1 A 1104 GLU 1 0.420 38 1 A 1105 GLN 1 0.470 39 1 A 1106 GLN 1 0.470 40 1 A 1107 LEU 1 0.480 41 1 A 1108 SER 1 0.510 42 1 A 1109 GLU 1 0.550 43 1 A 1110 LEU 1 0.550 44 1 A 1111 LYS 1 0.570 45 1 A 1112 LYS 1 0.610 46 1 A 1113 THR 1 0.620 47 1 A 1114 LEU 1 0.640 48 1 A 1115 SER 1 0.690 49 1 A 1116 THR 1 0.690 50 1 A 1117 VAL 1 0.710 51 1 A 1118 GLN 1 0.700 52 1 A 1119 ASN 1 0.740 53 1 A 1120 GLU 1 0.690 54 1 A 1121 VAL 1 0.710 55 1 A 1122 GLN 1 0.720 56 1 A 1123 GLU 1 0.710 57 1 A 1124 ALA 1 0.760 58 1 A 1125 LEU 1 0.650 59 1 A 1126 GLN 1 0.660 60 1 A 1127 ARG 1 0.510 61 1 A 1128 ALA 1 0.590 62 1 A 1129 SER 1 0.710 63 1 A 1130 THR 1 0.750 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #