data_SMR-73d347bd69aaa3ea7ac761a8ed424458_4 _entry.id SMR-73d347bd69aaa3ea7ac761a8ed424458_4 _struct.entry_id SMR-73d347bd69aaa3ea7ac761a8ed424458_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9Y618 (isoform 2)/ NCOR2_HUMAN, Nuclear receptor corepressor 2 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y618 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 311746.318 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NCOR2_HUMAN Q9Y618 1 ;MSGSTQPVAQTWRATEPRYPPHSLSYPVQIARTHTDVGLLEYQHHSRDYASHLSPGSIIQPQRRRPSLLS EFQPGNERSQELHLRPESHSYLPELGKSEMEFIESKRPRLELLPDPLLRPSPLLATGQPAGSEDLTKDRS LTGKLEPVSPPSPPHTDPELELVPPRLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEP EKPVSPPPIESKHRSLVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKL ILYFKRRNHARKQWEQKFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRELQERM QSRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMADPM KVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAECVLYYYLTKKNENYKSLVRRSYRRR GKSQQQQQQQQQQQQQQQQQPMPRSSQEEKDEKEKEKEAEKEEEKPEVENDKEDLLKEKTDDTSGEDNDE KEAVASKGRKTANSQGRRKGRITRSMANEANSEEAITPQQSAELASMELNESSRWTEEEMETAKKGLLEH GRNWSAIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKAPAAASEEAAFPPVV EDEEMEASGVSGNEEEMVEEAEATVNNSSDTESIPSPHTEAAKDTGQNGPKPPATLGADGPPPGPPTPPP EDIPAPTEPTPASEATGAPTPPPAPPSPSAPPPVVPKEEKEEETAAAPPVEEGEEQKPPAAEELAVDTGK AEEPVKSECTEEAEEGPAKGKDAEAAEATAEGALKAEKKEGGSGRATTAKSSGAPQDSDSSATCSADEVD EAEGGDKNRLLSPRPSLLTPTGDPRANASPQKPLDLKQLKQRAAAIPPIQVTKVHEPPREDAAPTKPAPP APPPPQNLQPESDAPQQPGSSPRGKSRSPAPPADKEAFAAEAQKLPGDPPCWTSGLPFPVPPREVIKASP HAPDPSAFSYAPPGHPLPLGLHDTARPVLPRPPTISNPPPLISSAKHPSVLERQIGAISQGMSVQLHVPY SEHAKAPVGPVTMGLPLPMDPKKLAPFSGVKQEQLSPRGQAGPPESLGVPTAQEASVLRGTALGSVPGGS ITKGIPSTRVPSDSAITYRGSITHGTPADVLYKGTITRIIGEDSPSRLDRGREDSLPKGHVIYEGKKGHV LSYEGGMSVTQCSKEDGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRAISSASIEGLMGRAIPPERHSPHHLKE QHHIRGSITQGIPRSYVEAQEDYLRREAKLLKREGTPPPPPPSRDLTEAYKTQALGPLKLKPAHEGLVAT VKEAGRSIHEIPREELRHTPELPLAPRPLKEGSITQGTPLKYDTGASTTGSKKHDVRSLIGSPGRTFPPV HPLDVMADARALERACYEESLKSRPGTASSSGGSIARGAPVIVPELGKPRQSPLTYEDHGAPFAGHLPRG SPVTTREPTPRLQEGSLSSSKASQDRKLTSTPREIAKSPHSTVPEHHPHPISPYEHLLRGVSGVDLYRSH IPLAFDPTSIPRGIPLDAAAAYYLPRHLAPNPTYPHLYPPYLIRGYPDTAALENRQTIINDYITSQQMHH NAATAMAQRADMLRGLSPRESSLALNYAAGPRGIIDLSQVPHLPVLVPPTPGTPATAMDRLAYLPTAPQP FSSRHSSSPLSPGGPTHLTKPTTTSSSERERDRDRERDRDREREKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGS SGGGGGSSSRPASHSHAHQHSPISPRTQDALQQRPSVLHNTGMKGIITAVEPSTPTVLRSTSTSSPVRPA ATFPPATHCPLGGTLDGVYPTLMEPVLLPKEAPRVARPERPRADTGHAFLAKPPARSGLEPASSPSKGSE PRPLVPPVSGHATIARTPAKNLAPHHASPDPPAPPASASDPHREKTQSKPFSIQELELRSLGYHGSSYSP EGVEPVSPVSSPSLTHDKGLPKHLEELDKSHLEGELRPKQPGPVKLGGEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLL QTAPGVKGHQRVVTLAQHISEVITQDYTRHHPQQLSAPLPAPLYSFPGASCPVLDLRRPPSDLYLPPPDH GAPARGSPHSEGGKRSPEPNKTSVLGGGEDGIEPVSPPEGMTEPGHSRSAVYPLLYRDGEQTEPSRMGSK SPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSKKQEINKKLNTHNRNEPEYNISQPGTEIFNMPAITGTGLMTYRSQ AVQEHASTNMGLEAIIRKALMGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLASGDRPPSVSSVHSEGDCNRRTPLT NRVWEDRPSSAGSTPFPYNPLIMRLQAGVMASPPPPGLPAGSGPLAGPHHAWDEEPKPLLCSQYETLSDS E ; 'Nuclear receptor corepressor 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2451 1 2451 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NCOR2_HUMAN Q9Y618 Q9Y618-2 1 2451 9606 'Homo sapiens (Human)' 2018-09-12 24299917E937ED2A # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MSGSTQPVAQTWRATEPRYPPHSLSYPVQIARTHTDVGLLEYQHHSRDYASHLSPGSIIQPQRRRPSLLS EFQPGNERSQELHLRPESHSYLPELGKSEMEFIESKRPRLELLPDPLLRPSPLLATGQPAGSEDLTKDRS LTGKLEPVSPPSPPHTDPELELVPPRLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEP EKPVSPPPIESKHRSLVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKL ILYFKRRNHARKQWEQKFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRELQERM QSRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMADPM KVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAECVLYYYLTKKNENYKSLVRRSYRRR GKSQQQQQQQQQQQQQQQQQPMPRSSQEEKDEKEKEKEAEKEEEKPEVENDKEDLLKEKTDDTSGEDNDE KEAVASKGRKTANSQGRRKGRITRSMANEANSEEAITPQQSAELASMELNESSRWTEEEMETAKKGLLEH 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A 1 2349 LYS 2349 ? ? ? B . A 1 2350 SER 2350 ? ? ? B . A 1 2351 PRO 2351 ? ? ? B . A 1 2352 ALA 2352 ? ? ? B . A 1 2353 PRO 2353 ? ? ? B . A 1 2354 GLY 2354 ? ? ? B . A 1 2355 LEU 2355 ? ? ? B . A 1 2356 ALA 2356 ? ? ? B . A 1 2357 SER 2357 ? ? ? B . A 1 2358 GLY 2358 ? ? ? B . A 1 2359 ASP 2359 ? ? ? B . A 1 2360 ARG 2360 ? ? ? B . A 1 2361 PRO 2361 ? ? ? B . A 1 2362 PRO 2362 ? ? ? B . A 1 2363 SER 2363 ? ? ? B . A 1 2364 VAL 2364 ? ? ? B . A 1 2365 SER 2365 ? ? ? B . A 1 2366 SER 2366 ? ? ? B . A 1 2367 VAL 2367 ? ? ? B . A 1 2368 HIS 2368 ? ? ? B . A 1 2369 SER 2369 ? ? ? B . A 1 2370 GLU 2370 ? ? ? B . A 1 2371 GLY 2371 ? ? ? B . A 1 2372 ASP 2372 ? ? ? B . A 1 2373 CYS 2373 ? ? ? B . A 1 2374 ASN 2374 ? ? ? B . A 1 2375 ARG 2375 ? ? ? B . A 1 2376 ARG 2376 ? ? ? B . A 1 2377 THR 2377 ? ? ? B . A 1 2378 PRO 2378 ? ? ? B . A 1 2379 LEU 2379 ? ? ? B . A 1 2380 THR 2380 ? ? ? B . A 1 2381 ASN 2381 ? ? ? B . A 1 2382 ARG 2382 ? ? ? B . A 1 2383 VAL 2383 ? ? ? B . A 1 2384 TRP 2384 ? ? ? B . A 1 2385 GLU 2385 ? ? ? B . A 1 2386 ASP 2386 ? ? ? B . A 1 2387 ARG 2387 ? ? ? B . A 1 2388 PRO 2388 ? ? ? B . A 1 2389 SER 2389 ? ? ? B . A 1 2390 SER 2390 ? ? ? B . A 1 2391 ALA 2391 ? ? ? B . A 1 2392 GLY 2392 ? ? ? B . A 1 2393 SER 2393 ? ? ? B . A 1 2394 THR 2394 ? ? ? B . A 1 2395 PRO 2395 ? ? ? B . A 1 2396 PHE 2396 ? ? ? B . A 1 2397 PRO 2397 ? ? ? B . A 1 2398 TYR 2398 ? ? ? B . A 1 2399 ASN 2399 ? ? ? B . A 1 2400 PRO 2400 ? ? ? B . A 1 2401 LEU 2401 ? ? ? B . A 1 2402 ILE 2402 ? ? ? B . A 1 2403 MET 2403 ? ? ? B . A 1 2404 ARG 2404 ? ? ? B . A 1 2405 LEU 2405 ? ? ? B . A 1 2406 GLN 2406 ? ? ? B . A 1 2407 ALA 2407 ? ? ? B . A 1 2408 GLY 2408 ? ? ? B . A 1 2409 VAL 2409 ? ? ? B . A 1 2410 MET 2410 ? ? ? B . A 1 2411 ALA 2411 ? ? ? B . A 1 2412 SER 2412 ? ? ? B . A 1 2413 PRO 2413 ? ? ? B . A 1 2414 PRO 2414 ? ? ? B . A 1 2415 PRO 2415 ? ? ? B . A 1 2416 PRO 2416 ? ? ? B . A 1 2417 GLY 2417 ? ? ? B . A 1 2418 LEU 2418 ? ? ? B . A 1 2419 PRO 2419 ? ? ? B . A 1 2420 ALA 2420 ? ? ? B . A 1 2421 GLY 2421 ? ? ? B . A 1 2422 SER 2422 ? ? ? B . A 1 2423 GLY 2423 ? ? ? B . A 1 2424 PRO 2424 ? ? ? B . A 1 2425 LEU 2425 ? ? ? B . A 1 2426 ALA 2426 ? ? ? B . A 1 2427 GLY 2427 ? ? ? B . A 1 2428 PRO 2428 ? ? ? B . A 1 2429 HIS 2429 ? ? ? B . A 1 2430 HIS 2430 ? ? ? B . A 1 2431 ALA 2431 ? ? ? B . A 1 2432 TRP 2432 ? ? ? B . A 1 2433 ASP 2433 ? ? ? B . A 1 2434 GLU 2434 ? ? ? B . A 1 2435 GLU 2435 ? ? ? B . A 1 2436 PRO 2436 ? ? ? B . A 1 2437 LYS 2437 ? ? ? B . A 1 2438 PRO 2438 ? ? ? B . A 1 2439 LEU 2439 ? ? ? B . A 1 2440 LEU 2440 ? ? ? B . A 1 2441 CYS 2441 ? ? ? B . A 1 2442 SER 2442 ? ? ? B . A 1 2443 GLN 2443 ? ? ? B . A 1 2444 TYR 2444 ? ? ? B . A 1 2445 GLU 2445 ? ? ? B . A 1 2446 THR 2446 ? ? ? B . A 1 2447 LEU 2447 ? ? ? B . A 1 2448 SER 2448 ? ? ? B . A 1 2449 ASP 2449 ? ? ? B . A 1 2450 SER 2450 ? ? ? B . A 1 2451 GLU 2451 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'NUCLEAR RECEPTOR COREPRESSOR 2 {PDB ID=4a69, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=4a69.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 4a69, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-04 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-11-29 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 2 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GAMRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIAS FLERKTVAECVLYYYLTKKNENYK ; ;GAMRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIAS FLERKTVAECVLYYYLTKKNENYK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 3 94 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4a69 2023-12-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2451 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2451 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 8.67e-58 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSGSTQPVAQTWRATEPRYPPHSLSYPVQIARTHTDVGLLEYQHHSRDYASHLSPGSIIQPQRRRPSLLSEFQPGNERSQELHLRPESHSYLPELGKSEMEFIESKRPRLELLPDPLLRPSPLLATGQPAGSEDLTKDRSLTGKLEPVSPPSPPHTDPELELVPPRLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPIESKHRSLVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKLILYFKRRNHARKQWEQKFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRELQERMQSRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAECVLYYYLTKKNENYKSLVRRSYRRRGKSQQQQQQQQQQQQQQQQQPMPRSSQEEKDEKEKEKEAEKEEEKPEVENDKEDLLKEKTDDTSGEDNDEKEAVASKGRKTANSQGRRKGRITRSMANEANSEEAITPQQSAELASMELNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNWSAIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKAPAAASEEAAFPPVVEDEEMEASGVSGNEEEMVEEAEATVNNSSDTESIPSPHTEAAKDTGQNGPKPPATLGADGPPPGPPTPPPEDIPAPTEPTPASEATGAPTPPPAPPSPSAPPPVVPKEEKEEETAAAPPVEEGEEQKPPAAEELAVDTGKAEEPVKSECTEEAEEGPAKGKDAEAAEATAEGALKAEKKEGGSGRATTAKSSGAPQDSDSSATCSADEVDEAEGGDKNRLLSPRPSLLTPTGDPRANASPQKPLDLKQLKQRAAAIPPIQVTKVHEPPREDAAPTKPAPPAPPPPQNLQPESDAPQQPGSSPRGKSRSPAPPADKEAFAAEAQKLPGDPPCWTSGLPFPVPPREVIKASPHAPDPSAFSYAPPGHPLPLGLHDTARPVLPRPPTISNPPPLISSAKHPSVLERQIGAISQGMSVQLHVPYSEHAKAPVGPVTMGLPLPMDPKKLAPFSGVKQEQLSPRGQAGPPESLGVPTAQEASVLRGTALGSVPGGSITKGIPSTRVPSDSAITYRGSITHGTPADVLYKGTITRIIGEDSPSRLDRGREDSLPKGHVIYEGKKGHVLSYEGGMSVTQCSKEDGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRAISSASIEGLMGRAIPPERHSPHHLKEQHHIRGSITQGIPRSYVEAQEDYLRREAKLLKREGTPPPPPPSRDLTEAYKTQALGPLKLKPAHEGLVATVKEAGRSIHEIPREELRHTPELPLAPRPLKEGSITQGTPLKYDTGASTTGSKKHDVRSLIGSPGRTFPPVHPLDVMADARALERACYEESLKSRPGTASSSGGSIARGAPVIVPELGKPRQSPLTYEDHGAPFAGHLPRGSPVTTREPTPRLQEGSLSSSKASQDRKLTSTPREIAKSPHSTVPEHHPHPISPYEHLLRGVSGVDLYRSHIPLAFDPTSIPRGIPLDAAAAYYLPRHLAPNPTYPHLYPPYLIRGYPDTAALENRQTIINDYITSQQMHHNAATAMAQRADMLRGLSPRESSLALNYAAGPRGIIDLSQVPHLPVLVPPTPGTPATAMDRLAYLPTAPQPFSSRHSSSPLSPGGPTHLTKPTTTSSSERERDRDRERDRDREREKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGSSGGGGGSSSRPASHSHAHQHSPISPRTQDALQQRPSVLHNTGMKGIITAVEPSTPTVLRSTSTSSPVRPAATFPPATHCPLGGTLDGVYPTLMEPVLLPKEAPRVARPERPRADTGHAFLAKPPARSGLEPASSPSKGSEPRPLVPPVSGHATIARTPAKNLAPHHASPDPPAPPASASDPHREKTQSKPFSIQELELRSLGYHGSSYSPEGVEPVSPVSSPSLTHDKGLPKHLEELDKSHLEGELRPKQPGPVKLGGEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLLQTAPGVKGHQRVVTLAQHISEVITQDYTRHHPQQLSAPLPAPLYSFPGASCPVLDLRRPPSDLYLPPPDHGAPARGSPHSEGGKRSPEPNKTSVLGGGEDGIEPVSPPEGMTEPGHSRSAVYPLLYRDGEQTEPSRMGSKSPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSKKQEINKKLNTHNRNEPEYNISQPGTEIFNMPAITGTGLMTYRSQAVQEHASTNMGLEAIIRKALMGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLASGDRPPSVSSVHSEGDCNRRTPLTNRVWEDRPSSAGSTPFPYNPLIMRLQAGVMASPPPPGLPAGSGPLAGPHHAWDEEPKPLLCSQYETLSDSE 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAECVLYYYLTKKNENYK--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4a69.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 408 408 ? A 40.580 19.691 12.725 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 2 C CA . LYS 408 408 ? A 40.122 19.833 11.292 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 3 C C . LYS 408 408 ? A 39.654 21.221 10.893 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 4 O O . LYS 408 408 ? A 40.200 21.780 9.954 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 5 C CB . LYS 408 408 ? A 39.072 18.754 10.881 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 6 C CG . LYS 408 408 ? A 39.149 18.388 9.377 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 7 C CD . LYS 408 408 ? A 38.074 17.369 8.928 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 8 C CE . LYS 408 408 ? A 38.552 16.238 7.995 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 9 N NZ . LYS 408 408 ? A 39.251 16.786 6.813 1 1 B LYS 0.440 1 ATOM 10 N N . PHE 409 409 ? A 38.659 21.822 11.591 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 11 C CA . PHE 409 409 ? A 38.275 23.207 11.357 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 12 C C . PHE 409 409 ? A 39.067 24.183 12.222 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 13 O O . PHE 409 409 ? A 39.275 25.330 11.839 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 14 C CB . PHE 409 409 ? A 36.758 23.397 11.618 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 15 C CG . PHE 409 409 ? A 35.920 22.469 10.771 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 16 C CD1 . PHE 409 409 ? A 36.110 22.389 9.382 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 17 C CD2 . PHE 409 409 ? A 34.890 21.706 11.349 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 18 C CE1 . PHE 409 409 ? A 35.306 21.561 8.592 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 19 C CE2 . PHE 409 409 ? A 34.085 20.871 10.561 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 20 C CZ . PHE 409 409 ? A 34.294 20.799 9.180 1 1 B PHE 0.470 1 ATOM 21 N N . ILE 410 410 ? A 39.583 23.738 13.386 1 1 B ILE 0.640 1 ATOM 22 C CA . ILE 410 410 ? A 40.544 24.480 14.174 1 1 B ILE 0.640 1 ATOM 23 C C . ILE 410 410 ? A 41.705 23.508 14.369 1 1 B ILE 0.640 1 ATOM 24 O O . ILE 410 410 ? A 41.497 22.310 14.566 1 1 B ILE 0.640 1 ATOM 25 C CB . ILE 410 410 ? A 39.980 25.017 15.499 1 1 B ILE 0.640 1 ATOM 26 C CG1 . ILE 410 410 ? A 38.637 25.765 15.272 1 1 B ILE 0.640 1 ATOM 27 C CG2 . ILE 410 410 ? A 41.032 25.945 16.149 1 1 B ILE 0.640 1 ATOM 28 C CD1 . ILE 410 410 ? A 37.977 26.296 16.553 1 1 B ILE 0.640 1 ATOM 29 N N . ASN 411 411 ? A 42.951 24.007 14.209 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 30 C CA . ASN 411 411 ? A 44.193 23.312 14.501 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 31 C C . ASN 411 411 ? A 44.527 23.350 15.995 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 32 O O . ASN 411 411 ? A 43.947 24.114 16.759 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 33 C CB . ASN 411 411 ? A 45.389 23.964 13.755 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 34 C CG . ASN 411 411 ? A 45.336 23.682 12.260 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 35 O OD1 . ASN 411 411 ? A 44.361 23.158 11.715 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 36 N ND2 . ASN 411 411 ? A 46.458 23.980 11.565 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 37 N N . MET 412 412 ? A 45.537 22.561 16.440 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 38 C CA . MET 412 412 ? A 46.057 22.527 17.811 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 39 C C . MET 412 412 ? A 46.485 23.884 18.358 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 40 O O . MET 412 412 ? A 46.297 24.191 19.530 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 41 C CB . MET 412 412 ? A 47.292 21.578 17.878 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 42 C CG . MET 412 412 ? A 46.981 20.147 18.360 1 1 B MET 0.560 1 ATOM 43 S SD . MET 412 412 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.676 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 408 LYS 1 0.440 2 1 A 409 PHE 1 0.470 3 1 A 410 ILE 1 0.640 4 1 A 411 ASN 1 0.630 5 1 A 412 MET 1 0.560 6 1 A 413 ASN 1 0.600 7 1 A 414 GLY 1 0.630 8 1 A 415 LEU 1 0.660 9 1 A 416 MET 1 0.650 10 1 A 417 ALA 1 0.670 11 1 A 418 ASP 1 0.660 12 1 A 419 PRO 1 0.680 13 1 A 420 MET 1 0.670 14 1 A 421 LYS 1 0.720 15 1 A 422 VAL 1 0.740 16 1 A 423 TYR 1 0.700 17 1 A 424 LYS 1 0.700 18 1 A 425 ASP 1 0.680 19 1 A 426 ARG 1 0.660 20 1 A 427 GLN 1 0.640 21 1 A 428 VAL 1 0.470 22 1 A 429 MET 1 0.450 23 1 A 430 ASN 1 0.590 24 1 A 431 MET 1 0.560 25 1 A 432 TRP 1 0.570 26 1 A 433 SER 1 0.760 27 1 A 434 GLU 1 0.760 28 1 A 435 GLN 1 0.770 29 1 A 436 GLU 1 0.790 30 1 A 437 LYS 1 0.790 31 1 A 438 GLU 1 0.820 32 1 A 439 THR 1 0.810 33 1 A 440 PHE 1 0.800 34 1 A 441 ARG 1 0.800 35 1 A 442 GLU 1 0.750 36 1 A 443 LYS 1 0.730 37 1 A 444 PHE 1 0.710 38 1 A 445 MET 1 0.700 39 1 A 446 GLN 1 0.680 40 1 A 447 HIS 1 0.770 41 1 A 448 PRO 1 0.700 42 1 A 449 LYS 1 0.720 43 1 A 450 ASN 1 0.730 44 1 A 451 PHE 1 0.700 45 1 A 452 GLY 1 0.720 46 1 A 453 LEU 1 0.710 47 1 A 454 ILE 1 0.770 48 1 A 455 ALA 1 0.780 49 1 A 456 SER 1 0.710 50 1 A 457 PHE 1 0.650 51 1 A 458 LEU 1 0.700 52 1 A 459 GLU 1 0.570 53 1 A 460 ARG 1 0.570 54 1 A 461 LYS 1 0.690 55 1 A 462 THR 1 0.710 56 1 A 463 VAL 1 0.730 57 1 A 464 ALA 1 0.720 58 1 A 465 GLU 1 0.730 59 1 A 466 CYS 1 0.780 60 1 A 467 VAL 1 0.740 61 1 A 468 LEU 1 0.670 62 1 A 469 TYR 1 0.680 63 1 A 470 TYR 1 0.690 64 1 A 471 TYR 1 0.640 65 1 A 472 LEU 1 0.640 66 1 A 473 THR 1 0.710 67 1 A 474 LYS 1 0.680 68 1 A 475 LYS 1 0.430 69 1 A 476 ASN 1 0.470 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #